sp|P55852|SUMO1_ARATH ----> Small ubiquitin-related modifier 1

Intron 1 GTAAGATTTT ... TGTTTAACAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	26.1	923	145	326
A2	24.23	910	169.7	291
A3	19.73	948	200	233
A4	25.46	527	79.3	180
A5	18.68	431	74.7	99
A6	21.89	11313.7	2150.7	3170
A7	20.2	12146.7	2528	3074
A8	23.98	13452.3	2257	4244
A9	19.5	12345.3	2509.7	2990
A10	16.97	9297.3	2096.3	1900

>TRINITY_DN108891_c0_g1_i1 from sample A1 / Example spliced isoform

CGCGGATTTAAAAAGGCATTCGGCTAAAGTAAATTCTGTAGCCGCTCGATCACTTTTATGATTCTATTCCTCTGCCACAATAAACTTCACTGCACACACAAACACGGGGCAAGTTCTCGGGGCGGATGCGCTGCGACTTTGGGAGGATTGGTCGACTCCGTCTTTAAAATTTAGGCTTTGGAACTGAATCCCCGCTGCCA
GTTTTAGCGGCTTGGAGTGAATTTTGAGTGTTTTCGGGTAAGAATTGCTTTAGTTCGAGGGATCAGCCATGTCTGGCGTCGATAATGGCGGAAGCACGGGTGTCACCAACCAGGAGGAAGAGAGGAAGCCCATGGACCAGGGTGCCCACATTAATCTTAAAGTCAAGGGCCAGGATGGAAATGAAGTATTCTTCAGGATC
AAACGTAGTACACAACTGAGGAAGTTAATGAATGCTTACTGTGATAGGCAATCCGTTGATTTTAACTCTATAGCTTTTCTGTTTGATGGGAGGCGTTTACGAGGGGAACAAACTCCCGAAGAACTTGAAATGGAAGACGGGGATGAGGTTGATGCCATGCTTCATCAAACAGGAGGCAGGCGCTGAAGTGTGCTGCAAAC
TGAAGCAGTTTGGATTTGGAAAACATGTTAGAACCTTTTGGACTTAGTGTCAGCATGTAATATTAATTTTCATAGACTTAATTAGCATGCTCGGATTTAATATATATAGATCCCTTTGTATGGAACACATTGCACTTGCAATAAACAATGGATGTGAACTCAAATCTATCTTGATTGCGTGTTCTCTATTATGGGTAATA
TTTTGTACATGATTGGCACATGATATCAAATCTTACATTTGCTCTTAATGTTTGGCGTTGACCCTTGTTTGAAGTAAA

>TRINITY_DN108891_c0_g1_i2 from sample A1 / Example unspliced isoform:

GAGGGGAACAAACTCCCGAAGAAgtaagattttactgtgccatggtgttttgtacagacttatcttttactgttactatacttattttcagaaattgaaagacttaccagaaaatgattccaaggatttttttcatggctgaagaacaattttttcgttgatgtttaacagCTTGAAATGGAAGACGGGGATGAGGTTGA
TGCCATGCTTCATCAAACAGGAGGCAGGCGCTGAAGTGTGCTGCAAACTGAAGCAGTTTGGATTTGGAAAACATGTTAGAACCTTTTGGACTTAGTGTCAGCATGTAATATTAATTTTCATAGACTTAATTAGCATGCTCGGATTTAATATATATAGATCCCTTTGTATGGAACACATTGCACTTGCAATAAACAATGGA
TGTGAACTCAAATCTATCTTGATTGCGTGTTCTCTATTATGGGTAATATTTTGTACATGATTGGCACATGATATCAAATCTTACATTTGCTCTTAATGTTTGGCGTTGACCCTTGTTTGAAGTAAA

Intron 2 GTACCATTAC ... GATCCGGCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	18.39	1327	299	211
A2	20.15	1462	369	270.3
A3	20.77	1536	402.7	310.3
A4	19.48	959	232	150.3
A5	19.69	640.3	157	160
A6	17.73	14213	3064	3365
A7	18	16940.3	3717.7	3961
A8	17.4	15203.3	3203.7	3529.7
A9	17.48	16505.3	3496.3	4068
A10	16.7	14061.3	2818	3608

>TRINITY_DN43966_c0_g2_i1 from sample A6 / Example spliced isoform

ACCAAATCCACGAAAAAATATCAGCCGTTCGATCTGGGTCCCCTCTCTCGTCATTTAATCACTCCCACGCTCCCAAAATACCCCAAAAAATCAATGAAGAGGAGAAGGTCCCGCGGATTTAAAAAGGCATTCGGCTAAAGTAAATTCTGTAGCCGCTCGATCACTTTTATGATTCTATTCCTCTGCCACAATAAACTTCA
CTGCACACACAAACACGGGGCAAGTTCTCGGGGCGGATGCGCTGCGACTTTGGGAGGATTGGTCGACTCCGTCTTTAAAATTTAAGCTTTGGAACTGAATCCCCGCTGCCAGTTTTAGCGGCTTGGAGTGAATTTTGAGTGTTTTCGGGTAAGAATTGCTTTAGTTCGAGGGATCAGCCATGTCTGGCGTCGATAATGGC
GGAAGCACGGGTGTCACCAACCAGGAGGAAGAGAGGAAGCCCATGGACCAGGGTGCCCACATTAATCTTAAAGTCAAGGGCCAGGATGGAAATGAAGTATTCTTCAGGATCAAACGTAGTACACAACTGAGAAAGTTAATGAATGCTTACTGTGATAGGCAATCCGTTGATTTTAACTCTATAGCTTTTCTGTTTGATGG
GAGGCGTTTACGAGGGGAACAAACTCCCGAAGAACTTGAAATGGAAGACGGGGATGAGGTTGATGCCATGCTTCATCAAACAGGAGGCAGGCGCTGAAGTGTGCTGCAAACTGAAGCAGTTTGGATTTGGAAAACATGTTAGAACCTTTTGGACTTAGTGTCAGCATGTAATATTAATTTTCATAGACTTAATTAGCATG
CTCGGATTTAATATATATAGAACCCTTTGTATGGAACACATTGCACTTGCAATAAACAATGGATGTGAACTCAAATCTATCTTGATTGCGTGTTCTCTATTATGGGTAATATTTTGTACATGATTGGCACATGATATCAAATCTTACATTTGCTCTTAATGTTTGGCGTTGACCCTTGTTTGAAGTACACTCAATTTGTC
AATGTAGGTTGCCTTATTGTGTGTTGCCATAAATTGAGTTGTTTGAAGTGATTTATCTTCTTTTTCTTCTAATGATAAATTGAAATACAGAGGTTCATTATTAATGCAAATGGTGAGATGGGAGAAGAAAAGTTGTGCAGTGTGGATGGTCGGATTTTAACATTTATCACTTTGAACTTTACTGCTTTTGGTGTTTAGGT
TTATTCCTAACCTGAGCAATTCCTAATTGCATATAATATGGCATAACAGGGACGAGCATTTTGATCGATGCTGTGTGCAATTTGTGTAAAGAAAAACCTAAAATTGCAGTACTAGGTACTCTTGTTTTTATTACCTGCGAAAGGTTTGGTTGGTTGGTTGGCATCACGAACAAATATCGAACTTAATGAAGACAATGAAT
GCATC

>TRINITY_DN43966_c0_g2_i2 from sample A6 / Example unspliced isoform:

ACCAAATCCACGAAAAAATATCAGCCGTTCGATCTGGGTCCCCTCTCTCGTCATTTAATCACTCCCACGCTCCCAAAATACCCCAAAAAATCAATGAAGAGGAGAAGGTCCCGCGGATTTAAAAAGGCATTCGGCTAAAGTAAATTCTGTAGCCGCTCGATCACTTTTATGATTCTATTCCTCTGCCACAATAAACTTCA
CTGCACACACAAACACGGGGCAAGTTCTCGGGGCGGATGCGCTGCGACTTTGGGAGGATTGGTCGACTCCGTCTTTAAAATTTAAGCTTTGGAACTGAATCCCCGCTGCCAGTTTTAGCGGCTTGGAGTGAATTTTGAGTGTTTTCGGGTAAGAATTGCTTTAGTTCGAGGGATCAGCCATGTCTGGCGTCGATAATGGC
GGAAGCACGGGTGTCACCAACCAGGAGGAAGAGAGGAAGCCCATGGACCAGGGTGCCCACATTAATCTTAAAGTCAAGGGCCAGgtaccattacacaagattttgaagtagatggggaggttgggggaggtaaaagaaggattatacaaatgcattgagcggatggtctctgatcctagtaaacaagatgagatacacaa
caagctcttgcatttcaatgagagtattggtatctttggcatggctatggctatatgaagtagagcaaaagatccggcagGATGGAAATGAAGTATTCTT