NA ----> NA
Intron 1 GTATGTATAA ... TTGTTGGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 30.95 | 29 | 8 | 18 |
| A2 | 40.3 | 20 | 7 | 20 |
| A3 | 32.26 | 42 | 12 | 28 |
| A4 | 36.17 | 30 | 10 | 24 |
| A5 | 20 | 14 | 4 | 3 |
| A6 | 54.1 | 14 | 29 | 4 |
| A7 | 49.09 | 14 | 21 | 6 |
| A8 | 44 | 21 | 25 | 8 |
| A9 | 48.15 | 14 | 19 | 7 |
| A10 | 33.33 | 23 | 15 | 8 |
>TRINITY_DN98784_c0_g1_i1 from sample A5 / Example spliced isoformAAGTATTATCTGTTGGGTATATGTTGTAAGCTCAAGAACAAGAAGAGGATCGGTTCAGGGGATGGCTATGCAATGTTAAGCTAAGCCTGCAGCGCACAGTGGAGTAGATTAAGAGTTATCCATAACTGGGTAGAATTTCTTATTGAAATTCCAGTTAAGAAGAAGGGTGGACTGGGTAGAATTCCATAAAGAATTCCAGT
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>TRINITY_DN98784_c0_g1_i2 from sample A5 / Example unspliced isoform:AAGTATTATCTGTTGGGTATATGTTGTAAGCTCAAGAACAAGAAGAGGATCGGTTCAGGGGATGGCTATGCAATGTTAAGCTAAGCCTGCAGCGCACAGTGGAGTAGATTAAGAGTTATCCATgtatgtataaagcttttgatattaatggaaaaacacaagttttcttgtcacttattgtgtattgattttatgtgtta
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CGTTGCAGAAAACTGCTAAGGAGGTTTGGAACAAATGCTATTTCATTTTATGAGTTCATACAAATTGAATTCTAGATAATTGCTGTGAAGACATTGTTGTAAAGATTTTATCCTTTAAGAATTGGAATCTATTGTGGGGACC