sp|Q9ZQP1|TPMT1_ARATH ----> Phosphatidylglycerophosphate phosphatase PTPMT1
Intron 1 GTATATTCTT ... ATAATATCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 19.15 | 152 | 33.5 | 36 |
| A2 | 19.35 | 125 | 20.8 | 30 |
| A3 | 21.5 | 157 | 17.8 | 43 |
| A4 | 15.15 | 112 | 21.2 | 20 |
| A5 | 21.03 | 56.3 | 9.4 | 15 |
| A6 | 13.75 | 288.5 | 19.3 | 46 |
| A7 | 17.24 | 278.5 | 26.1 | 58 |
| A8 | 14.45 | 177.5 | 19.1 | 30 |
| A9 | 17.51 | 268.5 | 28.1 | 57 |
| A10 | 18 | 205 | 18.2 | 45 |
>TRINITY_DN114739_c0_g1_i13 from sample A2 / Example spliced isoformGTCGTATTTTGGTGGAATGAAAGCATTTGGGATGGCTGTGGGGTTTGTTGAATGAGTTAGGTGGAGCACGAAATTCTTACCAATTCCGCGAGAACTGAACCAGAAAGCTCGTTTAAATTTTACGATGACTTGGGAAATCCTTTTGTATACGGCTCTTTAACTTATTCCGCTAGAAATCTGTTTGTTCGGGCGGTGATCCG
GCTTTGTTCGGGCGGTGATCCGGCTTAAATCGGCGCTCTATCGGCTCTGTTTGGCCTCGGATTCAAACTGGTTTCGTATGGAATCGGAATAAAATTGGCCGTTTTTGTGCCTGGGAATCGAACCTTTGATGTTGAGGCGGAGGTGGTGAGTCTGGGTACTAGGTTTACATCGTCTTGAGGCGTCGTAGCTCTGGGATTTG
CAAGGGGAATGTTACGGCTTTGGGGTTCTTAATTGATTTTTATTTTTTTGGGGGGCATATGGTGGGCATACACCATGAATGGGTTTTGAGGGCCAGTCGGTTCATTTTATCGATATCTTCAACAAACTTCGGATATAATTAGGGGTGCCACGACTCAGTGCAATATTTTTTTGGATAATTTGAAAATCAGCTCGATTGAT
TGAACATGCTAAATTGGGGTTTTCTTTTATAGTGTAATCCTCTCCAGTCTTTAGGATTAGAGAAATAAAGAAACATCTGAAACGTACTATTGGGGGTTTCTTTTACTTGAATTGTGGATACGAGTACTGGTACTGCAAGTCGCAGTAGAAGCAATGCTTATCAAGGAAGTTGATTTGGTCGAGTCAGGAACCGATCCCGA
TTTTGAGATAGCCCAGACTCCATCGGTCAAGATTACTGCACACGATGTCCGGATAGAGAAGGTTGCTAAGAGGGCGTTTGTTGGAGCAGGTGCCCGCGTCTTATTTTATCCGACTCTTCTGTATAACGTTGTTCGGAACAAGTTTGAACCAGAATTTCGATGGTGGGATGAGGTTGATCAGTTTGTTTTGTTAGGTGCTG
TTCCATTTCCTAAAGATGTTCAACGCTTGAAAGAGCTTGGAGTACGAGGTGTTGTTACACTGAATGAGCCTTATGAGACGCTGGTCCCTACCACTCTGTACCAGGAACATGGTATCAAGCATCTGGTTATTCCAACAAGGGATTATCTCTTTGCTCCTTCATACGACGATATACGAACAGCTGTGGAATTTATTCATGAA
AATGCAATCTGTGGGAAGATGACTTATGTTCATTGTAAAGCTGGGCGAGGACGCAGTACAACTATTGTACTCTGTTATTTGGTGGAATACAAGCAAATGACACCTGCTGATGCCTATGAATATGTAAGGTCTAAGAGGCCAAGAGTTTTGCTGGCAGCCTCGCAGTGGCAGGCAGTACAGGGATATGAAAAACGGAAAAA
TGGAAGTCAGACAAAATTGACAAGTCAGACAAGATTGACATTTCCTGTTCGGCTTTCACTTCGAGATCAGTCTCCTATGATGCCTATATACATATCCCACAGGTTATATGAAAACAATGTGACTACCGACATAGGAGATAGGGACATCTGTTACGATGATTCAATTGTTCTTGTTACAAGTGCCGATCTTGAGGGATATA
GAAGTATTGAAGATGCAGGTCTCATTGGAAATCATTTATGGAAAGAATTGAAGGTAACTTATCGGGTGCGCTTTGTTGCTGCAAGAGGAGCAATAAGAGCTTCGGCTGCATTGGCAAGGCTATCTTACCTATGGGTTGGCTGTCAGACTGAAGGTAAAGCACGGCCAAAAGATCTTCCTGTGGCATCCCTGAAATCTTTA
AAATCTCTGGAGAGCTGCTCATCCGTTGCAGACCGTGTACATGTTCTATGTGCACAGGGTGTAGTTAATTGTTGAGGTGTTGACAGGACATTACGTGATGCTTTAATTCAAATCTTTGTAAGCTAGAAGGTTTATACATATTCATTTTAGAACTTGAACATCTCTCATCTGCATTGTTGTCTAAATTAGCTTGCGGGGCA
TATTCTAGGAAGTACCAGACGCCTTCAAGTTCAATTCTGGAACTTGCATCTAACAATAAGGTTTTAAGAGCTCGTCTTTTTTCAAGCATTGACATCACGAAGTGTCAGGTTATTTGGCCGTCAAGTGCATTTAAAGCTTAATAAGCTTATAGAAAGTATTGTAATGCCAGGCAAATAATTGTGCTGCAAATGAGCTTTTG
GTTGAGTAATTTTTGGCTTTCTGGAACAAGATGGTAGTACTGTAAAAACACATGTATGGTGATTATAGGAATATATTGTAACAATGTTGCTATTCGCATTATATGTCCGGCTTTCAAACTTTGGCTGTTTATTTATCTGTTGATATCCTAGTTTAGTTCTGTTGTTAGATGTGCTGTTATATCCACGAACCTACTTCGGT
GGTATTGAACTATCGATTCGTGCTGTCTGGAGCCAAGGGGGCATATTTTTTGGTATTTAGATTATTTTTTCTTAATATCATTGAGGTTTGCCAAACAAAGGTTCTAGGAGTTTAATTTAACTAAACAATTTGGTGTCTGCTAATTTTTAACTTATTTGAAAATTTATCGCATCACTTTTCTTGGGGCGTAAATATCTTAC
TAAGAAGTCGAATTGTTGGATTGAAATATGCTTCCATTTCATTTTAATAGAATTGGATAATTCTACTCTTAATTGCCTGTGGTCGGCCCTTTTCTTGAGGCGTAAATATCTTAGAAGTGGAATTGTTGGATTGAAAATATGCTTCCATTTCATTTTATAATAGAATTGGATAATTTTACTCATAATTGCCTTGTGGTTGT
ATGTCAGTTGGAAACGTTGAAAATATAAAAAGAGAC
>TRINITY_DN114739_c0_g1_i3 from sample A2 / Example unspliced isoform:GTCGTATTTTGGTGGAATGAAAGCATTTGGGATGGCTGTGGGGTTTGTTGAATGAGTTAGGTGGAGCACGAAATTCTTACCAATTCCGCGAGAACTGAACCAGAAAGCTCGTTTAAATTTTACGATGACTTGGGAAATCCTTTTGTATACGGCTCTTTAACTTATTCCGCTAGAAATCTGTTTGTTCGGGCGGTGATCCG
GCTTTGTTCGGGCGGTGATCCGGCTTAAATCGGCGCTCTATCGGCTCTGTTTGGCCTCGGATTCAAACTGGTTTCTTATGGAATCGGAATAAAATTGGCCGTTTTTGTGCCTGGGAATCGAACCTTTGATGTTGAGGCGGAGGTGGTGAGTCTGGGTACTAGGTTTACATCGTCTTGAGGCGTCGTAGCTCTGGGATTTG
CAAGGGGAATGTTACGGCTTTGGGGTTCTTAATTGATTTTTATTTTTTTGGGGGGCATATGGTGGGCATAGTAAGAGGTCACGCCGACACCATGAATGGGTTTTGAGGGCCAGTCGGTTCATTTTATCGATATCTTCAACAAACTTCGGATATAATTAGGGGTGCCACGACTTAGTGCAATATTGTTTTGGATAATTTGA
AAATCAGCTCGATTGATTGAACATGCTAAATTGGGGTTTTCTTTTATAGTGTAATCCTCTCCAGTCTTTAGGATTAGAGAAATAAAGAAACATCTGAAACGTACTATTGGGGGTTTCTTTTACTTGAATTGTGGATACGAGTACTGGTACTGCAAGTCGCAGTAGAAGCAATGCTTATCAAGGAAGTTGATTTGGTCGAG
TCAGGAACCGATCCCGATTTTGAGATAGCCCAGACTCCATCGGTCAAGATTACTGCACACGATGTCCGGATAGAGAAGGTTGCTAAGAGGGCGTTTGTTGGAGCAGGTGCCCGCGTCTTATTTTATCCGACTCTTCTGTATAACGTTGTTCGGAACAAGTTTGAACCAGAATTTCGATGGTGGGATGAGGTTGATCAGTT
TGTTTTGTTAGGTGCTGTTCCATTTCCTAAAGATGTTCAACGCTTGAAAGAGCTTGGAGTACGAGGTGTTGTTACACTGAATGAGCCTTATGAGACGCTGGTCCCTACCACTCTGTACCAGGAACATGGTATCAAGCATCTGGTTATTCCAACAAGGGATTATCTCTTTGCTCCTTCATACGACGATATACGAACAGCTG
TGGAATTTATTCATGAAAATGCAATCTGTGGGAAGATGACTTATGTTCATTGTAAAGCTGGGCGAGGACGCAGTACAACTATTGTACTCTGTTATTTGgtatattctttttgttcactgtcttctcaattcacgtgtcaataggaatttcataagtatattgtgatgtctgaatatattcttcaaaataatgaacctact
acttcagtgttgaaaagagaaatcacttttagggaatctcttttggtagggaatgtgtccattttaacatgttgcaacatctccaccttgccttgcacaactataccaaaacaatgacgttaattattttcaaataggataaataatttaattatgaaatgattttcaccagttgctggtttggtagctgtagcttctgt
cagaagctacatgctaactggaactattacgttaagggtggttctccgattaggttaaatattttcaattagaataaattatgaaatcattttcacctgttgttggtttatgaactgtagctcctgtctacagctatactttactggcactgttacactgcgtgctattctcggattaggttaaatattttcaaatagta
taataatgaaaccaggtgcaactttcttaaggtagatctacataaacttcagtaacggaaaaaaacagataattttgctacgtttagcgttacttaaaagatggccgtgacataatttgtgtgtgaaacatctaatgtctcaactcaagctaatttttgtgtaagaagctgtgggaaatggccccgtgtaaaccaaaaca
tgatctcccttggctcttggataatatcagGTGGAATACAAGCAAATGACACCTGCTGATGCCTATGAATATGTAAGGTCTAAGAGGCCAAGAGTTTTGCTGGCAGCCTCGCAGTGGCAGGCAGTACAGGGATATGAAAAACGGAAAAATGGAAGTCAGACAAAATTGACAAGTCAGACAAGATTGACATTTCCTGTTCG
GCTTTCACTTCGAGATCAGTCTCCTATGATGCCTATATACATATCCCACAGGTTATATGAAAACAATGTGACTACCGACATAGGAGATAGGGACATCTGTTACGATGATTCAATTGTTCTTGTTACAAGTGCCGATCTTGAGGGATATAGAAGTATTGAAGATGCAGGTCTCATTGGAAATCATTTATGGAAAGAATTGA
AGGTAACTTATCGGGTGCGCTTTGTTGCTGCAAGAGGAGCAATAAGAGCTTCGGCTGCATTGGCAAGGCTATCTTACCTATGGGTTGGCTGTCAGACTGAAGGTAAAGCACGGCCAAAAGATCTTCCTGTGGCATCCCTGAAATCTTTAAAATCTCTGGAGAGCTGCTCATCCGTTGCAGACCGTGTACCTAGCATGCGT
GTGGATGTTCTATGTGCACAGGGTGTAGTTAATTGTTGAGGTGTTGACAGGACATTACGTGATGCTTTAATTCAAATCTTTGTAAGCTAGAAGGTTTATACATATTCATTTTAGAACTTGAACATCTCTCATCTGCATTGTTGTCTAAATTAGCTTGCGGGGCATATTCTAGGAAGTACCAGACGCCTTCAAGTTCAATT
CTGGAACTTGCATCTAACAATAAGGTTTTAAGAGCTCGTCTTTTTTCAAGCATTGACATCACGAAGTGTCAGGTTATTTGGCCGTCAAGTGCATTTAAAGCTTAATAAGCTTATAGAAAGTATTGTAATGCCAGGCAAATAATTGTGCTGCAAATGAGCTTTTGGTTGAGTAATTTTTGGCTTTCTGGAACAAGATGGTA
GTACTGTAAAAACACATGTATGGTGATTATAGGAATATATTGTAACAATGTTGCTATTCGCATTATATGTCCGGCTTTCAAACTTTGGCTGTTTATTTATCTGTTGATATCCTAGTTTAGTTCTGTTGTTAGATGTGCTGTTATATCCACGAACCTACTTCGGTGGTATTGAACTATCGATTCGTGCTGTCTGGAGCCAA
GGGGGCATATTTTTTGGTATTTAGATTATTTTTTCTTAATATCATTGAGGTTTGCCAAACAAAGGTTCTAGGAGTTTAATTTAACTAAACAATTTGGTGTCTGCTAATTTTTAACTTATTTGAAAATTTATCGCATCACTTTTCTTGGGGCGTAAATATCTTACTAAGAAGTCGAATTGTTGGATTGAAATATGCTTCCA
TTTCATTTTAATAGAATTGGATAATTCTACTCTTAATTGCCTGTGGTCGGCCCTTTTCTTGAGGCGTAAATATCTTAGAAGTGGAATTGTTGGATTGAAAATATGCTTCCATTTCATTTTATAATAGAATTGGATAATTTTACTCATAATTGCCTTGTGGTTGTATGTCAGTTGGAAACGTTGAAAATATAAAAAGAGAC
Intron 2 GTGAGTCTGG ... GTCGAGTCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 78.42 | 45 | 203 | 124 |
| A2 | 78.77 | 43 | 197 | 122 |
| A3 | 71.43 | 69 | 211 | 134 |
| A4 | 64.91 | 80 | 199 | 97 |
| A5 | 70.9 | 47 | 156 | 73 |
| A6 | 71.54 | 72 | 201 | 161 |
| A7 | 71.66 | 89 | 270 | 180 |
| A8 | 65.69 | 41 | 92 | 65 |
| A9 | 74.83 | 57 | 207 | 132 |
| A10 | 66.67 | 86 | 195 | 149 |
>TRINITY_DN42444_c0_g1_i7 from sample A8 / Example spliced isoformGGACAAGTGGTCGTATTTTGGTGGAATGAAAGCATTTGGGATGGCTGTGGGGTTTGTTGAATGAGTTAGGTGGAGCACGAAATTCTTACCAATTCCGCGAGAACTGAACCAGAAAGCTCGTTTAAATTTTACGATGACTTGGGAAATCCTTTTGTATACGGCTCTTTAACTTATTCCGCTAGAAATCTGTTTGTTCGGGC
GGTGATCCGGCTTTGTTCGGGCGGTGATCCGGCTTAAATCGGTGCTCTATCGGCTCTGTTTGGCCTCGGATTCAAACTGGTTTCTTATGGAATCGGAATAAAATTGGCCGTTTTTGTGCCTGGGAATCGAACCTTTGATGTTGAGGCGGAGGTGGAACCGATCCCGATTTTGAGAAAGCCCAGACTCCATCGGTCAAGAT
TACTGCACACGATGTCCGGATAGAGAAGGTTGCTAAGAGGGCGTTTGTTGGAGCAGGTGCCCGCGTCTTATTTTATCCGACTCTTCTGTATAACGTTGTTCGGAACAAGTTTGAACCAGAATTTCGATGGTGGGATGAGGTTGATCAGTTTGTTTTGTTAGGTGCTGTTCCATTTCCTAAAGATGTTCAACGCTTGAAAG
AGCTTGGAGTACGAGGTGTTGTTACACTGAATGAGCCTTATGAGACGCTGGTCCCTACCACTCTGTACCAGGAACATGGTATCAAGCATCTGGTTATTCCAACAAGGGATTATCTCTTTGCTCCTTCATACGACGATATACGAACAGCTGTGGAATTTATTCATG
>TRINITY_DN42444_c0_g1_i2 from sample A8 / Example unspliced isoform:GGACAAGTGGTCGTATTTTGGTGGAATGAAAGCATTTGGGATGGCTGTGGGGTTTGTTGAATGAGTTAGGTGGAGCACGAAATTCTTACCAATTCCGCGAGAACTGAACCAGAAAGCTCGTTTAAATTTTACGATGACTTGGGAAATCCTTTTGTATACGGCTCTTTAACTTATTCCGCTAGAAATCTGTTTGTTCGGGC
GGTGATCCGGCTTTGTTCGGGCGGTGATCCGGCTTAAATCGGTGCTCTATCGGCTCTGTTTGGCCTCGGATTCAAACTGGTTTCTTATGGAATCGGAATAAAATTGGCCGTTTTTGTGCCTGGGAATCGAACCTTTGATGTTGAGGCGGAGGTGgtgagtctgggtactaggtttacatcgtcttgaggcgtcgtagctc
tgggatttgcaaggggaatgttacggctttggggttcttaattgatttttatttttttggggggcatatggtgggcatacaccatgaatgggttttgagggccagtcggttcattttatcgatatcttcaacaaacttcggatataattaggggtgccacgactcagtgcaatatttttttggataatttgaaaatcagc
tcgattgattgaacatgctaaattggggttttcttttatagtgtaatcctctccagtctttaggattagagaaataaagaaacatctgaaacgtactattgggggtttcttttacttgaattgtggatacgagtactggtactgcaagtcgcagtagaagcaatgcttatcaaggaagttgatttggtcgagtcagGAAC
CGATCCCGATTTTGAGAAAGCCCAGACTCCATCGGTCAAGATTACTGCACACGATGTCCGGATAGAGAAGGTTGCTAAGAGGGCGTTTGTTGGAGCAGGTGCCCGCGTCTTATTTTATCCGACTCTTCTGTATAACGTTGTTCGGAACAAGTTTGAACCAGAATTTCGATGGTGGGATGAGGTTGATCAGTTTGTTTTGT
TAGGTGCTGTTCCATTTCCTAAAGATGTTCAACGCTTGAAAGAGCTTGGAGTACGAGGTGTTGTTACACTGAATGAGCCTTATGAGACGCTGGTCCCTACCACTCTGTACCAGGAACATGGTATCAAGCATCTGGTTATTCCAACAAGGGATTATCTCTTTGCTCCTTCATACGACGATATACGAACAGCTGTGGAATTT
ATTCATGAAAATGCAATCTGTGGGAAGATGACTTATGTTCATTGTAAAGCTGGACGAGGACGCAGTACAACTATTGTACTCTGTTATTTGGTGGAATACAAGCAAATGACACCTGCTGATGCCTATGAATATGTAAGGTCTAAGAGGCCAAGAGTTTTGCTGGCAGCCTCGCAGTGGCAGGCAGTACAGGGATATGAAAA
ACGGAAAAATGGAAGTCAGACAAAATTGACAAGTCAGACAAGATTGACATTTCCTGTTCGGCTTTCACTTCGAGATCAGTCTCCTATGATGCCTATATACATATCCCACAGGTTATATGAAAACAATGTGACTACCGACATAGGAGATAGGGACATCTGTTACGATGATTCAATTGTTCTTGTTACAAGTGCCGATCTTG
AGGGATATAGAAGTATTGAAGATGCAGGTCTCATTGGAAATCATTTATGGAAAGAATTGAAGGTAACTTATCGGGTGCGCTTTGTTGCTGCAAGAGGAGCAATAAGAGCTTCGGCTGCATTGGCAAGGCTATCTTACCTATGGGTTGGCTGTCAGACTGAAGGTAAAGCACGGCCAAAAGATCTTCCTGTGGCATCCCTG
AAATCTTTAAAATCTCTGGAGAGCTGCTCATCCGTTGCAGACCGTGTACATGTTCTATGTGCACAGGGTGTAGTTAATTGTTGAGGTGTTGACAGGACATTACGTGATGCTTTAATTCAAATCTTTGTAAGCTAGAAGGTTTATACATATTCATTTTAGAACTTGAACATCTCTCATCTGCATTGTTGTCTAAATTAGCT
TGCGGGGCATATTCTAGGAAGTACCAGACGCCTTCAAGTTCAATTCTGGAACTTGCATCTAACAATAAGGTTTTAAGAGCTCGTCTTTTTTCAAGCATTGACATCACGAAGTGTCAGGTTATTTGGCCGTCAAGTGCATTTAAAGCTTAATAAGCTTATAGAAAGTATTGTAATGCCAGGCAAATAATTGTGCTGCAAAT
GAGCTTTTGGTTGAGTAATTTTTGGCTTTCTGGAACAAGATGGTAGTACTGTAAAAACACATGTATGGTGATTATAGGAATATATTGTAACAATGTTGCTATTCGCATTATATGTCCGGCTTTCAAACTTTGGCTGTTTATTTATCTGTTGATATCCTAGTTTAGTTCTGTTGTTAGATGTGCTGTTATATCCACGAACC
TACTTCGGTGGTATTGAACTATCGATTCGTGCTGTCTGGAGCCAAGGGGGCATATTTTTTGGTATTTAGATTATTTTTTCTTAATATCATTGAGGTTTGCCG
Intron 3 GTAGGCAGAC ... ATTTGAACAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 28.29 | 144 | 34.6 | 56.8 |
| A2 | 17.32 | 105 | 31.2 | 22 |
| A3 | 19.05 | 130 | 43.2 | 30.6 |
| A4 | 18.37 | 80 | 22.4 | 18 |
| A5 | 17.74 | 51 | 18.8 | 11 |
| A6 | 23.37 | 274 | 67.4 | 83.6 |
| A7 | 21.39 | 271.2 | 58.8 | 73.8 |
| A8 | 25.65 | 164 | 41.6 | 56.6 |
| A9 | 17.44 | 231 | 65 | 48.8 |
| A10 | 21.7 | 197 | 50.2 | 54.6 |
>TRINITY_DN109122_c0_g2_i20 from sample A4 / Example spliced isoformCGGATAAGGGTAGCCATAATAAATTCTCGACACGTGTCTCGAATATGCCAGAGTGGCCGAGTCTTACGTGGCACATGCGAGACGCGTTGTACCGGGGATGACGATGGGCGTGCCATGAATGTGATGAGGTGGACAAGTGGTCGTATTTTGGTGGAATGAAAGCATTTGGGATGGCTGTGGGGTTTGTTGAATGAGTTAGG
TGGAGCACGAAATTCTTACCAATTCCGCGAGAACTGAACCAGAAAGCTCGTTTAAATTTTACGATGACTTGGGAAATCCTTTTGTAAACGGCTCTTTAACTTATTCCGCTAGAAATCTGTTTGTTCGGGCGGTGATCCGGCTTTGTTCGGGCGGTGATCCGGCTTAAATCGGTGCTCTATCGGCTCTGTTTGGCCTCGGA
TTCAAACTGGTTTCTTATGGAATCGGAATAAAATTGGCCGTTTTTGTGCCTGGGAATCGAACCTTTGATGTTGAGGCGGAGGTGGTGAGTCTGGGTACTAGGTTTACATCGTCTTGAAGCGTCGTAGCTCTGGGATTTGCAAGGGGAATGTTACGGCTTTGGGGTTCTTAATTGATTTTTATTTTTTTGGGGGGCATATG
GTGGGCATAGTAAGAGGTCACGCCGACACCATGAATGGGTTTTGAGGGCCAGTCGGTTCATTTTATCGATATCTTCAACAAACTTCGGATATAATTAGGGGTGCCACGACTTAGTGCAATATTGTTTTGGATAATTTGAAAATCAGCTCGATTGATTGAACATGCTAAATTGGGGTTTTCTTTTATAGTGTAATCCTCTC
CAGTCTTTAGGATTAGAGAAATAAAGAAACATCTGAAACGTACTATTGGGGGTTTCTTTTACTTGAATTGTGGATACGAGTACTGGTACTGCAAGTCGCAGTAGAAGCAATGCTTATCAAGGAAGTTGATTTGGTCGAGTCAGGAACCGATCCCGATTTTGAGATAGCCCAGACTCCATCGGTCAAGATTACTGCACACG
ATGTCCGGATAGAGAAGGTTGCTAAGAGGGCGTTTGTTGGAGCAGGTGCCCGCGTCTTATTTTATCCGACCCTTCTGTATAACGTTGTTCGGAACAAGTTTGAACCAGAATTTCGATGGTGGGATGAGGTTGATCAGTTTGTTTTGTTAGGTGCTGTTCCATTTCCTAAAGATGTTCAACGCTTGAAAGAGCTTGGAGTA
CGAGGTGTTGTTACACTGAATGAGCCTTATGAGACGCTGGTCCCTACCACTCTGTACCAGGAACATGGTATCAAGCATCTGGTTATTCCAACAAGGGATTATCTCTTTGCTCCTTCATACGACGACATACGAACAGCTGTGGAATTTATTCATGAAAATGCAATCTGTGGGAAGATGACTTATGTTCATTGTAAAGCTGG
ACGAGGACGCAGTACAACTATTGTACTCTGTTATTTGGTGGAATACAAGCAAATGACACCTGCTGATGCCTATGAATATGTAAGGTCTAAGAGGCCAAGAGTTTTGCTGGCAGCCTCGCAGTGGCAGGCAGTACAGGGATATGAAAAACGGAAAAATGGAAGTCAGACAAAATTGACAAGTCAGACAAGATTGACATTTC
CTGTTCGGCTTTCACTTCGAGATCAGTCTCCTATGATGCCTATATACATATCCCACAGGTTATATGAAAACAATGTGACTACCGACATAGGAGATAGGGACATCTGTTACGATGATTCAATTGTTCTTGTTACAAGTGCCGATCTTGAGGGATATAGAAGTATTGAAGATGCAGGTCTCATTGGAAATCATTTATGGAAA
GAATTGAAGGTAACTTATCGGGTGCGCTTTGTTGCTGCAAGAGGAGCAATAAGAGCTTCGGCTGCATTGGCAAGGCTATCTTACCTATGGGTTGGCTGTCAGACTGAAGGTAAAGCACGGCCAAAAGATCTTCCTGTGGCATCCCTGAAATCTTTAAAATCTCTGGAGAGCTGCTCATCCGTTGCAGACCGTGTACCTAG
CATGCGTGTGGATGTTCTATGTGCACAGGGTGTAGTTAATTGTTGAGATGTTGACAGGACATTACGTGATGCTTTAATTCAAATCTTTGTAAGCTAGAAGGTTTATACATATTCATTTTAGAACTTGAACATCTCTCATCTGCATTGTTGTCTAAATTAGCTTGCGGGGCATATTCTAGGAAGTACCAGACGCCTTCAAG
TTCAATTCTGGAACTTGCATCTAACAATAAGGTTTTAAGAGCTCGTCTTTTTTCAAGCATTGACATCACGAAGTGTCAGGTTATTTGGCCGTCAAGTGCATTTAAAGCTTAATAAGCTTATAGAAAGTATTGTAATGCCAGGCAAATAATTGTGCTGCAAATGAGCTTTTGGTTGAGTAATTTTTGGCTTTCTGGAACAA
GATGGTAGTACTGTAAAAACACATGTATGGTGATTATAGGAATATATTGTAACAATGTTGCTATTCGCATTATATGTCCGGCTTTCAAACTTTGGCTGTTTATTTATCTGTTGATATCCTAGTTTAGTTCTGTTGTTAGATGTGCTGTTATATCCACGAACCTACTTCGGTGGTATTGAACTATCGATTCGTGCTGTCTG
GAGCCAAGGGGGCATATTTTTTGGTATTTAGATTATTTTTTCTTAATATCATTGAGGTTTGCCAAACAAAGGTTCTAGGAGTTTAATTTAACTAAACAATTTGGTGTCTGCTAATTTTTAACTTATTTGAAAATTTATCGCATCACTTTTCTTGGGGCGTAAATATCTTACTAAGAAGTCGAATTGTTGGATTGAAAATA
TGCTTCCATTTCATTTTAATAGAATTGGATAATTCTACTCTTAATTGCCTGTGGCCGGC
>TRINITY_DN109122_c0_g2_i12 from sample A4 / Example unspliced isoform:CTCAACTCAAGCTAATTTTTGTGTAAGAAGCTGTGGGAAATGGCCCCGTGTAAACCAAAACATGATCTCCCTTGGCTCTTGGATAATATCAGGTGGAATACAAGCAAATGACACCTGCTGATGCCTATGAATATGTAAGGTCTAAGAGGCCAAGAGTTTTGCTGGCAGCCTCGCAGTGGCAGgtaggcagactacacttc
ttgtctttgctatttaaaaagttgcatctccatatagaatatctgacggtttgatttgaacagGCAGTACAGGGATATGAAAAACGGAAAAATGGAAGTCAGACAAAATTGACAAGTCAGACAAGATTGACATTTCCTGTTCGGCTTTCACTTCGAGATCAGTCTCCTATGATGCCTATATACATATCCCACAGGTTATA
TGAAAACAATGTGACTACCGACATAGGAGATAGGGACATCTGTTACGATGATTCAATTGTTCTTGTTACAAGTGCCGATCTTGAGGGATATAGAAGTATTGAAGATGCAGGTCTCATTGGAAATCATTTATGGAAAGAATTGAAGGTAACTTATCGGGTGCGCTTTGTTGCTGCAAGAGGAGCAATAAGAGCTTCGGCTG
CATTGGCAAGGCTATCTTACCTATGGGTTGGCTGTCAGACTGAAGGTAAAGCACGGCCAAAAGATCTTCCTGTGGCATCCCTGAAATCTTTAAAATCTCTGGAGAGCTGCTCATCCGTTGCAGACCGTGTAC
Intron 4 GTGAGTCTGG ... GTCGAGTCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 78.42 | 45 | 203 | 124 |
| A2 | 78.77 | 43 | 197 | 122 |
| A3 | 71.43 | 69 | 211 | 134 |
| A4 | 64.84 | 80 | 199 | 96 |
| A5 | 70.9 | 47 | 156 | 73 |
| A6 | 71.54 | 72 | 201 | 161 |
| A7 | 71.66 | 89 | 270 | 180 |
| A8 | 65.69 | 41 | 92 | 65 |
| A9 | 74.78 | 57 | 207 | 131 |
| A10 | 66.6 | 86 | 195 | 148 |
>TRINITY_DN42444_c0_g1_i7 from sample A8 / Example spliced isoformGGACAAGTGGTCGTATTTTGGTGGAATGAAAGCATTTGGGATGGCTGTGGGGTTTGTTGAATGAGTTAGGTGGAGCACGAAATTCTTACCAATTCCGCGAGAACTGAACCAGAAAGCTCGTTTAAATTTTACGATGACTTGGGAAATCCTTTTGTATACGGCTCTTTAACTTATTCCGCTAGAAATCTGTTTGTTCGGGC
GGTGATCCGGCTTTGTTCGGGCGGTGATCCGGCTTAAATCGGTGCTCTATCGGCTCTGTTTGGCCTCGGATTCAAACTGGTTTCTTATGGAATCGGAATAAAATTGGCCGTTTTTGTGCCTGGGAATCGAACCTTTGATGTTGAGGCGGAGGTGGAACCGATCCCGATTTTGAGAAAGCCCAGACTCCATCGGTCAAGAT
TACTGCACACGATGTCCGGATAGAGAAGGTTGCTAAGAGGGCGTTTGTTGGAGCAGGTGCCCGCGTCTTATTTTATCCGACTCTTCTGTATAACGTTGTTCGGAACAAGTTTGAACCAGAATTTCGATGGTGGGATGAGGTTGATCAGTTTGTTTTGTTAGGTGCTGTTCCATTTCCTAAAGATGTTCAACGCTTGAAAG
AGCTTGGAGTACGAGGTGTTGTTACACTGAATGAGCCTTATGAGACGCTGGTCCCTACCACTCTGTACCAGGAACATGGTATCAAGCATCTGGTTATTCCAACAAGGGATTATCTCTTTGCTCCTTCATACGACGATATACGAACAGCTGTGGAATTTATTCATG
>TRINITY_DN42444_c0_g1_i10 from sample A8 / Example unspliced isoform:GGACAAGTGGTCGTATTTTGGTGGAATGAAAGCATTTGGGATGGCTGTGGGGTTTGTTGAATGAGTTAGGTGGAGCACGAAATTCTTACCAATTCCGCGAGAACTGAACCAGAAAGCTCGTTTAAATTTTACGATGACTTGGGAAATCCTTTTGTATACGGCTCTTTAACTTATTCCGCTAGAAATCTGTTTGTTCGGGC
GGTGATCCGGCTTTGTTCGGGCGGTGATCCGGCTTAAATCGGTGCTCTATCGGCTCTGTTTGGCCTCGGATTCAAACTGGTTTCTTATGGAATCGGAATAAAATTGGCCGTTTTTGTGCCTGGGAATCGAACCTTTGATGTTGAGGCGGAGGTGgtgagtctgggtactaggtttacatcgtcttgaggcgtcgtagctc
tgggatttgcaaggggaatgttacggctttggggttcttaattgatttttatttttttggggggcatatggtgggcatagtaagaggtcacgccgacaccatgaatgggttttgagggccagtcggttcattttatcgatatcttcaacaaacttcggatataattaggggtgccacgacttagtgcaatattgttttgg
ataatttgaaaatcagctcgattgattgaacatgctaaattggggttttcttttatagtgtaatcctctccagtctttaggattagagaaataaagaaacatctgaaacgtactattgggggtttcttttacttgaattgtggatacgagtactggtactgcaagtcgcagtagaagcaatgcttatcaaggaagttgat
ttggtcgagtcagGAACCGATCCCGATTTTGAGAAAGCCCAGACTCCATCGGTCAAGATTACTGCACACGATGTCCGGATAGAGAAGGTTGCTAAGAGGGCGTTTGTTGGAGCAGGTGCCCGCGTCTTATTTTATCCGACTCTTCTGTATAACGTTGTTCGGAACAAGTTTGAACCAGAATTTCGATGGTGGGATGAGGT
TGATCAGTTTGTTTTGTTAGGTGCTGTTCCATTTCCTAAAGATGTTCAACGCTTGAAAGAGCTTGGAGTACGAGGTGTTGTTACACTGAATGAGCCTTATGAGACGCTGGTCCCTACCACTCTGTACCAGGAACATGGTATCAAGCATCTGGTTATTCCAACAAGGGATTATCTCTTTGCTCCTTCATACGACGATATAC
GAACAGCTGTGGAATTTATTCATGAAAATGCAATCTGTGGGAAGATGACTTATGTTCATTGTAAAGCTGGACGAGGACGCAGTACAACTATTGTACTCTGTTATTTGGTGGAATACAAGCAAATGACACCTGCTGATGCCTATGAATATGTAAGGTCTAAGAGGCCAAGAGTTTTGCTGGCAGCCTCGCAGTGGCAGGCA
GTACAGGGATATGAAAAACGGAAAAATGGAAGTCAGACAAAATTGACAAGTCAGACAAGATTGACATTTCCTGTTCGGCTTTCACTTCGAGATCAGTCTCCTATGATGCCTATATACATATCCCACAGGTTATATGAAAACAATGTGACTACCGACATAGGAGATAGGGACATCTGTTACGATGATTCAATTGTTCTTGT
TACAAGTGCCGATCTTGAGGGATATAGAAGTATTGAAGATGCAGGTCTCATTGGAAATCATTTATGGAAAGAATTGAAGGTAACTTATCGGGTGCGCTTTGTTGCTGCAAGAGGAGCAATAAGAGCTTCGGCTGCATTGGCAAGGCTATCTTACCTATGGGTTGGCTGTCAGACTGAAGGTAAAGCACGGCCAAAAGATC
TTCCTGTGGCATCCCTGAAATCTTTAAAATCTCTGGAGAGCTGCTCATCCGTTGCAGACCGTGTACATGTTCTATGTGCACAGGGTGTAGTTAATTGTTGAGGTGTTGACAGGACATTACGTGATGCTTTAATTCAAATCTTTGTAAGCTAGAAGGTTTATACATATTCATTTTAGAACTTGAACATCTCTCATCTGCAT
TGTTGTCTAAATTAGCTTGCGGGGCATATTCTAGGAAGTACCAGACGCCTTCAAGTTCAATTCTGGAACTTGCATCTAACAATAAGGTTTTAAGAGCTCGTCTTTTTTCAAGCATTGACATCACGAAGTGTCAGGTTATTTGGCCGTCAAGTGCATTTAAAGCTTAATAAGCTTATAGAAAGTATTGTAATGCCAGGCAA
ATAATTGTGCTGCAAATGAGCTTTTGGTTGAGTAATTTTTGGCTTTCTGGAACAAGATGGTAGTACTGTAAAAACACATGTATGGTGATTATAGGAATATATTGTAACAATGTTGCTATTCGCATTATATGTCCGGCTTTCAAACTTTGGCTGTTTATTTATCTGTTGATATCCTAGTTTAGTTCTGTTGTTAGATGTGC
TGTTATATCCACGAACCTACTTCGGTGGTATTGAACTATCGATTCGTGCTGTCTGGAGCCAAGGGGGCATATTTTTTGGTATTTAGATTATTTTTTCTTAATATCATTGAGGTTTGCCG
Intron 5 GTTAAAAATC ... ACGGTTTCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 24.76 | 135.1 | 19 | 69.9 |
| A2 | 27.96 | 113.1 | 32.7 | 55 |
| A3 | 20.55 | 165.1 | 29.7 | 55.7 |
| A4 | 23.16 | 139.1 | 24.3 | 59.5 |
| A5 | 22.77 | 131.1 | 27.3 | 50 |
| A6 | 19.81 | 147.3 | 21.3 | 51.4 |
| A7 | 19.42 | 180.5 | 11.3 | 75.7 |
| A8 | 13.98 | 41 | 1.3 | 12 |
| A9 | 21.32 | 141.3 | 15.7 | 60.9 |
| A10 | 11.86 | 128.4 | 15.3 | 19.2 |
>TRINITY_DN120072_c0_g1_i9 from sample A1 / Example spliced isoformGTGGAATGAAAGCATTTGGGATGGCTGTGGGGTTTGTTGAATGAGTTAGGTGGAGCACGAAATTCTTACCAATTCCGCGAGAACTGAACCAGAAAGCTCGTTTAAATTTTACGATGACTTGGGAAATCCTTTTGTATACGGCTCTTTAACTTATTCCGCTAGAAATCTGTTTGTTCGGGCGGTGATCCGGCTTTGTTCGG
GCGGTGATCCGGCTTAAATCGGCGCTCTATCGGCTCTGTTTGGCCTCGGATTCAAACTGGTTTCTTATGGAATCGGAATAAAATTGGCCGTTTTTGTGCCTGGGAATCGAACCTTTGATGTTGAGGCGGAGGTGGTGAGTCTGGGTACTAGGTTTACATCGTCTTGAGGCGTCGTAGCTCTGGGATTTGCAAGGGGAATG
TTACGGCTTTGGGGTTCTTAATTGATTTTTATTTTTTTGGGGGGCATATGGTGGGCATAGTAAGAGGTCACGCCGACACCATGAATGGGTTTTGAGGGCCAGTCGGTTCATTTTATCGATATCTTCAACAAACTTCGGATATAATTAGGGGTGCCACGACTTAGTGCAATATTGTTTTGGATAATTTGAAAATCAGCTCG
ATTGATTGAACATGCTAAATTGGGGTTTTCTTTTATAGTGTAATCCTCTCCAGTCTTTAGGATTAGAGAAATAAAGAAACATCTGAAACGTACTATTGGGGGTTTCTTTTACTTGAATTGTGGATACGAGTACTGGTACTGCAAGTCGCAGTAGAAGCAATGCTTATCAAGGAAGTTGATTTGGTCGAGTCAGGAACCGA
TCCCGATTTTGAGATAGCCCAGACTCCATCGGTCAAGATTACTGCACACGATGTCCGGATAGAGAAGGTTGCTAAGAGGGCGTTTGTTGGAGCAGGTGCCCGCGTCTTATTTTATCCGACCCTTCTGTATAACGTTGTTCGGAACAAGTTTGAACCAGAATTTCGATGGTGGGATGAGGTTGATCAGGTTTGATTATGAT
ACTATCTCTTATATTTAAACTCAGTTAGCCTGGTTTTTAGCCTTTTGGTTTAATATTTTGACAAGGGTTTGCATAGGTATTTGTTCAGGAATATCAGATATTCGATTTCATTGACATAGTATTCTTTTGTTCCGGAATATAAGATACCCTGTTGCATTGATGTTTTCTATCTATAAATTCAGCAGATGAAGATCGTCATG
GACTAATTCTCTTTAGAGTTTTTGAATGAGGCCAATCATGTTTTTCCCATCAATGAATGAAATAAATTATGTTGTGATCCTTCAAGCCGTTATCATGTTTGCTTTTAAGCTCTGTGACACCCTTTCATGATGTACGATAATCTTAGAGGCTTCTTAGCTTTCTCATGTCTTCTATGCAGTACAATATTTGCTTATTTCTT
GAGTTCCAATTCATTTCTTGGTATTTATTATGTTGTCATATAATGGATGGATGTTTCATAGGACTACCTTCCTGAATTGCCTATTGGCAGGTCTATTCTTCCAATGTAATAATTGATATTTTCGCATCCTGCTTCACATTGAAGTTTGTTTAGATGTTTGATTTCTCTGTCACCTTGATTACTTACTGTGATATATTTGC
AGTTTTCATCTTTTGTCAAACCCTGTGCCGTTTTCTGTGAATCTTGATAATTCCGGAATTCATTAGATGGCTGTAATTTGACCTTTTGTTTAGGTTGTTGAGGGTTTTTTGGTACTTTGGGACTTGTTTTGTGTCAAACCCACAATTATTCATCTGTTTGATGGATATTTAAATTTAACCATCGTCATTGGTGATTTTTA
TTGTGATTGGTGGTTTTTTTTCGTTCTTGACCTTTTGTCTTATTATTGCCCGACATGCTAAGTCTCTCATTGCTCTAGCTTTGAGATGAGTCCTACCAGCTTTCAATAGGGGTTGAGGTATGTTTCTATTTATCTGTACTTGTTTTTGCAACTGTTTTTGTATGTGATCATTGAAGCACTGCCCTTCCATACTTTCTTCA
TGCATAATATTTCTGATTACCATTTACCAAGATTTAAAATGGACACATATTAATTTCTTATGTTGCCATGTCTCCACTTTCTATATATTGCCATATCCAACTGTCAATAATTGCATTAATTATATTGAATTGTTTGAAGAATCAAAACCAGAAAACATTTGGATATTGCCTTTAATTCGATATTTTTGTTGAAATGATTC
ATGATTCACAATAATCAGTTGCATAATCAGGAAATAAAACGAAGTATATTTCATGATTTACTTTGTGATTGGCTCTATACAATTTTGTTTGAAGGAAGTAGTTCTCCATTAATCTTTAAGGTTTGAAGATGTTGAAGCGTGACTCATGTTGACACTTAGTCCATTTGTCCTTTTGGTTACATAAGTTGAGTTGAAGGATA
GTTGTTTTGAGTCTTGACTCTCTTTGTCAAGGTGAGTATGTAAGAGAATGTATTGTCTAGTCTAGTTGACTTAGTCGACAACTTTGCTTTCTGTGCAGAAATTAGTTCATCCTTTGATTGTTTGCAGTTATCAAGCCTCCAATTAGTGACTGCCCAATTGTCATACCTTGCCACCATTATCTTGAATTCATAACATTCAT
CTAGCCTGTTGGAGTCTTGGACACACCCTTTGTAGTTTGGGGTGTGTCCTTATATTATGTTAGCTATGCATTATGCTTCTTTAACCATTGCTTCTCCTTTGATAAATGCTTCTTTAAGCCTTGCTTCACCTCTGAGAACGTGTCGACTCATAAGGTTGTTGATGTATATGTAACTTCGGAATGTATTTCATATATGTATG
TTGTATGTACTCCTATAGAGATGGTATTATTCCTCTATGCAGAAGTGTCGCC
>TRINITY_DN120072_c0_g1_i2 from sample A1 / Example unspliced isoform:GTGGAATGAAAGCATTTGGGATGGCTGTGGGGTTTGTTGAATGAGTTAGGTGGAGCACGAAATTCTTACCAATTCCGCGAGAACTGAACCAGAAAGCTCGTTTAAATTTTACGATGACTTGGGAAATCCTTTTGTATACGGCTCTTTAACTTATTCCGCTAGAAATCTGTTTGTTCGGGCGGTGATCCGGCTTTGTTCGG
GCGGTGATCCGGCTTAAATCGGCGCTCTATCGGCTCTGTTTGGCCTCGGATTCAAACTGgttaaaaatcggcccttttatgcccgtgttatcgtttcaattttgcatattttggtcaattaacagtgtatttatttggtttaaaattccatggagagatttttttggttctgatggttaattgtagttgtatgtgttttt
aatttcaatctggaaacggtttcagGTTTCTTATGGAATCGGAATAAAATTGGCCGTTTTTGTGCCTGGGAATCGAACCTTTGATGTTGAGGCGGAGGTGGTGAGTCTGGGTACTAGGTTTACATCGTCTTGAGGCGTCGTAGCTCTGGGATTTGCAAGGGGAATGTTACGGCTTTGGGGTTCTTAATTGATTTTTATTT
TTTTGGGGGGCATATGGTGGGCATACACCATGAATGGGTTTTGAGGGCCAGTCGGTTCATTTTATCGATATCTTCAACAAACTTCGGATATAATTAGGGGTGCCACGACTCAGTGCAATATTTTTTTGGATAATTTGAAAATCAGCTCGATTGATTGAACATGCTAAATTGGGGTTTTCTTTTATAGTGTAATCCTCTCC
AGTCTTTAGGATTAGAGAAATAAAGAAACATCTGAAACGTACTATTGGGGGTTTCTTTTACTTGAATTGTGGATACGAGTACTGGTACTGCAAGTCGCAGTAGAAGCAATGCTTATCAAGGAAGTTGATTTGGTCGAGTCAGGAACCGATCCCGATTTTGAGATAGCCCAGACTCCATCGGTCAAGATTACTGCACACGA
TGTCCGGATAGAGAAGGTTGCTAAGAGGGCGTTTGTTGGAGCAGGTGCCCGCGTCTTATTTTATCCGACCCTTCTGTATAACGTTGTTCGGAACAAGTTTGAACCAGAATTTCGATGGTGGGATGAGGTTGATCAGTTTGTTTTGTTAGGTGCTGTTCCATTTCCTAAAGATGTTCAACGCTTGAAAGAGCTTGGAGTAC
GAGGTGTT
Intron 6 GTCCGTAAGC ... ATTTATACAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 16.32 | 164.8 | 33.8 | 7.8 |
| A2 | 12.76 | 95 | 15.9 | 0.6 |
| A3 | 13.36 | 136.3 | 23.3 | 1.8 |
| A4 | 11.6 | 95.8 | 12.8 | 2.8 |
| A5 | 20.4 | 63 | 17.6 | 2 |
| A6 | 9.12 | 215 | 24.5 | 2.3 |
| A7 | 11.37 | 212.8 | 30.3 | 2 |
| A8 | 10.35 | 171.3 | 22.8 | 7.6 |
| A9 | 11.6 | 226.5 | 34.2 | 4.2 |
| A10 | 7.3 | 150.3 | 13.1 | 3.2 |
>TRINITY_DN45532_c1_g2_i8 from sample A7 / Example spliced isoformGGTCACGCTTAATTTGGATCTCGAAATCAAAAGATATTCATAATTTACTGCAACTTACAATTTTAAAATTTTTGGTAGTTCTCATGACTGGACTTGAACCCCACCTTGTATAGAGTCACAGACTGCATTTCCTAAATTTATATGCCAAATCTGCTGATATTTTAAGCACAGATACTATTAAGTTTCCTTCTTTCAAAAAA
ATAAGACTACTCAATTTGGATCTCCCCATCAAATTTTATAGGCTATAGCTCTGGGATTGAAGAGTACTTCTGGAAGGTACCGGTCTGAGAATTTTCTGCTCTGATACCACTTTTTTTCTCTTGAGAATAATTCCCCTGGCCCTCCTGCACTTAAGCGAAGAATGAGGAAGCTGGTACTGTGCCAGGACCATTCTGCAGAT
TTCTCCACTCTTCCTGGACTTCTGAAAGGAGGGTGGCATTAACCTCCAACCGCAATAATGGGTGGGTAATCTCTCAGGATTCTTTGGGAATGGATTCCACAACCTCGTTGAGCATTATGCCTTAGTGGAAAGGGTTGAACCAACTGAGCTATCCCTCGGGGCTTCTCTGATATCATTTGTTATGCTCCAAATTTCACAAC
AGAGATTACATGAAATATTTCCACTCTCCAAACTAGTGGAAATATCATGAAATATTCATAAAATAGCGAAAAGTATCATAAATAATGCAGAAATACACAAAGATGGGGGGAAGCATCTGGTTTGAGTGGGAATACATTTCTTGCTCTTTAAGTCCTCTCTCTTTCTGTTTCAGGAACATGGTATCAAGCATCTGGTTATT
CCAACAAGGGATTATCTCTTTGCTCCTTCATACGACGATATACGAACAGCTGTGGAATTTATTCATGAAAATGCAATCTGTGGGAAGATGACTTATGTTCATTGTAAAGCTGGACGAGGACGCAGTACAACTATTGTACTCTGTTATTTGGTGGAATACAAGCAAATGACACCTGCTGATGCCTATGAATATGTAAGGTC
TAAGAGGCCAAGAGTTTTGCTGGCAGCCTCGCAGTGGCAGGCAGTACAGGGATATGAAAAACGGAAAAATGGAAGTCAGACAAAATTGACAAGTCAGACAAGATTGACATTTCCTGTTCGGCTTTCACTTCGAGATCAGTCTCCTATGATGCCTATATACATATCCCACAGGTTATATGAAAACAATGTGACTACCGACA
TAGGAGATAGGGACATCTGTTACGATGATTCAATTGTTCTTGTTACAAGTGCCGATCTTGAGGGATATAGAAGTATTGAAGATGCAGGTCTCATTGGAAATCATTTATGGAAAGAATTGAAGGTAACTTATCGGGTGCGCTTTGTTGCTGCAAGAGGAGCAATAAGAGCTTCGGCTGCATTGGCAAGGCTATCTTACCTA
TGGGTTGGCTGTCAGACTGAAGGTAAAGCACGGCCAAAAGATCTTCCTGTGGCATCCCTGAAATCTTTAAAATCTCTGGAGAGCTGCTCATCCGTTGCAGACCGTGTACATGTTCTATGTGCACAGGGTGTAGTTAATTGTTGAGGTGTTGACAGGACATTACGTGATGCTTTAATTCAAATCTTTGTAAGCTAGAAGGT
TTATACATATTCATTTTAGAACTTGAACATCTCTCATCTGCATTGTTGTCTAAATTAGCTTGCGGGGCATATTCTAGGAAGTACCAGACGCCTTCAAGTTCAATTCTGGAACTTGCATCTAACAATAAGGTTTTAAGAGCTCGTCTTTTTTCAAGCATTGACATCACGAAGTGTCAGGTTATTTGGCCGTCAAGTGCATT
TAAAGCTTAATAAGCTTATAGAAAGTATTGTAATGCCAGGCAAATAATTGTGCTGCAAATGAGCTTTTGGTTGAGTAATTTTTGGCTTTCTGGAACAAGATGGTAGTACTGTAAAAACACATGTATGGTGATTATAGGAATATATTGTAACAATGTTGCTATTCGCATTATATGTCCGGCTTTCAAACTTTGGCTGTTTA
TTTATCTGTTGATATCCTAGTTTAGTTCTGTTGTTAGATGTGCTGTTATATCCACGAACCTACTTCGGTGGTATTGAACTATCGATTCGTGCTGTCTGGAGCCAAGGGGGCATATTTTTTGGTATTTAGATTATTTTTTCTTAATATCATTGAGG
>TRINITY_DN45532_c1_g2_i6 from sample A7 / Example unspliced isoform:TGTTGTGTATGGATGTGATTTTTACCTTGTTGATTACTTTGTCTTACGATATTGAGTTTGGCTACATCTTTGGTGACTTGGTCGGAATTAAGTTTGATTTAATTAATTTCTCAAAATTTTCATTTCAAAATTAATAAATTCTGTGTTTAAAAAAAAAGATAGATGTGTGTGTAATCTTGGCATAGTTCATCTTTGGTGTT
GTGTAACCTTGGAGGCAAAAGTAGACTCTAAGGGATATACACACACAGAGAGGCTTGGGACAAATCTGTACACCTGTTGTCGAGCTGGTTGCCACCACCTTTCTATTCAGCTGTATTTTTAATGACAGTGGGCATGTATGACATAATCCCTATGTTTCCAGGTCGTATGGGTTTTCTGGGCTTGTAGTGCCTAAAGGCCC
TGCAATAAATAACCACTGCAGACAAACAAGGGACAAAGATCAGCTCATTGACACAGAAACATATATATATCATGTGAATAATTTGACACAGGTCCATACCAGTGTTAGCATGTGTGTGTATGTTGATTTTTTGAGGTAGTGAATTTAGACCATGGATTCTATTTTATGCACTTGATGCCCGATTTTTATTGAACATTTTA
AATCTGGAGGAGGTTGAAATCAAATATACATTGGCTCTCCGTCAACACTTGGACATATAAACAGCTTAGAGTACCACTGCACTTTCTGCCTCCTTTCCTATTCTATGATATTTACAGTCCTTGTACGCATTACATTTTTACATCTATCTTATATAAAAAAGTATACAGTCCTAAACAGTTCTTCATTAACTTCAGTAGCC
CTAGACTCTGGAACCGAAACTGACCGAGTACCACAGAATTTAATATAGAGAAGTATCAGTGACCAAGTAGAGACTGAGAGTGCCTCCACTGAAAGTGTGTTCAGTAAGGGTACCCTCCACAGATTGGGTGTTAAAAATCGTGGTAAACATAAGTAAAAATCTATGAAATTACTTTTACGTTCTGAATTTGATTATGGGAA
TCAGCCCTATATTTTGAATGCTGTAATGTTGTTTGGTCCACTCAATCACAAGCTTTGAGTCTCCAAAGACTCGCAATTGTATTGTGACCTCTTTGTTTGTCAGTTTGTTTTGTTAGGTGCTGTTCCATTTCCTAAAGATGTTCAACGCTTGAAAGAGCTTGGAGTACGAGGTGTTGTTACACTGAATGAGCCTTATGAGA
CGCTGGTCCCTACCACTCTGTACCAGGAACATGGTATCAAGCATCTGGTTATTCCAACAAGGGATTATCTCTTTGCTCCTTCATACGACGATATACGAACAGCTGTGGAATTTATTCATGgtccgtaagcatcttttcccttattaatactacctgaatttgctggtgtagattattattacttggattcaaaaaaatgc
tcttggtcatgtcttttcatcatcattattcatgtgtaaattaaaaaatgtatctatggttgataaattacagtcaacatgttacttctggtttgaaatacaaatttattgccaggtatggtcatattgtacgtttccctcccactatagcttcatcttcattcggcccttatatattgtatttccatgtcttatttatt
cagAAAATGCAATCTGTGGGAAGATGACTTATGTTCATTGTAAAGCTGGACGAGGACGCAGTACAACTATTGTACTCTGTTATTTGGT