sp|B9HBA8|ACCC1_POPTR ----> Biotin carboxylase 1, chloroplastic
Intron 1 GTATGATTCC ... ATTATTGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 26.73 | 74 | 25 | 29 |
| A2 | 24.32 | 56 | 17 | 19 |
| A3 | 18.57 | 57 | 12 | 14 |
| A4 | 22.37 | 59 | 20 | 14 |
| A5 | 23.08 | 15 | 4 | 5 |
| A6 | 17.72 | 253 | 50 | 59 |
| A7 | 20.58 | 274 | 80 | 62 |
| A8 | 19.49 | 382 | 64 | 121 |
| A9 | 19.76 | 272 | 57 | 77 |
| A10 | 20 | 242 | 62 | 59 |
>TRINITY_DN35798_c0_g3_i3 from sample A9 / Example spliced isoformAAACGCTAAAAATATTTACTTAAAAACGGGAACGAATGTAAGAGTACAATCAATGTGGAGTGGGCGGAGCTTACTATGAGCAGCGAGCATTGTAATCATCGAAACATTTTTCATATTCATACTCTCCATCCACATCTTTCCTTGCACATCGATCGAGCAACAGATTCGTAGGACTTGCAGGTTTCCAGGGCATCCTGCAA
ATCTGTGAAAGAAAATGGAGACAATAAGTTTATCCAAGTCCTTTTGCTCAGTTCGGGCCCCAGCTGCTGTGGCCACTTCGAGTGGCAATAAGTCAAAGTCTTGCCATTCTAATGGACTGAGCTACCCACTTAGAGGGTCGACCAAAGGTATCAGGAGTGCAAGCTGCAGCTTTTTGAGTGGGAGTGAAACCGATGTCTTC
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TTCGTGTTGCACTAGGAGAGAAGCTTCGAATGAAACAGGAAGATGTGGTGTTGAGAGGACACTCCATTGAATGCAGAATCAATGCTGAGGATGCTTTCCAAGGATTTCGCCCAGGGCCAGGTAGGATAACAGGTTACTTGCCACCAGGAGGTCCATTTGTGCGAATGGATAGCCACATTTATTCCGATTACGTAGTTCCT
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TTCGTGTTGCACTAGGAGAGAAGCTTCGAATGAAACAGGAAGATGTGGTGTTGAGAGGACACTCCATTGAATGCAGAATCAATGCTGAGGATGCTTTCCAAGGATTTCGCCCAGGGCCAGGTAGGATAACAGGTTACTTGCCACCAGGAGGTCCATTTGTGCGAATGGATAGCCACATTTATTCCGATTACGTAGTTCCT
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GGAGTTGGCTTCTgtatgattcccatcatattatttgccatgtttaatttttttctttttgtttagtttttatgcattaagaattcatttttgtggcacactctgcaatttttgttcattcaaaggaaatgtggggaccacacaaaggtaaaatagccatcatatgtggattctcattcttggtttcttatgttctatct
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TGGTTTATGCAGAAGCCACTTAATAATTGACAAGCTTGTCTGATTTAAAAGCCAAGCTCCTGTCGTTGCATTTTTATTCCAGAGGTTATTATGTAATTGATTCAACATCATTGTTCCTAACAATATGGCTTTTATGGCTATATGTTCTAGGGCATTCCAATCATGAACAAATTGAAATGAGCTATTTCTTTTAGTCAACG
TATGAAATCATTTATCAAATAAACGTAGAAATTTACTGTTATTGATGTCCCCGTGCCTGCTAAAGAATACCGCAGTCCATCACCATCTAAAAAGAAATTTGTGTTATTTGTTATGAAGCCCCTACCAGATATTACGCTCCATTACATCGATCATATTTATTCTCATTTGCCGAAGTTCTGAGTATCAATTAACCAAAAAA
AAATCCAATTCTAATATTGGCAGATGAACATTGACATCATTTGAGTTATAAGTGAATGAGGAATTTATTGGAACTTTTATACTAATATGATAGAAAATGCCCGGGGTAATTGCAACGTGTGTGGTTGCAAGCTCGCATTCCTTGCTCAACCATTGCCGATAATGTCAAATAGTGGTGAGATTAAGAATGCATGAGTTTTC
TATATTTCTACGTTCCATATTTTTCTGTATGATCATTTATTATATGATGTATATAATTATATAGTCTG
Intron 2 GTAAGGCATA ... TGGCTGGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 9.51 | 314 | 3 | 33 |
| A2 | 13.59 | 248 | 0 | 39 |
| A3 | 19 | 260 | 2 | 61 |
| A4 | 11.44 | 209 | 1 | 27 |
| A5 | 23.91 | 105 | 1 | 33 |
| A6 | 15.47 | 388 | 1 | 71 |
| A7 | 15.69 | 677 | 2 | 126 |
| A8 | 14.39 | 464 | 6 | 78 |
| A9 | 14.36 | 489 | 1 | 82 |
| A10 | 10.34 | 642 | 1 | 74 |
>TRINITY_DN35798_c0_g3_i3 from sample A9 / Example spliced isoformAAACGCTAAAAATATTTACTTAAAAACGGGAACGAATGTAAGAGTACAATCAATGTGGAGTGGGCGGAGCTTACTATGAGCAGCGAGCATTGTAATCATCGAAACATTTTTCATATTCATACTCTCCATCCACATCTTTCCTTGCACATCGATCGAGCAACAGATTCGTAGGACTTGCAGGTTTCCAGGGCATCCTGCAA
ATCTGTGAAAGAAAATGGAGACAATAAGTTTATCCAAGTCCTTTTGCTCAGTTCGGGCCCCAGCTGCTGTGGCCACTTCGAGTGGCAATAAGTCAAAGTCTTGCCATTCTAATGGACTGAGCTACCCACTTAGAGGGTCGACCAAAGGTATCAGGAGTGCAAGCTGCAGCTTTTTGAGTGGGAGTGAAACCGATGTCTTC
AGACATGCTGTTCGCGCGATTGGTAAGTCAAAAACTGGTGGCGGAGCCCTTAGCTGTACATGTGACTACCAGAAGATCCTCATTGCAAACAGGGGGGAAATCGCTGTTCGCGTGATTCGCACAGCACATGAAATGGGCATTCAGTGTGTGGCGGTACACTCTACAGTAGATAAGCAAGCACTCCATGTTCAAATCGCAGA
CGAGGCCGTATGCATTGGAGAGGCACCGAGCAGTCAATCATATTTAGTTATCCCAAATATTGTAGCAGCTGCAGTGAGCCGTGGCTGTACCATGCTACACCCTGGATATGGTTTTCTTTCTGAAAATGCTAGCTTTGTGGACATCTGTAAAGAGCATGGAATCAACTTTATTGGGCCAAGTCCAGACAGCATTCGTGTTA
TGGGTGACAAAGCAACAGCTCGGGAAACAATGAAAAAAGCTGGGGTTCCAACTGTACCAGGAAGTGATGGGCTTTTAGAGTCAACAGAAGAGGCTATCACGGTTGCTAATGAGATTGGTTTTCCAGTAATGATCAAGGCAACTGCAGGTGGTGGAGGTCGTGGAATGCGATTGGCCAATGAACCAGGAGAGTTCGTGAAG
TTATTACAGCAAGCCAAGAGTGAGGCAGGTGCAGCCTTTGGGAATGATGGCGTTTATTTGGAGAGGTACATAAAAAACCCTAGACATATTGAGTTCCAGATTCTTGCAGACAAACATGGTAATTGTATCCACTTTGGAGAGCGTGATTGCAGTATTCAGCGGAGGAATCAAAAGCTTCTAGAGGAAGCACCATCTCCTGC
TTTGACCTCTGAGCTAAGAAGTGCCATGGGGGATGCTGCGGTTGCAGCTGCTTTATCTATAGGATATATTGGGGTTGGCACCGTTGAATTTCTTCTAGATGAAAGTGGTGACTTCTATTTCATGGAGATGAACACTAGGATCCAGGTGGAGCATCCAATAACTGAAATGATCTCCTCCACTGATTTAATTGAGGAACAAA
TTCGTGTTGCACTAGGAGAGAAGCTTCGAATGAAACAGGAAGATGTGGTGTTGAGAGGACACTCCATTGAATGCAGAATCAATGCTGAGGATGCTTTCCAAGGATTTCGCCCAGGGCCAGGTAGGATAACAGGTTACTTGCCACCAGGAGGTCCATTTGTGCGAATGGATAGCCACATTTATTCCGATTACGTAGTTCCT
CCAAGCTATGACTCTCTATTAGGAAAGCTTATCGTCTGGGCACCTACTAGAGAGAAGGCAATCGCACGTATGCAAAGAGCTCTTAATGAAACTATTATAGTAGGAATACCTACTACCATTGACTATCATAAACTTATCCTAGAAACTCAGGACTTCAAGGATGGAAAAATTGATACAGCATTCATTCCCAAACATGAAGA
GGAGTTGGCTTCTCCTCATGATGCTGTGCAAGTGCCTGTACCCACGAAGAGCGCTGTTAAAGCACTTGCTTGAATTCAAAGTTTCATGATGTGAGTTTAGTTATCAGGGTTGATTGTTTTGGTCGCAGAAACAGGCCTGCAGAATAGTGAAATTGCTCCTAATATTGTAGCCTATGATGGTTTATGCAGAAGCCACTTAA
TAATTGACAAGCTTGTCTGATTTAAAAGCCAAGCTCCTGTCGTTGCATTTTTATTCCAGAGGTTATTATGTAATTGATTCAACATCATTGTTCCTAACAATATGGCTTTTATGGCTATATGTTCTAGGGCATTCCAATCATGAACAAATTGAAATGAGCTATTTCTTTTAGTCAACGTATGAAATCATTTATCAAATAAA
CGTAGAAATTTACTGTTATTGATGTCCCCGTGCCTGCTAAAGAATACCGCAGTCCATCACCATCTAAAAAGAAATTTGTGTTATTTGTTATGAAGCCCCTACCAGATATTACGCTCCATTACATCGATCATATTTATTCTCATTTGCCGAAGTTCTGAGTATCAATTAACCAAAAAAAAATCCAATTCTAATATTGGCAG
ATGAACATTGACATCATTTGAGTTATAAGTGAATGAGGAATTTATTGGAACTTTTATACTAATATGATAGAAAATGCCCGGGGTAATTGCAACGTGTGTGGTTGCAAGCTCGCATTCCTTGCTCAACCATTGCCGATAATGTCAAATAGTGGTGAGATTAAGAATGCATGAGTTTTCTATATTTCTACGTTCCATATTTT
TCTGTATGATCATTTATTATATGATGTATATAATTATATAGTCTG
>TRINITY_DN35798_c0_g3_i2 from sample A9 / Example unspliced isoform:ACCCTAGACATATTGAGTTCCAGgtaaggcatacttttcttttactgtaggcctgcactcttcccttagtttataactttttttgcttgttttattttcattgtggaagttaaatatctatccacaattttaagtttagaaggaaatgtgaattttgtcatttttcaattagaatcaatttactaagaccgggaaagtgc
tgaaatgtttttgtttaatgatttccacaagtctagtgtaaattatttttttgaaaaaaatattcgaacttgcatttgaactggtgttctttggctgaacttttggctggcagATTCTTGCAGACAAACATGGTAATTGTATCCACTTTGGAGAGCGTGATTGCAGTATTCAGCGGAGGAATCAAAAGCTTCTAGAGGAA
GCACCATCTCCTGCTTTGACCTCTGAGCTAAGAAGTGCCATGGGGGATGCTGCGGTTGCAGCTGCTTTATCTATAGGATATATTGGGGTTGGCACCGTTGAATTTCTTCTAGATGAAAGTGGTGACTTCTATTTCATGGAGATGAACACTAGGATCCAGGTGGAGCATCCAATAACTGAAATGATCTCCTCCACTGATTT
AATTGAGGAACAAATTCGTGTTGCACTAGGAGAGAAGCTTCGAATGAAACAGGAAGATGTGGTGTTGAGAGGACACTCCATTGAATGCAGAATCAATGCTGAGGATGCTTTCCAAGGATTTCGCCCAGGGCCAGGTAGGATAACAGGTTACTTGCCACCAGGAGGTCCATTTGTGCGAATGGATAGCCACATTTATTCCG
ATTACGTAGTTCCTCCAAGCTATGACTCTCTATTAGGAAAGCTTATCGTCTGGGCACCTACTAGAGAGAAGGCAATCGCACGTATGCAAAGAGCTCTTAATGAAACTATTATAGTAGGAATACCTACTACCATTGACTATCATAAACTTATCCTAGAAACTCAGGACTTCAAGGATGGAAAAATTGATACAGCATTCATT
CCCAAACATGAAGAGGAGTTGGCTTCTCCTCATGATGCTGTGCAAGTGCCTGTACCCACGAAGAGCGCTGTTAAAGCACTTGCTTGAATTCAAAGTTTCATGATGTGAGTTTAGTTATCAGGGTTGATTGTTTTGGTCGCAGAAACAGGCCTGCAGAATAGTGAAATTGCTCCTAATATTGTAGCCTATGATGGTTTATG
CAGAAGCCACTTAATAATTGACAAGCTTGTCTGATTTAAAAGCCAAGCTCCTGTCGTTGCATTTTTATTCCAGAGGTTATTATGTAATTGATTCAACATCATTGTTCCTAACAATATGGCTTTTATGGCTATATGTTCTAGGGCATTCCAATCATGAACAAATTGAAATGAGCTATTTCTTTTAGTCAACGTATGAAATC
ATTTATCAAATAAACGTAGAAATTTACTGTTATTGATGTCCCCGTGCCTGCTAAAGAATACCGCAGTCCATCACCATCTAAAAAGAAATTTGTGTTATTTGTTATGAAGCCCCTACCAGATATTACGCTCCATTACATCGATCATATTTATTCTCATTTGCCGAAGTTCTGAGTATCAATTAACCAAAAAAAAATCCAAT
TCTAATATTGGCAGATGAACATTGACATCATTTGAGTTATAAGTGAATGAGGAATTTATTGGAACTTTTATACTAATATGATAGAAAATGCCCGGGGTAATTGCAACGTGTGTGGTTGCAAGCTCGCATTCCTTGCTCAACCATTGCCGATAATGTCAAATAGTGGTGAGATTAAGAATGCATGAGTTTTCTATATTTCT
ACGTTCCATATTTTTCTGTATGATCATTTATTATATGATGTATATAATTATATAGTCTG