sp|Q84JU6|HOS1_ARATH ----> E3 ubiquitin-protein ligase HOS1
Intron 1 GTAATGTGGA ... TCCATTTCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 61.7 | 54 | 97 | 77 |
| A2 | 65.66 | 42.1 | 86 | 75 |
| A3 | 77.27 | 25 | 105 | 65 |
| A4 | 75.47 | 28.4 | 90 | 85 |
| A5 | 68.14 | 18 | 38 | 39 |
| A6 | 62.74 | 72.4 | 130 | 114 |
| A7 | 65.8 | 106.6 | 206 | 204 |
| A8 | 65.39 | 91.6 | 155 | 191 |
| A9 | 72.98 | 67.2 | 170 | 193 |
| A10 | 62.86 | 91 | 183 | 125 |
>TRINITY_DN124867_c1_g1_i5 from sample A1 / Example spliced isoformTTGGGTTGAAAGTTTTTCCCTCTTCTCGTAAAATTACTTACTAAAACTCGGGCACTATTTCAATTTCTCTACGACAGTCGGATGAACGGGCCACAGGAAAACCGCCATGAATACCGCTCTCAGAGACGCCCCCAAGCTCGGCAGTTCCCAGCGCAAGCGTCGACTGGATGCATTGGAGCGCTTAGCAAACATTGATCCTT
TTGATCTATGCAGTGAGGCAAAAGTTGAAAAGTGCCGTGCCATAAGAGACTTGAGGAGCTGTGGGCGAGTTGTTCAGCACATTTTAACATCTTGTGGCCATGCATCTTTGTGTGTGGAATGTATTCAACGGTGTGATGTATGTCCTATCTGTAGGGTTTCAATTCCAAAACATGATGGGACTATGCGATTACGTCTTTAC
AATGAATGTCTTGATGTTGGCCTTATCTCTAGAAAGTCTGATGAAAATTTTAAGGAAAGGAAAGGAGATGGCCAGTGTTGGACAGAAGATGTTCAGCATCTTTATTCTTTGTTTGATGTTGCCTTGGAGAATAATTTGATATCCCTGGTTTGCCATTGTATCCTTTGTGGGGGACTTAATGTGTTTATTCATGCAATTAT
TTTTTGTGATTTTTATGTTTAGTATTTTTAAATTATAATTACCTTTCCAGTTCATTCCTTATCATATTTGCAGATGTCACAGATGTTTGTATGGATGAAAGTGCTGTTTCCAGCGATGCTATTGTAGCAATGCTTCTCGATGGTGGAGTTGTAAAGGATTGGTGCAAGAGAACATTATTGAATGTCATATCTAGTCTGCC
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TCGCCATTGGAACGTTCCTAACACGAATTGGAGAAATATAGTGGATGATTATGCTGGAACCTTTGGCATCACAAGAAATTTAGTTCTTGAATCATTAGTCTTTTATCTGTTGGACGACAATACAGAGGAGGCATTAGAGGAAGCCTGTCATCTTCTTCCAGAAATTGTAAGTCCAACTACACATCCAAAAGTTGCTCGTG
TTTTACTCGAAAGGAAAAAGCCGGATGCAGCTTTGATGGTTTTACGTTGCGCTGGACATGATGGTCAGTTTGGAATCACAGATTCTGGTTTCCAGAGGGCAGGTGTAGTTGCTCTTCCTGAGGCTGTGACAGCTGTCAGAGTCAGGCTTGAGTGTGCACTTCTAACTGAAGCTTATCTTTATCAGAGAACACATTGCCTA
CGAGTCAAAGCAGAGCAATCAAAACACCGACAAATGACAGCTGGATCACATGGAGCAGAAGATATGAGTGGGTGTCGAGATTGGCTTACAGAAATGGAGATTCTAGTGGGTGAGATATGCTGGTTATGTATTAGAAGAAATTTGGTTGATAGGATGATTGAGTTACCTTGGCACAGCGATGAGGAAAAGTTTTTGAAAAA
TTGTCTTTTAGAGAGAACGGTACAAGATTCTTCATCTTCTGCTGGCAATCTTCTGGTTGTCTTTTTCATCCAGCGATGCCGCTACCCTGAAGCATATCAGATTCATAAAAAGCTTTGTGACTTGGAAGAAAAAATCATATCCCAAAACATGGATAAGAAAATTGTTGAGAGGATTGAAAGTGCAAGTGAATGGAGACAAC
GGTTGATTGAAAAATGTATTGAGTTGCTACCAGAAATACAGCGTCGACAGCTAAAAAGTGGAATTGTTTCTGAATATCCTGTTTCTACTTTGACAGTAGAGCAGTACCAACCTCTCGATATGGAGATAGAGCAAGCAATATTGTCCACTGTTTCTAACACATCTGCAAGCATAGTGCCACCATCAGTACTTCAACAGCCA
TTTGATGCAAAGAAGAGCAAACTTACTCAAAATAGTTCCATGAACTCAGATGATATACCTTCTGCTTCCACTTTGGGACGGGGTGATAATCGTCAGCCATGCTTTCTTCCTGTGAAACCATTCCGATCCACAGTGGGAAGTCCATCACTTAATCCAACATTAGACTCATCTCCACTGCTAAATGGGCAGTCTAAGCAAAA
AGATCAGGAAAAGCCTGGTGTCAGTCCCATTCGGGGTCGGATATTGAACTATGACTTTGAGTCTGGGAAGCCTTTGCATGAGAATGAATCAGCTGAGCAACATTCTTTTGTGTCAAATTATACATCCTCGCAGGAGGCAGGAGCTGTTTCACCTGTGAAAGATGGGGACCAGGTGAGCCTTGAAAATGGTTTTCTTCATA
CACGAGACTTACCGACTACTTCAAGCTTTGATGCTCCATGTTCAAGTATAGTGATGTCGCAGGATAGATTGTCTGTTCCAAGTCGAACTGATTTGGACATCTCAGGCCTTCCCTTATCTAGCCCAGGATCAAGTGGAAAACGACTACCATCAGATCGTTCATGGCTGGCTAGTCCATCTGATGATGATTTTTGGAGGGGA
AAAGGAGGAGGAACAGTTCCCAGCTTCTCATTTAGTGCAAAGAATCAGGAATTGTCTCCATATTCTCATACTGATTCTTATCAAAGTCCAAATTCAGGGGTTGAAAGTCCAAAGCCAAATGGCGGTGTGAGATGGAGGTCAGATGAAGGAGAGGAGGAAGATGATCCGAGGCCTAAAAGTTCTGGAAGGTTAAAAGGTTC
TTCTGGTACTAAAGGAAGAGGTATAGGCCGAAGCAGGTTTTATGCAAGTCACATTTGATATCTTCTGATAATTTGTACCAATAAAATATGGGGTAGTCCAAATTTTATGTTGCTGGTATCCAGTTTTGGATTCTCCATTTCTTGTAGATTTAACATAATAGAAAGGCAAGAACAGGCTGCCCATAAGAGGATACATGCCT
ATTTCTAACTCGAAGATGCTACATGTGGTAGACATTCTTGAATATCAACCAATGTTTCCAAGCAAATATCCAAGTATCAGCTAGATTCAAGTGTAGCTGATATTCTGCGAGTTCTTCCAAGTGCTGGGATATCATGTTTATCCTTGGTTGCAAAGCTCAAGGTCTAAATCTTTGCTTGAATGTCTTTGATTCTTCTGGAA
GAGAAATTACTGTTTAATTATTGTACAACATCCTCGAGGATTTTATGAAAACCTGGCTGCATTTGCCAGCAGAATCTCAGTTGTTTGTTCTGTGCATTGTAAATCTGTTCCACATGTTTGGCATTTACCTCAAAATGAGAAGTAAAATCAAAGTTTTGTAACGGGCTTTTGCAGAATTGCAGCACTGGAAGGTGACATGG
GAATTTTCAATTAGATTGGTAGGCTAGATCCGGTTTTAACTTTTGATATCCCAAAATTTATGTTTTTGACTCAGAGTGGGGAGCTCGGCAGATAAACTGAGGGTTTTTGGTTTAAGGTCAACTCTTGGTATATTCAATAAATAATTAGCAAGCATGGATCATTCAATTCTGTTTGATGTAAATGGAAATCAGTTTTTTGA
AAGGATCAGTTATTCAGGGGACTAATTTTGACCGTATTCCTATGGGTTGGTGTGCTGATTGATGATATTTCCCTTTCATTCTTGATGTTATGGTTGAAACTCTTTTGTCAGCTAGGTGTGCTGCTATTTCCACTCAACTGCTAGAAGAAGTTAGGATATAGATGCCCAAAATCAAAAGACA
>TRINITY_DN124867_c1_g1_i7 from sample A1 / Example unspliced isoform:TTGGGTTGAAAGTTTTTCCCTCTTCTCGTAAAATTACTTACTAAAACTCGGGCACTATTTCAATTTCTCTACGACAGTCGGATGAACGGGCCACAGGAAAACCGCCATGAATACCGCTCTCAGAGACGCCCCCAAGCTCGGCAGTTCCCAGCGCAAGCGTCGACTGGATGCATTGGAGCGCTTAGCAAACATTGATCCTT
TTGATCTATGCAGTGAGGCAAAAGTTGAAAAGTGCCGTGCCATAAGAGACTTGAGGAGCTGTGGGCGAGTTGTTCAGCACATTTTAACATCTTGTGGCCATGCATCTTTGTGTGTGGAATGTATTCAACGGTGTGATGTATGTCCTATCTGTAGGGTTTCAATTCCAAAACATGATGGGACTATGCGATTACGTCTTTAC
AATGAATGTCTTGATGTTGGCCTTATCTCTAGAAAGTCTGATGAAAATTTTAAGGAAAGGAAAGGAGATGGCCAGTGTTGGACAGAAGATGTTCAGCATCTTTATTCTTTGTTTGATGTTGCCTTGGAGAATAATTTGATATCCCTGGTTTGCCATTATGTCACAGATGTTTGTATGGATGAAAGTGCTGTTTCCAGCGA
TGCTATTGTAGCAATGCTTCTCGATGGTGGAGTTGTAAAGGATTGGTGCAAGAGAACATTATTGAATGTCATATCTAGTCTGCCAGAAATTTATAATCTCGGGGTTCAATCAGATGTATTCAGTAAGTATACAACGCAACTCGATGCTATAGTCAATGTACTTGAAGTGTTAGAAGGATCACTTTTGGATTTACCTTCAC
CTCAATTGTTGGAGCTGCAACATCTTTTGGAGACTGCATCCAAAGTGAAACAACATTTGGAGGTAATGGCTTGGTGTGCAAGGCACAGCTTTCTTGAGGGTGTTCAATGTCGCTATATGGGCATCTCTCATTGGAGAAATTCTTTTCATGAGAGAAAGACTGCTGCATGTGAGCGAACTTGGCCTGATTATTCAAAAAAT
ACATCACGGCTTGGGTCTCAATCTCAAGCAACTTTGTTCATTGAGGATGCCTTGGCTAACCTGAGCATAGGGCAAGATTATGATGGAGAACTAGGAAAAGAGGCTCATGAACTAAGTTGGCTGCGGCAAGGAGGAAGTTTATCTCGGTTACCTTTCAAGGATGGACTGGATGGGCCTGCATACCCACCAGAAAATTTGCG
TGCAGCTGTTGATCTTCTTTTTCTAGAGGGAAGTTCAGGTCTCATCCTTGCGAAAAGAGCAATTTTTCTTTATTACTTATTTGATCGCCATTGGAACGTTCCTAACACGAATTGGAGAAATATAGTGGATGATTATGCTGGAACCTTTGGCATCACAAGAAATTTAGTTCTTGAATCATTAGTCTTTTATCTGTTGGACG
ACAATACAGAGGAGGCATTAGAGGAAGCCTGTCATCTTCTTCCAGAAATTGTAAGTCCAACTACACATCCAAAAGTTGCTCGTGTTTTACTCGAAAGGAAAAAGCCGGATGCAGCTTTGATGGTTTTACGTTGCGCTGGACATGATGGTCAGTTTGGAATCACAGATTCTGGTTTCCAGAGGGCAGGTGTAGTTGCTCTT
CCTGAGGCTGTGACAGCTGTCAGAGTCAGGCTTGAGTGTGCACTTCTAACTGAAGCTTATCTTTATCAGAGAACACATTGCCTACGAGTCAAAGCAGAGCAATCAAAACACCGACAAATGACAGCTGGATCACATGGAGCAGAAGATATGAGTGGGTGTCGAGATTGGCTTACAGAAATGGAGATTCTAGTGGGTGAGAT
ATGCTGGTTATGTATTAGAAGAAATTTGGTTGATAGGATGATTGAGTTACCTTGGCACAGCGATGAGGAAAAGTTTTTGAAAAATTGTCTTTTAGAGAGAACGGTACAAGATTCTTCATCTTCTGCTGGCAATCTTCTGGTTGTCTTTTTCATCCAGCGATGCCGCTACCCTGAAGCATATCAGATTCATAAAAAGCTTT
GTGACTTGGAAGAAAAAATCATATCCCAAAACATGGATAAGAAAATTGTTGAGAGGATTGAAAGTGCAAGTGAATGGAGACAACGGTTGATTGAAAAATGTATTGAGTTGCTACCAGAAATACAGCGTCGACAGCTAAAAAGTGGAATTGTTTCTGAATATCCTGTTTCTACTTTGACAGTAGAGCAGTACCAACCTCTC
GATATGGAGATAGAGCAAGCAATATTGTCCACTGTTTCTAACACATCTGCAAGCATAGTGCCACCATCAGTACTTCAACAGCCATTTGATGCAAAGAAGAGCAAACTTACTCAAAATAGTTCCATGAACTCAGATGATATACCTTCTGCTTCCACTTTGGGACGGGGTGATAATCGTCAGCCATGCTTTCTTCCTGTGAA
ACCATTCCGATCCACAGTGGGAAGTCCATCACTTAATCCAACATTAGACTCATCTCCACTGCTAAATGGGCAGTCTAAGCAAAAAGATCAGGAAAAGCCTGGTGTCAGTCCCATTCGGGGTCGGATATTGAACTATGACTTTGAGTCTGGGAAGCCTTTGCATGAGAATGAATCAGCTGAGCAACATTCTTTTGTGTCAA
ATTATACATCCTCGCAGGAGGCAGgtaatgtggagaaagaagttgcttatagaattcattcaaaggggtttttctcagattcatctaatgagacgagggggcatgaagtattaattaagacacataatggaactggaagttctaaacaaaatgggtattccatttcagGAGCTGTTTCACCTGTGAAAGATGGGGACCAG
GTGAGCCTTGAAAATGGTTTTCTTCATACACGAGACTTACCGACTACTTCAAGCTTTGATGCTCCATGTTCAAGTATAGTGATGTCGCAGGATAGATTGTCTGTTCCAAGTCGAACTGATTTGGACATCTCAGGCCTTCCCTTATCTAGCCCAGGATCAAGTGGAAAACGACTACCATCAGATCGTTCATGGCTGGCTAG
TCCATCTGATGATGATTTTTGGAGGGGAAAAGGAGGAGGAACAGTTCCCAGCTTCTCATTTAGTGCAAAGAATCAGGAATTGTCTCCATATTCTCATACTGATTCTTATCAAAGTCCAAATTCAGGGGTTGAAAGTCCAAAGCCAAATGGCGGTGTGAGATGGAGGTCAGATGAAGGAGAGGAGGAAGATGATCCGAGGC
CTAAAAGTTCTGGAAGGTTAAAAGGTTCTTCTGGTACTAAAGGAAGAGGTATAGGCCGAAGCAGGTTTTATGCAAGTCACATTTGATATCTTCTGATAATTTGTACCAATAAAATATGGGGTAGTCCAAATTTTATGTTGCTGGTATCCAGTTTTGGATTCTCCATTTCTTGTAGATTTAACATAATAGAAAGGCAAGAA
CAGGCTGCCCATAAGAGGATACATGCCTATTTCTAACTCGAAGATGCTACATGTGGTAGACATTCTTGAATATCAACCAATGTTTCCAAGCAAATATCCAAGTATCAGCTAGATTCAAGTGTAGCTGATATTCTGCGAGTTCTTCCAAGTGCTGGGATATCATGTTTATCCTTGGTTGCAAAGCTCAAGGTCTAAATCTT
TGCTTGAATGTCTTTGATTCTTCTGGAAGAGAAATTACTGTTTAATTATTGTACAACATCCTCGAGGATTTTATGAAAACCTGGCTGCATTTGCCAGCAGAATCTCAGTTGTTTGTTCTGTGCATTGTAAATCTGTTCCACATGTTTGGCATTTACCTCAAAATGAGAAGTAAAATCAAAGTTTTGTAACGGGCTTTTGC
AGAATTGCAGCACTGGAAGGTGACATGGGAATTTTCAATTAGATTGGTAGGCTAGATCCGGTTTTAACTTTTGATATCCCAAAATTTATGTTTTTGACTCAGAGTGGGGAGCTCGGCAGATAAACTGAGGGTTTTTGGTTTAAGGTCAACTCTTGGTATATTCAATAAATAATTAGCAAGCATGGATCATTCAATTCTGT
TTGATGTAAATGGAAATCAGTTTTTTGAAAGGATCAGTTATTCAGGGGACTAATTTTGACCGTATTCCTATGGGTTGGTGTGCTGATTGATGATATTTCCCTTTCATTCTTGATGTTATGGTTGAAACTCTTTTGTCAGCTAGGTGTGCTGCTATTTCCACTCAACTGCTAGAAGAAGTTAGGATATAGATGCCCAAAAT
CAAAAGACA
Intron 2 GTATCCTTTG ... ATATTTGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 29.78 | 112 | 48 | 47 |
| A2 | 23.14 | 98 | 30 | 29 |
| A3 | 23.13 | 103 | 30 | 32 |
| A4 | 24.18 | 116 | 40 | 34 |
| A5 | 33.33 | 61 | 29 | 32 |
| A6 | 35.71 | 9 | 5 | 5 |
| A7 | 23.96 | 73 | 18 | 28 |
| A8 | 31.91 | 16 | 8 | 7 |
| A9 | 28.46 | 44 | 15 | 20 |
| A10 | 22.96 | 52 | 21 | 10 |
>TRINITY_DN124867_c1_g1_i7 from sample A1 / Example spliced isoformTTGGGTTGAAAGTTTTTCCCTCTTCTCGTAAAATTACTTACTAAAACTCGGGCACTATTTCAATTTCTCTACGACAGTCGGATGAACGGGCCACAGGAAAACCGCCATGAATACCGCTCTCAGAGACGCCCCCAAGCTCGGCAGTTCCCAGCGCAAGCGTCGACTGGATGCATTGGAGCGCTTAGCAAACATTGATCCTT
TTGATCTATGCAGTGAGGCAAAAGTTGAAAAGTGCCGTGCCATAAGAGACTTGAGGAGCTGTGGGCGAGTTGTTCAGCACATTTTAACATCTTGTGGCCATGCATCTTTGTGTGTGGAATGTATTCAACGGTGTGATGTATGTCCTATCTGTAGGGTTTCAATTCCAAAACATGATGGGACTATGCGATTACGTCTTTAC
AATGAATGTCTTGATGTTGGCCTTATCTCTAGAAAGTCTGATGAAAATTTTAAGGAAAGGAAAGGAGATGGCCAGTGTTGGACAGAAGATGTTCAGCATCTTTATTCTTTGTTTGATGTTGCCTTGGAGAATAATTTGATATCCCTGGTTTGCCATTATGTCACAGATGTTTGTATGGATGAAAGTGCTGTTTCCAGCGA
TGCTATTGTAGCAATGCTTCTCGATGGTGGAGTTGTAAAGGATTGGTGCAAGAGAACATTATTGAATGTCATATCTAGTCTGCCAGAAATTTATAATCTCGGGGTTCAATCAGATGTATTCAGTAAGTATACAACGCAACTCGATGCTATAGTCAATGTACTTGAAGTGTTAGAAGGATCACTTTTGGATTTACCTTCAC
CTCAATTGTTGGAGCTGCAACATCTTTTGGAGACTGCATCCAAAGTGAAACAACATTTGGAGGTAATGGCTTGGTGTGCAAGGCACAGCTTTCTTGAGGGTGTTCAATGTCGCTATATGGGCATCTCTCATTGGAGAAATTCTTTTCATGAGAGAAAGACTGCTGCATGTGAGCGAACTTGGCCTGATTATTCAAAAAAT
ACATCACGGCTTGGGTCTCAATCTCAAGCAACTTTGTTCATTGAGGATGCCTTGGCTAACCTGAGCATAGGGCAAGATTATGATGGAGAACTAGGAAAAGAGGCTCATGAACTAAGTTGGCTGCGGCAAGGAGGAAGTTTATCTCGGTTACCTTTCAAGGATGGACTGGATGGGCCTGCATACCCACCAGAAAATTTGCG
TGCAGCTGTTGATCTTCTTTTTCTAGAGGGAAGTTCAGGTCTCATCCTTGCGAAAAGAGCAATTTTTCTTTATTACTTATTTGATCGCCATTGGAACGTTCCTAACACGAATTGGAGAAATATAGTGGATGATTATGCTGGAACCTTTGGCATCACAAGAAATTTAGTTCTTGAATCATTAGTCTTTTATCTGTTGGACG
ACAATACAGAGGAGGCATTAGAGGAAGCCTGTCATCTTCTTCCAGAAATTGTAAGTCCAACTACACATCCAAAAGTTGCTCGTGTTTTACTCGAAAGGAAAAAGCCGGATGCAGCTTTGATGGTTTTACGTTGCGCTGGACATGATGGTCAGTTTGGAATCACAGATTCTGGTTTCCAGAGGGCAGGTGTAGTTGCTCTT
CCTGAGGCTGTGACAGCTGTCAGAGTCAGGCTTGAGTGTGCACTTCTAACTGAAGCTTATCTTTATCAGAGAACACATTGCCTACGAGTCAAAGCAGAGCAATCAAAACACCGACAAATGACAGCTGGATCACATGGAGCAGAAGATATGAGTGGGTGTCGAGATTGGCTTACAGAAATGGAGATTCTAGTGGGTGAGAT
ATGCTGGTTATGTATTAGAAGAAATTTGGTTGATAGGATGATTGAGTTACCTTGGCACAGCGATGAGGAAAAGTTTTTGAAAAATTGTCTTTTAGAGAGAACGGTACAAGATTCTTCATCTTCTGCTGGCAATCTTCTGGTTGTCTTTTTCATCCAGCGATGCCGCTACCCTGAAGCATATCAGATTCATAAAAAGCTTT
GTGACTTGGAAGAAAAAATCATATCCCAAAACATGGATAAGAAAATTGTTGAGAGGATTGAAAGTGCAAGTGAATGGAGACAACGGTTGATTGAAAAATGTATTGAGTTGCTACCAGAAATACAGCGTCGACAGCTAAAAAGTGGAATTGTTTCTGAATATCCTGTTTCTACTTTGACAGTAGAGCAGTACCAACCTCTC
GATATGGAGATAGAGCAAGCAATATTGTCCACTGTTTCTAACACATCTGCAAGCATAGTGCCACCATCAGTACTTCAACAGCCATTTGATGCAAAGAAGAGCAAACTTACTCAAAATAGTTCCATGAACTCAGATGATATACCTTCTGCTTCCACTTTGGGACGGGGTGATAATCGTCAGCCATGCTTTCTTCCTGTGAA
ACCATTCCGATCCACAGTGGGAAGTCCATCACTTAATCCAACATTAGACTCATCTCCACTGCTAAATGGGCAGTCTAAGCAAAAAGATCAGGAAAAGCCTGGTGTCAGTCCCATTCGGGGTCGGATATTGAACTATGACTTTGAGTCTGGGAAGCCTTTGCATGAGAATGAATCAGCTGAGCAACATTCTTTTGTGTCAA
ATTATACATCCTCGCAGGAGGCAGGTAATGTGGAGAAAGAAGTTGCTTATAGAATTCATTCAAAGGGGTTTTTCTCAGATTCATCTAATGAGACGAGGGGGCATGAAGTATTAATTAAGACACATAATGGAACTGGAAGTTCTAAACAAAATGGGTATTCCATTTCAGGAGCTGTTTCACCTGTGAAAGATGGGGACCAG
GTGAGCCTTGAAAATGGTTTTCTTCATACACGAGACTTACCGACTACTTCAAGCTTTGATGCTCCATGTTCAAGTATAGTGATGTCGCAGGATAGATTGTCTGTTCCAAGTCGAACTGATTTGGACATCTCAGGCCTTCCCTTATCTAGCCCAGGATCAAGTGGAAAACGACTACCATCAGATCGTTCATGGCTGGCTAG
TCCATCTGATGATGATTTTTGGAGGGGAAAAGGAGGAGGAACAGTTCCCAGCTTCTCATTTAGTGCAAAGAATCAGGAATTGTCTCCATATTCTCATACTGATTCTTATCAAAGTCCAAATTCAGGGGTTGAAAGTCCAAAGCCAAATGGCGGTGTGAGATGGAGGTCAGATGAAGGAGAGGAGGAAGATGATCCGAGGC
CTAAAAGTTCTGGAAGGTTAAAAGGTTCTTCTGGTACTAAAGGAAGAGGTATAGGCCGAAGCAGGTTTTATGCAAGTCACATTTGATATCTTCTGATAATTTGTACCAATAAAATATGGGGTAGTCCAAATTTTATGTTGCTGGTATCCAGTTTTGGATTCTCCATTTCTTGTAGATTTAACATAATAGAAAGGCAAGAA
CAGGCTGCCCATAAGAGGATACATGCCTATTTCTAACTCGAAGATGCTACATGTGGTAGACATTCTTGAATATCAACCAATGTTTCCAAGCAAATATCCAAGTATCAGCTAGATTCAAGTGTAGCTGATATTCTGCGAGTTCTTCCAAGTGCTGGGATATCATGTTTATCCTTGGTTGCAAAGCTCAAGGTCTAAATCTT
TGCTTGAATGTCTTTGATTCTTCTGGAAGAGAAATTACTGTTTAATTATTGTACAACATCCTCGAGGATTTTATGAAAACCTGGCTGCATTTGCCAGCAGAATCTCAGTTGTTTGTTCTGTGCATTGTAAATCTGTTCCACATGTTTGGCATTTACCTCAAAATGAGAAGTAAAATCAAAGTTTTGTAACGGGCTTTTGC
AGAATTGCAGCACTGGAAGGTGACATGGGAATTTTCAATTAGATTGGTAGGCTAGATCCGGTTTTAACTTTTGATATCCCAAAATTTATGTTTTTGACTCAGAGTGGGGAGCTCGGCAGATAAACTGAGGGTTTTTGGTTTAAGGTCAACTCTTGGTATATTCAATAAATAATTAGCAAGCATGGATCATTCAATTCTGT
TTGATGTAAATGGAAATCAGTTTTTTGAAAGGATCAGTTATTCAGGGGACTAATTTTGACCGTATTCCTATGGGTTGGTGTGCTGATTGATGATATTTCCCTTTCATTCTTGATGTTATGGTTGAAACTCTTTTGTCAGCTAGGTGTGCTGCTATTTCCACTCAACTGCTAGAAGAAGTTAGGATATAGATGCCCAAAAT
CAAAAGACA
>TRINITY_DN124867_c1_g1_i1 from sample A1 / Example unspliced isoform:TTGGGTTGAAAGTTTTTCCCTCTTCTCGTAAAATTACTTACTAAAACTCGGGCACTATTTCAATTTCTCTACGACAGTCGGATGAACGGGCCACAGGAAAACCGCCATGAATACCGCTCTCAGAGACGCCCCCAAGCTCGGCAGTTCCCAGCGCAAGCGTCGACTGGATGCATTGGAGCGCTTAGCAAACATTGATCCTT
TTGATCTATGCAGTGAGGCAAAAGTTGAAAAGTGCCGTGCCATAAGAGACTTGAGGAGCTGTGGGCGAGTTGTTCAGCACATTTTAACATCTTGTGGCCATGCATCTTTGTGTGTGGAATGTATTCAACGGTGTGATGTATGTCCTATCTGTAGGGTTTCAATTCCAAAACATGATGGGACTATGCGATTACGTCTTTAC
AATGAATGTCTTGATGTTGGCCTTATCTCTAGAAAGTCTGATGAAAATTTTAAGGAAAGGAAAGGAGATGGCCAGTGTTGGACAGAAGATGTTCAGCATCTTTATTCTTTGTTTGATGTTGCCTTGGAGAATAATTTGATATCCCTGGTTTGCCATTgtatcctttgtgggggacttaatgtgtttattcatgcaattat
tttttgtgatttttatgtttagtatttttaaattataattacctttccagttcattccttatcatatttgcagATGTCACAGATGTTTGTATGGATGAAAGTGCTGTTTCCAGCGATGCTATTGTAGCAATGCTTCTCGATGGTGGAGTTGTAAAGGATTGGTGCAAGAGAACATTATTGAATGTCATATCTAGTCTGCC
AGAAATTTATAATCTCGGGGTTCAATCAGATGTATTCAGTAAGTATACAACGCAACTCGATGCTATAGTCAATGTACTTGAAGTGTTAGAAGGATCACTTTTGGATTTACCTTCACCTCAATTGTTGGAGCTGCAACATCTTTTGGAGACTGCATCCAAAGTGAAACAACATTTGGAGGTAATGGCTTGGTGTGCAAGGC
ACAGCTTTCTTGAGGGTGTTCAATGTCGCTATATGGGCATCTCTCATTGGAGAAATTCTTTTCATGAGAGAAAGACTGCTGCATGTGAGCGAACTTGGCCTGATTATTCAAAAAATACATCACGGCTTGGGTCTCAATCTCAAGCAACTTTGTTCATTGAGGATGCCTTGGCTAACCTGAGCATAGGGCAAGATTATGAT
GGAGAACTAGGAAAAGAGGCTCATGAACTAAGTTGGCTGCGGCAAGGAGGAAGTTTATCTCGGTTACCTTTCAAGGATGGACTGGATGGGCCTGCATACCCACCAGAAAATTTGCGTGCAGCTGTTGATCTTCTTTTTCTAGAGGGAAGTTCAGGTCTCATCCTTGCGAAAAGAGCAATTTTTCTTTATTACTTATTTGA
TCGCCATTGGAACGTTCCTAACACGAATTGGAGAAATATAGTGGATGATTATGCTGGAACCTTTGGCATCACAAGAAATTTAGTTCTTGAATCATTAGTCTTTTATCTGTTGGACGACAATACAGAGGAGGCATTAGAGGAAGCCTGTCATCTTCTTCCAGAAATTGTAAGTCCAACTACACATCCAAAAGTTGCTCGTG
TTTTACTCGAAAGGAAAAAGCCGGATGCAGCTTTGATGGTTTTACGTTGCGCTGGACATGATGGTCAGTTTGGAATCACAGATTCTGGTTTCCAGAGGGCAGGTGTAGTTGCTCTTCCTGAGGCTGTGACAGCTGTCAGAGTCAGGCTTGAGTGTGCACTTCTAACTGAAGCTTATCTTTATCAGAGAACACATTGCCTA
CGAGTCAAAGCAGAGCAATCAAAACACCGACAAATGACAGCTGGATCACATGGAGCAGAAGATATGAGTGGGTGTCGAGATTGGCTTACAGAAATGGAGATTCTAGTGGGTGAGATATGCTGGTTATGTATTAGAAGAAATTTGGTTGATAGGATGATTGAGTTACCTTGGCACAGCGATGAGGAAAAGTTTTTGAAAAA
TTGTCTTTTAGAGAGAACGGTACAAGATTCTTCATCTTCTGCTGGCAATCTTCTGGTTGTCTTTTTCATCCAGCGATGCCGCTACCCTGAAGCATATCAGATTCATAAAAAGCTTTGTGACTTGGAAGAAAAAATCATATCCCAAAACATGGATAAGAAAATTGTTGAGAGGATTGAAAGTGCAAGTGAATGGAGACAAC
GGTTGATTGAAAAATGTATTGAGTTGCTACCAGAAATACAGCGTCGACAGCTAAAAAGTGGAATTGTTTCTGAATATCCTGTTTCTACTTTGACAGTAGAGCAGTACCAACCTCTCGATATGGAGATAGAGCAAGCAATATTGTCCACTGTTTCTAACACATCTGCAAGCATAGTGCCACCATCAGTACTTCAACAGCCA
TTTGATGCAAAGAAGAGCAAACTTACTCAAAATAGTTCCATGAACTCAGATGATATACCTTCTGCTTCCACTTTGGGACGGGGTGATAATCGTCAGCCATGCTTTCTTCCTGTGAAACCATTCCGATCCACAGTGGGAAGTCCATCACTTAATCCAACATTAGACTCATCTCCACTGCTAAATGGGCAGTCTAAGCAAAA
AGATCAGGAAAAGCCTGGTGTCAGTCCCATTCGGGGTCGGATATTGAACTATGACTTTGAGTCTGGGAAGCCTTTGCATGAGAATGAATCAGCTGAGCAACATTCTTTTGTGTCAAATTATACATCCTCGCAGGAGGCAGGTAATGTGGAGAAAGAAGTTGCTTATAGAATTCATTCAAAGGGGTTTTTCTCAGATTCAT
CTAATGAGACGAGGGGGCATGAAGTATTAATTAAGACACATAATGGAACTGGAAGTTCTAAACAAAATGGGTATTCCATTTCAGGAGCTGTTTCACCTGTGAAAGATGGGGACCAGGTGAGCCTTGAAAATGGTTTTCTTCATACACGAGACTTACCGACTACTTCAAGCTTTGATGCTCCATGTTCAAGTATAGTGATG
TCGCAGGATAGATTGTCTGTTCCAAGTCGAACTGATTTGGACATCTCAGGCCTTCCCTTATCTAGCCCAGGATCAAGTGGAAAACGACTACCATCAGATCGTTCATGGCTGGCTAGTCCATCTGATGATGATTTTTGGAGGGGAAAAGGAGGAGGAACAGTTCCCAGCTTCTCATTTAGTGCAAAGAATCAGGAATTGTC
TCCATATTCTCATACTGATTCTTATCAAAGTCCAAATTCAGGGGTTGAAAGTCCAAAGCCAAATGGCGGTGTGAGATGGAGGTCAGATGAAGGAGAGGAGGAAGATGATCCGAGGCCTAAAAGTTCTGGAAGGTTAAAAGGTTCTTCTGGTACTAAAGGAAGAGGTATAGGCCGAAGCAGGTTTTATGCAAGTCACATTT
GATATCTTCTGATAATTTGTACCAATAAAATATGGGGTAGTCCAAATTTTATGTTGCTGGTATCCAGTTTTGGATTCTCCATTTCTTGTAGATTTAACATAATAGAAAGGCAAGAACAGGCTGCCCATAAGAGGATACATGCCTATTTCTAACTCGAAGATGCTACATGTGGTAGACATTCTTGAATATCAACCAATGTT
TCCAAGCAAATATCCAAGTATCAGCTAGATTCAAGTGTAGCTGATATTCTGCGAGTTCTTCCAAGTGCTGGGATATCATGTTTATCCTTGGTTGCAAAGCTCAAGGTCTAAATCTTTGCTTGAATGTCTTTGATTCTTCTGGAAGAGAAATTACTGTTTAATTATTGTACAACATCCTCGAGGATTTTATGAAAACCTGG
CTGCATTTGCCAGCAGAATCTCAGTTGTTTGTTCTGTGCATTGTAAATCTGTTCCACATGTTTGGCATTTACCTCAAAATGAGAAGTAAAATCAAAGTTTTGTAACGGGCTTTTGCAGAATTGCAGCACTGGAAGGTGACATGGGAATTTTCAATTAGATTGGTAGGCTAGATCCGGTTTTAACTTTTGATATCCCAAAA
TTTATGTTTTTGACTCAGAGTGGGGAGCTCGGCAGATAAACTGAGGGTTTTTGGTTTAAGGTCAACTCTTGGTATATTCAATAAATAATTAGCAAGCATGGATCATTCAATTCTGTTTGATGTAAATGGAAATCAGTTTTTTGAAAGGATCAGTTATTCAGGGGACTAATTTTGACCGTATTCCTATGGGTTGGTGTGCT
GATTGATGATATTTCCCTTTCATTCTTGATGTTATGGTTGAAACTCTTTTGTCAGCTAGGTGTGCTGCTATTTCCACTCAACTGCTAGAAGAAGTTAGGATATAGATGCCCAAAATCAAAAGACA