sp|Q9FGK3|MO25N_ARATH ----> Putative MO25-like protein At5g47540


Intron 1 GTTTGTCATC ... ACTGTTTCAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A119.0634.15.68
A220.2827.657
A331.4626.13.312
A425.5126.37.69
A5032.10
A632.0540.31.319
A723.2766620
A834.5449.32.126
A922.5951.48.915
A1021.7450.42.114



>TRINITY_DN113458_c3_g1_i16 from sample A3 / Example spliced isoform
TACGGATTGGATATCTATGATAACGGCCCGGTTTGATTTTTCGGTTAAGGATTTGATATATGTAACAGGCTTCGATTTTGTTTCCCAACCCTAGTTTGAGTCAAGTTCAAACCCTCGAGCCACTCGAAGGTTACAGACACATATACTGACGTAGCGTGGAGTCGAGACAAAAAAACGTCTAAAACACGCGATGGAGATCT
TCCTGAGCACATTTTGTGCATGGTCCAAGGCGATGATTCTATGAGGGTATTAGTACTAGAGCCCTTATTTGACCAGATAAACAAACAAGCTTACATAATTTCTATAGCTGAATGATCGATCGAGCAAGACAATGCAGTTCCAAGCAGCCATGTCTTTCTCCTTCTTCAAGCCATCGAAGCCCAAAACACCATCGGAGCTC
GTCAGGGCGACCAGAGACGCGCTCTTGGCTCTCGATGCCAAGACCGTTGCAGAAGTCAGGCTTCTTGAGAAGGCATTAGAGGAAGTGGACAAAAATTTGTTGGCGATGAGGCAAATGCTTTTAGGTGAAAACGAGACTGAACCAAACTTAGAGCAGATACTGCAGCTAGCAATAGAAGCTTGCAAGGAAGATCTTTTGGA
ATTGCTTGTTCAGAAGTTACCCATCCTTGGATGGGAGGGCAGAAAGGATCTGGTACATATTTGGTCCACATTGCTGAGGCAGAGGTTTGGATCTAGTAACTGTTGTTTGGAGTATATTGAGAATCATACAGAACTCCTCGACTTTCTAGTTTCAAGCTACGAGAACAAGGACACAGCTCTGAATTGTGGCAGTATGTTGA
GAGAATGCGCAAAATATCCTACATTATCAAAATACATGTTGGAGTCAGCTAGCTTTGAATTGTTTTTCAAGTATGTTGAGCTTCCAAACTTTGATATTGCTTCAGATGCTTTCATGACTTTCAAGGAATTGCTTACAAGGCATGAAACAGTGGTGGCTGAATACCTGACTACAAATTATGCACAGTTCTTTGGACTCTAT
GAGAAATTTTTGACATCCATCAACTATGTAACGAGGCGGCAATCTCTAAAGCTGCTTTCGGAATTTCTCCTTGAGCGTCCAAATGCAGCAATTATGATGAAGTATATTTCTGAAGTACGAAACTTGAAGATGATGATGACATTGCTTAAGGATCCCAGCAAAAATATTCAGTCGTCTGCATTCCATATCTTCAAGGTTTT
TGTTGCCAATCCAAATAAACCTCCTGCCATAAGTTCACTGCTCTTAAAGAACTGTGAAAAATTGCTGAAGTATTTGCAGAGTCTCCACTTCAGCAAAGAAGATGAACAATTTGAAGAGGAGAAAGACCTGCTTATCAGGGAGATTGAAGGGCTGCGTCTATCTGGTGATAGTCACTAGATTTGTTCTTGGTTTACATGTA
TGGCATCCAAACTCTGTTGGATGATATTCTCTCCATGAAAATGTTCACTAAGCTACAATACACAGCATCACTCAAGATCGCTAACCAAGACGTTTAGGAAGTATGACTGATGTATTTCAGGCGCCTACTGATATATGTAATTTCTTGGGTGGTTATATTAAATGCATTTCATCTTGAAATGGAACACCTGCTATTATTTT
TCTAGTGGAGGATGTAAAATTATTTCCCAGCTTCTTTAGTTGTACATAATTTCTTCTTTGAGAAAGACTTGGGTTTTGGTCCTTGTGGAAAAGTTCCCGGTAATTAATCGTGTGGGGAAGTTCCCTGTAATTAATTCTCTGTGCATTTTATATGGGCTTGAGTTATTTCCTAAAGTATACAAGCTTGTGATCTTGTATAC
CCCCAAGGCTTGTAATGCCAACAACTCGTCACATGTATACCCGTGACTTCTCATTGTTTGGGGCAATGATTGGAGTAGTAAATCCTGTTCATATTTAAGCTGGAAGTTAGAGCTTTCGTATGATGAATTAACAGGTTAAGCTGTAATCAAAATACCAGAGACACTAAGATTGTTTTATATTCCTTTTCATATTTATTTTT
ATTTTCCTTTTAAGGAAATGTTACGTCCTATTCTCCAGTTAACAATTATCTTTTGCTTTATGGATGTGCTGATTTATTTCTAGCTGTG


>TRINITY_DN113458_c3_g1_i5 from sample A3 / Example unspliced isoform:
CAAGCTACGAGAACAAGGACACAGCTCTGAATTGTGGCAGTATGTTGAGAGAATGCGCAAAATATCCTACATTATCAAAATACATGTTGGAGTCAGCTAGCTTTGAATTGTTTTTCAAGTATGTTGAGCTTCCAAACTTTGATATTGCTTCAGATGCTTTCATGACTTTCAAGGAATTGCTTACAAGGCATGAAACAGTG
GTGGCTGAATACCTGACTACAAATTATGCACAGgtttgtcatctttatgggggtaacagttttccttatacctgatccttgtaaatcatgtatttcttgatgctggacggttatctggtcatttctctttgcttctcttgttaaatcaaacctttaaagttcctttggaagtactggatactgaaatttgtattttggct
cactggaatgccaaatataaaagactttacagagatctttactttggcaaaattgtctgagggtttagtttatttttaatgatgatttgttccaattactgtttcag
TTCTTTGGACTCTATGAGAAATTTTTGACATCCATCAACTATGTAACGAGGCGGCAATCTCTAAAGCTGCTTTCGGAATTTCTCCTTGAGCGT
CCAAATGCAGCAATTATGATGAAGTATATTTCTGAAGTACGAAACTTGAAGATGATGATGACATTGCTTAAGGATCCCAGCAAAAATATTCAGTCGTCTGCATTCCATATCTTCAAGGTTTTTGTTGCCAATCCAAATAAACCTCCTGCCATAAGTTCACTGCTCTTAAAGAACTGTGAAAAATTGCTGAAGTATTTGCA
GAGTCTCCACTTCAGCAAAGAAGATGAACAATTTGAAGAGGAGAAAGACCTGCTTATCAGGGAGATTGAAGGGCTGCGTCTATCTGGTGATAGTCACTAGATTTGTTCTTGGTTTACATGTATGGCATCCAAACTCTGTTGGATGATATTCTCTCCATGAAAATGTTCACTAAGCTACAATACACAGCATCACTCAAGAT
CGCTAACCAAGACGTTTAGGAAGTATGACTGATGTATTTCAGGCGCCTACTGATATATGTAATTTCTTGGGTGGTTATATTAAATGCATTTCATCTTGAAATGGAACACCTGCTATTATTTTTCTAGTGGAGGATGTAAAATTATTTCCCAGCTTCTTTAGTTGTACATAATTTCTTCTTTGAGAAAGACTTGGGTTTTG
GTCCTTGTGGAAAAGTTCCCGGTAATTAATCGTGTGGGGAAGTTCCCTGTAATTAATTCTCTGTGCATTTTATATGGGCTTGAGTTATTTCCTAAAGTATACAAGCTTGTGATCTTGTATACCCCCAAGGCTTGTAATGCCAACAACTCGTCACATGTATACCCGTGACTTCTCATTGTTTGGGGCAATGATTGGAGTAG
TAAATCCTGTTCATATTTAAGCTGGAAGTTAGAGCTTTCGTATGATGAATTAACAGGTTAAGCTGTAATCAAAATACCAGAGACACTAAGATTGTTTTATATTCCTTTTCATATTTATTTTTATTTTCCTTTTAAGGAAATGTTACGTCCTATTCTCCAGTTAACAATTATCTTTTGCTTTATGGATGTGCTGATTTATT
TCTAGCTGTG




Intron 2 GTGAGTTTCC ... TATATATTAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A112.9237125.5
A220.447225.818.5
A325.0950.82217
A412.125816.58
A5095.30
A611.685614.37.5
A711.6710932.314.5
A815.255011.39
A916.868821.818
A1011.488125.510.5



>TRINITY_DN119464_c10_g2_i9 from sample A2 / Example spliced isoform
GGCTCATACCCCAAAACCCGAACATTATCTTAAATTTACCCATCAATGGCAAATTGGAAAGCCATCCCCACCTAGCAAGTCCATTGCCCCAATGACGCTCACAATCCCCTCATTGTGTCCTCTATTGGATACGGATTGGATATCTATGATAACGGCCCGGTTTGATTTTTCGGTTAAGGATTTGATATATGTAACAGGCT
TCGATTTTGTTTCCCAACCCTAGTTTGAGTCAAGTTCAAACCCTCGAGCCACTCGAAGGTTACAGACACATATACTGACGTAGCGTGGAGTCGAGACAAAAAAACGTCTAAAACACGCGATGGAGATCTTCCTGAGCACATTTTGTGCATGGTCCAAGGCGATGATTCTATGAGGGTATTAGTACTAGAGCCCTTATTTG
ACCAGATAAACAAACAAGCTTACATAATTTCTATAGCTGAATGATCGATCGAGCAAGACAATGCAGTTCCAAGCAGCCATGTCTTTCTCCTTCTTCAAGCCATCGAAGCCCAAAACACCATCGGAGCTCGTCAGGGCGACCAGAGACGCGCTCTTGGCTCTCGATGCCAAGACCGTTGCAGAAGTCAGGCTTCTTGAGAA
GGCATTAGAGGAAGTGGACAAAAATTTGTTGGCGATGAGGCAAATGCTTTTAGGTGAAAACGAGACTGAACCAAACTTAGAGCAGATACTGCAGCTAGCAATAGAAGCTTGCAAGGAAGATCTTTTGGAATTGCTTGTTCAGAAGTTACCCATCCTTGGATGGGAGGGCAGAAAGGATCTGGTACATATTTGGTCCACAT
TGCTGAGGCAGAGGTTTGGATCTAGTAACTGTTGTTTGGAGTATATTGAGAATCATACAGAACTCCTCGACTTTCTAGTTTCATGCTACGAGAACAAGGACACAGCTCTGAATTGTGGCAGTATGTTGAGAGAATGCGCAAAATATCCTACATTATCAAAATACATGTTGGAGTCAGCTAGCTTTGAATTGTTTTTCAAG
TATGTTGAGCTTCCAAACTTTGATATTGCTTCAGATGCTTTCATGACTTTCAAGGAATTGCTTACAAGGCATGAAACAGTGGTGGCTGAATACCTGACTACAAATTATGCACAGGTTTGTCATCTTTATGGGGGTAACAGTTTTCCTTATACCTGATCCTTGTAAATCATGTATTTCTTGATGCTGGACGGTTATCTGGT
CATTTCTCTTTGCTTCTCTTGTTAAATCAAACCTTTAAAGTTCCTTTGGAAGTACTGGATACTGAAATTTGTATTTTGGCTCACTGGAATGCCAAATATAAAAGACTTTACAGAGATCTTTACTTTGGCAAAATTGTCTGAGGGTTTAGTTT


>TRINITY_DN119464_c10_g2_i6 from sample A2 / Example unspliced isoform:
GCCACATTTTCATTAATCTGCAATAGACCAATAATAAGAAGAAAACAGGTTGAGTTTCTAATTTTCCTTGATATAGCTTTTGTTAGGTTGTGGCAGGTGAAATTCCAGTATTTTGCTTTTTGCAATGATGTTTTCTTATGATGGATAACAGTGAAGTCATGATTTGATTATAGTTCGAATTAATGGATTGATTTTTTTTT
AGCAATTTTCAATGCTTGTTAAGTTTTTATTGGTACAAATTTTGTTTATGTTCAGGGATTCTTTTGCTAGCTGTCATCATATATCAAATGATTATTTAGCTTCAATCTAGACACAGCTTAATTTGGTACATCTTCCATTTGGAGTGCTTTTGCAACCATGATAAAGCTTCATTTGCAGGCATTTGTGTTGACTTTGCTTG
TCTTATTATGTGTACCTTCAATTTCTCTTTGTGAATAATCATGCCAGGCATTAGAGGAAGTGGACAAAAATTTGTTGGCGATGAGGCAAATGCTTTTAGGTGAAAACGAGACTGAACCAAACTTAGAGCAGATACTGCAGCTAGCAATAGAAGCTTGCAAGGAAGATCTTTTGGAATTGCTTGTTCAGAAGTTACCCATC
CTTGGATGGGAGgtgagtttccttgagtcttcctctttctttcagagccattgttgaatgtaaatcagggaactaatttactgattgtttactatatattagGGCAGAAAGGATCTGGTACATATTTGGTCCACATTGCTGAGGCAGAGGTTTGGATCTAGTAACTGTTGTTTGGAGTATATTGAGAATCATACAGAACT
CCTCGACTTTCTAGTTTCATGGTATGTTTCTTCTCTGCTATATCAATGTTGGTAAGTGTTGATTTATTGTGGTTGGGAAAATAATTTTGTCACCATTGTTTTTAATGACATTCATTCTTGAAATTTTCCAAGTTTGAATGTGATGCAAAATTGAAGCATTAAATGCTCTTTAGTGGTGTTTAGGTGAATTGAGTCGCAAC
TAATAATTGTTGTTTTCATTACAGAATTTGAGACTACACTTGAAAAGCATTTGAAATCACCAATCC




Intron 3 GTGAATTTCT ... GAGATTGCAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A16.384403
A25.561701
A317.023928
A482302
A5-1000
A616.4461012
A76.856805
A811.5100013
A99.596607
A1018.374009



>TRINITY_DN113458_c3_g1_i5 from sample A3 / Example spliced isoform
CAAGCTACGAGAACAAGGACACAGCTCTGAATTGTGGCAGTATGTTGAGAGAATGCGCAAAATATCCTACATTATCAAAATACATGTTGGAGTCAGCTAGCTTTGAATTGTTTTTCAAGTATGTTGAGCTTCCAAACTTTGATATTGCTTCAGATGCTTTCATGACTTTCAAGGAATTGCTTACAAGGCATGAAACAGTG
GTGGCTGAATACCTGACTACAAATTATGCACAGGTTTGTCATCTTTATGGGGGTAACAGTTTTCCTTATACCTGATCCTTGTAAATCATGTATTTCTTGATGCTGGACGGTTATCTGGTCATTTCTCTTTGCTTCTCTTGTTAAATCAAACCTTTAAAGTTCCTTTGGAAGTACTGGATACTGAAATTTGTATTTTGGCT
CACTGGAATGCCAAATATAAAAGACTTTACAGAGATCTTTACTTTGGCAAAATTGTCTGAGGGTTTAGTTTATTTTTAATGATGATTTGTTCCAATTACTGTTTCAGTTCTTTGGACTCTATGAGAAATTTTTGACATCCATCAACTATGTAACGAGGCGGCAATCTCTAAAGCTGCTTTCGGAATTTCTCCTTGAGCGT
CCAAATGCAGCAATTATGATGAAGTATATTTCTGAAGTACGAAACTTGAAGATGATGATGACATTGCTTAAGGATCCCAGCAAAAATATTCAGTCGTCTGCATTCCATATCTTCAAGGTTTTTGTTGCCAATCCAAATAAACCTCCTGCCATAAGTTCACTGCTCTTAAAGAACTGTGAAAAATTGCTGAAGTATTTGCA
GAGTCTCCACTTCAGCAAAGAAGATGAACAATTTGAAGAGGAGAAAGACCTGCTTATCAGGGAGATTGAAGGGCTGCGTCTATCTGGTGATAGTCACTAGATTTGTTCTTGGTTTACATGTATGGCATCCAAACTCTGTTGGATGATATTCTCTCCATGAAAATGTTCACTAAGCTACAATACACAGCATCACTCAAGAT
CGCTAACCAAGACGTTTAGGAAGTATGACTGATGTATTTCAGGCGCCTACTGATATATGTAATTTCTTGGGTGGTTATATTAAATGCATTTCATCTTGAAATGGAACACCTGCTATTATTTTTCTAGTGGAGGATGTAAAATTATTTCCCAGCTTCTTTAGTTGTACATAATTTCTTCTTTGAGAAAGACTTGGGTTTTG
GTCCTTGTGGAAAAGTTCCCGGTAATTAATCGTGTGGGGAAGTTCCCTGTAATTAATTCTCTGTGCATTTTATATGGGCTTGAGTTATTTCCTAAAGTATACAAGCTTGTGATCTTGTATACCCCCAAGGCTTGTAATGCCAACAACTCGTCACATGTATACCCGTGACTTCTCATTGTTTGGGGCAATGATTGGAGTAG
TAAATCCTGTTCATATTTAAGCTGGAAGTTAGAGCTTTCGTATGATGAATTAACAGGTTAAGCTGTAATCAAAATACCAGAGACACTAAGATTGTTTTATATTCCTTTTCATATTTATTTTTATTTTCCTTTTAAGGAAATGTTACGTCCTATTCTCCAGTTAACAATTATCTTTTGCTTTATGGATGTGCTGATTTATT
TCTAGCTGTG


>TRINITY_DN113458_c3_g1_i9 from sample A3 / Example unspliced isoform:
GCAGAGTCTCCACTTCAGCAAAGgtgaatttcttgaaactatcatccatattttagctaattgtaaattctgttttatagatgacttgtgattgcttttgcatgatttattgtatgtggatttacgtttctgagattgcagAAGATGAACAATTTGAAGAGGAGAAAGACCTGCTTATCAGGGAGATTGAAGGGCTGCGT
CTATCTGGTGATAGTCACTAGATTTGTTCTTGGTTTACATGTATGGCATCCAAACTCTGTTGGATGATATTCTCTCCATGAAAATGTTCACTAAGCTACAATACACAGTGAGTATTTCCACCAGCCATATTACAATAATTGAATATCTTTCCAATATTTATTGTGCCTAAGAATGGGTTTTAGAAATTCCTTTATATAGA
AGATAATTAAACATCTTGATTGAAACACATACTCAGAATATCATGTTTGTAGTGGTTTACAGATATTTTACTCAATGATTGTTACATGGACAGGCATCACTCAAGATCGCTAACCAAGACGTTTAGGAAGTATGACTGATGTATTTCAGGCGCCTACTGATATATGTAATTTCTTGGGTGGTTATATTAAATGCATTTCA
TCTTGAAATGGAACACCTGCTATTATTTTTCTAGTGGAGGATGTAAAATTATTTCCCAGCTTCTTTAGTTGTACATAATTTCTTCTTTGAGAAAGACTTGGGTTTTGGTCCTTGTGGAAAAGTTCCCGGTAATTAATCGTGTGGGGAAGTTCCCTGTAATTAATTCTCTGTGCATTTTATATGGGCTTGAGTTATTTCCT
AAAGTATACAAGCTTGTGATCTTGTATACCCCCAAGGCTTGTAATGCCAACAACTCGTCACATGTATACCCGTGACTTCTCATTGTTTGGGGCAATGATTGGAGTAGTAAATCCTGTTCATATTTAAGCTGGAAGTTAGAGCTTTCGTATGATGAATTAACAGGTTAAGCTGTAATCAAAATACCAGAGACACTAAGATT
GTTTTATATTCCTTTTCATATTTATTTTTATTTTCCTTTTAAGGAAATGTTACGTCCTATTCTCCAGTTAACAATTATCTTTTGCTTTATGGATGTGCTGATTTATTTCTAGCTGTG




Intron 4 GTGAGTATTT ... ACATGGACAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A123.2633119
A27.321921
A327.43412110
A422.582486
A536845
A625.991314646
A722.12812719
A821.581293140
A924.921133738
A1022.487320.322



>TRINITY_DN116131_c1_g1_i3 from sample A1 / Example spliced isoform
CCCTCATTGTGTCCTCTATTGGATACGGATTGGATATCTATGATAACGGCCCGGTTTGATTTTTCGGTTAAGGATTTGATATATGTAACAGGCTTCGATTTTGTTTCCCAACCCTAGTTTGAGTCAAGTTCAAACCCTCGAGCCACTCGAAGGTTACAGACACATATACTGACGTAGCGTGGAGTCGAGACAAAAAAACG
TCTAAAACACGCGATGGAGATCTTCCTGAGCACATTTTGTGCATGGTCCAAGGCGATGATTCTATGAGGGTATTAGTACTAGAGCCCTTATTTGACCAGATAAACAAACAAGCTTACATAATTTCTATAGCTGAATGATCGATCGAGCAAGACAATGCAGTTCCAAGCAGCCATGTCTTTCTCCTTCTTCAAGCCATCGA
AGCCCAAAACACCATCGGAGCTCGTCAGGGCGACCAGAGACGCGCTCTTGGCTCTCGATGCCAAGACCGTTGCAGAAGTCAGGCTTCTTGAGAAGGCATTAGAGGAAGTGGACAAAAATTTGTTGGCGATGAGGCAAATGCTTTTAGGTGAAAACGAGACTGAACCAAACTTAGAGCAGATACTGCAGCTAGCAATAGAA
GCTTGCAAGGAAGATCTTTTGGAATTGCTTGTTCAGAAGTTACCCATCCTTGGATGGGAGGGCAGAAAGGATCTGGTACATATTTGGTCCACATTGCTGAGGCAGAGGTTTGGATCTAGTAACTGTTGTTTGGAGTATATTGAGAATCATACAGAACTCCTCGACTTTCTAGTTTCATGCTACGAGAACAAGGACACAGC
TCTGAATTGTGGCAGTATGTTGAGAGAATGCGCAAAATATCCTACATTATCAAAATACATGTTGGAGTCAGCTAGCTTTGAATTGTTTTTCAAGTATGTTGAGCTTCCAAACTTTGATATTGCTTCAGATGCTTTCATGACTTTCAAGGAATTGCTTACAAGGCATGAAACAGTGGTGGCTGAATACCTGACTACAAATT
ATGCACAGTTCTTTGGACTCTATGAGAAATTTTTGACATCCATCAACTATGTAACGAGGCGGCAATCTCTAAAGCTGCTTTCGGAATTTCTCCTTGAGCGTCCAAATGCAGCAATTATGATGAAGTATATTTCTGAAGTACGAAACTTGAAGATGATGATGACATTGCTTAAGGATCCCAGCAAAAATATTCAGTCGTCT
GCATTCCATATCTTCAAGGTTTTTGTTGCCAATCCAAATAAACCTCCTGCCATAAGTTCACTGCTCTTAAAGAACTGTGAAAAATTGCTGAAGTATTTGCAGAGTCTCCACTTCAGCAAAGAAGATGAACAATTTGAAGAGGAGAAAGACCTGCTTATCAGGGAGATTGAAGGGCTGCGTCTATCTGGTGATAGTCACTA
GATTTGTTCTTGGTTTACATGTATGGCATCCAAACTCTGTTGGATGATATTCTCTCCATGAAAATGTTCACTAAGCTACAATACACAGCATCACTCAAGATCGCTAACCAAGACGTTTAGGAAGTATGACTGATGTATTTCAGGCGCCTACTGATATATGTAATTTCTTGGGTGGTTATATTAAATGCATTTCATCTTGA
AATGGAACACCTGCTATTATTTTTCTAGTGGAGGATGTAAAATTATTTCCCAGCTTCTTTAGTTGTACATAATTTCTTCTTTGAGAAAGACTTGGGTTTTGGTCCTTGTGGAAAAGTTCCCGGTAATTAATCGTGTGGGGAAGTTCCCTGTAATTAATTCTCTGTGCATTTTATATGGGCTTGAGTTATTTCCTAAAGTA
TACAAGCTTGTGATCTTGTATACCCCCAAGGCTTGTAATGCCAACAACTCGTCACATGTATACCCGTGACTTCTCATTGTTTGGGGCAATGATTGGAGTAGTAAATCCTGTTCATATTTAAGCTGGAAGTTAGAGCTTTCGTATGATGAATTAACAGGTTAAGCTGTAATCAAAATACCAGAGACACTAAGATTGTTTTA
TATTCCTTTTCATATTTATTTTTATTTTCCTTTTAAGGAAATGTTACGTCCTA


>TRINITY_DN116131_c1_g1_i2 from sample A1 / Example unspliced isoform:
CCCTCATTGTGTCCTCTATTGGATACGGATTGGATATCTATGATAACGGCCCGGTTTGATTTTTCGGTTAAGGATTTGATATATGTAACAGGCTTCGATTTTGTTTCCCAACCCTAGTTTGAGTCAAGTTCAAACCCTCGAGCCACTCGAAGGTTACAGACACATATACTGACGTAGCGTGGAGTCGAGACAAAAAAACG
TCTAAAACACGCGATGGAGATCTTCCTGAGCACATTTTGTGCATGGTCCAAGGCGATGATTCTATGAGGGTATTAGTACTAGAGCCCTTATTTGACCAGATAAACAAACAAGCTTACATAATTTCTATAGCTGAATGATCGATCGAGCAAGACAATGCAGTTCCAAGCAGCCATGTCTTTCTCCTTCTTCAAGCCATCGA
AGCCCAAAACACCATCGGAGCTCGTCAGGGCGACCAGAGACGCGCTCTTGGCTCTCGATGCCAAGACCGTTGCAGAAGTCAGGCTTCTTGAGAAGGCATTAGAGGAAGTGGACAAAAATTTGTTGGCGATGAGGCAAATGCTTTTAGGTGAAAACGAGACTGAACCAAACTTAGAGCAGATACTGCAGCTAGCAATAGAA
GCTTGCAAGGAAGATCTTTTGGAATTGCTTGTTCAGAAGTTACCCATCCTTGGATGGGAGGGCAGAAAGGATCTGGTACATATTTGGTCCACATTGCTGAGGCAGAGGTTTGGATCTAGTAACTGTTGTTTGGAGTATATTGAGAATCATACAGAACTCCTCGACTTTCTAGTTTCATGCTACGAGAACAAGGACACAGC
TCTGAATTGTGGCAGTATGTTGAGAGAATGCGCAAAATATCCTACATTATCAAAATACATGTTGGAGTCAGCTAGCTTTGAATTGTTTTTCAAGTATGTTGAGCTTCCAAACTTTGATATTGCTTCAGATGCTTTCATGACTTTCAAGGAATTGCTTACAAGGCATGAAACAGTGGTGGCTGAATACCTGACTACAAATT
ATGCACAGTTCTTTGGACTCTATGAGAAATTTTTGACATCCATCAACTATGTAACGAGGCGGCAATCTCTAAAGCTGCTTTCGGAATTTCTCCTTGAGCGTCCAAATGCAGCAATTATGATGAAGTATATTTCTGAAGTACGAAACTTGAAGATGATGATGACATTGCTTAAGGATCCCAGCAAAAATATTCAGTCGTCT
GCATTCCATATCTTCAAGGTTTTTGTTGCCAATCCAAATAAACCTCCTGCCATAAGTTCACTGCTCTTAAAGAACTGTGAAAAATTGCTGAAGTATTTGCAGAGTCTCCACTTCAGCAAAGAAGATGAACAATTTGAAGAGGAGAAAGACCTGCTTATCAGGGAGATTGAAGGGCTGCGTCTATCTGGTGATAGTCACTA
GATTTGTTCTTGGTTTACATGTATGGCATCCAAACTCTGTTGGATGATATTCTCTCCATGAAAATGTTCACTAAGCTACAATACACAgtgagtatttccaccagccatattacaataattgaatatctttccaatatttattgtgcctaagaatgggttttagaaattcctttatatagaagataattaaacatcttgat
tgaaacacatactcagaatatcatgtttgtagtggtttacagatattttactcaatgattgttacatggacag
GCATCACTCAAGATCGCTAACCAAGACGTTTAGGAAGTATGACTGATGTATTTCAGGCGCCTACTGATATATGTAATTTCTTGGGTGGTTATATTAAATGCATTTCATCTTGAAATGGAACACCTGC
TATTATTTTTCTAGTGGAGGATGTAAAATTATTTCCCAGCTTCTTTAGTTGTACATAATTTCTTCTTTGAGAAAGACTTGGGTTTTGGTCCTTGTGGAAAAGTTCCCGGTAATTAATCGTGTGGGGAAGTTCCCTGTAATTAATTCTCTGTGCATTTTATATGGGCTTGAGTTATTTCCTAAAGTATACAAGCTTGTGAT
CTTGTATACCCCCAAGGCTTGTAATGCCAACAACTCGTCACATGTATACCCGTGACTTCTCATTGTTTGGGGCAATGATTGGAGTAGTAAATCCTGTTCATATTTAAGCTGGAAGTTAGAGCTTTCGTATGATGAATTAACAGGTTAAGCTGTAATCAAAATACCAGAGACACTAAGATTGTTTTATATTCCTTTTCATA
TTTATTTTTATTTTCCTTTTAAGGAAATGTTACGTCCTA




Intron 5 GTATTAGTAC ... GACAATGCAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A163.33335064
A275.42226570
A364.13406677
A470336688
A576.6112844
A676.19154650
A772.133470106
A872.13173553
A969.59336586
A1076.71299695



>TRINITY_DN113458_c3_g1_i8 from sample A3 / Example spliced isoform
TACGGATTGGATATCTATGATAACGGCCCGGTTTGATTTTTCGGTTAAGGATTTGATATATGTAACAGGCTTCGATTTTGTTTCCCAACCCTAGTTTGAGTCAAGTTCAAACCCTCGAGCCACTCGAAGGTTACAGACACATATACTGACGTAGCGTGGAGTCGAGACAAAAAAACGTCTAAAACACGCGATGGAGATCT
TCCTGAGCACATTTTGTGCATGGTCCAAGGCGATGATTCTATGAGGTTCCAAGCAGCCATGTCTTTCTCCTTCTTCAAGCCATCGAAGCCCAAAACACCATCGGAGCTCGTCAGGGCGACCAGAGACGCGCTCTTGGCTCTCGATGCCAAGACCGTTGCAGAAGTCAGGCTTCTTGAGAAGG


>TRINITY_DN113458_c3_g1_i16 from sample A3 / Example unspliced isoform:
TACGGATTGGATATCTATGATAACGGCCCGGTTTGATTTTTCGGTTAAGGATTTGATATATGTAACAGGCTTCGATTTTGTTTCCCAACCCTAGTTTGAGTCAAGTTCAAACCCTCGAGCCACTCGAAGGTTACAGACACATATACTGACGTAGCGTGGAGTCGAGACAAAAAAACGTCTAAAACACGCGATGGAGATCT
TCCTGAGCACATTTTGTGCATGGTCCAAGGCGATGATTCTATGAGGgtattagtactagagcccttatttgaccagataaacaaacaagcttacataatttctatagctgaatgatcgatcgagcaagacaatgcagTTCCAAGCAGCCATGTCTTTCTCCTTCTTCAAGCCATCGAAGCCCAAAACACCATCGGAGCTC
GTCAGGGCGACCAGAGACGCGCTCTTGGCTCTCGATGCCAAGACCGTTGCAGAAGTCAGGCTTCTTGAGAAGGCATTAGAGGAAGTGGACAAAAATTTGTTGGCGATGAGGCAAATGCTTTTAGGTGAAAACGAGACTGAACCAAACTTAGAGCAGATACTGCAGCTAGCAATAGAAGCTTGCAAGGAAGATCTTTTGGA
ATTGCTTGTTCAGAAGTTACCCATCCTTGGATGGGAGGGCAGAAAGGATCTGGTACATATTTGGTCCACATTGCTGAGGCAGAGGTTTGGATCTAGTAACTGTTGTTTGGAGTATATTGAGAATCATACAGAACTCCTCGACTTTCTAGTTTCAAGCTACGAGAACAAGGACACAGCTCTGAATTGTGGCAGTATGTTGA
GAGAATGCGCAAAATATCCTACATTATCAAAATACATGTTGGAGTCAGCTAGCTTTGAATTGTTTTTCAAGTATGTTGAGCTTCCAAACTTTGATATTGCTTCAGATGCTTTCATGACTTTCAAGGAATTGCTTACAAGGCATGAAACAGTGGTGGCTGAATACCTGACTACAAATTATGCACAGTTCTTTGGACTCTAT
GAGAAATTTTTGACATCCATCAACTATGTAACGAGGCGGCAATCTCTAAAGCTGCTTTCGGAATTTCTCCTTGAGCGTCCAAATGCAGCAATTATGATGAAGTATATTTCTGAAGTACGAAACTTGAAGATGATGATGACATTGCTTAAGGATCCCAGCAAAAATATTCAGTCGTCTGCATTCCATATCTTCAAGGTTTT
TGTTGCCAATCCAAATAAACCTCCTGCCATAAGTTCACTGCTCTTAAAGAACTGTGAAAAATTGCTGAAGTATTTGCAGAGTCTCCACTTCAGCAAAGAAGATGAACAATTTGAAGAGGAGAAAGACCTGCTTATCAGGGAGATTGAAGGGCTGCGTCTATCTGGTGATAGTCACTAGATTTGTTCTTGGTTTACATGTA
TGGCATCCAAACTCTGTTGGATGATATTCTCTCCATGAAAATGTTCACTAAGCTACAATACACAGCATCACTCAAGATCGCTAACCAAGACGTTTAGGAAGTATGACTGATGTATTTCAGGCGCCTACTGATATATGTAATTTCTTGGGTGGTTATATTAAATGCATTTCATCTTGAAATGGAACACCTGCTATTATTTT
TCTAGTGGAGGATGTAAAATTATTTCCCAGCTTCTTTAGTTGTACATAATTTCTTCTTTGAGAAAGACTTGGGTTTTGGTCCTTGTGGAAAAGTTCCCGGTAATTAATCGTGTGGGGAAGTTCCCTGTAATTAATTCTCTGTGCATTTTATATGGGCTTGAGTTATTTCCTAAAGTATACAAGCTTGTGATCTTGTATAC
CCCCAAGGCTTGTAATGCCAACAACTCGTCACATGTATACCCGTGACTTCTCATTGTTTGGGGCAATGATTGGAGTAGTAAATCCTGTTCATATTTAAGCTGGAAGTTAGAGCTTTCGTATGATGAATTAACAGGTTAAGCTGTAATCAAAATACCAGAGACACTAAGATTGTTTTATATTCCTTTTCATATTTATTTTT
ATTTTCCTTTTAAGGAAATGTTACGTCCTATTCTCCAGTTAACAATTATCTTTTGCTTTATGGATGTGCTGATTTATTTCTAGCTGTG




Intron 6 GTACCATCCA ... TTTTTTAGAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A166.67265747
A262.09296134
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A458.27295724
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>TRINITY_DN111840_c0_g1_i9 from sample A5 / Example spliced isoform
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ACTGGCTTCATGGTTAGGAGCAAAACATACCTCAAGGATGGCTCTAAGGTCCCAGGAGGAGATCCACTTTTGAAGCTCTTGGCTGTTGACTGGTTCAAGTCAAACAACAAGGTTCAGAAGGTTGCAGTACATCCCCTGTGTGTTGTTCAGACAGAAGTAGGTAAAAGTTTGCCATTCGTTCTTGTAATAAATTTACAGAT
TGAT
GTTGATATTGGCTCTTCATCAGTGGCAAGCAGCATTATAGGGCTTGTTCTGGGATACGTAACAAACCTTGTTGTTGATCTTGCAATTCTAATTGAGGCTAAGGAAGAGGATAAATTGCCTGAATATCTGCTGGGAACAGTTAGAATAAATCATGTCAAACTTGACTCTGCTATACCGTTCTGGGGGGATGCATGAG
AGGATACTAAGATCCAGTACCAAACTTGTTTTTGGACTGTAAAGTTCACTGTCAGTGCTCATCCTGCAGTTATCCTAAGATGCTGCACCAAAGTTGTTCTTGGACTGTAAAGTCCAGTGCCAATGCACATCCTGCAGTTATTTATAGGTGGGATATTCATATGTGGAATGCAATGAGTTCTGAAACAATGTGGAATGCAA
TAAGTTCTGAAACAATGTTGCTGCTTGGTTCAGAGAAGTGCATGTTATTTTTACCCTTGTTTAAAAATAATGCAGTTTGCTGGGAGATTTAAGGTAGTAAAGTGGGTTGGTTTCTGATTTATATAGATAGGCTTCCTTTTCATCCCGGGGTTTTGGATGGCCTGCACTAAACGTTGTCCTGTTGTATCTATATTAATGGC
AAATTAATGTCTCATGTATCCTAAAAGTTTTTTTTTCGAACTGCAAAGAGAAGTTGTAGATTACTGTAGGATGGTTGCCAACAAGAAGCAGCACAGACCAGATTTTCGGACTATATTAGTTAAACATGTATTCTGTGCCGCTTAACTACTCAAATTAGCTTTTGCTTCGTAGTACTTTTCACTTGATTATTCATTTCTAT
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>TRINITY_DN111840_c0_g1_i5 from sample A5 / Example unspliced isoform:
GATATAGACACAAATCAATAGCAGGAGCAGTCAAAAATATTTCTTGGGCTCTTATGAGAATGCGGCCGCCAGGTCCAGAGGCAAACACAGAACTAGTGTTGACTGCTCCTGCTATTGATATAGACACAAATCAATTTAAAGGCTCCTTGCACCTTGGAAAGAGTAAGACTGATTCAGACTGCTGGGATGATCCTGGTGGT
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accatccaaaccaaaccacagcatggtcttttactttggggcaaaccgaccaatcaggaaagggtctttgttggataaatttgcaaatggtgatgacatgtttcgggatgcacgctttaaacttatcccaagtattaaagagggatactggatggtcaagcgtgctgttggaactaaagcttgtctcttgggaaaggcag
tgacatgtgaatacctacgacaagataattttttagag
ATTGATGTTGATATTGGCTCTTCATCAGTGGCAAGCAGCATTATAGGGCTTGTTCTGGGATACGTAACAAACCTTGTTGTTGATCTTGCAATTCTAATTGAGGCTAAGGAAGAGGATAAATTGCCTGAATATCTGCTGGGAACAGTTAGAATAAATCATGTC
AAACTTGACTCTGCTATACCGTTCTGGGGGGATGCATGAGAGGATACTAAGATCCAGTACCAAACTTGTTTTTGGACTGTAAAGTTCACTGTCAGTGCTCATCCTGCAGTTATCCTAAGATGCTGCACCAAAGTTGTTCTTGGACTGTAAAGTCCAGTGCCAATGCACATCCTGCAGTTATTTATAGGTGGGATATTCAT
ATGTGGAATGCAATGAGTTCTGAAACAATGTGGAATGCAATAAGTTCTGAAACAATGTTGCTGCTTGGTTCAGAGAAGTGCATGTTATTTTTACCCTTGTTTAAAAATAATGCAGTTTGCTGGGAGATTTAAGGTAGTAAAGTGGGTTGGTTTCTGATTTATATAGATAGGCTTCCTTTTCATCCCGGGGTTTTGGATGG
CCTGCACTAAACGTTGTCCTGTTGTATCTATATTAATGGCAAATTAATGTCTCATGTATCCTAAAAGTTTTTTTTTCGAACTGCAAAGAGAAGTTGTAGATTACTGTAGGATGGTTGCCAACAAGAAGCAGCACAGACCAGATTTTCGGACTATATTAGTTAAACATGTATTCTGTGCCGCTTAACTACTCAAATTAGCT
TTTGCTTCGTAGTACTTTTCACTTGATTATTCATTTCTATACAGAACTCGCCTGTAGTGGGAAATTAAATTTGGAGGATCAGAATTATTCATATTGTTTGCTGCTATACATAACGAAAACAGAATGCCCA




Intron 7 GTTAGTTCAT ... CTGTGGGCAG

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>TRINITY_DN100116_c5_g1_i5 from sample A4 / Example spliced isoform
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CTGAATACCTGACTACAAATTATGCACAGTTCTTTGGACTCTATGAGAAATTTTTGACATCCATCAACTATGTAACGAGGCGGCAATCTCTAAAGCTGCTTTCGGAATTTCTCCTTGAGCGTCCAAATGCAGCAATTATGATGAAGTATATTTCTGAAGTACGAAACTTGAAGATGATGATGACATTGCTTAAGGATCCC
AGCAAAAATATTCAGTCGTCTGCATTCCATATCTTCAAGGTTTTTGTTGCCAATCCAAATAAACCTCCTGCCATAAGTTCACTGCTCTTAAAGAACTGTGAAAAATTGCTGAAGTATTTGCAGAGTCTCCACTTCAGCAAAGAAGATGAACAATTTGAAGAGGAGAAAGACCTGCTTATCAGGGAGATTGAAGGGCTGCG
TCTATCTGGTGATAGTCACTAGATTTGTTCTTGGTTTACATGTATGGCATCCAAACTCTGTTGGATGATATTCTCTCCATGAAAATGTTCACTAAGCTACAATACACAGCATCACTCAAGATCGCTAACCAAGACGTTTAGGAAGTATGACTGATGTATTTCAGGCGCCTACTGATATATGTAATTTCTTGGGTGGTTAT
ATTAAATGCATTTCATCTTGAAATGGAACACCTGCTATTATTTTTCTAGTGGAGGATGTAAAATTATTTCCCAGCTTCTTTAGTTGTACATAATTTCTTCTTTGAGAAAGACTTGGGTTTTGGTCCTTGTGGAAAAGTTCCCGGTAATTAATCGTGTGGGGAAGTTCCCTGTAATTAATTCTCTGTGCATTTTATATGGG
CTTGAGTTATTTCCTAAAGTATACAAGCTTGTGATCTTGTATACCCCCAAGGCTTGTAATGCCAACAACTCGTCACATGTATACCCGTGACTTCTCATTGTTTGGGGCAATGATTGGAGTAGTAAATCCTGTTCATATTTAAGCTGGAAGTTAGAGCTTTCGTATGATGAATTAACAGGTTAAGCTGTAATCAAAATACC
AGAGACACTAAGATTGTTTTATATTCCTTTTCATATTTATTTTTATTTTCCTTTTAAGGAAATGTTACGTCCTATTCTCCAG


>TRINITY_DN100116_c5_g1_i1 from sample A4 / Example unspliced isoform:
GCCCCAATGACGCTCACAATCCCCTCATTGTGTCCTCTATTGGATACGGATTGGATATCTATGATAACGGCCCGGTTTGATTTTTCGGTTAAGGATTTGATATATGTAACAGGCTTCGATTTTGTTTCCCAACCCTAGTTTGAGTCAAGTTCAAACCCTCGAGCCACTCGAAGGTTACAGACACATATACTGACGTAGCG
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tgaaacattctgattattgtagaatgagttatttctaatccacagttgtgtttttatttgatatcctggggctgctgctctgtctcatatattctgatttgtatggctaacaaaattgcgagtcgatcatcacaaatgcagatcaaatgagatgttgataatcttttgctttgctgtgggcag
GAATTGCTTACAAGGCA
TGAAACAGTGGTGGCTGAATACCTGACTACAAATTATGCACAGGTTTGTCATCTTTATGGGGGTAACAGTTTTCCTTATACCTGATCCTTGTAAATCATGTATTTCTTGATGCTGGACGGTTATCTGGTCATTTCTCTTTGCTTCTCTTGTTAAATCAAACCTTTAAAGTTCCTTTGGAAGTACTGGATACTGAAATTTG
TATTTTGGCTCACTGGAATGCCAAATATAAAAGACTTTACAGAGATCTTTACTTTGGCAAAATTGTCTGAGGGTTTAGTTTATTTTTAATGATGATTTGTTCCAATTACTGTTTCAGTTCTTTGGACTCTATGAGAAATTTTTGACATCCATCAACTATGTAACGAGGCGGCAATCTCTAAAGCTGCTTTCGGAATTTCT
CCTTGAGCGTCCAAATGCAGCAATTATGATGAAGTATATTTCTGAAGTACGAAACTTGAAGATGATGATGACATTGCTTAAGGATCCCAGCAAAAATATTCAGTCGTCTGCATTCCATATCTTCAAGGTTTTTGTTGCCAATCCAAATAAACCTCCTGCCATAAGTTCACTGCTCTTAAAGAACTGTGAAAAATTGCTGA
AGTATTTGCAGAGTCTCCACTTCAGCAAAGAAGATGAACAATTTGAAGAGGAGAAAGACCTGCTTATCAGGGAGATTGAAGGGCTGCGTCTATCTGGTGATAGTCACTAGATTTGTTCTTGGTTTACATGTATGGCATCCAAACTCTGTTGGATGATATTCTCTCCATGAAAATGTTCACTAAGCTACAATACACAGCAT
CACTCAAGATCGCTAACCAAGACGTTTAGGAAGTATGACTGATGTATTTCAGGCGCCTACTGATATATGTAATTTCTTGGGTGGTTATATTAAATGCATTTCATCTTGAAATGGAACACCTGCTATTATTTTTCTAGTGGAGGATGTAAAATTATTTCCCAGCTTCTTTAGTTGTACATAATTTCTTCTTTGAGAAAGAC
TTGGGTTTTGGTCCTTGTGGAAAAGTTCCCGGTAATTAATCGTGTGGGGAAGTTCCCTGTAATTAATTCTCTGTGCATTTTATATGGGCTTGAGTTATTTCCTAAAGTATACAAGCTTGTGATCTTGTATACCCCCAAGGCTTGTAATGCCAACAACTCGTCACATGTATACCCGTGACTTCTCATTGTTTGGGGCAATG
ATTGGAGTAGTAAATCCTGTTCATATTTAAGCTGGAAGTTAGAGCTTTCGTATGATGAATTAACAGGTTAAGCTGTAATCAAAATACCAGAGACACTAAGATTGTTTTATATTCCTTTTCATATTTATTTTTATTTTCCTTTTAAGGAAATGTTACGTCCTATTCTCCAG