sp|Q05153|SSRP1_ARATH ----> FACT complex subunit SSRP1


Intron 1 GTTTCAAAGT ... TCATCTATAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A133.33615
A233.33330
A3-1000
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A566.67122
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A89211013
A9100018
A1063.644410



>TRINITY_DN45323_c1_g3_i10 from sample A7 / Example spliced isoform
TTGTTCCCTATGATCATTACATGTCCAGAAAACCAAACATGAGCGGAGCTTCTCTATTTCTGCAGCCTTACTTTAATGGAGACTAGGGTTTGAGAGAAGGGTATTCGAACAAATTCCTGAATGTAAAGAAGTTGTATGGAATTCAACAATTGAAACATATGCCTGGCTTGGACATGGGGATGACAACTCTTTCTCCAAAT
GGGAGCAGGAGAACTCAAGCCAACCCCATTCATTTTCACCACAGTTGTCAGTTCATGTATAGGCATAGCAAACATCAAAGAAGATTCCAGCTCAAATGTGTGTATAGAATACTGCCACATTCACATTGGTGATGATATTTTCGCAATAAAAAGTGGATGGGATGAGCACGGAATCACTCAGGGGCATCCAACTTCAGACA
TAATTATTATGGATGTGCAAATATTTACTTCAGTAAGGCCTCTATATGCCTCCATTGATGAGAAACATCATCCTTCGCAGTAGTATAATCGATTGGTGGCAAGAAGAATCCTACACCAATCTGATGTCACTGTTTCTGCTGGTATTCTAATGATTGGCTTACCCAATTCAAATGATTGTGCATTTTCAATGTCAATCAGA
AGAAATGGAAATGGGTTGATGTGTGCACTTGGAAGAGGAATTCCATTGCCAAGGCCAGGATTTCCAAGAATATGATCACCGAGAATTCCTTGGATGGTTTCTTCAGGAATTAGTATCATGCTCTCTTCTAATGGTACCAGATTGCCTATCAGTGGTCCAATTCCTTCTTGGATTATGCATGTTCTAGGAAGTATGATTCG
CAAGCCAAGTGAGATGCAGATGTTGCAGGAAAGCTCCTATATTTTACCAGTCTTTCCTTGGTTACAAAATAATGTGGGGAAGAGAGGAAAATTTGACTCTTTTTTCACTACACAAAAGAGTTATCTATTACACTCTTACAAGGAAGCAGGATGTTGACAAGCTCATGAGGGATACATTGGACAAAGTTCTGGTTCTCTGA
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GTTTTGGAGTCTTATAATATGAAGAATTTCTTTGATTGTATACAGCTCCCCAATTTCGACATTGCTTCAGATGCTGCAACCACCTTTAAGGGCTTACATTTTGGGTAGGTTCAAAACCGGTTTTTGAGGTATCCTTGGTAGATGAATCTCAAATGCAGCTCCAAGGAAAGAATGATATTGTCTTAGAATTCCACGTGGTC
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GAAGCTTAGGAACAACTGCATGTTAAATAATGAAGTGGTGATCATTCGATGCGTGTGCTACATTAAGGGAAACTCACGGATGGGTGTGCTAGAAGGAAGGAAACTTAGTTACATGTTTCACAACTATATGAAAAAAAATCGGAAGATACATCTATGTCTTGTAGAATTGTTGCCCCTGCTGGTGACAAGGATTTGTACTT
CAAGTATAGCTCCATTATGTTTGAGAAGATGAAAATTGAGAAAGAGTAGCTGGAGCAGATTGATATTAAATAGATACATTTTCTCATCCATGAGGTGAATGGTGAG


>TRINITY_DN45323_c1_g3_i9 from sample A7 / Example unspliced isoform:
TTGTTCCCTATGATCATTACATGTCCAGAAAACCAAACATGAGCGGAGCTTCTCTATTTCTGCAGCCTTACTTTAATGGAGACTAGGGTTTGAGAGAAGGGTATTCGAACAAATTCCTGAATGTAAAGAAGTTGTATGGAATTCAACAATTGAAACATATGCCTGGCTTGGACATGGGGATGACAACTCTTTCTCCAAAT
GGGAGCAGGAGAACTCAAGCCAACCCCATTCATTTTCACCACAGTTGTCAGTTCATGTATAGGCATAGCAAACATCAAAGAAGATTCCAGCTCAAATGTGTGTATAGAATACTGCCACATTCACATTGGTGATGATATTTTCGCAATAAAAAGTGGATGGGATGAGCACGGAATCACTCAGGGGCATCCAACTTCAGACA
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ATGTCACTGTTTCTGCTGGTATTCTAATGATTGGCTTACCCAATTCAAATGATTGTGCATTTTCAATGTCAATCAGAAGAAATGGAAATGGGTTGATGTGTGCACTTGGAAGAGGAATTCCATTGCCAAGGCCAGGATTTCCAAGAATATGATCACCGAGAATTCCTTGGATGGTTTCTTCAGGAATTAGTATCATGCTC
TCTTCTAATGGTACCAGATTGCCTATCAGTGGTCCAATTCCTTCTTGGATTATGCATGTTCTAGGAAGTATGATTCGCAAGCCAAGTGAGATGCAGATGTTGCAGGAAAGCTCCTATATTTTACCAGTCTTTCCTTGGTTACAAAATAATGTGGGGAAGAGAGGAAAATTTGACTCTTTTTTCACTACACAAAAGAGTTA
TCTATTACACTCTTACAAGGAAGCAGGATGTTGACAAGCTCATGAGGGATACATTGGACAAAGTTCTGGTTCTCTGATTTGGAAGGGCCACAGATGTTGTTTGCATGCACCTTGATGAAATTAAACTGTATGTGAAGTGTCCAAGTTTGCATCAATCGCTTTAGTGGATGTTGACGCGGAGGAAACCCAAGTTTATGTCA
AGTACTTTGACATCACTTTGATACCTGTTGAAATCTTATTCTTTAATGCACATCACATGAAGATGGACTTAATGTATGTTTTGGAGTCTTATAATATGAAGAATTTCTTTGATTGTATACAGCTCCCCAATTTCGACATTGCTTCAGATGCTGCAACCACCTTTAAGGGCTTACATTTTGGGTAGGTTCAAAACCGGTTT
TTGAGGTATCCTTGGTAGATGAATCTCAAATGCAGCTCCAAGGAAAGAATGATATTGTCTTAGAATTCCACGTGGTCCGTCCAATTGGAGCCAATTAGGTAAGTATTTCCTATTGTACTTGTCAACCTGATTCACCTCCCAAATTTTTTTTTCTTGTGTTGGTGGCGGGGGTTTCAACTTTTAGTAGCTATTAACTTGGA
GCCTGCATCATATCTAGTATTTTATGCCTAGTGATTTTTTGATGGTATGCTTGCGTAAACAATTTTATATCCCAGGCCCATCTATAGAAAATATTGAATTTCATCCGTTTTTTTTCTTCACTTTCTTAGATGAAAATGGACTTGCTAACTCTTTGTGTTTGCTACTTCTTGCAATTCTGGCATTGAGCAAAAGAATTTAT
AATTGTTAATCATGAATGAAAATGATAATATTAAATTTTAGCATCTACATCAAGAATGAATTTTGGTCATCCTATGAGAAGCTTAGGAACAACTGCATGTTAAATAATGAAGTGGTGATCATTCGATGCGTGTGCTACATTAAGGGAAACTCACGGATGGGTGTGCTAGAAGGAAGGAAACTTAGTTACATGTTTCACAA
CTATATGAAAAAAAATCGGAAGATACATCTATGTCTTGTAGAATTGTTGCCCCTGCTGGTGACAAGGATTTGTACTTCAAGTATAGCTCCATTATGTTTGAGAAGATGAAAATTGAGAAAGAGTAGCTGGAGCAGATTGATATTAAATAGATACATTTTCTCATCCATGAGGTGAATGGTGAG