sp|Q9XER8|RAB7_GOSHI ----> Ras-related protein Rab7

Intron 1 GTATCCTGGA ... GCCTTCATAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	28.72	372.7	9	140
A2	27.9	362	6	128
A3	28.55	359	11	132
A4	25.62	310.3	11	96
A5	30.51	171.7	12	69
A6	27	1713	4	565
A7	25.67	1607.3	8	496
A8	25.65	1114.7	5	347
A9	26.44	1766.3	8	570
A10	27.61	1536.3	3	527

>TRINITY_DN116806_c0_g2_i12 from sample A3 / Example spliced isoform

CTTCCCCCGGCTTCGAGTGTACTCAAGTGTACAAACTTAATTTTAATTCCCTGATCAATAACACCCTGGCATATGCTTACAAAATTGATTGCCAAGTGATATATTAATCCCCAATTTTATTTTTAACATTATACGAAACGAGGGGAGCGATCAATTGACCAGAGGAGGGCTTAAGCTAAAAACTTCAGCCAAGGCAGTTT
AGATCTCTACGACTCCAATTTTATCGATCGTAAGCTCGATCTCATCATGTCTGCCCGCAGAAGAACTCTGTTAAAGGTTATCATCCTTGGCGATAGCGGGTAAGTGGGTTCTGTAATTTACCAATTCTTCCATTTTGACGAATCTGATTTGAAGTTTTCGGCTTCAAATAGCTCGATTTCAAGGCCAGATTGTTAGGTTG
TGTTAAATTAGGGGTTTGAATTGAATTTTAGGTTGTAAATGGCGGTTATCTTGTTTTAATATGGTAGCCTTAGAAACGCAGTTTAGCCAGTTTTATTTCTTTTGGGCTGCTAAATTCGGTGGATCGGCGTCAGGGTTTTCAGCCAGATTGGAAATTGACATTTGGGTTTTGTTGATTTTTTGTGGGCAGGGTCGGTAAAA
CCTCGCTGATGAATCAATATGTAAACAAGAAATTCAGCAACCAGTATAAAGCAACCATTGGAGCAGATTTTTTGACGAAAGAAGTGCAGTTTGAGGATAGGTTGTTCACTTTACAGATATGGGATACCGCTGGCCAGGAAAGATTTCAGAGCCTTGGTGTTGCCTTCTACCGAGGTGCTGATTGCTGTGTTCTTGTTTAC
GATGTTAACGTGCTAAAATCATTTGATAACCTAAATAATTGGCGCGATGAATTTCTAATTCAGGCAAGCCCTTCTGACCCAGAAAACTTTCCATTTGTTGTGCTTGGAAATAAAATCGACGTGGATGGTGGGAACAGCAGAGTGGTTTCTGAGAAAAAGGCCAGGGCATGGTGTGCTTCTAAAGGCAACATTCCCTACTT
CGAAACTTCTGCAAAAGAGGGCTTTAATGTCGAAGCAGCTTTCCAGTGTATAGCCAAGAATGCGTTGAAGAACGAGCCTGAAGAGGAGATATATCTGCCGGACACAATTGATGTCAATGCTAGGAGACCACAAAGAGCATCAGGATGTGATTGTTAGTCGCCAGGGGATCATACAAGACTTTGATGCTACAAATAATAGT
TTACTTGCATGGTAAGATATAGACATTAAATCAGGCCATTGAGATGCGGATCAAACATTGATTTGTGTAGCCAGTGTAGAAATAGAATTGTACTCTAGTAATGCTTATTAAAAATTAGCTCTTTGTTTCACAATTTCGCAATTCAGTTCTTCAAGGATGGATTACCAACATTTACTACGATTCATATGGTGATTACTCTG
AAATTGCATTTCACTTGCAAAATATACTGCTTTTTTATGCCATTATTCTATTGTGATTATTTTAAAATATGGCTCCAATTATTGTTTGATTGTTTGCCATGAAAATAAGAAGCTAAATGATTCCAAACTTCCAATGTAGATTGATTTATGTGGACT

>TRINITY_DN116806_c0_g2_i3 from sample A3 / Example unspliced isoform:

CTTCCCCCGGCTTCGAGTGTACTCAAGTGTACAAACTTAATTTTAATTCCCTGATCAATAACACCCTGGCATATGCTTACAAAATTGATTGCCAAGTGATATATTAATCCCCAATTTTATTTTTAACATTATACGAAACGAGGGGAGCGATCAATTGACCAGAGGAGGGCTTAAGCTAAAAACTTCAGCCAAGGCAGTTT
AGATCTCTACGACTCCAATTTTATCGATCGTAAGCTCGATCTCATCATGTCTGCCCGCAGAAGAACTCTGTTAAAGGTTATCATCCTTGGCGATAGCGGGTAAGTGGGTTCTGTAATTTACCAATTCTTCCATTTTGACGAATCTGATTTGAAGTTTTCGGCTTCAAATAGCTCGATTTCAAGGCCAGATTGTTAGGTTG
TGTTAAATTAGGGGTTTGAATTGAATTTTAGGTTGTAAATGGCGGTTATCTTGTTTTAATATGGTAGCCTTAGAAACGCAGTTTAGCCAGTTTTATTTCTTTTGGGCTGCTAAATTCGGTGGATCGGCGTCAGGGTTTTCAGCCAGATTGGAAATTGACATTTGGGTTTTGTTGATTTTTTGTGGGCAGGGTCGGTAAAA
CCTCGCTGATGAATCAgtatcctggaattgatttcgatatctagtgttttgaatttgttttattatgtattctgggtgatctatttagggtttgtcactgcctgttagattaggttaaagttatgttggaattgaaattttaaattcaacgtaacaccacgcagctttgaaaatactaattttaattatatttaactagt
gtggtccttaagtgccttcatagATATGTAAACAAGAAATTCAGCAACCAGTATAAAGCAACCATTGGAGCAGATTTTTTGACGAAAGAAGTGCAGTTTGAGGATAGGTTGTTCACTTTACAGATATGGGATACCGCTGGCCAGGAAAGATTTCAGAGCCTTGGTGTTGCCTTCTACCGAGGTGCTGATTGCTGTGTTCT
TGTTTACGATGTTAACGTGCTAAAATCATTTGATAACCTAAATAATTGGCGCGATGAATTTCTAATTCAGGCAAGCCCTTCTGACCCAGAAAACTTTCCATTTGTTGTGCTTGGAAATAAAATCGACGTGGATGGTGGGAACAGCAGAGTGGTTTCTGAGAAAAAGGCCAGGGCATGGTGTGCTTCTAAAGGCAACATTC
CCTACTTCGAAACTTCTGCAAAAGAGGGCTTTAATGTCGAAGCAGCTTTCCAGTGTATAGCCAAGAATGCGTTGAAGAACGAGCCTGAAGAGGAGATATATCTGCCGGACACAATTGATGTCAATGCTAGGAGACCACAAAGAGCATCAGGATGTGATTGTTAGTCGCCAGGGGATCATACAAGACTTTGATGCTACAAA
TAATAGTTTACTTGCATGGTAAGATATAGACATTAAATCAGGCCATTGAGATGCGGATCAAACATTGATTTGTGTAGCCAGTGTAGAAATAGAATTGTACTCTAGTAATGCTTATTAAAAATTAGCTCTTTGTTTCACAATTTCGCAATTCAGTTCTTCAAGGATGGATTACCAACATTTACTACGATTCATATGGTGAT
TACTCTGAAATTGCATTTCACTTGCAAAATATACTGCTTTTTTATGCCATTATTCTATTGTGATTATTTTAAAATATGGCTCCAATTATTGTTTGATTGTTTGCCATGAAAATAAGAAGCTAAATGATTCCAAACTTCCAATGTAGATTGATTTATGTGGACT

Intron 2 GTAAGTGGGT ... TTGTGGGCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	21.03	477	127	80
A2	22.73	469	138	67
A3	26.47	475	171	60.5
A4	24.51	425	138	59.5
A5	27.35	263	99	32.5
A6	28.01	2444	951	242
A7	28.17	2292	899	234
A8	25.26	1503	508	183.5
A9	25.73	2416	837	269
A10	27.86	2121	819	200

>TRINITY_DN116806_c0_g2_i5 from sample A3 / Example spliced isoform

CTTCCCCCGGCTTCGAGTGTACTCAAGTGTACAAACTTAATTTTAATTCCCTGATCAATAACACCCTGGCATATGCTTACAAAATTGATTGCCAAGTGATATATTAATCCCCAATTTTATTTTTAACATTATACGAAACGAGGGGAGCGATCAATTGACCAGAGGAGGGCTTAAGCTAAAAACTTCAGCCAAGGCAGTTT
AGATCTCTACGACTCCAATTTTATCGATCGTAAGCTCGATCTCATCATGTCTGCCCGCAGAAGAACTCTGTTAAAGGTCATCATCCTTGGCGATAGCGGGGTCGGTAAAACCTCGCTGATGAATCAATATGTAAACAAGAAATTCAGCAACCAGTATAAAGCAACCATTGGAGCAGATTTTTTGACGAAAGAAGTGCAGT
TTGAGGATAGGTTGTTCACTTTACAGATATGGGATACCGCTGGCCAGGAAAGATTTCAGAGCCTTGGTGTTGCCTTCTACCGAGGTGCTGATTGCTGTGTTCTTGTTTACGATGTTAACGTGCTAAAATCATTTGATAACCTAAATAATTGGCGCGATGAATTTCTAATTCAGGCAAGCCCTTCTGACCCAGAAAACTTT
CCATTTGTTGTGCTTGGAAATAAAATCGACGTGGATGGTGGGAACAGCAGAGTGGTTTCTGAGAAAAAGGCCAGGGCATGGTGTGCTTCTAAAGGCAACATTCCCTACTTCGAAACTTCTGCAAAAGAGGGCTTTAATGTCGAAGCAGCTTTCCAGTGTATAGCCAAGAATGCGTTGAAGAACGAGCCTGAAGAGGAGAT
ATATCTGCCGGACACAATTGATGTCAATGCTAGGAGACCACAAAGAGCATCAGGATGTGATTGTTAGTCGCCAGGGGATCATACAAGACTTTGATGCTACAAATAATAGTTTACTTGCATGGTAAGATATAGACATTAAATCAGGCCATTGAGATGCGGATCAAACATTGATTTGTGTAGCCAGTGTAGAAATAGAATTG
TACTCTAGTAATGCTTATTAAAAATTAGCTCTTTGTTTCACAATTTCGCAATTCAGTTCTTCAAGGATGGATTACCAACATTTACTACGATTCATATGGTGATTACTCTGAAATTGCATTTCACTTGCAAAATATACTGCTTTTTTATGCCATTATTCTATTGTGATTATTTTAAAATATGGCTCCAATTATTGTTTGAT
TGTTTGCCATGAAAATAAGAAGCTAAATGATTCCAAACTTCCAATGTAGATTGATTTATGTGGACT

>TRINITY_DN116806_c0_g2_i12 from sample A3 / Example unspliced isoform:

CTTCCCCCGGCTTCGAGTGTACTCAAGTGTACAAACTTAATTTTAATTCCCTGATCAATAACACCCTGGCATATGCTTACAAAATTGATTGCCAAGTGATATATTAATCCCCAATTTTATTTTTAACATTATACGAAACGAGGGGAGCGATCAATTGACCAGAGGAGGGCTTAAGCTAAAAACTTCAGCCAAGGCAGTTT
AGATCTCTACGACTCCAATTTTATCGATCGTAAGCTCGATCTCATCATGTCTGCCCGCAGAAGAACTCTGTTAAAGGTTATCATCCTTGGCGATAGCGGgtaagtgggttctgtaatttaccaattcttccattttgacgaatctgatttgaagttttcggcttcaaatagctcgatttcaaggccagattgttaggttg
tgttaaattaggggtttgaattgaattttaggttgtaaatggcggttatcttgttttaatatggtagccttagaaacgcagtttagccagttttatttcttttgggctgctaaattcggtggatcggcgtcagggttttcagccagattggaaattgacatttgggttttgttgattttttgtgggcagGGTCGGTAAAA
CCTCGCTGATGAATCAATATGTAAACAAGAAATTCAGCAACCAGTATAAAGCAACCATTGGAGCAGATTTTTTGACGAAAGAAGTGCAGTTTGAGGATAGGTTGTTCACTTTACAGATATGGGATACCGCTGGCCAGGAAAGATTTCAGAGCCTTGGTGTTGCCTTCTACCGAGGTGCTGATTGCTGTGTTCTTGTTTAC
GATGTTAACGTGCTAAAATCATTTGATAACCTAAATAATTGGCGCGATGAATTTCTAATTCAGGCAAGCCCTTCTGACCCAGAAAACTTTCCATTTGTTGTGCTTGGAAATAAAATCGACGTGGATGGTGGGAACAGCAGAGTGGTTTCTGAGAAAAAGGCCAGGGCATGGTGTGCTTCTAAAGGCAACATTCCCTACTT
CGAAACTTCTGCAAAAGAGGGCTTTAATGTCGAAGCAGCTTTCCAGTGTATAGCCAAGAATGCGTTGAAGAACGAGCCTGAAGAGGAGATATATCTGCCGGACACAATTGATGTCAATGCTAGGAGACCACAAAGAGCATCAGGATGTGATTGTTAGTCGCCAGGGGATCATACAAGACTTTGATGCTACAAATAATAGT
TTACTTGCATGGTAAGATATAGACATTAAATCAGGCCATTGAGATGCGGATCAAACATTGATTTGTGTAGCCAGTGTAGAAATAGAATTGTACTCTAGTAATGCTTATTAAAAATTAGCTCTTTGTTTCACAATTTCGCAATTCAGTTCTTCAAGGATGGATTACCAACATTTACTACGATTCATATGGTGATTACTCTG
AAATTGCATTTCACTTGCAAAATATACTGCTTTTTTATGCCATTATTCTATTGTGATTATTTTAAAATATGGCTCCAATTATTGTTTGATTGTTTGCCATGAAAATAAGAAGCTAAATGATTCCAAACTTCCAATGTAGATTGATTTATGTGGACT

Intron 3 GTATCCTGGA ... GCCTTCATAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	27.5	391.3	3	140
A2	26.54	382	6	128
A3	27.22	378.3	9	132
A4	24.23	328.5	6	96
A5	29.07	181.3	9	69
A6	25.5	1816.8	3	565
A7	24.24	1703.3	4	496
A8	24.29	1178.8	3	347
A9	25.01	1870.5	6	570
A10	26.14	1627	2	527

>TRINITY_DN116806_c0_g2_i12 from sample A3 / Example spliced isoform

CTTCCCCCGGCTTCGAGTGTACTCAAGTGTACAAACTTAATTTTAATTCCCTGATCAATAACACCCTGGCATATGCTTACAAAATTGATTGCCAAGTGATATATTAATCCCCAATTTTATTTTTAACATTATACGAAACGAGGGGAGCGATCAATTGACCAGAGGAGGGCTTAAGCTAAAAACTTCAGCCAAGGCAGTTT
AGATCTCTACGACTCCAATTTTATCGATCGTAAGCTCGATCTCATCATGTCTGCCCGCAGAAGAACTCTGTTAAAGGTTATCATCCTTGGCGATAGCGGGTAAGTGGGTTCTGTAATTTACCAATTCTTCCATTTTGACGAATCTGATTTGAAGTTTTCGGCTTCAAATAGCTCGATTTCAAGGCCAGATTGTTAGGTTG
TGTTAAATTAGGGGTTTGAATTGAATTTTAGGTTGTAAATGGCGGTTATCTTGTTTTAATATGGTAGCCTTAGAAACGCAGTTTAGCCAGTTTTATTTCTTTTGGGCTGCTAAATTCGGTGGATCGGCGTCAGGGTTTTCAGCCAGATTGGAAATTGACATTTGGGTTTTGTTGATTTTTTGTGGGCAGGGTCGGTAAAA
CCTCGCTGATGAATCAATATGTAAACAAGAAATTCAGCAACCAGTATAAAGCAACCATTGGAGCAGATTTTTTGACGAAAGAAGTGCAGTTTGAGGATAGGTTGTTCACTTTACAGATATGGGATACCGCTGGCCAGGAAAGATTTCAGAGCCTTGGTGTTGCCTTCTACCGAGGTGCTGATTGCTGTGTTCTTGTTTAC
GATGTTAACGTGCTAAAATCATTTGATAACCTAAATAATTGGCGCGATGAATTTCTAATTCAGGCAAGCCCTTCTGACCCAGAAAACTTTCCATTTGTTGTGCTTGGAAATAAAATCGACGTGGATGGTGGGAACAGCAGAGTGGTTTCTGAGAAAAAGGCCAGGGCATGGTGTGCTTCTAAAGGCAACATTCCCTACTT
CGAAACTTCTGCAAAAGAGGGCTTTAATGTCGAAGCAGCTTTCCAGTGTATAGCCAAGAATGCGTTGAAGAACGAGCCTGAAGAGGAGATATATCTGCCGGACACAATTGATGTCAATGCTAGGAGACCACAAAGAGCATCAGGATGTGATTGTTAGTCGCCAGGGGATCATACAAGACTTTGATGCTACAAATAATAGT
TTACTTGCATGGTAAGATATAGACATTAAATCAGGCCATTGAGATGCGGATCAAACATTGATTTGTGTAGCCAGTGTAGAAATAGAATTGTACTCTAGTAATGCTTATTAAAAATTAGCTCTTTGTTTCACAATTTCGCAATTCAGTTCTTCAAGGATGGATTACCAACATTTACTACGATTCATATGGTGATTACTCTG
AAATTGCATTTCACTTGCAAAATATACTGCTTTTTTATGCCATTATTCTATTGTGATTATTTTAAAATATGGCTCCAATTATTGTTTGATTGTTTGCCATGAAAATAAGAAGCTAAATGATTCCAAACTTCCAATGTAGATTGATTTATGTGGACT

>TRINITY_DN116806_c0_g2_i4 from sample A3 / Example unspliced isoform:

CATCATCCTTGGCGATAGCGGGGTCGGTAAAACCTCGCTGATGAATCAgtatcctggaattgatttcgatatctagtgttttgttttgaatttgttttattatgtattctgggtgatctatttagggtttgtcaccgccggttagattaggttaaagctatgttggaattagaattttaaattcaacgtaacaccacgca
gctttgaaaatactaattttaattatatttaactagtgtggtccttaagtgccttcatagATATGTAAACAAGAAATTCAGCAACCAGTATAAAGCAACCATTGGAGCAGATTTTTTGACGAAAGAAGTGCAGTTTGAGGATAGGTTGTTCACTTTACAGATATGGGATACCGCTGGCCAGGAAAGATTTCAGAGCCTTG
GTGTTGCCTTCTACCG