sp|Q93VH9|RS41_ARATH ----> Small ribosomal subunit protein eS4z
Intron 1 GTATATAGAA ... TCGTAAGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 54.77 | 45 | 51 | 58 |
| A2 | 52.34 | 51 | 47 | 65 |
| A3 | 55.13 | 35 | 50 | 36 |
| A4 | 48.67 | 58 | 50 | 60 |
| A5 | 57.45 | 20 | 31 | 23 |
| A6 | 70.49 | 9 | 19 | 24 |
| A7 | 74.07 | 14 | 44 | 36 |
| A8 | 60 | 11 | 14 | 19 |
| A9 | 71.88 | 18 | 39 | 53 |
| A10 | 49.44 | 45 | 49 | 39 |
>TRINITY_DN41296_c1_g2_i7 from sample A9 / Example spliced isoformCATACTGGGTCTGGTGTTTCATATGAAGTGGATTCAGCTCTAGAAACTCTGGTTTTGCTGGCAACAAAGCATTCTCGAGAGCTTCTCCCTGTTTCTTCTTATATAACTGGTATTTTGGATTATCTGGAAGGATTTCAAGATGAACACCTACATAAGATTTCAAATCCAGATCCAAGATACAGGCGTATGGGCATTATTGG
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GCCTGAATTTCTTTATTTATTGCTCGGAATAAAATGCCACATGTTTATGTTCAAGCAAGATTACTGCATAAAGATCATTAATGATGCAGATTGCATTCTATTAGCTC
>TRINITY_DN41296_c1_g2_i3 from sample A9 / Example unspliced isoform:CATACTGGGTCTGGTGTTTCATATGAAGTGGATTCAGCTCTAGAAACTCTGGTTTTGCTGGCAACAAAGCATTCTCGAGAGCTTCTCCCTGTTTCTTCTTATATAACTGGTATTTTGGATTATCTGGAAGGATTTCAAGATGAACACCTACATAAGgtatatagaattttcagccaacttgctttaacagtttggtctgg
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CCCTGTGGTGGTCTAGAAGGGGAAATATGGATGAATTTGGATGGTGAGGTGTCACCAATTTGCCTTAATGTCCTACCTCTAGTGACATCTTATCAGCAAAGGTCCTCGCAGGCATTGCATTTTCTTCCTGCTAATTTTTATCTATTAGCGGTTGTGGAGCAACTAACAAACAAAGGTTCTCTTGGGAGCATTGATGCACT
CCTTGGTTGTCCCTTGTATCTTCCGAAACATCAGCTTTTATTTGGAGACACATGGAAATCTTTGGCTAGAAGACACAAGCATATAATATGCCTTTCACTTTACTATGGAATAAGCTGGATAAGGGAGTTGATAAATGCTTTCTCTACACAAATTGCTGACCAAATGGAGAGTATGACCCAATTTACGCGGGAAGAAACAG
CTGTAAAATTATTGAAACGCATGAGAAACTTATTGTACTTGGAAAGTTTACTGAATATGTGCCTCAAATCATTGCCTCTATTTTTGCCACAGCTACATTCTCTTACAGACAGCTCTGGACCTGCAGAAAATAGTGAGCATCACCAGTTAAAGAACACCCCATTGAAAAAAAGAGGAAGAAAATCAAAAGCCGTGGGTTTA
GGCAGTGCATCAGAAATAATTAAAAGTCAGAGTACAAGCTCAAAGTCTTCCCAAGATCGAAATTCTAGTGGAAGACTAAAGCAGCAAACAATTTCAGATGTCTTGAAAAATGTAACAAGAGGGCCAAGTCAGCAATCTTCTCAGCAGACACAGGGTTTGCCTGCCAGTTCAGATAAACAAAAGGGAACTACAGGCGAGGA
GACAGAAGCTAGGAATAATGATGAACAAGAATTGATAGATATTTCAATGTTTCCTGAACAGTTGGAGATGCAGAGATTCAAATTCAGGCCACTAGTTTTATCCTGTTTATCAATCCTCTCTCTTTCGCAGGAGTCAAAGGAATCCTGTTGCGCTGATCCAGCAGCTGAGCTGCCAGTTCACTTGTACCTTATACGTGATT
TTTGCCATAAACTGGACTGCATGGATTTTCCTCGCAAGCAATTTCCTGCAATGTTATCCACTGTATGCAAGGCGCCTTCTGGCCTTAAGAACATGTCCTTATTTGAATTTCTAAAGAAAGTGCAAGGCCTATTTCCAAGCCTCAGAAGGCATCTTGACAGTGCAGTTAATTTGCTTAAAGAAGATTGTGAAGCTTACCGA
CAACATTGGATGACTGAGTCTCTTTCATCTGGGAACCCAAAAATAACAATTGTTATTGCTTCAAGTTCTCTAACTGCAGAATCTGTTTTCAAGGAGATTCTTTGCTGTGTGCGTAAGATGTTAAGCTTTGATGACTTGTCCACTCCTAGTAATGTGCCCATTCTAAAAGAGTTGCTTGAGGCATTCCAATCATCCGATGC
AGCAAATGATCTTTGTTCACTTCACCCATGCCCTTCTTTTGGCACTTTGGAGTACTGTTTCTGTAGTGCATATGCATTCATTGATGGGCTTTTTGATACTGCTAGCACAACTTCATTTTTAGTGGCATCAGAACTTATAATGACACTCAGAGCATTAGCAAACTGTGCTCAAGCCTCTGTTGAAAAATTTGCTGAAAGCA
AGCGACGACACTCAAGTGTTAGTGGGATGGTAAGATTTGTCCCAATTTTGCGTAAAAGGCTGAGTGCATCAGCACGTAAGTTACTGGAGCACAATTGGGATATTGATGGTCAGGGTAAAACTTGGACAAGCAAAGGAGATGTGCTACAGCAGGTACTTCATATCTACATTGAATACAGTGAATCTCCAATCGATTGTCTT
GAAGAACTTGCTTGCAGCTTTATGCCACAGATGCCTGCAGGGAAATCCCGAAGTGGACAAGATTCAGTTCTAGGGTTTCCTACTCTTTCCTCGGCTACATTCGTTATTTGGTACCGAGTACAGCATGAAGAAATCCTTGTTATCTTAAACAAAGTGATCCAAGAAATAATAACATGTCACAAGTCGAAGGTTGCTGTAAA
TGAAGAGAATGTCAAAAAGCTTTTGAGTACTGCCCATCAGTGTGTGAATGTGGTTGTATCTCTTGTGAATCTGACAAAAATTCATGATAAGGTATCCATACATGCCATGGCAGTTAAGTATGGTGGGAAATTCGTAGACACCTTTCTGAAAGGTTTTGAATTTTTCCAGGCACGCTATGATGCTCACAAGAATAACGTAA
TTACGTTGGTGAAAGAGCTCCAGAAAGCAACCAGGACTATTCAAACACTCTGTTCTGAGGCCAAGGGTTTCAAAAGGACACTCATCACAAGCAAGATCCCTGCTGTGAAGCGGTCCATGGAACGCTACCTGTTTTGTGTTAAAGCTCTTCTTCACAGTACCTCACATGGCGATACTTTCTGGATGGGCAACCTAAAGCAT
AAAGATTTGCAAGGTCGGGAGGTTAGTTCTCAGTTGCATGTGAGTGAAGATGAAGAGGATGAACCTCTAGATGGCCAGAATGAGGTGGCTGAGTCCGATGATAATGATGATGATGGTGAAAATAATCATGTCCAGGGATTGGAGAGTTGAAACGTGAGGAAATGATTAATTTCAAGGCAGGTGACATGAGGAAATGAAAC
GTGCAACATCTCTCTTCTTAGTTAAATCTCACTGATTTGAGCTGATACCAGTTTCTGGATTGTGTCCATGTATTGATGTCTGCAAAGTTAAATTAATATAGAAATGAGCCAATTGAGCCCTTCGACAAGTGACGATGGCAACTATACACTATCTTCTTTTGCAACCAACTATACACCTGTAATAATTAAGAAGAGAACAG
AACAGTTTTCACTACAAGACCAATCAGCCATTGTTTGGTAGTTAGAATAGATGTATGTCTGTAGCTATATGTCCACCAAACATCATCTTGTTATCAGAGGCATGTATTGAGAATATCTGATGTAAATAGTAATCAATGACTCTTCTCAAGGGAGCTAAATTTGTGATCTTTCCAGTAGACGACAATTGACCCACTAAACC
ATTTGGGAGTACCTGTAGGGCATTATTTGGCCTCACTTCGTCCAGGCCTTGACATTAGAGATGGTTAATTTGGTGACATTTTATCCTTTTTGACCTGAGAGTTGTAGACTTCAGACACCCTGCAACTCAAAGTTGTATTGGTGACTTGGAATGTTGGAAATGTTTGTAGTATGTACATTTACTAATCAGAAAGCTCATAA
TATTGGTGCAATTTGTGCTACCTTGTTCTTTCAACTTCTCATGCGAATGCATATAATGCTTGGCATCTTGTTATCCATGCCAATTAGCTACAAACTTTGCTTGCCTGAATTTCTTTATTTATTGCTCGGAATAAAATGCCACATGTTTATGTTCAAGCAAGATTACTGCATAAAGATCATTAATGATGCAGATTGCATTC
TATTAGCTC