NA ----> NA
Intron 1 GTTAGGAGGG ... GCATTTTCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 63.64 | 2 | 1 | 6 |
| A2 | 81.82 | 1 | 4 | 5 |
| A3 | 85.71 | 1 | 3 | 9 |
| A4 | 100 | 0 | 0 | 2 |
| A5 | 33.33 | 1 | 0 | 1 |
| A6 | 60 | 5 | 7 | 8 |
| A7 | 72.22 | 5 | 12 | 14 |
| A8 | 47.62 | 11 | 13 | 7 |
| A9 | 70 | 3 | 6 | 8 |
| A10 | 60 | 4 | 6 | 6 |
>TRINITY_DN9859_c0_g1_i2 from sample A10 / Example spliced isoformCAGGTACATTGTTTATGTGCATATTTGGCATCCTTGTCTTTGCTGGCGGTACCAAGGTCACAGATAAGGTGAACCAATTACTTACACCTTGTTTGATGGGTCTATTTTTGGTGATAGTAGCAGTAACGCCTTTACTTGGAAGTTGGTCTGGGCTCAATCACATGAACTGGGATATGGTACCAAACACAATTCCAGTGATT
CTTTTTTCTCTTGTCTATCATGATTTGACTCCAGTGCTTTGTGCATATTTGGGAGGGGACATGTCACGTATCAGGATATCTATCATTCTGGGAAGTATAATACCTTTAGCAACATTTCTTATTTGGGATGCTGCTATTCTTGGGCTTGCTCCGACTTTGAGTGGTGGAGATCCTTTGGAATTTCTTATAAGAATATTTCT
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GTTTCAGTTCTTGACAAGTGGTGGATGGATAATGGTTTGCATCTTACCTCTTTTGTGCTAGTGATTGTTCCACCTTTGTTGGTTTCAACTATGGTGACAGATGCATTCTTCACTGCAACCGATATTGCGGGTGCTTATGGAATGACAACACTCTATGGAATCTTCCCACCTGCAATGGCATGGACATTGACCAAATCACA
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ATCAAATCTGAATTGCCA
>TRINITY_DN9859_c0_g1_i1 from sample A10 / Example unspliced isoform:CAGGTACATTGTTTATGTGCATATTTGGCATCCTTGTCTTTGCTGGCGGTACCAAGGTCACAGATAAGGTGAACCAATTACTTACACCTTGTTTGATGGGTCTATTTTTGGTGATAGTAGCAGTAACGCCTTTACTTGGAAGTTGGTCTGGGCTCAATCACATGAACTGGGATATGGTACCAAACACAATTCCAGTGATT
CTTTTTTCTCTTGTCTATCATGATTTGACTCCAGTGCTTTGTGCATATTTGGGAGGGGACATGTCACGTATCAGGATATCTATCATTCTGGGAAGTATAATACCTTTAGCAACATTTCTTATTTGGGATGCTGCTATTCTTGGGCTTGCTCCGACTTTGAGTGGTGGAGATCCTTTGGAATTTCTTATAAGgttaggagg
gaccaatgtttcctatctaatccaagtattttctctcttggctactgcaacttcattaattggtactttattagcattttcagAATATTTCTTGGAGCTGTTAAGCAACTCACCCAAAATTATGGCCAAAGTAAGACGAAATATAAGGATTACGCCCTTCTCTATGATGTACGCAAAAACCAAACAGTTTGTCATGTCAT
TACATCCAATCAATGGGATTATTTCTTCTTGGGCTTATCGAGCATGCTCTTGGAGATCTTCTACATCTTTCATTAATGGATCATACAAAATGGTTTCAGTTCTTGACAAGTGGTGGATGGATAATGGTTTGCATCTTACCTCTTTTGTGCTAGTGATTGTTCCACCTTTGTTGGTTTCAACTATGGTGACAGATGCATTC
TTCACTGCAACCGATATTGCGGGTGCTTATGGAATGACAACACTCTATGGAATCTTCCCACCTGCAATGGCATGGACATTGACCAAATCACAGAATACGTTACCGTTAGCAGAATCTATGCCTCTTGCAGGCCTTGGACGAAAGTTTGCATTAGTTGGAATTGGACTTTGTGCCTGTGGGGTAGTATTGGATCAACTATT
GCTAGACTCAGCTAAAATTCCATTTGGCAGCAATGCAGATATTAGTGTTATAACTGAAATAAACAATTCAATTCCTGCCCTGTAATAGAGTTGCATATGTACTATAGAACCTCATTGATTTCCTCCCAATTCCACGAACCTATTGGGATGTAATTATATATTTCATGTGATATTGGGTTCTTGAGCGTAACTGTACTTTG
TCTCTGTTCCCCAAGATGTGTCTACAATAGTGTCTTTTATGGTAGATCGTTTTTGTCGATACACCTCAGCACTGTTCAAGCATGTCAAGCATATCAAATCTGAATTGCCA