sp|Q8LFL8|LSM1B_ARATH ----> Sm-like protein LSM1B

Intron 1 GTAGGAGTTC ... ATGTATGTAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	26.25	59	19	23
A2	41.05	28	21	18
A3	26.09	34	6	18
A4	30.1	36	8	23
A5	12	11	1	2
A6	27.19	162	47	74
A7	28.07	164	57	71
A8	26.29	136	50	47
A9	26.2	131	48	45
A10	26.9	125	42	50

>TRINITY_DN113337_c0_g1_i1 from sample A1 / Example spliced isoform

GGAGAAATACCGGGAGGAGGGCGAACGGAGATTTGGTGGAAAGGACTGGAAGGCATGGGAGGAGCAGAAGATATACCTACATAGATTTGCGTTGCCCGTTTTTATTTGCAAGGAAGGAAGTCTTGACCGTCCGTCTGTTGGGCCACTTCTGATTCGAGTGTTGCTGGAAAAGCTACTTTGTGGGTGATTGACATATATAT
ATATATATTTATATTTACCTCTTCTGTTCCTGCAACAAAGGTAGGATTCGAGGGGGCTATCTTCCAACACATAGATTGACAAGTGTATTTACTAGTTATAGGGCTTTTCGAGAAGATCTGGTCGCATCAGCGTAGCATATCAATTAATCGACCGATCGTTACTTTGGGAGGGACGGAGGAGGAGCGCTGCCAATGCTATT
TATAATAACAACAAGTTCGACAAATTGCTTCAGGTTTGGGTGTATTATTACTATTATTGTTGTTGCAGCAAATAGCAATAGCAATAACAGTATCAAAGCAGCAGAATTTAGAGAGCAGGAGGAGGGGATGTCTTGGGCAGGCCCGGAGGACATCTTCCTCTCCACTTCTCTCGCCAGCTACCTAGACAAAAAGTTACTAG
TTTTGCTTCGAGATGGAAGAAAACTCATTGGCATTCTTCGTTCATTCGATCAATTTGCAAATGCTGTATTAGAAAATGCTCTTGAGAGAGTAATTGTGGGAGATCTCTACTGTGATCTTCCTCTTGGCCTGTATGTGATTCGAGGTGAAAATGTTGTGCTAATAGGAGAGCTGGATCCTGAGAGGGAGGAGCTTCCTGCT
AACATGATCCATGTTTCTGCCACAGAGATTAAAAGGGCCCAGAAAGCAGAGAGAGATGCAACAGACTTGAAAGGATCTATGAGAAAACGCATGGAATTTCTTGATTTGGAATAATTATCCTGGACTATGATGTCACTATATATCCTCTTCTAAATGCACCATCGTTCAGTGGAGTTGGTAAAATTCTTATGGGTTTACTA
TGCAAGCAATATATTAGCTACACGTGCTCTGTCAGTTTGGCGAGTTTTATGCCAAATGGCCCGCAAATATTATCGCGGATAGCACATATGGAAATGTTTGGTTGGGAAGGATTACTTCTCTTTTCAACTGATTGTTGACTTGCAATCCAGAGACCTTCAGAAATTCTCTTTAAGTGTTCCATAGCTTAATGAGCGACTTA
TAGGTAGTGATTAATTATCCATTTTTATTCTGTTTTTCAGTTCAATCTTGCTTATAATAAGAATGTTAATAGCTTAGGAAGTGAGCATCATCTTCACGCTGCATGATGTTCTCGGTTTGGCTGTATTATTTTTTGTAAGATATGGCCATGGCCATGTGGGCACCTTCAGTATGCTTCAGATTTAATAATTCAGTAATTGT
TCTGGGTTTTTAAAAGCTGAAGCACAAGTTTAGTTGCTTTACATGGGAAAGTTATTTGCTTTATTTGGCAATGGGCATTGGTGTGAGCCTCTATACTTTTCACAAAATATGTGAAATTCATCTGGGATATAAATTTTTGTGGGAAATCATATTTGCCTGAACGAAAAATATTATTAGACATGAATGGGGAATCTCCTATT
TTTGTTTCCTG

>TRINITY_DN113337_c0_g1_i2 from sample A1 / Example unspliced isoform:

GGAGAAATACCGGGAGGAGGGCGAACGGAGATTTGGTGGAAAGGACTGGAAGGCATGGGAGGAGCAGAAGATATACCTACATAGATTTGCGTTGCCCGTTTTTATTTGCAAGGAAGGAAGTCTTGACCGTCCGTCTGTTGGGCCACTTCTGATTCGAGTGTTGCTGGAAAAGCTACTTTGTGGGTGATTGACATATATAT
ATATATATTTATATTTACCTCTTCTGTTCCTGCAACAAAGGTAGGATTCGAGGGGGCTATCTTCCAACACATAGATTGACAAGTGTATTTACTAGTTATAGGGCTTTTCGAGAAGATCTGGTCGCATCAGCGTAGCATATCAATTAATCGACCGATCGTTACTTTGGGAGGGACGGAGGAGGAGCGCTGCCAATGCTATT
TATAATAACAACAAGTTCGACAAATTGCTTCAGGTTTGGGTGTATTATTACTATTATTGTTGTTGCAGCAAATAGCAATAGCAATAACAGTATCAAAGCAGCAGAATTTAGAGAGCAGGAGGAGGGGATGTCTTGGGCAGGCCCGGAGGACATCTTCCTCTCCACTTCTCTCGCCAGCTACCTAGACAAAAAGTTACTAG
TTTTGCTTCGAGATGGAAGAAAACTCATTGGCATTCTTCGTTCATTCGATCAATTTGCAAATGCTGTATTAGAAAATGCTCTTGAGAGAGTAATTGTGGGAGATCTCTACTGTGATCTTCCTCTTGGCCTGTATGTGATTCGAGGTGAAAATGTTGTGCTAATAGGAGAGCTGGATCCTGAGAGGGAGGAGCTTCCTGCT
AACATGATCCATGTTTCTGCCACAGAGATTAAAAGGgtaggagttcaagcctacacttacataaattgcgtaagtccattattgagcttgttaaatttcttgctttgttaatgtatgtagGCCCAGAAAGCAGAGAGAGATGCAACAGACTTGAAAGGATCTATGAGAAAACGCATGGAATTTCTTGATTTGGAATAATT
ATCCTGGACTATGATGTCACTATATATCCTCTTCTAAATGCACCATCGTTCAGTGGAGTTGGTAAAATTCTTATGGGTTTACTATGCAAGCAATATATTAGCTACACGTGCTCTGTCAGTTTGGCGAGTTTTATGCCAAATGGCCCGCAAATATTATCGCGGATAGCACATATGGAAATGTTTGGTTGGGAAGGATTACT
TCTCTTTTCAACTGATTGTTGACTTGCAATCCAGAGACCTTCAGAAATTCTCTTTAAGTGTTCCATAGCTTAATGAGCGACTTATAGGTAGTGATTAATTATCCATTTTTATTCTGTTTTTCAGTTCAATCTTGCTTATAATAAGAATGTTAATAGCTTAGGAAGTGAGCATCATCTTCACGCTGCATGATGTTCTCGGT
TTGGCTGTATTATTTTTTGTAAGATATGGCCATGGCCATGTGGGCACCTTCAGTATGCTTCAGATTTAATAATTCAGTAATTGTTCTGGGTTTTTAAAAGCTGAAGCACAAGTTTAGTTGCTTTACATGGGAAAGTTATTTGCTTTATTTGGCAATGGGCATTGGTGTGAGCCTCTATACTTTTCACAAAATATGTGAAA
TTCATCTGGGATATAAATTTTTGTGGGAAATCATATTTGCCTGAACGAAAAATATTATTAGACATGAATGGGGAATCTCCTATTTTTGTTTCCTG

Intron 2 GTGGGTGATT ... CTAGTTATAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	58.9	30	54	32
A2	63.03	22	45	30
A3	53.19	44	54	46
A4	65.52	20	39	37
A5	55.56	16	30	10
A6	45.41	119	109	89
A7	51.52	96	97	107
A8	50.52	71	83	62
A9	50.52	120	150	95
A10	50.08	148	144	153

>TRINITY_DN113337_c0_g1_i5 from sample A1 / Example spliced isoform

GGAGAAATACCGGGAGGAGGGCGAACGGAGATTTGGTGGAAAGGACTGGAAGGCATGGGAGGAGCAGAAGATATACCTACATAGATTTGCGTTGCCCGTTTTTATTTGCAAGGAAGGAAGTCTTGACCGTCCGTCTGTTGGGCCACTTCTGATTCGAGTGTTGCTGGAAAAGCTACTTTGGCTTTTCGAGAAGATCTGGT
CGCATCAGCGTAGCATATCAATTAATCGACCGATCGTTACTTTGGGAGGGACGGAGGAGGAGCGCTGCCAATGCTATTTATAATAACAACAAGTTCGACAAATTGCTTCAGGTTTGGGTGTATTATTACTATTATTGTTGTTGCAGCAAATAGCAATAGCAATAACAGTATCAAAGCAGCAGAATTTAGAGAGCAGGAGG
AGGGGATGTCTTGGGCAGGCCCGGAGGACATCTTCCTCTCCACTTCTCTCGCCAGCTACCTAGACAAAAAGTTACTAGTTTTGCTTCGAGATGGAAGAAAACTCATTGGCATTCTTCGTTCATTCGATCAATTTGCAAATGCTGTATTAGAAAATGCTCTTGAGAGAGTAATTGTGGGAGATCTCTACTGTGATCTTCCT
CTTGGCCTGTATGTGATTCGAGGTGAAAATGTTGTGCTAATAGGAGAGCTGGATCCTGAGAGGGAGGAGCTTCCTGCTAACATGATCCATGTTTCTGCCACAGAGATTAAAAGGGCCCAGAAAGCAGAGAGAGATGCAACAGACTTGAAAGGATCTATGAGAAAACGCATGGAATTTCTTGATTTGGAATAATTATCCTG
GACTATGATGTCACTATATATCCTCTTCTAAATGCACCATCGTTCAGTGGAGTTGGTAAAATTCTTATGGGTTTACTATGCAAGCAATATATTAGCTACACGTGCTCTGTCAGTTTGGCGAGTTTTATGCCAAATGGCCCGCAAATATTATCGCGGATAGCACATATGGAAATGTTTGGTTGGGAAGGATTACTTCTCTT
TTCAACTGATTGTTGACTTGCAATCCAGAGACCTTCAGAAATTCTCTTTAAGTGTTCCATAGCTTAATGAGCGACTTATAGGTAGTGATTAATTATCCATTTTTATTCTGTTTTTCAGTTCAATCTTGCTTATAATAAGAATGTTAATAGCTTAGGAAGTGAGCATCATCTTCACGCTGCATGATGTTCTCGGTTTGGCT
GTATTATTTTTTGTAAGATATGGCCATGGCCATGTGGGCACCTTCAGTATGCTTCAGATTTAATAATTCAGTAATTGTTCTGGGTTTTTAAAAGCTGAAGCACAAGTTTAGTTGCTTTACATGGGAAAGTTATTTGCTTTATTTGGCAATGGGCATTGGTGTGAGCCTCTATACTTTTCACAAAATATGTGAAATTCATC
TGGGATATAAATTTTTGTGGGAAATCATATTTGCCTGAACGAAAAATATTATTAGACATGAATGGGGAATCTCCTATTTTTGTTTCCTG

>TRINITY_DN113337_c0_g1_i4 from sample A1 / Example unspliced isoform:

GGAGAAATACCGGGAGGAGGGCGAACGGAGATTTGGTGGAAAGGACTGGAAGGCATGGGAGGAGCAGAAGATATACCTACATAGATTTGCGTTGCCCGTTTTTATTTGCAAGGAAGGAAGTCTTGACCGTCCGTCTGTTGGGCCACTTCTGATTCGAGTGTTGCTGGAAAAGCTACTTTgtgggtgattgacatatatat
atatatatttatatttacctcttctgttcctgcaacaaaggtaggattcgagggggctatcttccaacacatagattgacaagtgtatttactagttatagGGCTTTTCGAGAAGATCTGGTCGCATCAGCGTAGCATATCAATTAATCGACCGATCGTTACTTTGGGAGGGACGGAGGAGGAGCGCTGCCAATGCTATT
TATAATAACAACAAGTTCGACAAATTGCTTCAGGTTTGGGTGTATTATTACTATTATTGTTGTTGCAGCAAATAGCAATAGCAATAACAGTATCAAAGCAGCAGAATTTAGAGAGCAGGAGGAGGGGATGTCTTGGGCAGGCCCGGAGGACATCTTCCTCTCCACTTCTCTCGCCAGCTACCTAGACAGTAAGTACTACC
CTCCCTCCCCTTACCTCTTTCTCTGCGGTAAACAAGTTTTCAAGTTAAATTGTTCAAGCACTACAGCTCGTTAGGGCTGTGGCTTTTGTGCCAACTCTTCTTTTACATTATTTGTTTTGCTGCAATATTGGCCTCCGTCCCGTCGGCCTCTTCTATTACAATCAATACATGGATCTGGGTTTTGTCTGTTTTTGTGTTGT
GTTCTTCCCACATGACATGTGTTAGCTATCGAGGTTAGCGGGTGGAAATTGTTAGAAATAGCTGCAAGTTCAATCCCCATCTATGGCTTTGGGTTTCATCGTTTTTGTGTTTTGTGGCATTGATTGCTCTAATAATTATTAGTAGCTGCAGGTGCCAAATTGTTGGCAACGTGTGCAAGTCCAATGCCCAGCGGTTGATT
TGGGTTTCTTCTATTTAGTGTTTTGGATATGGGTTTGGTCTAGCGGTTATTACATTGGCTTAATCCAGTCGGTCTCTTCTCAAATGGGCTTGGTTAGTTAATGGATGGCATTCGTTAAGATTGATTGCAAGTTTGATTTCCCTGGAGTCGTCAACACTGAAACAGACAGTTATGCCCCAGTAGAAAAGAAAATGGTGTTC
AAATACCTAGAAACTTCAGTTTGCCATGGGTTTTCTTGTACATTTTTAACCTTGTTTGTTTGTATCCAACTTTTTTGATACTTTCTCCACTATCCTTGTTGTACAGTAGTGATCTCTAGGGTAACTAGAGTGTAAGACAAAGAGGACCCCTTTGCTTTTTAAGATGAATGCTGAAAGAATTTCAACGTAGTCAGTTCAGT
CATTCTAACAAGTTATTGTTTTCCTAATTGTTAAATTAGGACCCACTTTGGGCTGGCTGATATGTTTGATAAAATCCATTAAGTATTATCTGCCACGATAAATTGAAGGTAAAGCAGTTTTGCAAACTGCGTCAAGAGGTGTTTTTAAGTATCAAGAGATTTCAAAATCAGTTTGGACAATTTTATTTAACTTAACAGCA
TTCACTGACATCC