sp|Q9MAT6|HMG15_ARATH ----> High mobility group B protein 15

Intron 1 GTTTATGCTT ... ACTTTGACAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	20.82	451.8	71	166.6
A2	21.44	244	33	100.2
A3	19.38	319	40	113.4
A4	19.87	260.8	42	87.3
A5	20.73	143	41	33.8
A6	18.89	297	31.5	106.8
A7	17.91	747	96.5	229.5
A8	18.16	660	70.5	222.2
A9	16.52	768	100	203.8
A10	18.06	741.9	102	224.9

>TRINITY_DN135973_c2_g1_i3 from sample A1 / Example spliced isoform

AATATAGAGATCAAATCCGAGTTGAGGGACATGGCTCTTCAGCTTAGTTCTGTTTTGATTGCAATGCAATATTTCTTGGAGCGTCAATGTTTGTTAAAATGCACACGGCAACTTCTCATGTACAAGTCTCCTCCGTATGCTGTAAGTCCCTTTCCTCAGTCACCAGATAATGGATCTGCCCATCCTGGTTCAAACGAAAA
GCAACCAGAATTCAAGAAGCGAAAGATGAAAAGTTGTCCCTTGCCCTCGCCAATTGTTGGAGTTGATCCCACATCTTCAGTGGATCAACCTGTAACAGGAGTTATTGATGGGAAGTTTGATTATGGTTACCTTGCAACTGTAAAGTTGGGTTCAGATATATTAAGAGGAGTATTGTATCACAAACCAACTGAAATTTCAG
GGGCACAGTTTGCAGGTGTTTCTTGTTTGCAAGACAGCAGTGTTTTTGATAGCTGCAGCTTCAGAAATCAGTACTTGCCGGAAGAAGAAAAAGGACTGACTCAAAAAGAGGGATCCTGATCATCCATAGCCAAACAAGAGTGGTTACAATTTTTTTTTTGTTGAGCAACATGCATGGCTGAAGGCATTGCATCCTGCCAA
GGATAGAGAGATCAGCAAAATGATTGGGGAGTTGTGGAATAAACTCAATGAAGATGAAAGACTGGTTTATCAAGATTTTGGATTGAAGGACAAGGAAAGGTACAAAAGGGAAATGCAAGAGTATAAATAAAGACTGACGGTTCAGCCTAACACAAATGAAGTTTTGAAACAACAATTCACCAAAATTCCAGTGATCACAG
GATGGACTACCCATTATCCATTGGAGCATCACCAAAATTTGCTGACGTTGATGTTAAGATACTGTCAATTCAATCTGGTACAGCAGACATCAATATTTCAGCAGAAAAAAAATCTTCTAAGTTCTAACCAAGAAAATGATTACAAGGAGTCCATCTTGAAGCAATAAGCTTACTGTTGAGGAGCTTCATTTCTCTTCTAC
CTGTTGACAATCACCATGTAGTAGGACCAATTATTTTTGGCAATGGAATGCACAAACTGTGCTCTCTATCCCGGCTCAGCTGATTTTATGATACTGTAATGACCAATCAACATTTCCATATTTTATGATACTGTAATGCAAATATTATTATATGTTATTTCAATTACAAAATTATTGTGATCATTAGTTGTCAAGTCAGT
TGTCATCTTTGACTGGCATGGTTTTACAAGCCATTATGGTTTTCTACATGCTGTAATGTTTACTATTTAAATGATTCTGAATTGCACATGAATTGTAAGATATTTGATGGCTTTAAACATTGAGAGAGTAGCTACGTAGGAGTTTAACATATACATATACTAAACCTAAAATGCACCCCTGAAATCTAGGCTTCTCTTTT
GGTTGGATTTGAGGGACAAATTTCTCACTTGGAGTATTCTCCAAAACAGAACTTCTTTGACACCTTCCATACCTTACCATTCAAAACTGGATATAAATGGATCAGATTTGAGGGGTCTTTTCTACGCAGATCTAAGCACTTAGGATATTCCTAGCCCTGTATTACCTTGTGAATGAGTGATGAGGTCAGAAATTATAGCT
TGGACAACTCCCTGTAGCATTGGTTGTTGTTCAAAGGGAGTCATGTCCTCAAGGGAGTCATATAGGTTGCAACTGAATGACTACAGTGACCTTGCCCATTAGAGCAAGCATATGTGTGCCCTGTTTCTTTTTGGAATTCATATAGGAAATGTTCAAAGGGATAATCTGATCCCAAATACATTTATCATGCAGATCTTGGA
CCATTGTACTTTTGACCATGGTTTGCTTCATATCCAAAACAGATCATTCTACTAAACGTGATTAGGTTTTAAGGTAAATTTCATGTTAGTTTTCTCCTGGAAATTAGCTGATGGTTGTCCTTAATAAAAGTGGACCAACATCAATGCTATCCTCGTGACAGAATTGATTCTGAAGGTTTGCAGTACAGTCTTCTTATGGA
AATAAAGTGACATTTCTTATGGCATAGAATGCATCAATAGTCTCTTGTAATGGAGGACATCGGATGTATATTGGAGGGTTTGCTAGATTTTGAACTAATATCACATATGACAGCAATGTTGAACTACCATGATATCATGATTTGGTTTTCTTTGCAATTATGAAATCCTAGATTCACTGAGTCATTGACACAAGAGAGGA
GGGCCATTAGAGGAGAGTTAACTTGGAAGTGCAACTCTCTAAAATGATGAAACTATATCTTTTGAATGCTAATTTGGGCGATATACTTATCATAACATTGCAAGGTGCAATTGTTGATTATAGAAACAAAGAAAAACATTTATATGATGAATTCCTTGTAGAACTCTTTTTTCCAAGACATCCTGTGTGAAGTTGCTCTT
GTGTAAAGCATCCAAACTATTGTCGTTACAATGTTCATTGAAGTATCCACTTCTATTGCCATTACTCCTATTAAAGTGGAGTGAATTAGACTTTCCATTAAAGTTTGAAAAGGAAGGGCCAGCCTTTCTATTTGACACCAGTATGTAATATCTCGACTCTCATTTGTAAATATTGGTTAAGATTTGCAATATTCGGGATA
TAAACTTGTATTCTAGGTAGAAAAAAAAGCATGACTTAGAAACACTCTTTGTCATTTAGTTAATGCTCTGTGTAAATTGTTCAAAGTTCTTTGTCATTTATTCAATAGTTAGCATAAGTAAAAATATTCAGTTTTCAGTACACTTTATGCAGATTCAGATGAGTTTGTACAATTGGTGCAAATTGGACATTTAGATATGG
GATACCCTAATGTACAACCACCTCTCTTTCCTTTCCTTTCCTTCCGGACTTGCAACCACATTCAATTCTTTCTAAGGTCCACCCAGCAGCCCCACCTGAAACAACTTGTGTGTCACCAGAATGAAACTCATCGGGCTTGTGAGATATGAAGGACCAATAATATGTAGCTATCTTTGGCATGTAGTCTGCAAAATTCTTGC
TCCTAGAAAGTAGGAGAACTACCAAAAATATCAAGTGCTCGAAATCTTACAAAACTCAATGTGTAGCAGGTTCTAGTCAGTGTAAAACCCTGGATGTACCTATAACAAGACTGGCATGATGAAAATATGCATCATTAATAACTGCATATTTAAAATAAATGTTGTTTTCATGGTTTGATGTAACTATAAATGTGATATGC
AGATAAAACATCGAAAAAAGAGTGATTGTATGCATCACATATTAGAACAACTTCCAATCTAAATACAAACGCGCACTGCACATTTTAAATCTCATACATGTTATAATACATATAAAAGCAGGTTTCAAATGTAAGCTTGAAACTCTTATCCCAATGTATGAATGCTTGAGTAGGAGAATGGATTAAAAACTATTACATCT
GGTGATAACTTTTTTCAAAATAAGACTACTGCACTGCTGTGATTGACGGTTCACTGCTGTTGTAAGTTCTGGAGCAGGTTATTTCAGGATTCTTTGATCCTCGTTAATCATAAAAGGGCTATATCCATTTTCAGGCCTAGAAATGCCACTCTTCCAAAGGATCTTCTTACACAGGACAACAAAAAATTCATTCCACTTCT
CATTTGCTTGCTGGCCAGTTGTGTGCCAAAGAGGCTGTTCAGTCCTTGTAATATGCCATGAATACTCATTGCTGGGAAACACTCCTCCAAGGATCTATCACCATGCACATACATCGTGATCTGTTTGGAGATCAGCATTAGGATCTACACCATCAATTTGTGCAGTTGTTACAGGTCTGAAAATAG

>TRINITY_DN135973_c2_g1_i2 from sample A1 / Example unspliced isoform:

AATATAGAGATCAAATCCGAGTTGAGGGACATGGCTCTTCAGCTTAGTTCTGTTTTGATTGCAATGCAATATTTCTTGGAGCGTCAATGTTTGTTAAAATGCACACGGCAACTTCTCATGTACAAGTCTCCTCCGTATGCTGTAAGTCCCTTTCCTCAGTCACCAGATAATGGATCTGCCCATCCTGGTTCAAACGAAAA
GCAACCAGAATTCAAGAAGCGAAAGATGAAAAGTTGTCCCTTGCCCTCGCCAATTGTTGGAGgtttatgcttcatttgtttgcattactatgctttgcaatgacaattcatttatattgtaacattttgttgcttatggactgacaccacttgaccttttctgtccactttgacagTTGATCCCACATCTTCAGTGGATC
AACCTGTAACAGGAGTTATTGATGGGAAGTTTGATTATGGTTACCTTGCAACTGTAAAGTTGGGTTCAGATATATTAAGAGGAGTATTGTATCACAAACCAACTGAAATTTCAGGGGCACAGTTTGCAGGTGTTTCTTGTTTGCAAGACAGCAGTGTTTTTGATAGCTGCAGCTTCAGAAATCAGTACTTGCCGGAAGAA
GAAAAAGGACTGACTCAAAAAGAGGGATCCTGATCATCCATAGCCAAACAAGAGTGGTTACAATTTTTTTTTTGTTGAGCAACATGCATGGCTGAAGGCATTGCATCCTGCCAAGGATAGAGAGATCAGCAAAATGATTGGGGAGTTGTGGAATAAACTCAATGAAGATGAAAGACTGGTTTATCAAGATTTTGGATTGA
AGGACAAGGAAAGGTACAAAAGGGAAATGCAAGAGTATAAATAAAGACTGACGGTTCAGCCTAACACAAATGAAGTTTTGAAACAACAATTCACCAAAATTCCAGTGATCACAGGATGGACTACCCATTATCCATTGGAGCATCACCAAAATTTGCTGACGTTGATGTTAAGATACTGTCAATTCAATCTGGTACAGCAG
ACATCAATATTTCAGCAGAAAAAAAATCTTCTAAGTTCTAACCAAGAAAATGATTACAAGGAGTCCATCTTGAAGCAATAAGCTTACTGTTGAGGAGCTTCATTTCTCTTCTACCTGTTGACAATCACCATGTAGTAGGACCAATTATTTTTGGCAATGGAATGCACAAACTGTGCTCTCTATCCCGGCTCAGCTGATTT
TATGATACTGTAATGACCAATCAACATTTCCATATTTTATGATACTGTAATGCAAATATTATTATATGTTATTTCAATTACAAAATTATTGTGATCATTAGTTGTCAAGTCAGTTGTCATCTTTGACTGGCATGGTTTTACAAGCCATTATGGTTTTCTACATGCTGTAATGTTTACTATTTAAATGATTCTGAATTGCA
CATGAATTGTAAGATATTTGATGGCTTTAAACATTGAGAGAGTAGCTACGTAGGAGTTTAACATATACATATACTAAACCTAAAATGCACCCCTGAAATCTAGGCTTCTCTTTTGGTTGGATTTGAGGGACAAATTTCTCACTTGGAGTATTCTCCAAAACAGAACTTCTTTGACACCTTCCATACCTTACCATTCAAAA
CTGGATATAAATGGATCAGATTTGAGGGGTCTTTTCTACGCAGATCTAAGCACTTAGGATATTCCTAGCCCTGTATTACCTTGTGAATGAGTGATGAGGTCAGAAATTATAGCTTGGACAACTCCCTGTAGCATTGGTTGTTGTTCAAAGGGAGTCATGTCCTCAAGGGAGTCATATAGGTTGCAACTGAATGACTACAG
TGACCTTGCCCATTAGAGCAAGCATATGTGTGCCCTGTTTCTTTTTGGAATTCATATAGGAAATGTTCAAAGGGATAATCTGATCCCAAATACATTTATCATGCAGATCTTGGACCATTGTACTTTTGACCATGGTTTGCTTCATATCCAAAACAGATCATTCTACTAAACGTGATTAGGTTTTAAGGTAAATTTCATGT
TAGTTTTCTCCTGGAAATTAGCTGATGGTTGTCCTTAATAAAAGTGGACCAACATCAATGCTATCCTCGTGACAGAATTGATTCTGAAGGTTTGCAGTACAGTCTTCTTATGGAAATAAAGTGACATTTCTTATGGCATAGAATGCATCAATAGTCTCTTGTAATGGAGGACATCGGATGTATATTGGAGGGTTTGCTAG
ATTTTGAACTAATATCACATATGACAGCAATGTTGAACTACCATGATATCATGATTTGGTTTTCTTTGCAATTATGAAATCCTAGATTCACTGAGTCATTGACACAAGAGAGGAGGGCCATTAGAGGAGAGTTAACTTGGAAGTGCAACTCTCTAAAATGATGAAACTATATCTTTTGAATGCTAATTTGGGCGATATAC
TTATCATAACATTGCAAGGTGCAATTGTTGATTATAGAAACAAAGAAAAACATTTATATGATGAATTCCTTGTAGAACTCTTTTTTCCAAGACATCCTGTGTGAAGTTGCTCTTGTGTAAAGCATCCAAACTATTGTCGTTACAATGTTCATTGAAGTATCCACTTCTATTGCCATTACTCCTATTAAAGTGGAGTGAAT
TAGACTTTCCATTAAAGTTTGAAAAGGAAGGGCCAGCCTTTCTATTTGACACCAGTATGTAATATCTCGACTCTCATTTGTAAATATTGGTTAAGATTTGCAATATTCGGGATATAAACTTGTATTCTAGGTAGAAAAAAAAGCATGACTTAGAAACACTCTTTGTCATTTAGTTAATGCTCTGTGTAAATTGTTCAAAG
TTCTTTGTCATTTATTCAATAGTTAGCATAAGTAAAAATATTCAGTTTTCAGTACACTTTATGCAGATTCAGATGAGTTTGTACAATTGGTGCAAATTGGACATTTAGATATGGGATACCCTAATGTACAACCACCTCTCTTTCCTTTCCTTTCCTTCCGGACTTGCAACCACATTCAATTCTTTCTAAGGTCCACCCAG
CAGCCCCACCTGAAACAACTTGTGTGTCACCAGAATGAAACTCATCGGGCTTGTGAGATATGAAGGACCAATAATATGTAGCTATCTTTGGCATGTAGTCTGCAAAATTCTTGCTCCTAGAAAGTAGGAGAACTACCAAAAATATCAAGTGCTCGAAATCTTACAAAACTCAATGTGTAGCAGGTTCTAGTCAGTGTAAA
ACCCTGGATGTACCTATAACAAGACTGGCATGATGAAAATATGCATCATTAATAACTGCATATTTAAAATAAATGTTGTTTTCATGGTTTGATGTAACTATAAATGTGATATGCAGATAAAACATCGAAAAAAGAGTGATTGTATGCATCACATATTAGAACAACTTCCAATCTAAATACAAACGCGCACTGCACATTTT
AAATCTCATACATGTTATAATACATATAAAAGCAGGTTTCAAATGTAAGCTTGAAACTCTTATCCCAATGTATGAATGCTTGAGTAGGAGAATGGATTAAAAACTATTACATCTGGTGATAACTTTTTTCAAAATAAGACTACTGCACTGCTGTGATTGACGGTTCACTGCTGTTGTAAGTTCTGGAGCAGGTTATTTCA
GGATTCTTTGATCCTCGTTAATCATAAAAGGGCTATATCCATTTTCAGGCCTAGAAATGCCACTCTTCCAAAGGATCTTCTTACACAGGACAACAAAAAATTCATTCCACTTCTCATTTGCTTGCTGGCCAGTTGTGTGCCAAAGAGGCTGTTCAGTCCTTGTAATATGCCATGAATACTCATTGCTGGGAAACACTCCT
CCAAGGATCTATCACCATGCACATACATCGTGATCTGTTTGGAGATCAGCATTAGGATCTACACCATCAATTTGTGCAGTTGTTACAGGTCTGAAAATAG

Intron 2 GTATGTTGAG ... TGAATTACAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	52.51	123	31	136
A2	55.62	75	19	94
A3	56.78	86	23	113
A4	48.74	61	24	58
A5	48.48	51	19	48
A6	51.14	86	11	90
A7	53.63	217	33	251
A8	53.43	197	39	226
A9	51.21	202	14	212
A10	52.29	240	27	263

>TRINITY_DN120489_c4_g1_i6 from sample A3 / Example spliced isoform

ATTCATGGTCCCAACTATTGGAGGCAAGGAACTGGATTTGCATCTTCTCTATGTTGAGGTTACAGCTCGTGGTGGCCTTGATCAGGTAATTAAAGACCGAAAATGGAAGAAAATAACTTGTGTATTCAACTTTGCTCCAACTACCACCAGTGCATCATTTGTCTTGCGGAAATACTATATTGCCCTGCTTCGTTATTATG
AACATGTTTACTTCTTTCAAGCACAGGGTCAGCTTCCTGCTGCTCCTCCGTATGCTGTAAGTCCTGTTCCTCAGTCACCAGATAATGGATCTGCCCATCCTGGTTCAAACGAAAAGCAACCAGAATTCAAGAAGCGAAAGATGAAAAGTTGTCCCTTGCCCTCGCCAATTGTTGGAGTTGATCCCACATCTTCAGTGGAT
CAACCTGTAACAGGAGTTATTGATGGGAAGTTTGATTATGGTTACCTTGCAACTGTAAAGTTGGGTTCAGATATATTAAGAGGAGTATTGTATCACAAACCAACTGAAATTTCAGGGGCACAGTTTGCAGGTGTTTCTTGTTTGCAAGACAGCAGTGTTTTTGATAGCTGCAGCTTCAGAAATCAGTACTTGCCGGAAGA
AGAAAAAGGACTGACTCAAAAAGAGGGATCCTGATCATCCATAGCCAAACAAGAGTGGTTACAATTTTTTTTTTGTTGAGCAACATGCATGGCTGAAGGCATTGCATCCTGCCAAGGATAGAGAGATCAGCAAAATGATTGGGGAGTTGTGGAATAAACTCAATGAAGATGAAAGACTGGT

>TRINITY_DN120489_c4_g1_i10 from sample A3 / Example unspliced isoform:

CTTGTGGTGGCGGAGCAACACTTGTAGAACTATCTATAGTAGGATAGTAGGATAGCAACACTTGTGGTGGCGGAGCAGCTGCAAGTTTTTTTTCCTAAGCTTCATATTGTTCCATGGTAGTATGTGATGTAAGCTTTGTAGCATGTGGGAAATTGTCTGAAACATACTCTTGTTGGTAGGTAATTAAAGACCGAAAATGG
AAGAAAATAACTTGTGTATTCAACTTTGCTCCAACTACCACCAGTGCATCATTTGTCTTGCGGAAATACTATATTGCCCTGCTTCGTTATTATGAACATGTTTACTTCTTTCAAGCACAGGGTCAGCTTCCTGCTGgtatgttgagtattcagtctattacaccattttatagcaaatcagacctgaaatacttttatct
aattactgttatgatgaattacagCTCCTCCGTATGCTGTAAGTCCCTTTCCTCAGTCACCAGATAATGGATCTGCCCATCCTGGTTCAAACGAAAAGCAACCAGAATTCAAGAAGCGAAAGATGAAAAGTTGTCCCTTGCCCTCGCCAATTGTTGGAGTTGATCCCACATCTTCAGTGGATCAACCTGTAACAGGAGTT
ATTGATGGGAAGTTTGATTATGGTTACCTTGCAACTGTAAAGTTGGGTTCAGATATATTAAGAGGAGTATTGTATCACAAACCAACTGAAATTTCAGGGGCACAGTTTGCAGGTGTTTCTTGTTTGCAAGACAGCAGTGTTTTTGATAGCTGCAGCTTCAGAAATCAGTACTTGCCGGAAGAAGAAAAAGGACTGACTCA
AAAAGAGGGATCCTGATCATCCATAGCCAAACAAGAGTGGTTACAATTTTTTTTTTGTTGAGCAACATGCATGGCTGAAGGCATTGCATCCTGCCAAGGATAGAGAGATCAGCAAAATGATTGGGGAGTTGTGGAATAAACTCAATGAAGATGAAAGACTGGTAAGATAAGTGTCTGATGAGCATTTGGTCTCTCTAAGA
ATCTTGCAAATGAGGCATAGACAAAATTCTTTTATGTTATTATTACGTGAATTTATGGGGCTTATTGGGCATAATTTCTTGCAATAGCAGGCATCAGGATATAGCTTAGGATTTTGCCTTATGATTGCAGGTTTATCAAGATTTTGGATTGAAGGACAAGGAAAGGTACAAAAGGGAAATGCAAGAGTATAAATAAAGAC
TGACGGTTCAGCCTAACACAAATGAAGTTTTGAAACAACAATTCACCAAAATTCCAGTGATCACAGGATGGACTACCCATTATCCATTGGAGCATCACCAAAATTTGCTGACGTTGATGTTAAGATACTGTCAATTCAATCTGGTACAGCAGACATCAATATTTCAGCAGAAAAAAAATCTTCTAAGTTCTAACCAAGAA
AATGATTACAAGGAGTCCATCTTGAAGCAATAAGCTTACTGTTGAGGAGCTTCATTTCTCTTCTACCTGTTGACAATCACCATGTAGTAGGACCAATTATTTTTGGCAATGGAATGCACAAACTGTGCTCTCTATCCCGGCTCAGCTGATTTTATGATACTGTAATGACCAATCAACATTTCCATATTTTATGATACTGT
AATGCAAATATTATTATATGTTATTTCAATTACAAAATTATTGTGATCATTATTAGTTGTCAAGTCAGTTGTCATCTTTGACTGGCATGGTTTTACAAGCCATTATGGTTTTCTACATGCTGTAATGTTTACTATTTAAATGATTCTGAATTGCACATGAATTGTAAGATATTTGATGGCTTTAAACATTGAGAGAGTAG
CTACGTAGGAGTTTAACATATACATATACTAAACCTAAAATGCACCCCTGAAATCTAGGCTTCTCTTTTGGTTGGATTTGAGGGACAAATTTCTCACTTGGAGTATTCTCCAAAACAGAACTTCTTTGACACCTTCCATACCTTACCATTCAAAACTGGATATAAATGGATCAGATTTGAGGGGTCTTTTCTACACAGAT
CTAAGCACTTAGGATATTCCTGGCCCTGTATTACCTTGTGAATGAGTGATGAGGTCAG

Intron 3 GTAAGATAAG ... ATGATTGCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	17.06	487	100.2	110.6
A2	18.29	429	96	85.8
A3	16.77	412	83	95.8
A4	20.19	328	83	64.8
A5	25.56	134	46	27.6
A6	12.19	686	95.2	165.4
A7	15.39	1792	326	461.6
A8	13.87	1941	312.6	532.4
A9	15.36	1647	299	402.8
A10	15.44	1427	260.6	347

>TRINITY_DN135973_c2_g1_i2 from sample A1 / Example spliced isoform

AATATAGAGATCAAATCCGAGTTGAGGGACATGGCTCTTCAGCTTAGTTCTGTTTTGATTGCAATGCAATATTTCTTGGAGCGTCAATGTTTGTTAAAATGCACACGGCAACTTCTCATGTACAAGTCTCCTCCGTATGCTGTAAGTCCCTTTCCTCAGTCACCAGATAATGGATCTGCCCATCCTGGTTCAAACGAAAA
GCAACCAGAATTCAAGAAGCGAAAGATGAAAAGTTGTCCCTTGCCCTCGCCAATTGTTGGAGGTTTATGCTTCATTTGTTTGCATTACTATGCTTTGCAATGACAATTCATTTATATTGTAACATTTTGTTGCTTATGGACTGACACCACTTGACCTTTTCTGTCCACTTTGACAGTTGATCCCACATCTTCAGTGGATC
AACCTGTAACAGGAGTTATTGATGGGAAGTTTGATTATGGTTACCTTGCAACTGTAAAGTTGGGTTCAGATATATTAAGAGGAGTATTGTATCACAAACCAACTGAAATTTCAGGGGCACAGTTTGCAGGTGTTTCTTGTTTGCAAGACAGCAGTGTTTTTGATAGCTGCAGCTTCAGAAATCAGTACTTGCCGGAAGAA
GAAAAAGGACTGACTCAAAAAGAGGGATCCTGATCATCCATAGCCAAACAAGAGTGGTTACAATTTTTTTTTTGTTGAGCAACATGCATGGCTGAAGGCATTGCATCCTGCCAAGGATAGAGAGATCAGCAAAATGATTGGGGAGTTGTGGAATAAACTCAATGAAGATGAAAGACTGGTTTATCAAGATTTTGGATTGA
AGGACAAGGAAAGGTACAAAAGGGAAATGCAAGAGTATAAATAAAGACTGACGGTTCAGCCTAACACAAATGAAGTTTTGAAACAACAATTCACCAAAATTCCAGTGATCACAGGATGGACTACCCATTATCCATTGGAGCATCACCAAAATTTGCTGACGTTGATGTTAAGATACTGTCAATTCAATCTGGTACAGCAG
ACATCAATATTTCAGCAGAAAAAAAATCTTCTAAGTTCTAACCAAGAAAATGATTACAAGGAGTCCATCTTGAAGCAATAAGCTTACTGTTGAGGAGCTTCATTTCTCTTCTACCTGTTGACAATCACCATGTAGTAGGACCAATTATTTTTGGCAATGGAATGCACAAACTGTGCTCTCTATCCCGGCTCAGCTGATTT
TATGATACTGTAATGACCAATCAACATTTCCATATTTTATGATACTGTAATGCAAATATTATTATATGTTATTTCAATTACAAAATTATTGTGATCATTAGTTGTCAAGTCAGTTGTCATCTTTGACTGGCATGGTTTTACAAGCCATTATGGTTTTCTACATGCTGTAATGTTTACTATTTAAATGATTCTGAATTGCA
CATGAATTGTAAGATATTTGATGGCTTTAAACATTGAGAGAGTAGCTACGTAGGAGTTTAACATATACATATACTAAACCTAAAATGCACCCCTGAAATCTAGGCTTCTCTTTTGGTTGGATTTGAGGGACAAATTTCTCACTTGGAGTATTCTCCAAAACAGAACTTCTTTGACACCTTCCATACCTTACCATTCAAAA
CTGGATATAAATGGATCAGATTTGAGGGGTCTTTTCTACGCAGATCTAAGCACTTAGGATATTCCTAGCCCTGTATTACCTTGTGAATGAGTGATGAGGTCAGAAATTATAGCTTGGACAACTCCCTGTAGCATTGGTTGTTGTTCAAAGGGAGTCATGTCCTCAAGGGAGTCATATAGGTTGCAACTGAATGACTACAG
TGACCTTGCCCATTAGAGCAAGCATATGTGTGCCCTGTTTCTTTTTGGAATTCATATAGGAAATGTTCAAAGGGATAATCTGATCCCAAATACATTTATCATGCAGATCTTGGACCATTGTACTTTTGACCATGGTTTGCTTCATATCCAAAACAGATCATTCTACTAAACGTGATTAGGTTTTAAGGTAAATTTCATGT
TAGTTTTCTCCTGGAAATTAGCTGATGGTTGTCCTTAATAAAAGTGGACCAACATCAATGCTATCCTCGTGACAGAATTGATTCTGAAGGTTTGCAGTACAGTCTTCTTATGGAAATAAAGTGACATTTCTTATGGCATAGAATGCATCAATAGTCTCTTGTAATGGAGGACATCGGATGTATATTGGAGGGTTTGCTAG
ATTTTGAACTAATATCACATATGACAGCAATGTTGAACTACCATGATATCATGATTTGGTTTTCTTTGCAATTATGAAATCCTAGATTCACTGAGTCATTGACACAAGAGAGGAGGGCCATTAGAGGAGAGTTAACTTGGAAGTGCAACTCTCTAAAATGATGAAACTATATCTTTTGAATGCTAATTTGGGCGATATAC
TTATCATAACATTGCAAGGTGCAATTGTTGATTATAGAAACAAAGAAAAACATTTATATGATGAATTCCTTGTAGAACTCTTTTTTCCAAGACATCCTGTGTGAAGTTGCTCTTGTGTAAAGCATCCAAACTATTGTCGTTACAATGTTCATTGAAGTATCCACTTCTATTGCCATTACTCCTATTAAAGTGGAGTGAAT
TAGACTTTCCATTAAAGTTTGAAAAGGAAGGGCCAGCCTTTCTATTTGACACCAGTATGTAATATCTCGACTCTCATTTGTAAATATTGGTTAAGATTTGCAATATTCGGGATATAAACTTGTATTCTAGGTAGAAAAAAAAGCATGACTTAGAAACACTCTTTGTCATTTAGTTAATGCTCTGTGTAAATTGTTCAAAG
TTCTTTGTCATTTATTCAATAGTTAGCATAAGTAAAAATATTCAGTTTTCAGTACACTTTATGCAGATTCAGATGAGTTTGTACAATTGGTGCAAATTGGACATTTAGATATGGGATACCCTAATGTACAACCACCTCTCTTTCCTTTCCTTTCCTTCCGGACTTGCAACCACATTCAATTCTTTCTAAGGTCCACCCAG
CAGCCCCACCTGAAACAACTTGTGTGTCACCAGAATGAAACTCATCGGGCTTGTGAGATATGAAGGACCAATAATATGTAGCTATCTTTGGCATGTAGTCTGCAAAATTCTTGCTCCTAGAAAGTAGGAGAACTACCAAAAATATCAAGTGCTCGAAATCTTACAAAACTCAATGTGTAGCAGGTTCTAGTCAGTGTAAA
ACCCTGGATGTACCTATAACAAGACTGGCATGATGAAAATATGCATCATTAATAACTGCATATTTAAAATAAATGTTGTTTTCATGGTTTGATGTAACTATAAATGTGATATGCAGATAAAACATCGAAAAAAGAGTGATTGTATGCATCACATATTAGAACAACTTCCAATCTAAATACAAACGCGCACTGCACATTTT
AAATCTCATACATGTTATAATACATATAAAAGCAGGTTTCAAATGTAAGCTTGAAACTCTTATCCCAATGTATGAATGCTTGAGTAGGAGAATGGATTAAAAACTATTACATCTGGTGATAACTTTTTTCAAAATAAGACTACTGCACTGCTGTGATTGACGGTTCACTGCTGTTGTAAGTTCTGGAGCAGGTTATTTCA
GGATTCTTTGATCCTCGTTAATCATAAAAGGGCTATATCCATTTTCAGGCCTAGAAATGCCACTCTTCCAAAGGATCTTCTTACACAGGACAACAAAAAATTCATTCCACTTCTCATTTGCTTGCTGGCCAGTTGTGTGCCAAAGAGGCTGTTCAGTCCTTGTAATATGCCATGAATACTCATTGCTGGGAAACACTCCT
CCAAGGATCTATCACCATGCACATACATCGTGATCTGTTTGGAGATCAGCATTAGGATCTACACCATCAATTTGTGCAGTTGTTACAGGTCTGAAAATAG

>TRINITY_DN135973_c2_g1_i4 from sample A1 / Example unspliced isoform:

TAGCCAAACAAGAGTGGTTACAATTTTTTTTTTGTTGAGCAACATGCATGGCTGAAGGCATTGCATCCTGCCAAGGATAGAGAGATCAGCAAAATGATTGGGGAGTTGTGGAATAAACTCAATGAAGATGAAAGACTGgtaagataagtgtctgatgagcatttggtctctctaagaatcttgcaaatgaggcatagaca
aaattcttttatgttattattacgtgaatttatggggcttattgggcataatttcttgcaatagcaggcatcaggatatagcttaggattttgccttatgattgcagGTTTATCAAGATTTTGGATTGAAGGACAAGGAAAGGTACAAAAGGGAAATGCAAGAGTATAAATAAAGACTGACGGTTCAGCCTAACACAAAT
GAAGTTTTGAAACAACAATTCA