sp|F4JTS8|NOV_ARATH ----> Protein NO VEIN
Intron 1 GTTATATTAC ... TGAATGGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 53.09 | 76 | 86 | 29.5 |
| A2 | 55.5 | 50.5 | 63 | 24 |
| A3 | 56.05 | 51 | 65 | 15 |
| A4 | 48.78 | 42 | 40 | 18 |
| A5 | 67.2 | 10 | 20.5 | 1 |
| A6 | 63.55 | 109 | 190 | 63 |
| A7 | 66.59 | 151.5 | 302 | 75 |
| A8 | 66.55 | 280 | 557 | 131.5 |
| A9 | 63.68 | 170 | 298 | 76.5 |
| A10 | 61.32 | 94 | 149 | 40.5 |
>TRINITY_DN135879_c4_g4_i3 from sample A1 / Example spliced isoformGCTACTTACTGCTGTGGCAGTCCTGGTGGGAAGGGAGCAAAGTATACAGAGCCTTCATGTGTTTTAAAGATTCGTGAATATTGCTGGGTAAAATCAAGACTTGATGGGAAGCTTTATTTTCCATCTGACCTATTCTTTGACTGTGATGAGGTTAGGTCTATCCTGGGTTCTAATGCTCCTTATGCAGCTCCTCAGATTCA
TAGTAGAAAGCTTTTGGCAGATATTGGATTCAGGACACAGGTTCCTGTTAAAGATGCCCTTAGTCTCCTTTCCAAGTGGAGCAAATGTGAGTGCATGTTCAAAGGAAGCATTTCCGAAATGGGAAGACTATATTCATTCCTCTCGACTAGAATGGACACATGCAGGGGCGAAATAGTTACCCATTTCAGGATGAACCCTT
CTATTTTTGTGCCAATCGTGGATGACTCAAAACAGGAATCAGTTACCCCAGGAATGTTTCTTCTACTTGATCAAGTTTACTGGAAAGATCCAACTGGCTGCCTTGATCTATTAGCAAAGGGGACACTATCTTCTGCTAAGATTCCTACCACTGATAAGATGTTCCTTCGAGCCTTGTGCCAGATCTATCCAAATCTTCAT
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CAAATTAGGCAATTCAGTTCTTCCAACAATGCAGGACAAATGGGTCTCTCTCCATCCAAATTTTGGCCTTGTTTGCTGGTATGATGATGCAGAAATTGGGGAACAATTTAAGCACTGTAATGGAGTTTATTTCTTATGCCTTGATGCTGGGGGTAAGCGCAAGAAAACCAAGGCAAAAGACAGAGTTCGAGCCAAAATTA
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CAATTGCGTCTTTTGGTGGTTGAGGAATTATTTTATAGGCACACTTTACAAGGCTGCCACACTGTCTCAAACAAAAGGCATGAGTGTAACTCTCTCTTACAGGGAAGCACCTTGTATATGTCTCGAACAGCTGATTTTTCTGCAATATACTCAGAATTATCACGTCTTTTCTTCAATCGACATGTGGATCTTCAGCTGGT
AAATTTTCTTCATCTTATAACTATCATGGCAGATACTGGGTCTACTGTGGAACAGACAGAATCATTTATTCTGAATGCACAGACAATCCCCAAGCTTCCTCTGGAAGAAGTAACCTGGTTTTTTGAACATAGAGGAGATGAGATCGACATTCATCCAATACTGTCAAATCCAACCTTTCCTGAAAATAAGTTGATGACTA
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AATACTTCAGCTTCTGTTGATACTGCAGTTCCATATGATTCAAAGTCTGAACATGACATGGACATGAAAAAGGTCGAATTTGGTGGGGAGAGTTCTCTTGCAGATAATGATAATATTTTCCTGGGATTACCTTCAACAGGACTTGAATGTGCCAATATTAGTAACAAATCATACAAATTGTCTGCCCCCAGTGAAATGGA
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ATAAAGCTTGCCATTTTGATGCCTGTCAATAAGCACTGTGCTCTTCCAGAGGCCACCTTCATTCCCCAGAGAGAGGGAGGAGATTGAAGCTTCGGGCTTTGATAATCTACAATGTTAAGTCCAATATGCCAATTAAAGATGCCTTTATGATTCTTTATTCCATTTCAGGGCATTTGCATCAAATGGAAAAAACCATCTCA
AAGACTGGAGGGTGACTTGAATACAATTCCTATTTTCTTGGAAAATTGCCAGTATAACAATTAAGTCCTTGCAATGGATGGTTGAGAGTTTGATTAGTATTGGCTTTTGTCTATGGTCTGTACAATTTTAGCAGCTAATGCAATTCGCTGTTAAATTTTGTTTTTGTCTACCATGTATGCCTTGACCAATGTACTATGAC
AAGGTGGTCTTTATCCACAAGGCTTCAGCCATGGAGATAAAATGTAATCCATAATTATTTTGGACTAGGATGATTTAGAGACTAACCTCAGGCTGTACCAGAGGCACACAAATAAAACAATAATGCATAATCCATTGCTGCATATAAATCTCCAAAATGACTAAACAGCGATGTAATTTATTGATAATTTCGTTTCTAGT
ATATTTGAAAGTATTCTC
>TRINITY_DN135879_c4_g4_i5 from sample A1 / Example unspliced isoform:GCTACTTACTGCTGTGGCAGTCCTGGTGGGAAGGGAGCAAAGTATACAGAGCCTTCATGTGTTTTAAAGATTCGTGAATATTGCTGGGTAAAATCAAGACTTGATGGGAAGCTTTATTTTCCATCTGACCTATTCTTTGACTGTGATGAGGTTAGGTCTATCCTGGGTTCTAATGCTCCTTATGCAGCTCCTCAGATTCA
TAGTAGAAAGCTTTTGGCAGATATTGGATTCAGGACACAGGTTCCTGTTAAAGATGCCCTTAGTCTCCTTTCCAAGTGGAGCAAATGTGAGTGCATGTTCAAAGGAAGCATTTCCGAAATGGGAAGACTATATTCATTCCTCTCGACTAGAATGGACACATGCAGGGGCGAAATAGTTACCCATTTCAGGATGAACCCTT
CTATTTTTGTGCCAATCGTGGATGACTCAAAACAGGAATCAGTTACCCCAGGAATGTTTCTTCTACTTGATCAAGTTTACTGGAAAGATCCAACTGGCTGCCTTGATCTATTAGCAAAGGGGACACTATCTTCTGCTAAGATTCCTACCACTGATAAGATGTTCCTTCGAGCCTTGTGCCAGATCTATCCAAATCTTCAT
GGCCTCTTTGTGAATGAATGCTGTGTGCAAAGAAGCCCTGATTTTGATGATTATCTTAGGATACTGAAGCATCTTGCAAGTATTGCTTTACCGTCAGAAGTGTATGAGGAGGTTATGCAAGTATTTTACCTGTGGGCTGAAGATATTGAATCTGAGAGAATAGACCACACGGAGATTTCCCGGTGGAAAGACTGCCTACA
CAAATTAGGCAATTCAGTTCTTCCAACAATGCAGGACAAATGGGTCTCTCTCCATCCAAATTTTGGCCTTGTTTGCTGGTATGATGATGCAGAAATTGGGGAACAATTTAAGCACTGTAATGGAGTTTATTTCTTATGCCTTGATGCTGGGGGTAAGCGCAAGAAAACCAAGGCAAAAGACAGAGTTCGAGCCAAAATTA
CAACTTTTATGCATGCAATGGGAATCCCTTCACTTTCAGAGGTGGTGGTGCGCGAGGCAATATTTTATGGGATTCAAGACAATGAGAAATTATTTTCCCTCGTTAACTGGATTCTTCCTTATGCTCAAAGATATCTGTTCAAAATGCATCCTGAAGTATACTGTGCACTTAAGGACAATATATTCAACAATCAATTAAAG
CAATTGCGTCTTTTGGTGGTTGAGGAATTATTTTATAGGCACACTTTACAAGGCTGCCACACTGTCTCAAACAAAAGGCATGAGTGTAACTCTCTCTTACAGGGAAGCACCTTGTATATGTCTCGAACAGCTGATTTTTCTGCAATATACTCAGAATTATCACGTCTTTTCTTCAATCGACATGTGGATCTTCAGCTGGT
AAATTTTCTTCATCTTATAACTATCATGGCAGATACTGGGTCTACTGTGGAACAGACAGAATCATTTATTCTGAATGCACAGACAATCCCCAAGCTTCCTCTGGAAGAAGTAACCTGGTTTTTTGAACATAGAGGAGATGAGATCGACATTCATCCAATACTGTCAAATCCAACCTTTCCTGAAAATAAGTTGATGACTA
AGAAGCCGCAAAAGATTAGTGTTGATGCTAGTTGGCCCCCAACAACTTGGAAAGGAGTTCCAAAATCTAGAGACAAGGTACAGGCACAGGCAGGAAATTCAGGCATAAAACAAGATTTTATAAGTCACGAACATAACACTGTTATAGACAACACAATTGTATCTAATACAAACACTGCATGTGAAAGTGATCGGGTCATA
AATACTTCAGCTTCTGTTGATACTGCAGTTCCATATGATTCAAAGTCTGAACATGACATGGACATGAAAAAGGTCGAATTTGGTGGGGAGAGTTCTCTTGCAGATAATGATAATATTTTCCTGGGATTACCTTCAACAGGACTTGAATGTGCCAATATTAGTAACAAATCATACAAATTGTCTGCCCCCAGTGAAATGGA
TATTGGGATGTCTAATGTCTTTACAAACAGAAAACAACTATGCGTGGGTGTGCCTGATGATGAACAGCGACGGCTCACCGGTAGATTAGGAGAGTGTGTTGTTTACAAGTATTTAACTGACATGTATGGTCCTGCATCTGTGAAGTGGGTAAATGAAAATGGGGAAACTGGTTCAGCTTTTGACATGATTCTCAGCAAAG
AGGATGGTAAGAAAGAATTCATAGAAGTAAAGGCAACGAGGTCAGAAAATAAAGATTGGTTTGAGATAACCAACCGAGAGTGGGACTTTGCAAGCAAAAATAGTGATTGCTTCACCATAATTCGGGTGTTTTTGGGTAGCAGTCCATATGTAAAGTTTGTTACGCTTGCAAATCCTATAAAGCTCTACCAACAGAAAATT
ATAAAGCTTGCCATTTTGATGCCTGTCAATAAGCACTGTGCTCTTCCAGAGGCCACCTTCATTCCCCAGAGAGAGGGAGGAGATTGAAGCTTCGGGCTTTGATAATCTACAATGTTAAGTCCAATATGCCAATTAAAGgttatattaccagcaaacctcttagcatgaatctgtgaatactatatcaaaagacattttga
cttatgtaaacaattaagaaagaggcagggttgacctaatgacaggcaatttgtcaaagcagctgtgaagagtgttttaggcatctggttgatctctattagcaaatggctttatattgtaaacaatggagggttgatttatttttgtcattaattttttgactgatttttaataaaatctaaaccattttttgtctttt
gaatggcagATGCCTTTATGATTCTTTATTCCATTTCAGGGCATTTGCATCAAATGGAAAAAACCATCTCAAAGACTGGAGGGTGACTTGAATACAATTCCTATTTTCTTGGAAAATTGCCAGTATAACAATTAAGTCCTTGCAATGGATGGTTGAGAGTTTGATTAGTATTGGCTTTTGTCTATGGTCTGTACAATTTT
AGCAGCTAATGCAATTCGCTGTTAAATTTTGTTTTTGTCTACCATGTATGCCTTGACCAATGTACTATGACAAGGTGGTCTTTATCCACAAGGCTTCAGCCATGGAGATAAAATGTAATCCATAATTATTTTGGACTAGGATGATTTAGAGACTAACCTCAGGCTGTACCAGAGGCACACAAATAAAACAATAATGCATA
ATCCATTGCTGCATATAAATCTCCAAAATGACTAAACAGCGATGTAATTTATTGATAATTTCGTTTCTAGTATATTTGAAAGTATTCTC
Intron 2 GTTATATTAC ... TCCATTTCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 63.7 | 49 | 86 | 42.5 |
| A2 | 69.62 | 27.5 | 63 | 25.5 |
| A3 | 56.53 | 50 | 65 | 24 |
| A4 | 64.52 | 22 | 40 | 18 |
| A5 | 67.2 | 10 | 20.5 | 1 |
| A6 | 68.84 | 86 | 190 | 66 |
| A7 | 71.31 | 121.5 | 302 | 82 |
| A8 | 70.56 | 232.5 | 557 | 152.5 |
| A9 | 68.12 | 139.5 | 298 | 83.5 |
| A10 | 68.35 | 69 | 149 | 41.5 |
>TRINITY_DN135879_c4_g4_i1 from sample A1 / Example spliced isoformGCTACTTACTGCTGTGGCAGTCCTGGTGGGAAGGGAGCAAAGTATACAGAGCCTTCATGTGTTTTAAAGATTCGTGAATATTGCTGGGTAAAATCAAGACTTGATGGGAAGCTTTATTTTCCATCTGACCTATTCTTTGACTGTGATGAGGTTAGGTCTATCCTGGGTTCTAATGCTCCTTATGCAGCTCCTCAGATTCA
TAGTAGAAAGCTTTTGGCAGATATTGGATTCAGGACACAGGTTCCTGTTAAAGATGCCCTTAGTCTCCTTTCCAAGTGGAGCAAATGTGAGTGCATGTTCAAAGGAAGCATTTCCGAAATGGGAAGACTATATTCATTCCTCTCGACTAGAATGGACACATGCAGGGGCGAAATAGTTACCCATTTCAGGATGAACCCTT
CTATTTTTGTGCCAATCGTGGATGACTCAAAACAGGAATCAGTTACCCCAGGAATGTTTCTTCTACTTGATCAAGTTTACTGGAAAGATCCAACTGGCTGCCTTGATCTATTAGCAAAGGGGACACTATCTTCTGCTAAGATTCCTACCACTGATAAGATGTTCCTTCGAGCCTTGTGCCAGATCTATCCAAATCTTCAT
GGCCTCTTTGTGAATGAATGCTGTGTGCAAAGAAGCCCTGATTTTGATGATTATCTTAGGATACTGAAGCATCTTGCAAGTATTGCTTTACCGTCAGAAGTGTATGAGGAGGTTATGCAAGTATTTTACCTGTGGGCTGAAGATATTGAATCTGAGAGAATAGACCACACGGAGATTTCCCGGTGGAAAGACTGCCTACA
CAAATTAGGCAATTCAGTTCTTCCAACAATGCAGGACAAATGGGTCTCTCTCCATCCAAATTTTGGCCTTGTTTGCTGGTATGATGATGCAGAAATTGGGGAACAATTTAAGCACTGTAATGGAGTTTATTTCTTATGCCTTGATGCTGGGGGTAAGCGCAAGAAAACCAAGGCAAAAGACAGAGTTCGAGCCAAAATTA
CAACTTTTATGCATGCAATGGGAATCCCTTCACTTTCAGAGGTGGTGGTGCGCGAGGCAATATTTTATGGGATTCAAGACAATGAGAAATTATTTTCCCTCGTTAACTGGATTCTTCCTTATGCTCAAAGATATCTGTTCAAAATGCATCCTGAAGTATACTGTGCACTTAAGGACAATATATTCAACAATCAATTAAAG
CAATTGCGTCTTTTGGTGGTTGAGGAATTATTTTATAGGCACACTTTACAAGGCTGCCACACTGTCTCAAACAAAAGGCATGAGTGTAACTCTCTCTTACAGGGAAGCACCTTGTATATGTCTCGAACAGCTGATTTTTCTGCAATATACTCAGAATTATCACGTCTTTTCTTCAATCGACATGTGGATCTTCAGCTGGT
AAATTTTCTTCATCTTATAACTATCATGGCAGATACTGGGTCTACTGTGGAACAGACAGAATCATTTATTCTGAATGCACAGACAATCCCCAAGCTTCCTCTGGAAGAAGTAACCTGGTTTTTTGAACATAGAGGAGATGAGATCGACATTCATCCAATACTGTCAAATCCAACCTTTCCTGAAAATAAGTTGATGACTA
AGAAGCCGCAAAAGATTAGTGTTGATGCTAGTTGGCCCCCAACAACTTGGAAAGGAGTTCCAAAATCTAGAGACAAGGTACAGGCACAGGCAGGAAATTCAGGCATAAAACAAGATTTTATAAGTCACGAACATAACACTGTTATAGACAACACAATTGTATCTAATACAAACACTGCATGTGAAAGTGATCGGGTCATA
AATACTTCAGCTTCTGTTGATACTGCAGTTCCATATGATTCAAAGTCTGAACATGACATGGACATGAAAAAGGTCGAATTTGGTGGGGAGAGTTCTCTTGCAGATAATGATAATATTTTCCTGGGATTACCTTCAACAGGACTTGAATGTGCCAATATTAGTAACAAATCATACAAATTGTCTGCCCCCAGTGAAATGGA
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ATAAAGCTTGCCATTTTGATGCCTGTCAATAAGCACTGTGCTCTTCCAGAGGCCACCTTCATTCCCCAGAGAGAGGGAGGAGATTGAAGCTTCGGGCTTTGATAATCTACAATGTTAAGTCCAATATGCCAATTAAAGGGCATTTGCATCAAATGGAAAAAACCATCTCAAAGACTGGAGGGTGACTTGAATACAATTCC
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ATGGAGATAAAATGTAATCCATAATTATTTTGGACTAGGATGATTTAGAGACTAACCTCAGGCTGTACCAGAGGCACACAAATAAAACAATAATGCATAATCCATTGCTGCATATAAATCTCCAAAATGACTAAACAGCGATGTAATTTATTGATAATTTCGTTTCTAGTATATTTGAAAGTATTCTC
>TRINITY_DN135879_c4_g4_i5 from sample A1 / Example unspliced isoform:GCTACTTACTGCTGTGGCAGTCCTGGTGGGAAGGGAGCAAAGTATACAGAGCCTTCATGTGTTTTAAAGATTCGTGAATATTGCTGGGTAAAATCAAGACTTGATGGGAAGCTTTATTTTCCATCTGACCTATTCTTTGACTGTGATGAGGTTAGGTCTATCCTGGGTTCTAATGCTCCTTATGCAGCTCCTCAGATTCA
TAGTAGAAAGCTTTTGGCAGATATTGGATTCAGGACACAGGTTCCTGTTAAAGATGCCCTTAGTCTCCTTTCCAAGTGGAGCAAATGTGAGTGCATGTTCAAAGGAAGCATTTCCGAAATGGGAAGACTATATTCATTCCTCTCGACTAGAATGGACACATGCAGGGGCGAAATAGTTACCCATTTCAGGATGAACCCTT
CTATTTTTGTGCCAATCGTGGATGACTCAAAACAGGAATCAGTTACCCCAGGAATGTTTCTTCTACTTGATCAAGTTTACTGGAAAGATCCAACTGGCTGCCTTGATCTATTAGCAAAGGGGACACTATCTTCTGCTAAGATTCCTACCACTGATAAGATGTTCCTTCGAGCCTTGTGCCAGATCTATCCAAATCTTCAT
GGCCTCTTTGTGAATGAATGCTGTGTGCAAAGAAGCCCTGATTTTGATGATTATCTTAGGATACTGAAGCATCTTGCAAGTATTGCTTTACCGTCAGAAGTGTATGAGGAGGTTATGCAAGTATTTTACCTGTGGGCTGAAGATATTGAATCTGAGAGAATAGACCACACGGAGATTTCCCGGTGGAAAGACTGCCTACA
CAAATTAGGCAATTCAGTTCTTCCAACAATGCAGGACAAATGGGTCTCTCTCCATCCAAATTTTGGCCTTGTTTGCTGGTATGATGATGCAGAAATTGGGGAACAATTTAAGCACTGTAATGGAGTTTATTTCTTATGCCTTGATGCTGGGGGTAAGCGCAAGAAAACCAAGGCAAAAGACAGAGTTCGAGCCAAAATTA
CAACTTTTATGCATGCAATGGGAATCCCTTCACTTTCAGAGGTGGTGGTGCGCGAGGCAATATTTTATGGGATTCAAGACAATGAGAAATTATTTTCCCTCGTTAACTGGATTCTTCCTTATGCTCAAAGATATCTGTTCAAAATGCATCCTGAAGTATACTGTGCACTTAAGGACAATATATTCAACAATCAATTAAAG
CAATTGCGTCTTTTGGTGGTTGAGGAATTATTTTATAGGCACACTTTACAAGGCTGCCACACTGTCTCAAACAAAAGGCATGAGTGTAACTCTCTCTTACAGGGAAGCACCTTGTATATGTCTCGAACAGCTGATTTTTCTGCAATATACTCAGAATTATCACGTCTTTTCTTCAATCGACATGTGGATCTTCAGCTGGT
AAATTTTCTTCATCTTATAACTATCATGGCAGATACTGGGTCTACTGTGGAACAGACAGAATCATTTATTCTGAATGCACAGACAATCCCCAAGCTTCCTCTGGAAGAAGTAACCTGGTTTTTTGAACATAGAGGAGATGAGATCGACATTCATCCAATACTGTCAAATCCAACCTTTCCTGAAAATAAGTTGATGACTA
AGAAGCCGCAAAAGATTAGTGTTGATGCTAGTTGGCCCCCAACAACTTGGAAAGGAGTTCCAAAATCTAGAGACAAGGTACAGGCACAGGCAGGAAATTCAGGCATAAAACAAGATTTTATAAGTCACGAACATAACACTGTTATAGACAACACAATTGTATCTAATACAAACACTGCATGTGAAAGTGATCGGGTCATA
AATACTTCAGCTTCTGTTGATACTGCAGTTCCATATGATTCAAAGTCTGAACATGACATGGACATGAAAAAGGTCGAATTTGGTGGGGAGAGTTCTCTTGCAGATAATGATAATATTTTCCTGGGATTACCTTCAACAGGACTTGAATGTGCCAATATTAGTAACAAATCATACAAATTGTCTGCCCCCAGTGAAATGGA
TATTGGGATGTCTAATGTCTTTACAAACAGAAAACAACTATGCGTGGGTGTGCCTGATGATGAACAGCGACGGCTCACCGGTAGATTAGGAGAGTGTGTTGTTTACAAGTATTTAACTGACATGTATGGTCCTGCATCTGTGAAGTGGGTAAATGAAAATGGGGAAACTGGTTCAGCTTTTGACATGATTCTCAGCAAAG
AGGATGGTAAGAAAGAATTCATAGAAGTAAAGGCAACGAGGTCAGAAAATAAAGATTGGTTTGAGATAACCAACCGAGAGTGGGACTTTGCAAGCAAAAATAGTGATTGCTTCACCATAATTCGGGTGTTTTTGGGTAGCAGTCCATATGTAAAGTTTGTTACGCTTGCAAATCCTATAAAGCTCTACCAACAGAAAATT
ATAAAGCTTGCCATTTTGATGCCTGTCAATAAGCACTGTGCTCTTCCAGAGGCCACCTTCATTCCCCAGAGAGAGGGAGGAGATTGAAGCTTCGGGCTTTGATAATCTACAATGTTAAGTCCAATATGCCAATTAAAGgttatattaccagcaaacctcttagcatgaatctgtgaatactatatcaaaagacattttga
cttatgtaaacaattaagaaagaggcagggttgacctaatgacaggcaatttgtcaaagcagctgtgaagagtgttttaggcatctggttgatctctattagcaaatggctttatattgtaaacaatggagggttgatttatttttgtcattaattttttgactgatttttaataaaatctaaaccattttttgtctttt
gaatggcagatgcctttatgattctttattccatttcagGGCATTTGCATCAAATGGAAAAAACCATCTCAAAGACTGGAGGGTGACTTGAATACAATTCCTATTTTCTTGGAAAATTGCCAGTATAACAATTAAGTCCTTGCAATGGATGGTTGAGAGTTTGATTAGTATTGGCTTTTGTCTATGGTCTGTACAATTTT
AGCAGCTAATGCAATTCGCTGTTAAATTTTGTTTTTGTCTACCATGTATGCCTTGACCAATGTACTATGACAAGGTGGTCTTTATCCACAAGGCTTCAGCCATGGAGATAAAATGTAATCCATAATTATTTTGGACTAGGATGATTTAGAGACTAACCTCAGGCTGTACCAGAGGCACACAAATAAAACAATAATGCATA
ATCCATTGCTGCATATAAATCTCCAAAATGACTAAACAGCGATGTAATTTATTGATAATTTCGTTTCTAGTATATTTGAAAGTATTCTC