sp|Q9SQI3|FATB_GOSHI ----> Palmitoyl-acyl carrier protein thioesterase, chloroplastic


Intron 1 GTGGGTTTAT ... TTTCGTGCAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A156163.410208
A258.721169165
A357.25159.818.8214
A460.9210226159
A559.33854124
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A760.4531447480
A856.251474189
A959.5529026427
A1059.96337.846.4506



>TRINITY_DN107956_c0_g1_i4 from sample A2 / Example spliced isoform
ATTTGAACCAGCCTGTGTTATACGCGTGTATTCTCTGCTATGTCATGTATTGGATTGGATCGTTGGTGCATTTGCATTTCCATGGGCTTGAACAAGTTCTGATTTGGTGGACTCTGATATTGCATACACCATAACAGATTCAGCAGATCCATGCTCGCAATCCCAAGGGTTCAAGATGGTGGCCGCCGCTGCAACAATGC
TAATGTTTTCTTCAAGCTCTCAGTGCAATACACAGAACAAGATCTCGTCATCTGCTTCATCAGGGAAGCCCACAATGCCAGTGAGCTCTCCTGAGCGTGTTGATGTAAAACTTAAACCCACTACATACAAGGGACTCCAAGTCAATGGAAATTCTCAAGGGGCATCCAAGATCAATGGCATCAAGGTGAACGGAACAGCA
GTGGATAGCATGAAGCATAACGTTGGCTTGAAGGAAGCACCTGAGGAAGAAAGCACTGCTAAGAGCAGGATCAATCAACTCCCAGATTGGAGTATGCTTCTTGCAACTATTGCTACCATTATTCTGGCAGCCGAGAAGCAGTGGACCAATTTTGACTGGAAGCCAAGGAAAACAGACATGTTTGGTGACGTTTTCAGGTT
GGGCAGATTTATGGAAGATAATCTGGTTTTCAGGCAGAACTTCGCCATAAGATCTTATGAGATTGGTGCAGACAAAACGGCTTCTATTGAAACCTTGATGAACCATCTTCAGGAAACTGCCCTCAACCATGTTTGGCTTTCTGGGCTAGCTGGGGATGGATTCGGTGCTACTCTTGAGATGAGCCGGAGAAATCTTCTAT
GGGTTGTGGCTCGCATGCAAATTCAAGTTGAACGTTATCCCTCATGGGGTGATATTGTGGAGATAGATACATGGGTTGGCCCATCTGGTAAAAATGGCATGCGGCGTGATTGGCTTGTTCGAGACTCAAAGACGAATGCCATTCTTACAAGAGCTACCAGTACATGGGTAATGATGAATAGAAAGACAAGAAAACTGTCC
AAAATTCCTGATGCTGTCAAAGAAGAGATACAGCCTTATTTCACAGCAAGAAATGTCTTTGTGGCAGAAGACACCAGAAAGTTGCCAAAGCTGGAGGATGACACTGCTCAGTATATATGTTCGGATCTAGCACCACGTTGGAGTGATTTGGATGTGAATCAGCATGTCAACAATGTTAAATATATTGGTTGGATTTTGGA
GAGTTTACCCATCTCTGTTTTAGAGGGCAATGAACTAGCTAATATAACATTGGAGTACAGGCGTGAATGTGGGCCGACGCATGTACTCCAATCATTGACAAGCCCACAGCCTGGTGAGGTGATTGCCGGTTCAACTGCACCATTTTCGCAGAGAAATGATCCTGCAGACACCTTTAAATCCTTGCCTGCATTGCAGTTTG
CCCACTTGCTTCGAATGCAAGATGACAGATCAGAAATTCTAAGGGCAAGGTCAGAATGGAGGTCAAAGAAAAAGAACAATCTTAACAACCTTCACGATCTTGCTTGACCTCATATTATGCAGTGTACATACATGTATACTTATTGATGCTTTCTTTAATCTTCATTCTTATTGATACTTATTTGTGATGTAATGCTGTTC
GCTCGTATGTATTGTCCTGCAAATGGATGAAGGATGGCTCTATGTCTTGATGTTATTGCAAGCTTTGCTCAGATCTAGCAATATGTTTTATTAGATTTTAGAATCATGTTTTGCATCTCACAGTGCCAGGCTGTGGAATTAAATATTTTTAGTTGGGCTTCCTAGAAAGGCAGTACTTTATTTTGCCACATTCCTTCTCT
TTGTCGTGGCATTTAGGACAAATGCATCTTTATAGTTTTAACTCTGGCGAAGGTACATTGTATGCTGGTTGGAACTCCCTTGGTTCAGTTTGACTTTAAGAAACAGTTGAAAGCTGAATCAAATATATTCTATCTAGATGGAAGTTGCCTATTCTTTCAATGTAAAGCTTGATATTCTATTTTGCGA


>TRINITY_DN107956_c0_g1_i1 from sample A2 / Example unspliced isoform:
ATTTGAACCAGCCTGTGTTATACGCGTGTATTCTCTGCTATGTCATGTATTGGATTGGATCGTTGGTGCATTTGCATgtgggtttatgagggaatgattctgcgatattttcttcaatgcattcgctgttatggaccctggtttgattattttgaatttcgtgcagTTCCATGGGCTTGAACAAGTTCTGATTTGGTGGA
CTCTGATATTGCATACACCATAACAGATTCAGCAGATCCATGCTCGCAATCCCAAGGGTTCAAGATGGTGGCCGCCGCTGCAACAATGCTAATGTTTTCTTCAAGCTCTCAGTGCAATACACAGAACAAGATCTCGTCATCTGCTTCATCAGGGAAGCCCACAATGCCAGTGAGCTCTCCTGAGCGTGTTGATGTAAAAC
TTAAACCCACTACATACAAGGGACTCCAAGTCAATGGAAATTCTCAAGGGGCATCCAAGATCAATGGCATCAAGGTGAACGGAACAGCAGTGGATAGCATGAAGCATAACGTTGGCTTGAAGGAAGCACCTGAGGAAGAAAGCACTGCTAAGAGCAGGATCAATCAACTCCCAGATTGGAGTATGCTTCTTGCAACTATT
GCTACCATTATTCTGGCAGCCGAGAAGCAGTGGACCAATTTTGACTGGAAGCCAAGGAAAACAGACATGTTTGGTGACGTTTTCAGGTTGGGCAGATTTATGGAAGATAATCTGGTTTTCAGGCAGAACTTCGCCATAAGATCTTATGAGATTGGTGCAGACAAAACGGCTTCTATTGAAACCTTGATGAACCATCTTCA
GGAAACTGCCCTCAACCATGTTTGGCTTTCTGGGCTAGCTGGGGATGGATTCGGTGCTACTCTTGAGATGAGCCGGAGAAATCTTCTATGGGTTGTGGCTCGCATGCAAATTCAAGTTGAACGTTATCCCTCATGGGGTGATATTGTGGAGATAGATACATGGGTTGGCCCATCTGGTAAAAATGGCATGCGGCGTGATT
GGCTTGTTCGAGACTCAAAGACGAATGCCATTCTTACAAGAGCTACCAGTACATGGGTAATGATGAATAGAAAGACAAGAAAACTGTCCAAAATTCCTGATGCTGTCAAAGAAGAGATACAGCCTTATTTCACAGCAAGAAATGTCTTTGTGGCAGAAGACACCAGAAAGTTGCCAAAGCTGGAGGATGACACTGCTCAG
TATATATGTTCGGATCTAGCACCACGTTGGAGTGATTTGGATGTGAATCAGCATGTCAACAATGTTAAATATATTGGTTGGATTTTGGAGAGTTTACCCATCTCTGTTTTAGAGGGCAATGAACTAGCTAATATAACATTGGAGTACAGGCGTGAATGTGGGCCGACGCATGTACTCCAATCATTGACAAGCCCACAGCC
TGGTGAGGTGATTGCCGGTTCAACTGCACCATTTTCGCAGAGAAATGATCCTGCAGACACCTTTAAATCCTTGCCTGCATTGCAGTTTGCCCACTTGCTTCGAATGCAAGATGACAGATCAGAAATTCTAAGGGCAAGGTCAGAATGGAGGTCAAAGAAAAAGAACAATCTTAACAACCTTCACGATCTTGCTTGACCTC
ATATTATGCAGTGTACATACATGTATACTTATTGATGCTTTCTTTAATCTTCATTCTTATTGATACTTATTTGTGATGTAATGCTGTTCGCTCGTATGTATTGTCCTGCAAATGGATGAAGGATGGCTCTATGTCTTGATGTTATTGCAAGCTTTGCTCAGATCTAGCAATATGTTTTATTAGATTTTAGAATCATGTTT
TGCATCTCACAGTGCCAGGCTGTGGAATTAAATATTTTTAGTTGGGCTTCCTAGAAAGGCAGTACTTTATTTTGCCACATTCCTTCTCTTTGTCGTGGCATTTAGGACAAATGCATCTTTATAGTTTTAACTCTGGCGAAGGTACATTGTATGCTGGTTGGAACTCCCTTGGTTCAGTTTGACTTTAAGAAACAGTTGAA
AGCTGAATCAAATATATTCTATCTAGATGGAAGTTGCCTATTCTTTCAATGTAAAGCTTGATATTCTATTTTGCGA




Intron 2 GTATATTTAG ... TTATATGCAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A125.5136871.3126
A220.3730561.978
A317.6831257.267
A426.5528548.5103
A521.9418528.952
A617.351596311.5335
A718.021560306.9343
A819.631691288413
A918.521615306.7367
A1016.141195229.5230



>TRINITY_DN100295_c4_g1_i3 from sample A4 / Example spliced isoform
ATTTGAACCAGCCTGTGTTATACGCGTGTATTCTCTGCTATGTCATGTATTGGATTGGATCGTTGGTGCATTTGCATGTGGGTTTATGAGGGAATGATTCTGCGATATTTTCTTCAATGCATTCGCTGTTATGGACCCTGGTTTGATTATTTTGAATTTCGTGCAGTTCCATGGGCTTGAACAAGTTCTGATTTGGTGGA
CTCTGATATTGCATACACCATAACAGATTCAGCAGATCCATGCTCGCAATCCCAAGGGTTCAAGATGGTGGCCGCCGCTGCAACAATGCTAATGTTTTCTTCAAGCTCTCAGTGCAATACACAGAACAAGATCTCGTCATCTGCTTCATCAGGGAAGCCCACAATGCCAGTGAGCTCTCCTGAGCGTGTTGATGTAAAAC
TTAAACCCACTACATACAAGGGACTCCAAGTCAATGGAAATTCTCAAGGGGCATCCAAGATCAATGGCATCAAGGTGAACGGAACAGCAGTGGATAGCATGAAGCATAACGTTGGCTTGAAGGAAGCACCTGAGGAAGAAAGCACTGCTAAGAGCAGGATCAATCAACTCCCAGATTGGAGTATGCTTCTTGCAACTATT
GCTACCATTATTCTGGCAGCCGAGAAGCAGTGGACCAATTTTGACTGGAAGCCAAGGAAAACAGACATGTTTGGTGACGTTTTCAGGTTGGGCAGATTTATGGAAGATAATCTGGTTTTCAGGCAGAACTTCGCCATAAGATCTTATGAGATTGGTGCAGACAAAACGGCTTCTATTGAAACCTTGATGAACCATCTTCA
GGAAACTGCCCTCAACCATGTTTGGCTTTCTGGGCTAGCTGGGGATGGATTCGGTGCTACTCTTGAGATGAGCCGGAGAAATCTTCTATGGGTTGTGGCTCGCATGCAAATTCAAGTTGAACGATATCCCTCATGGGGTGATATTGTGGAGATAGATACATGGGTTGGCCCATCTGGTAAAAATGGCATGCGGCGTGATT
GGCTTGTTCGAGACTCAAAGACGAATGCCATTCTTACAAGAGCTACCAGTACATGGGTAATGATGAATAGAAAGACAAGAAAACTGTCCAAAATTCCTGATGCTGTCAAAGAAGAGATACAGCCTTATTTCACAGCAAGAAATGTCTTTGTGGCAGAAGACACCAGAAAGTTGCCAAAGCTGGAGGATGACACTGCTCAG
TATATATGTTCGGATCTAGCACCACGTTGGAGTGATTTGGATGTGAATCAGCATGTCAACAATGTTAAATATATTGGTTGGATTTTGGAGAGTTTACCCATCTCTGTTTTAGAGGGCAATGAACTAGCTAATATAACATTGGAGTACAGGCGTGAATGTGGGCCGACGCATGTACTCCAATCATTGACAAGCCCACAGCC
TGGTGAGGTGATTGCCGGTTCAACTGCACCATTTTCGCAGAGAAATGATCCTGCAGACACCTTTAAATCCTTGCCTGCATTGCAGTTTGCCCACTTGCTTCGAATGCAAGATGACAGATCAGAAATTCTAAGGGCAAGGTCAGAATGGAGGTCAAAGAAAAAGAACAATCTTAACAACCTTCACGATCTTGCTTGACCTC
ATATTATGCAGTGTACATACATGTATACTTATTGATGCTTTCTTTAATCTTCATTCTTATTGATACTTATTTGTGATGTAATGCTGTTCGCTCGTATGTATTGTCCTGCAAATGGATGAAGGATGGCTCTATGTCTTGATGTTATTGCAAGCTTTGCTCAGATCTAGCAATATGTTTTATTAGATTTTAGAATCATGTTT
TGCATCTCACAGTGCCAGGCTGTGGAATTAAGTATTTTTAGTTGGGCTTCCTAGAAAGGCAGTACTTTATTTTGCCACATTCCTTCTCTTTGTCGTGGCATTTAGGACAAATGCATCTTTATAGTTTTAACTCTGGCGAAGGTACATTGTATGCTGGTTGGAACTCCCTTGGTTCAGTTTGACTTTAAGAAACAGTTGAA
AGCTGAATCAAATATATTCTATCTAGATGGAAGTTGCCTATTCTTTCAATGTAAAGCTTGATATTCTATTTTGCGATTGGTTCTTTTCTTATGCCAATTTTGAACTCGTTGGTTTTGGTTGACCAAAATTCTGTATAGAAAGG


>TRINITY_DN100295_c4_g1_i5 from sample A4 / Example unspliced isoform:
CAAGGATCCATAATTTTCTTAAAGTGTAGAAATCTTGACGCATCCTACTAATTATCAAATTTTTACCCATAATATGTCTAAGGCTTCTATATATAGTTTTTATTGCAAAAAAATGGAAAATGGCTAATACCTTGAAGATTAGCCATTAGCCCATGGGCTAAATTTCCCCTTAAAATTTTCCTTGTTTAAATCACATAATC
TAACATAATTTTCTCTCTAGTCAAGATGGTATTCATTTTAATCCAAAAAAAGGATTTGCTAATTTGGATGAGTTGTGGCCTAATTCCCAGAGAATATCTATCCCTTATTGGCAGGTCAGATTCTAAGGATAAATTTCTCCTTTCTGTAGGGGTGATATTGTGGAGATAGATACATGGGTTGGCCCATCTGGTAAAAATGG
CATGCGGCGTGATTGGCTTGTTCGAGACTCAAAGACGAATGCCATTCTTACAAGAGCTACCAGTACATGGGTAATGATGAATAGAAAGACAAGAAAACTGTCCAAAATTCCTGATGCTGTCAAAGAAGAGATACAGCCTTATTTCACAGCAAGAAATGTCTTTGTGGCAGAAGACACCAGAAAGTTGCCAAAGCTGGAGG
ATGACACTGCTCAGTATATATGTTCGGATCTAGCAGTAAGTACACCTATTGTTATTGAAACAAAAGAATTCCCACGCATTTTGAAATTATTAACAGGTCAGAGTATTTTGTGTATTTTTGGTTACCAATTGTTATTGAAACAAAAAGAATTCCCACGCTTTTTGAAATTATTGACAGGTCAGTACTTTGTGTTTTTTTTT
TTGCAGCCACGTTGGAGTGATTTGGATGTGAATCAGCATGTCAACAATGTTAAATATATTGGTTGGATTTTGGAGgtatatttagagaatttcttgcaacccttgctgccaactggttacatttgtctctctgcaccatttttgcaagctttatctggctagcctcttctttccttcatttttaaagtaatattttgagg
aattgaactaaacacgtaaggttttaggcttgtatcgatgtctttatgcaggaaatctgtagtttcagagttaaccggactttcaagtcttaaagccataccttataggcttagtcttgctcttcaaccccaaagatatgatgttcagactaaatttttaatttttttggcctttctgctcgtgtcttaatttttggcat
tttggtgcttgctttggcttcgctcttggtttcaatttccgttatgttttgtttttcttctagtttccatgtctgtctttgtttttgttccattggacacaacaatatgatttcgatttacagttttatattagagactgaacaccacgatcctggcatgctaacctgtttggctaggaaaatttcttttaaaaattgaa
agaaatcttggcaacagttgttacagctacttttgtagtagcggagagtttgcatgtctgaattaactggtggtgggcaatgtttaaattcatacctcatgctctcagtgttgttgtttctacccaaagacataatgtttagacctatatctatatgttttagcacctatccatactcggatgcaaatcaatttattttt
gcccaaaattttccttttggcagaaaattttgccttttgtctttggcatcttcgttttgatcttggttttagcttccgttgggtgtttagtttttgttctggttgaactcggggctacggatctgtaaattgtgaccttaaccaatagacaaacacatgactcttggtatagttagcaggtccagtgtcggactaaggga
gcttgcatgtttgaatgaattggttgtgtgccgtgtttttgaacataaacatgtatcaatgctttgctagaaatgttttgttttttgaacataaacatgtatcaatgttatgaatctttgctttaagttgacattattatggattttatatgcag
AGTTTACCCATCTCTGTTTTAGAGGGCAATGAACTAGCTAATATA
ACATTGGAGTACAGGCGTGAATGTGGGCCGACGCATGTACTCCAATCATTGACAAGCCCACAGCCTGGTGAGGTGATTGCCGGTTCAACTGCACCATTTTCGCAGAGAAATGATCCTGCAGACACCTTTAAATCCTTGCCTGCATTGCAGTTTGCCCACTTGCTTCGAATGCAAGATGACAGATCAGAAATTCTAAGGGC
AAGGTCAGAATGGAGGTCAAAGAAAAAGAACAATCTTAACAACCTTCACGATCTTGCTTGACCTCATATTATGCAGTGTACATACATGTATACTTATTGATGCTTTCTTTAATCTTCATTCTTATTGATACTTATTTGTGATGTAATGCTGTTCGCTCGTATGTATTGTCCTGCAAATGGATGAAGGATGGCTCTATGTC
TTGATGTTATTGCAAGCTTTGCTCAGATCTAGCAATATGTTTTATTAGATTTTAGAATCATGTTTTGCATCTCACAGTGCCAGGCTGTGGAATTAAGTATTTTTAGTTGGGCTTCCTAGAAAGGCAGTACTTTATTTTGCCACATTCCTTCTCTTTGTCGTGGCATTTAGGACAAATGCATCTTTATAGTTTTAACTCTG
GCGAAGGTACATTGTATGCTGGTTGGAACTCCCTTGGTTCAGTTTGACTTTAAGAAACAGTTGAAAGCTGAATCAAATATATTCTATCTAGATGGAAGTTGCCTATTCTTTCAATGTAAAGCTTGATATTCTATTTTGCGATTGGTTCTTTTCTTATGCCAATTTTGAACTCGTTGGTTTTGGTTGACCAAAATTCTGTA
TAGAAAGG




Intron 3 GTATTGTCAT ... TTTCGTGCAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A140.633040208
A240.742400165
A339.343300214
A441.622230159
A540.261840124
A638.695150325
A738.937530480
A837.653130189
A937.497120427
A1039.267831506



>TRINITY_DN107073_c0_g1_i1 from sample A3 / Example spliced isoform
TAATTTTTATCCCTAAAACAGTTTTTCACCTTGACGTGGACTAATCATGGGGTGCCCGATGGACAGGCTCACTACGTGTCAAATGCGACAGGGCAAAAACATCGAAGGAAACTAAATATAAGAGGAGTGTTAGTTCTAACTTGATTTGTCTTTTGCCTTCCATTCGATCAAGGCCAACTTTTTCCCTCCATCCAGCCTCA
CTGGATTCTCTGCCCTCCCTTTTTGGCTTTAGCCCTTTAAGGGTCTAGAAGAAGGCTTTGATTTGAGCTTCCTGTTTGTGCAAAAGTACAAAGAGATTTAGAGGGATTTTGTTTTATTTTTTCTGTAATGGGATTGGTAATGCGTGTGGGGTTGGGATTGTGCGTTGTAATGAAGAAGCCATGAATGCGCTTATTAGTCA
CGGTGGCAACTTCCAGAGTGTTTCTGTGAATAAGTTTTATTATATATCATTGAATGTGGTGTGCCAGAGTGGCTCAAGCTGTGGGATGTTCTATTCAAAGTTTAGAAGTGTTTGATTGGAGGAAGCCCTTTTTCATTTCTTGGTGTCTCCGCATTTCGTTCCAAACAAGTTCCATGGGCTTGAACAAGTTCTGATTTGGT
GGACTCTGATATTGCATACACCATAACAGATTCAGCAGATCCATGCTCGCAATCCCAAGGGTTCAAGATGGTGGCCGCCGCTGCAACAATGCTAATGTTTTCTTCAAGCTCTCAGTGCAATACACAGAACAAGATCTCGTCATCTGCTTCATCAGGGAAGCCCACAATGCCAGTGAGCTCTCCTGAGCGTGTTGATGTAA
AACTTAAACCCACTACATACAAGGGACTCCAAGTCAATGGAAATTCTCAAGGGGCATCCAAGATCAATGGCATCAAGGTGAACGGAACAGCAGTGGATAGCATGAAGCATAACGTTGGCTTGAAGGAAGCACCTGAGGAAGAAAGCACTGCTAAGAGCAGGATCAATCAACTCCCAGATTGGAGTATGCTTCTTGCAACT
ATTGCTACCATTATTCTGGCAGCCGAGAAGCAGTGGACCAATTTTGACTGGAAGCCAAGGAAAACAGACATGTTTGGTGACGTTTTCAGGTTGGGCAGATTTATGGAAGATAATCTGGTTTTCAGGCAGAACTTCGCCATAAGATCTTATGAGATTGGTGCAGACAAAACGGCTTCTATTGAAACCTTGATGAACCATCT
TCAGGAAACTGCCCTCAACCATGTTTGGCTTTCTGGGCTAGCTGGGGATGGATTCGGTGCTACTCTTGAGATGAGCCGGAGAAATCTTCTATGGGTTGTGGCTCGCATGCAAATTCAAGTTGAACGTTATCCCTCATGGGGTGATATTGTGGAGATAGATACATGGGTTGGCCCATCTGGTAAAAATGGCATGCGGCGTG
ATTGGCTTGTTCGAGACTCAAAGACGAATGCCATTCTTACAAGAGCTACCAGTACATGGGTAATGATGAATAGAAAGACAAGAAAACTGTCCAAAATTCCTGATGCTGTCAAAGAAGAGATACAGCCTTATTTCACAGCAAGAAATGTCTTTGTGGCAGAAGACACCAGAAAGTTGCCAAAGCTGGAGGATGACACTGCT
CAGTATATATGTTCGGATCTAGCACCACGTTGGAGTGATTTGGATGTGAATCAGCATGTCAACAATGTTAAATATATTGGTTGGATTTTGGAGGTATATTTAGAGAATTTCTTGCAACCCTTGCTGCCAACTGGTTACATTTGTCTCTCTGCACCATTTTTGCAAGCTTTATCTGGCTAGCCTCTTCTTTCCTTCATTTT
TAAAGTAATATTTTGAGGAATTGAACTAAACACGTAAGGTTTTAGGCTTGTATCGATGTCTTTATGCAGGAAATCTGTGGTTTCAGAGTTAACCGGACTTTCAAGTCTTAAAGCCATACCTTATAGGCTTAGTCTTGCTCTTCAACCCCAAAGATATGATGTTCAGAC


>TRINITY_DN107073_c0_g1_i2 from sample A3 / Example unspliced isoform:
CTCCGCATTTCGTTCCAAACAAGgtattgtcatttctgagtttgtatttgcatttgaaccagcctgtgttatacgcgtgtattctctgctatgtcatgtattggattggatcgttggtgcatttgcatgtgggtttatgagggaatgattctgcgatattttcttcaatgcattcgctgttatggaccctggtttgatta
ttttgaatttcgtgcag
TTCCATGGGCTTGAACAAGTTCTGATTTGGTGGACTCTGATATTGCATACACCATAACAGATTCAGCAGATCCATGCTCGCAATCCCAAGGGTTCAAGATGGTGGCCGCCGCTGCAACAATGCTAATGTTTTCTTCAAGCTCTCAGTGCAATACACAGAACAAGATCTCGTCATCTGCTTCAT
CAGGGAAGCCCACAATGCCAGTGAGCTCTCCTGAGCGTGTTGATGTAAAACTTAAACCCACTACATACAAGGGACTCCAAGTCAATGGAAATTCTCAAGGGGCATCCAAGATCAATGGCATCAAGGTGAACGGAACAGCAGTGGATAGCATGAAGCATAACGTTGGCTTGAAGGAAGCACCTGAGGAAGAAAGCACTGCT
AAGAGCAGGATCAATCAACTCCCAGATTGGAGTATGCTTCTTGCAACTATTGCTACCATTATTCTGGCAGCCGAGAAGCAGTGGACCAATTTTGACTGGAAGCCAAGGAAAACAGACATGTTTGGTGACGTTTTCAGGTTGGGCAGATTTATGGAAGATAATCTGGTTTTCAGGCAGAACTTCGCCATAAGATCTTATGA
GATTGGTGCAGACAAAACGGCTTCTATTGAAACCTTGATGAACCATCTTCAGGAAACTGCCCTCAACCATGTTTGGCTTTCTGGGCTAGCTGGGGATGGATTCGGTGCTACTCTTGAGATGAGCCGGAGAAATCTTCTATGGGTTGTGGCTCGCATGCAAATTCAAGTTGAACGTTATCCCTCATGGGGTGATATTGTGG
AGATAGATACATGGGTTGGCCCATCTGGTAAAAATGGCATGCGGCGTGATTGGCTTGTTCGAGACTCAAAGACGAATGCCATTCTTACAAGAGCTACCAGTACATGGGTAATGATGAATAGAAAGACAAGAAAACTGTCCAAAATTCCTGATGCTGTCAAAGAAGAGATACAGCCTTATTTCACAGCAAGAAATGTCTTT
GTGGCAGAAGACACCAGAAAGTTGCCAAAGCTGGAGGATGACACTGCTCAGTATATATGTTCGGATCTAGCACCACGTTGGAGTGATTTGGATGTGAATCAGCATGTCAACAATGTTAAATATATTGGTTGGATTTTGGAGAGTTTACCCATCTCTGTTTTAGAGGGCAATGAACTAGCTAATATAACATTGGAGTACAG
GCGTGAATGTGGGCCGACGCATGTACTCCAATCATTGACAAGCCCACAGCCTGGTGAGGTGATTGCCGGTTCAACTGCACCATTTTCGCAGAGAAATGATCCTGCAGACACCTTTAAATCCTTGCCTGCATTGCAGTTTGCCCACTTGCTTCGAATGCAAGATGACAGATCAGAAATTCTAAGGGCAAGGTCAGAATGGA
GGTCAAAGAAAAAGAACAATCTTAACAACCTTCACGATCTTGCTTGACCTCATATTATGCAGTGTACATACATGTATACTTATTGATGCTTTCTTTAATCTTCATTCTTATTGATACTTATTTGTGATGTAATGCTGTTCGCTCGTATGTATTGTCCTGCAAATGGATGAAGGATGGCTCTATGTCTTGATGTTATTGCA
AGCTTTGCTCAGATCTAGCAATATGTTTTATTAGATTTTAGAATCATGTTTTGCATCTCACAGTGCCAGGCTGTGGAATTAAGTATTTTTAGTTGGGCTTCCTAGAAAGGCAGTACTTTATTTTGCCACATTCCTTCTCTTTGTCGTGGCATTTAGGACAAATGCATCTTTATAGTTTTAACTCTGGCGAAGGTACATTG
TATGCTGGTTGGAACTCCCTTGGTTCAGTTTGACTTTAAGAAACAGTTGAAAGCTGAATCAAATATATTCTATCTAGATGGAAGTTGCCTATTCTTTCAATGTAAAGCTTGATATTCTATTTTGCGATTGGTTCTTTTCTTATGCCAATTTTGAACTCGTTGGTTTTGGTTGACCAAAATTCTGTATAGAAAGGACTTGA
AATTTGTGATAAAGACAAAACAGTTGAAAGCCAGATTAAATATCCGCAGCTTAGAGATGGAAGTTGCCTTATTCAAAATAAAGCTTGCTACTTTATTTTGCTGGCCATTTTCTGTATTTAAGATCTCTACTTGTGTATTCTTGTTATTCACTTGCAGTCTCTTACTTTGTTGAGCTTGAGCTAAAGCTTAGTT




Intron 4 GTAAGTACAC ... TTTTTTGCAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A119.643117676
A220.532716674
A320.812937381
A420.362195458
A521.241523151
A618.521285228356
A718.61243196372
A818.631262202376
A919.861297222421
A1019.28980183285



>TRINITY_DN115599_c0_g1_i4 from sample A1 / Example spliced isoform
TTTGCCTTCCATTCGATCAAGGCCAACTTTTTCCCTCCATCCAGCCTCACTGGATTCTCTGCCCTCCCTTTTTGGCTTTAGCCCTTTAAGGGTCTAGAAGAAGGCTTTGATTTGAGCTTCCTGTTTGTGCAAAAGTACAAAGAGATTTAGAGGGATTTTGTTTTATTTTTTCTGTAATGGGATTGGTAATGCGTGTGGGG
TTGGGATTGTGCGTTGTAATGAAGAAGCCATGAATGCGCTTATTAGTCACGGTGGCAACTTCCAGAGTGTTTCTGTGAATAAGTTTTATTATATATCATTGAATGTGGTGTGCCAGAGTGGCTCAAGCTGTGGGATGTTCTATTCAAAGTTTAGAAGTGTTTGATTGGAGGAAGCCCTTTTTCATTTCTTGGTGTCTCCG
CATTTCGTTCCAAACAAGTTCCATGGGCTTGAACAAGTTCTGATTTGGTGGACTCTGATATTGCATACACCATAACAGATTCAGCAGATCCATGCTCGCAATCCCAAGGGTTCAAGATGGTGGCCGCCGCTGCAACAATGCTAATGTTTTCTTCAAGCTCTCAGTGCAATACACAGAACAAGATCTCGTCATCTGCTTCG
TCAGGGAAGCCCACAATGCCAGTGAGCTCTCCTGAGCGTGTTGATGTAAAACCCAAACCCACTACATACAAGGGACTCCAAGTCAATGGAAATTCTCAAGGGGCATCCAAGATCAATGGCATCAAGGTGAACGGAACAGCAGTGGATAGCATGAAGCATAACGTTGGCTTGAAGGAAGCACCTGAGGAAGAAAGCACTGC
TAAGAGCAGGATCAATCAACTCCCAGATTGGAGTATGCTTCTTGCAACTATTGCTACCATTATTCTGGCAGCCGAGAAGCAGTGGACCAATTTTGACTGGAAGCCAAGGAAAACAGACATGTTTGGTGACGTTTTCAGGTTGGGCAGATTTATGGAAGATAATCTGGTTTTTAGGCAGAACTTCGCCATAAGATCTTATG
AGATTGGTGCAGACAAAACGGCTTCTATTGAAACCTTGATGAACCATCTTCAGGAAACTGCCCTCAACCATGTTTGGCTTTCTGGGCTAGCTGGGGATGGATTCGGTGCTACTCTTGAGATGAGCCGGAGAAATCTTCTATGGGTTGTGGCTCGCATGCAAATTCAAGTTGAACGTTATCCCTCATGGGGTGATATTGTG
GAGATAGATACATGGGTTGGCCCATCTGGTAAAAATGGCATGCGGCGTGATTGGCTTGTTCGAGACTCAAAGACGAATGCCATTCTTACAAGAGCTACCAGTACATGGGTAATGATGAATAGAAAGACAAGAAAACTGTCCAAAATTCCTGATGCTGTCAAAGAAGAGATACAGCCTTATTTCACAGCAAGAAATGTCTT
TGTGGCAGAAGACACCAGAAAGTTGCCAAAGCTGGAGGATGACACTGCTCAGTATATATGTTCGGATCTAGCACCACGTTGGAGTGATTTGGATGTGAATCAGCATGTCAACAATGTTAAATATATTGGTTGGATTTTGGAGAGTTTACCCATCTCTGTTTTAGAGGGCAATGAACTAGCTAATATAACATTGGAGTACA
GGCGTGAATGTGGGCCGACGCATGTACTCCAATCATTGACAAGCCCACAGCCTGGTGAGGTGATTGCCGGTTCAACTGCACCATTTTCGCAGAGAAATGATCCTGCAGACACCTTTAAATCCTTGCCTGCATTGCAGTTTGCCCACTTGCTTCGAATGCAAGATGACAGATCAGAAATTCTAAGGGCAAGGTCAGAATGG
AGGTCAAAGAAAAAGAACAATCTTAACAACCTTCACGATCTTGCTTGACCTCATATTATGCAGTGTACATACATGTATACTTATTGATGCTTTCTTTAATCTTCATTCTTATTGATACTTATTTGTGATGTAATGCTGTTCGCTCGTATGTATTGTCCTGCAAATGGATAAAGGATGGCTCTATGTCTTGATGTTATTGC
AAGCTTTGCTCAGATCTAGCAATATGTTTTATTAGATTTTAGAATCATGTTTTGCATCTCACAGTGCCAGGCTGTGGAATTAAATATTTTTAGTTGGGCTTCCTAGAAAGGCAGTACTTTATTTTGCCACATTCCTTCTCTTTGTCGTGGCATTTAGGACAAATGCATCTTTATAGTTTTAACTCTGGCGAAGGTACATT
GTATGCTGGTTGGAACTCCCTTGGTTCAGTTTGACTTTAAGAAACAGTTGAAAGCTGAATCAAATATATTCTATCTAGATGGAAGTTGCCTATTCTTTCAATGTAAAGCTTGATATTCTATTTTGCGATTGGTTCTTTTCTTATGCCAATTTTGAACTCGTTGGTTTTGGTTGACCAAAATTCTGTATAGAAAGGACTTG
AAATTT


>TRINITY_DN115599_c0_g1_i2 from sample A1 / Example unspliced isoform:
AAGGGTTCAAGATGGTGGCCGCCGCTGCAACAATGCTAATGTTTTCTTCAAGCTCTCAGTGCAATACACAGAACAAGATCTCGTCATCTGCTTCGTCAGGGAAGCCCACAATGCCAGTGAGCTCTCCTGAGCGTGTTGATGTAAAACCCAAACCCACTACATACAAGGGACTCCAAGTCAATGGAAATTCTCAAGGGGCA
TCCAAGATCAATGGCATCAAGGTGAACGGAACAGCAGTGGATAGCATGAAGCATAACGTTGGCTTGAAGGAAGCACCTGAGGAAGAAAGCACTGCTAAGAGCAGGATCAATCAACTCCCAGATTGGAGTATGCTTCTTGCAACTATTGCTACCATTATTCTGGCAGCCGAGAAGCAGTGGACCAATTTTGACTGGAAGCC
AAGGAAAACAGACATGTTTGGTGACGTTTTCAGGTTGGGCAGATTTATGGAAGATAATCTGGTTTTTAGGCAGAACTTCGCCATAAGATCTTATGAGATTGGTGCAGACAAAACGGCTTCTATTGAAACCTTGATGAACCATCTTCAGGAAACTGCCCTCAACCATGTTTGGCTTTCTGGGCTAGCTGGGGATGGATTCG
GTGCTACTCTTGAGATGAGCCGGAGAAATCTTCTATGGGTTGTGGCTCGCATGCAAATTCAAGTTGAACGTTATCCCTCATGGGGTGATATTGTGGAGATAGATACATGGGTTGGCCCATCTGGTAAAAATGGCATGCGGCGTGATTGGCTTGTTCGAGACTCAAAGACGAATGCCATTCTTACAAGAGCTACCAGTACA
TGGGTAATGATGAATAGAAAGACAAGAAAACTGTCCAAAATTCCTGATGCTGTCAAAGAAGAGATACAGCCTTATTTCACAGCAAGAAATGTCTTTGTGGCAGAAGACACCAGAAAGTTGCCAAAGCTGGAGGATGACACTGCTCAGTATATATGTTCGGATCTAGCAgtaagtacacctattgttattgaaacaaaaga
attcccacgcattttgaaattattaacaggtcagagtattttgtgtattttttgttacctattgttactgaaacaaaaagaattcccacgctttttgaaattattgacaggtcagtactttgtgttttttttgcag
CCACGTTGGAGTGATTTGGATGTGAATCAGCATGTCAACAATGTTAAATATATTGGTTGGATTT
TGGAGAGTTTACCCATCTCTGTTTTAGAGGGCAATGAACTAGCTAATATAACATTGGAGTACAGGCGTGAATGTGGGCCGACGCATGTACTCCAATCATTGACAAGCCCACAGCCTGGTGAGGTGATTGCCGGTTCAACTGCACCATTTTCGCAGAGAAATGATCCTGCAGACACCTTTAAATCCTTGCCTGCATTGCAG
TTTGCCCACTTGCTTCGAATGCAAGATGACAGATCAGAAATTCTAAGGGCAAGGTCAGAATGGAGGTCAAAGAAAAAGAACAATCTTAACAACCTTCACGATCTTGCTTGACCTCATATTATGCAGTGTACATACATGTATACTTATTGATGCTTTCTTTAATCTTCATTCTTATTGATACTTATTTGTGATGTAATGCT
GTTCGCTCGTATGTATTGTCCTGCAAATGGATAAAGGATGGCTCTATGTCTTGATGTTATTGCAAGCTTTGCTCAGATCTAGCAATATGTTTTATTAGATTTTAGAATCATGTTTTGCATCTCACAGTGCCAGGCTGTGGAATTAAATATTTTTAGTTGGGCTTCCTAGAAAGGCAGTACTTTATTTTGCCACATTCCTT
CTCTTTGTCGTGGCATTTAGGACAAATGCATCTTTATAGTTTTAACTCTGGCGAAGGTACATTGTATGCTGGTTGGAACTCCCTTGGTTCAGTTTGACTTTAAGAAACAGTTGAAAGCTGAATCAAATATATTCTATCTAGATGGAAGTTGCCTATTCTTTCAATGTAAAGCTTGATATTCTATTTTGCGATTGGTTCTT
TTCTTATGCCAATTTTGAACTCGTTGGTTTTGGTTGACCAAAATTCTGTATAGAAAGGACTTGAAATTT




Intron 5 GTAAGTACAC ... TTTTTTGCAG

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>TRINITY_DN100295_c4_g1_i3 from sample A4 / Example spliced isoform
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CTCTGATATTGCATACACCATAACAGATTCAGCAGATCCATGCTCGCAATCCCAAGGGTTCAAGATGGTGGCCGCCGCTGCAACAATGCTAATGTTTTCTTCAAGCTCTCAGTGCAATACACAGAACAAGATCTCGTCATCTGCTTCATCAGGGAAGCCCACAATGCCAGTGAGCTCTCCTGAGCGTGTTGATGTAAAAC
TTAAACCCACTACATACAAGGGACTCCAAGTCAATGGAAATTCTCAAGGGGCATCCAAGATCAATGGCATCAAGGTGAACGGAACAGCAGTGGATAGCATGAAGCATAACGTTGGCTTGAAGGAAGCACCTGAGGAAGAAAGCACTGCTAAGAGCAGGATCAATCAACTCCCAGATTGGAGTATGCTTCTTGCAACTATT
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GGAAACTGCCCTCAACCATGTTTGGCTTTCTGGGCTAGCTGGGGATGGATTCGGTGCTACTCTTGAGATGAGCCGGAGAAATCTTCTATGGGTTGTGGCTCGCATGCAAATTCAAGTTGAACGATATCCCTCATGGGGTGATATTGTGGAGATAGATACATGGGTTGGCCCATCTGGTAAAAATGGCATGCGGCGTGATT
GGCTTGTTCGAGACTCAAAGACGAATGCCATTCTTACAAGAGCTACCAGTACATGGGTAATGATGAATAGAAAGACAAGAAAACTGTCCAAAATTCCTGATGCTGTCAAAGAAGAGATACAGCCTTATTTCACAGCAAGAAATGTCTTTGTGGCAGAAGACACCAGAAAGTTGCCAAAGCTGGAGGATGACACTGCTCAG
TATATATGTTCGGATCTAGCACCACGTTGGAGTGATTTGGATGTGAATCAGCATGTCAACAATGTTAAATATATTGGTTGGATTTTGGAGAGTTTACCCATCTCTGTTTTAGAGGGCAATGAACTAGCTAATATAACATTGGAGTACAGGCGTGAATGTGGGCCGACGCATGTACTCCAATCATTGACAAGCCCACAGCC
TGGTGAGGTGATTGCCGGTTCAACTGCACCATTTTCGCAGAGAAATGATCCTGCAGACACCTTTAAATCCTTGCCTGCATTGCAGTTTGCCCACTTGCTTCGAATGCAAGATGACAGATCAGAAATTCTAAGGGCAAGGTCAGAATGGAGGTCAAAGAAAAAGAACAATCTTAACAACCTTCACGATCTTGCTTGACCTC
ATATTATGCAGTGTACATACATGTATACTTATTGATGCTTTCTTTAATCTTCATTCTTATTGATACTTATTTGTGATGTAATGCTGTTCGCTCGTATGTATTGTCCTGCAAATGGATGAAGGATGGCTCTATGTCTTGATGTTATTGCAAGCTTTGCTCAGATCTAGCAATATGTTTTATTAGATTTTAGAATCATGTTT
TGCATCTCACAGTGCCAGGCTGTGGAATTAAGTATTTTTAGTTGGGCTTCCTAGAAAGGCAGTACTTTATTTTGCCACATTCCTTCTCTTTGTCGTGGCATTTAGGACAAATGCATCTTTATAGTTTTAACTCTGGCGAAGGTACATTGTATGCTGGTTGGAACTCCCTTGGTTCAGTTTGACTTTAAGAAACAGTTGAA
AGCTGAATCAAATATATTCTATCTAGATGGAAGTTGCCTATTCTTTCAATGTAAAGCTTGATATTCTATTTTGCGATTGGTTCTTTTCTTATGCCAATTTTGAACTCGTTGGTTTTGGTTGACCAAAATTCTGTATAGAAAGG


>TRINITY_DN100295_c4_g1_i5 from sample A4 / Example unspliced isoform:
CAAGGATCCATAATTTTCTTAAAGTGTAGAAATCTTGACGCATCCTACTAATTATCAAATTTTTACCCATAATATGTCTAAGGCTTCTATATATAGTTTTTATTGCAAAAAAATGGAAAATGGCTAATACCTTGAAGATTAGCCATTAGCCCATGGGCTAAATTTCCCCTTAAAATTTTCCTTGTTTAAATCACATAATC
TAACATAATTTTCTCTCTAGTCAAGATGGTATTCATTTTAATCCAAAAAAAGGATTTGCTAATTTGGATGAGTTGTGGCCTAATTCCCAGAGAATATCTATCCCTTATTGGCAGGTCAGATTCTAAGGATAAATTTCTCCTTTCTGTAGGGGTGATATTGTGGAGATAGATACATGGGTTGGCCCATCTGGTAAAAATGG
CATGCGGCGTGATTGGCTTGTTCGAGACTCAAAGACGAATGCCATTCTTACAAGAGCTACCAGTACATGGGTAATGATGAATAGAAAGACAAGAAAACTGTCCAAAATTCCTGATGCTGTCAAAGAAGAGATACAGCCTTATTTCACAGCAAGAAATGTCTTTGTGGCAGAAGACACCAGAAAGTTGCCAAAGCTGGAGG
ATGACACTGCTCAGTATATATGTTCGGATCTAGCAgtaagtacacctattgttattgaaacaaaagaattcccacgcattttgaaattattaacaggtcagagtattttgtgtatttttggttaccaattgttattgaaacaaaaagaattcccacgctttttgaaattattgacaggtcagtactttgtgttttttttt
ttgcag
CCACGTTGGAGTGATTTGGATGTGAATCAGCATGTCAACAATGTTAAATATATTGGTTGGATTTTGGAGGTATATTTAGAGAATTTCTTGCAACCCTTGCTGCCAACTGGTTACATTTGTCTCTCTGCACCATTTTTGCAAGCTTTATCTGGCTAGCCTCTTCTTTCCTTCATTTTTAAAGTAATATTTTGAGG
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GCTTGCATGTTTGAATGAATTGGTTGTGTGCCGTGTTTTTGAACATAAACATGTATCAATGCTTTGCTAGAAATGTTTTGTTTTTTGAACATAAACATGTATCAATGTTATGAATCTTTGCTTTAAGTTGACATTATTATGGATTTTATATGCAGAGTTTACCCATCTCTGTTTTAGAGGGCAATGAACTAGCTAATATA
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AAGGTCAGAATGGAGGTCAAAGAAAAAGAACAATCTTAACAACCTTCACGATCTTGCTTGACCTCATATTATGCAGTGTACATACATGTATACTTATTGATGCTTTCTTTAATCTTCATTCTTATTGATACTTATTTGTGATGTAATGCTGTTCGCTCGTATGTATTGTCCTGCAAATGGATGAAGGATGGCTCTATGTC
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GCGAAGGTACATTGTATGCTGGTTGGAACTCCCTTGGTTCAGTTTGACTTTAAGAAACAGTTGAAAGCTGAATCAAATATATTCTATCTAGATGGAAGTTGCCTATTCTTTCAATGTAAAGCTTGATATTCTATTTTGCGATTGGTTCTTTTCTTATGCCAATTTTGAACTCGTTGGTTTTGGTTGACCAAAATTCTGTA
TAGAAAGG