NA ----> NA
Intron 1 GTAAGTGATA ... GTTCATGAAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 25 | 3 | 0 | 2 |
| A2 | 50 | 2 | 2 | 2 |
| A3 | 42.86 | 2 | 0 | 3 |
| A4 | 0 | 2 | 0 | 0 |
| A5 | 57.14 | 3 | 5 | 3 |
| A6 | 20 | 4 | 2 | 0 |
| A7 | 30.29 | 42.6 | 14 | 23 |
| A8 | 25.15 | 64 | 26 | 17 |
| A9 | 27.27 | 52 | 21 | 18 |
| A10 | 27.73 | 43 | 17 | 16 |
>TRINITY_DN44193_c0_g1_i29 from sample A8 / Example spliced isoformGTTGATGTTGCATGCTCATTATCCTTTTCTCCGCTTTGTTGGAATTGAAGGATGGTTTCTTGCCGAGGTTCAAGAATGGCAATTGATTCATTGTGTGCGACAAACATTTCATCATGTACCTCTAGAATCTCCTCATTCTCACTCATATATCCTTCTTCTAATGAGTTTGGTTGCTGGTCCTTTCATACACAACAAATTTT
AACTTGTTATTTTAACATACTATATTTAATTAACTTATCACATAATTCATCAAAATTTCTAAATAACTTACATCAGATGTATGCCCAGTGATCAATTTCTCCCCTCGATCTAGCATATGTTGTTGGAGGCCTCGAGAACCATGTAATAAGGCATATTTCAAATCCTCCTCTGAAGCTTCCTTTCCAAATTACATCCCATC
TGCACGAGAAGGAGGTAAAAGACGTCTTCGTGATACAACAAAAGCGACTAAAGCTAGGGTGTCAAGTATTGGATCCCACAAATTAGGATCTGGTGGGTACAATAGCATTCGTGGCAACTTGGTTCATCAATTTGAAAAGGAAGCTTCAGAGGAGGATTTGAAATATGCCTTATTACATGGTTCTCGAGGCCTCCAACAAC
ATATGCTAGATCGAGGGGAGAAATTGATCACTGGGCATACATCTGATG
>TRINITY_DN44193_c0_g1_i21 from sample A8 / Example unspliced isoform:TTTTCATACTTATTCTAGGCCTGCAAACCAAGGGGAAACATGGTTGTCCATCATGTGGGCCGAAATTGTTGTCTAGACAATCAAAAGATCTCAAGAAAATAGTGTATGATGAGTATAGACACTTCTTACCACAAAACCATCGCTATCGAGTGTGCGAGAAAAATAAGTTCAATGGAAAGGAGGAGGAAAAGAGGAAACCA
AAAAAGATGAACCCAGTAAGGTGGAAAGAAGCATATGAAAAAAGGGAAGGGAATGGATTTCCACTAGGAATGAAAAGACTATCCATTTTCTACAACTTAGAATATTATGAGCACCTCCCAATAGCTCACTTGTTTGATACTATGCACATTGGGAAAAATGTGGCTGAGTGCTTGTGGAAACACCTAAATGGAACCAACAT
TGAAGCACAATTAAGATTACGGAAGGACCTGCAAGTTGCCAATATGATGCCAAACCTTTGGTTGCATGAAAATAACTCATATGATCACGCTCCATGGATTTTTACATCAACGGAGAAAGCAAAAGTTATTGATATGATGAAAATCATAAGATTTCCTTCTGGTTTTGGTGCAACCTTTAAAAATTTATTCACAAGAGATG
GGTCAGAGCTCTCTGGACTAAAGACACATGATTGGCACAATTGGATAAAGGTAATGTGTAATATGCTAAACTTGTTTGGCAGCATAATTGCAATTTTTTCTATATTAATGATATTATATGACCATGTCTTGTTTAACACTGTTTTTTTAATGGTGATGTACTAGTATGTGTTGCCTGTAGCAATACCAAGCACATTCGAC
CATGGCATCACACAAACCATTTACAAATTATCAAAATATTTGAGGTATTTGAATCTATCATGCATTCTTCAATAGATCAACTCTTATCCTTTGAATTATGTCATTTGTGATGTCTTTATACAGGTTTATACCTATAATTTTGACACAAATTAAAAATATTTATATTGTAGTGCATATTGACAATATTTGTAGGTGGGTCT
CATCAAAAGAGATACACCAAGATGAATTGAAGTATTGGAAGAGGAACATTTCACTTTTGATGTGTGATATTCAAATGAACTTCCCTCCCAGCTTTTTCAATTCCCAAGAGCATTACCTTATACACCTAGTAGAAGAGATTGAACAATGTGGTCCTATCCATATCCGTACAATGTGGCTTGTGGAGAGATATATGAAGGTT
CTAAAAAATTTTGTGAGGCAAAGAGCTCGTCCTGAAGGGTCTATGGCTGAGGGGTACATGGCGTTTCAGACAATGGTTCATTTGAGTGAGTACTTACCTCAATTGCATATTGAAGCTCCACGATTATGGGGTGATAACCAACCTCAATTTTTTGAAGGGGAAAGATTAGAGGGTCAAGGATCTTCAAAGAGGATAAAAGG
TATACTTAAATTCTCGTATCAATTGTTTTGATCCTAAATCTTGGAAATTTGGATTTAACTATTGATTACTTGTACTTGTAGATGCTAAGGACTGGGAGTCATTACATTTGTATGTTGCATACAATTCTGAATTTATGTTAGACTGGATGGAGGAGTATAATCAACAAAAGAAGTTAGAAGATGAAAAGGCATGGGCTGAT
ATATATAATAGACATGGTCATAACACTGCTCGAGGTCTCCCTGCGAGCCATAAAAGAAAATGGCCAGATAGATGCACGTGGAATTGGCTAAAAACCAATGTTGAACATGAGGCAACAAAGAGGAAGCACCGTGTGACTCAACAACAACTTGATTTCGTTAAAGGATCTACAAATGGGGAGGTAATAAAAAAATATAAACA
TATTAAAGGTGTTTACTAAACTTTTTCTTTGAACTATTTGTACCCTTGAATCTTATTAGTTAATATGTATATGAATTCAGGTATCATACTACAAAGGAATGTGGAATAATGGTCATCATTTTCGTATCAGAAAGGTTGATGAGAATCGACAAACTTATGATTGTGGAGTATCAGCATCGTTTGAGGTGGATTCTCGTTCA
CATGCATATGATAGACACCCAATCACAAGCATACTTTGTTATTATGGAGTGTTGGAGGATATCATAGAGCTCAATTTCATGTCTTTCAAAAAAGTTCTTTTTCGTGTTGAATGGTACAAGCTCATCAAAGTCGGCCCAGAAAAAACCATCATCTTGCACAATAATGGGTTCAATATGATCAATACATCTAGGTTTGAAGC
CACTTCTGAACCTTATGTGTTTCCAAATCAATGTGACCAAATATTTCTTGTTCCAAATTTAGAACAACCTGGTTGGTCATTTGTGATTGATTATGATCCAAGAGGACGGAGAGTAACATTTGTTCAGGATGTAGAAAACCATGATTCGTCTGAAGATTCAGAAGATTTGTCTGAATATGTAGATGAAGAAGATGAAGATG
TTGATAATTTGAGTATTGATAATGAATATGATCAAGATGAAGACACTGATGATTTTATTGAAGTGCAAGAAGGACAAGAACAACATCATGGGTATCATGTACATGAAGATGACGAATTTATTGATTTTGATTTACATATAGATGAAGGGGATGAAGACCATGAGAACATATGGTACTAATTTATTTGTGGATTCAGGCCT
AGTAATGATGATGTAATTATTCCTTTATATGAGGAAATTTCACATGATGATGAAATGGTTTGGTTTCCATCCTCACTTTAAAATGGTTTTTAGAAAATAATGGAATATAATTAATTCTATAGAAAATGAATATTGTGTATGTTTTGTTTATGAATCAAACACAATCGAAATAATATTGTTAAAAGTTTTTGAGTGGTGTT
TTAGTGGATGTTTATGATGTCAAGGTAAATAGTTGGCATACCTTCTCAATTGGATAAAAAAAATTCATATTAATTTGTATTTCTCTAATAATTTGCTTGAAGCACACATTTGATTTTGTGGGTATAGGGAATCTACCACACTCCAATGCTTTAATTTAAATGTTGAAAAGTTTGATGCAATCAACACCTATGTACGAAAA
CTGTAATACAATAAAGATAAGAAATAAAAGTAAAAACCTTAAAATTTGATTATTGTTTATAATTTTTTCGTTTGAAAATGTATTCAAAATTATTTTGGTCAAGTTTTTGTTTGAGTGTTAGTAAACTTGTCTTATGATAATGATATCATTTGGATATATTTCAATTAATATGTTTTCATTTTAAGTATTTTGTTCTTTTG
TAAGAATGTTCATAAGGGTACTCCAAGTTCTACTATGGGGGATTCACAACTGTTGAGTAATTTAATTGCGATGTTGAGCAATGGGCAAGGACAAGAAGTTACCATGATGGTGCAAGAGGCCATTTCTAAAGTCATTCCATCACCTAACATGCCCTTTAGTGCATCTGGTAGTATGCAAGAGGATGTTTCTAGAATAACTC
CAACAAGATTGCAATCTATCAACAAGGACAATCATGCCACGCCCTCTACTTCTAAACTAGCAAATTTGCACACAACAATGACTACTAATGATCAATATCATAACATGCCTTCTACAACCAACATGGATCATTTGAGCATGCCGGCAACTATTAGGAGTACATCACAATTCAGAAATAATTTTTCAAATGTCGGCTCAGTC
AGAATTCTCCCACCAACAACAAAACAAGTTTCCTTAAGGAGTCTCATAGAATCACAAGAAAGAATACTAAGGCTCCTATCGAATGCTCCTGAAAATGATCATATTAGGAAAGAATTACTTGAACAAATTCAGATATGGGAGACGGAATTATTAGAAAGTGAAGGCCTTTGCTCGGATGAAATGGAAATAAATGACAATGT
GATCCATATACCTATAGTGAAAAGTGCTTCAACCCCTAAGACTCCAACAGTTTCCTTGGTAACAACAAAGGGATTGAAAGAAGTCACAATCTTGCTAACATCTGAGGGAAATGTCTTGAAGGATGAAATGGGGTTAAAATTATACCATTTTATCTTCCGTCGTGCAGAGCAGTTGTTTGGTAATACAATCCAAGTGGATT
GGAGGAAACAACTCCAAGTTAGGAAAGATGAACTCTTCAATGATGTCATTACAACCTTTGGGAATCCTGGATTTAATAAGGAAATTATTTTGGATATTGCTCGAAAATACATTCACTCTAAAAGGGACAACATAAGGTCCAAGCTAACAAAGGACTTGAGATATCCACGCCCATATTGGATCACAGACCAAACAACATGG
GATGAACTTATAAAGGATGCCAAGTTTAAAAGGAAGTGCCATAATAATCCAAATTACATCCCATCTGCACGAGAAGGAGGTAAAAGACGTCTTCGTGATACAACAAAAGCGACTAAAGCTAGGGTGTCAAGTATTGGATCCCACAAATTAGGATCTGGTGGGTACAATAGCATTCGTGGCAACTTGgtaagtgatatttt
ttcatttactttatcctctatttgaaaataaatttggaaatttatgagcaagttgtatttatgagtaattataaaatacgaatttgattacttttgttcatgaagGTTCATCAATTTGAAAAGGAAGCTTCAGAGGAGGATTTGAAATATGCCTTATTACATGGTTCTCGAGGCCTCCAACAACATATGCTAGATCGAGG
GGAGAAATTGATCACTGGGCATACATCTGATGTAAGTTATTTAGAAATTTTGATGAATTATGTGATAAGTTAATTAAATATAGTATGTTAAAATAACAAGTTAAAATTTGTTGTGTATGAAAGGACCAGCAACCAAACTCATTAGAAGAAGGATATATGAGTGAGAATGAGGAGATTCTAGAGGTACATGATGAAATGTT
TGTCGCACACAATGAATCAATTGCCATTCTTGAACCTCGGCAAGAAACCATCCTTCAATTCCAACAAAGCGGAGAAAAGGATAATGAGCATGCAACATCAACAATTAGAGTAGTGCCTCGTAGAAAGAGGACAAAAAGGAATAGGATTGATAACAATGATCTATAATAAGTTTCTATGATAGGTACATTTCAATCTTTTT
ATAACTCTTCCATTCGAACTTTGTCATCTCTTCATATCATTGGATTCTAGAACTATGCAATATGCCTTGAAATTTTTCATCTTGAGATGTTATGAGGATGGTGGTTTGGATTCTTTCATCATGAGTTATAAAATGTAGATAAATTGTAATATGTTATTCATTTTACATAAGTTTACATTAAATATATTTTTTGGTTTAAT
ATTTTACTCACTTATATATGTCTTGTTTATTGTAGGTTGCAAGAGAAACATCAAGAGTATGATGTGCTTTTGGTTGTCCATTTTTGAATGATAAAGGGAGCATTGCTAAGAAATTCTAGTTTCTTCATAATTTGTAATTAATTTATGGGGCATCTTCGCCACACTATCAAATTTTTCGCCACTATCAATTTTTTTGAGGA
TGTAGTGTTTGAGAAATGTAGCACGTCAATATTAAATAATCACTATGACATATCTATGTTATGTATTTTTTCCCATGGAGCAACTCTCCAATCATTTTATAAACTAAAAATGTTGAAAATAATTATAGTAATATTGTGATTCTAGTC
Intron 2 GTAAGTTATT ... TGTATGAAAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 29.41 | 12 | 1 | 9 |
| A2 | 37.5 | 5 | 1 | 5 |
| A3 | 33.33 | 2 | 1 | 1 |
| A4 | 0 | 1 | 0 | 0 |
| A5 | 20 | 2 | 0 | 1 |
| A6 | 42.86 | 2 | 1 | 2 |
| A7 | 30.83 | 46 | 17 | 24 |
| A8 | 33.33 | 39 | 19 | 20 |
| A9 | 26.32 | 49 | 14 | 21 |
| A10 | 33.76 | 52 | 20 | 33 |
>TRINITY_DN44193_c0_g1_i5 from sample A8 / Example spliced isoformTTTTCATACTTATTCTAGGCCTGCAAACCAAGGGGAAACATGGTTGTCCATCATGTGGGCCGAAATTGTTGTCTAGACAATCAAAAGATCTCAAGAAAATAGTGTATGATGAGTATAGACACTTCTTACCACAAAACCATCGCTATCGAGTGTGCGAGAAAAATAAGTTCAATGGAAAGGAGGAGGAAAAGAGGAAACCA
AAAAAGATGAACCCAGTAAGGTGGAAAGAAGCATATGAAAAAAGGGAAGGGAATGGATTTCCACTAGGAATGAAAAGACTATCCATTTTCTACAACTTAGAATATTATGAGCACCTCCCAATAGCTCACTTGTTTGATACTATGCACATTGGGAAAAATGTGGCTGAGTGCTTGTGGAAACACCTAAATGGAACCAACAT
TGAAGCACAATTAAGATTACGGAAGGACCTGCAAGTTGCCAATATGATGCCAAACCTTTGGTTGCATGAAAATAACTCATATGATCACGCTCCATGGATTTTTACATCAACGGAGAAAGCAAAAGTTATTGATATGATGAAAATCATAAGATTTCCTTCTGGTTTTGGTGCAACCTTTAAAAATTTATTCACAAGAGATG
GGTCAGAGCTCTCTGGACTAAAGACACATGATTGGCACAATTGGATAAAGGTAATGTGTAATATGCTAAACTTGTTTGGCAGCATAATTGCAATTTTTTCTATATTAATGATATTATATGACCATGTCTTGTTTAACACTGTTTTTTTAATGGTGATGTACTAGTATGTGTTGCCTGTAGCAATACCAAGCACATTCGAC
CATGGCATCACACAAACCATTTACAAATTATCAAAATATTTGAGGTGGGTCTCATCAAAAGAGATACACCAAGATGAATTGAAGTATTGGAAGAGGAACATTTCACTTTTGATGTGTGATATTCAAATGAACTTCCCTCCCAGCTTTTTCAATTCCCAAGAGCATTACCTTATACACCTAGTAGAAGAGATTGAACAATG
TGGTCCTATCCATATCCGTACAATGTGGCTTGTGGAGAGATATATGAAGGTTCTAAAAAATTTTGTGAGGCAAAGAGCTCGTCCTGAAGGGTCTATGGCTGAGGGGTACATGGCGTTTCAGACAATGGTTCATTTGAGTGAGTACTTACCTCAATTGCATATTGAAGCTCCACGATTATGGGGTGATAACCAACCTCAAT
TTTTTGAAGGGGAAAGATTAGAGGGTCAAGGATCTTCAAAGAGGATAAAAGGTATACTTAAATTCTCGTATCAATTGTTTTGATCCTAAATCTTGGAAATTTGGATTTAACTATTGATTACTTGTACTTGTAGATGCTAAGGACTGGGAGTCATTACATTTGTATGTTGCATACAATTCTGAATTTATGTTAGACTGGAT
GGAGGAGTATAATCAACAAAAGAAGTTAGAAGATGAAAAGGCATGGGCTGATATATATAATAGACATGGTCATAACACTGCTCGAGGTCTCCCTGCGAGCCATAAAAGAAAATGGCCAGATAGATGCACGTGGAATTGGCTAAAAACCAATGTTGAACATGAGGCAACAAAGAGGAAGCACCGTGTGACTCAACAACAAC
TTGATTTCGTTAAAGGATCTACAAATGGGGAGGTAATAAAAAAATATAAACATATTAAAGGTGTTTACTAAACTTTTTCTTTGAACTATTTGTACCCTTGAATCTTATTAGTTAATATGTATATGAATTCAGGTATCATACTACAAAGGAATGTGGAATAATGGTCATCATTTTCGTATCAGAAAGGTTGATGAGAATCG
ACAAACTTATGATTGTGGAGTATCAGCATCGTTTGAGGTGGATTCTCGTTCACATGCATATGATAGACACCCAATCACAAGCATACTTTGTTATTATGGAGTGTTGGAGGATATCATAGAGCTCAATTTCATGTCTTTCAAAAAAGTTCTTTTTCGTGTTGAATGGTACAAGCTCATCAAAGTCGGCCCAGAAAAAACCA
TCATCTTGCACAATAATGGGTTCAATATGATCAATACATCTAGGTTTGAAGCCACTTCTGAACCTTATGTGTTTCCAAATCAATGTGACCAAATATTTCTTGTTCCAAATTTAGAACAACCTGGTTGGTCATTTGTGATTGATTATGATCCAAGAGGACGGAGAGTAACATTTGTTCAGGATGTAGAAAACCATGATTCG
TCTGAAGATTCAGAAGATTTGTCTGAATATGTAGATGAAGAAGATGAAGATGTTGATAATTTGAGTATTGATAATGAATATGATCAAGATGAAGACACTGATGATTTTATTGAAGTGCAAGAAGGACAAGAACAACATCATGGGTATCATGTACATGAAGATGACGAATTTATTGATTTTGATTTACATATAGATGAAGG
GGATGAAGACCATGAGAACATATGGTACTAATTTATTTGTGGATTCAGGCCTAGTAATGATGATGTAATTATTCCTTTATATGAGGAAATTTCACATGATGATGAAATGGTTTGGTTTCCATCCTCACTTTAAAATGGTTTTTAGAAAATAATGGAATATAATTAATTCTATAGAAAATGAATATTGTGTATGTTTTGTT
TATGAATCAAACACAATCGAAATAATATTGTTAAAAGTTTTTGAGTGGTGTTTTAGTGGATGTTTATGATGTCAAGGTAAATAGTTGGCATACCTTCTCAATTGGATAAAAAAAATTCATATTAATTTGTATTTCTCTAATAATTTGCTTGAAGCACACATTTGATTTTGTGGGTATAGGGAATCTACCACACTCCAATG
CTTTAATTTAAATGTTGAAAAGTTTGATGCAATCAACACCTATGTACGAAAACTGTAATACAATAAAGATAAGAAATAAAAGTAAAAACCTTAAAATTTGATTATTGTTTATAATTTTTTCGTTTGAAAATGTATTCAAAATTATTTTGGTCAAGTTTTTGTTTGAGTGTTAGTAAACTTGTCTTATGATAATGATATCA
TTTGGATATATATTTCAATTAATATGTTTTCATTTTAAGTATTTTGTTCTTTTGTAAGAATGTTCATAAGGGTACTCCAAGTTCTACTATGGGGGATTCACAACTGTTGAGTAATTTAATTGCGATGTTGAGCAATGGGCAAGGACAAGAAGTTACCATGATGGTGCAAGAGGTGAGATTCAAAATTTTACTTTACAGTT
TTAATTATCTCATGTTTTATACTATATTGTTTTAATTTGTCCGTTTGTGATGCAGGCCATTTCTAAAGTCATTCCATCACCTAACATGCCCTTTAGTGCATCTGGTAGTATGCAAGAGGATGTTTCTAGAATAACTCCAACAAGATTGCAATCTATCAACAAGGACAATCATGCCACGCCCTCTACTTCTAAACTAGCAA
ATTTGCACACAACAATGACTACTAATGATCAATATCATAACATGCCTTCTACAACCAACATGGATCATTTGAGCATGCCGGCAACTATTAGGAGTACATCACAATTCAGAAATAATTTTTCAAATGTCGGCTCAGTCAGAATTCTCCCACCAACAACAAAACAAGTTTCCTTAAGGAGTCTCATAGAATCACAAGAAAGA
ATACTAAGGCTCCTATCGAATGCTCCTGAAAATGATCATATTAGGAAAGAATTACTTGAACAAATTCAGATATGGGAGACGGAATTATTAGAAAGTGAAGGCCTTTGCTCGGATGAAATGGAAATAAATGACAATGTGATCCATATACCTATAGTGAAAAGTGCTTCAACCCCTAAGACTCCAACAGTTTCCTTGGTAAC
AACAAAGGGATTGAAAGAAGTCACAATCTTGCTAACATCTGAGGGAAATGTCTTGAAGGATGAAATGGGGTTAAAATTATACCATTTTATCTTCCGTCGTGCAGAGCAGTTGTTTGGTAATACAATCCAAGTGGATTGGAGGAAACAACTCCAAGTTAGGAAAGATGAACTCTTCAATGATGTCATTACAACCTTTGGGA
ATCCTGGATTTAATAAGGAAATTATTTTGGATATTGCTCGAAAATACATTCACTCTAAAAGGGACAACATAAGGTCCAAGCTAACAAAGGACTTGAGATATCCACGCCCATATTGGATCACAGACCAAACAACATGGGATGAACTTATAAAGGATGCCAAGTTTAAAAGGAAGTGCCATAATAATCCAAATTACATCCCA
TCTGCACGAGAAGGAGGTAAAAGACGTCTTCGTGATACAACAAAAGCGACTAAAGCTAGGGTGTCAAGTATTGGATCCCACAAATTAGGATCTGGTGGGTACAATAGCATTCGTGGCAACTTGGTAAGTGATATTTTTTCATTTACTTTATCCTCTATTTGAAAATAAATTTGGAAATTTATGAGCAAGTTGTATTTATG
AGTAATTATAAAATACGAATTTGATTACTTTTGTTCATGAAGGTTCATCAATTTGAAAAGGAAGCTTCAGAGGAGGATTTGAAATATGCCTTATTACATGGTTCTCGAGGCCTCCAACAACATATGCTAGATCGAGGGGAGAAATTGATCACTGGGCATACATCTGATGACCAGCAACCAAACTCATTAGAAGAAGGATA
TATGAGTGAGAATGAGGAGATTCTAGAGGTACATGATGAAATGTTTGTCGCACACAATGAATCAATTGCCATTCTTGAACCTCGGCAAGAAACCATCCTTCAATTCCAACAAAGCGGAGAAAAGGATAATGAGCATGCAACATCAACAATTAGAGTAGTGCCTCGTAGAAAGAGGACAAAAAGGAATAGGATTGATAACA
ATGATCTATAATAAGTTTCTATGATAGGTTGCAAGAGAAACATCAAGAGTATGATGTGCTTTTGGTTGTCCATTTTTGAATGATAAAGGGAGCATTGCTAAGAAATTCTAGTTTCTTCATAATTTGTAATTAATTTATGGGGCATCTTCGCCACACTATCAAATTTTTCGCCACTATCAATTTTTTTGAGGATGTAGTGT
TTGAGAAATGTAGCACGTCAATATTAAATAATCACTATGACATATCTATGTTATGTATTTTTTCCCATGGAGCAACTCTCCAATCATTTTATAAACTAAAAATGTTGAAAATAATTATAGTAATATTGTGATTCTAGTC
>TRINITY_DN44193_c0_g1_i21 from sample A8 / Example unspliced isoform:TTTTCATACTTATTCTAGGCCTGCAAACCAAGGGGAAACATGGTTGTCCATCATGTGGGCCGAAATTGTTGTCTAGACAATCAAAAGATCTCAAGAAAATAGTGTATGATGAGTATAGACACTTCTTACCACAAAACCATCGCTATCGAGTGTGCGAGAAAAATAAGTTCAATGGAAAGGAGGAGGAAAAGAGGAAACCA
AAAAAGATGAACCCAGTAAGGTGGAAAGAAGCATATGAAAAAAGGGAAGGGAATGGATTTCCACTAGGAATGAAAAGACTATCCATTTTCTACAACTTAGAATATTATGAGCACCTCCCAATAGCTCACTTGTTTGATACTATGCACATTGGGAAAAATGTGGCTGAGTGCTTGTGGAAACACCTAAATGGAACCAACAT
TGAAGCACAATTAAGATTACGGAAGGACCTGCAAGTTGCCAATATGATGCCAAACCTTTGGTTGCATGAAAATAACTCATATGATCACGCTCCATGGATTTTTACATCAACGGAGAAAGCAAAAGTTATTGATATGATGAAAATCATAAGATTTCCTTCTGGTTTTGGTGCAACCTTTAAAAATTTATTCACAAGAGATG
GGTCAGAGCTCTCTGGACTAAAGACACATGATTGGCACAATTGGATAAAGGTAATGTGTAATATGCTAAACTTGTTTGGCAGCATAATTGCAATTTTTTCTATATTAATGATATTATATGACCATGTCTTGTTTAACACTGTTTTTTTAATGGTGATGTACTAGTATGTGTTGCCTGTAGCAATACCAAGCACATTCGAC
CATGGCATCACACAAACCATTTACAAATTATCAAAATATTTGAGGTATTTGAATCTATCATGCATTCTTCAATAGATCAACTCTTATCCTTTGAATTATGTCATTTGTGATGTCTTTATACAGGTTTATACCTATAATTTTGACACAAATTAAAAATATTTATATTGTAGTGCATATTGACAATATTTGTAGGTGGGTCT
CATCAAAAGAGATACACCAAGATGAATTGAAGTATTGGAAGAGGAACATTTCACTTTTGATGTGTGATATTCAAATGAACTTCCCTCCCAGCTTTTTCAATTCCCAAGAGCATTACCTTATACACCTAGTAGAAGAGATTGAACAATGTGGTCCTATCCATATCCGTACAATGTGGCTTGTGGAGAGATATATGAAGGTT
CTAAAAAATTTTGTGAGGCAAAGAGCTCGTCCTGAAGGGTCTATGGCTGAGGGGTACATGGCGTTTCAGACAATGGTTCATTTGAGTGAGTACTTACCTCAATTGCATATTGAAGCTCCACGATTATGGGGTGATAACCAACCTCAATTTTTTGAAGGGGAAAGATTAGAGGGTCAAGGATCTTCAAAGAGGATAAAAGG
TATACTTAAATTCTCGTATCAATTGTTTTGATCCTAAATCTTGGAAATTTGGATTTAACTATTGATTACTTGTACTTGTAGATGCTAAGGACTGGGAGTCATTACATTTGTATGTTGCATACAATTCTGAATTTATGTTAGACTGGATGGAGGAGTATAATCAACAAAAGAAGTTAGAAGATGAAAAGGCATGGGCTGAT
ATATATAATAGACATGGTCATAACACTGCTCGAGGTCTCCCTGCGAGCCATAAAAGAAAATGGCCAGATAGATGCACGTGGAATTGGCTAAAAACCAATGTTGAACATGAGGCAACAAAGAGGAAGCACCGTGTGACTCAACAACAACTTGATTTCGTTAAAGGATCTACAAATGGGGAGGTAATAAAAAAATATAAACA
TATTAAAGGTGTTTACTAAACTTTTTCTTTGAACTATTTGTACCCTTGAATCTTATTAGTTAATATGTATATGAATTCAGGTATCATACTACAAAGGAATGTGGAATAATGGTCATCATTTTCGTATCAGAAAGGTTGATGAGAATCGACAAACTTATGATTGTGGAGTATCAGCATCGTTTGAGGTGGATTCTCGTTCA
CATGCATATGATAGACACCCAATCACAAGCATACTTTGTTATTATGGAGTGTTGGAGGATATCATAGAGCTCAATTTCATGTCTTTCAAAAAAGTTCTTTTTCGTGTTGAATGGTACAAGCTCATCAAAGTCGGCCCAGAAAAAACCATCATCTTGCACAATAATGGGTTCAATATGATCAATACATCTAGGTTTGAAGC
CACTTCTGAACCTTATGTGTTTCCAAATCAATGTGACCAAATATTTCTTGTTCCAAATTTAGAACAACCTGGTTGGTCATTTGTGATTGATTATGATCCAAGAGGACGGAGAGTAACATTTGTTCAGGATGTAGAAAACCATGATTCGTCTGAAGATTCAGAAGATTTGTCTGAATATGTAGATGAAGAAGATGAAGATG
TTGATAATTTGAGTATTGATAATGAATATGATCAAGATGAAGACACTGATGATTTTATTGAAGTGCAAGAAGGACAAGAACAACATCATGGGTATCATGTACATGAAGATGACGAATTTATTGATTTTGATTTACATATAGATGAAGGGGATGAAGACCATGAGAACATATGGTACTAATTTATTTGTGGATTCAGGCCT
AGTAATGATGATGTAATTATTCCTTTATATGAGGAAATTTCACATGATGATGAAATGGTTTGGTTTCCATCCTCACTTTAAAATGGTTTTTAGAAAATAATGGAATATAATTAATTCTATAGAAAATGAATATTGTGTATGTTTTGTTTATGAATCAAACACAATCGAAATAATATTGTTAAAAGTTTTTGAGTGGTGTT
TTAGTGGATGTTTATGATGTCAAGGTAAATAGTTGGCATACCTTCTCAATTGGATAAAAAAAATTCATATTAATTTGTATTTCTCTAATAATTTGCTTGAAGCACACATTTGATTTTGTGGGTATAGGGAATCTACCACACTCCAATGCTTTAATTTAAATGTTGAAAAGTTTGATGCAATCAACACCTATGTACGAAAA
CTGTAATACAATAAAGATAAGAAATAAAAGTAAAAACCTTAAAATTTGATTATTGTTTATAATTTTTTCGTTTGAAAATGTATTCAAAATTATTTTGGTCAAGTTTTTGTTTGAGTGTTAGTAAACTTGTCTTATGATAATGATATCATTTGGATATATTTCAATTAATATGTTTTCATTTTAAGTATTTTGTTCTTTTG
TAAGAATGTTCATAAGGGTACTCCAAGTTCTACTATGGGGGATTCACAACTGTTGAGTAATTTAATTGCGATGTTGAGCAATGGGCAAGGACAAGAAGTTACCATGATGGTGCAAGAGGCCATTTCTAAAGTCATTCCATCACCTAACATGCCCTTTAGTGCATCTGGTAGTATGCAAGAGGATGTTTCTAGAATAACTC
CAACAAGATTGCAATCTATCAACAAGGACAATCATGCCACGCCCTCTACTTCTAAACTAGCAAATTTGCACACAACAATGACTACTAATGATCAATATCATAACATGCCTTCTACAACCAACATGGATCATTTGAGCATGCCGGCAACTATTAGGAGTACATCACAATTCAGAAATAATTTTTCAAATGTCGGCTCAGTC
AGAATTCTCCCACCAACAACAAAACAAGTTTCCTTAAGGAGTCTCATAGAATCACAAGAAAGAATACTAAGGCTCCTATCGAATGCTCCTGAAAATGATCATATTAGGAAAGAATTACTTGAACAAATTCAGATATGGGAGACGGAATTATTAGAAAGTGAAGGCCTTTGCTCGGATGAAATGGAAATAAATGACAATGT
GATCCATATACCTATAGTGAAAAGTGCTTCAACCCCTAAGACTCCAACAGTTTCCTTGGTAACAACAAAGGGATTGAAAGAAGTCACAATCTTGCTAACATCTGAGGGAAATGTCTTGAAGGATGAAATGGGGTTAAAATTATACCATTTTATCTTCCGTCGTGCAGAGCAGTTGTTTGGTAATACAATCCAAGTGGATT
GGAGGAAACAACTCCAAGTTAGGAAAGATGAACTCTTCAATGATGTCATTACAACCTTTGGGAATCCTGGATTTAATAAGGAAATTATTTTGGATATTGCTCGAAAATACATTCACTCTAAAAGGGACAACATAAGGTCCAAGCTAACAAAGGACTTGAGATATCCACGCCCATATTGGATCACAGACCAAACAACATGG
GATGAACTTATAAAGGATGCCAAGTTTAAAAGGAAGTGCCATAATAATCCAAATTACATCCCATCTGCACGAGAAGGAGGTAAAAGACGTCTTCGTGATACAACAAAAGCGACTAAAGCTAGGGTGTCAAGTATTGGATCCCACAAATTAGGATCTGGTGGGTACAATAGCATTCGTGGCAACTTGGTAAGTGATATTTT
TTCATTTACTTTATCCTCTATTTGAAAATAAATTTGGAAATTTATGAGCAAGTTGTATTTATGAGTAATTATAAAATACGAATTTGATTACTTTTGTTCATGAAGGTTCATCAATTTGAAAAGGAAGCTTCAGAGGAGGATTTGAAATATGCCTTATTACATGGTTCTCGAGGCCTCCAACAACATATGCTAGATCGAGG
GGAGAAATTGATCACTGGGCATACATCTGATgtaagttatttagaaattttgatgaattatgtgataagttaattaaatatagtatgttaaaataacaagttaaaatttgttgtgtatgaaagGACCAGCAACCAAACTCATTAGAAGAAGGATATATGAGTGAGAATGAGGAGATTCTAGAGGTACATGATGAAATGTT
TGTCGCACACAATGAATCAATTGCCATTCTTGAACCTCGGCAAGAAACCATCCTTCAATTCCAACAAAGCGGAGAAAAGGATAATGAGCATGCAACATCAACAATTAGAGTAGTGCCTCGTAGAAAGAGGACAAAAAGGAATAGGATTGATAACAATGATCTATAATAAGTTTCTATGATAGGTACATTTCAATCTTTTT
ATAACTCTTCCATTCGAACTTTGTCATCTCTTCATATCATTGGATTCTAGAACTATGCAATATGCCTTGAAATTTTTCATCTTGAGATGTTATGAGGATGGTGGTTTGGATTCTTTCATCATGAGTTATAAAATGTAGATAAATTGTAATATGTTATTCATTTTACATAAGTTTACATTAAATATATTTTTTGGTTTAAT
ATTTTACTCACTTATATATGTCTTGTTTATTGTAGGTTGCAAGAGAAACATCAAGAGTATGATGTGCTTTTGGTTGTCCATTTTTGAATGATAAAGGGAGCATTGCTAAGAAATTCTAGTTTCTTCATAATTTGTAATTAATTTATGGGGCATCTTCGCCACACTATCAAATTTTTCGCCACTATCAATTTTTTTGAGGA
TGTAGTGTTTGAGAAATGTAGCACGTCAATATTAAATAATCACTATGACATATCTATGTTATGTATTTTTTCCCATGGAGCAACTCTCCAATCATTTTATAAACTAAAAATGTTGAAAATAATTATAGTAATATTGTGATTCTAGTC
Intron 3 GTAACATCTT ... TTCCTTGTAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 64.29 | 5 | 7 | 11 |
| A2 | 40 | 3 | 1 | 3 |
| A3 | 42.86 | 2 | 2 | 1 |
| A4 | 20 | 2 | 1 | 0 |
| A5 | -1 | 0 | 0 | 0 |
| A6 | 25 | 3 | 2 | 0 |
| A7 | 14.63 | 35 | 5 | 7 |
| A8 | 14.94 | 37 | 6 | 7 |
| A9 | 9.28 | 44 | 2 | 7 |
| A10 | 2.5 | 39 | 0 | 2 |
>TRINITY_DN41732_c0_g1_i5 from sample A9 / Example spliced isoformTCGGGTGTGGTCCATTAGCTCGCTGTGTTTCCGCTTAATTATGTGATTCCAGTTTTGCCTCAGATCTGTGAAGTGCTTTGAAGCTGAAGGTAGCTGCATCAAAGCTGAAGGCGTAACTTGTGTAGATCAATGAGGTGCGTGGAGGCTGAAGGTAACTGAAGCATCAAAGCTGAAGGTGATAGTGTGGCTGGACAAACTGA
GCTGAAATTTGAGTAGAATTTTATTACACTATTGGCTAAGTGTATTTGGACAAAATGGCAGACCAGAATGTTCATAAGGGTACTCCAAGTTCTACTATGGGGGATTCACAACTGTTGAGTAATTTAATTGCGATGTTGAGCAATGGGCAAGGACAAGAAGTTACCATGATGGTGCAAGAGGCCATTTCTAAAGTCATTCC
ATCACCTAACATGCCCTTTAGTGCATCTGGTAGTATGCAAGAGGATGTTTCTAGAATAACTCCAACAAGATTGCAATCTATCAACAAGGACAATCATGCCACGCCCTCTACTTCTAAACTAGCAAATTTGCACACAACAATGACTACTAATGATCAATATCATAACATGCCTTCTACAACCAACATGGATCATTTGAGCA
TGCCGGCAACTATTAGGAGTACATCACAATTCAGAAATAATTTTTCAAATGTCGGCTCAGTCAGAATTCTCCCACCAACAACAAAACAAGTTTCCTTAAGGAGTCTCATAGAATCACAAGAAAGAATACTAAGGCTCCTATCGAATGCTCCTGAAAATGATCATATTAGGAAAGAATTACTTGAACAAATTCAGATATGG
GAGACGGAATTATTAGAAAGTGAAGGCCTTTGCTCGGATGAAATGGTTGCAAGAGAAACATCAAGAGTATGATGTGCTTTTGGTTGTCCATTTTTGAATGATAAAGGGAGCATTGCTAAGAAATTCTAGTTTCTTCATAATTTGTAATTAATTTATGGGGCATCTTCGCCACACTATCAAATTTTTCGCCACTATCAATT
TTTTTGAGGATGTAGTGTTTGAGAAATGTAGCACGTCAATATTAAATAATCACTATGACATATCTATGTTATGTATTTTTTCCCATGGAGCAACTCTCCAATCATTTTATAAACTAAAAATGTTGAAAATAATTATAGTAATATTGTGATTCTA
>TRINITY_DN41732_c0_g1_i11 from sample A9 / Example unspliced isoform:AATTTTATTACACTATTGGCTAAGTGTATTTGGACAAAATGGCAGACCAGGGTACTCCAAGTTCTACTATGGGGGATTCACAACTGTTGAGTAATTTAATTGCGATGTTGAGCAATGGGCAAGGACAAGAAGTTACCATGATGGTGCAAGAGGTGAGATTCAAAATTTTACTTTACAGTTTTAATTATCTCATGTTTTAT
ACTATATTGTTTTAATTTGTCCGTTTGTGATGCAGGCCATTTCTAAAGTCATTCCATCACCTAACATGCCCTTTAGTGCATCTGGTAGTATGCAAGAGgtaacatcttatcataggttttttgtgggtttaattaacttatttttcttattaataatatcatcttaatatttacttttttaccacatacaaaattactat
attaaatacaatgattgtgcatcttgttggcatgtaggatcctactatcctttttaatgcatcaagcattatggtagacataagattcaataatagatttatgtgggtttaactatgttattttaccatattatattattttaatatctgtgatttttccttgtagGATGTTTCTAGAATAACTCCAACAAGATTGCAAT
CTATCAACAAGGACAATCATGCCACGCCCTCTACTTCTAAACTAGCAAATTTGCACACAACAATGACTACTAATGATCAATATCATAACATGCCTTCTACAACCAACATGGATCATTTGAGCATGCCGGCAACTATTAGGAGTACATCACAATTCAGAAATAATTTTTCAAATGTCGGCTCAGTCAGAATTCTCCCACCA
ACAACAAAACAAGTTTCCTTAAGGAGTCTCATAGAATCACAAGAAAGAATACTAAGGCTCCTATCGAATGCTCCTGAAAATGATCATATTAGGAAAGAATTACTTGAACAAATTCAGATATGGGAGACGGAATTATTAGAAAGTGAAGGCCTTTGCTCGGATGAAATGGTTGCAAGAGAAACATCAAGAGTATGATGTGC
TTTTGGTTGTCCATTTTTGAATGATAAAGGGAGCATTGCTAAGAAATTCTAGTTTCTTCATAATTTGTAATTAATTTATGGGGCATCTTCGCCACACTATCAAATTTTTCGCCACTATCAATTTTTTTGAGGATGTAGTGTTTGAGAAATGTAGCACGTCAATATTAAATAATCACTATGACATATCTATGTTATGTATT
TTTTCCCATGGAGCAACTCTCCAATCATTTTATAAACTAAAAATGTTGAAAATAATTATAGTAATATTGTGATTCTA
Intron 4 GTACATTTCA ... TTTATTGTAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 69.23 | 2 | 7 | 2 |
| A2 | 50 | 2 | 3 | 1 |
| A3 | 36.84 | 6 | 6 | 1 |
| A4 | 0 | 2 | 0 | 0 |
| A5 | -1 | 0 | 0 | 0 |
| A6 | 47.83 | 6 | 2 | 9 |
| A7 | 41.67 | 42 | 20 | 40 |
| A8 | 38.81 | 41 | 21 | 31 |
| A9 | 32.54 | 57 | 13 | 42 |
| A10 | 32.43 | 50 | 16 | 32 |
>TRINITY_DN44193_c0_g1_i5 from sample A8 / Example spliced isoformTTTTCATACTTATTCTAGGCCTGCAAACCAAGGGGAAACATGGTTGTCCATCATGTGGGCCGAAATTGTTGTCTAGACAATCAAAAGATCTCAAGAAAATAGTGTATGATGAGTATAGACACTTCTTACCACAAAACCATCGCTATCGAGTGTGCGAGAAAAATAAGTTCAATGGAAAGGAGGAGGAAAAGAGGAAACCA
AAAAAGATGAACCCAGTAAGGTGGAAAGAAGCATATGAAAAAAGGGAAGGGAATGGATTTCCACTAGGAATGAAAAGACTATCCATTTTCTACAACTTAGAATATTATGAGCACCTCCCAATAGCTCACTTGTTTGATACTATGCACATTGGGAAAAATGTGGCTGAGTGCTTGTGGAAACACCTAAATGGAACCAACAT
TGAAGCACAATTAAGATTACGGAAGGACCTGCAAGTTGCCAATATGATGCCAAACCTTTGGTTGCATGAAAATAACTCATATGATCACGCTCCATGGATTTTTACATCAACGGAGAAAGCAAAAGTTATTGATATGATGAAAATCATAAGATTTCCTTCTGGTTTTGGTGCAACCTTTAAAAATTTATTCACAAGAGATG
GGTCAGAGCTCTCTGGACTAAAGACACATGATTGGCACAATTGGATAAAGGTAATGTGTAATATGCTAAACTTGTTTGGCAGCATAATTGCAATTTTTTCTATATTAATGATATTATATGACCATGTCTTGTTTAACACTGTTTTTTTAATGGTGATGTACTAGTATGTGTTGCCTGTAGCAATACCAAGCACATTCGAC
CATGGCATCACACAAACCATTTACAAATTATCAAAATATTTGAGGTGGGTCTCATCAAAAGAGATACACCAAGATGAATTGAAGTATTGGAAGAGGAACATTTCACTTTTGATGTGTGATATTCAAATGAACTTCCCTCCCAGCTTTTTCAATTCCCAAGAGCATTACCTTATACACCTAGTAGAAGAGATTGAACAATG
TGGTCCTATCCATATCCGTACAATGTGGCTTGTGGAGAGATATATGAAGGTTCTAAAAAATTTTGTGAGGCAAAGAGCTCGTCCTGAAGGGTCTATGGCTGAGGGGTACATGGCGTTTCAGACAATGGTTCATTTGAGTGAGTACTTACCTCAATTGCATATTGAAGCTCCACGATTATGGGGTGATAACCAACCTCAAT
TTTTTGAAGGGGAAAGATTAGAGGGTCAAGGATCTTCAAAGAGGATAAAAGGTATACTTAAATTCTCGTATCAATTGTTTTGATCCTAAATCTTGGAAATTTGGATTTAACTATTGATTACTTGTACTTGTAGATGCTAAGGACTGGGAGTCATTACATTTGTATGTTGCATACAATTCTGAATTTATGTTAGACTGGAT
GGAGGAGTATAATCAACAAAAGAAGTTAGAAGATGAAAAGGCATGGGCTGATATATATAATAGACATGGTCATAACACTGCTCGAGGTCTCCCTGCGAGCCATAAAAGAAAATGGCCAGATAGATGCACGTGGAATTGGCTAAAAACCAATGTTGAACATGAGGCAACAAAGAGGAAGCACCGTGTGACTCAACAACAAC
TTGATTTCGTTAAAGGATCTACAAATGGGGAGGTAATAAAAAAATATAAACATATTAAAGGTGTTTACTAAACTTTTTCTTTGAACTATTTGTACCCTTGAATCTTATTAGTTAATATGTATATGAATTCAGGTATCATACTACAAAGGAATGTGGAATAATGGTCATCATTTTCGTATCAGAAAGGTTGATGAGAATCG
ACAAACTTATGATTGTGGAGTATCAGCATCGTTTGAGGTGGATTCTCGTTCACATGCATATGATAGACACCCAATCACAAGCATACTTTGTTATTATGGAGTGTTGGAGGATATCATAGAGCTCAATTTCATGTCTTTCAAAAAAGTTCTTTTTCGTGTTGAATGGTACAAGCTCATCAAAGTCGGCCCAGAAAAAACCA
TCATCTTGCACAATAATGGGTTCAATATGATCAATACATCTAGGTTTGAAGCCACTTCTGAACCTTATGTGTTTCCAAATCAATGTGACCAAATATTTCTTGTTCCAAATTTAGAACAACCTGGTTGGTCATTTGTGATTGATTATGATCCAAGAGGACGGAGAGTAACATTTGTTCAGGATGTAGAAAACCATGATTCG
TCTGAAGATTCAGAAGATTTGTCTGAATATGTAGATGAAGAAGATGAAGATGTTGATAATTTGAGTATTGATAATGAATATGATCAAGATGAAGACACTGATGATTTTATTGAAGTGCAAGAAGGACAAGAACAACATCATGGGTATCATGTACATGAAGATGACGAATTTATTGATTTTGATTTACATATAGATGAAGG
GGATGAAGACCATGAGAACATATGGTACTAATTTATTTGTGGATTCAGGCCTAGTAATGATGATGTAATTATTCCTTTATATGAGGAAATTTCACATGATGATGAAATGGTTTGGTTTCCATCCTCACTTTAAAATGGTTTTTAGAAAATAATGGAATATAATTAATTCTATAGAAAATGAATATTGTGTATGTTTTGTT
TATGAATCAAACACAATCGAAATAATATTGTTAAAAGTTTTTGAGTGGTGTTTTAGTGGATGTTTATGATGTCAAGGTAAATAGTTGGCATACCTTCTCAATTGGATAAAAAAAATTCATATTAATTTGTATTTCTCTAATAATTTGCTTGAAGCACACATTTGATTTTGTGGGTATAGGGAATCTACCACACTCCAATG
CTTTAATTTAAATGTTGAAAAGTTTGATGCAATCAACACCTATGTACGAAAACTGTAATACAATAAAGATAAGAAATAAAAGTAAAAACCTTAAAATTTGATTATTGTTTATAATTTTTTCGTTTGAAAATGTATTCAAAATTATTTTGGTCAAGTTTTTGTTTGAGTGTTAGTAAACTTGTCTTATGATAATGATATCA
TTTGGATATATATTTCAATTAATATGTTTTCATTTTAAGTATTTTGTTCTTTTGTAAGAATGTTCATAAGGGTACTCCAAGTTCTACTATGGGGGATTCACAACTGTTGAGTAATTTAATTGCGATGTTGAGCAATGGGCAAGGACAAGAAGTTACCATGATGGTGCAAGAGGTGAGATTCAAAATTTTACTTTACAGTT
TTAATTATCTCATGTTTTATACTATATTGTTTTAATTTGTCCGTTTGTGATGCAGGCCATTTCTAAAGTCATTCCATCACCTAACATGCCCTTTAGTGCATCTGGTAGTATGCAAGAGGATGTTTCTAGAATAACTCCAACAAGATTGCAATCTATCAACAAGGACAATCATGCCACGCCCTCTACTTCTAAACTAGCAA
ATTTGCACACAACAATGACTACTAATGATCAATATCATAACATGCCTTCTACAACCAACATGGATCATTTGAGCATGCCGGCAACTATTAGGAGTACATCACAATTCAGAAATAATTTTTCAAATGTCGGCTCAGTCAGAATTCTCCCACCAACAACAAAACAAGTTTCCTTAAGGAGTCTCATAGAATCACAAGAAAGA
ATACTAAGGCTCCTATCGAATGCTCCTGAAAATGATCATATTAGGAAAGAATTACTTGAACAAATTCAGATATGGGAGACGGAATTATTAGAAAGTGAAGGCCTTTGCTCGGATGAAATGGAAATAAATGACAATGTGATCCATATACCTATAGTGAAAAGTGCTTCAACCCCTAAGACTCCAACAGTTTCCTTGGTAAC
AACAAAGGGATTGAAAGAAGTCACAATCTTGCTAACATCTGAGGGAAATGTCTTGAAGGATGAAATGGGGTTAAAATTATACCATTTTATCTTCCGTCGTGCAGAGCAGTTGTTTGGTAATACAATCCAAGTGGATTGGAGGAAACAACTCCAAGTTAGGAAAGATGAACTCTTCAATGATGTCATTACAACCTTTGGGA
ATCCTGGATTTAATAAGGAAATTATTTTGGATATTGCTCGAAAATACATTCACTCTAAAAGGGACAACATAAGGTCCAAGCTAACAAAGGACTTGAGATATCCACGCCCATATTGGATCACAGACCAAACAACATGGGATGAACTTATAAAGGATGCCAAGTTTAAAAGGAAGTGCCATAATAATCCAAATTACATCCCA
TCTGCACGAGAAGGAGGTAAAAGACGTCTTCGTGATACAACAAAAGCGACTAAAGCTAGGGTGTCAAGTATTGGATCCCACAAATTAGGATCTGGTGGGTACAATAGCATTCGTGGCAACTTGGTAAGTGATATTTTTTCATTTACTTTATCCTCTATTTGAAAATAAATTTGGAAATTTATGAGCAAGTTGTATTTATG
AGTAATTATAAAATACGAATTTGATTACTTTTGTTCATGAAGGTTCATCAATTTGAAAAGGAAGCTTCAGAGGAGGATTTGAAATATGCCTTATTACATGGTTCTCGAGGCCTCCAACAACATATGCTAGATCGAGGGGAGAAATTGATCACTGGGCATACATCTGATGACCAGCAACCAAACTCATTAGAAGAAGGATA
TATGAGTGAGAATGAGGAGATTCTAGAGGTACATGATGAAATGTTTGTCGCACACAATGAATCAATTGCCATTCTTGAACCTCGGCAAGAAACCATCCTTCAATTCCAACAAAGCGGAGAAAAGGATAATGAGCATGCAACATCAACAATTAGAGTAGTGCCTCGTAGAAAGAGGACAAAAAGGAATAGGATTGATAACA
ATGATCTATAATAAGTTTCTATGATAGGTTGCAAGAGAAACATCAAGAGTATGATGTGCTTTTGGTTGTCCATTTTTGAATGATAAAGGGAGCATTGCTAAGAAATTCTAGTTTCTTCATAATTTGTAATTAATTTATGGGGCATCTTCGCCACACTATCAAATTTTTCGCCACTATCAATTTTTTTGAGGATGTAGTGT
TTGAGAAATGTAGCACGTCAATATTAAATAATCACTATGACATATCTATGTTATGTATTTTTTCCCATGGAGCAACTCTCCAATCATTTTATAAACTAAAAATGTTGAAAATAATTATAGTAATATTGTGATTCTAGTC
>TRINITY_DN44193_c0_g1_i21 from sample A8 / Example unspliced isoform:TTTTCATACTTATTCTAGGCCTGCAAACCAAGGGGAAACATGGTTGTCCATCATGTGGGCCGAAATTGTTGTCTAGACAATCAAAAGATCTCAAGAAAATAGTGTATGATGAGTATAGACACTTCTTACCACAAAACCATCGCTATCGAGTGTGCGAGAAAAATAAGTTCAATGGAAAGGAGGAGGAAAAGAGGAAACCA
AAAAAGATGAACCCAGTAAGGTGGAAAGAAGCATATGAAAAAAGGGAAGGGAATGGATTTCCACTAGGAATGAAAAGACTATCCATTTTCTACAACTTAGAATATTATGAGCACCTCCCAATAGCTCACTTGTTTGATACTATGCACATTGGGAAAAATGTGGCTGAGTGCTTGTGGAAACACCTAAATGGAACCAACAT
TGAAGCACAATTAAGATTACGGAAGGACCTGCAAGTTGCCAATATGATGCCAAACCTTTGGTTGCATGAAAATAACTCATATGATCACGCTCCATGGATTTTTACATCAACGGAGAAAGCAAAAGTTATTGATATGATGAAAATCATAAGATTTCCTTCTGGTTTTGGTGCAACCTTTAAAAATTTATTCACAAGAGATG
GGTCAGAGCTCTCTGGACTAAAGACACATGATTGGCACAATTGGATAAAGGTAATGTGTAATATGCTAAACTTGTTTGGCAGCATAATTGCAATTTTTTCTATATTAATGATATTATATGACCATGTCTTGTTTAACACTGTTTTTTTAATGGTGATGTACTAGTATGTGTTGCCTGTAGCAATACCAAGCACATTCGAC
CATGGCATCACACAAACCATTTACAAATTATCAAAATATTTGAGGTATTTGAATCTATCATGCATTCTTCAATAGATCAACTCTTATCCTTTGAATTATGTCATTTGTGATGTCTTTATACAGGTTTATACCTATAATTTTGACACAAATTAAAAATATTTATATTGTAGTGCATATTGACAATATTTGTAGGTGGGTCT
CATCAAAAGAGATACACCAAGATGAATTGAAGTATTGGAAGAGGAACATTTCACTTTTGATGTGTGATATTCAAATGAACTTCCCTCCCAGCTTTTTCAATTCCCAAGAGCATTACCTTATACACCTAGTAGAAGAGATTGAACAATGTGGTCCTATCCATATCCGTACAATGTGGCTTGTGGAGAGATATATGAAGGTT
CTAAAAAATTTTGTGAGGCAAAGAGCTCGTCCTGAAGGGTCTATGGCTGAGGGGTACATGGCGTTTCAGACAATGGTTCATTTGAGTGAGTACTTACCTCAATTGCATATTGAAGCTCCACGATTATGGGGTGATAACCAACCTCAATTTTTTGAAGGGGAAAGATTAGAGGGTCAAGGATCTTCAAAGAGGATAAAAGG
TATACTTAAATTCTCGTATCAATTGTTTTGATCCTAAATCTTGGAAATTTGGATTTAACTATTGATTACTTGTACTTGTAGATGCTAAGGACTGGGAGTCATTACATTTGTATGTTGCATACAATTCTGAATTTATGTTAGACTGGATGGAGGAGTATAATCAACAAAAGAAGTTAGAAGATGAAAAGGCATGGGCTGAT
ATATATAATAGACATGGTCATAACACTGCTCGAGGTCTCCCTGCGAGCCATAAAAGAAAATGGCCAGATAGATGCACGTGGAATTGGCTAAAAACCAATGTTGAACATGAGGCAACAAAGAGGAAGCACCGTGTGACTCAACAACAACTTGATTTCGTTAAAGGATCTACAAATGGGGAGGTAATAAAAAAATATAAACA
TATTAAAGGTGTTTACTAAACTTTTTCTTTGAACTATTTGTACCCTTGAATCTTATTAGTTAATATGTATATGAATTCAGGTATCATACTACAAAGGAATGTGGAATAATGGTCATCATTTTCGTATCAGAAAGGTTGATGAGAATCGACAAACTTATGATTGTGGAGTATCAGCATCGTTTGAGGTGGATTCTCGTTCA
CATGCATATGATAGACACCCAATCACAAGCATACTTTGTTATTATGGAGTGTTGGAGGATATCATAGAGCTCAATTTCATGTCTTTCAAAAAAGTTCTTTTTCGTGTTGAATGGTACAAGCTCATCAAAGTCGGCCCAGAAAAAACCATCATCTTGCACAATAATGGGTTCAATATGATCAATACATCTAGGTTTGAAGC
CACTTCTGAACCTTATGTGTTTCCAAATCAATGTGACCAAATATTTCTTGTTCCAAATTTAGAACAACCTGGTTGGTCATTTGTGATTGATTATGATCCAAGAGGACGGAGAGTAACATTTGTTCAGGATGTAGAAAACCATGATTCGTCTGAAGATTCAGAAGATTTGTCTGAATATGTAGATGAAGAAGATGAAGATG
TTGATAATTTGAGTATTGATAATGAATATGATCAAGATGAAGACACTGATGATTTTATTGAAGTGCAAGAAGGACAAGAACAACATCATGGGTATCATGTACATGAAGATGACGAATTTATTGATTTTGATTTACATATAGATGAAGGGGATGAAGACCATGAGAACATATGGTACTAATTTATTTGTGGATTCAGGCCT
AGTAATGATGATGTAATTATTCCTTTATATGAGGAAATTTCACATGATGATGAAATGGTTTGGTTTCCATCCTCACTTTAAAATGGTTTTTAGAAAATAATGGAATATAATTAATTCTATAGAAAATGAATATTGTGTATGTTTTGTTTATGAATCAAACACAATCGAAATAATATTGTTAAAAGTTTTTGAGTGGTGTT
TTAGTGGATGTTTATGATGTCAAGGTAAATAGTTGGCATACCTTCTCAATTGGATAAAAAAAATTCATATTAATTTGTATTTCTCTAATAATTTGCTTGAAGCACACATTTGATTTTGTGGGTATAGGGAATCTACCACACTCCAATGCTTTAATTTAAATGTTGAAAAGTTTGATGCAATCAACACCTATGTACGAAAA
CTGTAATACAATAAAGATAAGAAATAAAAGTAAAAACCTTAAAATTTGATTATTGTTTATAATTTTTTCGTTTGAAAATGTATTCAAAATTATTTTGGTCAAGTTTTTGTTTGAGTGTTAGTAAACTTGTCTTATGATAATGATATCATTTGGATATATTTCAATTAATATGTTTTCATTTTAAGTATTTTGTTCTTTTG
TAAGAATGTTCATAAGGGTACTCCAAGTTCTACTATGGGGGATTCACAACTGTTGAGTAATTTAATTGCGATGTTGAGCAATGGGCAAGGACAAGAAGTTACCATGATGGTGCAAGAGGCCATTTCTAAAGTCATTCCATCACCTAACATGCCCTTTAGTGCATCTGGTAGTATGCAAGAGGATGTTTCTAGAATAACTC
CAACAAGATTGCAATCTATCAACAAGGACAATCATGCCACGCCCTCTACTTCTAAACTAGCAAATTTGCACACAACAATGACTACTAATGATCAATATCATAACATGCCTTCTACAACCAACATGGATCATTTGAGCATGCCGGCAACTATTAGGAGTACATCACAATTCAGAAATAATTTTTCAAATGTCGGCTCAGTC
AGAATTCTCCCACCAACAACAAAACAAGTTTCCTTAAGGAGTCTCATAGAATCACAAGAAAGAATACTAAGGCTCCTATCGAATGCTCCTGAAAATGATCATATTAGGAAAGAATTACTTGAACAAATTCAGATATGGGAGACGGAATTATTAGAAAGTGAAGGCCTTTGCTCGGATGAAATGGAAATAAATGACAATGT
GATCCATATACCTATAGTGAAAAGTGCTTCAACCCCTAAGACTCCAACAGTTTCCTTGGTAACAACAAAGGGATTGAAAGAAGTCACAATCTTGCTAACATCTGAGGGAAATGTCTTGAAGGATGAAATGGGGTTAAAATTATACCATTTTATCTTCCGTCGTGCAGAGCAGTTGTTTGGTAATACAATCCAAGTGGATT
GGAGGAAACAACTCCAAGTTAGGAAAGATGAACTCTTCAATGATGTCATTACAACCTTTGGGAATCCTGGATTTAATAAGGAAATTATTTTGGATATTGCTCGAAAATACATTCACTCTAAAAGGGACAACATAAGGTCCAAGCTAACAAAGGACTTGAGATATCCACGCCCATATTGGATCACAGACCAAACAACATGG
GATGAACTTATAAAGGATGCCAAGTTTAAAAGGAAGTGCCATAATAATCCAAATTACATCCCATCTGCACGAGAAGGAGGTAAAAGACGTCTTCGTGATACAACAAAAGCGACTAAAGCTAGGGTGTCAAGTATTGGATCCCACAAATTAGGATCTGGTGGGTACAATAGCATTCGTGGCAACTTGGTAAGTGATATTTT
TTCATTTACTTTATCCTCTATTTGAAAATAAATTTGGAAATTTATGAGCAAGTTGTATTTATGAGTAATTATAAAATACGAATTTGATTACTTTTGTTCATGAAGGTTCATCAATTTGAAAAGGAAGCTTCAGAGGAGGATTTGAAATATGCCTTATTACATGGTTCTCGAGGCCTCCAACAACATATGCTAGATCGAGG
GGAGAAATTGATCACTGGGCATACATCTGATGTAAGTTATTTAGAAATTTTGATGAATTATGTGATAAGTTAATTAAATATAGTATGTTAAAATAACAAGTTAAAATTTGTTGTGTATGAAAGGACCAGCAACCAAACTCATTAGAAGAAGGATATATGAGTGAGAATGAGGAGATTCTAGAGGTACATGATGAAATGTT
TGTCGCACACAATGAATCAATTGCCATTCTTGAACCTCGGCAAGAAACCATCCTTCAATTCCAACAAAGCGGAGAAAAGGATAATGAGCATGCAACATCAACAATTAGAGTAGTGCCTCGTAGAAAGAGGACAAAAAGGAATAGGATTGATAACAATGATCTATAATAAGTTTCTATGATAGgtacatttcaatcttttt
ataactcttccattcgaactttgtcatctcttcatatcattggattctagaactatgcaatatgccttgaaatttttcatcttgagatgttatgaggatggtggtttggattctttcatcatgagttataaaatgtagataaattgtaatatgttattcattttacataagtttacattaaatatattttttggtttaat
attttactcacttatatatgtcttgtttattgtagGTTGCAAGAGAAACATCAAGAGTATGATGTGCTTTTGGTTGTCCATTTTTGAATGATAAAGGGAGCATTGCTAAGAAATTCTAGTTTCTTCATAATTTGTAATTAATTTATGGGGCATCTTCGCCACACTATCAAATTTTTCGCCACTATCAATTTTTTTGAGGA
TGTAGTGTTTGAGAAATGTAGCACGTCAATATTAAATAATCACTATGACATATCTATGTTATGTATTTTTTCCCATGGAGCAACTCTCCAATCATTTTATAAACTAAAAATGTTGAAAATAATTATAGTAATATTGTGATTCTAGTC
Intron 5 GTATTTGAAT ... ATATTTGTAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 74.29 | 2.2 | 10 | 2 |
| A2 | 100 | 0 | 0 | 3 |
| A3 | 60 | 1 | 3 | 0 |
| A4 | 100 | 0 | 3 | 3 |
| A5 | -1 | 0 | 0 | 0 |
| A6 | -1 | 0 | 0 | 0 |
| A7 | 75 | 1 | 6 | 0 |
| A8 | 40 | 3 | 2 | 2 |
| A9 | 61.91 | 1.6 | 3 | 2 |
| A10 | 45.45 | 3 | 1 | 4 |
>TRINITY_DN44193_c0_g1_i5 from sample A8 / Example spliced isoformTTTTCATACTTATTCTAGGCCTGCAAACCAAGGGGAAACATGGTTGTCCATCATGTGGGCCGAAATTGTTGTCTAGACAATCAAAAGATCTCAAGAAAATAGTGTATGATGAGTATAGACACTTCTTACCACAAAACCATCGCTATCGAGTGTGCGAGAAAAATAAGTTCAATGGAAAGGAGGAGGAAAAGAGGAAACCA
AAAAAGATGAACCCAGTAAGGTGGAAAGAAGCATATGAAAAAAGGGAAGGGAATGGATTTCCACTAGGAATGAAAAGACTATCCATTTTCTACAACTTAGAATATTATGAGCACCTCCCAATAGCTCACTTGTTTGATACTATGCACATTGGGAAAAATGTGGCTGAGTGCTTGTGGAAACACCTAAATGGAACCAACAT
TGAAGCACAATTAAGATTACGGAAGGACCTGCAAGTTGCCAATATGATGCCAAACCTTTGGTTGCATGAAAATAACTCATATGATCACGCTCCATGGATTTTTACATCAACGGAGAAAGCAAAAGTTATTGATATGATGAAAATCATAAGATTTCCTTCTGGTTTTGGTGCAACCTTTAAAAATTTATTCACAAGAGATG
GGTCAGAGCTCTCTGGACTAAAGACACATGATTGGCACAATTGGATAAAGGTAATGTGTAATATGCTAAACTTGTTTGGCAGCATAATTGCAATTTTTTCTATATTAATGATATTATATGACCATGTCTTGTTTAACACTGTTTTTTTAATGGTGATGTACTAGTATGTGTTGCCTGTAGCAATACCAAGCACATTCGAC
CATGGCATCACACAAACCATTTACAAATTATCAAAATATTTGAGGTGGGTCTCATCAAAAGAGATACACCAAGATGAATTGAAGTATTGGAAGAGGAACATTTCACTTTTGATGTGTGATATTCAAATGAACTTCCCTCCCAGCTTTTTCAATTCCCAAGAGCATTACCTTATACACCTAGTAGAAGAGATTGAACAATG
TGGTCCTATCCATATCCGTACAATGTGGCTTGTGGAGAGATATATGAAGGTTCTAAAAAATTTTGTGAGGCAAAGAGCTCGTCCTGAAGGGTCTATGGCTGAGGGGTACATGGCGTTTCAGACAATGGTTCATTTGAGTGAGTACTTACCTCAATTGCATATTGAAGCTCCACGATTATGGGGTGATAACCAACCTCAAT
TTTTTGAAGGGGAAAGATTAGAGGGTCAAGGATCTTCAAAGAGGATAAAAGGTATACTTAAATTCTCGTATCAATTGTTTTGATCCTAAATCTTGGAAATTTGGATTTAACTATTGATTACTTGTACTTGTAGATGCTAAGGACTGGGAGTCATTACATTTGTATGTTGCATACAATTCTGAATTTATGTTAGACTGGAT
GGAGGAGTATAATCAACAAAAGAAGTTAGAAGATGAAAAGGCATGGGCTGATATATATAATAGACATGGTCATAACACTGCTCGAGGTCTCCCTGCGAGCCATAAAAGAAAATGGCCAGATAGATGCACGTGGAATTGGCTAAAAACCAATGTTGAACATGAGGCAACAAAGAGGAAGCACCGTGTGACTCAACAACAAC
TTGATTTCGTTAAAGGATCTACAAATGGGGAGGTAATAAAAAAATATAAACATATTAAAGGTGTTTACTAAACTTTTTCTTTGAACTATTTGTACCCTTGAATCTTATTAGTTAATATGTATATGAATTCAGGTATCATACTACAAAGGAATGTGGAATAATGGTCATCATTTTCGTATCAGAAAGGTTGATGAGAATCG
ACAAACTTATGATTGTGGAGTATCAGCATCGTTTGAGGTGGATTCTCGTTCACATGCATATGATAGACACCCAATCACAAGCATACTTTGTTATTATGGAGTGTTGGAGGATATCATAGAGCTCAATTTCATGTCTTTCAAAAAAGTTCTTTTTCGTGTTGAATGGTACAAGCTCATCAAAGTCGGCCCAGAAAAAACCA
TCATCTTGCACAATAATGGGTTCAATATGATCAATACATCTAGGTTTGAAGCCACTTCTGAACCTTATGTGTTTCCAAATCAATGTGACCAAATATTTCTTGTTCCAAATTTAGAACAACCTGGTTGGTCATTTGTGATTGATTATGATCCAAGAGGACGGAGAGTAACATTTGTTCAGGATGTAGAAAACCATGATTCG
TCTGAAGATTCAGAAGATTTGTCTGAATATGTAGATGAAGAAGATGAAGATGTTGATAATTTGAGTATTGATAATGAATATGATCAAGATGAAGACACTGATGATTTTATTGAAGTGCAAGAAGGACAAGAACAACATCATGGGTATCATGTACATGAAGATGACGAATTTATTGATTTTGATTTACATATAGATGAAGG
GGATGAAGACCATGAGAACATATGGTACTAATTTATTTGTGGATTCAGGCCTAGTAATGATGATGTAATTATTCCTTTATATGAGGAAATTTCACATGATGATGAAATGGTTTGGTTTCCATCCTCACTTTAAAATGGTTTTTAGAAAATAATGGAATATAATTAATTCTATAGAAAATGAATATTGTGTATGTTTTGTT
TATGAATCAAACACAATCGAAATAATATTGTTAAAAGTTTTTGAGTGGTGTTTTAGTGGATGTTTATGATGTCAAGGTAAATAGTTGGCATACCTTCTCAATTGGATAAAAAAAATTCATATTAATTTGTATTTCTCTAATAATTTGCTTGAAGCACACATTTGATTTTGTGGGTATAGGGAATCTACCACACTCCAATG
CTTTAATTTAAATGTTGAAAAGTTTGATGCAATCAACACCTATGTACGAAAACTGTAATACAATAAAGATAAGAAATAAAAGTAAAAACCTTAAAATTTGATTATTGTTTATAATTTTTTCGTTTGAAAATGTATTCAAAATTATTTTGGTCAAGTTTTTGTTTGAGTGTTAGTAAACTTGTCTTATGATAATGATATCA
TTTGGATATATATTTCAATTAATATGTTTTCATTTTAAGTATTTTGTTCTTTTGTAAGAATGTTCATAAGGGTACTCCAAGTTCTACTATGGGGGATTCACAACTGTTGAGTAATTTAATTGCGATGTTGAGCAATGGGCAAGGACAAGAAGTTACCATGATGGTGCAAGAGGTGAGATTCAAAATTTTACTTTACAGTT
TTAATTATCTCATGTTTTATACTATATTGTTTTAATTTGTCCGTTTGTGATGCAGGCCATTTCTAAAGTCATTCCATCACCTAACATGCCCTTTAGTGCATCTGGTAGTATGCAAGAGGATGTTTCTAGAATAACTCCAACAAGATTGCAATCTATCAACAAGGACAATCATGCCACGCCCTCTACTTCTAAACTAGCAA
ATTTGCACACAACAATGACTACTAATGATCAATATCATAACATGCCTTCTACAACCAACATGGATCATTTGAGCATGCCGGCAACTATTAGGAGTACATCACAATTCAGAAATAATTTTTCAAATGTCGGCTCAGTCAGAATTCTCCCACCAACAACAAAACAAGTTTCCTTAAGGAGTCTCATAGAATCACAAGAAAGA
ATACTAAGGCTCCTATCGAATGCTCCTGAAAATGATCATATTAGGAAAGAATTACTTGAACAAATTCAGATATGGGAGACGGAATTATTAGAAAGTGAAGGCCTTTGCTCGGATGAAATGGAAATAAATGACAATGTGATCCATATACCTATAGTGAAAAGTGCTTCAACCCCTAAGACTCCAACAGTTTCCTTGGTAAC
AACAAAGGGATTGAAAGAAGTCACAATCTTGCTAACATCTGAGGGAAATGTCTTGAAGGATGAAATGGGGTTAAAATTATACCATTTTATCTTCCGTCGTGCAGAGCAGTTGTTTGGTAATACAATCCAAGTGGATTGGAGGAAACAACTCCAAGTTAGGAAAGATGAACTCTTCAATGATGTCATTACAACCTTTGGGA
ATCCTGGATTTAATAAGGAAATTATTTTGGATATTGCTCGAAAATACATTCACTCTAAAAGGGACAACATAAGGTCCAAGCTAACAAAGGACTTGAGATATCCACGCCCATATTGGATCACAGACCAAACAACATGGGATGAACTTATAAAGGATGCCAAGTTTAAAAGGAAGTGCCATAATAATCCAAATTACATCCCA
TCTGCACGAGAAGGAGGTAAAAGACGTCTTCGTGATACAACAAAAGCGACTAAAGCTAGGGTGTCAAGTATTGGATCCCACAAATTAGGATCTGGTGGGTACAATAGCATTCGTGGCAACTTGGTAAGTGATATTTTTTCATTTACTTTATCCTCTATTTGAAAATAAATTTGGAAATTTATGAGCAAGTTGTATTTATG
AGTAATTATAAAATACGAATTTGATTACTTTTGTTCATGAAGGTTCATCAATTTGAAAAGGAAGCTTCAGAGGAGGATTTGAAATATGCCTTATTACATGGTTCTCGAGGCCTCCAACAACATATGCTAGATCGAGGGGAGAAATTGATCACTGGGCATACATCTGATGACCAGCAACCAAACTCATTAGAAGAAGGATA
TATGAGTGAGAATGAGGAGATTCTAGAGGTACATGATGAAATGTTTGTCGCACACAATGAATCAATTGCCATTCTTGAACCTCGGCAAGAAACCATCCTTCAATTCCAACAAAGCGGAGAAAAGGATAATGAGCATGCAACATCAACAATTAGAGTAGTGCCTCGTAGAAAGAGGACAAAAAGGAATAGGATTGATAACA
ATGATCTATAATAAGTTTCTATGATAGGTTGCAAGAGAAACATCAAGAGTATGATGTGCTTTTGGTTGTCCATTTTTGAATGATAAAGGGAGCATTGCTAAGAAATTCTAGTTTCTTCATAATTTGTAATTAATTTATGGGGCATCTTCGCCACACTATCAAATTTTTCGCCACTATCAATTTTTTTGAGGATGTAGTGT
TTGAGAAATGTAGCACGTCAATATTAAATAATCACTATGACATATCTATGTTATGTATTTTTTCCCATGGAGCAACTCTCCAATCATTTTATAAACTAAAAATGTTGAAAATAATTATAGTAATATTGTGATTCTAGTC
>TRINITY_DN44193_c0_g1_i16 from sample A8 / Example unspliced isoform:TTTTCATACTTATTCTAGGCCTGCAAACCAAGGGGAAACATGGTTGTCCATCATGTGGGCCGAAATTGTTGTCTAGACAATCAAAAGATCTCAAGAAAATAGTGTATGATGAGTATAGACACTTCTTACCACAAAACCATCGCTATCGAGTGTGCGAGAAAAATAAGTTCAATGGAAAGGAGGAGGAAAAGAGGAAACCA
AAAAAGATGAACCCAGTAAGGTGGAAAGAAGCATATGAAAAAAGGGAAGGGAATGGATTTCCACTAGGAATGAAAAGACTATCCATTTTCTACAACTTAGAATATTATGAGCACCTCCCAATAGCTCACTTGTTTGATACTATGCACATTGGGAAAAATGTGGCTGAGTGCTTGTGGAAACACCTAAATGGAACCAACAT
TGAAGCACAATTAAGATTACGGAAGGACCTGCAAGTTGCCAATATGATGCCAAACCTTTGGTTGCATGAAAATAACTCATATGATCACGCTCCATGGATTTTTACATCAACGGAGAAAGCAAAAGTTATTGATATGATGAAAATCATAAGATTTCCTTCTGGTTTTGGTGCAACCTTTAAAAATTTATTCACAAGAGATG
GGTCAGAGCTCTCTGGACTAAAGACACATGATTGGCACAATTGGATAAAGGTAATGTGTAATATGCTAAACTTGTTTGGCAGCATAATTGCAATTTTTTCTATATTAATGATATTATATGACCATGTCTTGTTTAACACTGTTTTTTTAATGGTGATGTACTAGTATGTGTTGCCTGTAGCAATACCAAGCACATTCGAC
CATGGCATCACACAAACCATTTACAAATTATCAAAATATTTGAGgtatttgaatctatcatgcattcttcaatagatcaactcttatcctttgaattatgtcatttgtgatgtctttatacaggtttatacctataattttgacacaaattaaaaatatttatattgtagtgcatattgacaatatttgtagGTGGGTCT
CATCAAAAGAGATACACCAAGATGAATTGAAGTATTGGAAGAGGAACATTTCACTTTTGATGTGTGATATTCAAATGAACTTCCCTCCCAGCTTTTTCAATTCCCAAGAGCATTACCTTATACACCTAGTAGAAGAGATTGAACAATGTGGTCCTATCCATATCCGTACAATGTGGCTTGTGGAGAGATATATGAAGGTT
CTAAAAAATTTTGTGAGGCAAAGAGCTCGTCCTGAAGGGTCTATGGCTGAGGGGTACATGGCGTTTCAGACAATGGTTCATTTGAGTGAGTACTTACCTCAATTGCATATTGAAGCTCCACGATTATGGGGTGATAACCAACCTCAATTTTTTGAAGGGGAAAGATTAGAGGGTCAAGGATCTTCAAAGAGGATAAAAGG
TATACTTAAATTCTCGTATCAATTGTTTTGATCCTAAATCTTGGAAATTTGGATTTAACTATTGATTACTTGTACTTGTAGATGCTAAGGACTGGGAGTCATTACATTTGTATGTTGCATACAATTCTGAATTTATGTTAGACTGGATGGAGGAGTATAATCAACAAAAGAAGTTAGAAGATGAAAAGGCATGGGCTGAT
ATATATAATAGACATGGTCATAACACTGCTCGAGGTCTCCCTGCGAGCCATAAAAGAAAATGGCCAGATAGATGCACGTGGAATTGGCTAAAAACCAATGTTGAACATGAGGCAACAAAGAGGAAGCACCGTGTGACTCAACAACAACTTGATTTCGTTAAAGGATCTACAAATGGGGAGGTAATAAAAAAATATAAACA
TATTAAAGGTGTTTACTAAACTTTTTCTTTGAACTATTTGTACCCTTGAATCTTATTAGTTAATATGTATATGAATTCAGGTATCATACTACAAAGGAATGTGGAATAATGGTCATCATTTTCGTATCAGAAAGGTTGATGAGAATCGACAAACTTATGATTGTGGAGTATCAGCATCGTTTGAGGTGGATTCTCGTTCA
CATGCATATGATAGACACCCAATCACAAGCATACTTTGTTATTATGGAGTGTTGGAGGATATCATAGAGCTCAATTTCATGTCTTTCAAAAAAGTTCTTTTTCGTGTTGAATGGTACAAGCTCATCAAAGTCGGCCCAGAAAAAACCATCATCTTGCACAATAATGGGTTCAATATGATCAATACATCTAGGTTTGAAGC
CACTTCTGAACCTTATGTGTTTCCAAATCAATGTGACCAAATATTTCTTGTTCCAAATTTAGAACAACCTGGTTGGTCATTTGTGATTGATTATGATCCAAGAGGACGGAGAGTAACATTTGTTCAGGATGTAGAAAACCATGATTCGTCTGAAGATTCAGAAGATTTGTCTGAATATGTAGATGAAGAAGATGAAGATG
TTGATAATTTGAGTATTGATAATGAATATGATCAAGATGAAGACACTGATGATTTTATTGAAGTGCAAGAAGGACAAGAACAACATCATGGGTATCATGTACATGAAGATGACGAATTTATTGATTTTGATTTACATATAGATGAAGGGGATGAAGACCATGAGAACATATGGTACTAATTTATTTGTGGATTCAGGCCT
AGTAATGATGATGTAATTATTCCTTTATATGAGGAAATTTCACATGATGATGAAATGGTTTGGTTTCCATCCTCACTTTAAAATGGTTTTTAGAAAATAATGGAATATAATTAATTCTATAGAAAATGAATATTGTGTATGTTTTGTTTATGAATCAAACACAATCGAAATAATATTGTTAAAAGTTTTTGAGTGGTGTT
TTAGTGGATGTTTATGATGTCAAGGTAAATAGTTGGCATACCTTCTCAATTGGATAAAAAAAATTCATATTAATTTGTATTTCTCTAATAATTTGCTTGAAGCACACATTTGATTTTGTGGGTATAGGGAATCTACCACACTCCAATGCTTTAATTTAAATGTTGAAAAGTTTGATGCAATCAACACCTATGTACGAAAA
CTGTAATACAATAAAGATAAGAAATAAAAGTAAAAACCTTAAAATTTGATTATTGTTTATAATTTTTTCGTTTGAAAATGTATTCAAAATTATTTTGGTCAAGTTTTTGTTTGAGTGTTAGTAAACTTGTCTTATGATAATGATATCATTTGGATATATATTTCAATTAATATGTTTTCATTTTAAGTATTTTGTTCTTT
TGTAAGAATGTTCATAAGGGTACTCCAAGTTCTACTATGGGGGATTCACAACTGTTGAGTAATTTAATTGCGATGTTGAGCAATGGGCAAGGACAAGAAGTTACCATGATGGTGCAAGAGGTGAGATTCAAAATTTTACTTTACAGTTTTAATTATCTCATGTTTTATACTATATTGTTTTAATTTGTCCGTTTGTGATG
CAGGCCATTTCTAAAGTCATTCCATCACCTAACATGCCCTTTAGTGCATCTGGTAGTATGCAAGAGGATGTTTCTAGAATAACTCCAACAAGATTGCAATCTATCAACAAGGACAATCATGCCACGCCCTCTACTTCTAAACTAGCAAATTTGCACACAACAATGACTACTAATGATCAATATCATAACATGCCTTCTAC
AACCAACATGGATCATTTGAGCATGCCGGCAACTATTAGGAGTACATCACAATTCAGAAATAATTTTTCAAATGTCGGCTCAGTCAGAATTCTCCCACCAACAACAAAACAAGTTTCCTTAAGGAGTCTCATAGAATCACAAGAAAGAATACTAAGGCTCCTATCGAATGCTCCTGAAAATGATCATATTAGGAAAGAAT
TACTTGAACAAATTCAGATATGGGAGACGGAATTATTAGAAAGTGAAGGCCTTTGCTCGGATGAAATGGAAATAAATGACAATGTGATCCATATACCTATAGTGAAAAGTGCTTCAACCCCTAAGACTCCAACAGTTTCCTTGGTAACAACAAAGGGATTGAAAGAAGTCACAATCTTGCTAACATCTGAGGGAAATGTC
TTGAAGGATGAAATGGGGTTAAAATTATACCATTTTATCTTCCGTCGTGCAGAGCAGTTGTTTGGTAATACAATCCAAGTGGATTGGAGGAAACAACTCCAAGTTAGGAAAGATGAACTCTTCAATGATGTCATTACAACCTTTGGGAATCCTGGATTTAATAAGGAAATTATTTTGGATATTGCTCGAAAATACATTCA
CTCTAAAAGGGACAACATAAGGTCCAAGCTAACAAAGGACTTGAGATATCCACGCCCATATTGGATCACAGACCAAACAACATGGGATGAACTTATAAAGGATGCCAAGTTTAAAAGGAAGTGCCATAATAATCCAAATTACATCCCATCTGCACGAGAAGGAGGTAAAAGACGTCTTCGTGATACAACAAAAGCGACTA
AAGCTAGGGTGTCAAGTATTGGATCCCACAAATTAGGATCTGGTGGGTACAATAGCATTCGTGGCAACTTGGTAAGTGATATTTTTTCATTTACTTTATCCTCTATTTGAAAATAAATTTGGAAATTTATGAGCAAGTTGTATTTATGAGTAATTATAAAATACGAATTTGATTACTTTTGTTCATGAAGGTTCATCAAT
TTGAAAAGGAAGCTTCAGAGGAGGATTTGAAATATGCCTTATTACATGGTTCTCGAGGCCTCCAACAACATATGCTAGATCGAGGGGAGAAATTGATCACTGGGCATACATCTGATGACCAGCAACCAAACTCATTAGAAGAAGGATATATGAGTGAGAATGAGGAGATTCTAGAGGTACATGATGAAATGTTTGTCGCA
CACAATGAATCAATTGCCATTCTTGAACCTCGGCAAGAAACCATCCTTCAATTCCAACAAAGCGGAGAAAAGGATAATGAGCATGCAACATCAACAATTAGAGTAGTGCCTCGTAGAAAGAGGACAAAAAGGAATAGGATTGATAACAATGATCTATAATAAGTTTCTATGATAGGTTGCAAGAGAAACATCAAGAGTAT
GATGTGCTTTTGGTTGTCCATTTTTGAATGATAAAGGGAGCATTGCTAAGAAATTCTAGTTTCTTCATAATTTGTAATTAATTTATGGGGCATCTTCGCCACACTATCAAATTTTTCGCCACTATCAATTTTTTTGAGGATGTAGTGTTTGAGAAATGTAGCACGTCAATATTAAATAATCACTATGACATATCTATGTT
ATGTATTTTTTCCCATGGAGCAACTCTCCAATCATTTTATAAACTAAAAATGTTGAAAATAATTATAGTAATATTGTGATTCTAGTC
Intron 6 GTAAATATTA ... GTTATTGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 46.67 | 8 | 5 | 9 |
| A2 | 16.67 | 5 | 2 | 0 |
| A3 | 60 | 1 | 0 | 3 |
| A4 | 50 | 3 | 6 | 0 |
| A5 | 0 | 3 | 0 | 0 |
| A6 | 100 | 0 | 2 | 0 |
| A7 | 31.15 | 21 | 5 | 14 |
| A8 | 22.58 | 12 | 5 | 2 |
| A9 | 21.52 | 31 | 9 | 8 |
| A10 | 18.64 | 48 | 7 | 15 |
>TRINITY_DN44193_c0_g1_i5 from sample A8 / Example spliced isoformTTTTCATACTTATTCTAGGCCTGCAAACCAAGGGGAAACATGGTTGTCCATCATGTGGGCCGAAATTGTTGTCTAGACAATCAAAAGATCTCAAGAAAATAGTGTATGATGAGTATAGACACTTCTTACCACAAAACCATCGCTATCGAGTGTGCGAGAAAAATAAGTTCAATGGAAAGGAGGAGGAAAAGAGGAAACCA
AAAAAGATGAACCCAGTAAGGTGGAAAGAAGCATATGAAAAAAGGGAAGGGAATGGATTTCCACTAGGAATGAAAAGACTATCCATTTTCTACAACTTAGAATATTATGAGCACCTCCCAATAGCTCACTTGTTTGATACTATGCACATTGGGAAAAATGTGGCTGAGTGCTTGTGGAAACACCTAAATGGAACCAACAT
TGAAGCACAATTAAGATTACGGAAGGACCTGCAAGTTGCCAATATGATGCCAAACCTTTGGTTGCATGAAAATAACTCATATGATCACGCTCCATGGATTTTTACATCAACGGAGAAAGCAAAAGTTATTGATATGATGAAAATCATAAGATTTCCTTCTGGTTTTGGTGCAACCTTTAAAAATTTATTCACAAGAGATG
GGTCAGAGCTCTCTGGACTAAAGACACATGATTGGCACAATTGGATAAAGGTAATGTGTAATATGCTAAACTTGTTTGGCAGCATAATTGCAATTTTTTCTATATTAATGATATTATATGACCATGTCTTGTTTAACACTGTTTTTTTAATGGTGATGTACTAGTATGTGTTGCCTGTAGCAATACCAAGCACATTCGAC
CATGGCATCACACAAACCATTTACAAATTATCAAAATATTTGAGGTGGGTCTCATCAAAAGAGATACACCAAGATGAATTGAAGTATTGGAAGAGGAACATTTCACTTTTGATGTGTGATATTCAAATGAACTTCCCTCCCAGCTTTTTCAATTCCCAAGAGCATTACCTTATACACCTAGTAGAAGAGATTGAACAATG
TGGTCCTATCCATATCCGTACAATGTGGCTTGTGGAGAGATATATGAAGGTTCTAAAAAATTTTGTGAGGCAAAGAGCTCGTCCTGAAGGGTCTATGGCTGAGGGGTACATGGCGTTTCAGACAATGGTTCATTTGAGTGAGTACTTACCTCAATTGCATATTGAAGCTCCACGATTATGGGGTGATAACCAACCTCAAT
TTTTTGAAGGGGAAAGATTAGAGGGTCAAGGATCTTCAAAGAGGATAAAAGGTATACTTAAATTCTCGTATCAATTGTTTTGATCCTAAATCTTGGAAATTTGGATTTAACTATTGATTACTTGTACTTGTAGATGCTAAGGACTGGGAGTCATTACATTTGTATGTTGCATACAATTCTGAATTTATGTTAGACTGGAT
GGAGGAGTATAATCAACAAAAGAAGTTAGAAGATGAAAAGGCATGGGCTGATATATATAATAGACATGGTCATAACACTGCTCGAGGTCTCCCTGCGAGCCATAAAAGAAAATGGCCAGATAGATGCACGTGGAATTGGCTAAAAACCAATGTTGAACATGAGGCAACAAAGAGGAAGCACCGTGTGACTCAACAACAAC
TTGATTTCGTTAAAGGATCTACAAATGGGGAGGTAATAAAAAAATATAAACATATTAAAGGTGTTTACTAAACTTTTTCTTTGAACTATTTGTACCCTTGAATCTTATTAGTTAATATGTATATGAATTCAGGTATCATACTACAAAGGAATGTGGAATAATGGTCATCATTTTCGTATCAGAAAGGTTGATGAGAATCG
ACAAACTTATGATTGTGGAGTATCAGCATCGTTTGAGGTGGATTCTCGTTCACATGCATATGATAGACACCCAATCACAAGCATACTTTGTTATTATGGAGTGTTGGAGGATATCATAGAGCTCAATTTCATGTCTTTCAAAAAAGTTCTTTTTCGTGTTGAATGGTACAAGCTCATCAAAGTCGGCCCAGAAAAAACCA
TCATCTTGCACAATAATGGGTTCAATATGATCAATACATCTAGGTTTGAAGCCACTTCTGAACCTTATGTGTTTCCAAATCAATGTGACCAAATATTTCTTGTTCCAAATTTAGAACAACCTGGTTGGTCATTTGTGATTGATTATGATCCAAGAGGACGGAGAGTAACATTTGTTCAGGATGTAGAAAACCATGATTCG
TCTGAAGATTCAGAAGATTTGTCTGAATATGTAGATGAAGAAGATGAAGATGTTGATAATTTGAGTATTGATAATGAATATGATCAAGATGAAGACACTGATGATTTTATTGAAGTGCAAGAAGGACAAGAACAACATCATGGGTATCATGTACATGAAGATGACGAATTTATTGATTTTGATTTACATATAGATGAAGG
GGATGAAGACCATGAGAACATATGGTACTAATTTATTTGTGGATTCAGGCCTAGTAATGATGATGTAATTATTCCTTTATATGAGGAAATTTCACATGATGATGAAATGGTTTGGTTTCCATCCTCACTTTAAAATGGTTTTTAGAAAATAATGGAATATAATTAATTCTATAGAAAATGAATATTGTGTATGTTTTGTT
TATGAATCAAACACAATCGAAATAATATTGTTAAAAGTTTTTGAGTGGTGTTTTAGTGGATGTTTATGATGTCAAGGTAAATAGTTGGCATACCTTCTCAATTGGATAAAAAAAATTCATATTAATTTGTATTTCTCTAATAATTTGCTTGAAGCACACATTTGATTTTGTGGGTATAGGGAATCTACCACACTCCAATG
CTTTAATTTAAATGTTGAAAAGTTTGATGCAATCAACACCTATGTACGAAAACTGTAATACAATAAAGATAAGAAATAAAAGTAAAAACCTTAAAATTTGATTATTGTTTATAATTTTTTCGTTTGAAAATGTATTCAAAATTATTTTGGTCAAGTTTTTGTTTGAGTGTTAGTAAACTTGTCTTATGATAATGATATCA
TTTGGATATATATTTCAATTAATATGTTTTCATTTTAAGTATTTTGTTCTTTTGTAAGAATGTTCATAAGGGTACTCCAAGTTCTACTATGGGGGATTCACAACTGTTGAGTAATTTAATTGCGATGTTGAGCAATGGGCAAGGACAAGAAGTTACCATGATGGTGCAAGAGGTGAGATTCAAAATTTTACTTTACAGTT
TTAATTATCTCATGTTTTATACTATATTGTTTTAATTTGTCCGTTTGTGATGCAGGCCATTTCTAAAGTCATTCCATCACCTAACATGCCCTTTAGTGCATCTGGTAGTATGCAAGAGGATGTTTCTAGAATAACTCCAACAAGATTGCAATCTATCAACAAGGACAATCATGCCACGCCCTCTACTTCTAAACTAGCAA
ATTTGCACACAACAATGACTACTAATGATCAATATCATAACATGCCTTCTACAACCAACATGGATCATTTGAGCATGCCGGCAACTATTAGGAGTACATCACAATTCAGAAATAATTTTTCAAATGTCGGCTCAGTCAGAATTCTCCCACCAACAACAAAACAAGTTTCCTTAAGGAGTCTCATAGAATCACAAGAAAGA
ATACTAAGGCTCCTATCGAATGCTCCTGAAAATGATCATATTAGGAAAGAATTACTTGAACAAATTCAGATATGGGAGACGGAATTATTAGAAAGTGAAGGCCTTTGCTCGGATGAAATGGAAATAAATGACAATGTGATCCATATACCTATAGTGAAAAGTGCTTCAACCCCTAAGACTCCAACAGTTTCCTTGGTAAC
AACAAAGGGATTGAAAGAAGTCACAATCTTGCTAACATCTGAGGGAAATGTCTTGAAGGATGAAATGGGGTTAAAATTATACCATTTTATCTTCCGTCGTGCAGAGCAGTTGTTTGGTAATACAATCCAAGTGGATTGGAGGAAACAACTCCAAGTTAGGAAAGATGAACTCTTCAATGATGTCATTACAACCTTTGGGA
ATCCTGGATTTAATAAGGAAATTATTTTGGATATTGCTCGAAAATACATTCACTCTAAAAGGGACAACATAAGGTCCAAGCTAACAAAGGACTTGAGATATCCACGCCCATATTGGATCACAGACCAAACAACATGGGATGAACTTATAAAGGATGCCAAGTTTAAAAGGAAGTGCCATAATAATCCAAATTACATCCCA
TCTGCACGAGAAGGAGGTAAAAGACGTCTTCGTGATACAACAAAAGCGACTAAAGCTAGGGTGTCAAGTATTGGATCCCACAAATTAGGATCTGGTGGGTACAATAGCATTCGTGGCAACTTGGTAAGTGATATTTTTTCATTTACTTTATCCTCTATTTGAAAATAAATTTGGAAATTTATGAGCAAGTTGTATTTATG
AGTAATTATAAAATACGAATTTGATTACTTTTGTTCATGAAGGTTCATCAATTTGAAAAGGAAGCTTCAGAGGAGGATTTGAAATATGCCTTATTACATGGTTCTCGAGGCCTCCAACAACATATGCTAGATCGAGGGGAGAAATTGATCACTGGGCATACATCTGATGACCAGCAACCAAACTCATTAGAAGAAGGATA
TATGAGTGAGAATGAGGAGATTCTAGAGGTACATGATGAAATGTTTGTCGCACACAATGAATCAATTGCCATTCTTGAACCTCGGCAAGAAACCATCCTTCAATTCCAACAAAGCGGAGAAAAGGATAATGAGCATGCAACATCAACAATTAGAGTAGTGCCTCGTAGAAAGAGGACAAAAAGGAATAGGATTGATAACA
ATGATCTATAATAAGTTTCTATGATAGGTTGCAAGAGAAACATCAAGAGTATGATGTGCTTTTGGTTGTCCATTTTTGAATGATAAAGGGAGCATTGCTAAGAAATTCTAGTTTCTTCATAATTTGTAATTAATTTATGGGGCATCTTCGCCACACTATCAAATTTTTCGCCACTATCAATTTTTTTGAGGATGTAGTGT
TTGAGAAATGTAGCACGTCAATATTAAATAATCACTATGACATATCTATGTTATGTATTTTTTCCCATGGAGCAACTCTCCAATCATTTTATAAACTAAAAATGTTGAAAATAATTATAGTAATATTGTGATTCTAGTC
>TRINITY_DN44193_c0_g1_i31 from sample A8 / Example unspliced isoform:CTTATCATAGGTTTTTTGTGGGTTTAATTAACTTATTTTTCTTATTAATAATATCATCTTAATATTTACTTTTTTACCACATACAAAATTACTATATTAAATACAATGATTGTGCATCTTGTTGGCATGTAGGATCCTACTATCCTTTTTAATGCATCAAGCATTATGGTAGACATAAGATTCAATAATAGATTTATGTG
GGTTTAACTATGTTATTTTACCATATTATATTATTTTAATATCTGTGATTTTTCCTTGTAGGATGTTTCTAGAATAACTCCAACAAGATTGCAATCTATCAACAAGGACAATCATGCCACGCCCTCTACTTCTAAACTAGCAAATTTGCACACAACAATGACTACTAATGATCAATATCATAACATGCCTTCTACAACCA
ACATGGATCATTTGAGCATGCCGGCAACTATTAGGAGTACATCACAATTCAGAAATAATTTTTCAAATGTCGGCTCAGTCAGAATTCTCCCACCAACAACAAAACAAGTTTCCTTAAGGAGTCTCATAGAATCACAAGAAAGAATACTAAGGCTCCTATCGAATGCTCCTGAAAATGATCATATTAGGAAAGAATTACTT
GAACAAATTCAGATATGGGAGACGGAATTATTAGAAAGTGAAGGCCTTTGCTCGGATGAAATGgtaaatattatctaaatatatattctcaaattttgattattatttagaaatctaaatttcatttattgcatcttcaatttttttagtacatagcattttctcaaattcttaaactttattacatctctaaatacttc
taattttcaagtgcttagttcaattttttaatttcatatttggcatgtaggaaaattatttgaaactctagacttctttaatattttggttggtttcataacatttttacattcaaattgttattgcagGAAATAAATGACAATGTGATCCATATACCTATAGTGAAAAGTGCTTCAACCCCTAAGACTCCAACAGTTTC
CTTGGTAACAACAAAGGGATTGAAAGAAGTCACAATCTTGCTAACATCTGAGGGAAATGTCTTGAAGGATGAAATGGGGTTAAAATTATACCATTTTATCTTCCGTCGTGCAGAGCAGTTGTTTGGTAATACAATCCAAGTGGATTGGAGGAAACAACTCCAAGTTAGGAAAGATGAACTCTTCAATGATGTCATTACAA
CCTTTGGGAATCCTGGATTTAATAAGGAAATTATTTTGGATATTGCTCGAAAATACATTCACTCTAAAAGGGACAACATAAGGTCCAAGCTAACAAAGGACTTGAGATATCCACGCCCATATTGGATCACAGACCAAACAACATGGGATGAACTTATAAAGGATGCCAAGTTTAAAAGGAAGTGCCATAATAATCCAAAT
TACATCCCATCTGCACGAGAAGGAGGTAAAAGACGTCTTCGTGATACAACAAAAGCGACTAAAGCTAGGGTGTCAAGTATTGGATCCCACAAATTAGGATCTGGTGGGTACAATAGCATTCGTGGCAACTTGGT
Intron 7 GTGAGATTCA ... TGTGATGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 83.71 | 1.7 | 8 | 9.4 |
| A2 | 44.48 | 1.7 | 1 | 1.7 |
| A3 | 52.5 | 4.6 | 6.2 | 4 |
| A4 | 35.77 | 2 | 1 | 1.3 |
| A5 | -1 | 0 | 0 | 0 |
| A6 | 13.69 | 9.7 | 1.9 | 1.2 |
| A7 | 19.93 | 35.6 | 7.1 | 10.6 |
| A8 | 32.84 | 30.9 | 10.9 | 19.2 |
| A9 | 17.12 | 42.9 | 6.6 | 11.4 |
| A10 | 20.69 | 51.8 | 14.5 | 12.6 |
>TRINITY_DN44193_c0_g1_i19 from sample A8 / Example spliced isoformTCCATTAGCTCGCTGTGTTTCCGCTTAATTATGTGATTCCAGTTTTGCCTCAGATCTGTGAAGTGCTTTGAAGCTGAAGGTAGCTGCATCAAAGCTGAAGGCGTAACTTGTGTAGATCAATGAGGTGCGTGGAGGCTGAAGGTAACTGAAGCATCAAAGCTGAAGGTGATAGTGTGGCTGGACAAACTGAGCTGAAATTT
GAGTAGAATTTTATTACACTATTGGCTAAGTGTATTTGGACAAAATGGCAGACCAGAATGTTCATAAGGGTACTCCAAGTTCTACTATGGGGGATTCACAACTGTTGAGTAATTTAATTGCGATGTTGAGCAATGGGCAAGGACAAGAAGTTACCATGATGGTGCAAGAGGCCATTTCTAAAGTCATTCCATCACCTAAC
ATGCCCTTTAGTGCATCTGGTAGTATGCAAGAGGTTGCAAGAGAAACATCAAGAGTATGATGTGCTTTTGGTTGTCCATTTTTGAATGATAAAGGGAGCATTGCTAAGAAATTCTAGTTTCTTCATAATTTGTAATTAATTTATGGGGCATCTTCGCCACACTATCAAATTTTTCGCCACTATCAATTTTTTTGAGGATG
TAGTGTTTGAGAAATGTAGCACGTCAATATTAAATAATCACTATGACATATCTATGTTATGTATTTTTTCCCATGGAGCAACTCTCCAATCATTTTATAAACTAAAAATGTTGAAAATAATTATAGTAATATTGTGATTCTAGTC
>TRINITY_DN44193_c0_g1_i17 from sample A8 / Example unspliced isoform:TTTTCATACTTATTCTAGGCCTGCAAACCAAGGGGAAACATGGTTGTCCATCATGTGGGCCGAAATTGTTGTCTAGACAATCAAAAGATCTCAAGAAAATAGTGTATGATGAGTATAGACACTTCTTACCACAAAACCATCGCTATCGAGTGTGCGAGAAAAATAAGTTCAATGGAAAGGAGGAGGAAAAGAGGAAACCA
AAAAAGATGAACCCAGTAAGGTGGAAAGAAGCATATGAAAAAAGGGAAGGGAATGGATTTCCACTAGGAATGAAAAGACTATCCATTTTCTACAACTTAGAATATTATGAGCACCTCCCAATAGCTCACTTGTTTGATACTATGCACATTGGGAAAAATGTGGCTGAGTGCTTGTGGAAACACCTAAATGGAACCAACAT
TGAAGCACAATTAAGATTACGGAAGGACCTGCAAGTTGCCAATATGATGCCAAACCTTTGGTTGCATGAAAATAACTCATATGATCACGCTCCATGGATTTTTACATCAACGGAGAAAGCAAAAGTTATTGATATGATGAAAATCATAAGATTTCCTTCTGGTTTTGGTGCAACCTTTAAAAATTTATTCACAAGAGATG
GGTCAGAGCTCTCTGGACTAAAGACACATGATTGGCACAATTGGATAAAGGTAATGTGTAATATGCTAAACTTGTTTGGCAGCATAATTGCAATTTTTTCTATATTAATGATATTATATGACCATGTCTTGTTTAACACTGTTTTTTTAATGGTGATGTACTAGTATGTGTTGCCTGTAGCAATACCAAGCACATTCGAC
CATGGCATCACACAAACCATTTACAAATTATCAAAATATTTGAGGTATTTGAATCTATCATGCATTCTTCAATAGATCAACTCTTATCCTTTGAATTATGTCATTTGTGATGTCTTTATACAGGTTTATACCTATAATTTTGACACAAATTAAAAATATTTATATTGTAGTGCATATTGACAATATTTGTAGGTGGGTCT
CATCAAAAGAGATACACCAAGATGAATTGAAGTATTGGAAGAGGAACATTTCACTTTTGATGTGTGATATTCAAATGAACTTCCCTCCCAGCTTTTTCAATTCCCAAGAGCATTACCTTATACACCTAGTAGAAGAGATTGAACAATGTGGTCCTATCCATATCCGTACAATGTGGCTTGTGGAGAGATATATGAAGGTT
CTAAAAAATTTTGTGAGGCAAAGAGCTCGTCCTGAAGGGTCTATGGCTGAGGGGTACATGGCGTTTCAGACAATGGTTCATTTGAGTGAGTACTTACCTCAATTGCATATTGAAGCTCCACGATTATGGGGTGATAACCAACCTCAATTTTTTGAAGGGGAAAGATTAGAGGGTCAAGGATCTTCAAAGAGGATAAAAGG
TATACTTAAATTCTCGTATCAATTGTTTTGATCCTAAATCTTGGAAATTTGGATTTAACTATTGATTACTTGTACTTGTAGATGCTAAGGACTGGGAGTCATTACATTTGTATGTTGCATACAATTCTGAATTTATGTTAGACTGGATGGAGGAGTATAATCAACAAAAGAAGTTAGAAGATGAAAAGGCATGGGCTGAT
ATATATAATAGACATGGTCATAACACTGCTCGAGGTCTCCCTGCGAGCCATAAAAGAAAATGGCCAGATAGATGCACGTGGAATTGGCTAAAAACCAATGTTGAACATGAGGCAACAAAGAGGAAGCACCGTGTGACTCAACAACAACTTGATTTCGTTAAAGGATCTACAAATGGGGAGGTAATAAAAAAATATAAACA
TATTAAAGGTGTTTACTAAACTTTTTCTTTGAACTATTTGTACCCTTGAATCTTATTAGTTAATATGTATATGAATTCAGGTATCATACTACAAAGGAATGTGGAATAATGGTCATCATTTTCGTATCAGAAAGGTTGATGAGAATCGACAAACTTATGATTGTGGAGTATCAGCATCGTTTGAGGTGGATTCTCGTTCA
CATGCATATGATAGACACCCAATCACAAGCATACTTTGTTATTATGGAGTGTTGGAGGATATCATAGAGCTCAATTTCATGTCTTTCAAAAAAGTTCTTTTTCGTGTTGAATGGTACAAGCTCATCAAAGTCGGCCCAGAAAAAACCATCATCTTGCACAATAATGGGTTCAATATGATCAATACATCTAGGTTTGAAGC
CACTTCTGAACCTTATGTGTTTCCAAATCAATGTGACCAAATATTTCTTGTTCCAAATTTAGAACAACCTGGTTGGTCATTTGTGATTGATTATGATCCAAGAGGACGGAGAGTAACATTTGTTCAGGATGTAGAAAACCATGATTCGTCTGAAGATTCAGAAGATTTGTCTGAATATGTAGATGAAGAAGATGAAGATG
TTGATAATTTGAGTATTGATAATGAATATGATCAAGATGAAGACACTGATGATTTTATTGAAGTGCAAGAAGGACAAGAACAACATCATGGGTATCATGTACATGAAGATGACGAATTTATTGATTTTGATTTACATATAGATGAAGGGGATGAAGACCATGAGAACATATGGTACTAATTTATTTGTGGATTCAGGCCT
AGTAATGATGATGTAATTATTCCTTTATATGAGGAAATTTCACATGATGATGAAATGGTTTGGTTTCCATCCTCACTTTAAAATGGTTTTTAGAAAATAATGGAATATAATTAATTCTATAGAAAATGAATATTGTGTATGTTTTGTTTATGAATCAAACACAATCGAAATAATATTGTTAAAAGTTTTTGAGTGGTGTT
TTAGTGGATGTTTATGATGTCAAGGTAAATAGTTGGCATACCTTCTCAATTGGATAAAAAAAATTCATATTAATTTGTATTTCTCTAATAATTTGCTTGAAGCACACATTTGATTTTGTGGGTATAGGGAATCTACCACACTCCAATGCTTTAATTTAAATGTTGAAAAGTTTGATGCAATCAACACCTATGTACGAAAA
CTGTAATACAATAAAGATAAGAAATAAAAGTAAAAACCTTAAAATTTGATTATTGTTTATAATTTTTTCGTTTGAAAATGTATTCAAAATTATTTTGGTCAAGTTTTTGTTTGAGTGTTAGTAAACTTGTCTTATGATAATGATATCATTTGGATATATATTTCAATTAATATGTTTTCATTTTAAGTATTTTGTTCTTT
TGTAAGAATGTTCATAAGGGTACTCCAAGTTCTACTATGGGGGATTCACAACTGTTGAGTAATTTAATTGCGATGTTGAGCAATGGGCAAGGACAAGAAGTTACCATGATGGTGCAAGAGgtgagattcaaaattttactttacagttttaattatctcatgttttatactatattgttttaatttgtccgtttgtgatg
cagGCCATTTCTAAAGTCATTCCATCACCTAACATGCCCTTTAGTGCATCTGGTAGTATGCAAGAGGATGTTTCTAGAATAACTCCAACAAGATTGCAATCTATCAACAAGGACAATCATGCCACGCCCTCTACTTCTAAACTAGCAAATTTGCACACAACAATGACTACTAATGATCAATATCATAACATGCCTTCTAC
AACCAACATGGATCATTTGAGCATGCCGGCAACTATTAGGAGTACATCACAATTCAGAAATAATTTTTCAAATGTCGGCTCAGTCAGAATTCTCCCACCAACAACAAAACAAGTTTCCTTAAGGAGTCTCATAGAATCACAAGAAAGAATACTAAGGCTCCTATCGAATGCTCCTGAAAATGATCATATTAGGAAAGAAT
TACTTGAACAAATTCAGATATGGGAGACGGAATTATTAGAAAGTGAAGGCCTTTGCTCGGATGAAATGGAAATAAATGACAATGTGATCCATATACCTATAGTGAAAAGTGCTTCAACCCCTAAGACTCCAACAGTTTCCTTGGTAACAACAAAGGGATTGAAAGAAGTCACAATCTTGCTAACATCTGAGGGAAATGTC
TTGAAGGATGAAATGGGGTTAAAATTATACCATTTTATCTTCCGTCGTGCAGAGCAGTTGTTTGGTAATACAATCCAAGTGGATTGGAGGAAACAACTCCAAGTTAGGAAAGATGAACTCTTCAATGATGTCATTACAACCTTTGGGAATCCTGGATTTAATAAGGAAATTATTTTGGATATTGCTCGAAAATACATTCA
CTCTAAAAGGGACAACATAAGGTCCAAGCTAACAAAGGACTTGAGATATCCACGCCCATATTGGATCACAGACCAAACAACATGGGATGAACTTATAAAGGATGCCAAGTTTAAAAGGAAGTGCCATAATAATCCAAATTACATCCCATCTGCACGAGAAGGAGGTAAAAGACGTCTTCGTGATACAACAAAAGCGACTA
AAGCTAGGGTGTCAAGTATTGGATCCCACAAATTAGGATCTGGTGGGTACAATAGCATTCGTGGCAACTTGGTAAGTGATATTTTTTCATTTACTTTATCCTCTATTTGAAAATAAATTTGGAAATTTATGAGCAAGTTGTATTTATGAGTAATTATAAAATACGAATTTGATTACTTTTGTTCATGAAGGTTCATCAAT
TTGAAAAGGAAGCTTCAGAGGAGGATTTGAAATATGCCTTATTACATGGTTCTCGAGGCCTCCAACAACATATGCTAGATCGAGGGGAGAAATTGATCACTGGGCATACATCTGATGTAAGTTATTTAGAAATTTTGATGAATTATGTGATAAGTTAATTAAATATAGTATGTTAAAATAACAAGTTAAAATTTGTTGTG
TATGAAAGGACCAGCAACCAAACTCATTAGAAGAAGGATATATGAGTGAGAATGAGGAGATTCTAGAGGTACATGATGAAATGTTTGTCGCACACAATGAATCAATTGCCATTCTTGAACCTCGGCAAGAAACCATCCTTCAATTCCAACAAAGCGGAGAAAAGGATAATGAGCATGCAACATCAACAATTAGAGTAGTG
CCTCGTAGAAAGAGGACAAAAAGGAATAGGATTGATAACAATGATCTATAATAAGTTTCTATGATAGGTACATTTCAATCTTTTTATAACTCTTCCATTCGAACTTTGTCATCTCTTCATATCATTGGATTCTAGAACTATGCAATATGCCTTGAAATTTTTCATCTTGAGATGTTATGAGGATGGTGGTTTGGATTCTT
TCATCATGAGTTATAAAATGTAGATAAATTGTAATATGTTATTCATTTTACATAAGTTTACATTAAATATATTTTTTGGTTTAATATTTTACTCACTTATATATGTCTTGTTTATTGTAGGTTGCAAGAGAAACATCAAGAGTATGATGTGCTTTTGGTTGTCCATTTTTGAATGATAAAGGGAGCATTGCTAAGAAATT
CTAGTTTCTTCATAATTTGTAATTAATTTATGGGGCATCTTCGCCACACTATCAAATTTTTCGCCACTATCAATTTTTTTGAGGATGTAGTGTTTGAGAAATGTAGCACGTCAATATTAAATAATCACTATGACATATCTATGTTATGTATTTTTTCCCATGGAGCAACTCTCCAATCATTTTATAAACTAAAAATGTTG
AAAATAATTATAGTAATATTGTGATTCTAGTC
Intron 8 GTAAGTTATT ... TTTATTGTAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 42.86 | 2 | 1 | 2 |
| A2 | 33.33 | 2 | 1 | 1 |
| A3 | 100 | 0 | 1 | 1 |
| A4 | -1 | 0 | 0 | 0 |
| A5 | -1 | 0 | 0 | 0 |
| A6 | 55.56 | 4 | 1 | 9 |
| A7 | 46.34 | 33 | 17 | 40 |
| A8 | 53.19 | 22 | 19 | 31 |
| A9 | 42.42 | 38 | 14 | 42 |
| A10 | 47.27 | 29 | 20 | 32 |
>TRINITY_DN44193_c0_g1_i24 from sample A8 / Example spliced isoformTCATCAATTTGAAAAGGAAGCTTCAGAGGAGGATTTGAAATATGCCTTATTACATGGTTCTCGAGGCCTCCAACAACATATGCTAGATCGAGGGGAGAAATTGATCACTGGGCATACATCTGATGTTGCAAGAGAAACATCAAGAGTATGATGTGCTTTTGGTTGTCCATTTTTGAATGATAAAGGGAGCATTGCTAAGA
AATTCTAGTTTCTTCATAATTTGTAATTAATTTATGGGGCATCTTCGCCACACTATCAAATTTTTCGCCACTATCAATTTTTTTGAGGATGTAGTGTTTGAGAAATGTAGCACGTCAATATTAAATAATCACTATGACATATCTATGTTATGTATTTTTTCCCATGGAGCAACTCTCCAATCATTTTATAAACTAAAAAT
GTTGAAAATAATTATAGTAATATTGTGATTCTAGTC
>TRINITY_DN44193_c0_g1_i21 from sample A8 / Example unspliced isoform:TTTTCATACTTATTCTAGGCCTGCAAACCAAGGGGAAACATGGTTGTCCATCATGTGGGCCGAAATTGTTGTCTAGACAATCAAAAGATCTCAAGAAAATAGTGTATGATGAGTATAGACACTTCTTACCACAAAACCATCGCTATCGAGTGTGCGAGAAAAATAAGTTCAATGGAAAGGAGGAGGAAAAGAGGAAACCA
AAAAAGATGAACCCAGTAAGGTGGAAAGAAGCATATGAAAAAAGGGAAGGGAATGGATTTCCACTAGGAATGAAAAGACTATCCATTTTCTACAACTTAGAATATTATGAGCACCTCCCAATAGCTCACTTGTTTGATACTATGCACATTGGGAAAAATGTGGCTGAGTGCTTGTGGAAACACCTAAATGGAACCAACAT
TGAAGCACAATTAAGATTACGGAAGGACCTGCAAGTTGCCAATATGATGCCAAACCTTTGGTTGCATGAAAATAACTCATATGATCACGCTCCATGGATTTTTACATCAACGGAGAAAGCAAAAGTTATTGATATGATGAAAATCATAAGATTTCCTTCTGGTTTTGGTGCAACCTTTAAAAATTTATTCACAAGAGATG
GGTCAGAGCTCTCTGGACTAAAGACACATGATTGGCACAATTGGATAAAGGTAATGTGTAATATGCTAAACTTGTTTGGCAGCATAATTGCAATTTTTTCTATATTAATGATATTATATGACCATGTCTTGTTTAACACTGTTTTTTTAATGGTGATGTACTAGTATGTGTTGCCTGTAGCAATACCAAGCACATTCGAC
CATGGCATCACACAAACCATTTACAAATTATCAAAATATTTGAGGTATTTGAATCTATCATGCATTCTTCAATAGATCAACTCTTATCCTTTGAATTATGTCATTTGTGATGTCTTTATACAGGTTTATACCTATAATTTTGACACAAATTAAAAATATTTATATTGTAGTGCATATTGACAATATTTGTAGGTGGGTCT
CATCAAAAGAGATACACCAAGATGAATTGAAGTATTGGAAGAGGAACATTTCACTTTTGATGTGTGATATTCAAATGAACTTCCCTCCCAGCTTTTTCAATTCCCAAGAGCATTACCTTATACACCTAGTAGAAGAGATTGAACAATGTGGTCCTATCCATATCCGTACAATGTGGCTTGTGGAGAGATATATGAAGGTT
CTAAAAAATTTTGTGAGGCAAAGAGCTCGTCCTGAAGGGTCTATGGCTGAGGGGTACATGGCGTTTCAGACAATGGTTCATTTGAGTGAGTACTTACCTCAATTGCATATTGAAGCTCCACGATTATGGGGTGATAACCAACCTCAATTTTTTGAAGGGGAAAGATTAGAGGGTCAAGGATCTTCAAAGAGGATAAAAGG
TATACTTAAATTCTCGTATCAATTGTTTTGATCCTAAATCTTGGAAATTTGGATTTAACTATTGATTACTTGTACTTGTAGATGCTAAGGACTGGGAGTCATTACATTTGTATGTTGCATACAATTCTGAATTTATGTTAGACTGGATGGAGGAGTATAATCAACAAAAGAAGTTAGAAGATGAAAAGGCATGGGCTGAT
ATATATAATAGACATGGTCATAACACTGCTCGAGGTCTCCCTGCGAGCCATAAAAGAAAATGGCCAGATAGATGCACGTGGAATTGGCTAAAAACCAATGTTGAACATGAGGCAACAAAGAGGAAGCACCGTGTGACTCAACAACAACTTGATTTCGTTAAAGGATCTACAAATGGGGAGGTAATAAAAAAATATAAACA
TATTAAAGGTGTTTACTAAACTTTTTCTTTGAACTATTTGTACCCTTGAATCTTATTAGTTAATATGTATATGAATTCAGGTATCATACTACAAAGGAATGTGGAATAATGGTCATCATTTTCGTATCAGAAAGGTTGATGAGAATCGACAAACTTATGATTGTGGAGTATCAGCATCGTTTGAGGTGGATTCTCGTTCA
CATGCATATGATAGACACCCAATCACAAGCATACTTTGTTATTATGGAGTGTTGGAGGATATCATAGAGCTCAATTTCATGTCTTTCAAAAAAGTTCTTTTTCGTGTTGAATGGTACAAGCTCATCAAAGTCGGCCCAGAAAAAACCATCATCTTGCACAATAATGGGTTCAATATGATCAATACATCTAGGTTTGAAGC
CACTTCTGAACCTTATGTGTTTCCAAATCAATGTGACCAAATATTTCTTGTTCCAAATTTAGAACAACCTGGTTGGTCATTTGTGATTGATTATGATCCAAGAGGACGGAGAGTAACATTTGTTCAGGATGTAGAAAACCATGATTCGTCTGAAGATTCAGAAGATTTGTCTGAATATGTAGATGAAGAAGATGAAGATG
TTGATAATTTGAGTATTGATAATGAATATGATCAAGATGAAGACACTGATGATTTTATTGAAGTGCAAGAAGGACAAGAACAACATCATGGGTATCATGTACATGAAGATGACGAATTTATTGATTTTGATTTACATATAGATGAAGGGGATGAAGACCATGAGAACATATGGTACTAATTTATTTGTGGATTCAGGCCT
AGTAATGATGATGTAATTATTCCTTTATATGAGGAAATTTCACATGATGATGAAATGGTTTGGTTTCCATCCTCACTTTAAAATGGTTTTTAGAAAATAATGGAATATAATTAATTCTATAGAAAATGAATATTGTGTATGTTTTGTTTATGAATCAAACACAATCGAAATAATATTGTTAAAAGTTTTTGAGTGGTGTT
TTAGTGGATGTTTATGATGTCAAGGTAAATAGTTGGCATACCTTCTCAATTGGATAAAAAAAATTCATATTAATTTGTATTTCTCTAATAATTTGCTTGAAGCACACATTTGATTTTGTGGGTATAGGGAATCTACCACACTCCAATGCTTTAATTTAAATGTTGAAAAGTTTGATGCAATCAACACCTATGTACGAAAA
CTGTAATACAATAAAGATAAGAAATAAAAGTAAAAACCTTAAAATTTGATTATTGTTTATAATTTTTTCGTTTGAAAATGTATTCAAAATTATTTTGGTCAAGTTTTTGTTTGAGTGTTAGTAAACTTGTCTTATGATAATGATATCATTTGGATATATTTCAATTAATATGTTTTCATTTTAAGTATTTTGTTCTTTTG
TAAGAATGTTCATAAGGGTACTCCAAGTTCTACTATGGGGGATTCACAACTGTTGAGTAATTTAATTGCGATGTTGAGCAATGGGCAAGGACAAGAAGTTACCATGATGGTGCAAGAGGCCATTTCTAAAGTCATTCCATCACCTAACATGCCCTTTAGTGCATCTGGTAGTATGCAAGAGGATGTTTCTAGAATAACTC
CAACAAGATTGCAATCTATCAACAAGGACAATCATGCCACGCCCTCTACTTCTAAACTAGCAAATTTGCACACAACAATGACTACTAATGATCAATATCATAACATGCCTTCTACAACCAACATGGATCATTTGAGCATGCCGGCAACTATTAGGAGTACATCACAATTCAGAAATAATTTTTCAAATGTCGGCTCAGTC
AGAATTCTCCCACCAACAACAAAACAAGTTTCCTTAAGGAGTCTCATAGAATCACAAGAAAGAATACTAAGGCTCCTATCGAATGCTCCTGAAAATGATCATATTAGGAAAGAATTACTTGAACAAATTCAGATATGGGAGACGGAATTATTAGAAAGTGAAGGCCTTTGCTCGGATGAAATGGAAATAAATGACAATGT
GATCCATATACCTATAGTGAAAAGTGCTTCAACCCCTAAGACTCCAACAGTTTCCTTGGTAACAACAAAGGGATTGAAAGAAGTCACAATCTTGCTAACATCTGAGGGAAATGTCTTGAAGGATGAAATGGGGTTAAAATTATACCATTTTATCTTCCGTCGTGCAGAGCAGTTGTTTGGTAATACAATCCAAGTGGATT
GGAGGAAACAACTCCAAGTTAGGAAAGATGAACTCTTCAATGATGTCATTACAACCTTTGGGAATCCTGGATTTAATAAGGAAATTATTTTGGATATTGCTCGAAAATACATTCACTCTAAAAGGGACAACATAAGGTCCAAGCTAACAAAGGACTTGAGATATCCACGCCCATATTGGATCACAGACCAAACAACATGG
GATGAACTTATAAAGGATGCCAAGTTTAAAAGGAAGTGCCATAATAATCCAAATTACATCCCATCTGCACGAGAAGGAGGTAAAAGACGTCTTCGTGATACAACAAAAGCGACTAAAGCTAGGGTGTCAAGTATTGGATCCCACAAATTAGGATCTGGTGGGTACAATAGCATTCGTGGCAACTTGGTAAGTGATATTTT
TTCATTTACTTTATCCTCTATTTGAAAATAAATTTGGAAATTTATGAGCAAGTTGTATTTATGAGTAATTATAAAATACGAATTTGATTACTTTTGTTCATGAAGGTTCATCAATTTGAAAAGGAAGCTTCAGAGGAGGATTTGAAATATGCCTTATTACATGGTTCTCGAGGCCTCCAACAACATATGCTAGATCGAGG
GGAGAAATTGATCACTGGGCATACATCTGATgtaagttatttagaaattttgatgaattatgtgataagttaattaaatatagtatgttaaaataacaagttaaaatttgttgtgtatgaaaggaccagcaaccaaactcattagaagaaggatatatgagtgagaatgaggagattctagaggtacatgatgaaatgtt
tgtcgcacacaatgaatcaattgccattcttgaacctcggcaagaaaccatccttcaattccaacaaagcggagaaaaggataatgagcatgcaacatcaacaattagagtagtgcctcgtagaaagaggacaaaaaggaataggattgataacaatgatctataataagtttctatgataggtacatttcaatcttttt
ataactcttccattcgaactttgtcatctcttcatatcattggattctagaactatgcaatatgccttgaaatttttcatcttgagatgttatgaggatggtggtttggattctttcatcatgagttataaaatgtagataaattgtaatatgttattcattttacataagtttacattaaatatattttttggtttaat
attttactcacttatatatgtcttgtttattgtagGTTGCAAGAGAAACATCAAGAGTATGATGTGCTTTTGGTTGTCCATTTTTGAATGATAAAGGGAGCATTGCTAAGAAATTCTAGTTTCTTCATAATTTGTAATTAATTTATGGGGCATCTTCGCCACACTATCAAATTTTTCGCCACTATCAATTTTTTTGAGGA
TGTAGTGTTTGAGAAATGTAGCACGTCAATATTAAATAATCACTATGACATATCTATGTTATGTATTTTTTCCCATGGAGCAACTCTCCAATCATTTTATAAACTAAAAATGTTGAAAATAATTATAGTAATATTGTGATTCTAGTC