NA ----> NA


Intron 1 GTATGGTTTA ... TGTGATGTAG

Found issues: Low number of reads   


SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A133.33101
A20100
A333.33404
A4-1000
A5-1000
A620210
A786.671.39.36
A837.5515
A973.330.71.71
A1050120



>TRINITY_DN6889_c0_g1_i1 from sample A6 / Example spliced isoform
GTCAAACCAAGAGATATCATTGGAGCAAGGTGGAATTTCGGGGAGATCTGGAGCTGCCCGTTCCTCTTGGTAGATTCAAAGCTGCAGATGTAGGCCCCATGAGGCTACCTCAGAGGACAAGACCGAGGCGGGATTAGCCAGCTTGTAGAGCTAGACCTGCTATTGGAGGAGTAGGTGTTGCTGAGTGTGGTCTTGGCGGA
GTTGCGACATGTGGGGTAACTTTTGGGGACTAGATGGCGGTTTTGGTAGCTGATTTGGAGAGGAGGCTTGGTGGGATGACCATTGGATTTAATGAGCGAGACTAGTCAACCTTGATGATGATGAGCAACGAGTTTCATTTGATTTCCACATAGCACAAGAGGTGCATGGAGGAGCAGTTCCTCCTCTATGACAGCGACCA
CGGCGGGGACTAGAGCCAGCGCGAGGGGAGGATGTATGTCCACTGGCCATTTTGGGTCCCCTAGATCCACCGACTGGTAGGGCGGATTGATGTTATGTAGGGCTCTGAGCCCCAATTTTGTAGATATACATTTTGATGGGCCTATGGGAGGCGTTTTTTATGTATCCCCCATAAGGCTACTATGTATATGCCCCAGGAGG
GCCATTTTTTGTATATGACACATATTTTTTGATGATATATATATATATATATATACCATTTTGGCGGA


>TRINITY_DN6889_c0_g1_i2 from sample A6 / Example unspliced isoform:
GTCAAACCAAGAGATATCATTGGAGCAAGGTGGAATTTCGGGGAGATCTGGAGCTGCCCGTTCCTCTTGGTAGATTCAAAGCTGCAGgtatggtttactagttttgtacttgtcacatatatatttgtacatattgtttatgtctgcactttgatgatatatatgtttatctggtacttatgatggtttgttgctctgtg
atgtag
ATGTAGGCCCCATGAGGCTACCTCAGAGGACAAGACCGAGGCGGGATTAGCCAGCTTGTAGAGCTAGACCTGCTATTGGAGGAGTAGGTGTTGCTGAGTGTGGTCTTGGCGGAGTTGCGACATGTGGGGTAACTTTTGGGGACTAGATGGCGGTTTTGGTAGCTGATTTGGAGAGGAGGCTTGGTGGGATGACC
ATTGGATTTAATGAGCGAGACTAGTCAACCTTGATGATGATGAGCAACGAGTTTCATTTGATTTCCACATAGCACAAGAGGTGCATGGAGGAGCAGTTCCTCCTCTATGACAGCGACCACGGCGGGGACTAGAGCCAGCGCGAGGGGAGGATGTATGTCCACTGGCCATTTTGGGTCCCCTAGATCCACCGACTGGTAGG
GCGGATTGATGTTATGTAGGGCTCTGAGCCCCAATTTTGTAGATATACATTTTGATGGGCCTATGGGAGGCGTTTTTTATGTATCCCCCATAAGGCTACTATGTATATGCCCCAGGAGGGCCATTTTTTGTATATGACACATATTTTTTGATGATATATATATATATATATATACCATTTTGGCGGA