sp|Q9LVJ0|UVB31_ARATH ----> UV-B-induced protein At3g17800, chloroplastic

Intron 1 GTGAGTGACC ... GGATTTGCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	61.6	48	9	77
A2	71.58	52	12	131
A3	71.43	52	30	130
A4	70.31	38	19	90
A5	65.18	39	12	73
A6	63.66	141	57	247
A7	64.89	138	41	255
A8	65.46	67	34	127
A9	63.44	151	66	262
A10	74.62	66	60	194

>TRINITY_DN112543_c0_g1_i10 from sample A3 / Example spliced isoform

TCGTTATCTGGTTCCGTTAAATTTGTTCGTCCCTTCCCAAGGGCCTCCTTGCCCCTGATTGCCGGCCTTCCCAATCCACACTGAAGGTAGAGATATCGAATATTTTCGGCTGAGAAAATGCAAGGTGCGGTCGTTGTTGGAACCCTAAACCCTGCTTGTAGTTTGAGTACAACAACTGCTTCTCGAACGGTCTCGAATGT
TCGATCGATTTCCTCCTATGGCCTCATGTTTGGTTTCTGCAAGAGGTCCCTAAAGGATTTAGTTTTGTGCAATTTGTCCAAATTCAGCCTTATCATAAACTATACAGAATGGTATGTGGAAGTGATTGTGTGCATACCTTAGCCTTCGCAAAACGGTCCTAAGATCAGAGTGAAGTGGGTTTTATCCCGCAAATATATGG
ATTTTTATTCAATTGGGGATATATGAGCTTGTGGGTCTAATACCGAAGTGGAGTATTCACGAGACGCAGGTGTCAAGTTCTATCCTCACTAAAGGTAGAAGATACTCGGGTAGTAGCTCTATCATCAACTACGTGAAAGCAATTTATCCACTGGTGCAAATGACTGACACTATGGGAGTACTCCAACATGACAGTTCGTT
TAATTTATATTCTGGTGTATCTAACTCTGATTTGCACGTTTGCACTGCAATATGTTGATAAATAGGGTTAACGGGAAGTCACTTGATTGAAATTAAGTTCATTTTCCATTTCCTTCTTCTTAGATATCCTTTAAGGATGGAAATCTTTGTCTTAGGAATCACATGTAAGGGGTATGTTTTCCACTAGGAATCACTTGTAA
GGGGTATGTATTCCACAATTGCACATGGACTTTTTGTCGGTTTGCCTAGAAGAAACAGCCTAGGCTCAGCTTTCGTAGGTCTTGCACATGGATTTTGTCGGTTTGCCTAGAAGAAACAGCCTAGGTTCAGCTAACTATGATATATCACAAGATAGCACAGGCTCAGCTAACTATGAGATATCACAAGATAGCACAACAAA
AAGTATGAGCTATCACAACAAATTGGCTGCATTAGAATGGCAGAGATATCACAAGATAGCACAACAAAAACTATGAGATATCACAACAATTGGCTGCATGTTCTTACGGGGATTGAACTTGGGTATCTGGGAAGAAAGCTCATTTGAATTACCACTTATCCACAACCTGCTGGACAACATTTTGCCTGTTCTTATAACCC
GCCATATCCTAAATTAAAGCACTTGGCTGTATTTCACTGGTTTTTTTCAAATGGATCACAGAAAAATAGTTTTTACAGGATATATTAAAGTATGGAGAAAGTTTTTTTTTAAATCAATGATAAACAATTTTAAGAAGAGGAAAATGCGTGTAAATTACTAAATGATAGTCAAATATAATTGACTTGATGTTTATATAGTA
GCTTTAGAGAATCCGATGCAAAATGAAGTTAATCGAATTTAAAGCTTCTTTATGGGTCTATTCAAAGTTGCTCTTATTTTATTATCCTGGTTGAAAATATCTTGTTAGTTGTATCTCCTGAAAATATCTTGTTAGTTGTATCTCCTGAGCTACGTCAAGAAATGTTTACGAATGGAAGATTTTTATTGATTCAAGCCAAA
TTGAGTTTGACAAAGTTATTAAAAGATTTCTTCGCAAAGCTCAACGAATGCATGTATTTTTATTTTTATTTTTTTATGTTCATTAAATTTTCACTCCGAAGCAGACCGAAATGTAGTTAGGTTTTTGAGTGTAACTGAAATTTAGACACTTGGGTAGTATTGTCTAGTGGTAAGATACTTGTTCATTCATTCAGCAATAA
GATAGAAGGGAAGTACATGCCATATATTATATATGAAAGACAAAAGACACCCAAAGGATCCAATATTAAGGAAGCATTTCTTATGTAAAATGGGAAGTAACGATCTCTTCCATTGTTTCTAGAGTAAAAATATGTCTGACTTGACAGTGTAAGCAAAAATTTCTGATTCTGAAAATGCGGAATAAAACTTTGATACAGAA
TCGAAATATGAATACCAAATAGATCATACCTCCAGCCATTGATGCTACTTGAGTTGCTGTAAAAGATTTCCCTGTTCCACAACGTTTAGCTTCTTGTACGGCACTTCCAAGCTCTGCTTACTCTTTCTTGATGGTGTAAAACTGAAGGGGATTGAGTTAGCGAGATTGGGGACCAAACAAGGGTTTTAATAGCCAAGCTT
CCATCAAGCTTATGATGGCTATGTGTCAATCGTTCCACAGATCAAGATAGAGAACCGTTGAGGGAGTTATGGACCATTCCCAGAGCTTTCAACGAGAAATCAGTTATTTCCTTAATTAGTTGAAGAGTTGTCAATATTAGTTAAGAGAGCTTACAGACAGTTGCATAGAGTTTTATAACAGGTTATAAGCCTAATTAACT
GGATGGATTCAATATGTGTCATTTAACTCGCGATGTGCTGGCTTATAAAGTAGTGTTAAACATTGTAAATTCGAGTAAAGAGAGTGCCCTTGTGACTGTGGGACTTCATGTATCTATTATTATTTCATGTCAGCCTGTGCCCCATTTCTGTATGGGGACTTGGGAGTGGTGGTGTTGGTATATATACATATATTTCCTCT
TGAGCGTGTCTTATCTGTTTGCTATTATATGAGTTTTTTCTATACCCAGGACTCTCATACCTTTCGATGAAAATGGTGCACCTCAAATGCAG

>TRINITY_DN112543_c0_g1_i2 from sample A3 / Example unspliced isoform:

TCGTTATCTGGTTCCGTTAAATTTGTTCGTCCCTTCCCAAGGGCCTCCTTGCCCCTGATTGCCGGCCTTCCCAATCCACACTGAAGgtgagtgaccatcgtaattcgtaagtgaggcacccgagacttcatatctccactcggtgactcttaaaagagcaggtgggcgttctctatcctgttgttgattgagtcataaat
ctgtggatttgcagGTAGAGATATCGAATATTTTCGGCTGAGATAATGCAAGGTGCGGGCGTTGTTCGAACCCTAAACCCTGCTTGTAGTTTGAGTACAACAACTGCTTCTCGAACGGTCTCGAATGTTCGATCGATTTCCTCCTATGGCCTCATGTTTGGTTTCTGCAAGGGGTCCCTGAAGGTTTGTTGGACATAGCC
GTTTAATAATCACTTATTTGGAAAATTTTCTGCAGTCAATTGTGTTTTCAATGAAATTAGATTAAAATTCTTGTTTTGCATTGCAATCTGTTCAAATAAATTTATTCAGGTTAAGTCAGAATAAGGACTGTTACACAATGGATTATTTAGAGTAAAATAGCTCTGATAAGATGGGTTTACATTTTTATTCCCAGGATTTA
GTTTTGTGCAATTTGTCCAAATTCAGCCTTATCATAAACTATACAGAATGGTATGTGGAAGTGATTGTGTGCATACCTTAGCCTTCGCAAAACGGTCCTAAGATCAGAGTGAAGTGGGTTTTATCCCGCAAATATATGGATTTTTATTCAATTGGGGATATATGAGCTTGTGGGTCTAATACCGAAGTGGAGTATTCACG
AGACGCAGGTGTCAAGTTCTATCCTCACTAAAGGTAGAAGATACTCGGGTAGTAGCTCTATCATCAACTACGTGAAAGCAATTTATCCACTGGTGCAAATGACTGACACTATGGGAGTACTCCAACATGACAGTTCGTTTAATTTATATTCTGGTGTATCTAACTCTGATTTGCACGTTTGCACTGCAATATGTTGATAA
ATAGGGTTAACGGGAAGTCACTTGATTGAAATTAAGTTCATTTTCCATTTCCTTCTTCTTAGATATCCTTTAAGGATGGAAATCTTTGTCTTAGGAATCACATGTAAGGGGTATGTTTTCCACTAGGAATCACTTGTAAGGGGTATGTATTCCACAATTGCACATGGACTTTTTGTCGGTTTGCCTAGAAGAAACAGCCT
AGGCTCAGCTTTCGTAGGTCTTGCACATGGATTTTGTCGGTTTGCCTAGAAGAAACAGCCTAGGTTCAGCTAACTATGATATATCACAAGATAGCACAGGCTCAGCTAACTATGAGATATCACAAGATAGCACAACAAAAAGTATGAGCTATCACAACAAATTGGCTGCATTAGAATGGCAGAGATATCACAAGATAGCA
CAACAAAAACTATGAGATATCACAACAATTGGCTGCATGTTCTTACGGGGATTGAACTTGGGTATCTGGGAAGAAAGCTCATTTGAATTACCACTTATCCACAACCTGCTGGACAACATTTTGCCTGTTCTTATAACCCGCCATATCCTAAATTAAAGCACTTGGCTGTATTTCACTGGTTTTTTTCAAATGGATCACAG
AAAAATAGTTTTTACAGGATATATTAAAGTATGGAGAAAGTTTTTTTTTAAATCAATGATAAACAATTTTAAGAAGAGGAAAATGCGTGTAAATTACTAAATGATAGTCAAATATAATTGACTTGATGTTTATATAGTAGCTTTAGAGAATCCGATGCAAAATGAAGTTAATCGAATTTAAAGCTTCTTTATGGGTCTAT
TCAAAGTTGCTCTTATTTTATTATCCTGGTTGAAAATATCTTGTTAGTTGTATCTCCTGAAAATATCTTGTTAGTTGTATCTCCTGAGCTACGTCAAGAAATGTTTACGAATGGAAGATTTTTATTGATTCAAGCCAAATTGAGTTTGACAAAGTTATTAAAAGATTTCTTCGCAAAGCTCAACGAATGCATGTATTTTT
ATTTTTATTTTTTTATGTTCATTAAATTTTCACTCCGAAGCAGACCGAAATGTAGTTAGGTTTTTGAGTGTAACTGAAATTTAGACACTTGGGTAGTATTGTCTAGTGGTAAGATACTTGTTCATTCATTCAGCAATAAGATAGAAGGGAAGTACATGCCATATATTATATATGAAAGACAAAAGACACCCAAAGGATCC
AATATTAAGGAAGCATTTCTTATGTAAAATGGGAAGTAACGATCTCTTCCATTGTTTCTAGAGTAAAAATATGTCTGACTTGACAGTGTAAGCAAAAATTTCTGATTCTGAAAATGCGGAATAAAACTTTGATACAGAATCGAAATATGAATACCAAATAGATCATACCTCCAGCCATTGATGCTACTTGAGTTGCTGTA
AAAGATTTCCCTGTTCCACAACGTTTAGCTTCTTGTACGGCACTTCCAAGCTCTGCTTACTCTTTCTTGATGGTGTAAAACTGAAGGGGATTGAGTTAGCGAGATTGGGGACCAAACAAGGGTTTTAATAGCCAAGCTTCCATCAAGCTTATGATGGCTATGTGTCAATCGTTCCACAGATCAAGATAGAGAACCGTTGA
GGGAGTTATGGACCATTCCCAGAGCTTTCAACGAGAAATCAGTTATTTCCTTAATTAGTTGAAGAGTTGTCAATATTAGTTAAGAGAGCTTACAGACAGTTGCATAGAGTTTTATAACAGGTTATAAGCCTAATTAACTGGATGGATTCAATATGTGTCATTTAACTCGCGATGTGCTGGCTTATAAAGTAGTGTTAAAC
ATTGTAAATTCGAGTAAAGAGAGTGCCCTTGTGACTGTGGGACTTCATGTATCTATTATTATTTCATGTCAGCCTGTGCCCCATTTCTGTATGGGGACTTGGGAGTGGTGGTGTTGGTATATATACATATATTTCCTCTTGAGCGTGTCTTATCTGTTTGCTATTATATGAGTTTTTTCTATACCCAGGACTCTCATACC
TTTCGATGAAAATGGTGCACCTCAAATGCAG