sp|G5DAC6|XTH1_DIOKA ----> Xyloglucan endotransglucosylase protein 1

Intron 1 GTAAACTTTC ... TACATTTCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	14.29	3	1	0
A2	17.24	12	1	4
A3	20	4	0	2
A4	27.27	8	3	3
A5	17.95	16	0	7
A6	15.38	11	1	3
A7	25.37	25	5	12
A8	23.64	21	9	4
A9	18.18	18	3	5
A10	11.11	20	0	5

>TRINITY_DN40569_c0_g1_i6 from sample A8 / Example spliced isoform

CCCCTCTTCCTACAACAATTCTGTTTCAAACCGAGCAGGCCGGATTCGACTGGACTCTTCAACATCTTATCCGCCAGATTTGATCAATATCCTTTGTATCCATGGAGGTTCCCAGCGCTCTTAGTATACATTTCATTCTCATTGTTATCATCTGCACAGCTTTATCTCCCAGAGTTTCTGCCAATTTCTACGATGATATC
GATGTATCATGGGGCGATAACAACGTCAACATATTCAACGATGGCGAAGAATTGCAGCTTTCTCTCACTAATTATTCTGGTGGTGCGGGATTTCAATCGAAGAAGGAGATTTTGTTTGGAAGTGTTGATATGTCTATGAAGCTGGTGCCCGATAATTCTGCAGGCACCGTCACAACATACTATTTATCTTCTACAGGAGA
GGGGCACGACGAAATTGATATGGAGTTCCTAGGAAATGTTTCTGGCGAGCCCTACATTCTGCACACAAACATTTATATCAATGGGTCAGCCGATAGAGAACAGCAGTTTTATTTATGGTTTGATCCAACAGCAGATTACCACAATTACTCAATTCTCTGGAACCCACAACAAATTGCGCTTTTCGTTGATGGTTTGCCAA
TCAGAGTATTTCCAAACAGTGAAGACATAGGCGTGCCATATCCAAATGAGCAGGCAATGAGAGTGTACTCGAGCTTATGGAACGGGGATCAGTGGGCAACTCAAGGGGGGCGTGTGAAAACAGATTGGTCTTACTCACCATTTGTGGCTTCCTACATGAATTTCAGAACTGACGTCTGTGAATGGACTGGCAATGGCAGC
GCCTCTCAGTGTTGGGCAAATAACTGGAGTCAGAGCTTGAGCTATGCCCAGCAAGGACAACTACAGTGGGTTCGCACTAATTATCTCATCTACGATTACTGCAAAGATACCGCCAGATTCAATTATCAGCTTCCAGCCGAGTGCTCGCGACAACCACAGTAAAAAATGATTCCACTACGAATCTCGGTGTATGCTTTAGA
TTCTTCTTCGATGCTATTGATTTTTTATTAATTTGAAACAAATCTCCCGGACCTCTCGACGGCTAAATAAAATCCAATTTTACCCAACCTGCCTTCGTTTTTATGTAGAGATCTAGATGTTAGTTCTGCCCGCGACCAAATATAAATAAAATGGTTGTTTTCTATCCATGTTCCGTGAGAATGTTATTGAACACGCC

>TRINITY_DN40569_c0_g1_i2 from sample A8 / Example unspliced isoform:

CCCCTCTTCCTACAACAATTCTGTTTCAAACCGAGCAGGCCGGATTCGACTGGACTCTTCAACATCTTATCTGCCAAATTTGATCCATGGAGGTTCCCAGCGCTCTTAGTATATTACCAGGTTATGTTCATTTCATTCTCATTGTTATCATCTGCACAGCTTTATCTCCCAGAGTTTCTGCCAATTTCTACGATGATATC
GATGTATCATGGGGCGATAACAACGTCAACATATTCAACGATGGCGAAGAATTGCAGCTTTCTCTCACTAATTATTCTGGTGGTGCGGGATTTCAATCGAAGAAGGAGATTTTGTTTGGAAGTGTTGATATGTCTATGAAGCTGGTGCCCGATAATTCTGCAGGCACCGTCACAACATACTATGTGAGATTTCTGTTTCT
GTGTAGATCTATTAATTTATCTTTCATTTCATGATATAGGAACAAATAAACTTCCCAGGGTAAGTTGCAGATCTGCCTTCAGTTTATTCCCTTAATCTGTAGTCAAAATATTTAAATACACGCACATGGTACAGTTATCTTCTACAGGAGAGGGGCACGACGAAATTGATATGGAGTTCCTAGGAAATGTTTCTGGCGAG
CCCTACATTCTGCACACAAACATTTATATCAATGGGTCAGCCGATAGAGAACAGCAGTTTTATTTATGGTTTGATCCAACAGCAGATTACCACAATTACTCAATTCTCTGGAACCCACAACAAATTGCgtaaactttctctaactctatctttctctcgcttgctttgaacgttgaatccatttcgagtttaatccagtt
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GGCTTCCTACATGAATTTCAGAACTGACGTCTGTGAATGGACTGGCAATGGCAGCGCCTCTCAGTGTTGGGCAAATAACTGGAGTCAGAGCTTGAGCTATGCCCAGCAAGGACAACTACAGTGGGTTCGCACTAATTATCTCATCTACGATTACTGCAAAGATACCGCCAGATTCAATTATCAGCTTCCAGCCGAGTGCT
CGCGACAACCACAGTAAAAAATGATTCCACTACGAATCTCGGTGTATGCTTTAGATTCTTCTTCGATGCTATTGATTTTTTATTAATTTGAAACAAATCTCCCGGACCTCTCGACGGCTAAATAAAATCCAATTTTACCCAACCTGCCTTCGTTTTTATGTAGAGATCTAGATGTTAGTTCTGCCCGCGACCAAATATAA
ATAAAATGGTTGTTTTCTATCCATGTTCCGTGAGAATGTTATTGAACACGCC

Intron 2 GTGAGATTTC ... CATGGTACAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	64.29	5	9	9
A2	6.67	14	2	0
A3	20	4	2	0
A4	12	11	1	2
A5	50	2	2	2
A6	24.32	14	7	2
A7	6.25	15	1	1
A8	51.72	7	9	6
A9	16.67	25	1	9
A10	16.67	5	2	0

>TRINITY_DN40569_c0_g1_i6 from sample A8 / Example spliced isoform

CCCCTCTTCCTACAACAATTCTGTTTCAAACCGAGCAGGCCGGATTCGACTGGACTCTTCAACATCTTATCCGCCAGATTTGATCAATATCCTTTGTATCCATGGAGGTTCCCAGCGCTCTTAGTATACATTTCATTCTCATTGTTATCATCTGCACAGCTTTATCTCCCAGAGTTTCTGCCAATTTCTACGATGATATC
GATGTATCATGGGGCGATAACAACGTCAACATATTCAACGATGGCGAAGAATTGCAGCTTTCTCTCACTAATTATTCTGGTGGTGCGGGATTTCAATCGAAGAAGGAGATTTTGTTTGGAAGTGTTGATATGTCTATGAAGCTGGTGCCCGATAATTCTGCAGGCACCGTCACAACATACTATTTATCTTCTACAGGAGA
GGGGCACGACGAAATTGATATGGAGTTCCTAGGAAATGTTTCTGGCGAGCCCTACATTCTGCACACAAACATTTATATCAATGGGTCAGCCGATAGAGAACAGCAGTTTTATTTATGGTTTGATCCAACAGCAGATTACCACAATTACTCAATTCTCTGGAACCCACAACAAATTGCGCTTTTCGTTGATGGTTTGCCAA
TCAGAGTATTTCCAAACAGTGAAGACATAGGCGTGCCATATCCAAATGAGCAGGCAATGAGAGTGTACTCGAGCTTATGGAACGGGGATCAGTGGGCAACTCAAGGGGGGCGTGTGAAAACAGATTGGTCTTACTCACCATTTGTGGCTTCCTACATGAATTTCAGAACTGACGTCTGTGAATGGACTGGCAATGGCAGC
GCCTCTCAGTGTTGGGCAAATAACTGGAGTCAGAGCTTGAGCTATGCCCAGCAAGGACAACTACAGTGGGTTCGCACTAATTATCTCATCTACGATTACTGCAAAGATACCGCCAGATTCAATTATCAGCTTCCAGCCGAGTGCTCGCGACAACCACAGTAAAAAATGATTCCACTACGAATCTCGGTGTATGCTTTAGA
TTCTTCTTCGATGCTATTGATTTTTTATTAATTTGAAACAAATCTCCCGGACCTCTCGACGGCTAAATAAAATCCAATTTTACCCAACCTGCCTTCGTTTTTATGTAGAGATCTAGATGTTAGTTCTGCCCGCGACCAAATATAAATAAAATGGTTGTTTTCTATCCATGTTCCGTGAGAATGTTATTGAACACGCC

>TRINITY_DN40569_c0_g1_i3 from sample A8 / Example unspliced isoform:

CCCCTCTTCCTACAACAATTCTGTTTCAAACCGAGCAGGCCGGATTCGACTGGACTCTTCAACATCTTATCTGCCAAATTTGATCCATGGAGGTTCCCAGCGCTCTTAGTATATTACCAGGTTATGTTCATTTCATTCTCATTGTTATCATCTGCACAGCTTTATCTCCCAGAGTTTCTGCCAATTTCTACGATGATATC
GATGTATCATGGGGCGATAACAACGTCAACATATTCAACGATGGCGAAGAATTGCAGCTTTCTCTCACTAATTATTCTGGTGGTGCGGGATTTCAATCGAAGAAGGAGATTTTGTTTGGAAGTGTTGATATGTCTATGAAGCTGGTGCCCGATAATTCTGCAGGCACCGTCACAACATACTATgtgagatttctgtttct
gtgtagatctattaatttatctttcatttcatgatataggaacaaataaacttcccagggtaagttgcagatctgccttcagtttattcccttaatctgtagtcaaaatatttaaatacacgcacatggtacagTTATCTTCTACAGGAGAGGGGCACGACGAAATTGATATGGAGTTCCTAGGAAATGTTTCTGGCGAG
CCCTACATTCTGCACACAAACATTTATATCAATGGGTCAGCCGATAGAGAACAGCAGTTTTATTTATGGTTTGATCCAACAGCAGATTACCACAATTACTCAATTCTCTGGAACCCACAACAAATTGCGCTTTTCGTTGATGGTTTGCCAATCAGAGTATTTCCAAACAGTGAAGACATAGGCGTGCCATATCCAAATGA
GCAGGCAATGAGAGTGTACTCGAGCTTATGGAACGGGGATCAGTGGGCAACTCAAGGGGGGCGTGTGAAAACAGATTGGTCTTACTCACCATTTGTGGCTTCCTACATGAATTTCAGAACTGACGTCTGTGAATGGACTGGCAATGGCAGCGCCTCTCAGTGTTGGGCAAATAACTGGAGTCAGAGCTTGAGCTATGCCC
AGCAAGGACAACTACAGTGGGTTCGCACTAATTATCTCATCTACGATTACTGCAAAGATACCGCCAGATTCAATTATCAGCTTCCAGCCGAGTGCTCGCGACAACCACAGTAAAAAATGATTCCACTACGAATCTCGGTGTATGCTTTAGATTCTTCTTCGATGCTATTGATTTTTTATTAATTTGAAACAAATCTCCCG
GACCTCTCGACGGCTAAATAAAATCCAATTTTACCCAACCTGCCTTCGTTTTTATGTAGAGATCTAGATGTTAGTTCTGCCCGCGACCAAATATAAATAAAATGGTTGTTTTCTATCCATGTTCCGTGAGAATGTTATTGAACACGCC