sp|Q9ZW24|GSTU7_ARATH ----> Glutathione S-transferase U7

Intron 1 GTATAACTTT ... TTGTTAAAAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	65.52	27	53.2	42.8
A2	63.89	3	6	4
A3	48.25	19.8	21	11.8
A4	68.77	7.8	22	11
A5	61.39	6.2	11	6.8
A6	59.44	33.6	58	36.2
A7	53.36	96.8	125	84.6
A8	61.32	80	135.2	111
A9	58.54	50.6	70	68.8
A10	62.4	56	110	68.8

>TRINITY_DN121697_c3_g3_i1 from sample A1 / Example spliced isoform

GCCATTGCCTTGAGCCATTTTAAACATATCGGGTTTAGGTTTATTTCATTAAGGAATGAGGAGAGAGCATTCTTTAACCAGGTCCAGAGCACACCAATGATCAGTTGCGCGGGGAAAATCAGGAGCTACGGTGCACGCCGGACGGTTTATGTGGCCAGACCTCAAAGAAGAAGATGCGCAGAGATCGGAGACTGCAGACT
GGATATCTGGTATAAATGGAGACTGCGCACCCGATATTGGAGAATGCATGCTCGATATCTGGGCGAATTGAAACTGATGAAACCAAATTACTAAGTTGATCGATAACGATTTGGCATCAATTCGCCAGCAGAAAGAATCGCGTTTTGTTGGCTAACGAAAATGATAAAAGTGCTAAATGTAATAG

>TRINITY_DN121697_c3_g3_i2 from sample A1 / Example unspliced isoform:

AAACATTCTATACCGCTCGTTTAAGCATTATTTAGTTTAATTTATCCGGAAAGTTAGCGGGTTTCGATTATGTTAAATAATACCATTTTGAGCTCTCTATTTTCTTTATAATTAATATTTAATAATTTTCATTTTCTTCATTTCTTTAAAATCATTTTATTTATATAATATTTACACTTATTTTCATGAAAAAATCATTT
TATTTAACATAATCTTTGTTATTTAGTATAATTTTTTTTTTTCATTTAATTTATATTAATATTATTATTTTTAAATAATATTAATTGATAGATAATTGGAAGAAATATTTGTTAACTTCTCCATCCTTATTCAAATCTAATTTTATGACACTTTTCTTTAAAAACCAACTTTAAGTATTAAATAAATTCAATTTTAATAT
AATATTTACTTCTTAAGTATTTTATTTATATAATTTTTAGGCCGTAAGGCGTTTTATTTCAAGTTTGGGGGGTGGGGCAGCGGTGGATGATTTTTCATTTTTAAAAAAATGAATGGCCAGATTTAAAGAATGGTGGAATATTCTTCGTCTGGTGCATGAATAAACGATTGAGATTTACTAAATTAACTAGGGTGCATGTT
TAATTTGAAGAGTCACCACTAATTAATAAAAAATAGAATTATTTTAAATATCATGTAAACGCACTGGCTGGAACGTGGCTAACGTGGCTGAAAGGTTGAAATATCAGGAACTGATAACCAACAGCTTCAGATGTACACATGGCTCCATCATCTATATTGGTTCACTCTCCTCCAGGGCAAATTAGGCTCCGCTCTCCTCC
ACGGCAAAGAAACATCCGTTTCAGTAGACAACCTTCCCACCTTCCCATCCGTGGCTGTTACAAACAATTTTTGGAAACGTTTTGAAAAAAAATTGGTTTTTACAAGTGTCACCATAGGTTATAGAGCGTTGGGAGGAATGCAGACAGCCTCATTGTCTTGGGGATCTACATGAATGCCTGCAGCCTCATTGTATCTGTAG
TCGCCTGAGTTAACAATTTTAACCTTTGTATTGCAGGGATCTTGGGGCGCCACTCCATTCACAAGCCTCCCAGCATTACATTGTAACTATTACATTGTAACTATTAAACTAGGGTGCCGACTCTTGCAGGTCCAGAGCACACCAATGATCAGTTGCGCGGGGAAAATCAGGAGCTACGGTGCACGCCGGACGGTTTATGT
GGCCAGACCTCAAAGAAGAAGATGCGCAGAGATCGGAGACTGCAGACTGGATATCTGGTATAAATGGAGACTGCGCACCCGATATTGGAGAATGCATGCTCGATATCTGgtataacttttaacacctttgatttattaaatcacatcatcactgttttaatattgttccatgatatgggttttacttttgttaaaagGGC
GAATTGAAACTGATGAAACCAAATTACTAAGTTGATCGATAACGATTTGGCATCAATTCGCCAGCAGAAAGAATCGCGTTTTGTTGGCTAACGAAAATGATAAAAATGCTAAATGTAATAGATATATAGGAACAGGGGGTTTCAGGCGCAGAGAGAGGTGACACTGCCGTTATTCATGTCAAACTGAAAGTGAATGAATG
AAGAGCGATATATGAAAACAGTGTCATCTCTTCTGTGCCAGAAACACAGCACTGCCTCCTATTCTCCACGACGATCTTATCTACTCTCTCAGCTTCTATGAATATAGCGATAAACAGATCTTGTTTTTTCATATGTTTGTACCGGGTATCACTTCATATTTATAGGGAAAACGCATCTTGATTTCATTTTTCTGTAGATT
GTAGACTATAGATAACTAGATTAATGGCAGTCAATGGGACTCCAGAGAATTTGAATGGAATCATATAACTCACATGGAATATTTTTCAAAGACTATTAATAATCTAATCGCATCTTGGTAGGGTATGGTTGGACCCTACAATATTGATAATTAATTAAATTATTGGCATGCTTCGCCTGAATGGTCTAAAAGCTTCTAGA
CGGTAGTCCGTCATGAAATTATTCGTTGATGACAAATAGTGTAACGAAAGATGAGAGGGACTTGATTTCCTCTAGACATTTGTGTCGTGGCAGCCGAG