NA ----> NA
Intron 1 GTTTACAGTC ... CATGCTGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 42.86 | 2 | 1 | 2 |
| A2 | 50 | 1 | 0 | 2 |
| A3 | 69.23 | 2 | 3 | 6 |
| A4 | 41.67 | 7 | 1 | 9 |
| A5 | 36.36 | 7 | 2 | 6 |
| A6 | 63.64 | 2 | 4 | 3 |
| A7 | 51.11 | 11 | 9 | 14 |
| A8 | 56.1 | 9 | 8 | 15 |
| A9 | 35.14 | 12 | 4 | 9 |
| A10 | 40 | 12 | 8 | 8 |
>TRINITY_DN42097_c0_g1_i2 from sample A10 / Example spliced isoformGTCGGAATATGCTAGTACAAGATTTGTTGTACTTACGGGGAAGCCTGGAAGCCAACTCCCATAACTACCGCGTTCTTCGGGTGTTGTCTTCATTCGGTTGACTGGTCGATTGCCGTCACTGACTTTCTGCTAAAAAGCATCCATTCCCCAGTTAACACCACACCACTCCCCAATCACACTATTGGAAATTTGGAATCTTA
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GGTTGATGCACCAGTCACCCAGTCTTTAATTGTTTATATTCTTCTAGCTTTGATATATGGTGGTGTACTGCTATATCGTGGTAAAAAACTACAGGTTCCTTGGTATTGGTACATTTTATTGGCATTTGTTGATGTGGAAGGAAATTTTCTTGTTGTGAAGGCATATCAGTACACATCAATTACTAGCGTCACATTGTTGG
ACTGCTGGACCATCCCATGGGTTATGATTCTCACTTGTTTCTTTATCAAGACAAAATATACCCCGTGGCAGTTTGCTGGTGCTGTTATTTGTATTGTTGGGCTTGTTCTTGTTCTTTTCTCAGATGCGAGTACATCTGATTCAGGTGGAACCAAGCCAATTCTAGGTGACACTCTTGTTATTGCAGGAACTATTTTTTAT
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CACTGGCGTGCCATTCCTTCTAAAGATGACTGGAGCAACCCTTTTTAATCTGTCACTTTTGACTTCCGATATGTGGGCTATACTTATCCGCATATTTTTTTATCATAAAGCAGTTGATTGGTTATATTACGTTGCTTTTGGAGTTGTCGTTGTGGGCCTAACCATCTATTCAATCTATAGCGACAAAGAGAGCACTATTT
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TGTTTTATAGATATACCAAC
>TRINITY_DN42097_c0_g1_i3 from sample A10 / Example unspliced isoform:GTCGGAATATGCTAGTACAAGATTTGTTGTACTTACGGGGAAGCCTGGAAGCCAACTCCCATAACTACCGCGTTCTTCGGGTGTTGTCTTCATTCGGTTGACTGGTCGATTGCCGTCACTGACTTTCTGCTAAAAAGCATCCATTCCCCAGTTAACACCACACCACTCCCCAATCACACTATTGGAAATTTGGAATCTTA
AGAATGTTTGACATTCCGTCGAACAAGTCGGCTAAGCAAGTCGCTGAGGCTTAAAGgtttacagtctgttgggcaaatgaattaaccatatttagagctccctttaattatgttaaaagccttcaagcctgagtaatcttgcacatgctgcagAGTAAATTGGTGTAGGCTTTTTAAGCCATCATCAACTATGAACGAGC
ATCTATGGTACGTTCTTGGAGCTTTAGCTCTTGGTCAGCTGGTTTCGCTCAGCATGACCGGGGCCAGCTTCGCGTCTTCAGCATTGTCAGACAAAGGGGTTGATGCACCAGTCACCCAGTCTTTAATTGTTTATATTCTTCTAGCTTTGATATATGGTGGTGTACTGCTATATCGTGGTAAAAAACTACAGGTTCCTTGG
TATTGGTACATTTTATTGGCATTTGTTGATGTGGAAGGAAATTTTCTTGTTGTGAAGGCATATCAGTACACATCAATTACTAGCGTCACATTGTTGGACTGCTGGACCATCCCATGGGTTATGATTCTCACTTGTTTCTTTATCAAGACAAAATATACCCCGTGGCAGTTTGCTGGTGCTGTTATTTGTATTGTTGGGCT
TGTTCTTGTTCTTTTCTCAGATGCGAGTACATCTGATTCAGGTGGAACCAAGCCAATTCTAGGTGACACTCTTGTTATTGCAGGAACTATTTTTTATGCAATGAGTAATGTTGGTGAGGAGTTCTGTGTAAAGAAGAAAGATCGTGTCGAGGTTGTTGCAATGCTTGGTGTTTTTGGAGCACTCATAAGTACAATCCAAC
TTCTCATATTTGAGAGGAAGGAATTAGAAAGTTTGGACTGGTCTTACACTATTGTTCTACTCTTTCTTGGATTTGGACTATCAATGTTTGCATTCTACACTGGCGTGCCATTCCTTCTAAAGATGACTGGAGCAACCCTTTTTAATCTGTCACTTTTGACTTCCGATATGTGGGCTATACTTATCCGCATATTTTTTTAT
CATAAAGCAGTTGATTGGTTATATTACGTTGCTTTTGGAGTTGTCGTTGTGGGCCTAACCATCTATTCAATCTATAGCGACAAAGAGAGCACTATTTTAAATGTGAGCGAAAATGATCCAAGTGAAAGCATACCGTACACACATCTCAATCAAGAAAGGGATCTTAATATACCAGGCATAAATGTAACTCATGATTAGAA
AATCACTCTTTAGCCTGAGTGTCACAGCCATCATTATTGTTTTAGAGTATTCAACCTTTGAACAAATTCATTACAAAGAATATAATTAAGCTACAATTGTTTTATAGATATACCAAC