sp|Q40588|ASO_TOBAC ----> L-ascorbate oxidase


Intron 1 GTAATGCATT ... TTTGTGACAG

Found issues: Low number of reads   


SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A133.33101
A233.33101
A3-1000
A4-1000
A5-1000
A653.85307
A7100012
A840644
A914.29310
A1071.43123



>TRINITY_DN39114_c0_g1_i5 from sample A9 / Example spliced isoform
GTTACGATTGTAATGAATGTTGAGTATGAAAAGGCTCTGGGACATCACCAGTTCTGGTCCTAGCATTGAAGTCTTCTGACAGTTGTTGTTAGTGGATGTATGAGTGTATGCCACGGTGGCTATGAGCACATGACGGAGTTGATAAAATTGTAATACGAGTCCGAGCTGTAACTAGCTTTTCCCTTTGGAATATTGAGTTG
GCATTGTCGTGGTTGTAACATTAATGATGTCTTGAATGTAGTGGTTTCCCACTTTCCAACGTTCCTGTTTGGTAGCAATCTTCACCATTGATCTAAGTTTCTTGATATTTTAATGGAAAACCCTAACTTCATACTACAACAGCATTGAAACACATTCCTCAGCATTCATTTTTCTAGGTAATGGTCTTGGGGAGAGGCTG
ATAGGCCGAGGGGTTCTACGGTTTTGAGAGTTGGAGGTTCTCCAAGCTCGAACCCGTGACCTATGTGCGTTAAAACTACAAGTGGAAGTCATGTTATGAAGCCGAGCCTCTGGCAGAGTTTTTATAGTAGCTAAAACATCGAAGGGGAAATTCTTTAGATGATATCTCTGTGTAATTCTTGAGAGAGTGTTAGTTCATGG
TCTGTGTTGAAGTAATTGAACTAGTTTCAGCCTTTCATGCCGTGATACTTTCGAACTCAGAACTTGAACTCTCTCTTCCATAAGCTGGATGGGTGGCTTTAACCTTGTTTGCAGGAGAGTCTTCTCAATGCGAAGGTTTTCCTTTGCCGGAGGACCATTCACTTGAGAAATGATGGAGGTGCTCTGCTTGTCCACCAGTA
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TTGAAAAGTATCTTGTTTGGAGATTTATTTGATGAAGGAATGAACCCTCGTTTTTAATGGAAC


>TRINITY_DN39114_c0_g1_i1 from sample A9 / Example unspliced isoform:
CTGAATGGTAGGTGTGATCAAAATTTGTTGGCAGAGGGAAATAAAGAAGAGGTACACGGTCACATTTTAGAAGGGCATGGCACACAAGCAGCCTGCAGGTGAGTCATGTAAAACGAAAATGAGAAATAAAGAATCTGTTCTCCTATCCGATTGGACATTCTTTGGACACTTGGCTGGACGGAGCGGCATAAGTTAGATTC
GTGTTTCTTTCTTCATCAGGTGTTACGATTGTAATGAATGTTGAGTATGAAAAGGCTCTGGGACATCACCAGTTCTGGTCCTAGCATTGAAGTCTTCTGACAGTTGTTGTTAGTGGATGTATGAGTGTATGCCACGGTGGCTATGAGCACATGACGGAGTTGATAAAATTGTAATACGAGTCCGAGCTGTAACTAGCTTT
TCCCTTTGGAATATTGAGTTGGCATTGTCGTGGTTGTAACATTAATGATGTCTTGAATGTAGTGGTTTCCCACTTTCCAACGTTCCTGTTTGGTAGCAATCTTCACCATTGATCTAAGTTTCTTGATATTTTAATGGAAAACCCTAACTTCATACTACAACAGCATTGAAACACATTCCTCAGCATTCATTTTTCTAGGT
AATGGTCTTGGGGAGAGGCTGATAGGCCGAGGGGTTCTACGGTTTTGAGAGTTGGAGGTTCTCCAAGCTCGAACCCGTGACCTATGTGCGTTAAAACTACAAGTGGAAGTCATGTTATGAAGCCGAGCCTCTGGCAGAGTTTTTATAGTAGCTAAAACATCGAAGGGGAAATTCTTTAGATGATATCTCTGTGTAATTCT
TGAGAGAGTGTTAGTTCATGGTCTGTGTTGAAGTAATTGAACTAGTTTCAGCCTTTCATGCCGTGATACTTTCGAACTCAGAACTTGAACTCTCTCTTCCATAAGCTGGATGGGTGGCTTTAACCTTGTTTGCAGGAGAGTCTTCTCAATGCGAAGgtaatgcattcttctaatccatcactgttattttaaatgcttcc
ataaatatatctagtaacttgtttaaccattcacagtttttgtgacag
GTTTTCCTTTGCCGGAGGACCATTCACTTGAGAAATGATGGAGGTGCTCTGCTTGTCCACCAGTAAGCCTCGATGGTTTCCTTACCTCGTTGGTCATCCTGGTTTAGCTGAGGTCAACGAATGATGTTTGACAAAGTTGTAGGTGTTTGGAT
TTTTGGCACGGTTTTTGTCCTTTGAATGTAACTTGTGAGCATTAATACTAAGTGCCTAGCTGCTAAGATGTTGGCTAGTTTGGTTAATACAGCATCTACTGTAATTTTTTTGTTTGAAAAGTATCTTGTTTGGAGATTTATTTGATGAAGGAATGAACCCTCGTTTTTAATGGAAC