sp|Q9M7I7|CLH2_ARATH ----> Chlorophyllase-2

Intron 1 GTAGGGTTTC ... TTCGTAACAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	92.31	4	48	8
A2	97.06	1	33	1
A3	100	0	28	1
A4	100	0	12	3
A5	100	0	15	0
A6	97.43	7	265	6
A7	96.1	12	296	14
A8	95.91	16	375	14
A9	98.5	5	328	8
A10	93.23	13	179	10

>TRINITY_DN48760_c1_g5_i4 from sample A10 / Example spliced isoform

TGAAGGCGTTGGAACCTATGGAGCACTCATGCCAACTGGATTACGGATGACGAGGAGATTTAGAGGCTCGGGCGCGTGGAGATCATCAGTCTTAAAAACATAAAAAAAAAACTCCATGCTCCAGGTGACACGTACCGTGACTTCACAAATTTGTGGTTCGTTACATTGATTTTTAAGGAGTATAAGAGAACATATACAGT
TCATCTAACACTGCTGTGTGTTTGACGTAATAGGTGTGACTTCTATACCACATGCATTCAGAATTTTTTTTATCCTTCATAGATTGGGGCGTAAGATAGATTTATTTTAATTATAACGATTTTATTGTGAATTTCATACTGTAAATTTATTTGTTATCTCATAACCCATTCGGATTGGTATATCTTCCAATTTTCAATCC
AATTTTGGCTATTAACTTTTAATTTTCAATCTAAAA

>TRINITY_DN48760_c1_g5_i1 from sample A10 / Example unspliced isoform:

TGAAGGCGTTGGAACCTATGGAGCACTCATGCCAACTGGATTACGGATGACGAGGAGATTTAGAGGCTCGGGCGCGTGGAGATCATCAGgtagggtttctcagtgacttcgcctatactattaatatgtctgggttaaagttcatttgggctaaattaaagttaaattgcgttaaaattttaggtgagtttaaagtctca
cgaaactttgatcggaaaggctttttctgctataaatcggctttaaaaatgaacaaaatttttcaaatccataaaattgtttcaaataccttgtgaaaattgttcaataattagactgatccactgagcttgttttttaccattaaaacttcggctctcacattgagcagttattttaaacaaaattataaatctccgag
ctctaaaactgaggtgcagattttccatcagttacttaaaaaaccatttatacctttctttagttctggattttttatataaaaaacagttcgtccaaaattactgtaaatgtttgcttgaagagtaccaaacatatggctgggtgcatatgttgtgatatgtagatttagattggcaccaatttaaaggtaatttgtta
aggaaattagttacaagtgactggtatttccatttctttttcaatttcaatgaaatatggacattcatgaaataggtggcaaaagtataggtgacaagtattctaacatagaattgtgtggttgtctactgtgattttcgtaacagTCTTAAAAACATAAAAAAAAAACTCCATGCTCCAGGTGACACGTACCGTGACTT
CACAAATTTGTGGTTCGTTACATTGATTTTTAAGGAGTATAAGAGAACATATACAGTTCATCTAACACTGCTGTGTGTTTGACGTAATAGGTGTGACTTCTATACCACATGCATTCAGAATTTTTTTTATCCTTCATAGATTGGGGCGTAAGATAGATTTATTTTAATTATAACGATTTTATTGTGAATTTCATACTGTA
AATTTATTTGTTATCTCATAACCCATTCGGATTGGTATATCTTCCAATTTTCAATCCAATTTTGGCTATTAACTTTTAATTTTCAATCTAAAA