sp|Q9FMU6|MPCP3_ARATH ----> Mitochondrial phosphate carrier protein 3, mitochondrial


Intron 1 GTGAGTTTTG ... ATTATTGCAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A115.7757101181
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A513.022844144
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A1013.611669239287



>TRINITY_DN132286_c0_g1_i4 from sample A1 / Example spliced isoform
TAATAAGAAATAATAAGAGGCAACCCTGAACGCTGAAGGCCTCTCTAAAACCTAACCAGACAGAGGAGGAAGGAGGGCAGAGGCAACCGTTTATCTCCCTCGTGTGTTCGATTCATCTCTGTGTTACACATCGATCGATCGAATCCATGGCCATGGCGATCTCAGAACAAGACAGCCGAGCTCTGTTGCCAAGCTTTCTT
TATTCCCCATCTTCTTCTTCTTTGAGCCATCTCAGAGGAGGCTCATTTGCATCAGAGACCCTTCTAAACAGAAATAGGAATCCTCTGTTGAATCTCAACAGCACTAGGAGTTCTGCAGAAAATGCATCTGCCAAAGTCAATGCTCCAAAGGCATTTGTTGTGCCGGCGCCCAGCGAGCCGGGGAAGATCACCATGTATTC
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TTGGATATAGTGCTCAGGGTGCTTGCAAGTTTGGCTTTTATGAGTTCTTCAAGAAGTACTACTCAGACATTGCAGGGCCTGAGTTTTCTGCCAAATACAAGACATTGATCTACTTGGCAGGATCTGCATCTGCAGAATTTATTGCTGATATTGCTCTTTGTCCTTTTGAGGCTGTAAAAGTTCGAGTACAAACACAACCT
GGCTTTGCTAGAGGATTATCTGATGGGCTTCCAAAGTTTGTCAGATCAGAAGGAGTTCTTGGTCTGTACAAAGGTATTGGTCCACTTTGGGGACGCCAAATTCCTTACACCATGATGAAGTTTGCGTCCTTTGAAACCATAGTAGAGTTGATCTACAAGCATGCAGTCCCCATCCCCAAGGACCAATGTAGCAAACCTCT
ACAGCTGGGAGTGAGTTTTGCGGCTGGATACATTGCTGGTGTCTTTTGTGCAATTGTTTCTCACCCTGCTGACAACCTGGTTTCTTTCCTAAACAATGCTAAGGGTGCAACCGTGGGAGATGCTGTGAAGAAGATGGGTCTTGTTGGTCTCTGTACTCGGGGTCTTCCTTTACGTATTGTTATGATTGGAACACTTACTG
GAGCACAATGGGGTATCTATGATGCTTTCAAGGTGTTCGTTGGCCTGCCGACTACTGGTGGAGTTACTCCCCCTGCTGCGGAACTCAAGGAGTTGAACAAATTGAGCTAGTTTGAAGGCGGCATTCTTGAGATCAAACTTTAAGGCTTAGTGTTCTTCCTGCAGCGCAGAAGTTAGACATGGCTGAATAAAACCATGGAG
GGTTGACTCTAGATTTTTGTTTCTTCCAAACTTAGGCTGATTCACACAGCTTGCAAGCGCTCTTGCAAGTTTATTTTTTGAGGTTATTTTTTTGTCAGAAAGGCTGGTTTCATTTTATTTTTTCCATCCCACTCAGACTTGAATTATATTTCCAAAGTTACATGGCATATTCTCTGGTATACCTTGAATTAATTTTGGTT
GGGGTACGGCTAACCAGCTTGTTGGGGTGTAATTTAGCTTCCCTACGTTTCGTTGTTACTGGGAGTAGCTTCTATGCACTTGTTACTATGAGTGAGAACCCACATAATAAAAGGCAATCTCAGTTCTACTTTCAGATGGCATTAGTCTTGAGCAACTACCACTTCCTGAATGATTCAAGGTTAGTGTGTTTTGGGGAATA
TACTAAAGAAAACAGATGATGGCCGTGTTGAAAACTTAAGTGAAAGATAACTGTGGTAACTTTGTTTGTAGCTAGACTTTTGTGGTTAAACCTGTTTTTATAACTTCAAAATTTACATACTTAGTTTATAGTTTGATGAGAAGAACGATGAAGGTTGTTGTCGTTGATCTGGTAAAGTCTAGAGATAATGAATTTGATGT
GAAATACGGTAATAATCTTTTCAATTTTTTGTGATTGCTATACTGTTATGGTCGGTTTTATTGATTCCAAGAGAAAAATAGGCTATTTAAGAATACATATTTCTTTTTCAATAATTTGGAAACAAAATTTCAGAGGGGCAATTGCAGTTTTGACAAGTTCCAGTGTGCCAGTTATCCTTACTTGAACAACTTCCGTTGCA
TTTTGTAGGATCCAACCGTGGAATGTTAAATAACTCTTTCTGTGTTGCTTAGACATTCTAAGTCGAAAATGTTCGCCCTTTTGAAGGGTCTTTTCATTTAAAAAGGTTGTTGACTTGGTTGGTTTCAGAGGTTATTGAATTACCAGCCTGTACAATTCTGTGTCTTTCTTCTTGGTTTGGTTCCAATTTTTTTGCTTAGA
TTGATATTATTGATTATAAACCACTATGTATTTGGTGGCTTTCATGTCAATCAACTAATCCGTTCTGCTTTGAGGTCGATAGAAGAGAGCATGATATTCATGTCTCCTTCGGGATATATGGACTTATTTTAAGAATCCCACCAAATGTTACACTAATGTTTGGTGTGCCGTGTCCAATTTCTTTCTTTTGTTTCCCCTTT
CATCTCTGCAATTACAAATCTGCTGTTTAAGTTTGTAATGTTTTTCAGAGTTTGCTTTCTTCACACCTCAGGGGTAAAGGACCAGATCAATTTTTCAACTTGACCTTACATTTCATTAGATCTAATTCCGTGACACGATTTTTAACCGAGAGGTTATTTTCTTGTTTGTCTAATGTTTTCTCTAAACAGGTTAACAATTC
TGATTCAGTGCTATAGTTAATTATCTTTGGCAATTTTTGGTTAGGCATTTGAAAGATTAGGACAGATTTATTCACATAAAAGCCCCAAAGAGTTTAGTTGAAATCAATCAAGGGAAAGACAAATGTCTAATGAACTTTTTCAAGTGTTGCTTTCCTTCTGACAATGCCGATGTAACAAAAGCAAGCCTTTGTTAACCTGT
TTTCTCTAAACAGGTTAAAAATTCTGATTCAGTGCTATAGTTAATTATCTTTGGTAATTTTTGGTTAGGGATTTGAAAGATTAGGACAGATTTATTCACATAAAAGCCCCAAAGAGTTTAGTTGAAATCAATCAAGGGAAAGACATTTCTGATGAACTTTTTCAAGTGTTGCTTTCCTTCTGACAATGCCGATGTAACAG
AAGGAAGCCTTTGACGAACTGTCTTTTGACAAAGCATGAATATCATCATCAATGGTAGGAGCGAGCCCCGATATTTAGGGATTAAAGGAAAACCTTTTTGGATGGTATAATTTTGTTTTGCTACGTGTTTTTCAATAAGATCTGGAATGACTAAGATTGAT


>TRINITY_DN132286_c0_g1_i6 from sample A1 / Example unspliced isoform:
TAATAAGAAATAATAAGAGGCAACCCTGAACGCTGAAGGCCTCTCTAAAACCTAACCAGACAGAGGAGGAAGGAGGGCAGAGGCAACCGTTTATCTCCCTCGTGTGTTCGATTCATCTCTGTGTTACACATCGATCGATCGAATCCATGGCCATGGCGATCTCAGAACAAGACAGCCGAGCTCTGTTGCCAAGCTTTCTT
TATTCCCCATCTTCTTCTTCTTTGAGCCATCTCAGAGGAGGCTCATTTGCATCAGAGACCCTTCTAAACAGAAATAGGAATCCTCTGTTGAATCTCAACAGCACTAGGAGTTCTGCAGAAAATGCATCTGCCAAAGTCAATGCTCCAAAGGCATTTGTTGTGCCGGCGCCCAGCGAGCCGGGGAAGATCACCATGTATTC
CCCGGCCTTCTATGCAGCCTGTACCATGGGAGGCATTCTCAGCTGCGGTGTCACCCACACTGGCGTAACTCCTTTGGATCTCGTCAAATGCAATATGCAGATTGACCCTGTAAAGTACAAGAGCATCTCGACTGGCTTTGGTGTTTTACTTAAAGAACAAGGAGCAAAGGGTTTATTCAGAGGGTGGGTGCCAACACTTC
TTGGATATAGTGCTCAGGGTGCTTGCAAGTTTGGCTTTTATGAGTTCTTCAAGAAGTACTACTCAGACATTGCAGGGCCTGAGTTTTCTGCCAAATACAAGACATTGATCTACTTGGCAGGATCTGCATCTGCAGAATTTATTGCTGATATTGCTCTTTGTCCTTTTGAGGCTGTAAAAGTTCGAGTACAAACACAACCT
GGCTTTGCTAGAGGATTATCTGATGGGCTTCCAAAGTTTGTCAGATCAGAAGGAGTTCTTGGgtgagttttgtcccctttcttacatattttctataaactttgaataaaatctcatggagaatttatgaaactctattgtgttcactcaattattgcagTCTGTACAAAGGTATTGGTCCACTTTGGGGACGCCAAATT
CCTTACACCATGATGAAGTTTGCGTCCTTTGGAACCATAGTAGATTTGATCTACAAGCATGCAGTTCCCATCCCCAAGGACCAATATAGCAAACCTCTACAGATGGGAGTGAGTTTTGCGGCTGGATACATTGCTGGTGTCTTTTGTGCAATTGTTTCTCACCCTGCTGACAACCTGGTTTCTTTCCTAAACAATGCCAA
GGATGCAACCGTGGGAGATGCTGTGAAGAAGATGGGTCTTGTTGGTCTCTGTACTCGGGGTCTTCCTTTACGTATTGTTATGATTGGAACACTTACTGGAGCACAATGGGGTATCTATGATGCTTTCAAGGTGTTCGTTGGCCTGCCGACTACTGGTGGAGTTACTCCCCCTGCTGCGGAACTCAAGGAGTTGAACAAAT
TGAGCTAGTTTGAAGGCGGCATTCTTGAGATCAAACTTTAAGGCTTAGTGTTCTTCCTGCAGCGCAGAAGTTAGACATGGCTGAATAAAACCATGGAGGGTTGACTCTAGATTTTTGTTTCTTCCAAACTTAGGCTGATTCACACAGCTTGCAAGCGCTCTTGCAAGTTTATTTTTTGAGGTTATTTTTTTGTCAGAAAG
GCTGGTTTCATTTTATTTTTTCCATCCCACTCAGACTTGAATTATATTTCCAAAGTTACATGGCATATTCTCTGGTATACCTTGAATTAATTTTGGTTGGGGTACGGCTAACCAGCTTGTTGGGGTGTAATTTAGCTTCCCTACGTTTCGTTGTTACTGGGAGTAGCTTCTATGCACTTGTTACTATGAGTGAGAACCCA
CATAATAAAAGGCAATCTCAGTTCTACTTTCAGATGGCATTAGTCTTGAGCAACTACCACTTCCTGAATGATTCAAGGTTAGTGTGTTTTGGGGAATATACTAAAGAAAACAGATGATGGCCGTGTTGAAAACTTAAGTGAAAGATAACTGTGGTAACTTTGTTTGTAGCTAGACTTTTGTGGTTAAACCTGTTTTTATA
ACTTCAAAATTTACATACTTAGTTTATAGTTTGATGAGAAGAACGATGAAGGTTGTTGTCGTTGATCTGGTAAAGTCTAGAGATAATGAATTTGATGTGAAATACGGTAATAATCTTTTCAATTTTTTGTGATTGCTATACTGTTATGGTCGGTTTTATTGATTCCAAGAGAAAAATAGGCTATTTAAGAATACATATTT
CTTTTTCAATAATTTGGAAACAAAATTTCAGAGGGGCAATTGCAGTTTTGACAAGTTCCAGTGTGCCAGTTATCCTTACTTGAACAACTTCCGTTGCATTTTGTAGGATCCAACCGTGGAATGTTAAATAACTCTTTCTGTGTTGCTTAGACATTCTAAGTCGAAAATGTTCGCCCTTTTGAAGGGTCTTTTCATTTAAA
AAGGTTGTTGACTTGGTTGGTTTCAGAGGTTATTGAATTACCAGCCTGTACAATTCTGTGTCTTTCTTCTTGGTTTGGTTCCAATTTTTTTGCTTAGATTGATATTATTGATTATAAACCACTATGTATTTGGTGGCTTTCATGTCAATCAACTAATCCGTTCTGCTTTGAGGTCGATAGAAGAGAGCATGATATTCATG
TCTCCTTCGGGATATATGGACTTATTTTAAGAATCCCACCAAATGTTACACTAATGTTTGGTGTGCCGTGTCCAATTTCTTTCTTTTGTTTCCCCTTTCATCTCTGCAATTACAAATCTGCTGTTTAAGTTTGTAATGTTTTTCAGAGTTTGCTTTCTTCACACCTCAGGGGTAAAGGACCAGATCAATTTTTCAACTTG
ACCTTACATTTCATTAGATCTAATTCCGTGACACGATTTTTAACCGAGAGGTTATTTTCTTGTTTGTCTAATGTTTTCTCTAAACAGGTTAACAATTCTGATTCAGTGCTATAGTTAATTATCTTTGGCAATTTTTGGTTAGGCATTTGAAAGATTAGGACAGATTTATTCACATAAAAGCCCCAAAGAGTTTAGTTGAA
ATCAATCAAGGGAAAGACAAATGTCTAATGAACTTTTTCAAGTGTTGCTTTCCTTCTGACAATGCCGATGTAACAAAAGCAAGCCTTTGTTAACCTGTTTTCTCTAAACAGGTTAAAAATTCTGATTCAGTGCTATAGTTAATTATCTTTGGTAATTTTTGGTTAGGGATTTGAAAGATTAGGACAGATTTATTCACATA
AAAGCCCCAAAGAGTTTAGTTGAAATCAATCAAGGGAAAGACATTTCTGATGAACTTTTTCAAGTGTTGCTTTCCTTCTGACAATGCCGATGTAACAGAAGGAAGCCTTTGACGAACTGTCTTTTGACAAAGCATGAATATCATCATCAATGGTAGGAGCGAGCCCCGATATTTAGGGATTAAAGGAAAACCTTTTTGGA
TGGTATAATTTTGTTTTGCTACGTGTTTTTCAATAAGATCTGGAATGACTAAGATTGAT




Intron 2 GTAAGATGGG ... TTACTTTTAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A153.04160.79181.7
A251.2276.7880.7
A352.451264139
A451.66101.37108.3
A553.440346
A650.852426250.3
A751.29282.32297.3
A851.07175.75183.3
A951.15281.35294.7
A1051.28282.73297.7



>TRINITY_DN46109_c1_g2_i8 from sample A8 / Example spliced isoform
TGAACTGTCTGTATCCTGCAAAGAAGAATCTTATTCTTAGCTGTATTTAAGGGTTCCACGTGACTACATAAATTATTATTTACCAAAATAAATCTTCCAGGAATCTGGACTTGAGATAACTTCTTCTACCGATTTCAATGTGTTTTTCCTTTCCTAACTAAATTGACCCTGTAAAGTACAAGAGCATCTCGACTGGCTTT
GGTGTTTTACTTAAAGAACAGGGAGCAAAGGGTTTATTCAGAGGGTGGGTGCCAACACTTCTTGGATATAGTGCTCAGGGTGCTTGCAAGTTTGGCTTTTATGAGTTCTTCAAGAAGTACTACTCAGACATTGCAGGGCC


>TRINITY_DN46109_c1_g2_i3 from sample A8 / Example unspliced isoform:
CTAGCCTTCCACAAAATGGTGAAACACCCATGAATAGTTCATTTTTTGCACAGGTTGAAGTGGAGTATGTACAGATGTCCCTCCTTGTCCCCAATATAACAAAAAAAATATCAACCGTTGAATGAAATCCACTTCCAGCGGTCTCCCTGCAAATATCCTCCCTTGGTTGAGCGCTTGACTAATTCTATCTAGGAAATTAT
AGGATATAGTCAATTTGAGGTTTTTATATTTTTTAATCACTACCATGTAACCATGCACAGGAAACCCCTAGAGACTTCACTGCCATTGACTAGTAGTAACCAGGGTAAACCGGTGGCATAGACTAGTATACCCGACCTAGAAGGGACATTGTGTATTGACATATGATATCACATATACCTGGCAGGGACATTGTGTATTA
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TGTAGAGTAGTGCACCTAACCCAGGGGGATTTTGAACTGGACACCTGCTGGCATGGAAACATCTTCTCCCACCCTCAAGAACGTAAGCGATAGTGAGATTGCTTGTACATTGATAGCAATCATGTCTTAGGAAGGATTTAAATTTGGGTTGGGAGGATAGCAGCTTCTCCTCTTTGCCACCCAAATTAGACCCAACTGTT
AGCTACAAAATCTACGTATATTCTGCATGTGTATATATTAAATTGCACCTATTAATCTGGGGATCTGTTAAAGTGGTAGTCACAAAAATGGATTCTACAACTAGTTCTGGAATGTTTACTTGAACTATCATATTCAACTGGGGGATTTATCCAAATCAGTTACAAAATACTAAATAGTTTCTTCAGTGAGTTATATACTT
GCTTGAAATGCCCTATGGTTGAATATATGCATTTCTTAATAACTGAAGAAGTTTTTGTTTGTGTTTTAACTTTTCATTAATGCCAGACAAGGTTGTCATTGTGTAACCTACTTTTGGTTGGGAAAGAGAAAATCACAAATTATTTAAAGGATATTAACTCAAGAACTAGTGAACAAACACCGGAATACTTTTAATGATGT
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TTCTACCGATTTCAATGTGTTTTTCCTTTCCTAACTAAgtaagatgggcatttcttcacatttttcattcctgactttcacttaattctaaattttaatgttttccagcaaaaaataatatttcatcccttctgtttgttttgttgttacttttagATTGACCCTGTAAAGTACAAGAGCATCTCGACTGGCTTTGGTGT
TTTACTTAAAGAACAGGGAGCAAAGGGTTTATTCAGAGGGTGGGTGCCAACACTTCTTGGATATAGTGCTCAGGGTGCTTGCAAGTTTGGCTTTTATGAGTTCTTCAAGAAGTACTACTCAGACATTGCAGGGCCTGAGTTTTCTGCCAAATACAAGACATTGATCTACTTGGCAGGATCTGCATCTGCAGAATTTATTG
CTGATATTGCTCTTTGTCCTTTTGAGGCTGTAAAAGTTCGAGTACAAACACAACCTGGCTTTGCTAGAGGATTATCTGATGGGCTTCCAAAGTTTGTCAGATCAGAAGGAGTTCTTGGTCTGTACAAAGGTATTGGTCCACTTTGGGGACGCCAAATTCCTTACACCATGATGAAGTTTGCGTCCTTTGAAACCATAGTA
GAGTTGATCTACAAGCATGCAGTCCCCATCCCCAAGGACCAATGTAGCAAACCTCTACAGCTGGGAGTGAGTTTTGCGGCTGGATACATTGCTGGTGTCTTTTGTGCAATTGTTTCTCACCCTGCTGACAACCTGGTTTCTTTCCTAAACAATGCTAAGGGTGCAACCGTGGGAGATGCTGTGAAGAAGATGGGTCTTGT
TGGTCTCTGTACTCGGGGTCTTCCTTTACGTATTGTTATGATTGGAACACTTACTGGAGCACAATGGGGTATCTATGATGCTTTCAAGGTGTTCGTTGGCCTGCCGACTACTGGTGGAGTTACTCCCCCTGCTGCGGAACTCAAGGAGTTGAACAAATTGAGCTAGTTTGAAGGCGACATTCTTGAGATCAAACTTTAAG
GCTTAGTGTTCTTCCTGCAGCGCAGAAGTTAGACATGGCTGAATAAAACCATGGAGGGTTGACTCTAGATTTTTGTTTCTTCCAAACTTAGGCTGATTCACACAGCTTGCAAGCACTCTTGCAAGTTTATTTTTTGAGGTTATTTTTTTGTCAGAAAGGCTGGTTTCATTTTATTTTTTCCATCCCACTCAGACTTGAAT
TATATTTCCAAAGTTACATGGCATATTCTCTGGTATACCTTGAATTAATTTTGGTTGGGGTACGTCTAACCAGCTTGTTGGGGTGTAATTTAGCTTCCCTACGTTTCGTTGTTACTGGGAGTAGCTTCTATGCACTTGTTACTATGAGTGAGAACCCACATAATAAAAGGCAATCTCAGTTCTGCTTTCAGATGGCATTA
GTCTTGAGCAACTACCACTTCCTGAATGATTCAAGGTTAGTGTGTTTTGGGGAATATACTAAAGAAAACAGATGATGGCCGTGTTGAAAACTTAAGTGAAAGATAACTGTGGTAACTTTGTTTGTAGCTAGACTTTTGTGGTTAAACCTGTTTTTATAACTTCAAAATTTACATACTTAGTTTATAGTTTGATGAGAAGA
ACGATGAAGGTTGTTGTAGTTGATCTGGTAAAGTCTAGAGATAATGAATTTGATGTGAAATAGGGTAATAATCTTTTCAATTTTTTGTGATTGCTATAATGTTATGGCGGTTTTATTGATTCCAAGAGAAAAAGAGGCTATTTAAGAATACATATTGCTTTTCAATAATTTGGAAACCAAATTTCACAGGGGCAATTGCA
GTTTTGACAAGTCCCAGTGTGCCAGTTATCCTTACTTGAACAGCTTGCGTTGCATTTTGTAGGATCCAACTGTGGAAGGTTAAATAACTCTTTCTGTGTTGCTTAGACATTCTAAGTTGAAAATATTCGCGCTTTTGAAGG