sp|Q9C718|RH20_ARATH ----> DEAD-box ATP-dependent RNA helicase 20

Intron 1 GTTGAAGCTT ... CCTTCCATAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	21.14	332.2	51.8	89
A2	17.86	179.4	29	39
A3	20.5	252.4	41.2	65
A4	23.18	179.4	22.2	54
A5	17.87	110.4	11.2	24
A6	20.81	297	42.4	78
A7	18.02	573.6	96	126
A8	18.07	277	44	61
A9	18.11	493.4	86.4	109
A10	17.74	552.2	75.2	119

>TRINITY_DN118591_c2_g1_i5 from sample A1 / Example spliced isoform

TTTCTATCAATTAACTAATCCATCTCCATCAAATTCAATCCTCCATTGCATTTCATAGCTTCTGTCCTTCACATATTGTTTCAAGGGTTTGTGTGTTTCTACGCGCAGTAGTCGTCATGCCTTACGTTCCACCTCACCAAAGGAATGGAGGAGCAGCAGCAACAGCTGCGCCAGCTCCTTCCGCTTTCGGTAACGCCGGT
AGAACCGCTGATCTAGGCGCCCACAGGCCAGCGGATGGTTATTACCATAACAGCGCAGGTAAGAGCTTCGGAAACAATAAGGATTACGGTCCCAGCTTTGGAAACTCAAATAGGCGAGGTTCGAATCTCCGGGAGGACGGCAATTGCAACGGCGCTGGTTTCCCTCACAGGCGCCCCGATGCCCGCGGCTCCGCTATTCC
CGACCCCGTCGTATCCCAATGGCAACCTTCTGAACGCATTCGCCGTCTTCAAAACGAGCAGATTGAAGAGGTTATGGCCAGGCTAAACGTTGATGTCCACATAACCCCGGGCACCCCTCCTGCACCTGCACCTGTGGAGTCATTTGAGGATATGTGTTTAAATCCTAGCATCATGAAAGATATTATTTTCCATGATTACT
CTACACCAACTCCTATTCAAGCTCAAGCCATGCCAGTTGCTCTGAGTGGAAGAGACCTCCTTGGTTGCGCAGAGACAGGGAGTGGGAAAACTGCAGCATTCTCTATTCCCATGATTCAGCACTGTTTGGCACAACCACCTATTCGGCATGGGGATGGACCTTTGGCTTTAGTTCTGGCACCAACTCGAGAGCTTGCTCAG
CAGATAGAAAAAGAGGTCAAGGCTTTCAGCAGATCATTGGAGTCATTCAGGACTGCTATTGTTGTTGGAGGAACAAACATTTCTGAGCAGAGATCGGAGCTGAGAGCTGGAGTGGAAATTGTTGTTGCTACACCTGGAAGATTTATAGATCATCTACAACAAGGAAACAGCTCTCTTTCTAGGATCTCATATGTTGTATT
AGATGAGGCAGATAGAATGTTAGATATGGGTTTTGAGCCGCAGATAAGAGAGGTCATGCGGAGTCTTCCTAAAATGCACCAGACGTTATTGTTCAGTGCCACAATGCCAGAGGAGATTGAAGCACTTGCTCAGGAGTATCTGAATAATCCAGTGCAAGTAAAGGTGGGGAAAGTAAGCAGTCCAACAGCAAATGTTTCAC
AGGTCCTAGAGAAGGTTACCGAAGAAGAAAAGACTGATCGTCTATTAGCTTTACTTGTGGAGGAATCATCCCAAGCAGAGAAGTCTGGACAACCTCTTCCTCTGACCATTGTTTTTGTTGAACGAAAGACAAGGTGTGACGAAGTTACAGATGCATTAGTTGCACAAGGTCTTCACGCAGTTGCGCTGCATGGTGGTCGA
AGTCAAGTGGAAAGAGAAGCTGCTTTACGTGAGTTTCGGAATGGCTCCACTAATATTCTGGTTGCTACAGATGTGGCCTCTCGAGGCTTGGATGTGACTGGTGTTTCCCATGTTGTTAACCTGGATCTTCCGAAGGCTATGGAGGATTATGTGCATCGTATTGGAAGAACCGGCCGTGCAGGAACCAGTGGCCGAGCAAC
TTCCTTTTACACAGAGCGTGATATGTTCCTGGTAGCTCATATTCGGAAGGCAATAGCAGATGCAGAAGCTGGAAACACCATGGCATTTGCAACTGGAAAGGCTGCAAGGAGAAAGGAGAGAGAACAAGCAGCAGCATTCCGGGAAGGAAGACTTGCTCCTACTGGAACAAGTGTCGTTGGATCAACTACCATTCGTGTTG
AAGACAAATATAAGTACATGTTGGCACATGCGAATCTCAAGCAAGAAGGTGCCGCAGATAATGCCTGGGATGATTGATGTCTGCTTTTTATATTGTTTAATCACGTTGGGGTATGGAGGAGATATCAGAGGACTGCCTACTTAACTATTCTTTCTATAGGAGGTGGACGAAGATTTAATGTGCTTGCCATGAGCATTCGG
TGTGGGTGCCCTTGGTTTTGTGTCAACTTGAAGCATTGTAAATTCAGCATACAGTGTATGCATGAAAAAATGTGTGGAGATGGCACTGTACAAATTATGTACATGGCAGTATTTATCTTTTGTTGTTCTATCACAAGAGAAGCATTGTATCTGCAGCTGACTGTTCAAAATACTGATCAAGAAAGATAGTTGCAGGCCTT
TTAACGAACACTTGCAGTTTATTTACTGGATAGCTCTGACCAACAGATTCAAGTTTTCTTTTTTCTAAAGCAATAATTAATTTTCTTCGCTGAAGTAATTGGTTATCAGTTATAGTTATGCATGGTAAAGATTGGCAAACTTTTGTGCTAAATTACCGATTGACACTAACTATCATAAAGCACACAGCCTATTCTCTAAA
GTGAGTATGGAATATTTTAATATAGTGAAATGCTGTAGCTCTGTCACATGTCGGTCCCAAATGTGATAGCAGTCTTGTATTGTGCTCGGAGTGAGTTAAATTTTGTTCGAACATGTTTCTCTTAATTCTCTGAGCAATTGCCATGTGCTAATGTTAAATGCTAACAGTTTTCATTCTCAAGCCTTCTAAGTAGTCACGCT
TATTTCACCTGGGATTCTATTGATCAGTAAAGCTACAGACAACCGACTTGGACATTTGACTCGACTGTTAGCTTTGTTCGGAGTTTAAAAAAATCTACGAACCTATCAGTTTCCTGTGAGGTTCTTAAATCATAGTAAATTGATAATCCATCACTTTTTTGCATCTC

>TRINITY_DN118591_c2_g1_i2 from sample A1 / Example unspliced isoform:

CATTCTCTATTCCCATGATTCAGgttgaagcttaatttctcaccgatgtgaatagtttattttgatttttttcttgtttctgaaaattataatagtattttctagttcatttagtacaagcttgttatcaaatcgatggttatgctgtttccagatacattttccgtttcatgcgatcattttaaatggattgtgctaat
tatttgcatccttccatagCACTGTTTGGCACAACCACCTATTCGGCATGGGGATGGACCTTTGGCTTTAGTTCTGGCACCAACTCGAGAGCTTGCTCAGCAGATAGAAAAAGAGGTCAAGGCTTTCAGCAGATCATTGGAGTCATTCAGGACTGCTATTGTTGTTGGAGGAACAAACATTTCTGAGCAGAGATCGGAGC
TGAGAGCTGGAGTGGAAATTGTTGTTGCTACACCTGGAAGATTTATAGATCATCTACAACAAGGAAACAGCTCTCTTTCTAGGATCTCATATGTTGTATTAGATGAGGCAGATAGAATGTTAGATATGGGTTTTGAGCCGCAGATAAGAG

Intron 2 GTTTGTATTG ... TGTTTTCCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	14.09	189	0	31
A2	14.12	152	4	25
A3	16.73	214	2	43
A4	17.86	138	2	30
A5	14.71	116	0	20
A6	15.66	280	0	52
A7	16.33	574	0	112
A8	10.63	269	0	32
A9	14.29	552	0	92
A10	14.89	526	0	92

>TRINITY_DN115487_c4_g1_i2 from sample A2 / Example spliced isoform

GCATATTCTTTCTATCAATTAACTAATCCATCTCCATCAAATTCAATCCTCCATTGCATTTCATAGCTTCTGTCCTTCACATATTGTTTCAAGGGTTTGTGTGTTTCTACGCGCAGTAGTCGTCATGCCTTACGTTCCACCTCACCAAAGGAATGGAGGAGCAGCAGCAACAGCTGCGCCAGCTCCTTCCGCTTTCGGTA
ACGCCGGTAGAACCGCTGATCTAGGCGCCCACAGGCCAGCGGATGGTTATTACCATAACAGCGCAGGTAAGAGCTTCGGAAACAATAAGGATTACGGTCCCAGCTTTGGAAACTCAAATAGGCGAGGTTCGAATCTCCGGGAGGACGGCAATTGCAACGGCGCTGGTTTCCCTCACAGGCGCCCCGATGCCCGCGGCTCC
GCTATTCCCGACCCCGTCGTATCCCAATGGCAACCTTCTGAACGCATTCGCCGTCTTCAAAACGAGCAGATTGAAGAGGTTATGGCCAGGCTAAACGTTGATGTCCACATAACCCCGGGCACCCCTCCTGCACCTGCACCTGTGGAGTCATTTGAGGATATGTGTTTAAATCCTAGCATCATGAAAGATATTATTTTCCA
TGATTACTCTACACCAACTCCTATTCAAGCTCAAGCCATGCCAGTTGCTCTGAGTGGAAGAGACCTCCTTGGTTGCGCAGAGACAGGGAGTGGGAAAACTGCAGCATTCTCTATTCCCATGATTCAGCACTGTTTGGCACAACCACCTATTCGGCATGGGGATGGACCTTTGGCTTTAGTTCTGGCACCAACTCGAGAGC
TTGCTCAGCAGATAGAAAAAGAGGTCAAGGCTTTCAGCAGATCATTGGAGTCATTCAGGACTGCTATTGTTGTTGGAGGAACAAACATTTCTGAGCAGAGATCGGAGCTGAGAGCTGGAGTGGAAATTGTTGTTGCTACACCTGGAAGATTTATAGATCATCTACAACAAGGAAACAGCTCTCTTTCTAGGATCTCATAT
GTTGTATTAGATGAGGCAGATAGAATGTTAGATATGGGTTTTGAGCCGCAGATAAGAGAGGTCATGCGGAGTCTTCCTAAAATGCACCAGACGTTATTGTTCAGTGCCACAATGCCAGAGGAGATTGAAGCACTTGCTCAGGAGTATCTGAATAATCCAGTGCAAGTAAAGGTGGGGAAAGTAAGCAGTCCAACAGCAAA
TGTTTCACAG

>TRINITY_DN115487_c4_g1_i4 from sample A2 / Example unspliced isoform:

CTGTGGAGTCATTTGAGGATATGgtttgtattgttattttatttgagcattttctagtgtgtgcttgaatgtttttgaacgttttctgttttgattgcattacttttcctgttatagtaattatttactgttttccagTGTTTAAATCCTAGCATCATGAAAGATATTATTTTCCATGATTACTCTACACCAACTCCTAT
TCAAGCTCAAGCCATGCCAGTTGCTCTGAGTGGAAGAGACCTCCTTGGTTGCGCAGAGACAGGGAGTGGGAAAACTGCAGCATTCTCTATTCCCATGATTCAGCACTGTTTGGCACAACCACCTATTCGGCATGGGGATGGACCTTTGGCTTTAGTTCTGGCACCAACTCGAGAGCTTGCTCAGCAGATAGAAAAAGAGG
TCAAGGCTTTCAGCAGATCATTGGAGTCATTCAGGACTGCTATTGTTGTTGGAGGAACAAACATTTCTGAGCAGAGATCGGAGCTGAGAGCTGGAGTGGAAATTGTTGTTGCTACACCTGGAAGATTTATAGATCATCTACAACAAGGAAACAGCTCTCTTTCTAGGATCTCATATGTTGTATTAGATGAGGCAGATAGA
ATGTTAGATATGGGTTTTGAGCCGCAGATAAGAGAGGTCATGCGGAGTCTTCCTAAAATGCACCAGACGTTATTGTTCAGTGCCACAATGCCAGAGGAGATTGAAGCACTTGCTCAGGAGTATCTGAATAATCCAGTGCAAGTAAAGGTGGGGAAAGTAAGCAGTCCAACAGCAAATGTTTCACAG

Intron 3 GTTTGTTATA ... AACATAACAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	17.43	616	179	81
A2	18.2	454	148	54
A3	17.05	462.5	132	58
A4	16.78	362	102	44
A5	18.2	200	69	20
A6	18.12	1100	305	182
A7	17.62	1618	462	230
A8	19.45	1592	462	307
A9	18.4	1457	430	227
A10	18.07	1281	384	181

>TRINITY_DN44506_c1_g6_i3 from sample A10 / Example spliced isoform

TTTCTATCAATTAACTAATCCATCTCCATCAAATTCAATCCTCCATTGCATTTCATAGCTTCTGTCCTTCACATATTGTTTCAAGGGTTTGTGTGTTTCTACGCGCAGTAGTCGTCATGCCTTACGTTCCACCTCACCAAAGGAATGGAGGAGCAGCAGCAACAGCTGCGCCAGCTCCTTCCGCTTTCGGTAACGCCGGT
AGAACCGCTGATCTAGGCGCCCACAGGCCAGCGGATGGTTATTACCATAACAGCGCAGGTAAGAGCTTCGGAAACAATAAGGATTACGGTCCCAGCTTTGGAAACTCAAATAGGCGAGGTTCGAATCTCCGGGAGGACGGCAATTGCAACGGCGCTGGTTTCCCTCACAGGCGCCCCGATGCCCGCGGCTCCGCTATTCC
CGACCCCGTCGTATCCCAATGGCAACCTTCTGAACGCATTCGCCGTCTTCAAAACGAGCAGATTGAAGAGGTTATGGCCAGGCTAAACGTTGATGTCCACATAACCCCGGGCACCCCTCCTGCACCTGCACCTGTGGAGTCATTTGAGGATATGTGTTTAAATCCTAGCATCATGAAAGATATTATTTTCCATGATTACT
CTACACCAACTCCTATTCAAGCTCAAGCCATGCCAGTTGCTCTGAGTGGAAGAGACCTCCTTGGTTGCGCAGAGACAGGGAGTGGGAAAACTGCAGCATTCTCTATTCCCATGATTCAGCACTGTTTGGCACAACCACCTATTCGGCATGGGGATGGACCTTTGGCTTTAGTTCTGGCACCAACTCGAGAGCTTGCTCAG
CAGATAGAAAAAGAGGTCAAGGCTTTCAGCAGATCATTGGAGTCATTCAGGACTGCTATTGTTGTTGGAGGAACAAACATTTCTGAGCAGAGATCGGAGCTGAGAGCTGGAGTGGAAATTGTTGTTGCTACACCTGGAAGATTTATAGATCATCTACAACAAGGAAACAGCTCTCTTTCTAGGATCTCATATGTTGTATT
AGATGAGGCAGATAGAATGTTAGATATGGGTTTTGAGCCGCAGATAAGAGAGGTCATGCGGAGTCTTCCTAAAATGCACCAGACGTTATTGTTCAGTGCCACAATGCCAGAGGAGATTGAAGCACTTGCTCAGGAGTATCTGAATAATCCAGTGCAAGTAAAGGTGGGGAAAGTAAGCAGTCCAACAGCAAATGTTTCAC
AGGTCCTAGAGAAGGTTACCGAAGAAGAAAAGACTGATCGTCTATTAGCTTTACTTGTGGAGGAATCATCCCAAGCAGAGAAGTCTGGACAACCTCTTCCTCTGACCATTGTTTTTGTTGAACGAAAGACAAGGTGTGACGAAGTTACAGATGCATTAGTTGCACAAGGTCTTCACGCAGTTGCGCTGCATGGTGGTCGA
AGTCAAGTGGAAAGAGAAGCTGCTTTACGCGAGTTTCGGAATGGCTCCACTAATATTCTGGTTGCTACAGATGTGGCCTCTCGAGGCTTGGATGTGACTGGTGTTTCCCATGTTGTTAACCTGGATCTTCCGAAGGCTATGGAGGATTATGTGCATCGTATTGGAAGAACCGGCCGTGCAGGAACCAGTGGCCGAGCAAC
TTCCTTTTACACAGAGCGTGATATGTTCCTGGTAGCTCATATTCGGAAGGCAATAGCAGATGCAGAAGCTGGAAACACCATGGCATTTGCAACTGGAAAGGCTGCAAGGAGAAAGGAGAGAGAACAAGCAGCAGCATTCCGGGAAGGAAGACTTGCTCCTACTGGAACAAGTGTCGTTGGATCAACTACCATTCGTGTTG
AAGACAAATATAAGTACATGTTGGCACATGCGAATCTCAAGCAAGAAGGTGCCGCAGATAATGCCTGGGATGATTGATGTCTGCTTTTTATATTGTTTAATCACGTTGGGGTATGGAGGAGATATCAGAGGACTGCCTACTTAACTATTCTTTCTATAGGAGGTGGACGAAGATTTAATGTGCTTGCCATGAGCATTCGG
TGTGGGTGCCCTTGGTTTTGTGTCAACTTGAAGCATTGTAAATTCAGCATACAGTGTATGCATGAAAAAATGTGTGGAGATGGCACTGTACAAATTATGTACATGGCAGTATTTATCTTTTGTTGTTCTATCACAAGAGAAGCATTGTATCTGCAGCTGACTGTTCAAAATACTGATCAAGAAAGATAGTTGCAGGCCTT
TTAACGAACACTTGCAGTTTATTTACTGGATAGCTCTGACCAACAGATTCAAGTTTTCTTTTTTCTAAAGCAATAATTAATTTTCTTCGCTGAAGTAATTGGTTATCAGTTATAGTTATGCATGGTAAAGATTGGCAAACTTTTGTGCTAAATTACCGATTGACACTAACTATCATAAAGCACACAGCCTATTCTCTAAA
GTGAGTATGGAATATTTTAATATAGTGAAATGCTGTAGCTCTGTCACATGTCGGTCCCAAATGTGATAGCAGTCTTGTATTGTGCTCGGAGTGAGTTAAATTTTGTTTGAACATGTCTCTCTTAATTCTCTGAGCAATGGCCATGTGCTAATGTTAAATGTTAACAGTTTTCATTCTCAAGCCTTCTAAGTAGTCACGCT
TATTTCACCTGGGATTCTATTGATCAGTAAAGCTACAGACAACCGACTTGGACATTTGACTCGACTGTTAGCTTTGTTCGGAGTTTAAAAAAATCTACGAACCTATCAGTTTCCTGTGAGGTTCTTAAATCATAGTAAATTGATAATCCATCACTTTTTTGCATCTCATATATATACATGTAACACTTTTGTTCATCACT
TATTCAATCTTTTGCATGTTGGTGCGGGGAGT

>TRINITY_DN44506_c1_g6_i4 from sample A10 / Example unspliced isoform:

AGACTGATCGTCTATTAGCTTTACTTGTGGAGGAATCATCCCAAGCAGAGAAGTCTGGACAACCTCTTCCTCTGACCATTGTTTTTGTTGAACGAAAGACAAGGTGTGACGAAGTTACAGATGCATTAGTTGCACAAGGTCTTCACGCAGTTGCGCTGCATGGTGGTCGAAGTCAAGTGGAAAGAGAAGCTGCTTTACGC
GAGTTTCGGAATGGCTCCACTAATATTCTGGTTGCTACAGATGTGGCCTCTCGAGGCTTGGATGTGACTGGTGTTTCCCATGTTGTTAACCTGGATCTTCCGAAGgtttgttatagtcctatctaataggattcctttagtggaactaatgcgtgcatctggaaattattttgtgtatggacacattacgttgagctttg
tatgcactttaatttatttttaatcaacataacagGCTATGGAGGATTATGTGCATCGTATTGGAAGAACCGGCCGTGCAGGAACCAGTGGCCGAGCAACTTCCTTTTACACAGAGCGTGATATGTTCCTGGTAGCTCATATTCGGAAGGCAATAGCAGATGCAGAAGCTGGAAACACCATGGCATTTGCAACTGGAAAG
GCTGCAAGGAGAAAGGAGAGAGAACAAGCAGCAGCATTCCGGGAAGGAAGACTTGCTCCTACTGGAACAAGTGTCGTTGGATCAACTACCATTCGTGTTGAAGACAAATATAAGTACATGTTGGCACATGCGAATCTCAAGCAAGAAGGTGCCGCAGATAATGCCTGGGATGATTGATGTCTGCTTTTTATATTGTTTAA
TCACGTTGGGGTATGGAGGAGATATCAGAGGACTGCCTACTTAACTATTCTTTCTATAGGAGGTGGACGAAGATTTAATGTGCTTGCCATGAGCATTCGGTGTGGGTGCCCTTGGTTTTGTGTCAACTTGAAGCATTGTAAATTCAGCATACAGTGTATGCATGAAAAAATGTGTGGAGATGGCACTGTACAAATTATGT
ACATGGCAGTATTTATCTTTTGTTGTTCTATCACAAGAGAAGCATTGTATCTGCAGCTGACTGTTCAAAATACTGATCAAGAAAGATAGTTGCAGGCCTTTTAACGAACACTTGCAGTTTATTTACTGGATAGCTCTGACCAACAGATTCAAGTTTTCTTTTTTCTAAAGCAATAATTAATTTTCTTCGCTGAAGTAATT
GGTTATCAGTTATAGTTATGCATGGTAAAGATTGGCAAACTTTTGTGCTAAATTACCGATTGACACTAACTATCATAAAGCACACAGCCTATTCTCTAAAGTGAGTATGGAATATTTTAATATAGTGAAATGCTGTAGCTCTGTCACATGTCGGTCCCAAATGTGATAGCAGTCTTGTATTGTGCTCGGAGTGAGTTAAA
TTTTGTTTGAACATGTCTCTCTTAATTCTCTGAGCAATGGCCATGTGCTAATGTTAAATGTTAACAGTTTTCATTCTCAAGCCTTCTAAGTAGTCACGCTTATTTCACCTGGGATTCTATTGATCAGTAAAGCTACAGACAACCGACTTGGACATTTGACTCGACTGTTAGCTTTGTTCGGAGTTTAAAAAAATCTACGA
ACCTATCAGTTTCCTGTGAGGTTCTTAAATCATAGTAAATTGATAATCCATCACTTTTTTGCATCTCATATATATACATGTAACACTTTTGTTCATCACTTATTCAATCTTTTGCATGTTGGTGCGGGGAGT

Intron 4 GTGAGGGTAA ... AAATTCCTAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	14.84	640	69	154
A2	15.25	467	57	111
A3	16.83	415	62	106
A4	14.89	380	59	74
A5	16.04	225	35	51
A6	16.88	958	107	282
A7	16.47	1395	135	415
A8	15.08	1357	170	312
A9	15.92	1262	170	308
A10	16.62	1091	144	291

>TRINITY_DN40189_c2_g2_i1 from sample A9 / Example spliced isoform

GCATATTCTTTCTATCAATTAACTAATCCATCTCCATCAAATTCAATCCTCCATTGCATTTCATAGCTTCTGTCCTTCACATATTGTTTCAAGGGTTTGTGTGTTTCTACGCGCAGTAGTCGTCATGCCTTACGTTCCACCTCACCAAAGGAATGGAGGAGCAGCAGCAACAGCTGCGCCAGCTCCTTCCGCTTTCGGTA
ACGCCGGTAGAACCGCTGATCTAGGCGCCCACAGGCCAGCGGATGGTTATTACCATAACAGCGCAGGTAAGAGCTTCGGAAACAATAAGGATTACGGTCCCAGCTTTGGAAACTCAAATAGGCGAGGTTCGAATCTCCGGGAGGACGGCAATTGCAACGGCGCTGGTTTCCCTCACAGGCGCCCCGATGCCCGCGGCTCC
GCTATTCCCGACCCCGTCGTATCCCAATGGCAACCTTCTGAACGCATTCGCCGTCTTCAAAACGAGCAGATTGAAGAGGTTATGGCCAGGCTAAACGTTGATGTCCACATAACCCCGGGCACCCCTCCTGCACCTGCACCTGTGGAGTCATTTGAGGATATGTGTTTAAATCCTAGCATCATGAAAGATATTATTTTCCA
TGATTACTCTACACCAACTCCTATTCAAGCTCAAGCCATGCCAGTTGCTCTGAGTGGAAGAGACCTCCTTGGTTGCGCAGAGACAGGGAGTGGGAAAACTGCAGCATTCTCTATTCCCATGATTCAGCACTGTTTGGCACAACCACCTATTCGGCATGGGGATGGACCTTTGGCTTTAGTTCTGGCACCAACTCGAGAGC
TTGCTCAGCAGATAGAAAAAGAGGTCAAGGCTTTCAGCAGATCATTGGAGTCATTCAGGACTGCTATTGTTGTTGGAGGAACAAACATTTCTGAGCAGAGATCGGAGCTGAGAGCTGGAGTGGAAATTGTTGTTGCTACACCTGGAAGATTTATAGATCATCTACAACAAGGAAACAGCTCTCTTTCTAGGATCTCATAT
GTTGTATTAGATGAGGCAGATAGAATGTTAGATATGGGTTTTGAGCCGCAGATAAGAGAGGTCATGCGGAGTCTTCCTAAAATGCACCAGACGTTATTGTTCAGTGCCACAATGCCAGAGGAGATTGAAGCACTTGCTCAGGAGTATCTGAATAATCCAGTGCAAGTAAAGGTGGGGAAAGTAAGCAGTCCAACAGCAAA
TGTTTCACAGGTCCTAGAGAAGGTTACCGAAGAAGAAAAGACTGATCGTCTATTAGCTTTACTTGTGGAGGAATCATCCCAAGCAGAGAAGTCTGGACAACCTCTTCCTCTGACCATTGTTTTTGTTGAACGAAAGACAAGGTGTGACGAAGTTACAGATGCATTAGTTGCACAAGGTCTTCACGCAGTTGCGCTGCATG
GTGGTCGAAGTCAAGTGGAAAGAGAAGCTGCTTTACGCGAGTTTCGGAATGGCTCCACTAATATTCTGGTTGCTACAGATGTGGCCTCTCGAGGCTTGGATGTGACTGGTGTTTCCCATGTTGTTAACCTGGATCTTCCGAAGGCTATGGAGGATTATGTGCATCGTATTGGAAGAACTGGCCGTGCAGGAACCAGTGGC
CGAGCAACTTCCTTTTACACAGAGCGTGATATGTTCCTGGTAGCTCATATTCGGAAGGCAATAGCAGATGCAGAAGCTGGAAACACCATGGCATTTGCAACTGGAAAGGCTGCAAGGAGAAAGGAGAGAGAACAAGCAGCAGCATTCCGGGAAGGAAGACTTGCTCCTACTGGAACAAGTGTCGTTGGATCAACTACCAT
TCGTGTTGAAGACAAATATAAGTACATGTTGGCACATGCGAATCTCAAGCAAGAAGGTGCCGCAGATAATGCCTGGGATGATTGATGTCTGCTTTTTATATTGTTTAATCACGTTGGGGTATGGAGGAGATATCAGAGGACTGCCTACTTAACTATTCTTTCTATAGGAGGTGGACGAAGATTTAATGTGCTTGCCATGA
GCATTCGGTGTGGGTGCCCTTGGTTTTGTGTCAACTTGAAGCATTGTAAATTCAGCATACAGTGTATGCATGAAAAAATGTGTGGAGATGGCACTGTACAAATTATGTACATGGCAGTATTTATCTTTTGTTGTTCTATCACAAGAGAAGCATTGTATCTGCAGCTGACTGTTCAAAATACTGATCAAGAAAGATAGTTG
CAGGCCTTTTAACGAACACTTGCAGTTTATTTACTGGATAGCTCTGACCAACAGATTCAAGTTTTCTTTTTTCTAAAGCAATAATTAATTTTCTTCGCTGAAGTAATTGGTTATCAGTTATAGTTATGCATGGTAAAGATTGGCAAACTTTTGTGCTAAATTACCGATTGACACTAACTATCATAAAGCACACAGCCTAT
TCTCTAAAGTGAGTATGGAATATTTTAATATAGTGAAATGCTGTAGCTCTGTCACATGTCGGTCCCAAATGTGATAGCAGTCTTGTATTGTGCTCGGAGTGAGTTAAATTTTGTTTGAACATGTCTCTCTTAATTCTCTGAGCAATGGCCATGTGCTAATGTTAAATGTTAACAGTTTTCATTCTCAAGCCTTCTAAGTA
GTCACGCTTATTTCACCTGGGATTCTATTGATCAGTAAAGCTACAGACAACCGACTTGGACATTTGACTCGACTGTTAGCTTTGTTCGGAGTTTAAAAAAATCTACGAACCTATCAGTTTCCTGTGAGGTTCTTAAATCATAGTAAATTGATAATCCATCACTTTTTTGCATCTCATATATATACATGTAACACTTTTGT
TCATCACTTATTCAATCTTTTGCATGTTGGTGCGGGGAGAAAATTACTTTGTTGTTCAGTTCTAACGTTTGCTTTGATATGGCGTCCATTATAATACCATAAATGCATCTCTTTGATATGTAACCAAGTTTCTATCGTTTTTTTATAGACACTGACCAGC

>TRINITY_DN40189_c2_g2_i2 from sample A9 / Example unspliced isoform:

GCATATTCTTTCTATCAATTAACTAATCCATCTCCATCAAATTCAATCCTCCATTGCATTTCATAGCTTCTGTCCTTCACATATTGTTTCAAGGGTTTGTGTGTTTCTACGCGCAGTAGTCGTCATGCCTTACGTTCCACCTCACCAAAGGAATGGAGGAGCAGCAGCAACAGCTGCGCCAGCTCCTTCCGCTTTCGGTA
ACGCCGGTAGAACCGCTGATCTAGGCGCCCACAGGCCAGCGGATGGTTATTACCATAACAGCGCAGGTAAGAGCTTCGGAAACAATAAGGATTACGGTCCCAGCTTTGGAAACTCAAATAGGCGAGGTTCGAATCTCCGGGAGGACGGCAATTGCAACGGCGCTGGTTTCCCTCACAGGCGCCCCGATGCCCGCGGCTCC
GCTATTCCCGACCCCGTCGTATCCCAATGGCAACCTTCTGAACGCATTCGCCGTCTTCAAAACGAGCAGATTGAAGAGGTTATGGCCAGGCTAAACGTTGATGTCCACATAACCCCGGGCACCCCTCCTGCACCTGCACCTGTGGAGTCATTTGAGGATATGTGTTTAAATCCTAGCATCATGAAAGATATTATTTTCCA
TGATTACTCTACACCAACTCCTATTCAAGCTCAAGCCATGCCAGTTGCTCTGAGTGGAAGAGACCTCCTTGGTTGCGCAGAGACAGGGAGTGGGAAAACTGCAGCATTCTCTATTCCCATGATTCAGCACTGTTTGGCACAACCACCTATTCGGCATGGGGATGGACCTTTGGCTTTAGTTCTGGCACCAACTCGAGAGC
TTGCTCAGCAGATAGAAAAAGAGGTCAAGGCTTTCAGCAGATCATTGGAGTCATTCAGGACTGCTATTGTTGTTGGAGGAACAAACATTTCTGAGCAGAGATCGGAGCTGAGAGCTGGAGTGGAAATTGTTGTTGCTACACCTGGAAGATTTATAGATCATCTACAACAAGGAAACAGCTCTCTTTCTAGGATCTCATAT
GTTGTATTAGATGAGGCAGATAGAATGTTAGATATGGGTTTTGAGCCGCAGATAAGAGAGGTCATGCGGAGTCTTCCTAAAATGCACCAGACGTTATTGTTCAGTGCCACAATGCCAGAGGAGATTGAAGCACTTGCTCAGGAGTATCTGAATAATCCAGTGCAAGTAAAGGTGGGGAAAGTAAGCAGTCCAACAGCAAA
TGTTTCACAGGTCCTAGAGAAGGTTACCGAAGAAGAAAAGACTGATCGTCTATTAGCTTTACTTGTGGAGGAATCATCCCAAGCAGAGAAGTCTGGACAACCTCTTCCTCTGACCATTGTTTTTGTTGAACGAAAGACAAGGTGTGACGAAGTTACAGATGCATTAGTTGCACAAGGTCTTCACGCAGTTGCGCTGCATG
GTGGTCGAAGTCAAGTGGAAAGAGAAGCTGCTTTACGCGAGTTTCGGAATGGCTCCACTAATATTCTGgtgagggtaaacttgctttttttaatggtttaaatgattttctttgtttcttatctcttccaacacacttttctcttgttggggttgctcggtgacaaatgctaatgctacattcatttaattattgcaaaa
ttcctagGTTGCTACAGATGTGGCCTCTCGAGGCTTGGATGTGACTGGTGTTTCCCATGTTGTTAACCTGGATCTTCCGAAGGCTATGGAGGATTATGTGCATCGTATTGGAAGAACTGGCCGTGCAGGAACCAGTGGCCGAGCAACTTCCTTTTACACAGAGCGTGATATGTTCCTGGTAGCTCATATTCGGAAGGCAA
TAGCAGATGCAGAAGCTGGAAACACCATGGCATTTGCAACTGGAAAGGCTGCAAGGAGAAAGGAGAGAGAACAAGCAGCAGCATTCCGGGAAGGAAGACTTGCTCCTACTGGAACAAGTGTCGTTGGATCAACTACCATTCGTGTTGAAGACAAATATAAGTACATGTTGGCACATGCGAATCTCAAGCAAGAAGGTGCC
GCAGATAATGCCTGGGATGATTGATGTCTGCTTTTTATATTGTTTAATCACGTTGGGGTATGGAGGAGATATCAGAGGACTGCCTACTTAACTATTCTTTCTATAGGAGGTGGACGAAGATTTAATGTGCTTGCCATGAGCATTCGGTGTGGGTGCCCTTGGTTTTGTGTCAACTTGAAGCATTGTAAATTCAGCATACA
GTGTATGCATGAAAAAATGTGTGGAGATGGCACTGTACAAATTATGTACATGGCAGTATTTATCTTTTGTTGTTCTATCACAAGAGAAGCATTGTATCTGCAGCTGACTGTTCAAAATACTGATCAAGAAAGATAGTTGCAGGCCTTTTAACGAACACTTGCAGTTTATTTACTGGATAGCTCTGACCAACAGATTCAAG
TTTTCTTTTTTCTAAAGCAATAATTAATTTTCTTCGCTGAAGTAATTGGTTATCAGTTATAGTTATGCATGGTAAAGATTGGCAAACTTTTGTGCTAAATTACCGATTGACACTAACTATCATAAAGCACACAGCCTATTCTCTAAAGTGAGTATGGAATATTTTAATATAGTGAAATGCTGTAGCTCTGTCACATGTCG
GTCCCAAATGTGATAGCAGTCTTGTATTGTGCTCGGAGTGAGTTAAATTTTGTTTGAACATGTCTCTCTTAATTCTCTGAGCAATGGCCATGTGCTAATGTTAAATGTTAACAGTTTTCATTCTCAAGCCTTCTAAGTAGTCACGCTTATTTCACCTGGGATTCTATTGATCAGTAAAGCTACAGACAACCGACTTGGAC
ATTTGACTCGACTGTTAGCTTTGTTCGGAGTTTAAAAAAATCTACGAACCTATCAGTTTCCTGTGAGGTTCTTAAATCATAGTAAATTGATAATCCATCACTTTTTTGCATCTCATATATATACATGTAACACTTTTGTTCATCACTTATTCAATCTTTTGCATGTTGGTGCGGGGAGAAAATTACTTTGTTGTTCAGTT
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