sp|Q9ZVJ2|AMERL_ARATH ----> Uncharacterized protein At2g38710


Intron 1 GTTTTGATTC ... GCTTACACAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A161.9449
A261.9449
A368.423310
A4100034
A571.43132
A690.911812
A77061216
A869.234810
A980.952512
A1089.1921320



>TRINITY_DN37063_c0_g2_i2 from sample A6 / Example spliced isoform
GATTTTGATATTAATTTTTTACTCGTGAGTGCAATTCACGAGAAGCACGGAGTCATTATCTCTCCATCCCCATCAAACACATTAAGACGCCCGAGCACATGGCAGCCCGGGTCTCAGAGATGGGCATGATTGACAGAAGTAGAATATCTGTTCTGGCGTTTTGGAGTGGGGAGACGCGATTCTAGCGCCTCTTTTTATAC
CTCTTGTTCTCTCCATTCCACTTTATAAGAATTAGAGCTTATGATTTCTTACAGCCCAAGGGATTTAAGAAAGGACAACAATCGCTGCATAGCTGTGGCGATCTGAGGACTCCAGCATATCATTTTTATGTTATTTGTACAGATACCCTTAATCTGTCAAACCCTTGTTCGAATCCCGGGGAAGGTGGATTTATAGCGAA
GAATTCATTGAAGAGAGGGATTCAAGATGGTGTCTGCAAACAAAGAAATGGTTGTGTACTGCTTCGACAATTTAGTGGCCCATTATACCAGTGAGCTTGTGTCTCCTCCTGCCTTTGACGATGGCCAACATCCTTTATTTGTCACATGGAAAAAAGTTGTTGGCGGGGAGCCTCGTCTGAGAGGATGCATTGGTACATTG
GAAGCTAGGGGTCTTTTTAATGGGTTCAAAGACTACGCACTTACAAGTGCCCTACGTGATCGCCGCTTCCCACCTATACAGGCCAGAGAAATTCCATACCTGGAATGCACAGTCTCTATCCTTGCAGATTATGAGCCTGCAGCCAATTATCTAGATTGGGAGGTTGGAAAGCATGGCATGATTATGGAGTTTAATGATCC
AGATAATACAAGACGCAGTGCAACTTACTTGCCTGAAGTAGCTGCACAAGAAGGTTGGACAAAGACCGAGACAATTGATTCACTGATGCGCAAATCAGGGTATGTGGGCCCTATCACCGAGTCTCTTCGCAAAAGAGTTCGCATCACTCGTTACCAGAGCACTCTCTACACCATGCATTACAATGACTATGTTGCATTTG
TGAAGAGAACAAGAGGTACAGCTCCTCTTATTGGAATGAGGCCATATCACTAATGTGAGGGCTTCTATTTGAAACAGATTATTTCCTAAAGACATCGGTATTTATTCCACATAATACCATAATACCTTTAATTAATGGATACAGAGGATCACTCAAGGTGGTCCTTTAATTGACAGTGGGTTTGATTATTTTAAGCTGCA
AACCTTCTGCTGATCTCTTTTCCTTTTTTTTTCTGTAACACAGGAGGTATTGTTGACTGATAATACCTTCAGAAAGAATTGATTTGTCAAGAATATCAGAATCAATGGGGAATTTGATTCTATTTATTACAGTGATGCATTGAAAATCTTATCAATGTCTTTATCTGTTTTATTGGATTATCTATTTAGTAAATGCACGC
CTTGTAGCTGA


>TRINITY_DN37063_c0_g2_i1 from sample A6 / Example unspliced isoform:
GATTTTGATATTAATTTTTTACTCGTGAGTGCAATTCACGAGAAGCACGGAGTCATTATCTCTCCATCCCCATCAAACACATTAAGACGCCCGAGCACATGGCAGCCCGGGTCTCAGAGgttttgattcggactccctggcctcatctccaactttaatgggcccattggaccccaatatgcacaatgcccttttttcat
ggagattttcttcagcttttacaattttagctcacttccccacgccttcactttatttataatggaggcttacacagATGGGCATGATTGACAGAAGTAGAATATCTGTTCTGGCGTTTTGGAGTGGGGAGACGCGATTCTAGCGCCTCTTTTTATACCTCTTGTTCTCTCCATTCCACTTTATAAGAATTAGAGCTTAT
GATTTCTTACAGCCCAAGGGATTTAAGAAAGGACAACAATCGCTGCATAGCTGTGGCGATCTGAGGACTCCAGCATATCATTTTTATGTTATTTGTACAGATACCCTTAATCTGTCAAACCCTTGTTCGAATCCCGGGGAAGGTGGATTTATAGCGAAGAATTCATTGAAGAGAGGGATTCAAGATGGTGTCTGCAAACA
AAGAAATGGTTGTGTACTGCTTCGACAATTTAGTGGCCCATTATACCAGTGAGCTTGTGTCTCCTCCTGCCTTTGACGATGGCCAACATCCTTTATTTGTCACATGGAAAAAAGTTGTTGGCGGGGAGCCTCGTCTGAGAGGATGCATTGGTACATTGGAAGCTAGGGGTCTTTTTAATGGGTTCAAAGACTACGCACTT
ACAAGTGCCCTACGTGATCGCCGCTTCCCACCTATACAGGCCAGAGAAATTCCATACCTGGAATGCACAGTCTCTATCCTTGCAGATTATGAGCCTGCAGCCAATTATCTAGATTGGGAGGTTGGAAAGCATGGCATGATTATGGAGTTTAATGATCCAGATAATACAAGACGCAGTGCAACTTACTTGCCTGAAGTAGC
TGCACAAGAAGGTTGGACAAAGACCGAGACAATTGATTCACTGATGCGCAAATCAGGGTATGTGGGCCCTATCACCGAGTCTCTTCGCAAAAGAGTTCGCATCACTCGTTACCAGAGCACTCTCTACACCATGCATTACAATGACTATGTTGCATTTGTGAAGAGAACAAGAGGTACAGCTCCTCTTATTGGAATGAGGC
CATATCACTAATGTGAGGGCTTCTATTTGAAACAGATTATTTCCTAAAGACATCGGTATTTATTCCACATAATACCATAATACCTTTAATTAATGGATACAGAGGATCACTCAAGGTGGTCCTTTAATTGACAGTGGGTTTGATTATTTTAAGCTGCAAACCTTCTGCTGATCTCTTTTCCTTTTTTTTTCTGTAACACA
GGAGGTATTGTTGACTGATAATACCTTCAGAAAGAATTGATTTGTCAAGAATATCAGAATCAATGGGGAATTTGATTCTATTTATTACAGTGATGCATTGAAAATCTTATCAATGTCTTTATCTGTTTTATTGGATTATCTATTTAGTAAATGCACGCCTTGTAGCTGA



Intron 2 GTACAGCTCC ... TGTAACACAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A178.573139
A2100071
A3100021
A4100040
A5100052
A683.5183348
A77572913
A875.82113930
A964.4481415
A1068.755166



>TRINITY_DN36099_c0_g2_i1 from sample A9 / Example spliced isoform
CTACCTTTACAGAATGTTGAATTTAATTTACAAAATCACCACCATAAACTGTTTAATTTAATCTACAAAATTGGGACTCTTAGATTTTGATATTAATTTTTTACTCGTGAGTGCAATTCACGAGAAGCACGGAGTCATTATCTCTCCATCCCCATCAAACACATTAAGACGCCCGAGCACATGGCAGCCCGGGTCTCAGA
GGTTTTGATTCGGACTCCCTGGCCTCATCTCCAACTTTAATGGGCCCATTGGACCCCAATATGCACAATGCCCTTTTTTCATGGAGATTTTCTTCAGCTTTTACAATTTTAGCTCACTTCCCCACGCCTTCACTTTATTTATAATGGAGGCTTACACAGATGGGCATGATTGACAGAAGTAGAATATCTGTTCTGGCGTT
TTGGAGTGGGGAGACGCGATTCTAGCGCCTCTTTTTATACCTCTTGTTCTCTCCATTCCACTTTATAAGAATTAGAGCTTATGATTTCTTACAGCCCAAGGGATTTAAGAAAGGACAACAATCGCTGCATAGCTGTGGCGATCTGAGGACTCCAGCATATCATTTTTATGTTATTTGTACAGATACCCTTAATCTGTCAA
ACCCTTGTTCGAATCCCGGGGAAGGTGGATTTATAGCGAAGAATTCATTGAAGAGAGGGATTCAAGATGGTGTCTGCAAACAAAGAAATGGTTGTGTACTGCTTCGACAATTTAGTGGCCCATTATACCAGTGAGCTTGTGTCTCCTCCTGCCTTTGACGATGGCCAACATCCTTTATTTGTCACATGGAAAAAAGTTGT
TGGCGGGGAGCCTCGTCTGAGAGGATGCATTGGTACATTGGAAGCTAGGGGTCTTTTTAATGGGTTCAAAGACTACGCACTTACAAGTGCCCTACGTGATCGCCGCTTCCCACCTATACAGGCCAGAGAAATTCCATACCTGGAATGCACAGTCTCTATCCTTGCAGATTATGAGCCTGCAGCCAATTATCTAGATTGGG
AGGTTGGAAAGCATGGCATGATTATGGAGTTTAATGATCCAGATAATACAAGACGCAGTGCAACTTACTTGCCTGAAGTAGCTGCACAAGAAGGTTGGACAAAGACCGAGACAATTGATTCACTGATGCGCAAATCAGGGTATGTGGGCCCTATCACCGAGTCTCTTCGCAAAAGAGTTCGCATCACTCGTTACCAGAGC
ACTCTCTACACCATGCATTACAATGACTATGTTGCATTTGTGAAGAGAACAAGAGGAGGTATTGTTGACTGATAATACCTTCAGAAAGAATTGATTTGTCAAGAATATCAGAATCAATGGGGAATTTGATTCTATTTATTACAGTGATGCATTGAAAATCTTATCAATGTCTTTATCTGTTTTATTGGATTATCTATTTA
GTAAATGCACGCCTTGTAGCTGTTATATATTTATCATTGAATTTAA


>TRINITY_DN36099_c0_g2_i2 from sample A9 / Example unspliced isoform:
CTACCTTTACAGAATGTTGAATTTAATTTACAAAATCACCACCATAAACTGTTTAATTTAATCTACAAAATTGGGACTCTTAGATTTTGATATTAATTTTTTACTCGTGAGTGCAATTCACGAGAAGCACGGAGTCATTATCTCTCCATCCCCATCAAACACATTAAGACGCCCGAGCACATGGCAGCCCGGGTCTCAGA
GGTTTTGATTCGGACTCCCTGGCCTCATCTCCAACTTTAATGGGCCCATTGGACCCCAATATGCACAATGCCCTTTTTTCATGGAGATTTTCTTCAGCTTTTACAATTTTAGCTCACTTCCCCACGCCTTCACTTTATTTATAATGGAGGCTTACACAGATGGGCATGATTGACAGAAGTAGAATATCTGTTCTGGCGTT
TTGGAGTGGGGAGACGCGATTCTAGCGCCTCTTTTTATACCTCTTGTTCTCTCCATTCCACTTTATAAGAATTAGAGCTTATGATTTCTTACAGCCCAAGGGATTTAAGAAAGGACAACAATCGCTGCATAGCTGTGGCGATCTGAGGACTCCAGCATATCATTTTTATGTTATTTGTACAGATACCCTTAATCTGTCAA
ACCCTTGTTCGAATCCCGGGGAAGGTGGATTTATAGCGAAGAATTCATTGAAGAGAGGGATTCAAGATGGTGTCTGCAAACAAAGAAATGGTTGTGTACTGCTTCGACAATTTAGTGGCCCATTATACCAGTGAGCTTGTGTCTCCTCCTGCCTTTGACGATGGCCAACATCCTTTATTTGTCACATGGAAAAAAGTTGT
TGGCGGGGAGCCTCGTCTGAGAGGATGCATTGGTACATTGGAAGCTAGGGGTCTTTTTAATGGGTTCAAAGACTACGCACTTACAAGTGCCCTACGTGATCGCCGCTTCCCACCTATACAGGCCAGAGAAATTCCATACCTGGAATGCACAGTCTCTATCCTTGCAGATTATGAGCCTGCAGCCAATTATCTAGATTGGG
AGGTTGGAAAGCATGGCATGATTATGGAGTTTAATGATCCAGATAATACAAGACGCAGTGCAACTTACTTGCCTGAAGTAGCTGCACAAGAAGGTTGGACAAAGACCGAGACAATTGATTCACTGATGCGCAAATCAGGGTATGTGGGCCCTATCACCGAGTCTCTTCGCAAAAGAGTTCGCATCACTCGTTACCAGAGC
ACTCTCTACACCATGCATTACAATGACTATGTTGCATTTGTGAAGAGAACAAGAGgtacagctcctcttattggaatgaggccatatcactaatgtgagggcttctatttgaaacagattatttcctaaagacatcggtatttattccacataataccataatacctttaattaatggatacagaggatcactcaaggtg
gtcctttaattgacagtgggtttgattattttaagctgcaaaccttctgctgatctcttttcctttttttttctgtaacacagGAGGTATTGTTGACTGATAATACCTTCAGAAAGAATTGATTTGTCAAGAATATCAGAATCAATGGGGAATTTGATTCTATTTATTACAGTGATGCATTGAAAATCTTATCAATGTCT
TTATCTGTTTTATTGGATTATCTATTTAGTAAATGCACGCCTTGTAGCTGTTATATATTTATCATTGAATTTAA