sp|Q0DGD7|BGAL8_ORYSJ ----> Beta-galactosidase 8

Intron 1 GTAAGGGATT ... TCTGATGCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	14.05	104	0	17
A2	14.89	80	0	14
A3	9.46	67	0	7
A4	14.1	67	0	11
A5	8.33	44	0	4
A6	14.03	380	0	62
A7	16.36	271	0	53
A8	18.59	254	0	58
A9	17.48	288	4	61
A10	16.47	213	0	42

>TRINITY_DN37287_c0_g2_i2 from sample A9 / Example spliced isoform

ACAAGATCTAAACCATGGTTAACTTAGTTATTACGTTATCCCGAGAATCTGGTAAGAATGGAACTTGTGTCTATGATTTCATGAATTCTCCAGTGTGGGACCCAGTATCCACAACGGTCTGAACATTTAGATTTAAATTTAAATTTAAAAATAAAAGATAGCCGTTTATAGTTACGGAGAATAAGAAGAGGAAGGGACGC
GAACAATGGCAGAGTACTGCAGAAAAGCCGAAACAGAGGAGGTTGGAAATTTGACAGTATAACAATGGAGGCTTCGCCAAAGTCTGCAATACAATCAGTTGACATCGTGACGCAAATACTGGGTAGGGTTGAATCCCCGCGAGATCTGTTATCGGCTTCCGCCGTTTGCAGAACATGGAGATCGGCAGCGAACGATCCGT
CGCAGCTGCGCTCGTGGACGCTCGACGACCCGCTCACAACCGTGGAAGGTGCTAAGGTGTCCTTAATTCCTATGCTGCCGAAGACCCCTCAGCCCCGTCACTGGATAAACCCGGCCGCCGATTCGCCCTTGGCGTCCTTCAAGACCCCCAGAAGCCTAAGGTCTCTTAGGTTTCCCTCAATTTCCGAGGCGGCAGAGTTC
GGCAGCGGAGAAGCGGAGTCGCCCCACACGCCGTCTCCCCTGCAGCAGCCGCCTGAGCAGGCCGGGAACTTCAAACTTGCGATCATTCACAAAATGGTTATGGGCAGATTTTTAGGTGATATTGATATATGTTCATCCCAGCTAAGTGATGAATGTCTACAAATTATTACAAAAAGTTGTCCACGGCTTCATACACTCAG
ACTGCTGCACATTTGTGGTGCTCAACAAGCTGATCCCGATGAATCCTTTTTCTGTCAGAACAGAGCTGAGCTGGAGCCTGATAAAAATGGGAATTACCTTCCTACATCATGTAGGTGCAGCCATCTCTCTGAAAAAGGATTTCTGGACATTAGCAGGCATTGTCCAGACCTTGTGTCAGTCACACTCGTCTTCCAGCATA
TTGTCTTGAGAGAGGTGTTGCAAGATATTTTGGTGGAGCTGGGAAAACTTATAAAGCTGCATACTCTTTCCATTGAGCTCCGCATGCCCTTATTTGTACATTCTATCAAGTCAGAGGTCATCTGGGAAAGTTATCTTCGCTGCACAGATAAGGAAATTCTTGCACTACTCGAAGCTGGGCAGCCACCTTTGCAGGCGCTA
GCTCTTAACCGATGTGATCTAACTGAAGTGTCTATAAATGCATTGACAAAAGCTTGCCCAAATATTGAGGCTATTGATTTGCATGGTCATTTCCAGGTTCCTAAAGATCAGGGTCTTAATTCTGGTGTTCCTCTGTGTTTGAAGGACTTGACATCTCTTTCAGCTGCAGCATTTGGTGTTTTGCATGATCTTGAAGAATG
CCAATTTGCAGCTTGGAATTTGCATTCTTTGAAGCGTTTACGACTGGAATCTAGGGAACCTCTTGCCATACAGCATCTTGAGAGTTTGCAGTGTTCATGCCCTCAGCTGGAAAGCGTTCACCTGATTTGGAACAGTTTCAGCGGACCAAAGGAAGCACAAATTTATCCCTTTACACATGAAGGCATCATGGACTATATTA
GATCTGTTTTTGTATAGATGCTGCATTTTAAAAGGGTTGAAATTCAGGCTGCAATTAGTATGTCCTGGATGATTCGGAAAAGTTTATTATCCTGCAGTGTATATTAAGTCGGCAATATAGAAACATGGTTGTTAGCAGGTTTTGTGGAGGGTTGATATTATTGGGCCTTTTGTGCTCAGATTTATTCTTGTGCTGGTAAT
ATGGCATTGTATAGCATTGTAGACAATTCTAGCAATGAGTAATATAAGTCATTAGAATTGGGATACTCTTAAGGTTTTGTTTGACTGTTTGGCTCAATTTCAGTTCACTAAGCTTTACTAGTTAACATTATTATAATTGTTTGAACTTTATTACTCTCAAAGGTTTTGTATGATAATTAAAAACGTGTTTAGCT

>TRINITY_DN37287_c0_g2_i1 from sample A9 / Example unspliced isoform:

CTTTCCATTGAGCTCCGCATGCCgtaagggattctctcccctattactcaaatatttggccattagggacatctcaaatgaggtttgatccttctctttaacttgttatgccaatctgatgcagCTTATTTGTACATTCTATCAAGTCAGAGGTCATCTGGGAAAGTTATCTTCGCTGCACAGATAAGGAAATTCTTGCA
CTACTCGAAGCTGGGCAGCCACCTTTGCAGGCGCTAGCTCTTAACCGATGTGATCTAACTGAAGTGTCTATAAATGCATTGACAAAAGCTTGCCCAAATATTGAGGCTATTGATTTGCATGGTCATTTCCAGGTTCCTAAAGATCAGGGTCTTAATTCTGGTGTTCCTCTGTGTTTGAAGGACTTGACATCTCTTTCAGC
TGCAGCATTTGGTGTTTTGCATGATCTTGAAGAATGCCAATTTGCAGCTTGGAATTTGCATTCTTTGAAGCGTTTACGACTGGAATCTAGGGAACCTCTTGCCATACAGCATCTTGAGAGTTTGCAGTGTTCATGCCCTCAGCTGGAAAGCGTTCACCTGATTTGGAACAGTTTCAGCGGACCAAAGGAAGCACAAATTT
ATCCCTTTACACATGAAGGCATCATGGACTATATTAGATCTGTTTTTGTATAGATGCTGCATTTTAAAAGGGTTGAAATTCAGGCTGCAATTAGTATGTCCTGGATGATTCGGAAAAGTTTATTATCCTGCAGTGTATATTAAGTCGGCAATATAGAAACATGGTTGTTAGCAGGTTTTGTGGAGGGTTGATATTATTGG
GCCTTTTGTGCTCAGATTTATTCTTGTGCTGGTAATATGGCATTGTATAGCATTGTAGACAATTCTAGCAATGAGTAATATAAGTCATTAGAATTGGGATACTCTTAAGGTTTTGTTTGACTGTTTGGCTCAATTTCAGTTCACTAAGCTTTACTAGTTAACATTATTATAATTGTTTGAACTTTATTACTCTCAAAGGT
TTTGTATGATAATTAAAAACGTGTTTAGCT

Intron 2 GTATGTTACT ... CTTGAGGCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	10	72	0	8
A2	14.29	30	1	5
A3	12.77	41	0	6
A4	16.33	41	0	8
A5	4	24	0	1
A6	16.19	321	0	62
A7	12.94	222	0	33
A8	15.46	268	0	49
A9	11.76	255	0	34
A10	12.16	195	0	27

>TRINITY_DN40374_c0_g1_i2 from sample A8 / Example spliced isoform

TTGTGTCTATGATTTCATGAATTCTCCAGTGTGGGACCCAGTATCCACAACGGTCTGAACATTTAGATTTAAATTTAAATTTAAAAATAAAAGATAGCCGTTTATAGTTACGGAGAATAAGAAGAGGAAGGGACGCGAACAATGGCAGAGTACTGCAGAAAAGCCGAAACAGAGGAGGTTGGAAATTTGACAGTATAACA
ATGGAGGCTTCGCCAAAGTCTGCAATACAATCAGTTGACATCGTGACGCAAATACTGGGTAGGGTTGAATCCCCGCGAGATCTGTTATCGGCTTCCGCCGTTTGCAGAACATGGAGATCGGCAGCGAACGATCCGTCGCAGCTGCGCTCGTGGACTCTCGACGACCCGCTCACAACCGTGGAAGGTGCTAAGGTGTCCTT
AATTCCTATGCTGCCGAAGACCCCTCAGCCCCGTCACTGGATAAACCCGGCCGCCGATTCGCCCTTGGCGTCCTTCAAGACCCCCAGAAGCCTAAGGTCTCTTAGGTTTCCCTCAATTTCCGAGGCGGCAGAGTTCGGCAGCGGAGAAGCGGAGTCGCCCCACACGCCGTCTCCCCTGCAGCAGCCGCCTGAGCAGGCCG
GGAACTTCAAACTTGCGATCATTCACAAAATGGTTATGGGCAGATTTTTAGGTGATATTGATATATGTTCATCCCAGCTAAGTGATGAATGTCTACAAATTATTACAAAAAGTTGTCCACGGCTTCATACACTCAGACTGCTGCACATTTGTGGTGCTCAACAAGCTGATCCCGATGAATCCTTTTTCTGTCAGAACAGA
GCTGAGCTGGAGCCTGATAAAAATGGGAATTACCTTCCTACATCATGTAGGTGCAGCCATCTCTCTGAAAAAGGATTTCTGGACATTAGCAGGCATTGTCCAGACCTTGTGTCAGTCACACTCGTCTTCCAGCATATTGTCTTGAGAGAGGTGTTGCAAGATATTTTGGTGGAGCTGGGAAAACTTATAAAGCTGCATAC
TCTTTCCATTGAGCTCCGCATGCCCTTATTTGTACATTCTATCAAGTCAGAGGTCATCTGGGAAAGTTATCTTCGCTGCACAGATAAGGAAATTCTTGCACTACTCGAAGCTGGGCAGCCACCTTTGCAGGCGCTAGCTCTTAACCGATGTGATCTAACTGAAGTGTCTATAAATGCATTGACAAAAGCTTGCCCAAATA
TTGAGGCTATTGATTTGCATGGTCATTTCCAGGTTCCTAAAGATCAGGGTCTTAATTCTGGTGTTCCTCTGTGTTTGAAGGACTTGACATCTCTTTCAGCTGCAGCATTTGGTGTTTTGCATGATCTTGAAGAATGCCAATTTGCAGCTTGGAATTTGCATTCTTTGAAGCGTTTACGACTGGAATCTAGGGAACCTCTT
GCCATACAGCATCTTGAGAGTTTGCAGTGTTCATGCCCTCAGCTGGAAAGCGTTCACCTGATTTGGAACAGTTTCAGCGGACCAAAGGAAGCACAAATTTATCCCTTTACACATGAAGGCATCATGGACTATATTAGATCTGTTTTTGTATAGATGCTGCATTTTAAAAGGGTTGAAATTCAGGCTGCAATTAGTATGTC
CTGGATGATTCGGAAAAGTTTATTATCCTGCAGTGTATATTAAGTCGGCAATATAGAAACATGGTTGTTAGCAGGTTTTGTGGAGGGTTGATATTATTGGGCCTTTTGTGCTCAGATTTATTCTTGTGCTGGTAATATGGCATTGTATAGCATTGTAGACAATTCTAGCAATGAGTAATATAAGTCATTAGAATTGGGAT
ACTCTTAAGGTTTTGTTTGACTGTTTGGCTCAATTTCAGTTCACTAAGCTTTACTAGTTAACATTATTATAATTGTTTGAACTTTATTACTCTCAAAGGTTTTGTATGATAATTAAAAACGTGTTTAGCTCAAATTCAATACACTAAGTTAAGATTTAC

>TRINITY_DN40374_c0_g1_i1 from sample A8 / Example unspliced isoform:

AAAAGCTTGCCCAAATATTGAGgtatgttactattttactacaataatcaatcagctacagccagctccttgagcattagctgtattttccacaaaagcacaaccaacttttgggatggtgttttactaatgagatattttctgttttattaatgagatattttctgtgtgcttgaggcagGCTATTGATTTGCATGGTC
ATTTCCAGGTTCCTAAAGATCAGGGTCTTAATTCTGGTGTTCCTCTGTGTTTGAAGGACTTGACATCTCTTTCAGCTGCAGCATTTGGTGTTTTGCATGATCTTGAAGAATGCCAATTTGCAGCTTGGAATTTGCATTCTTTGAAGCGTTTACGACTGGAATCTAGGGAACCTCTTGCCATACAGCATCTTGAGAGTTTG
CAGTGTTCATGCCCTCAGCTGGAAAGCGTTCACCTGATTTGGAACAGTTTCAGCGGACCAAAGGAAGCACAAATTTATCCCTTTACACATGAAGGCATCATGGACTATATTAGATCTGTTTTTGTATAGATGCTGCATTTTAAAAGGGTTGAAATTCAGGCTGCAATTAGTATGTCCTGGATGATTCGGAAAAGTTTATT
ATCCTGCAGTGTATATTAAGTCGGCAATATAGAAACATGGTTGTTAGCAGGTTTTGTGGAGGGTTGATATTATTGGGCCTTTTGTGCTCAGATTTATTCTTGTGCTGGTAATATGGCATTGTATAGCATTGTAGACAATTCTAGCAATGAGTAATATAAGTCATTAGAATTGGGATACTCTTAAGGTTTTGTTTGACTGT
TTGGCTCAATTTCAGTTCACTAAGCTTTACTAGTTAACATTATTATAATTGTTTGAACTTTATTACTCTCAAAGGTTTTGTATGATAATTAAAAACGTGTTTAGCTCAAATTCAATACACTAAGTTAAGATTTAC