NA ----> NA
Intron 1 GTATGATTTG ... ATGTTTACAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 28 | 27 | 10 | 11 |
| A2 | 27.27 | 24 | 9 | 9 |
| A3 | 28.12 | 23 | 9 | 9 |
| A4 | 42.86 | 6 | 6 | 3 |
| A5 | 23.08 | 15 | 4 | 5 |
| A6 | 23.31 | 51 | 24 | 7 |
| A7 | 18.64 | 72 | 20 | 13 |
| A8 | 22.02 | 108 | 36 | 25 |
| A9 | 24.76 | 79 | 33 | 19 |
| A10 | 21.21 | 52 | 15 | 13 |
>TRINITY_DN40456_c1_g5_i1 from sample A6 / Example spliced isoformTTAAGGAAATCTTTCCAGATTATGGTGATGGATTTTTATCTTCTTGTTTGGATGTTTATAATGACAATCCCGAGGAAGTAATTCAGCGGATCTTGGAGGGGACACTTCATCCTGACTTATTACATTTGAACACATCTCTTCAATCAAAACCCAATAATAAGCAACCTGTAAGCAAAAATGACAAAGGAAAAGGGAGGTTG
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>TRINITY_DN40456_c1_g5_i2 from sample A6 / Example unspliced isoform:TTAAGGAAATCTTTCCAGATTATGGTGATGGATTTTTATCTTCTTGTTTGGATGTTTATAATGACAATCCCGAGGAAGTAATTCAGCGGATCTTGGAGGGGACACTTCATCCTGACTTATTACATTTGAACACATCTCTTCAATCAAAACCCAATAATAAGCAACCTGTAAGCAAAAATGACAAAGGAAAAGGGAGGTTG
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CTGAAAATTCTGGTATTGTGATATATTTTTGACGTCGATTGTTGTATATATCTATGGAAATCTCCACAGGTATGGTGGTTTTGACGAATCCAGTGGATCAGCAATTACAGCTCATCTATAGATTAAATAAGCTTGGAAGCAGAAAATATTCCATTATTGGAAATACCGTTTATATTGTTTTAAGCAAGATTAAAAATACA
TAATGAGCTGAGTCTACATCTTGTTCTATGCAGTACGTCTAGAGCTATAGCTATGGCATTCTTTTGCAAGCAGAGTCAGTGTAATTGTTGAAAAATTAGTTACAGATGTCAGAATCTTTGTATTAATGCTGCCTTTTTATTATCTGCATTTTATGCATACAGAAAATGTCTGTTGTGTAGTGGATTTTAGGCTGTAACAT
TTTGGTTCCAGTTTAACTTTTTTATCCTAATGGTGTAAACTATTTATGCTTATCAGAGTATGATGGTTCATCAATTATTCAATAACACGCAGAGTTGAATTGCTTCATTG