sp|P48622|FAD3D_ARATH ----> Temperature-sensitive sn-2 acyl-lipid omega-3 desaturase (ferredoxin), chloroplastic

Intron 1 GTGAGTATTG ... CTGCTTTCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	11.27	28	5	2
A2	4.98	40.8	2	2
A3	17.75	25.5	10	1
A4	10.77	41.8	5	5
A5	0	9.8	0	0
A6	2.17	46.8	1	1
A7	1.08	49.3	1	0
A8	0	25.3	0	0
A9	2.26	44.8	2	0
A10	0	44	0	0

>TRINITY_DN99237_c0_g1_i3 from sample A4 / Example spliced isoform

CAGTCCCTTGCGTAGAGGACCAAGGCTAGGAGGGCAGCCTGCTGTTGCAGTGCCTCTTAGGCATACTTTGGTTCCAGATAATGAGAATGGTGAAGCAGGCTTTGATCCGAGTGCGCCTCCTCCGTTCAACTTGGCGGACATTCGAGCAGCTATTCCTAAGCATTGTTGGGTGAAGGATCCTTTGAAGTCCATGAGCTATG
TTGTGAGGGATGTGGCTGTTGTCATTGGGCTGGCGGCTGCAGCTACATATTTTAACAATTGGGTGTTTTGGCCTATATATTGGGTTGCTCAGGGGACCATGTTTTGGGCACTTTTTGTGCTTGGACATGATTGTGGCCATGGAAGCTTTTCTAACAACCACAAACTTAACAGTGTGATTGGGCATTTGACACATTCTTCA
ATCCTCGTACCTTATCATGGCTGGAGAATCAGTCATAGAACGCATCATCAGAATCACGGACATGTAGAGAATGATGAGTCATGGCATCCTATGTCAGAAAAATTATATAACACTCTGGATGAATCAACCAAGAAGTTACGGTTTACCATCCCATGGCCCCTGTTGGCATATCCTTTCTACCTGTGGGGTAGAACTCCTGG
AAAGAAAGGTTCTCACTTTCATCCTGACAGCGATCTATTTGTTCCAAATGAGAAGAAGGATGTCATCACATCAACAGCATGCTGGACTGCAATGGTGGCTTTGCTAGCTGGACTTACAGTTTTTATGGGTCCTGCATGGATAATAAAGTTCTATGTTATTCCTTACTGGATTTTTGTAATGTGGTTAGATCTTGTGACAT
ATCTTCATCACCATGGTCATGATGAGAAGGTTCCATGGTACAGAGGCAAGGAATGGAGTTATCTCAGAGGAGGGCTTACTACAATTGATCGAGACTATGGCTTGATTAACAATATCCATCATGATATTGGAACCCATGTTGTACATCACTTGTTTCCTCAAATACCTCACTACCACCTGGTGGAAGCGACTGAAGCAGTA
AAGCCTGTGCTTGGAAAGTATTATCGGGAGCCAAAGCAATCCGGTCCTCTTCCATTGCACTTGTTGGACCCTCTGGTGAAGAGCATGTCACAAGATCATTATGTTAATGACGAGGGAGATATTGTGTTCTATCAAGCAGACCCTAACATCAATAAGTCCAGAAGATGAAATCAATCTGAAAATTGCAAGAGTATTTTTAA
CATATAGCATCATTCAGGAGCTATATTCTGGACATGTTTCTCTACTCATAAAACACTGAAAGCTGTTATATGATTCGGCCTTTGTATTCTAAGTTTGGATTCAAGGGTCTTGATTATTATCTTTTTGATAATTCATTTTTTAGTTCCACTCCAAAACAGAGTGGCTCAAGTTGATTATTGGTGCTTCTCTGAGTTTTCCC
AGAAATTGTGAAAGTATATCTTGGTAAGAAACTCAAAGATCACTTACATGTTGGTGGCTAGTATTTCGGTTTCGAAAAAGCTTGGAAAGTCTCTGCAGATTAGAGATGTTAAAGATTTTTTCGATGTACTATATATCTTATTTTAGATATATATATATTATTTATTTCTCAATAAATACCTCTGC

>TRINITY_DN99237_c0_g1_i4 from sample A4 / Example unspliced isoform:

GCATTGTCCTCCTTTTATGTGCTTCTAAAGCTGTATTCTTGCAAGATTTACGCTGCATTGTCCTCCTTTTATGTGCTTCTAAAGCTGTATTCTTGCAAGATTTACGCTGCATTGTCCTCCTTTTATGTGCTGCTAAAGGTGTATCGTTCTTGGAGATGCATAGGAATTTGTTAGTTTGTGTGAGTGGGAGTGTTCTATAT
TATCCTAAAAACTTTCGCACAGGATGTCTTTGGTGTCCTTTTTGGGGGGAGCATGTTAACAGTATTTTTGAATGTAATTAGAAATTGTGTATTTGCAGGAGAATCAGTCATAGAACGCATCATCAGAATCACGGACATGTAGAGAATGATGAGTCATGGCATCCTgtgagtattgacatgattcattaacattgcatttc
attgattaatgcaggtggtttggttttgccatcattttttttttagtttttgtttctgggtgctcctaatttcactcaaactagctcactgtagtcattctaagttcacaccaaagcacatgacagctccatgctgagataatgcttcgaagaacctcaataagttacttttgagaagtcccttggaaaagaattagatt
ttcaggactcgattttgattaacagctgttggagtaatgaaggcaatctctgttctaattactcaattttgatttgtctgctttcagATGTCAGAAAAATTATATAACACTCTGGATGAATCAACCAAGAAGTTACGGTTTACCATCCCATGGCCCCTGTTGGCATATCCTTTCTACCTGGTCAGTATGTGTTCTCTTTT
AATTTGTGCTAGCATTTTTACTACTCAAGGTATTGAAGTATCTTCACATATATTACCTGGCTCTGATTTGGTACATGCAATGGCTATTCTTTCAGTGGGGT