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Intron 1 GTTTGCTTTA ... ATTTATACAG

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>TRINITY_DN124246_c0_g3_i1 from sample A1 / Example spliced isoform
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TTTCTTTAACATGAAGTACTTTGAAGATCAAGTGCAGGCAGGAGAATGGGAAGAGGTGGAGAGATACCTGTCAGGATTCACAAAGGTGGATGACAACCGTTATTCCATGAAAATTTTCTTCGAGATCAGAAAACAGAAATACTTGGAAGCTCTAGACAAGCAAGATCGGAAGAGAGCTGTGGAGATATTGGCGAAAGACC
TCAAAGTCTTTTCTTCGTTCAATGAAGAGCTGTTCAAAGAAGTCACACAGCTTCTTACCCTAGACAACCTCAGGGAAAATGAACAGCTGTCTAAATATGGGGATGCAAAATCGGCCAGGAACATTATGATTATGGAGCTCAAGAAATTAATAGAAGCCAATCCTCTCTTCCGTGACAAGCTCACATTTCCTGTCTTCAAA
GCTGCCAGGCTTCGAACTCTGATAAATCAAAGTCTCAATTGGCAGCATCAGCTTTGTAAAAATCCCCGACCTAATCCTGATATTAAGACCTTGTTTGTCGATCATACATGCACACCAGCAAATGGGGCCCGAGCGCCCACGCCTTCAACTAACCCACTTGTGGGCACACTCCCAAAAGGAGCAGTGTTTCCTCCTATTGC
CGCCCACAGTGTGAATCAACTGCCTTTCCAGCCTTCTAGTGCTGCTTCCGCCAATCTTTCAGGATGGATGGCAAATCCCAATCCTGCTGCTCCACACTCTGCAGTGGCTGCTGGACCAGTGTCTCTTGCACCACCCCCAAACGCCGCGGCTTTCCTAAAACGACCTAGGACTCCACCATCAAATGGTCCCGCTGTAGACT
ATCAATCTGCTGATTCTGAACACCTCATGAAGCGCATCCGGGGTGGTCAGTCGGAAGAGGTGACCTACCCAGGCCCAGGCCCAACTCATTCTCTTAACATGTACTCACAAGATGACCTTCCAAAGACTGTGGCAAGAACTCTCAATCAGGGTTCGAATGTTATGAGTATGGATTTTCATCCTATGCAGCAGACAATTCTG
CTAGTTGGAACAAATGTTGGTGATATTGCAATTTGGGAAGTGGCATCTCGAGAAAGGTTAGCCCACAGGACCTTTAAGGTTTGGGATATTGCGTCCTGTTCGATGCCACTGCAGTCGGCTCTTCTGAAAGATCCAGCTGTATCAGTGAATCGTTGTATTTGGAGCCCAGATGGGGCAGTACTAGGAGTTTGTTTTTCCAA
GCATATAGTTCATGTATATTCTTATACTGGGGCAAGCGAGTTGAGACAACATTTAGAGATTGATGCACATGCTGGTGGTGTGAATGATATTGCTTTTTCGCACCCTACCTCGCAGCTCTGCATAATTACATGTGGGGATGATAAGACCATCAAGGTGTGGGATGCAGTAAGTGGTCGGAAGCAGTACACATTTGAAGGTC
ATGAAGCACCTGTCTATTCTGTTTGTCCTCATCAGAAAGAAAATATTCAGTTTATTTTTTCTACAGCTATTGATGGAAAGATCAAAGCCTGGTTGTATGACCTTGCGGGATCTAGGGTTGACTATAATGCTCCTGGCCTCTGGTGCACTACAATGGCTTACAGTGCTGATGGAACACGGCTCTTCTCTTGTGGAACAAGT
AAAGAAGGTGACTCGTATCTGGTAGAGTGGAATGAAAGTGAGGGAACAATCAAACGGACATATTCTGGTTTTAGGAAGCGTTCCTTAGGTGTTGTGCAATTTGATACAACCAGGAATAGGTTCTTGGCAGCTGGCGATGAATTTCAAATTAAGTTCTGGGACATGGATAACACCAATATCTTGACAACAATTGATGTTGA
CGGTAGTTCAACGGTAAGAAGTTATTTCTGAAGATCAGGGTGGTTTGTTTTTAAAGTTTGAGGGAATGTTTTTGAGGAAAAAAGATTCAGCACATCATTTCAAGTTTTTTAGATTACATCTCAATACATGATCCCTGTGTTATTTTGCCAAAGCTCCAGGCTAGTCCCCGCCTTCGTTTCAGTAAAGATGGTTCCCTGTT
GGCTGTCACAACAAATGACAATGGCATAAAGATCTTAGCCAATGCAGAGGGAATTCGTTTAATTCGTATGCTGGAGAGTAGATCCTTTGAGGGAGCAAGGGTGCCACCAGAGACAATAGCAACAAAGTCTTCAATTGTTAATGTCATGACTCCTGCAGTCACTGCACCTGGTTCCCTTCCTGGTGCTATAGAACGTTCAG
AGAGACTTCCACCTGCAGTGTCAATGACCAACTTTAATGGTATAGACAGCAATCGGACATCAGATGTTAAACCGAGGCTTCTAGATGAGGTTACAGACAAGAGCAAGAACTGGAAATTGACTGACATCACTGATCCAGGTCAGTGTAGGTCTCTCAGGTTGCCTGATGCAATACATGGAAGCAAGGTAGTAAGGCTGATT
TACACCAATTCAGGTGTTGCTGTTTTAGCACTGGCATCCAATGCTCTCCATAAGCTATGGAAATGGCAGCGGAATGAACGGAATCCCTCTGGAAAGTCTACAGCGAGTATTCCACCACAGATGTGGCAGCCGGCTAGTGGGATTGTTATGAATAATGACATCGGTGAGACAAACCCAGAAGAAACTGCTGCTTGCATAGC
ATTGTCTAAGAATGATTCCTATGTGATGTCTGCTTCTGGTGGCAAGGTGTCCTTATTCAATATGATGACTTTTAAGGTCATGACAACTTTCATGCCACCTCCTCCTGCAGCCACTTTTCTGGCTTTCCACCCCCAGGACAATAACATCATTGCAATTGGCATGGACGATTCATCAATTCAGATATACAATGTTCGAGTTG
ATGAGGTGAAAACAAAGCTCAAGGGCCACCAAAAGAAAATCACAGGTCTGGCTTTTTCACATTCTTTGAATGTGTTGGTATCATCTGGAGCTGATGCCCAGTTATGTCTCTGGGGCATCGATGGATGGGACAAGCGGAAGTCAAAAGCTGTGACAGTGCAGCCAGGAAGATCATCACCACCTGTCGGGGATACAAGAGTT
CAGTTTCATAATGATCAAATTCACTTGTTGGTTGTGCATGAGAGCCATCTTGCTATATATGAAGCTTCCAAGTTGGATCGCTTGCGCTCTTGGTCTCCTCACGATTCTCTATCTGCTCCCATTTCAAGTGCTATATACTCGTGTGACAGCCTCCTAGTTTATGCAAGCTTCTGTGATGGTGCAGTTGGAGTATTTGATGC
AGAAAGCTTGAGGCCTCACTGTCGCATTGCACCTTCTGCATATATACCATCGGGAATGAACAGCAGCAATAATGCCTATCCTCTAGTCATTGCATCACATCCATCCGAGCCAAATCAATTTGCTCTTGGAATGACAGATGGAGGAGTTCATGTTATTGAGCCTTCAGAGTCAGAAGGGAAATGGGGTGTTGGACCTCCCC
CAGATAATGGAACTGTCGGATCACATCCAGCATTAAGTAACCAAGGTTCGGAGCCACCCTCAAGGTAGTTCAATGGGAATATAAGAACAATATGAAGTATGCTGTACTACTTTGTGTCTACCAACTGTTTGTTTACAAGAATACCATGATACTGGTAGCGTCTTGGCAGTAAAATGCCTCACTGGTGTTCCATTTTTTGA
GGCATTCTATCAAGATTGTAATTTTCATCAGATATTGTTCAGCAATGTAGATGGAGGTAAAGCAATTGTAAATGATATGTAAATGAGTATCTAGGTGCAATCCTGGTCACTATATTTTTTTAGGTGGTGTAAAAATTAAAAGTCTGCCATTGGAGCATAATTCATGAATGTTCTTTCTGAGGGTTTCTCAGTATCGATTT
TTGAAACCCTACTTTGTACCACATGAGTTTTTTATACTATGATCATGTGCATTCAGACAATCCTGGTTTATGCGGAAGCTTTGTCAGACTCTAGGGGAATATTATATTTATTTAACTGAATCAGCATTTTTGGGTTGTGAATACTACTGGAG


>TRINITY_DN124246_c0_g3_i3 from sample A1 / Example unspliced isoform:
GAGGAGAAGCAGGAGCAGGGAAAATATTAGGGTTTATTGGGTGTACAGATCTCATCTTTGCAGGAAGGAGGAGTGAGTTGCAGAGGGGCTTGGGGAGCCATGAGCTCGTTGAGCAGGGAGCTCGTTTTCCTCATCTTGCAGTTTCTGGACGAGGAGAAGTTTAAAGAGACTGTGCACAAGTTGGAGCAGGAATCCGGGTT
TTTCTTTAACATGAAGTACTTTGAAGATCAAGTGCAGGCAGGAGAATGGGAAGAGGTGGAGAGATACCTGTCAGGATTCACAAAGGTGGATGACAACCGTTATTCCATGAAAATTTTCTTCGAGATCAGAAAACAGAAATACTTGGAAGCTCTAGACAAGCAAGATCGGAAGAGAGCTGTGGAGATATTGGCGAAAGACC
TCAAAGTCTTTTCTTCGTTCAATGAAGAGCTGTTCAAAGAAGTCACACAGCTTCTTACCCTAGACAACCTCAGGGAAAATGAACAGCTGTCTAAATATGGGGATGCAAAATCGGCCAGGAACATTATGATTATGGAGCTCAAGAAATTAATAGAAGCCAATCCTCTCTTCCGTGACAAGCTCACATTTCCTGTCTTCAAA
GCTGCCAGGCTTCGAACTCTGATAAATCAAAGTCTCAATTGGCAGCATCAGCTTTGTAAAAATCCCCGACCTAATCCTGATATTAAGACCTTGTTTGTCGATCATACATGCACACCAGCAAATGGGGCCCGAGCGCCCACGCCTTCAACTAACCCACTTGTGGGCACACTCCCAAAAGGAGCAGTGTTTCCTCCTATTGC
CGCCCACAGTGTGAATCAACTGGTAAATTTGTTTCCTTTCCAGCCTTCTAGTGCTGCTTCCGCCAATCTTTCAGGATGGATGGCAAATCCCAATCCTGCTGCTCCACACTCTGCAGTGGCTGCTGGACCAGTGTCTCTTGCACCACCCCCAAACGCCGCGGCTTTCCTAAAACGACCTAGGACTCCACCATCAAATGGTC
CCGCTGTAGACTATCAATCTGCTGATTCTGAACACCTCATGAAGCGCATCCGGGGTGGTCAGTCGGAAGAGGTGACCTACCCAGGCCCAGGCCCAACTCATTCTCTTAACATGTACTCACAAGATGACCTTCCAAAGACTGTGGCAAGAACTCTCAATCAGGGTTCGAATGTTATGAGTATGGATTTTCATCCTATGCAG
CAGACAATTCTGCTAGGTGATTTCAAATTCCGTTCGATACAGTTTTTCATTCAAATAAATTATTAAATTTTTTAAGGCAATTTGGAATGTGTACCTTTTATCTATATAAGTATGTTTACACTGGCTAGTTGTTGAAATTTGGATTGCCGGCTTTATCTATCAGTTGGAACAAATGTTGGTGATATTGCAATTTGGGAAGT
GGCATCTCGAGAAAGGTTAGCCCACAGGACCTTTAAGGTTTGGGATATTGCGTCCTGTTCGATGCCACTGCAGTCGGCTCTTCTGAAAGATCCAGCTGTATCAGTGAATCGTTGTATTTGGAGCCCAGATGGGGCAGTACTAGGTAACCTAATCTATACCATGTATTCTTTAATAGGATATTTTGATAGCAATTCCTTCT
TTTATTTAACAATGTGAGTGAATTGTAACAATGCCATCTACAAACGTCTCTCTGGTCACTTTTCAACTCAATTTGGTTGCACACCAATACAATGGTGTGCTATTCCCCATATTCATATAATTAACACGCCTGCATTTGTGTTATAGGAGTTTGTTTTTCCAAGCATATAGTTCATGTATATTCTTATACTGGGGCAAGCG
AGTTGAGACAACATTTAGAGgtttgctttatggccaatttgtacatgcttgttggtttgtaaaattaaacctgtatctagagtataatttattaacattgatataatttatacagATTGATGCACATGCTGGTGGTGTGAATGATATTGCTTTTTCGCACCCTACCTCGCAGCTCTGCATAATTACATGTGGGGATGATA
AGACCATCAAGGTGTGGGATGCAGTAAGTGGTCGGAAGCAGTACACATTTGAAGGTCATGAAGCACCTGTCTATTCTGTTTGTCCTCATCAGAAAGAAAATATTCAGTTTATTTTTTCTACAGCTATTGATGGAAAGATCAAAGCCTGGTTGTATGACCTTGCGGGATCTAGGGTTGACTATAATGCTCCTGGCCTCTGG
TGCACTACAATGGCTTACAGTGCTGATGGAACACGGCTCTTCTCTTGTGGAACAAGTAAAGAAGGTGACTCGTATCTGGTAGAGTGGAATGAAAGTGAGGGAACAATCAAACGGACATATTCTGGTTTTAGGAAGCGTTCCTTAGGTGTTGTGCAATTTGATACAACCAGGAATAGGTTCTTGGCAGCTGGCGATGAATT
TCAAATTAAGTTCTGGGACATGGATAACACCAATATCTTGACAACAATTGATGTTGACGGTAGTTCAACGCTCCAGGCTAGTCCCCGCCTTCGTTTCAGTAAAGATGGTTCCCTGTTGGCTGTCACAACAAATGACAATGGCATAAAGATCTTAGCCAATGCAGAGGGAATTCGTTTAATTCGTATGCTGGAGAGTAGAT
CCTTTGAGGGAGCAAGGGTGCCACCAGAGACAATAGCAACAAAGTCTTCAATTGTTAATGTCATGACTCCTGCAGTCACTGCACCTGGTTCCCTTCCTGGTGCTATAGAACGTTCAGAGAGACTTCCACCTGCAGTGTCAATGACCAACTTTAATGGTATAGACAGCAATCGGACATCAGATGTTAAACCGAGGCTTCTA
GATGAGGTTACAGACAAGAGCAAGAACTGGAAATTGACTGACATCACTGATCCAGGTCAGTGTAGGTCTCTCAGGTTGCCTGATGCAATACATGGAAGCAAGGTAGTAAGGCTGATTTACACCAATTCAGGTGTTGCTGTTTTAGCACTGGCATCCAATGCTCTCCATAAGCTATGGAAATGGCAGCGGAATGAACGGAA
TCCCTCTGGAAAGTCTACAGCGAGTATTCCACCACAGATGTGGCAGCCGGCTAGTGGGATTGTTATGAATAATGACATCGGTGAGACAAACCCAGAAGAAACTGCTGCTTGCATAGCATTGTCTAAGAATGATTCCTATGTGATGTCTGCTTCTGGTGGCAAGGTGTCCTTATTCAATATGATGACTTTTAAGGTCATGA
CAACTTTCATGCCACCTCCTCCTGCAGCCACTTTTCTGGCTTTCCACCCCCAGGACAATAACATCATTGCAATTGGCATGGACGATTCATCAATTCAGATATACAATGTTCGAGTTGATGAGGTGAAAACAAAGCTCAAGGGCCACCAAAAGAAAATCACAGGTCTGGCTTTTTCACATTCTTTGAATGTGTTGGTATCA
TCTGGAGCTGATGCCCAGTTATGTCTCTGGGGCATCGATGGATGGGACAAGCGGAAGTCAAAAGCTGTGACAGTGCAGCCAGGAAGATCATCACCACCTGTCGGGGATACAAGAGTTCAGTTTCATAATGATCAAATTCACTTGTTGGTTGTGCATGAGAGCCATCTTGCTATATATGAAGCTTCCAAGTTGGATCGCTT
GCGCTCTTGGTCTCCTCACGATTCTCTATCTGCTCCCATTTCAAGTGCTATATACTCGTGTGACAGCCTCCTAGTTTATGCAAGCTTCTGTGATGGTGCAGTTGGAGTATTTGATGCAGAAAGCTTGAGGCCTCACTGTCGCATTGCACCTTCTGCATATATACCATCGGGAATGAACAGCAGCAATAATGCCTATCCTC
TAGTCATTGCATCACATCCATCCGAGCCAAATCAATTTGCTCTTGGAATGACAGATGGAGGAGTTCATGTTATTGAGCCTTCAGAGTCAGAAGGGAAATGGGGTGTTGGACCTCCCCCAGATAATGGAACTGTCGGATCACATCCAGCATTAAGTAACCAAGGTTCGGAGCCACCCTCAAGGTAGTTCAATGGGAATATA
AGAACAATATGAAGTATGCTGTACTACTTTGTGTCTACCAACTGTTTGTTTACAAGAATACCATGATACTGGTAGCGTCTTGGCAGTAAAATGCCTCACTGGTGTTCCATTTTTTGAGGCATTCTATCAAGATTGTAATTTTCATCAGATATTGTTCAGCAATGTAGATGGAGGTAAAGCAATTGTAAATGATATGTAAA
TGAGTATCTAGGTGCAATCCTGGTCACTATATTTTTTTAGGTGGTGTAAAAATTAAAAGTCTGCCATTGGAGCATAATTCATGAATGTTCTTTCTGAGGGTTTCTCAGTATCGATTTTTGAAACCCTACTTTGTACCACATGAGTTTTTTATACTATGATCATGTGCATTCAGACAATCCTGGTTTATGCGGAAGCTTTG
TCAGACTCTAGGGGAATATTATATTTATTTAACTGAATCAGCATTTTTGGGTTGTGAATACTACTGGAG




Intron 2 GTAACCTAAT ... TGTGTTATAG

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TTTCTTTAACATGAAGTACTTTGAAGATCAAGTGCAGGCAGGAGAATGGGAAGAGGTGGAGAGATACCTGTCAGGATTCACAAAGGTGGATGACAACCGTTATTCCATGAAAATTTTCTTCGAGATCAGAAAACAGAAATACTTGGAAGCTCTAGACAAGCAAGATCGGAAGAGAGCTGTGGAGATATTGGCGAAAGACC
TCAAAGTCTTTTCTTCGTTCAATGAAGAGCTGTTCAAAGAAGTCACACAGCTTCTTACCCTAGACAACCTCAGGGAAAATGAACAGCTGTCTAAATATGGGGATGCAAAATCGGCCAGGAACATTATGATTATGGAGCTCAAGAAATTAATAGAAGCCAATCCTCTCTTCCGTGACAAGCTCACATTTCCTGTCTTCAAA
GCTGCCAGGCTTCGAACTCTGATAAATCAAAGTCTCAATTGGCAGCATCAGCTTTGTAAAAATCCCCGACCTAATCCTGATATTAAGACCTTGTTTGTCGATCATACATGCACACCAGCAAATGGGGCCCGAGCGCCCACGCCTTCAACTAACCCACTTGTGGGCACACTCCCAAAAGGAGCAGTGTTTCCTCCTATTGC
CGCCCACAGTGTGAATCAACTGCCTTTCCAGCCTTCTAGTGCTGCTTCCGCCAATCTTTCAGGATGGATGGCAAATCCCAATCCTGCTGCTCCACACTCTGCAGTGGCTGCTGGACCAGTGTCTCTTGCACCACCCCCAAACGCCGCGGCTTTCCTAAAACGACCTAGGACTCCACCATCAAATGGTCCCGCTGTAGACT
ATCAATCTGCTGATTCTGAACACCTCATGAAGCGCATCCGGGGTGGTCAGTCGGAAGAGGTGACCTACCCAGGCCCAGGCCCAACTCATTCTCTTAACATGTACTCACAAGATGACCTTCCAAAGACTGTGGCAAGAACTCTCAATCAGGGTTCGAATGTTATGAGTATGGATTTTCATCCTATGCAGCAGACAATTCTG
CTAGTTGGAACAAATGTTGGTGATATTGCAATTTGGGAAGTGGCATCTCGAGAAAGGTTAGCCCACAGGACCTTTAAGGTTTGGGATATTGCGTCCTGTTCGATGCCACTGCAGTCGGCTCTTCTGAAAGATCCAGCTGTATCAGTGAATCGTTGTATTTGGAGCCCAGATGGGGCAGTACTAGGAGTTTGTTTTTCCAA
GCATATAGTTCATGTATATTCTTATACTGGGGCAAGCGAGTTGAGACAACATTTAGAGATTGATGCACATGCTGGTGGTGTGAATGATATTGCTTTTTCGCACCCTACCTCGCAGCTCTGCATAATTACATGTGGGGATGATAAGACCATCAAGGTGTGGGATGCAGTAAGTGGTCGGAAGCAGTACACATTTGAAGGTC
ATGAAGCACCTGTCTATTCTGTTTGTCCTCATCAGAAAGAAAATATTCAGTTTATTTTTTCTACAGCTATTGATGGAAAGATCAAAGCCTGGTTGTATGACCTTGCGGGATCTAGGGTTGACTATAATGCTCCTGGCCTCTGGTGCACTACAATGGCTTACAGTGCTGATGGAACACGGCTCTTCTCTTGTGGAACAAGT
AAAGAAGGTGACTCGTATCTGGTAGAGTGGAATGAAAGTGAGGGAACAATCAAACGGACATATTCTGGTTTTAGGAAGCGTTCCTTAGGTGTTGTGCAATTTGATACAACCAGGAATAGGTTCTTGGCAGCTGGCGATGAATTTCAAATTAAGTTCTGGGACATGGATAACACCAATATCTTGACAACAATTGATGTTGA
CGGTAGTTCAACGGTAAGAAGTTATTTCTGAAGATCAGGGTGGTTTGTTTTTAAAGTTTGAGGGAATGTTTTTGAGGAAAAAAGATTCAGCACATCATTTCAAGTTTTTTAGATTACATCTCAATACATGATCCCTGTGTTATTTTGCCAAAGCTCCAGGCTAGTCCCCGCCTTCGTTTCAGTAAAGATGGTTCCCTGTT
GGCTGTCACAACAAATGACAATGGCATAAAGATCTTAGCCAATGCAGAGGGAATTCGTTTAATTCGTATGCTGGAGAGTAGATCCTTTGAGGGAGCAAGGGTGCCACCAGAGACAATAGCAACAAAGTCTTCAATTGTTAATGTCATGACTCCTGCAGTCACTGCACCTGGTTCCCTTCCTGGTGCTATAGAACGTTCAG
AGAGACTTCCACCTGCAGTGTCAATGACCAACTTTAATGGTATAGACAGCAATCGGACATCAGATGTTAAACCGAGGCTTCTAGATGAGGTTACAGACAAGAGCAAGAACTGGAAATTGACTGACATCACTGATCCAGGTCAGTGTAGGTCTCTCAGGTTGCCTGATGCAATACATGGAAGCAAGGTAGTAAGGCTGATT
TACACCAATTCAGGTGTTGCTGTTTTAGCACTGGCATCCAATGCTCTCCATAAGCTATGGAAATGGCAGCGGAATGAACGGAATCCCTCTGGAAAGTCTACAGCGAGTATTCCACCACAGATGTGGCAGCCGGCTAGTGGGATTGTTATGAATAATGACATCGGTGAGACAAACCCAGAAGAAACTGCTGCTTGCATAGC
ATTGTCTAAGAATGATTCCTATGTGATGTCTGCTTCTGGTGGCAAGGTGTCCTTATTCAATATGATGACTTTTAAGGTCATGACAACTTTCATGCCACCTCCTCCTGCAGCCACTTTTCTGGCTTTCCACCCCCAGGACAATAACATCATTGCAATTGGCATGGACGATTCATCAATTCAGATATACAATGTTCGAGTTG
ATGAGGTGAAAACAAAGCTCAAGGGCCACCAAAAGAAAATCACAGGTCTGGCTTTTTCACATTCTTTGAATGTGTTGGTATCATCTGGAGCTGATGCCCAGTTATGTCTCTGGGGCATCGATGGATGGGACAAGCGGAAGTCAAAAGCTGTGACAGTGCAGCCAGGAAGATCATCACCACCTGTCGGGGATACAAGAGTT
CAGTTTCATAATGATCAAATTCACTTGTTGGTTGTGCATGAGAGCCATCTTGCTATATATGAAGCTTCCAAGTTGGATCGCTTGCGCTCTTGGTCTCCTCACGATTCTCTATCTGCTCCCATTTCAAGTGCTATATACTCGTGTGACAGCCTCCTAGTTTATGCAAGCTTCTGTGATGGTGCAGTTGGAGTATTTGATGC
AGAAAGCTTGAGGCCTCACTGTCGCATTGCACCTTCTGCATATATACCATCGGGAATGAACAGCAGCAATAATGCCTATCCTCTAGTCATTGCATCACATCCATCCGAGCCAAATCAATTTGCTCTTGGAATGACAGATGGAGGAGTTCATGTTATTGAGCCTTCAGAGTCAGAAGGGAAATGGGGTGTTGGACCTCCCC
CAGATAATGGAACTGTCGGATCACATCCAGCATTAAGTAACCAAGGTTCGGAGCCACCCTCAAGGTAGTTCAATGGGAATATAAGAACAATATGAAGTATGCTGTACTACTTTGTGTCTACCAACTGTTTGTTTACAAGAATACCATGATACTGGTAGCGTCTTGGCAGTAAAATGCCTCACTGGTGTTCCATTTTTTGA
GGCATTCTATCAAGATTGTAATTTTCATCAGATATTGTTCAGCAATGTAGATGGAGGTAAAGCAATTGTAAATGATATGTAAATGAGTATCTAGGTGCAATCCTGGTCACTATATTTTTTTAGGTGGTGTAAAAATTAAAAGTCTGCCATTGGAGCATAATTCATGAATGTTCTTTCTGAGGGTTTCTCAGTATCGATTT
TTGAAACCCTACTTTGTACCACATGAGTTTTTTATACTATGATCATGTGCATTCAGACAATCCTGGTTTATGCGGAAGCTTTGTCAGACTCTAGGGGAATATTATATTTATTTAACTGAATCAGCATTTTTGGGTTGTGAATACTACTGGAG


>TRINITY_DN124246_c0_g3_i3 from sample A1 / Example unspliced isoform:
GAGGAGAAGCAGGAGCAGGGAAAATATTAGGGTTTATTGGGTGTACAGATCTCATCTTTGCAGGAAGGAGGAGTGAGTTGCAGAGGGGCTTGGGGAGCCATGAGCTCGTTGAGCAGGGAGCTCGTTTTCCTCATCTTGCAGTTTCTGGACGAGGAGAAGTTTAAAGAGACTGTGCACAAGTTGGAGCAGGAATCCGGGTT
TTTCTTTAACATGAAGTACTTTGAAGATCAAGTGCAGGCAGGAGAATGGGAAGAGGTGGAGAGATACCTGTCAGGATTCACAAAGGTGGATGACAACCGTTATTCCATGAAAATTTTCTTCGAGATCAGAAAACAGAAATACTTGGAAGCTCTAGACAAGCAAGATCGGAAGAGAGCTGTGGAGATATTGGCGAAAGACC
TCAAAGTCTTTTCTTCGTTCAATGAAGAGCTGTTCAAAGAAGTCACACAGCTTCTTACCCTAGACAACCTCAGGGAAAATGAACAGCTGTCTAAATATGGGGATGCAAAATCGGCCAGGAACATTATGATTATGGAGCTCAAGAAATTAATAGAAGCCAATCCTCTCTTCCGTGACAAGCTCACATTTCCTGTCTTCAAA
GCTGCCAGGCTTCGAACTCTGATAAATCAAAGTCTCAATTGGCAGCATCAGCTTTGTAAAAATCCCCGACCTAATCCTGATATTAAGACCTTGTTTGTCGATCATACATGCACACCAGCAAATGGGGCCCGAGCGCCCACGCCTTCAACTAACCCACTTGTGGGCACACTCCCAAAAGGAGCAGTGTTTCCTCCTATTGC
CGCCCACAGTGTGAATCAACTGGTAAATTTGTTTCCTTTCCAGCCTTCTAGTGCTGCTTCCGCCAATCTTTCAGGATGGATGGCAAATCCCAATCCTGCTGCTCCACACTCTGCAGTGGCTGCTGGACCAGTGTCTCTTGCACCACCCCCAAACGCCGCGGCTTTCCTAAAACGACCTAGGACTCCACCATCAAATGGTC
CCGCTGTAGACTATCAATCTGCTGATTCTGAACACCTCATGAAGCGCATCCGGGGTGGTCAGTCGGAAGAGGTGACCTACCCAGGCCCAGGCCCAACTCATTCTCTTAACATGTACTCACAAGATGACCTTCCAAAGACTGTGGCAAGAACTCTCAATCAGGGTTCGAATGTTATGAGTATGGATTTTCATCCTATGCAG
CAGACAATTCTGCTAGGTGATTTCAAATTCCGTTCGATACAGTTTTTCATTCAAATAAATTATTAAATTTTTTAAGGCAATTTGGAATGTGTACCTTTTATCTATATAAGTATGTTTACACTGGCTAGTTGTTGAAATTTGGATTGCCGGCTTTATCTATCAGTTGGAACAAATGTTGGTGATATTGCAATTTGGGAAGT
GGCATCTCGAGAAAGGTTAGCCCACAGGACCTTTAAGGTTTGGGATATTGCGTCCTGTTCGATGCCACTGCAGTCGGCTCTTCTGAAAGATCCAGCTGTATCAGTGAATCGTTGTATTTGGAGCCCAGATGGGGCAGTACTAGgtaacctaatctataccatgtattctttaataggatattttgatagcaattccttct
tttatttaacaatgtgagtgaattgtaacaatgccatctacaaacgtctctctggtcacttttcaactcaatttggttgcacaccaatacaatggtgtgctattccccatattcatataattaacacgcctgcatttgtgttatag
GAGTTTGTTTTTCCAAGCATATAGTTCATGTATATTCTTATACTGGGGCAAGCG
AGTTGAGACAACATTTAGAGGTTTGCTTTATGGCCAATTTGTACATGCTTGTTGGTTTGTAAAATTAAACCTGTATCTAGAGTATAATTTATTAACATTGATATAATTTATACAGATTGATGCACATGCTGGTGGTGTGAATGATATTGCTTTTTCGCACCCTACCTCGCAGCTCTGCATAATTACATGTGGGGATGATA
AGACCATCAAGGTGTGGGATGCAGTAAGTGGTCGGAAGCAGTACACATTTGAAGGTCATGAAGCACCTGTCTATTCTGTTTGTCCTCATCAGAAAGAAAATATTCAGTTTATTTTTTCTACAGCTATTGATGGAAAGATCAAAGCCTGGTTGTATGACCTTGCGGGATCTAGGGTTGACTATAATGCTCCTGGCCTCTGG
TGCACTACAATGGCTTACAGTGCTGATGGAACACGGCTCTTCTCTTGTGGAACAAGTAAAGAAGGTGACTCGTATCTGGTAGAGTGGAATGAAAGTGAGGGAACAATCAAACGGACATATTCTGGTTTTAGGAAGCGTTCCTTAGGTGTTGTGCAATTTGATACAACCAGGAATAGGTTCTTGGCAGCTGGCGATGAATT
TCAAATTAAGTTCTGGGACATGGATAACACCAATATCTTGACAACAATTGATGTTGACGGTAGTTCAACGCTCCAGGCTAGTCCCCGCCTTCGTTTCAGTAAAGATGGTTCCCTGTTGGCTGTCACAACAAATGACAATGGCATAAAGATCTTAGCCAATGCAGAGGGAATTCGTTTAATTCGTATGCTGGAGAGTAGAT
CCTTTGAGGGAGCAAGGGTGCCACCAGAGACAATAGCAACAAAGTCTTCAATTGTTAATGTCATGACTCCTGCAGTCACTGCACCTGGTTCCCTTCCTGGTGCTATAGAACGTTCAGAGAGACTTCCACCTGCAGTGTCAATGACCAACTTTAATGGTATAGACAGCAATCGGACATCAGATGTTAAACCGAGGCTTCTA
GATGAGGTTACAGACAAGAGCAAGAACTGGAAATTGACTGACATCACTGATCCAGGTCAGTGTAGGTCTCTCAGGTTGCCTGATGCAATACATGGAAGCAAGGTAGTAAGGCTGATTTACACCAATTCAGGTGTTGCTGTTTTAGCACTGGCATCCAATGCTCTCCATAAGCTATGGAAATGGCAGCGGAATGAACGGAA
TCCCTCTGGAAAGTCTACAGCGAGTATTCCACCACAGATGTGGCAGCCGGCTAGTGGGATTGTTATGAATAATGACATCGGTGAGACAAACCCAGAAGAAACTGCTGCTTGCATAGCATTGTCTAAGAATGATTCCTATGTGATGTCTGCTTCTGGTGGCAAGGTGTCCTTATTCAATATGATGACTTTTAAGGTCATGA
CAACTTTCATGCCACCTCCTCCTGCAGCCACTTTTCTGGCTTTCCACCCCCAGGACAATAACATCATTGCAATTGGCATGGACGATTCATCAATTCAGATATACAATGTTCGAGTTGATGAGGTGAAAACAAAGCTCAAGGGCCACCAAAAGAAAATCACAGGTCTGGCTTTTTCACATTCTTTGAATGTGTTGGTATCA
TCTGGAGCTGATGCCCAGTTATGTCTCTGGGGCATCGATGGATGGGACAAGCGGAAGTCAAAAGCTGTGACAGTGCAGCCAGGAAGATCATCACCACCTGTCGGGGATACAAGAGTTCAGTTTCATAATGATCAAATTCACTTGTTGGTTGTGCATGAGAGCCATCTTGCTATATATGAAGCTTCCAAGTTGGATCGCTT
GCGCTCTTGGTCTCCTCACGATTCTCTATCTGCTCCCATTTCAAGTGCTATATACTCGTGTGACAGCCTCCTAGTTTATGCAAGCTTCTGTGATGGTGCAGTTGGAGTATTTGATGCAGAAAGCTTGAGGCCTCACTGTCGCATTGCACCTTCTGCATATATACCATCGGGAATGAACAGCAGCAATAATGCCTATCCTC
TAGTCATTGCATCACATCCATCCGAGCCAAATCAATTTGCTCTTGGAATGACAGATGGAGGAGTTCATGTTATTGAGCCTTCAGAGTCAGAAGGGAAATGGGGTGTTGGACCTCCCCCAGATAATGGAACTGTCGGATCACATCCAGCATTAAGTAACCAAGGTTCGGAGCCACCCTCAAGGTAGTTCAATGGGAATATA
AGAACAATATGAAGTATGCTGTACTACTTTGTGTCTACCAACTGTTTGTTTACAAGAATACCATGATACTGGTAGCGTCTTGGCAGTAAAATGCCTCACTGGTGTTCCATTTTTTGAGGCATTCTATCAAGATTGTAATTTTCATCAGATATTGTTCAGCAATGTAGATGGAGGTAAAGCAATTGTAAATGATATGTAAA
TGAGTATCTAGGTGCAATCCTGGTCACTATATTTTTTTAGGTGGTGTAAAAATTAAAAGTCTGCCATTGGAGCATAATTCATGAATGTTCTTTCTGAGGGTTTCTCAGTATCGATTTTTGAAACCCTACTTTGTACCACATGAGTTTTTTATACTATGATCATGTGCATTCAGACAATCCTGGTTTATGCGGAAGCTTTG
TCAGACTCTAGGGGAATATTATATTTATTTAACTGAATCAGCATTTTTGGGTTGTGAATACTACTGGAG




Intron 3 GTAAGAAGTT ... TTTGCCAAAG

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>TRINITY_DN124246_c0_g3_i9 from sample A1 / Example spliced isoform
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TTTCTTTAACATGAAGTACTTTGAAGATCAAGTGCAGGCAGGAGAATGGGAAGAGGTGGAGAGATACCTGTCAGGATTCACAAAGGTGGATGACAACCGTTATTCCATGAAAATTTTCTTCGAGATCAGAAAACAGAAATACTTGGAAGCTCTAGACAAGCAAGATCGGAAGAGAGCTGTGGAGATATTGGCGAAAGACC
TCAAAGTCTTTTCTTCGTTCAATGAAGAGCTGTTCAAAGAAGTCACACAGCTTCTTACCCTAGACAACCTCAGGGAAAATGAACAGCTGTCTAAATATGGGGATGCAAAATCGGCCAGGAACATTATGATTATGGAGCTCAAGAAATTAATAGAAGCCAATCCTCTCTTCCGTGACAAGCTCACATTTCCTGTCTTCAAA
GCTGCCAGGCTTCGAACTCTGATAAATCAAAGTCTCAATTGGCAGCATCAGCTTTGTAAAAATCCCCGACCTAATCCTGATATTAAGACCTTGTTTGTCGATCATACATGCACACCAGCAAATGGGGCCCGAGCGCCCACGCCTTCAACTAACCCACTTGTGGGCACACTCCCAAAAGGAGCAGTGTTTCCTCCTATTGC
CGCCCACAGTGTGAATCAACTGCCTTTCCAGCCTTCTAGTGCTGCTTCCGCCAATCTTTCAGGATGGATGGCAAATCCCAATCCTGCTGCTCCACACTCTGCAGTGGCTGCTGGACCAGTGTCTCTTGCACCACCCCCAAACGCCGCGGCTTTCCTAAAACGACCTAGGACTCCACCATCAAATGGTCCCGCTGTAGACT
ATCAATCTGCTGATTCTGAACACCTCATGAAGCGCATCCGGGGTGGTCAGTCGGAAGAGGTGACCTACCCAGGCCCAGGCCCAACTCATTCTCTTAACATGTACTCACAAGATGACCTTCCAAAGACTGTGGCAAGAACTCTCAATCAGGGTTCGAATGTTATGAGTATGGATTTTCATCCTATGCAGCAGACAATTCTG
CTAGTTGGAACAAATGTTGGTGATATTGCAATTTGGGAAGTGGCATCTCGAGAAAGGTTAGCCCACAGGACCTTTAAGGTTTGGGATATTGCGTCCTGTTCGATGCCACTGCAGTCGGCTCTTCTGAAAGATCCAGCTGTATCAGTGAATCGTTGTATTTGGAGCCCAGATGGGGCAGTACTAGGAGTTTGTTTTTCCAA
GCATATAGTTCATGTATATTCTTATACTGGGGCAAGCGAGTTGAGACAACATTTAGAGATTGATGCACATGCTGGTGGTGTGAATGATATTGCTTTTTCGCACCCTACCTCGCAGCTCTGCATAATTACATGTGGGGATGATAAGACCATCAAGGTGTGGGATGCAGTAAGTGGTCGGAAGCAGTACACATTTGAAGGTC
ATGAAGCACCTGTCTATTCTGTTTGTCCTCATCAGAAAGAAAATATTCAGTTTATTTTTTCTACAGCTATTGATGGAAAGATCAAAGCCTGGTTGTATGACCTTGCGGGATCTAGGGTTGACTATAATGCTCCTGGCCTCTGGTGCACTACAATGGCTTACAGTGCTGATGGAACACGGCTCTTCTCTTGTGGAACAAGT
AAAGAAGGTGACTCGTATCTGGTAGAGTGGAATGAAAGTGAGGGAACAATCAAACGGACATATTCTGGTTTTAGGAAGCGTTCCTTAGGTGTTGTGCAATTTGATACAACCAGGAATAGGTTCTTGGCAGCTGGCGATGAATTTCAAATTAAGTTCTGGGACATGGATAACACCAATATCTTGACAACAATTGATGTTGA
CGGTAGTTCAACGCTCCAGGCTAGTCCCCGCCTTCGTTTCAGTAAAGATGGTTCCCTGTTGGCTGTCACAACAAATGACAATGGCATAAAGATCTTAGCCAATGCAGAGGGAATTCGTTTAATTCGTATGCTGGAGAGTAGATCCTTTGAGGGAGCAAGGGTGCCACCAGAGACAATAGCAACAAAGTCTTCAATTGTTA
ATGTCATGACTCCTGCAGTCACTGCACCTGGTTCCCTTCCTGGTGCTATAGAACGTTCAGAGAGACTTCCACCTGCAGTGTCAATGACCAACTTTAATGGTATAGACAGCAATCGGACATCAGATGTTAAACCGAGGCTTCTAGATGAGGTTACAGACAAGAGCAAGAACTGGAAATTGACTGACATCACTGATCCAGGT
CAGTGTAGGTCTCTCAGGTTGCCTGATGCAATACATGGAAGCAAGGTAGTAAGGCTGATTTACACCAATTCAGGTGTTGCTGTTTTAGCACTGGCATCCAATGCTCTCCATAAGCTATGGAAATGGCAGCGGAATGAACGGAATCCCTCTGGAAAGTCTACAGCGAGTATTCCACCACAGATGTGGCAGCCGGCTAGTGG
GATTGTTATGAATAATGACATCGGTGAGACAAACCCAGAAGAAACTGCTGCTTGCATAGCATTGTCTAAGAATGATTCCTATGTGATGTCTGCTTCTGGTGGCAAGGTGTCCTTATTCAATATGATGACTTTTAAGGTCATGACAACTTTCATGCCACCTCCTCCTGCAGCCACTTTTCTGGCTTTCCACCCCCAGGACA
ATAACATCATTGCAATTGGCATGGACGATTCATCAATTCAGATATACAATGTTCGAGTTGATGAGGTGAAAACAAAGCTCAAGGGCCACCAAAAGAAAATCACAGGTCTGGCTTTTTCACATTCTTTGAATGTGTTGGTATCATCTGGAGCTGATGCCCAGTTATGTCTCTGGGGCATCGATGGATGGGACAAGCGGAAG
TCAAAAGCTGTGACAGTGCAGCCAGGAAGATCATCACCACCTGTCGGGGATACAAGAGTTCAGTTTCATAATGATCAAATTCACTTGTTGGTTGTGCATGAGAGCCATCTTGCTATATATGAAGCTTCCAAGTTGGATCGCTTGCGCTCTTGGTCTCCTCACGATTCTCTATCTGCTCCCATTTCAAGTGCTATATACTC
GTGTGACAGCCTCCTAGTTTATGCAAGCTTCTGTGATGGTGCAGTTGGAGTATTTGATGCAGAAAGCTTGAGGCCTCACTGTCGCATTGCACCTTCTGCATATATACCATCGGGAATGAACAGCAGCAATAATGCCTATCCTCTAGTCATTGCATCACATCCATCCGAGCCAAATCAATTTGCTCTTGGAATGACAGATG
GAGGAGTTCATGTTATTGAGCCTTCAGAGTCAGAAGGGAAATGGGGTGTTGGACCTCCCCCAGATAATGGAACTGTCGGATCACATCCAGCATTAAGTAACCAAGGTTCGGAGCCACCCTCAAGGTAGTTCAATGGGAATATAAGAACAATATGAAGTATGCTGTACTACTTTGTGTCTACCAACTGTTTGTTTACAAGA
ATACCATGATACTGGTAGCGTCTTGGCAGTAAAATGCCTCACTGGTGTTCCATTTTTTGAGGCATTCTATCAAGATTGTAATTTTCATCAGATATTGTTCAGCAATGTAGATGGAGGTAAAGCAATTGTAAATGATATGTAAATGAGTATCTAGGTGCAATCCTGGTCACTATATTTTTTTAGGTGGTGTAAAAATTAAA
AGTCTGCCATTGGAGCATAATTCATGAATGTTCTTTCTGAGGGTTTCTCAGTATCGATTTTTGAAACCCTACTTTGTACCACATGAGTTTTTTATACTATGATCATGTGCATTCAGACAATCCTGGTTTATGCGGAAGCTTTGTCAGACTCTAGGGGAATATTATATTTATTTAACTGAATCAGCATTTTTGGGTTGTGA
ATACTACTGGAG


>TRINITY_DN124246_c0_g3_i1 from sample A1 / Example unspliced isoform:
GAGGAGAAGCAGGAGCAGGGAAAATATTAGGGTTTATTGGGTGTACAGATCTCATCTTTGCAGGAAGGAGGAGTGAGTTGCAGAGGGGCTTGGGGAGCCATGAGCTCGTTGAGCAGGGAGCTCGTTTTCCTCATCTTGCAGTTTCTGGACGAGGAGAAGTTTAAAGAGACTGTGCACAAGTTGGAGCAGGAATCCGGGTT
TTTCTTTAACATGAAGTACTTTGAAGATCAAGTGCAGGCAGGAGAATGGGAAGAGGTGGAGAGATACCTGTCAGGATTCACAAAGGTGGATGACAACCGTTATTCCATGAAAATTTTCTTCGAGATCAGAAAACAGAAATACTTGGAAGCTCTAGACAAGCAAGATCGGAAGAGAGCTGTGGAGATATTGGCGAAAGACC
TCAAAGTCTTTTCTTCGTTCAATGAAGAGCTGTTCAAAGAAGTCACACAGCTTCTTACCCTAGACAACCTCAGGGAAAATGAACAGCTGTCTAAATATGGGGATGCAAAATCGGCCAGGAACATTATGATTATGGAGCTCAAGAAATTAATAGAAGCCAATCCTCTCTTCCGTGACAAGCTCACATTTCCTGTCTTCAAA
GCTGCCAGGCTTCGAACTCTGATAAATCAAAGTCTCAATTGGCAGCATCAGCTTTGTAAAAATCCCCGACCTAATCCTGATATTAAGACCTTGTTTGTCGATCATACATGCACACCAGCAAATGGGGCCCGAGCGCCCACGCCTTCAACTAACCCACTTGTGGGCACACTCCCAAAAGGAGCAGTGTTTCCTCCTATTGC
CGCCCACAGTGTGAATCAACTGCCTTTCCAGCCTTCTAGTGCTGCTTCCGCCAATCTTTCAGGATGGATGGCAAATCCCAATCCTGCTGCTCCACACTCTGCAGTGGCTGCTGGACCAGTGTCTCTTGCACCACCCCCAAACGCCGCGGCTTTCCTAAAACGACCTAGGACTCCACCATCAAATGGTCCCGCTGTAGACT
ATCAATCTGCTGATTCTGAACACCTCATGAAGCGCATCCGGGGTGGTCAGTCGGAAGAGGTGACCTACCCAGGCCCAGGCCCAACTCATTCTCTTAACATGTACTCACAAGATGACCTTCCAAAGACTGTGGCAAGAACTCTCAATCAGGGTTCGAATGTTATGAGTATGGATTTTCATCCTATGCAGCAGACAATTCTG
CTAGTTGGAACAAATGTTGGTGATATTGCAATTTGGGAAGTGGCATCTCGAGAAAGGTTAGCCCACAGGACCTTTAAGGTTTGGGATATTGCGTCCTGTTCGATGCCACTGCAGTCGGCTCTTCTGAAAGATCCAGCTGTATCAGTGAATCGTTGTATTTGGAGCCCAGATGGGGCAGTACTAGGAGTTTGTTTTTCCAA
GCATATAGTTCATGTATATTCTTATACTGGGGCAAGCGAGTTGAGACAACATTTAGAGATTGATGCACATGCTGGTGGTGTGAATGATATTGCTTTTTCGCACCCTACCTCGCAGCTCTGCATAATTACATGTGGGGATGATAAGACCATCAAGGTGTGGGATGCAGTAAGTGGTCGGAAGCAGTACACATTTGAAGGTC
ATGAAGCACCTGTCTATTCTGTTTGTCCTCATCAGAAAGAAAATATTCAGTTTATTTTTTCTACAGCTATTGATGGAAAGATCAAAGCCTGGTTGTATGACCTTGCGGGATCTAGGGTTGACTATAATGCTCCTGGCCTCTGGTGCACTACAATGGCTTACAGTGCTGATGGAACACGGCTCTTCTCTTGTGGAACAAGT
AAAGAAGGTGACTCGTATCTGGTAGAGTGGAATGAAAGTGAGGGAACAATCAAACGGACATATTCTGGTTTTAGGAAGCGTTCCTTAGGTGTTGTGCAATTTGATACAACCAGGAATAGGTTCTTGGCAGCTGGCGATGAATTTCAAATTAAGTTCTGGGACATGGATAACACCAATATCTTGACAACAATTGATGTTGA
CGGTAGTTCAACGgtaagaagttatttctgaagatcagggtggtttgtttttaaagtttgagggaatgtttttgaggaaaaaagattcagcacatcatttcaagttttttagattacatctcaatacatgatccctgtgttattttgccaaagCTCCAGGCTAGTCCCCGCCTTCGTTTCAGTAAAGATGGTTCCCTGTT
GGCTGTCACAACAAATGACAATGGCATAAAGATCTTAGCCAATGCAGAGGGAATTCGTTTAATTCGTATGCTGGAGAGTAGATCCTTTGAGGGAGCAAGGGTGCCACCAGAGACAATAGCAACAAAGTCTTCAATTGTTAATGTCATGACTCCTGCAGTCACTGCACCTGGTTCCCTTCCTGGTGCTATAGAACGTTCAG
AGAGACTTCCACCTGCAGTGTCAATGACCAACTTTAATGGTATAGACAGCAATCGGACATCAGATGTTAAACCGAGGCTTCTAGATGAGGTTACAGACAAGAGCAAGAACTGGAAATTGACTGACATCACTGATCCAGGTCAGTGTAGGTCTCTCAGGTTGCCTGATGCAATACATGGAAGCAAGGTAGTAAGGCTGATT
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ATTGTCTAAGAATGATTCCTATGTGATGTCTGCTTCTGGTGGCAAGGTGTCCTTATTCAATATGATGACTTTTAAGGTCATGACAACTTTCATGCCACCTCCTCCTGCAGCCACTTTTCTGGCTTTCCACCCCCAGGACAATAACATCATTGCAATTGGCATGGACGATTCATCAATTCAGATATACAATGTTCGAGTTG
ATGAGGTGAAAACAAAGCTCAAGGGCCACCAAAAGAAAATCACAGGTCTGGCTTTTTCACATTCTTTGAATGTGTTGGTATCATCTGGAGCTGATGCCCAGTTATGTCTCTGGGGCATCGATGGATGGGACAAGCGGAAGTCAAAAGCTGTGACAGTGCAGCCAGGAAGATCATCACCACCTGTCGGGGATACAAGAGTT
CAGTTTCATAATGATCAAATTCACTTGTTGGTTGTGCATGAGAGCCATCTTGCTATATATGAAGCTTCCAAGTTGGATCGCTTGCGCTCTTGGTCTCCTCACGATTCTCTATCTGCTCCCATTTCAAGTGCTATATACTCGTGTGACAGCCTCCTAGTTTATGCAAGCTTCTGTGATGGTGCAGTTGGAGTATTTGATGC
AGAAAGCTTGAGGCCTCACTGTCGCATTGCACCTTCTGCATATATACCATCGGGAATGAACAGCAGCAATAATGCCTATCCTCTAGTCATTGCATCACATCCATCCGAGCCAAATCAATTTGCTCTTGGAATGACAGATGGAGGAGTTCATGTTATTGAGCCTTCAGAGTCAGAAGGGAAATGGGGTGTTGGACCTCCCC
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GGCATTCTATCAAGATTGTAATTTTCATCAGATATTGTTCAGCAATGTAGATGGAGGTAAAGCAATTGTAAATGATATGTAAATGAGTATCTAGGTGCAATCCTGGTCACTATATTTTTTTAGGTGGTGTAAAAATTAAAAGTCTGCCATTGGAGCATAATTCATGAATGTTCTTTCTGAGGGTTTCTCAGTATCGATTT
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>TRINITY_DN124246_c0_g3_i1 from sample A1 / Example spliced isoform
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TTTCTTTAACATGAAGTACTTTGAAGATCAAGTGCAGGCAGGAGAATGGGAAGAGGTGGAGAGATACCTGTCAGGATTCACAAAGGTGGATGACAACCGTTATTCCATGAAAATTTTCTTCGAGATCAGAAAACAGAAATACTTGGAAGCTCTAGACAAGCAAGATCGGAAGAGAGCTGTGGAGATATTGGCGAAAGACC
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CGCCCACAGTGTGAATCAACTGCCTTTCCAGCCTTCTAGTGCTGCTTCCGCCAATCTTTCAGGATGGATGGCAAATCCCAATCCTGCTGCTCCACACTCTGCAGTGGCTGCTGGACCAGTGTCTCTTGCACCACCCCCAAACGCCGCGGCTTTCCTAAAACGACCTAGGACTCCACCATCAAATGGTCCCGCTGTAGACT
ATCAATCTGCTGATTCTGAACACCTCATGAAGCGCATCCGGGGTGGTCAGTCGGAAGAGGTGACCTACCCAGGCCCAGGCCCAACTCATTCTCTTAACATGTACTCACAAGATGACCTTCCAAAGACTGTGGCAAGAACTCTCAATCAGGGTTCGAATGTTATGAGTATGGATTTTCATCCTATGCAGCAGACAATTCTG
CTAG
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AAAGAAGGTGACTCGTATCTGGTAGAGTGGAATGAAAGTGAGGGAACAATCAAACGGACATATTCTGGTTTTAGGAAGCGTTCCTTAGGTGTTGTGCAATTTGATACAACCAGGAATAGGTTCTTGGCAGCTGGCGATGAATTTCAAATTAAGTTCTGGGACATGGATAACACCAATATCTTGACAACAATTGATGTTGA
CGGTAGTTCAACGGTAAGAAGTTATTTCTGAAGATCAGGGTGGTTTGTTTTTAAAGTTTGAGGGAATGTTTTTGAGGAAAAAAGATTCAGCACATCATTTCAAGTTTTTTAGATTACATCTCAATACATGATCCCTGTGTTATTTTGCCAAAGCTCCAGGCTAGTCCCCGCCTTCGTTTCAGTAAAGATGGTTCCCTGTT
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AGAGACTTCCACCTGCAGTGTCAATGACCAACTTTAATGGTATAGACAGCAATCGGACATCAGATGTTAAACCGAGGCTTCTAGATGAGGTTACAGACAAGAGCAAGAACTGGAAATTGACTGACATCACTGATCCAGGTCAGTGTAGGTCTCTCAGGTTGCCTGATGCAATACATGGAAGCAAGGTAGTAAGGCTGATT
TACACCAATTCAGGTGTTGCTGTTTTAGCACTGGCATCCAATGCTCTCCATAAGCTATGGAAATGGCAGCGGAATGAACGGAATCCCTCTGGAAAGTCTACAGCGAGTATTCCACCACAGATGTGGCAGCCGGCTAGTGGGATTGTTATGAATAATGACATCGGTGAGACAAACCCAGAAGAAACTGCTGCTTGCATAGC
ATTGTCTAAGAATGATTCCTATGTGATGTCTGCTTCTGGTGGCAAGGTGTCCTTATTCAATATGATGACTTTTAAGGTCATGACAACTTTCATGCCACCTCCTCCTGCAGCCACTTTTCTGGCTTTCCACCCCCAGGACAATAACATCATTGCAATTGGCATGGACGATTCATCAATTCAGATATACAATGTTCGAGTTG
ATGAGGTGAAAACAAAGCTCAAGGGCCACCAAAAGAAAATCACAGGTCTGGCTTTTTCACATTCTTTGAATGTGTTGGTATCATCTGGAGCTGATGCCCAGTTATGTCTCTGGGGCATCGATGGATGGGACAAGCGGAAGTCAAAAGCTGTGACAGTGCAGCCAGGAAGATCATCACCACCTGTCGGGGATACAAGAGTT
CAGTTTCATAATGATCAAATTCACTTGTTGGTTGTGCATGAGAGCCATCTTGCTATATATGAAGCTTCCAAGTTGGATCGCTTGCGCTCTTGGTCTCCTCACGATTCTCTATCTGCTCCCATTTCAAGTGCTATATACTCGTGTGACAGCCTCCTAGTTTATGCAAGCTTCTGTGATGGTGCAGTTGGAGTATTTGATGC
AGAAAGCTTGAGGCCTCACTGTCGCATTGCACCTTCTGCATATATACCATCGGGAATGAACAGCAGCAATAATGCCTATCCTCTAGTCATTGCATCACATCCATCCGAGCCAAATCAATTTGCTCTTGGAATGACAGATGGAGGAGTTCATGTTATTGAGCCTTCAGAGTCAGAAGGGAAATGGGGTGTTGGACCTCCCC
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GGCATTCTATCAAGATTGTAATTTTCATCAGATATTGTTCAGCAATGTAGATGGAGGTAAAGCAATTGTAAATGATATGTAAATGAGTATCTAGGTGCAATCCTGGTCACTATATTTTTTTAGGTGGTGTAAAAATTAAAAGTCTGCCATTGGAGCATAATTCATGAATGTTCTTTCTGAGGGTTTCTCAGTATCGATTT
TTGAAACCCTACTTTGTACCACATGAGTTTTTTATACTATGATCATGTGCATTCAGACAATCCTGGTTTATGCGGAAGCTTTGTCAGACTCTAGGGGAATATTATATTTATTTAACTGAATCAGCATTTTTGGGTTGTGAATACTACTGGAG


>TRINITY_DN124246_c0_g3_i3 from sample A1 / Example unspliced isoform:
GAGGAGAAGCAGGAGCAGGGAAAATATTAGGGTTTATTGGGTGTACAGATCTCATCTTTGCAGGAAGGAGGAGTGAGTTGCAGAGGGGCTTGGGGAGCCATGAGCTCGTTGAGCAGGGAGCTCGTTTTCCTCATCTTGCAGTTTCTGGACGAGGAGAAGTTTAAAGAGACTGTGCACAAGTTGGAGCAGGAATCCGGGTT
TTTCTTTAACATGAAGTACTTTGAAGATCAAGTGCAGGCAGGAGAATGGGAAGAGGTGGAGAGATACCTGTCAGGATTCACAAAGGTGGATGACAACCGTTATTCCATGAAAATTTTCTTCGAGATCAGAAAACAGAAATACTTGGAAGCTCTAGACAAGCAAGATCGGAAGAGAGCTGTGGAGATATTGGCGAAAGACC
TCAAAGTCTTTTCTTCGTTCAATGAAGAGCTGTTCAAAGAAGTCACACAGCTTCTTACCCTAGACAACCTCAGGGAAAATGAACAGCTGTCTAAATATGGGGATGCAAAATCGGCCAGGAACATTATGATTATGGAGCTCAAGAAATTAATAGAAGCCAATCCTCTCTTCCGTGACAAGCTCACATTTCCTGTCTTCAAA
GCTGCCAGGCTTCGAACTCTGATAAATCAAAGTCTCAATTGGCAGCATCAGCTTTGTAAAAATCCCCGACCTAATCCTGATATTAAGACCTTGTTTGTCGATCATACATGCACACCAGCAAATGGGGCCCGAGCGCCCACGCCTTCAACTAACCCACTTGTGGGCACACTCCCAAAAGGAGCAGTGTTTCCTCCTATTGC
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GGCATCTCGAGAAAGGTTAGCCCACAGGACCTTTAAGGTTTGGGATATTGCGTCCTGTTCGATGCCACTGCAGTCGGCTCTTCTGAAAGATCCAGCTGTATCAGTGAATCGTTGTATTTGGAGCCCAGATGGGGCAGTACTAGGTAACCTAATCTATACCATGTATTCTTTAATAGGATATTTTGATAGCAATTCCTTCT
TTTATTTAACAATGTGAGTGAATTGTAACAATGCCATCTACAAACGTCTCTCTGGTCACTTTTCAACTCAATTTGGTTGCACACCAATACAATGGTGTGCTATTCCCCATATTCATATAATTAACACGCCTGCATTTGTGTTATAGGAGTTTGTTTTTCCAAGCATATAGTTCATGTATATTCTTATACTGGGGCAAGCG
AGTTGAGACAACATTTAGAGGTTTGCTTTATGGCCAATTTGTACATGCTTGTTGGTTTGTAAAATTAAACCTGTATCTAGAGTATAATTTATTAACATTGATATAATTTATACAGATTGATGCACATGCTGGTGGTGTGAATGATATTGCTTTTTCGCACCCTACCTCGCAGCTCTGCATAATTACATGTGGGGATGATA
AGACCATCAAGGTGTGGGATGCAGTAAGTGGTCGGAAGCAGTACACATTTGAAGGTCATGAAGCACCTGTCTATTCTGTTTGTCCTCATCAGAAAGAAAATATTCAGTTTATTTTTTCTACAGCTATTGATGGAAAGATCAAAGCCTGGTTGTATGACCTTGCGGGATCTAGGGTTGACTATAATGCTCCTGGCCTCTGG
TGCACTACAATGGCTTACAGTGCTGATGGAACACGGCTCTTCTCTTGTGGAACAAGTAAAGAAGGTGACTCGTATCTGGTAGAGTGGAATGAAAGTGAGGGAACAATCAAACGGACATATTCTGGTTTTAGGAAGCGTTCCTTAGGTGTTGTGCAATTTGATACAACCAGGAATAGGTTCTTGGCAGCTGGCGATGAATT
TCAAATTAAGTTCTGGGACATGGATAACACCAATATCTTGACAACAATTGATGTTGACGGTAGTTCAACGCTCCAGGCTAGTCCCCGCCTTCGTTTCAGTAAAGATGGTTCCCTGTTGGCTGTCACAACAAATGACAATGGCATAAAGATCTTAGCCAATGCAGAGGGAATTCGTTTAATTCGTATGCTGGAGAGTAGAT
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TCCCTCTGGAAAGTCTACAGCGAGTATTCCACCACAGATGTGGCAGCCGGCTAGTGGGATTGTTATGAATAATGACATCGGTGAGACAAACCCAGAAGAAACTGCTGCTTGCATAGCATTGTCTAAGAATGATTCCTATGTGATGTCTGCTTCTGGTGGCAAGGTGTCCTTATTCAATATGATGACTTTTAAGGTCATGA
CAACTTTCATGCCACCTCCTCCTGCAGCCACTTTTCTGGCTTTCCACCCCCAGGACAATAACATCATTGCAATTGGCATGGACGATTCATCAATTCAGATATACAATGTTCGAGTTGATGAGGTGAAAACAAAGCTCAAGGGCCACCAAAAGAAAATCACAGGTCTGGCTTTTTCACATTCTTTGAATGTGTTGGTATCA
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GCGCTCTTGGTCTCCTCACGATTCTCTATCTGCTCCCATTTCAAGTGCTATATACTCGTGTGACAGCCTCCTAGTTTATGCAAGCTTCTGTGATGGTGCAGTTGGAGTATTTGATGCAGAAAGCTTGAGGCCTCACTGTCGCATTGCACCTTCTGCATATATACCATCGGGAATGAACAGCAGCAATAATGCCTATCCTC
TAGTCATTGCATCACATCCATCCGAGCCAAATCAATTTGCTCTTGGAATGACAGATGGAGGAGTTCATGTTATTGAGCCTTCAGAGTCAGAAGGGAAATGGGGTGTTGGACCTCCCCCAGATAATGGAACTGTCGGATCACATCCAGCATTAAGTAACCAAGGTTCGGAGCCACCCTCAAGGTAGTTCAATGGGAATATA
AGAACAATATGAAGTATGCTGTACTACTTTGTGTCTACCAACTGTTTGTTTACAAGAATACCATGATACTGGTAGCGTCTTGGCAGTAAAATGCCTCACTGGTGTTCCATTTTTTGAGGCATTCTATCAAGATTGTAATTTTCATCAGATATTGTTCAGCAATGTAGATGGAGGTAAAGCAATTGTAAATGATATGTAAA
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TCAGACTCTAGGGGAATATTATATTTATTTAACTGAATCAGCATTTTTGGGTTGTGAATACTACTGGAG