sp|Q3E6Q1|PPR32_ARATH ----> Pentatricopeptide repeat-containing protein At1g11290, chloroplastic
Intron 1 GTGAGTGCTC ... GTCATTGTAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 49.15 | 15 | 10 | 19 |
| A2 | 41.67 | 21 | 20 | 10 |
| A3 | 39.39 | 10 | 9 | 4 |
| A4 | 20.75 | 21 | 9 | 2 |
| A5 | 33.33 | 8 | 5 | 3 |
| A6 | 38.46 | 4 | 3 | 2 |
| A7 | 32.65 | 33 | 18 | 14 |
| A8 | 24 | 19 | 6 | 6 |
| A9 | 30.23 | 30 | 14 | 12 |
| A10 | 35 | 26 | 13 | 15 |
>TRINITY_DN108789_c6_g9_i4 from sample A2 / Example spliced isoformCAAGACGTTTTCATAGGAACCAAACTGGTAAATGGATATGCCAAATATGGTAGTATAGTATATGCGCGCCAAGTGTTTGACAAAATGCCAACGAGAGATCTGGTCTTGTGGACTGCAATGATTTCAGGGTACGCGCAGAATAGTCATCCCACCGAGGCCTTGTCACTGTTTCATCAGATGCAATTGGCAGGCATCATGCC
TGATCAAGTCACCGTGGGACTGCGTTAATAGACATGTATGCAAAATGCGGGAGCGTGGAGGTTGCACGACAACTGTTTGACAAAATGCCTGAGAGAAATATAGTCTCATGGAATGCGATGATTGCTGGGTATGCAGAGAGTGAACAATTCAAAGATACTCTGGAAATTTTCAATCTAATGCAGCTGGCAGGGGTGAAGCC
GAACTCAATCACTATGCTTGGCATGCTCTCAGTGTGCAGCCGGTTGCGAACTCCAAAACAAGGTAAGAGTATCCATCGGTTCATCATTAGAGAGGGATATGAGTCGGACATTGCTATGGGAACTTCACTTATAGATATGTATGCAAAATGTGGGTGTTTAGATACTGCTCGCCAAGTGTTTGACAAGATGTATAAGCGAA
ATGTGGTTTCTTGGAGTGCAATGATTGCTGGGTATGTGCAGAATGGGCATGCCAATGAGGCCTTAACCCTCTTTGATCAAATGCAACTTACTGGTGTGAAACCCAATCCAGTCACTATGCTAAGTGTACTCTCGGCATGTACCCAGTTAGGAGCTCTGCGTAAAGGTAAGTGTATACATGACCATATAAATGGAGCTGGT
TTTGAGTCTGATGTTTCTGTACAGAATTGCCTTATAGATATGTATGCCAAATGTGGCTATTCAGTGTTTGCACGTCGGGTGTTTGACAACATGCTTCTTAGAAATGTTGTCTCCTGGAATGTAATGATTGCGGGTTATACCAATAATGAATGCAGTGAGGAGGCTTTAAAACTCTTTTGTGAAATGCAAGTAGCAGGTAT
AAAACCTACTTCAACCACCATCCTGAGTGTTCTCCATGCCTGTGCCCAATTGTCAGCTTTGCTAAAAGGCATGGAACTCCACAATTATGCAATAAGAAATGGGTTTGAATCAAACGTCAAAGTAGGGAGTGCCCTTATAGACATGTATGGCAAATGTGGGAATGTAGATATTGCATACCGTGTGTTCAATAAAATGTCTC
AGAGAAATTTGGTCTCATGGAATGCCATGATTGCAGGATTTACCCAAGATGGTGATGTTACTGAGGTATTCAGACTTGTCTATCAAATGCAATTGTCAGGCATGAGACCAGACTCATTCACAATTGTAAGTGTTCTCCAAATGTGTGTACAGTTAGAAGTTCTACAAAAGGGCAAAGAAATCCATAAGGACATCGTTGGA
ACCGAATTTGAGTGGGACGCTCATGTGGGTAATGCCCTTATACACATGTATGCAAAATGTGGGAGTATAGAGGATGCACGCCAAGTATTTGACAAAATGTCTGAACGGAATTTAGTTTCTTGGACATCCA
>TRINITY_DN108789_c6_g9_i2 from sample A2 / Example unspliced isoform:CAAGACGTTTTCATAGGAACCAAACTGGTAAATGGATATGCCAAATATGGTAGTATAGTATATGCGCGCCAAGTGTTTGACAAAATGCCAACGAGAGATCTGGTCTTGTGGACTGCAATGATTTCAGGGTACGCGCAGAATAGTCATCCCACCGAGGCCTTGTCACTGTTTCATCAGATGCAATTGGCAGGCATCATGCC
TGATCAAGTCACCGTGgtgagtgctctctctgcttgtgccaatttagggcttctgccacaaggcaagtggattcatacctatataatgagacgtggatttgaattgggtgtcattgtagGGACTGCGTTAATAGACATGTATGCAAAATGCGGGAGCGTGGAGGTTGCACGACAACTGTTTGACAAAATGCCTGAGAGAA
ATATAGTCTCATGGAATGCGATGATTGCTGGGTATGCAGAGAGTGAACAATTCAAAGATACTCTGGAAATTTTCAATCTAATGCAGCTGGCAGGGGTGAAGCCGAACTCAATCACTATGCTTGGCATGCTCTCAGTGTGCAGCCGGTTGCGAACTCCAAAACAAGGTAAGAGTATCCATCGGTTCATCATTAGAGAGGGA
TATGAGTCGGACATTGCTATGGGAACTTCACTTATAGATATGTATGCAAAATGTGGGTGTTTAGATACTGCTCGCCAAGTGTTTGACAAGATGTATAAGCGAAATGTGGTTTCTTGGAGTGCAATGATTGCTGGGTATGTGCAGAATGGGCATGCCAATGAGGCCTTAACCCTCTTTGATCAAATGCAACTTACTGGTGT
GAAACCCAATCCAGTCACTATGCTAAGTGTACTCTCGGCATGTACCCAGTTAGGAGCTCTGCGTAAAGGTAAGTGTATACATGACCATATAAATGGAGCTGGTTTTGAGTCTGATGTTTCTGTACAGAATTGCCTTATAGATATGTATGCCAAATGTGGCTATTCAGTGTTTGCACGTCGGGTGTTTGACAACATGCTTC
TTAGAAATGTTGTCTCCTGGAATGTAATGATTGCGGGTTATACCAATAATGAATGCAGTGAGGAGGCTTTAAAACTCTTTTGTGAAATGCAAGTAGCAGGTATAAAACCTACTTCAACCACCATCCTGAGTGTTCTCCATGCCTGTGCCCAATTGTCAGCTTTGCTAAAAGGCATGGAACTCCACAATTATGCAATAAGA
AATGGGTTTGAATCAAACGTCAAAGTAGGGAGTGCCCTTATAGACATGTATGGCAAATGTGGGAATGTAGATATTGCATACCGTGTGTTCAATAAAATGTCTCAGAGAAATTTGGTCTCATGGAATGCCATGATTGCAGGATTTACCCAAGATGGTGATGTTACTGAGGTATTCAGACTTGTCTATCAAATGCAATTGTC
AGGCATGAGACCAGACTCATTCACAATTGTAAGTGTTCTCCAAATGTGTGTACAGTTAGAAGTTCTACAAAAGGGCAAAGAAATCCATAAGGACATCGTTGGAACCGAATTTGAGTGGGACGCTCATGTGGGTAATGCCCTTATACACATGTATGCAAAATGTGGGAGTATAGAGGATGCACGCCAAGTATTTGACAAAA
TGTCTGAACGGAATTTAGTTTCTTGGACATCCA