NA ----> NA
Intron 1 GTTCATAAAT ... CTTGTCGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 100 | 0 | 4 | 4 |
| A2 | 0 | 3 | 0 | 0 |
| A3 | -1 | 0 | 0 | 0 |
| A4 | 55.56 | 2 | 2 | 3 |
| A5 | 50 | 1 | 0 | 2 |
| A6 | 25.93 | 10 | 5 | 2 |
| A7 | 100 | 0 | 1 | 0 |
| A8 | 44.44 | 5 | 6 | 2 |
| A9 | 40 | 3 | 2 | 2 |
| A10 | 45.45 | 3 | 3 | 2 |
>TRINITY_DN41206_c3_g7_i3 from sample A9 / Example spliced isoformCTTTGACACACATTTTACTTTCATTACATCTGAATTTGTTTTGTGCTCTTTGCACAGTTTGCTTATGCTGCTTGTGGCTCATTCAGGAGCTTGGACCGATACCCCATGAAATTGACACCCATTGATGGAGCTCAGCTGAACACTTCAAGAGACATTCCTTTGAAGGAGACTTGTTAAAATAATTGCCATTCTCTCCTGTG
ATGAGGAGGGTCGGTAAATGAGGAGGCTCAGCAGATGATCTATCCAACAGCATCTTGACACTAGTAGTTTGTTCGTCAAACAACAAAGTTATTTCATGGGCCAAATTCCAAACTCGACCTGTTTATATTGTCTTCATGTTATTGCTTTATTGGATTGAATGACCTTGTGGAGTAGACTTTCAAGACTCCTTTGTCACGGT
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CTGCGGTTTGTGCACATGGCCTATTTAGATATTTCTTTCTGCTGGATCATGTATGAATTCTATCATGACCAAAAGGGTAAGGACATTCACAGTTGTTCTTGTGCAATGCTTGTCTCCATATGCAGTGTTCCATGGGGACGCGTCCCCCAGGGTCAGGGGCTCGCTCCCCTCATTTCCCACACCCTGGGGGCTTCAGGACT
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AACTATCTCCTCGATGCTCTTTTAATGCTTTCAACTTTCTTTTCACTACTTTTATTTTCAGTGTTCATAACTTTTGACTCTAGAACTATATAATGTCATTGATGACTTCAGAATGAGTCTTTGACTCATCACTCTTTTGACTCTTTAAATTTGAAGGTGTTCAACACAAGTTTACG
>TRINITY_DN41206_c3_g7_i1 from sample A9 / Example unspliced isoform:CTTTGACACACATTTTACTTTCATTACATCTGAATTTGTTTTGTGCTCTTTGCACAGTTTGCTTATGCTGCTTGTGGCTCATTCAGGAGCTTGGACCGATACCCCATGAAATTGACACCCATTGATGGAGCTCAGCTGAACACTTCAAGAGACATTCCTTTGAAGGAGACTTGTTAAAATAATTGCCATTCTCTCCTGTG
ATGAGGAGGGTCGGTAAATGAGGAGGCTCAGCAGATGATCTATCCAACAGCATCTTGACACTAGTAGTTTGTTCGTCAAACAACAAAGgttcataaatgcattcaaactacattctccaaattggacatgttaaaaatctcttttatcttattggttatattttatagttgattgaccataaatgctttcttcttgtcgc
agTTATTTCATGGGCCAAATTCCAAACTCGACCTGTTTATATTGTCTTCATGTTATTGCTTTATTGGATTGAATGACCTTGTGGAGTAGACTTTCAAGACTCCTTTGTCACGGTAGACTAGATCTTTGTTCCTAGTTCAGGGCTATCACTTCTCAAAATTATCTGGAACGTTGACTAATTATGGCTGGCTTGGAATGCCA
GATCATGGCTCATTGGTGGATTAATTGACTTCTCTTTAAAAACTGTCATGTTTTGTACTGATGAGCTTTAGGGAAACACTTGTGTTGTAATGGAAATGTTTTATCTCCAAACCTCTGCGGTTTGTGCACATGGCCTATTTAGATATTTCTTTCTGCTGGATCATGTATGAATTCTATCATGACCAAAAGGGTAAGGACAT
TCACAGTTGTTCTTGTGCAATGCTTGTCTCCATATGCAGTGTTCCATGGGGACGCGTCCCCCAGGGTCAGGGGCTCGCTCCCCTCATTTCCCACACCCTGGGGGCTTCAGGACTCTTTGGGAAATGTTTCCCCACATCCCCTTTTCCTGGAAACTCTAGGAAATGCACAAGGAGCATCCCGAAGAGGTGGGGGCCGTCTG
GGCGTCTCCCTTATGAAAGCATGGTTTGGTTGGTGTGACACTCAGATAGTGACATTCCCATTGATGGTCTTGGTGGCTTCACACAGTGGATGCATGGGGAGGACCAATCCATGGAACTATCTCCTCGATGCTCTTTTAATGCTTTCAACTTTCTTTTCACTACTTTTATTTTCAGTGTTCATAACTTTTGACTCTAGAAC
TATATAATGTCATTGATGACTTCAGAATGAGTCTTTGACTCATCACTCTTTTGACTCTTTAAATTTGAAGGTGTTCAACACAAGTTTACG