NA ----> NA

Intron 1 GTAGGGTGAT ... TTGTGTGCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	32.13	10	5	5
A2	64.95	4	6	9
A3	55.84	11	17	11
A4	83.55	2	11.5	10
A5	28.39	7	3	3
A6	82.64	1	4.5	6
A7	47.89	9	8	9
A8	82.07	2	10	9
A9	55.77	5	9	4
A10	31.23	20	8	11

>TRINITY_DN107435_c0_g1_i3 from sample A3 / Example spliced isoform

GTGGGTTGACAGCACAGCCAAGCCTTTATGGCTACACTGTGATGCTATCACGATTGTCCATTTGGACCGACGTATGTCAAGGGAGTCACAAGGGCTTAATACAAGTTTATACAGTCTGGAAATCATTTTCTTTGATGGTTTTGGTCTGTAAGCGAGAGAGAGAGAGAGCTGAACTCTGCTATTCCAAGCGTCCTTGGGGT
TTTTCGAAAGTGTTTATGCTGTCATACTATTGAATGGTTCCACTTGGTTAGTTGGAATCCACACCGTTGTTGGTCGATATTGAAATGCGACCTCAGTGAGCAAGACTCTGCTCTTACCAGGCATTTTCCCTTTTTTTTTAGTATTGGGTAATGTAGTTACGTCTGTGACTGATGTTATTTTCTCCTGGATATTATTTGAG
GTCTTTACAAGGATTGGGGGTGGTCTCCAGTCGATTGCAGCGAAGGGGACTCGTACACACAAACGTCCTTGTTCTATCCAAGAAAGGTAGCGGGAGTGATAAGGGTTTATGAGGAGGAGATGACCTCAAGTTTTGTAAAGTTTAAAGAACAGGTGAAGGGCGTTAGGAAACGAAGATGGCACTTAAAAGTTGTTCTGGGG
TGCTCCGAGGGTTTCCAGCCTCAGCTCTTAAAGATAAGTAAATTTTACAAGAAGAATAAAACATCAAGGGTTTAACCCACAATAGGGGTTTCTCTATACCTGTATTTAATTGTATCTACGATGTATGTTTAGTGTTTTATTAAATATAAACTAGAATACTTTAGAAGAAAAAGAGGCCATAGTAGATGGCTGTAAAAGTT
GTAACCCTGGTCGTGACTGTAATCACGAAGGGTTTTAAGTCTCTATAACTTCTTCACAAGAGTGATTGAGTTTAATGGGAGAAGGAATGGGGACAATCCCCAGGGTTTCGAATTCTTCTACCCAGATTGGTAAATGAGTTTGTATGGGTCTTGCAGTTTATAATTTAAATAAGCATTTAATTAAACGCTCCTAGGTCTGT
AAGATGCCAAGATTAATTCTTGCAATTGATCTACCAGTAGTTTATTATTATAACTATTTGACCACTTGTGAGATCTGTTTTGGCTTGCAATTTTTCCTCGATTTGCTGTATAAATTTCCGGCAAGTATTAAATAAGCCCTTTGTTTTATATTTTACATATTTTAAAACAAAATAGTTAATAGGTATTCCTGTTTATAACC
CTTGACGGGGTTTGATCCGAGATCTCACACTCTATTGATTTCATAAAAGTTAGTATAATTTCGACTGTGTGATTTTGATTCGTAATTAACTATGATTATCCTAAATTTGGTCGATTGTAAAATTATGGAACTTAATGGTTTGCAGAACTTCTATCAATTTGACTTATTCGAAAACTAGGTCAACAAAATGTATTTGATCT
CAGTCCATCAATTTCAGTTTTATAAAGGATTTATTTAGGGACAAGTGGGCCATTGAGTTTATATGCTATCCTACAATAGCGACTGTATTCGTTGAACATTAGTTTTACTATATTATAAATATAACCAAAAAAATTATGCTCAGCAAAACAAAATTAAAGTATAGTTTTAAAAGAAAAACTACAGAGATATAATAAACATC
GTTGAGAAATAACATAGATATATGAAACGGGGAGATGTTTTTTTGAATTGAAACACTTTTCTTAATTAATAAATGTATATATATATATACTCGATAAGATAGTAGGAAAAGCAGAGTTTAAATCCTTTGGAGGGCAGACAGTTTGATTGTTGCGATGATCTATAATATGATCAGAAATATCTTTGTGATTGAACAATTAG
ATAAGAAAAATTATATTAAGAATGTGTGGGTAAAAAATAGTTGTACTTATACTAGGAACCTAACATCAGTATATCAATTCTAATTATGCAAAAAAAAACGTATTAAGACAGAAGTAAAATCTTTTGGATGTGTATATAGATTACTATCGAATAATTTGATATGAAACAGAAATAAAGTCTCTATTGTAAACAATATAGTG
AGATAGGAAAACAGAACAAGGAACTTGGCACTGTTTACGGGAAAACATAAGTGAAATAGTTGTTCCTCCCAACCAACTCCTAGAGCAGCCAAGTCTCACTTGCTCCAGAATCCTCGAGCCTGTTTTTTCTGAACCACAAGAGAAAAATCCTTCAATGCGCCATCTCTTGCATTCTCAGATTCAATCCTTGTCCAATGCTA
GCCTCCTGTTTCTCATGGACATACTAATCTAGAACTTGGTCATTTACGAGCCTCCTGCTCTTCAACACTTAACTAAGAGTTGTGACCTGATTTTTAGGGATGATACCTCC

>TRINITY_DN107435_c0_g1_i1 from sample A3 / Example unspliced isoform:

GTGGGTTGACAGCACAGCCAAGCCTTTATGGCTACACTGTGATGCTATCACGATTGTCCATTTGGACCGACGTATGTCAAGGGAGTCACAAGGGCTTAATACAAGTTTATACAGTCTGGAAATCATTTTCTTTGATGGTTTTGGTCTGTAAGCGAGAGAGAGAGAGAGCTGAACTCTGCTATTCCAAGCGTCCTTGGGGT
TTTTCGAAAGTGTTTATGCTGTCATACTATTGAATGGTTCCACTTGGTTAGTTGGAATCCACACCGTTGTTGGTCGATATTGAAATGCGACCTCAGTCTTTACAAGGATTGGGGGTGGTCTCCAGTCGATTGCAGCGAAGGGGACTCGTACACACAAACGTCCTTGTTCTATCCAAGAAAGGTAGCGGGAGTGATAAGGG
TTTATGAGGAGGAGATGACCTCAAGTTTTGTAAAGTTTAAAGAACAGGTGAAGGGCGTTAGGAAACGAAGgtagggtgatcacctccgatgcccgcgtcataagacgccctagttaagcttgttaccttaaagagaagaatttatattcataataataacaaattttagtagatagtgtgttatgagtgtatccaaacct
ttctttgtgtgcagATGGCACTTAAAAGTTGTTCTGGGGTGCTCCGAGGGTTTCCAGCCTCAGCTCTTAAAGATAAGTAAATTTTACAAGAAGAATAAAACATCAAGGGTTTAACCCACAATAGGGGTTTCTCTATACCTGTATTTAATTGTATCTACGATGTATGTTTAGTGTTTTATTAAATATAAACTAGAATACTT
TAGAAGAAAAAGAGGCCATAGTAGATGGCTGTAAAAGTTGTAACCCTGGTCGTGACTGTAATCACGAAGGGTTTTAAGTCTCTATAACTTCTTCACAAGAGTGATTGAGTTTAATGGGAGAAGGAATGGGGACAATCCCCAGGGTTTCGAATTCTTCTACCCAGATTGGTAAATGAGTTTGTATGGGTCTTGCAGTTTAT
AATTTAAATAAGCATTTAATTAAACGCTCCTAGGTCTGTAAGATGCCAAGATTAATTCTTGCAATTGATCTACCAGTAGTTTATTATTATAACTATTTGACCACTTGTGAGATCTGTTTTGGCTTGCAATTTTTCCTCGATTTGCTGTATAAATTTCCGGCAAGTATTAAATAAGCCCTTTGTTTTATATTTTACATATT
TTAAAACAAAATAGTTAATAGGTATTCCTGTTTATAACCCTTGACGGGGTTTGATCCGAGATCTCACACTCTATTGATTTCATAAAAGTTAGTATAATTTCGACTGTGTGATTTTGATTCGTAATTAACTATGATTATCCTAAATTTGGTCGATTGTAAAATTATGGAACTTAATGGTTTGCAGAACTTCTATCAATTTG
ACTTATTCGAAAACTAGGTCAACAAAATGTATTTGATCTCAGTCCATCAATTTCAGTTTTATAAAGGATTTATTTAGGGACAAGTGGGCCATTGAGTTTATATGCTATCCTACAATAGCGACTGTATTCGTTGAACATTAGTTTTACTATATTATAAATATAACCAAAAAAATTATGCTCAGCAAAACAAAATTAAAGTA
TAGTTTTAAAAGAAAAACTACAGAGATATAATAAACATCGTTGAGAAATAACATAGATATATGAAACGGGGAGATGTTTTTTTGAATTGAAACACTTTTCTTAATTAATAAATGTATATATATATATACTCGATAAGATAGTAGGAAAAGCAGAGTTTAAATCCTTTGGAGGGCAGACAGTTTGATTGTTGCGATGATCT
ATAATATGATCAGAAATATCTTTGTGATTGAACAATTAGATAAGAAAAATTATATTAAGAATGTGTGGGTAAAAAATAGTTGTACTTATACTAGGAACCTAACATCAGTATATCAATTCTAATTATGCAAAAAAAAACGTATTAAGACAGAAGTAAAATCTTTTGGATGTGTATATAGATTACTATCGAATAATTTGATA
TGAAACAGAAATAAAGTCTCTATTGTAAACAATATAGTGAGATAGGAAAACAGAACAAGGAACTTGGCACTGTTTACGGGAAAACATAAGTGAAATAGTTGTTCCTCCCAACCAACTCCTAGAGCAGCCAAGTCTCACTTGCTCCAGAATCCTCGAGCCTGTTTTTTCTGAACCACAAGAGAAAAATCCTTCAATGCGCC
ATCTCTTGCATTCTCAGATTCAATCCTTGTCCAATGCTAGCCTCCTGTTTCTCATGGACATACTAATCTAGAACTTGGTCATTTACGAGCCTCCTGCTCTTCAACACTTAACTAAGAGTTGTGACCTGATTTTTAGGGATGATACCTCC

Intron 2 GTAAGACCGT ... CTTTGTGCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	17.71	14	5	1
A2	0	5.5	0	0
A3	20	18	3	6
A4	0	4.5	0	0
A5	0	6	0	0
A6	5.26	9	0	1
A7	0	18	0	0
A8	0	11	0	0
A9	0	11	0	0
A10	0	20.5	0	0

>TRINITY_DN107435_c0_g1_i1 from sample A3 / Example spliced isoform

GTGGGTTGACAGCACAGCCAAGCCTTTATGGCTACACTGTGATGCTATCACGATTGTCCATTTGGACCGACGTATGTCAAGGGAGTCACAAGGGCTTAATACAAGTTTATACAGTCTGGAAATCATTTTCTTTGATGGTTTTGGTCTGTAAGCGAGAGAGAGAGAGAGCTGAACTCTGCTATTCCAAGCGTCCTTGGGGT
TTTTCGAAAGTGTTTATGCTGTCATACTATTGAATGGTTCCACTTGGTTAGTTGGAATCCACACCGTTGTTGGTCGATATTGAAATGCGACCTCAGTCTTTACAAGGATTGGGGGTGGTCTCCAGTCGATTGCAGCGAAGGGGACTCGTACACACAAACGTCCTTGTTCTATCCAAGAAAGGTAGCGGGAGTGATAAGGG
TTTATGAGGAGGAGATGACCTCAAGTTTTGTAAAGTTTAAAGAACAGGTGAAGGGCGTTAGGAAACGAAGGTAGGGTGATCACCTCCGATGCCCGCGTCATAAGACGCCCTAGTTAAGCTTGTTACCTTAAAGAGAAGAATTTATATTCATAATAATAACAAATTTTAGTAGATAGTGTGTTATGAGTGTATCCAAACCT
TTCTTTGTGTGCAGATGGCACTTAAAAGTTGTTCTGGGGTGCTCCGAGGGTTTCCAGCCTCAGCTCTTAAAGATAAGTAAATTTTACAAGAAGAATAAAACATCAAGGGTTTAACCCACAATAGGGGTTTCTCTATACCTGTATTTAATTGTATCTACGATGTATGTTTAGTGTTTTATTAAATATAAACTAGAATACTT
TAGAAGAAAAAGAGGCCATAGTAGATGGCTGTAAAAGTTGTAACCCTGGTCGTGACTGTAATCACGAAGGGTTTTAAGTCTCTATAACTTCTTCACAAGAGTGATTGAGTTTAATGGGAGAAGGAATGGGGACAATCCCCAGGGTTTCGAATTCTTCTACCCAGATTGGTAAATGAGTTTGTATGGGTCTTGCAGTTTAT
AATTTAAATAAGCATTTAATTAAACGCTCCTAGGTCTGTAAGATGCCAAGATTAATTCTTGCAATTGATCTACCAGTAGTTTATTATTATAACTATTTGACCACTTGTGAGATCTGTTTTGGCTTGCAATTTTTCCTCGATTTGCTGTATAAATTTCCGGCAAGTATTAAATAAGCCCTTTGTTTTATATTTTACATATT
TTAAAACAAAATAGTTAATAGGTATTCCTGTTTATAACCCTTGACGGGGTTTGATCCGAGATCTCACACTCTATTGATTTCATAAAAGTTAGTATAATTTCGACTGTGTGATTTTGATTCGTAATTAACTATGATTATCCTAAATTTGGTCGATTGTAAAATTATGGAACTTAATGGTTTGCAGAACTTCTATCAATTTG
ACTTATTCGAAAACTAGGTCAACAAAATGTATTTGATCTCAGTCCATCAATTTCAGTTTTATAAAGGATTTATTTAGGGACAAGTGGGCCATTGAGTTTATATGCTATCCTACAATAGCGACTGTATTCGTTGAACATTAGTTTTACTATATTATAAATATAACCAAAAAAATTATGCTCAGCAAAACAAAATTAAAGTA
TAGTTTTAAAAGAAAAACTACAGAGATATAATAAACATCGTTGAGAAATAACATAGATATATGAAACGGGGAGATGTTTTTTTGAATTGAAACACTTTTCTTAATTAATAAATGTATATATATATATACTCGATAAGATAGTAGGAAAAGCAGAGTTTAAATCCTTTGGAGGGCAGACAGTTTGATTGTTGCGATGATCT
ATAATATGATCAGAAATATCTTTGTGATTGAACAATTAGATAAGAAAAATTATATTAAGAATGTGTGGGTAAAAAATAGTTGTACTTATACTAGGAACCTAACATCAGTATATCAATTCTAATTATGCAAAAAAAAACGTATTAAGACAGAAGTAAAATCTTTTGGATGTGTATATAGATTACTATCGAATAATTTGATA
TGAAACAGAAATAAAGTCTCTATTGTAAACAATATAGTGAGATAGGAAAACAGAACAAGGAACTTGGCACTGTTTACGGGAAAACATAAGTGAAATAGTTGTTCCTCCCAACCAACTCCTAGAGCAGCCAAGTCTCACTTGCTCCAGAATCCTCGAGCCTGTTTTTTCTGAACCACAAGAGAAAAATCCTTCAATGCGCC
ATCTCTTGCATTCTCAGATTCAATCCTTGTCCAATGCTAGCCTCCTGTTTCTCATGGACATACTAATCTAGAACTTGGTCATTTACGAGCCTCCTGCTCTTCAACACTTAACTAAGAGTTGTGACCTGATTTTTAGGGATGATACCTCC

>TRINITY_DN107435_c0_g1_i4 from sample A3 / Example unspliced isoform:

TCTCCAGTCGATTGCAGCGAAGGGGACTCGTACACACAAACGTCCTTGTTCTATCCAAGAAAGgtaagaccgtaaaccaaaaggaaataagaagaggttttttttttataaaattttatagtgaaaattccagcattcaagagagggtttaaggttctcatctttgtgcagGTAGCGGGAGTGATAAGGGTTTATGAGGA
GGAGATGACCTCAAGTTTTGTAAAGTTTAAAGAACAGGTAACAAAGGTTCCTTCAAACAAATCTGCAACTCACAATTTTAATGCTTAAGAATTTCTAATAACTTCGTTATACCATTTTGTTCACAGGTGAAGGGCGTTAGGAAACGAAGGTAGGGTGATCACCTCCGATGCCCGCGTCATAAGACGCCCTAGTTAAGCTT
GTTACCTTAAAGAGAAGAATTTATATTCATAATAATAACAAATTTTAGTAGATAGTGTGTTATGAGTGTATCCAAACCTTTCTTTGTGTGCAGATGGCACTTAAAAGTTGTTCTGGGGTGCTCCGAGGGTTTCCAGCCTCAGCTCTTAAAGATAAGTAAATTTTACAAGAAGAATAAAACATCAAGGGTTTAACCCACAA
TAGGGGTTTCTCTATACCTGTATTTAATTGTATCTACGATGTATGTTTAGTGTTTTATTAAATATAAACTAGAATACTTTAGAAGAAAAAGAGGCCATAGTAGATGGCTGTAAAAGTTGTAACCCTGGTCGTGACTGTAATCACGAAGGGTTTTAAGTCTCTATAACTTCTTCACAAGAGTGATTGAGTTTAATGGGAGA
AGGAATGGGGACAATCCCCAGGGTTTCGAATTCTTCTACCCAGATTGGTAAATGAGTTTGTATGGGTCTTGCAGTTTATAATTTAAATAAGCATTTAATTAAACGCTCCTAGGTCTGTAAGATGCCAAGATTAATTCTTGCAATTGATCTACCAGTAGTTTATTATTATAACTATTTGACCACTTGTGAGATCTGTTTTG
GCTTGCAATTTTTCCTCGATTTGCTGTATAAATTTCCGGCAAGTATTAAATAAGCCCTTTGTTTTATATTTTACATATTTTAAAACAAAATAGTTAATAGGTATTCCTGTTTATAACCCTTGACGGGGTTTGATCCGAGATCTCACACTCTATTGATTTCATAAAAGTTAGTATAATTTCGACTGTGTGATTTTGATTCG
TAATTAACTATGATTATCCTAAATTTGGTCGATTGTAAAATTATGGAACTTAATGGTTTGCAGAACTTCTATCAATTTGACTTATTCGAAAACTAGGTCAACAAAATGTATTTGATCTCAGTCCATCAATTTCAGTTTTATAAAGGATTTATTTAGGGACAAGTGGGCCATTGAGTTTATATGCTATCCTACAATAGCGA
CTGTATTCGTTGAACATTAGTTTTACTATATTATAAATATAACCAAAAAAATTATGCTCAGCAAAACAAAATTAAAGTATAGTTTTAAAAGAAAAACTACAGAGATATAATAAACATCGTTGAGAAATAACATAGATATATGAAACGGGGAGATGTTTTTTTGAATTGAAACACTTTTCTTAATTAATAAATGTATATAT
ATATATACTCGATAAGATAGTAGGAAAAGCAGAGTTTAAATCCTTTGGAGGGCAGACAGTTTGATTGTTGCGATGATCTATAATATGATCAGAAATATCTTTGTGATTGAACAATTAGATAAGAAAAATTATATTAAGAATGTGTGGGTAAAAAATAGTTGTACTTATACTAGGAACCTAACATCAGTATATCAATTCTA
ATTATGCAAAAAAAAACGTATTAAGACAGAAGTAAAATCTTTTGGATGTGTATATAGATTACTATCGAATAATTTGATATGAAACAGAAATAAAGTCTCTATTGTAAACAATATAGTGAGATAGGAAAACAGAACAAGGAACTTGGCACTGTTTACGGGAAAACATAAGTGAAATAGTTGTTCCTCCCAACCAACTCCTA
GAGCAGCCAAGTCTCACTTGCTCCAGAATCCTCGAGCCTGTTTTTTCTGAACCACAAGAGAAAAATCCTTCAATGCGCCATCTCTTGCATTCTCAGATTCAATCCTTGTCCAATGCTAGCCTCCTGTTTCTCATGGACATACTAATCTAGAACTTGGTCATTTACGAGCCTCCTGCTCTTCAACACTTAACTAAGAGTTG
TGACCTGATTTTTAGGGATGATACCTCC

Intron 3 GTAACAAAGG ... TTGTTCACAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	4.55	10.5	0	1
A2	47.22	4.5	2	6
A3	38.01	18	7	14
A4	44.34	6.5	2	3
A5	21.11	7.5	2	2
A6	12.18	8.5	1	1
A7	7.24	19.5	0	3
A8	38.34	8.5	0	6
A9	16.25	11	0	4
A10	4.88	19.5	1	1

>TRINITY_DN107435_c0_g1_i1 from sample A3 / Example spliced isoform

GTGGGTTGACAGCACAGCCAAGCCTTTATGGCTACACTGTGATGCTATCACGATTGTCCATTTGGACCGACGTATGTCAAGGGAGTCACAAGGGCTTAATACAAGTTTATACAGTCTGGAAATCATTTTCTTTGATGGTTTTGGTCTGTAAGCGAGAGAGAGAGAGAGCTGAACTCTGCTATTCCAAGCGTCCTTGGGGT
TTTTCGAAAGTGTTTATGCTGTCATACTATTGAATGGTTCCACTTGGTTAGTTGGAATCCACACCGTTGTTGGTCGATATTGAAATGCGACCTCAGTCTTTACAAGGATTGGGGGTGGTCTCCAGTCGATTGCAGCGAAGGGGACTCGTACACACAAACGTCCTTGTTCTATCCAAGAAAGGTAGCGGGAGTGATAAGGG
TTTATGAGGAGGAGATGACCTCAAGTTTTGTAAAGTTTAAAGAACAGGTGAAGGGCGTTAGGAAACGAAGGTAGGGTGATCACCTCCGATGCCCGCGTCATAAGACGCCCTAGTTAAGCTTGTTACCTTAAAGAGAAGAATTTATATTCATAATAATAACAAATTTTAGTAGATAGTGTGTTATGAGTGTATCCAAACCT
TTCTTTGTGTGCAGATGGCACTTAAAAGTTGTTCTGGGGTGCTCCGAGGGTTTCCAGCCTCAGCTCTTAAAGATAAGTAAATTTTACAAGAAGAATAAAACATCAAGGGTTTAACCCACAATAGGGGTTTCTCTATACCTGTATTTAATTGTATCTACGATGTATGTTTAGTGTTTTATTAAATATAAACTAGAATACTT
TAGAAGAAAAAGAGGCCATAGTAGATGGCTGTAAAAGTTGTAACCCTGGTCGTGACTGTAATCACGAAGGGTTTTAAGTCTCTATAACTTCTTCACAAGAGTGATTGAGTTTAATGGGAGAAGGAATGGGGACAATCCCCAGGGTTTCGAATTCTTCTACCCAGATTGGTAAATGAGTTTGTATGGGTCTTGCAGTTTAT
AATTTAAATAAGCATTTAATTAAACGCTCCTAGGTCTGTAAGATGCCAAGATTAATTCTTGCAATTGATCTACCAGTAGTTTATTATTATAACTATTTGACCACTTGTGAGATCTGTTTTGGCTTGCAATTTTTCCTCGATTTGCTGTATAAATTTCCGGCAAGTATTAAATAAGCCCTTTGTTTTATATTTTACATATT
TTAAAACAAAATAGTTAATAGGTATTCCTGTTTATAACCCTTGACGGGGTTTGATCCGAGATCTCACACTCTATTGATTTCATAAAAGTTAGTATAATTTCGACTGTGTGATTTTGATTCGTAATTAACTATGATTATCCTAAATTTGGTCGATTGTAAAATTATGGAACTTAATGGTTTGCAGAACTTCTATCAATTTG
ACTTATTCGAAAACTAGGTCAACAAAATGTATTTGATCTCAGTCCATCAATTTCAGTTTTATAAAGGATTTATTTAGGGACAAGTGGGCCATTGAGTTTATATGCTATCCTACAATAGCGACTGTATTCGTTGAACATTAGTTTTACTATATTATAAATATAACCAAAAAAATTATGCTCAGCAAAACAAAATTAAAGTA
TAGTTTTAAAAGAAAAACTACAGAGATATAATAAACATCGTTGAGAAATAACATAGATATATGAAACGGGGAGATGTTTTTTTGAATTGAAACACTTTTCTTAATTAATAAATGTATATATATATATACTCGATAAGATAGTAGGAAAAGCAGAGTTTAAATCCTTTGGAGGGCAGACAGTTTGATTGTTGCGATGATCT
ATAATATGATCAGAAATATCTTTGTGATTGAACAATTAGATAAGAAAAATTATATTAAGAATGTGTGGGTAAAAAATAGTTGTACTTATACTAGGAACCTAACATCAGTATATCAATTCTAATTATGCAAAAAAAAACGTATTAAGACAGAAGTAAAATCTTTTGGATGTGTATATAGATTACTATCGAATAATTTGATA
TGAAACAGAAATAAAGTCTCTATTGTAAACAATATAGTGAGATAGGAAAACAGAACAAGGAACTTGGCACTGTTTACGGGAAAACATAAGTGAAATAGTTGTTCCTCCCAACCAACTCCTAGAGCAGCCAAGTCTCACTTGCTCCAGAATCCTCGAGCCTGTTTTTTCTGAACCACAAGAGAAAAATCCTTCAATGCGCC
ATCTCTTGCATTCTCAGATTCAATCCTTGTCCAATGCTAGCCTCCTGTTTCTCATGGACATACTAATCTAGAACTTGGTCATTTACGAGCCTCCTGCTCTTCAACACTTAACTAAGAGTTGTGACCTGATTTTTAGGGATGATACCTCC

>TRINITY_DN107435_c0_g1_i4 from sample A3 / Example unspliced isoform:

TCTCCAGTCGATTGCAGCGAAGGGGACTCGTACACACAAACGTCCTTGTTCTATCCAAGAAAGGTAAGACCGTAAACCAAAAGGAAATAAGAAGAGGTTTTTTTTTTATAAAATTTTATAGTGAAAATTCCAGCATTCAAGAGAGGGTTTAAGGTTCTCATCTTTGTGCAGGTAGCGGGAGTGATAAGGGTTTATGAGGA
GGAGATGACCTCAAGTTTTGTAAAGTTTAAAGAACAGgtaacaaaggttccttcaaacaaatctgcaactcacaattttaatgcttaagaatttctaataacttcgttataccattttgttcacagGTGAAGGGCGTTAGGAAACGAAGGTAGGGTGATCACCTCCGATGCCCGCGTCATAAGACGCCCTAGTTAAGCTT
GTTACCTTAAAGAGAAGAATTTATATTCATAATAATAACAAATTTTAGTAGATAGTGTGTTATGAGTGTATCCAAACCTTTCTTTGTGTGCAGATGGCACTTAAAAGTTGTTCTGGGGTGCTCCGAGGGTTTCCAGCCTCAGCTCTTAAAGATAAGTAAATTTTACAAGAAGAATAAAACATCAAGGGTTTAACCCACAA
TAGGGGTTTCTCTATACCTGTATTTAATTGTATCTACGATGTATGTTTAGTGTTTTATTAAATATAAACTAGAATACTTTAGAAGAAAAAGAGGCCATAGTAGATGGCTGTAAAAGTTGTAACCCTGGTCGTGACTGTAATCACGAAGGGTTTTAAGTCTCTATAACTTCTTCACAAGAGTGATTGAGTTTAATGGGAGA
AGGAATGGGGACAATCCCCAGGGTTTCGAATTCTTCTACCCAGATTGGTAAATGAGTTTGTATGGGTCTTGCAGTTTATAATTTAAATAAGCATTTAATTAAACGCTCCTAGGTCTGTAAGATGCCAAGATTAATTCTTGCAATTGATCTACCAGTAGTTTATTATTATAACTATTTGACCACTTGTGAGATCTGTTTTG
GCTTGCAATTTTTCCTCGATTTGCTGTATAAATTTCCGGCAAGTATTAAATAAGCCCTTTGTTTTATATTTTACATATTTTAAAACAAAATAGTTAATAGGTATTCCTGTTTATAACCCTTGACGGGGTTTGATCCGAGATCTCACACTCTATTGATTTCATAAAAGTTAGTATAATTTCGACTGTGTGATTTTGATTCG
TAATTAACTATGATTATCCTAAATTTGGTCGATTGTAAAATTATGGAACTTAATGGTTTGCAGAACTTCTATCAATTTGACTTATTCGAAAACTAGGTCAACAAAATGTATTTGATCTCAGTCCATCAATTTCAGTTTTATAAAGGATTTATTTAGGGACAAGTGGGCCATTGAGTTTATATGCTATCCTACAATAGCGA
CTGTATTCGTTGAACATTAGTTTTACTATATTATAAATATAACCAAAAAAATTATGCTCAGCAAAACAAAATTAAAGTATAGTTTTAAAAGAAAAACTACAGAGATATAATAAACATCGTTGAGAAATAACATAGATATATGAAACGGGGAGATGTTTTTTTGAATTGAAACACTTTTCTTAATTAATAAATGTATATAT
ATATATACTCGATAAGATAGTAGGAAAAGCAGAGTTTAAATCCTTTGGAGGGCAGACAGTTTGATTGTTGCGATGATCTATAATATGATCAGAAATATCTTTGTGATTGAACAATTAGATAAGAAAAATTATATTAAGAATGTGTGGGTAAAAAATAGTTGTACTTATACTAGGAACCTAACATCAGTATATCAATTCTA
ATTATGCAAAAAAAAACGTATTAAGACAGAAGTAAAATCTTTTGGATGTGTATATAGATTACTATCGAATAATTTGATATGAAACAGAAATAAAGTCTCTATTGTAAACAATATAGTGAGATAGGAAAACAGAACAAGGAACTTGGCACTGTTTACGGGAAAACATAAGTGAAATAGTTGTTCCTCCCAACCAACTCCTA
GAGCAGCCAAGTCTCACTTGCTCCAGAATCCTCGAGCCTGTTTTTTCTGAACCACAAGAGAAAAATCCTTCAATGCGCCATCTCTTGCATTCTCAGATTCAATCCTTGTCCAATGCTAGCCTCCTGTTTCTCATGGACATACTAATCTAGAACTTGGTCATTTACGAGCCTCCTGCTCTTCAACACTTAACTAAGAGTTG
TGACCTGATTTTTAGGGATGATACCTCC