sp|Q75HV0|CCP31_ORYSJ ----> Cyclin-P3-1
Intron 1 GTAAGTTAAT ... TGGAATGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 25.86 | 234.5 | 0 | 77 |
| A2 | 25.63 | 221.5 | 0 | 73 |
| A3 | 25.65 | 256.5 | 0 | 83 |
| A4 | 29.3 | 187.5 | 0 | 75 |
| A5 | 19.43 | 133.5 | 0 | 30 |
| A6 | 22.78 | 758.5 | 0 | 214 |
| A7 | 21.63 | 974 | 0 | 256 |
| A8 | 24.29 | 519 | 0 | 160 |
| A9 | 25.25 | 878 | 0 | 283 |
| A10 | 24.14 | 890 | 0 | 267 |
>TRINITY_DN127659_c8_g2_i2 from sample A1 / Example spliced isoformGTGGTAACTGGTAATGAAGCTTATCCTGGATTTCATCAAGGATTGATATCACTTCAGTGATGATTTTTAAATCCATGTAATACAGCGTTTGCTTCAGGGTTCTCCTGTAAACTTTTAACTTGTTTCTCCTATAGTCTTACCTTTCATGCTTGGCCTCTAATGATTAATTTCTATCACTGAAACTGTCCACTGATTTAAAC
TAAATTTGGATATGGTACAGAGAATGCTTGGATAAGGTCTGGTGGTAGTCAGCGGTTGCTTTTATTACACGTGCCCAAAAAGATCAGGGTTGTTGAAGGTGCATATTATTTTACATGGATTCTTCAGTTCATATGGTCGAGGAAGGTTCCAATGCAGATTTATATTCAGCACTCGATCTGAGTGAGTCTGAAGTGGGATT
CTGTGAAAGCCCCCGTGTGTTGTCTATTCTGGCCTCTCTTCTAGATAGAGTTGTACAAAGGAATGAAAAGTTACTGGAGGCTACCAAGAAGCAAGAAAAAATAACTGTTTTTCATGGCCTCCGAGCACCCAACTTGAGCATTCGAAGTTACATCGATAGAATTTTCAAGTACTCAAACTGCAGCCCATCGTGCTTTACTC
TTGCCTATGTGTACATTGATAGATTCATCCATCAACAACCGGAGGTTCCTATCACCTCCTTGAATGTTCACCGTCTTTTGATCACAAGTGTTATGGTTGCAGCAAAGTTTGTTGATGATGCATTCTTTAACAATGCTTATTACGCCAAAGTTGGGGGTGTAAGCACATTCGAGATGAATAGACTGGAACTTGAATTTTTA
TTTAATCTGGATTTCAAACTGCAAGTAACTGTCAGTACATTTGAGAGTTATTGCTTGAAGTTGGAGAAAGAAGTTGCTGTTGGTGGTGGGTACCAAATCGAGCGACCTCTCCAGTTTGTTTGCGGGCTTAATGGCTTAAATAATAAAGAGGAAACACAAGGACAATCGGTGGTGCCAAGGTTCACCTATGGTGCTGTATA
AGGAGCAGCTTCCCCGTAGTCAAGAATATCAATGTTGGTTGAGAAGAAGCTGCCTTAGAGGAATTATTCTGATAAAGGCTGTTTGTTTATTTCATCCAGCAGTTTAATCTTGACTTAGCTTCCATGAATATGCGGCCTCTTTAGATCATGTCGGAGCATCATGATCACAATAGTCATGATTTTGTGATTAAGTTCAGAAA
AATCACGACTCGTGAGTGAAGAAATGATGCTTGAATCATGTCAGAATTCTAGGCTGTTCTCGGTATCAGCAACTTTTCTCAGTCGTATGCATTGAATTGTGGCTTGATTATGACTTGTGTTTTTAACTAAACCAGATCATCTTTAGTTTGCAGGTTTTGGGTACCGAGAGGAAGTAGGAAGAACTTCTACCTCAGAAGGC
ATGTTTGCAAGTAAATCATAATGAACTATGGGTTTAGTGAGGAAGTAGTTCTGGAGCATCTTGTTTAGATGCTTGCAGGCAAACACTTTTGTGTCCTTTTCGTATATCAATAGTGAAAATCAGTTCTACAGATCCTGTTGGTGTAATGATCTTAAACAATCTTTTTGTTTTCAGGTATGATGTGATATCATGGCTTTGTA
AGGCAATCATATCCTATGTAGCATAGTTTGTGACCATAATACCGTCATAGTTTTAGTTTTACATCATAATAGTTAATCTTTAGATTTTAATTTTTCATGTTGTAAGGTTGTTTGAAC
>TRINITY_DN127659_c8_g2_i1 from sample A1 / Example unspliced isoform:TACACGTGCCCAAAAAGATCAGgtaagttaatacggtaagcttcccgctttgtaggtatacataatgacacagttgtatcatttttttcttactgtgaagctctggtatggaatgcagGGTTGTTGAAGGTGCATATTATTTTACATGGATTCTTCAGTTCATATGGTCGAGGAAGGTTCCAATGCAGATTTATATTCAG
CACTCGATCTGAGTGAGTCTGAAGTGGGATTCTGTGAAAGCCCCCGTGTGTTGTCTATTCTGGCCTCTCTTCTAGATAGAGTTGTACAAAGGAATGAAAAGTTACTGGAGGCTACCAAGAAGCAAGAAAAAATAACTGTTTTTCATGGCCTCCGAGCACCCAACTTGAGCATTCGAAGTTACATCGATAGAATTTTCAAG
TACTCAAACTGCAGCCCATCGTGCTTTACTCTTGCCTATGTGTACATTGATAGATTCATCCATCAACAACCGGAGGTTCCTATCACCTCCTTGAATGTTCACCGTCTTTTGATCACAAGTGTTATGGTTGCAGCAAAGTTTGTTGATGATGCATTCTTTAACAATGCTTATTACGCCAAAGTTGGGGGTGTAAGCACATT
CGAGATGAATAGACTGGAACTTGAATTTTTATTTAATCTGGATTTCAAACTGCAAGTAACTGTCAGTACATTTGAGAGTTATTGCTTGAAGTTGGAGAAAGAAGTTGCTGTTGGTGGTGGGTACCAAATCGAGCGACCTCTCCAGTTTGTTTGCGGGCTTAATGGCTTAAATAATAAAGAGGAAACACAAGGACAATCGG
TGGTGCCAAGGTTCACCTATGGTGCTGTATAAGGAGCAGCTTCCCCGTAGTCAAGAATATCAATGTTGGTTGAGAAGAAGCTGCCTTAGAGGAATTATTCTGATAAAGGCTGTTTGTTTATTTCATCCAGCAGTTTAATCTTGACTTAGCTTCCATGAATATGCGGCCTCTTTAGATCATGTCGGAGCATCATGATCACA
ATAGTCATGATTTTGTGATTAAGTTCAGAAAAATCACGACTCGTGAGTGAAGAAATGATGCTTGAATCATGTCAGAATTCTAGGCTGTTCTCGGTATCAGCAACTTTTCTCAGTCGTATGCATTGAATTGTGGCTTGATTATGACTTGTGTTTTTAACTAAACCAGATCATCTTTAGTTTGCAGGTTTTGGGTACCGAGA
GGAAGTAGGAAGAACTTCTACCTCAGAAGGCATGTTTGCAAGTAAATCATAATGAACTATGGGTTTAGTGAGGAAGTAGTTCTGGAGCATCTTGTTTAGATGCTTGCAGGCAAACACTTTTGTGTCCTTTTCGTATATCAATAGTGAAAATCAGTTCTACAGATCCTGTTGGTGTAATGATCTTAAACAATCTTTTTGTT
TTCAGGTATGATGTGATATCATGGCTTTGTAAGGCAATCATATCCTATGTAGCATAGTTTGTGACCATAATACCGTCATAGTTTTAGTTTTACATCATAATAGTTAATCTTTAGATTTTAATTTTTCATGTTGTAAGGTTGTTTGAAC
Intron 2 GTAAGTGTGG ... GGACCTGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 15.21 | 130 | 26.7 | 20 |
| A2 | 20.4 | 80 | 21 | 20 |
| A3 | 20.92 | 121 | 37 | 27 |
| A4 | 20.87 | 114.3 | 30.3 | 30 |
| A5 | 26.25 | 59 | 19 | 23 |
| A6 | 20.79 | 396.3 | 93 | 115 |
| A7 | 17.7 | 411.3 | 101 | 76 |
| A8 | 21.22 | 419 | 110.7 | 115 |
| A9 | 19.62 | 443 | 111.3 | 105 |
| A10 | 18.72 | 359 | 82.3 | 83 |
>TRINITY_DN105361_c4_g1_i1 from sample A4 / Example spliced isoformAGTCAAGAAATACCTTGTAGATAATAGCAAAAGGGAGGAAGCACCCACAAGGCCAAACACTAACCGACGAGGACAAACTTCGACACATTTAACCATCACAAATAGTAAATCAACAACAAGCTGCTCCGCTGTTGTACTGCCTGACTCATTTTGCATTGTTTAATGACAGAAACGTTGGGAATGGTGTCTGACAGTGCTTT
GACAAATAGTATGAGTGCGCCCCCACAAAAGTGTACCCAACTTTCCAGAGTGTACATTGTAGATGATGAGTCCGCTGCAGCTGCAACATCATTTGTCTTCCCCTTAAATCAGATGCTTCCGTGCTTGCGTAGATTTGTTAAAACATCTCGTTGCCTGTGTAGGGTTTGATATGATATTGTTGGGTATTGAAAAGTTCGCT
GAGATTATTTGGCTGGGAGGCTTGTAAGTGCAGTCAGAGTTTGTGGTGGGTGGCTTGTAAGTGCAATGGCCCTCAGGAGTCCCATTTCACATCGCTGGTGGTGGGCTTGGAGAAGGTGTGAAGTGGTGGGTTTGGAGGAGAAGTAAAGTGGATATCTGTCTAATTGCTTCCAGTGGACTAGAATGCTTGGATAAGGTCTG
GTGGTAGTCAGCGGTTGCTTTTATTACACGTGCCCAAAAAGATCAGGGTTGTTGAAGGTGCATATTATTTTACATGGATTCTTCAGTTCATATGGTCGAGGAAGGTTCCAATGCAGATTTATATTCAGCACTCGATCTGAGTGAGTCTGAAGTGGGATTCTGTGAAAGCCCCCGTGTGTTGTCTATTCTGGCCTCTCTTC
TAGATAGAGTTGTACAAAGGAATGAAAAGTTACTGGAGGCTACCAAGAAGCAAGAAAAAATAACTGTTTTTCATGGCCTCCGAGCACCCAACTTGAGCATTCGAAGTTACATCGATAGAATTTTCAAGTACTCAAACTGCAGCCCATCGTGCTTTACTCTTGCCTATGTGTACATTGATAGATTCATCCATCAACAACCG
GAGGTTCCTATCACCTCCTTGAATGTTCACCGTCTTTTGATCACAAGTGTTATGGTTGCAGCAAAGTTTGTTGATGATGCATTCTTTAACAATGCTTATTACGCCAAAGTTGGGGGTGTAAGCACATTCGAGATGAATAGACTGGAACTTGAATTTTTATTTAATCTGGATTTCAAACTGCAAGTAACTGTCAGTACATT
TGAGAGTTATTGCTTGAAGTTGGAGAAAGAAGTTGCTGTTGGTGGTGGGTACCAAATCGAGCGACCTCTCCAGTTTGTTTGCGGGCTTAATGGCTTAAATAATAAAGAGGAAACACAAGGACAATCGGTGGTGCCAAGGTTCACCTATGGTGCTGTATAAGGAGCAGCTTCCCCGTAGTCAAGAATATCAATGTTGGTTG
AGAAGAAGCTGCCTTAGAGGAATTATTCTGATAAAGGCTGTTTGTTTATTTCATCCAGCAGTTTAATCTTGACTTAGCTTCCATGAATATGCGGCCTCTTTAGATCATGTCGGAGCATCATGATCACAATAGTCATGATTTTGTGATTAAGTTCAGAAAAATCACGACTCGTGAGTGAAGAAATGATGCTTGAATCATGT
CAGAATTCTAGGCTGTTCTCGGTATCAGCAACTTTTCTCAGTCGTATGCATTGAATTGTGGCTTGATTATGACTTGTGTTTTTAACTAAACCAGATCATCTTTAGTTTGCAGGTTTTGGGTACCGAGAGGAAGTAGGAAGAACTTCTACCTCAGAAGGCATGTTTGCAAGTAAATCATAATGAACTATGGGTTTAGTGAG
GAAGTAGTTCTGGAGCATCTTGTTTAGATGCTTGCAGGCAAACACTTTTGTGTCCTTTTCGTATATCAATAGTGAAAATCAGTTCTACAGATCCTGTTGGTGTAATGATCTTAAACAATCTTTTTGTTTTCAGGTATGATGTGATATCATGGCTTTGTAAGGCAATCATATCCTATGTAGCATAGTTTGTGACCATAATA
CCGTCATAGTTTTAGTTTTACATCATAATAGTTAATCTTTAGATTTTAATTTTTCATGTTGTAAGGTTGTTTGAACTACTCCAGCTATCTTTGCTTGTGGCATTGCATGGTTTGTTTTTTGTGTATGGCATAAGTCACTTTTTTCTGGTAATTTAGCTTCTCTCAAATCTCCGTTGAGCTTGAAATATGTGATGCTGTCA
AGTTTCTAATAAGTAGAACAAGCCTCTGCAAGATTTTGTGTTTGCCTTGCAAGATTTCAACGTCTTCATTGACAAGCCTCTGCATCTGCA
>TRINITY_DN105361_c4_g1_i2 from sample A4 / Example unspliced isoform:AGTCAAGAAATACCTTGTAGATAATAGCAAAAGGGAGGAAGCACCCACAAGGCCAAACACTAACCGACGAGGACAAACTTCGACACATTTAACCATCACAAATAGTAAATCAACAACAAGCTGCTCCGCTGTTGTACTGCCTGACTCATTTTGCATTGTTTAATGACAGAAACGTTGGGAATGGTGTCTGACAGTGCTTT
GACAAATAGTATGAGTGCGCCCCCACAAAAGTGTACCCAACTTTCCAGAGTGTACATTGTAGATGATGAGTCCGCTGCAGCTGCAACATCATTTGTCTTCCCCTTAAATCAGATGCTTCCGTGCTTGCGTAGATTTGTTAAAACATCTCGTTGCCTGTGTAGGGTTTGATATGATATTGTTGGGTATTGAAAAGTTCGCT
GAGATTATTTGGCTGGGAGGCTTGTAAGTGCAGTCAGAGTTTGTGGTGGGTGGCTTGTAAGTGCAATGGCCCTCAGGAGTCCCATTTCACATCGCTGGTGGTGGGCTTGGAGAAGGTGTGAAGTGGTGGGTTTGGAGGAGAAGTAAAGTGGATATCTGTCTAATTGCTTCCAGTGGACTAGAATGCTTGGATAAGGTCTG
GTGGTAGTCAGCGGTTGCTTTTATTACACGTGCCCAAAAAGATCAGGGTTGTTGAAGGTGCATATTATTTTACATGGATTCTTCAGTTCATATGGTCGAGGAAGGTTCCAATGCAGATTTATATTCAGCACTCGATCTGAGTGAGTCTGAAGTGGGATTCTGTGAAAGCCCCCGTGTGTTGTCTATTCTGGCCTCTCTTC
TAGATAGAGTTGTACAAAGGAATGAAAAGTTACTGGAGGCTACCAAGAAGCAAGAAAAAATAACTGTTTTTCATGGCCTCCGAGCACCCAACTTGAGCATTCGAAGTTACATCGATAGAATTTTCAAGTACTCAAACTGCAGCCCATCGTGCTTTACTCTTGCCTATGTGTACATTGATAGATTCATCCATCAACAACCG
GAGGTTCCTATCACCTCCTTGAATGTTCACCGTCTTTTGATCACAAGTGTTATGGTTGCAGCAAAGTTTGTTGATGATGCgtaagtgtgggtttcaactcaatgctgtttgggatgtcatcacaaaaatttattgcattctgttgcatttaatgcttggaattatttcaaccttttaacatttagtttgtagaattttaa
atcttatttccattttcaacgaaagtgaaatatctttcacctgtaatttatctttgttctgaaataaattatcaattctacaaacctgctgtacaagagttttgtatttgctacttcttgatggcctctttttctgtggacctgcagATTCTTTAACAATGCTTATTACGCCAAAGTTGGGGGTGTAAGCACATTCGAGA
TGAATAGACTGGAACTTGAATTTTTATTTAATCTGGATTTCAAACTGCAAGTAACTGTCAGTACATTTGAGAGTTATTGCTTGAAGTTGGAGAAAGAAGTTGCTGTTGGTGGTGGGTACCAAATCGAGCGACCTCTCCAGTTTGTTTGCGGGCTTAATGGCTTAAATAATAAAGAGGAAACACAAGGACAATCGGTGGTG
CCAAGGTTCACCTATGGTGCTGTATAAGGAGCAGCTTCCCCGTAGTCAAGAATATCAATGTTGGTTGAGAAGAAGCTGCCTTAGAGGAATTATTCTGATAAAGGCTGTTTGTTTATTTCATCCAGCAGTTTAATCTTGACTTAGCTTCCATGAATATGCGGCCTCTTTAGATCATGTCGGAGCATCATGATCACAATAGT
CATGATTTTGTGATTAAGTTCAGAAAAATCACGACTCGTGAGTGAAGAAATGATGCTTGAATCATGTCAGAATTCTAGGCTGTTCTCGGTATCAGCAACTTTTCTCAGTCGTATGCATTGAATTGTGGCTTGATTATGACTTGTGTTTTTAACTAAACCAGATCATCTTTAGTTTGCAGGTTTTGGGTACCGAGAGGAAG
TAGGAAGAACTTCTACCTCAGAAGGCATGTTTGCAAGTAAATCATAATGAACTATGGGTTTAGTGAGGAAGTAGTTCTGGAGCATCTTGTTTAGATGCTTGCAGGCAAACACTTTTGTGTCCTTTTCGTATATCAATAGTGAAAATCAGTTCTACAGATCCTGTTGGTGTAATGATCTTAAACAATCTTTTTGTTTTCAG
GTATGATGTGATATCATGGCTTTGTAAGGCAATCATATCCTATGTAGCATAGTTTGTGACCATAATACCGTCATAGTTTTAGTTTTACATCATAATAGTTAATCTTTAGATTTTAATTTTTCATGTTGTAAGGTTGTTTGAACTACTCCAGCTATCTTTGCTTGTGGCATTGCATGGTTTGTTTTTTGTGTATGGCATAA
GTCACTTTTTTCTGGTAATTTAGCTTCTCTCAAATCTCCGTTGAGCTTGAAATATGTGATGCTGTCAAGTTTCTAATAAGTAGAACAAGCCTCTGCAAGATTTTGTGTTTGCCTTGCAAGATTTCAACGTCTTCATTGACAAGCCTCTGCATCTGCA