sp|Q94KJ7|VPS33_ARATH ----> Vacuolar protein-sorting-associated protein 33 homolog

Intron 1 GTGTTTGTCT ... TGAATCCCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	17.46	26	6	5
A2	21.95	16	6	3
A3	18.18	18	4	4
A4	14.29	9	2	1
A5	11.11	4	1	0
A6	19.32	71	14	20
A7	15.45	93	18	16
A8	19.52	101	24	25
A9	18.35	75.7	30	4
A10	14.67	64	12	10

>TRINITY_DN35843_c0_g1_i4 from sample A6 / Example spliced isoform

ATCCAAATCACTCATTCACTGAGGTGCGCGCTTTGAGCAAGAGCGGGAAGGTTTGTATATCGACTACTTCCAGAAAATCTTCGGCCCACATTTGTCATGACGTTTGCTGGACGACTTCATTAACGTTATGTGACATATCACATCTGGACATGCAATAATATTATAAGAGGACGAGGGTTTGGTTGAATTTTCTGTAGAGG
GAAGGTATTTAAAGTCTGTCAAATCTGCAGTTTTGGAAGACGATTCTTCTAAAAACGATGTATGGGAGAAAAGCTGTTGAACTTCTTCAAGAACTTGCCTCTGGCGAAAAAGAACAATTTGCTCGGTTTAATAATGATTTAGTTGAACAAGTGCTGGAGGAATGTAATGAACACCATTTTCAACTTGAAACTCGTTTGAG
AAAAATTCAAGAGGAAGATCTGGATGTGGAAACAACTAGGAACCAAGACCATTTTGGTGCTGTTGTTCATCACCTCTCTTTGATGCGCAATAAGCGTTGCCTCATGTCTTACATGTACAACCGGGCACAAAAAATACAAAGCTTAAGATGGAAGCTTGGATCTGTACTTCCAGAGGAAATTCAAATGAAGCTCAGCTATT
CTGAGAAGGAATACTTTAAGAGTTACTCAGAAATATTGGGATCGCACATGTCAGAGTTAGATCTTGACCTTACTGTGGATATGATCCCCCCAAAAGATCCATACATTAAGGTTCGTGTGGTTGATGATATCGGTGAAGTTTTGCTTGATGATCAGTCAACATCACTGATACGTAACTCAATGCATTTGATGAAGCGAACT
GAAGCAGAGTCTTTTGTTTCCCAGGGCTTGATGGAGGAGTTCATAGAATGATATAATGGCCGTTGCTAGACAGTAGCAGATACCATGCCATTTAATCTAAAGAGACAATGGGAACACATTTAAATCAAATTGCTTTTAATTTCTATAAAGAACTGTGCTTCCCACAGTGAAGCACAGGAGTGCTGAGAGCAGTTGAGAAC
TTGATTGGATGAAGAGTTCATGGAATGATAGAATGGTTGTCGCTACAAATTAGCAGATATTATGCTCTTTAATCTAGAGGTAATGGGGACAGATTTAAGTCACATTGCTTGTAACTACTATAAAGAGCTTTTCCTTTGAAACATTGGAGTGCTGGAAGCAGTTGAGAACTTTTAAGTTTTAACTGATTGCGGATACCACA
CCCTTTAATGGAAGCAATGAGAACTTATTTAATCACATTGCTAGTAACTAATATAAAGATTTATACTTCCCAATGTGAAGCACAGGGATGCTGAGAGCAGTTGAGAACTTGATTGTATGGCAAAAACTAATTGGAAAGCGGTTTATTTTGTCAAATTTCTCTTTTCGAAGAGCTTTTTGTCATTTGATGTGTTGTATTTG
AAGTTTCAGGAATTACAAACTACTTCAAAATCCTTTATATAAACTGCTTGAAACAGAAC

>TRINITY_DN35843_c0_g1_i1 from sample A6 / Example unspliced isoform:

CGATGTATGGGAGAAAAGCTGTTGAACTTCTTCAAGAACTTGCCTCTGGCGAAAAAGAACAATTTGCTCGGTTTAATAATGATTTAGTTGAACAAGTGCTGGAGGAATGTAATGAACACCATTTTCAACTTGAAACTCGTTTGAGAAAAATTCAAGAGGAAGATCTGGATGTGGAAACAACTAGGAACCAAGACCATTTT
GGTGCTGTTGTTCATCACCTCTCTTTGATGCGCAATAAGCGTTGCCTCATGTCTTACATGATATGATCCCCCCAAAAGATCCATACATTAAGGTTCGTGTGGTTGATGATATCGGTGAAGTTTTGCTTGATGATCAGTCAACATCACTGATACGTAACTCAATGCATTTGATGAAGCGAACTGAAGCAGAGTCTTTTGTT

TCCCAGgtgtttgtctttgctgcttttgtaaaatggttcactgtaacattatttgttatttcatccttctagctgggctcaaagcattttatttcttctgagactgatgagtttatcctatcttcacattttaactatatgggtgtttgtatgaatcccagGGCTTGATGGAGGAGTTCATAGAATGACATAATGGCTGT
TGCTAGAAAGTAGCGGATACCATGCCATTTAATCTAAAGAGACAATGGGAACACATTTAAATCAAATTGCTTTTAATTTCTATAAAGAACTGTGCTTCCCACAGTGAAGCACAGGAGTGCTGAGAGCAGTTGAGAACTTGATTGGATGAAGAGTTCATGGAATGATAGAATGGTTGTCGCTACAAATTAGCAGATATTAT
GCTCTTTAATCTAGAGGTAATGGGGACAGATTTAAGTCACATTGCTTGTAACTACTATAAAGAGCTTTTCCTTTGAAACATTGGAGTGCTGGAAGCAGTTGAGAACTTTTAAGTTTTAACTGATTGCGGATACCACACCCTTTAATGGAAGCAATGAGAACTTATTTAATCACATTGCTAGTAACTAATATAAAGATTTA
TACTTCCCAATGTGAAGCACAGGGATGCTGAGAGCAGTTGAGAACTTGATTGTATGGCAAAAACTAATTGGAAAGCGGTTTATTTTGTCAAATTTCTCTTTTCGAAGAGCTTTTTGTCATTTGATGTGTTGTATTTGAAGTTTCAGGAATTACAAACTACTTCAAAATCCTTTATATAAACTGCTTGAAACAGAAC