sp|Q9MA15|AB1K3_ARATH ----> Protein ACTIVITY OF BC1 COMPLEX KINASE 3, chloroplastic


Intron 1 GTAATTCTTA ... TGAGATGTAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A127.45742811
A225.6981288
A320.5981217
A413.2459911
A527.6947184.7
A620.3590235
A717.141743611.7
A819.13932211
A916.771342713.7
A1026.58116427



>TRINITY_DN104765_c0_g1_i1 from sample A3 / Example spliced isoform
TCGCCATGAGCCAATTTTAGCAGAACAGCTTCAATGGCATCGACCACACTCAACGCATGCTTCCACTCAGATATCAGGAGGCACGACAGTGGCAGAATATTCACCCCAACGAAATTTAGGCCCAAGATTAGAGCGGCCCTGGTCCAGTCGGGGCCAGGGGAACTCGTTCTCAGCGGTGGCGCAAAAAATGGCGGTGGCCT
TGCTGCCAACAGTAGTAATGGAAATTCTCGCAGCAAAGACATTGTGAGGAGGCTGGAGAGAAATCTCGAGTCCCGTAGCAGTGTCGATGACGATCCCGAAGCGGAAGCTAGGGCCGAAGCCAGAGCCGCCAACGCCTCCACTTATGACCCCGCTAAATTAGCGGAAAAATACCGTTCGAAGCCTCTTAAGTTATTTAGGC
GTACTTCAGAAATATTCTTGGCATTGGGCTCTTTTGCCATAACTCTGGTGCTTGATCAACGGAGTGGTCAGCTGGATCAAAATAAGCGTACACGGGCTAGAGAACTCAGAAAGATACTTACAAGGTTGGGTCCAACTTTTGTTAAAGTGGGACAAGGTCTATCAACCAGACCAGATCTTTGCCCTCCGGAGTACCTGGAA
GAACTGTCAGAACTGCAAGATGCCCTACCTACTTTTCCAAATGCTGATGCCTTTGCATGTATTGAAAGGGAGTTGGAGTTGCCACTTGAGTCAATTTTCTCGGCTATTTCAGAGTCCCCTATTGCAGCAGCAAGTTTGGGCCAGGTTTATAAAGCTTGCCTAAGATACTCTGGACAAGTGGTTGCCGTTAAAGTGCAGAG
GCCTGAGATTGAAGAAGCCATTGGGCTAGATTTCTACTTGGTTCGGGGCCTGGGTAAGCTTATTAATGAGTATGTAGACGTTGTCACCTCTGATGTTGTTGCTCTTGTAGATGAGTTTGCTAGAAGAGTATACCAGGAACTCAACTATGTGCAGGAAGCTAAAAATGCAATAAGGTTTAAAAAGCTGTATGGAGACAGGC
CAGATGTTCTTGTCCCTGAAATCTTCTGGGATTATACTAGTGTGAAAGTTTTGACAATGGATTGGATAGAGGGTGTTAAGCTGAATGAACAGGAAGCCATGAAAAGACAAGGTCTGGAACTTATAGATATGGTGAACATAGGCATTCAATGCAGTCTCAGGCAGCTACTTGAACATGGTTATTTTCATGCAGACCCACAT
CCAGGGAATCTTCTTGCCACAGCTGATGGAAAACTTGCGTTTTTGGATTTTGGAATGATGAGTGAAACCCCTCAACAGGCTAGATTTGCCATCATTGGTCATGTAGTTCACATGGTTAACCGAGACTATGAAGCTATGGCCCGTGATTACTATGCCTTGGATTTTCTATCACCTGATATAGATGTATCGCCTATTGTTCC
AGCATTAAGGGACTTTTTCGATAATGCACTAAATTCAACTGTCAGCGAGCTGAACTTTAAGACTATTGTGGATGGTCTAGGTGCTGTTCTATATGAGTATCCCTTTGATGTTCCAGCCTATTATGCTTTGATACTCAGGTCGCTTACAGTGCTTGAAGGACTAGCTCTTTATACGGATCCTAATTTTAAAGTACTGTCTG
CTTCATATCCTTATTTTGCGAAGCGGTTACTGACAGATACCAACCCTTACCTTAGGGATGCTCTTATCGAGCTTCTTTTCAAGGATGGAAGATTCAGGTGGAACAGACTTGAAAACCTGCTTGTCCAGGGGCGCAAAGACAGTGATTTTGCTGCCAAAGATGCTTTACAGCCTGTCCTTAAGCTTTTACTGGGATCTGAT
GGTGAAGAACTCCGTAGTTTAGTTGTCAAGGAGTCTGTGAGAGTTGTAGAAGCTATTTTATTCAGTGCTGCTATGGACAGCTTTAATTCTGTGCCTGAGCCTATCAGGACCCTGATTCCTAATGGCAATGGTAATGGATTTTTGAGAATTAATGAAAATGAACAGGCAGCCATGCTTGAACTTCGAGACCGAATATTTAG
AATATGGGGACTTCTGCAGTCTTCAAGAGGATTTGATCCAGCAATGTTTCAGCCTATCGTTGAGATTCTTCAACAACCTGAAGCGCGCAACATTGGTGGTCGTGTTGTAGGAGGTGTAACACAGCGCCTTGCAGCACGCTTGTTGCAACAAGTCCTCCGATCACCAAGTCCAGTTCCTACTGTTCCAACATAATGACAGA
TATTGGCTTGTTATATTGACAAAATACACATTATACTTCATGTATAGTAATTTCGGGTGACAATGTACTGTTCTTTATTCAATCTAATTGGATTGAAGAGCTGTATAAGCAATAACGTTGAAGAGGAATTTCATCCACAAAGCACTTTGCTGAAGGTGTCTACTGCACTTTGTTCCATTAGGGAGTCCATCTTTGCTGTT
AAGTCATATTGGAAGGAAGTACAAGAAGCCATTTTCGTAATCCTATATTTTGTTATCCTCAAAGGGGAAATATGGTTTAAAAGTTCAATTGGTTGCTGCAGTCATCACTAGAGGATTAAAGAAAACAAATGAATATTGGTTGTGAGCACAAGCACCCAAGGTAACCAATGAGCCAGCATCATGTACATAAAATATTCTTG
CACAGGAATAATATTTGATCATGATTTAGGCCCTTGCAGCTACCTTCATTTCAATCATGGTGTTGAGCTATCTAAGGTCACTGATTTTAATATACACTGGTACAATCCTACTGATATGATCTCAGTGGCTGAATTGAAATTTGTTTTTGATTTCAGTGGCTGGATTGAAATTTGTTTTTGTATAGGGTGCAACTGGAAAT
TCAGATTCTGCATTCC


>TRINITY_DN104765_c0_g1_i2 from sample A3 / Example unspliced isoform:
TCGCCATGAGCCAATTTTAGCAGAACAGCTTCAATGGCATCGACCACACTCAACGCATGCTTCCACTCAGATATCAGGAGGCACGACAGTGGCAGAATATTCACCCCAACGAAATTTAGGCCCAAGATTAGAGCGGCCCTGGTCCAGTCGGGGCCAGGGGAACTCGTTCTCAGCGGTGGCGCAAAAAATGGCGGTGGCCT
TGCTGCCAACAGTAGTAATGGAAATTCTCGCAGCAAAGACATTGTGAGGAGGCTGGAGAGAAATCTCGAGTCCCGTAGCAGTGTCGATGACGATCCCGAAGCGGAAGCTAGGGCCGAAGCCAGAGCCGCCAACGCCTCCACTTATGACCCCGCTAAATTAGCGGAAAAATACCGTTCGAAGCCTCTTAAGTTATTTAGGC
GTACTTCAGAAATATTCTTGGCATTGGGCTCTTTTGCCATAACTCTGGTGCTTGATCAACGGAGTGGTCAGCTGGATCAAAATAAGCGTACACGGGCTAGAGAACTCAGAAAGATACTTACAAGGTTGGGTCCAACTTTTGTTAAAGTGGGACAAGGTCTATCAACCAGACCAGATCTTTGCCCTCCGGAGTACCTGGAA
GAACTGTCAGAACTGCAAGATGCCCTACCTACTTTTCCAAATGCTGATGCCTTTGCATGTATTGAAAGGGAGTTGGAGTTGCCACTTGAGTCAATTTTCTCGGCTATTTCAGAGTCCCCTATTGCAGCAGCAAGTTTGGGCCAGGTTTATAAAGCTTGCCTAAGATACTCTGGACAAGTGGTTGCCGTTAAAGTGCAGAG
GCCTGAGATTGAAGAAGCCATTGGGCTAGATTTCTACTTGGTTCGGGGCCTGGGTAAGCTTATTAATGAGTATGTAGACGTTGTCACCTCTGATGTTGTTGCTCTTGTAGATGAGTTTGCTAGAAGAGTATACCAGGAACTCAACTATGTGCAGgtaattcttatgctctgttaatgcgggtttatataaataacatata
tattgattcttaagtgcatgcatttgcttttttctgttctgttccatatcatgatttgaaatatcttttgcttgttctacacagaagagatggaagatacagttttatttattagtattttctttgacttttgcacagtttctgtttattgaggcacccatacatgtgctttagttgattggagaaaggcaaatttgcaa
ctatggatatactgatcaaatgtttttattatcgcctatttttacaccaatattgcttttgagatgtagGAAGCTAAAAATGCAATAAGG