sp|Q66GP4|PP379_ARATH ----> Pentatricopeptide repeat-containing protein At5g13770, chloroplastic
Intron 1 GTTCGTTGAT ... GGGTTTGTAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 40.91 | 13 | 10 | 8 |
| A2 | 46.15 | 7 | 3 | 9 |
| A3 | 25 | 3 | 1 | 1 |
| A4 | 30 | 7 | 5 | 1 |
| A5 | 33.33 | 3 | 2 | 1 |
| A6 | 26.98 | 23 | 4 | 13 |
| A7 | 27.78 | 13 | 3 | 7 |
| A8 | 28.89 | 16 | 9 | 4 |
| A9 | 33.33 | 17 | 3 | 14 |
| A10 | 33.33 | 10 | 8 | 2 |
>TRINITY_DN108047_c10_g6_i1 from sample A2 / Example spliced isoformAGGGCGTATCTGAAAGAAAATATGGTTAATGAGGTGGATTCCATGGTTAGAGATGGAAGCCTTACAAGCCCAGATGATTTCTCCCACTTGATCAAAGCCTTCATTGATAGAAATTTACCGTTGCGGGCTATTGAAGTATTGGGGTTGATGCAGGAATCTGGAGTAAAAATCGGTGATCTGGATTATGCTAGAGTTATTCA
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>TRINITY_DN108047_c10_g6_i2 from sample A2 / Example unspliced isoform:AGGGCGTATCTGAAAGAAAATATGGTTAATGAGGTGGATTCCATGGTTAGAGATGGAAGCCTTACAAGCCCAGATGATTTCTCCCACTTGATCAAAGCCTTCATTGATAGAAATTTACCGTTGCGGGCTATTGAAGTATTGGGGTTGATGCAGGAATCTGGAGTAAAAATCGGTGATCTGGATTATGCTAGAGTTATTCA
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GATTAGCAGCAGAGTTCTTCACAGATTTATGTTTGTTAGGCAATATGTAGCTGCCAAATTGATAAGGTTTATGATTGCAGAATAATTATTAACCTGTTTTATGGAAATTTACGTCTTGACATACAGAACAAGTCAACCTTCATTTGGAAGTTTGGTAAAGAATAATACTAAGGTTTCTTGCAATCATGTAATGCCCTG