sp|Q9M0G0|GAGT3_ARATH ----> Glutathione hydrolase 3
Intron 1 GCAAGATTAC ... GAGATTTTAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 36.36 | 7 | 1 | 7 |
| A2 | 52.94 | 4 | 3 | 6 |
| A3 | 29.41 | 6 | 0 | 5 |
| A4 | 46.67 | 4 | 2 | 5 |
| A5 | 33.33 | 2 | 2 | 0 |
| A6 | 60 | 3 | 9 | 0 |
| A7 | 41.18 | 5 | 3 | 4 |
| A8 | 41.18 | 5 | 5 | 2 |
| A9 | 35.48 | 10 | 4 | 7 |
| A10 | 37.14 | 11 | 6 | 7 |
>TRINITY_DN39683_c3_g1_i6 from sample A9 / Example spliced isoformAACACGTTGTGTTCTGTGTTATATAAATGAAGCACGCGGATGACGTCAACAAGAAATGCTGCATGCAACTTGCTAGGAAGTAAGTTGCATCTATGTTTGTGGCACCTGCCGGCTGCCATCCTGTAGGCCCGGGCGGAGACTCGTCCGTCGAAGCAGAATATTCATCATCGCCCAATAAATAAGCGATTGCTACAATTAAC
AAATTCGTCGCAGAAGAGGTCTCGCGATCGAATCCTGAAGAGACAATCATTCTCCGGAATCAGATCCTTGACTTAACAAATATTTGGCTATTCTCCATCTTGGCCTCTTTAACTGGAAAGAACAATTGAAATTCAAAATGGTACGAGCAAGCTTGGAAGCACCACTTGTGGACTATGGCAACAATAATTCCTCCAAACGT
TCCATTCGGGGAATTGTCCAGACAACATTTACATTGCTTCTAGTGGCAGTGATTGCTCTTGCTTGTATTTTTGCATTTTCCAACATTGATAATAGCAGAGCATCACTTGAGACAGGTGGTCAGTTTCAAAAGGAAAACGGTGACATTGTAGAAGCAGAACATGGAGTGGTTGCTGCAGATGATGAACGTTGCTCTGATAT
TGGTATAGACATACTCAGAGAAGGGGGACATGCAGTGGATGCTGCTGTAGCAACCTCCTTATGCCTTGGTGTGGTGAGTCCAGCATCAAGTGGCCTTGGTGGAGGTGCCTTCATGCTATTAAGATCTTCAAATGGGCAAGCTCAAGCCTTCAACATGAGGGAGACTGCACCTCAAGCTGCTTCTGAGGACATGTATGCCA
AAAATCCTGCAGCCAAAAAGATTGGCCCTCTATCTGTAGGTGTACCAGGTGAGCTTGCAGGGCTCCATCTAGCATGGACACAGCATGGAAAACTGCCTTGGAAGAGGCTTGTCCAGCCTGTAATTAAATTGGTAGCCAAGGGTTTTGTCATTTCTCCTTATCTTGCCTCACACATTAAAAATTGTAAAAATGCTATTCTG
GCTGACAAAGGTCTTCGAGGAGTTTTTACAGTCAATGGGAAACTCCTAAGTGCCGGTGATACTTGCTACAACAAGAAGTTGGCAGAGACATTGCAAGCCATTTCTGATTTTGGACCAAGTGCCTTTTACAATGGTACCATTGGAAAAAGACTAGTAGCAGATGTACAAGCAGCCGGGGGGATCCTTTCTTTTGAGGATAT
GCAGAACTATAAAGTAGAAGTCATGGATCCTATTTCAGCGGAGGTCATGGGATATACAGTTCTGGGAATGCCACCTCCCTCTTCTGGAGCTGCAGGGCTAATTTTAGCTCTCAACATTCTTGGAAGCTATGGAACACCTGATGCAGCACAGGGCATATTGGGCCTACACCGTACAATTGAGGCCTTCAAACATATGTTTT
CTGTGAGGATGAATCTTGGTGACCCAAAATTTGTCAACATCAAGGATACATTGTCTGATATGCTTTCTCCAAAGTTTGCTGTAAAACTTAAAAGTAAAATATATGACAACACCACTTTTCCATCAGAGTACTATGGATACAAATGGAACCAACTTAGAGACCATGGTACCAGTCATTTTTGCATTGTCGATAGTGAGCGC
AATGCAGTGTCCATGACCACCACAGTGAATTACGCCTTCGGAGCCCTTATGCTCTCTCCTTCTACAGGCATTGTATTGAATAATGAAATGGATGACTTCTCCACACCTACAGAGATTTCTCCAGACAGGCTTCCTCCGGCTCCAGCAAATTTCATCAAACCTAATAAGCAACCATTATCTTCAATGTCTCCTACTATAGT
TCTGAAGGGCGGGCAATTAGCAGGGGTGCTTGGTGGCAGTGGCGGACTAAAAATAATCCCTGCAGTTGTTCAAGTTTTCCTGAACCATTTCATAAATGGGATGGATCCACTAGTTGCTGTAACAGCTCCAAGAGTATACCATAGGTTGATCCCAAACATGGTCACGTATGAAAACTGGACGGTTTTGAATGGACAGCACA
TTGAACTTTCTAGTGAGTCAAAGATGGGTTTGAGCCAAAGAGGCCATTCGTTAGAAGCACAGTCATCAGGTGCCATATCTCAGCTTGTTGTGCAGAACTTGAATAACCCTATAAAGCTGGAGTCAGATAATCAAGTTTTCTATGGGAAACTGACAGCGGTAAGTGACCCCAGGAAAGCTGGAATTCCAGCTGGGTTCTAG
ATACTTGAGTTGTCTGTCACTTCATTCTGTACTGTTGCTGCATGAGGATACATAACGCAGGATAAGCAAACAACACCTGTATCATAGATGATGCAAAATATAACAACTATTCCATTGTACCACAGCGTTAGAGAGTCTAAGTTGAGATCGTCTTGTCTATTATTGGACAACTTAATGCACAGTTTCAAACGACTTATTAC
TTTTCCCTAGCAAGGGTTTATATGGCTTCTATTCAGAGAGTGCAAAGACCCTGGAATGCCTCTTATCTACTTAGACAGGATCTGTGCATCTAAGCGTTATACTAGTCTAAGTAGTTTGAGATGTATATGATATTGATACTCTAACTGGTGGAGTGCTCGTTACCATAATATAATAAAAA
>TRINITY_DN39683_c3_g1_i5 from sample A9 / Example unspliced isoform:AACACGTTGTGTTCTGTGTTATATAAATGAAGCACGCGGATGACGTCAACAAGAAATGCTGCATGCAACTTGCTAGGAAGTAAGTTGCATCTATGTTTGTGGCACCTGCCGGCTGCCATCCTGTAGGCCCGGGCGGAGACTCGTCCGTCGAAGCAGAATATTCATCATCGCCCAATAAATAAGCGATTGCTACAATTAAC
AAATTCGTCGCAGAAGAGGTCTCGCGATCGAATCCTGAAGAGACAATCATTCTCCGGAATCAGgcaagattactgtagtttcgtcctctcgtccgacagattgaccaaggtttgtaaaaattgtcttgaagatctccgtgatttgctggaaattcagcggaaagaaaggagagacatagagattttagATCCTTGACTTA
ACAAATATTTGGCTATTCTCCATCTTGGCCTCTTTAACTGGAAAGAACAATTGAAATTCAAAATGGTACGAGCAAGCTTGGAAGCACCACTTGTGGACTATGGCAACAATAATTCCTCCAAACGTTCCATTCGGGGAATTGTCCAGACAACATTTACATTGCTTCTAGTGGCAGTGATTGCTCTTGCTTGTATTTTTGCA
TTTTCCAACATTGATAATAGCAGAGCATCACTTGAGACAGGTGGTCAGTTTCAAAAGGAAAACGGTGACATTGTAGAAGCAGAACATGGAGTGGTTGCTGCAGATGATGAACGTTGCTCTGATATTGGTATAGACATACTCAGAGAAGGGGGACATGCAGTGGATGCTGCTGTAGCAACCTCCTTATGCCTTGGTGTGGT
GAGTCCAGCATCAAGTGGCCTTGGTGGAGGTGCCTTCATGCTATTAAGATCTTCAAATGGGCAAGCTCAAGCCTTCAACATGAGGGAGACTGCACCTCAAGCTGCTTCTGAGGACATGTATGCCAAAAATCCTGCAGCCAAAAAGATTGGCCCTCTATCTGTAGGTGTACCAGGTGAGCTTGCAGGGCTCCATCTAGCAT
GGACACAGCATGGAAAACTGCCTTGGAAGAGGCTTGTCCAGCCTGTAATTAAATTGGTAGCCAAGGGTTTTGTCATTTCTCCTTATCTTGCCTCACACATTAAAAATTGTAAAAATGCTATTCTGGCTGACAAAGGTCTTCGAGGAGTTTTTACAGTCAATGGGAAACTCCTAAGTGCCGGTGATACTTGCTACAACAAG
AAGTTGGCAGAGACATTGCAAGCCATTTCTGATTTTGGACCAAGTGCCTTTTACAATGGTACCATTGGAAAAAGACTAGTAGCAGATGTACAAGCAGCCGGGGGGATCCTTTCTTTTGAGGATATGCAGAACTATAAAGTAGAAGTCATGGATCCTATTTCAGCGGAGGTCATGGGATATACAGTTCTGGGAATGCCACC
TCCCTCTTCTGGAGCTGCAGGGCTAATTTTAGCTCTCAACATTCTTGGAAGCTATGGAACACCTGATGCAGCACAGGGCATATTGGGCCTACACCGTACAATTGAGGCCTTCAAACATATGTTTTCTGTGAGGATGAATCTTGGTGACCCAAAATTTGTCAACATCAAGGATACATTGTCTGATATGCTTTCTCCAAAGT
TTGCTGTAAAACTTAAAAGTAAAATATATGACAACACCACTTTTCCATCAGAGTACTATGGATACAAATGGAACCAACTTAGAGACCATGGTACCAGTCATTTTTGCATTGTCGATAGTGAGCGCAATGCAGTGTCCATGACCACCACAGTGAATTACGCCTTCGGAGCCCTTATGCTCTCTCCTTCTACAGGCATTGTA
TTGAATAATGAAATGGATGACTTCTCCACACCTACAGAGATTTCTCCAGACAGGCTTCCTCCGGCTCCAGCAAATTTCATCAAACCTAATAAGCAACCATTATCTTCAATGTCTCCTACTATAGTTCTGAAGGGCGGGCAATTAGCAGGGGTGCTTGGTGGCAGTGGCGGACTAAAAATAATCCCTGCAGTTGTTCAAGT
TTTCCTGAACCATTTCATAAATGGGATGGATCCACTAGTTGCTGTAACAGCTCCAAGAGTATACCATAGGTTGATCCCAAACATGGTCACGTATGAAAACTGGACGGTTTTGAATGGACAGCACATTGAACTTTCTAGTGAGTCAAAGATGGGTTTGAGCCAAAGAGGCCATTCGTTAGAAGCACAGTCATCAGGTGCCA
TATCTCAGCTTGTTGTGCAGAACTTGAATAACCCTATAAAGCTGGAGTCAGATAATCAAGTTTTCTATGGGAAACTGACAGCGGTAAGTGACCCCAGGAAAGCTGGAATTCCAGCTGGGTTCTAGATACTTGAGTTGTCTGTCACTTCATTCTGTACTGTTGCTGCATGAGGATACATAACGCAGGATAAGCAAACAACA
CCTGTATCATAGATGATGCAAAATATAACAACTATTCCATTGTACCACAGCGTTAGAGAGTCTAAGTTGAGATCGTCTTGTCTATTATTGGACAACTTAATGCACAGTTTCAAACGACTTATTACTTTTCCCTAGCAAGGGTTTATATGGCTTCTATTCAGAGAGTGCAAAGACCCTGGAATGCCTCTTATCTACTTAGA
CAGGATCTGTGCATCTAAGCGTTATACTAGTCTAAGTAGTTTGAGATGTATATGATATTGATACTCTAACTGGTGGAGTGCTCGTTACCATAATATAATAAAAA
Intron 2 GTGAGCTTGC ... GCTGACAAAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 66.67 | 4 | 10 | 6 |
| A2 | 66.67 | 3 | 8 | 4 |
| A3 | 100 | 0 | 1 | 2 |
| A4 | 66.67 | 3 | 5 | 7 |
| A5 | 50 | 2 | 2 | 2 |
| A6 | 73.33 | 2 | 6 | 5 |
| A7 | 93.1 | 1 | 13 | 14 |
| A8 | 50 | 5 | 5 | 5 |
| A9 | 60 | 11 | 24 | 9 |
| A10 | 64.71 | 6 | 8 | 14 |
>TRINITY_DN39683_c3_g1_i2 from sample A9 / Example spliced isoformGGGCACTTTGATTGAAATTTCGTACAATAAAATTATATGCCTCTCATCCGATGCGGATTTTTGGTTCCCAATCCCCTTGAGACATAGTGAAACCAGGAGCATACCATCATGAAAATGTAAAAATGAGACGAACCGCGATGTTGACGAGGAGAACCAGAATGGAATAATCAGAAAACCCTGATTTCCCCGATATTAACGCA
GAAATCCATCCTAGAAACTACTGGATATGAATGAACTTTATCCTCGTTGCTAAGGGAGCCTAGAGCTGGCTTGAATTTATGGTTGTTAGAGCTATTAGATGCGACTCATGCGAGTCGCGAATCTGACGAGTTGGTGGGCATCAAGCCCTGTCTTCTCCAGGATCGGTACCGAGACGTCAGCCGAAATAGAATATTCATCT
CCCCAGAGCATGAGGAGTTGGTTTGTGGGGATCTGGCTTATGTAGGTTCGGCACCGAGCCGTCAGCCGAAATAGAATGTCCATGATTGCCCAGCACAGAGCTGATTGCTTCACTCAACTAAATTCGTTGCAGACGAGGTCAACGATCGAATCTTGCAGACACAATCGTTTCCACAAGAAGATCCTTGACTTAACAAATAT
TTGGCTATTCTCCATCTTGGCCTCTTTAACTGGAAAGAACAATTGAAATTCAAAATGGTACGAGCAAGCTTGGAAGCACCACTTGTGGACTATGGCAACAATAATTCCTCCAAACGTTCCATTCGGGGAATTGTCCAGACAACATTTACATTGCTTCTAGTGGCAGTGATTGCTCTTGCTTGTATTTTTGCATTTTCCAA
CATTGATAATAGCAGAGCATCACTTGAGACAGGTGGTCAGTTTCAAAAGGAAAACGGTGACATTGTAGAAGCAGAACATGGAGTGGTTGCTGCAGATGATGAACGTTGCTCTGATATTGGTATAGACATACTCAGAGAAGGGGGACATGCAGTGGATGCTGCTGTAGCAACCTCCTTATGCCTTGGTGTGGTGAGTCCAG
CATCAAGTGGCCTTGGTGGAGGTGCCTTCATGCTATTAAGATCTTCAAATGGGCAAGCTCAAGCCTTCAACATGAGGGAGACTGCACCTCAAGCTGCTTCTGAGGACATGTATGCCAAAAATCCTGCAGCCAAAAAGATTGGCCCTCTATCTGTAGGTGTACCAGGTCTTCGAGGAGTTTTTACAGTCAATGGGAAACTC
CTAAGTGCCGGTGATACTTGCTACAACAAGAAGTTGGCAGAGACATTGCAAGCCATTTCTGATTTTGGACCAAGTGCCTTTTACAATGGTACCATTGGAAAAAGACTAGTAGCAGATGTACAAGCAGCCGGGGGGATCCTTTCTTTTGAGGATATGCAGAACTATAAAGTAGAAGTCATGGATCCTATTTCAGCGGAGGT
CATGGGATATACAGTTCTGGGAATGCCACCTCCCTCTTCTGGAGCTGCAGGGCTAATTTTAGCTCTCAACATTCTTGGAAGCTATGGAACACCTGATGCAGCACAGGGCATATTGGGCCTACACCGTACAATTGAGGCCTTCAAACATATGTTTTCTGTGAGGATGAATCTTGGTGACCCAAAATTTGTCAACATCAAGG
ATACATTGTCTGATATGCTTTCTCCAAAGTTTGCTGTAAAACTTAAAAGTAAAATATATGACAACACCACTTTTCCATCAGAGTACTATGGATACAAATGGAACCAACTTAGAGACCATGGTACCAGTCATTTTTGCATTGTCGATAGTGAGCGCAATGCAGTGTCCATGACCACCACAGTGAATTACGCCTTCGGAGCC
CTTATGCTCTCTCCTTCTACAGGCATTGTATTGAATAATGAAATGGATGACTTCTCCACACCTACAGAGATTTCTCCAGACAGGCTTCCTCCGGCTCCAGCAAATTTCATCAAACCTAATAAGCAACCATTATCTTCAATGTCTCCTACTATAGTTCTGAAGGGCGGGCAATTAGCAGGGGTGCTTGGTGGCAGTGGCGG
ACTAAAAATAATCCCTGCAGTTGTTCAAGTTTTCCTGAACCATTTCATAAATGGGATGGATCCACTAGTTGCTGTAACAGCTCCAAGAGTATACCATAGGTTGATCCCAAACATGGTCACGTATGAAAACTGGACGGTTTTGAATGGACAGCACATTGAACTTTCTAGTGAGTCAAAGATGGGTTTGAGCCAAAGAGGCC
ATTCGTTAGAAGCACAGTCATCAGGTGCCATATCTCAGCTTGTTGTGCAGAACTTGAATAACCCTATAAAGCTGGAGTCAGATAATCAAGTTTTCTATGGGAAACTGACAGCGGTAAGTGACCCCAGGAAAGCTGGAATTCCAGCTGGGTTCTAGATACTTGAGTTGTCTGTCACTTCATTCTGTACTGTTGCTGCATGA
GGATACATAACGCAGGATAAGCAAACAACACCTGTATCATAGATGATGCAAAATATAACAACTATTCCATTGTACCACAGCGTTAGAGAGTCTAAGTTGAGATCGTCTTGTCTATTATTGGACAACTTAATGCACAGTTTCAAACGACTTATTACTTTTCCCTAGCAAGGGTTTATATGGCTTCTATTCAGAGAGTGCAA
AGACCCTGGAATGCCTCTTATCTACTTAGACAGGATCTGTGCATCTAAGCGTTATACTAGTCTAAGTAGTTTGAGATGTATATGATATTGATACTCTAACTGGTGGAGTGCTCGTTACCATAATATAATAAAAA
>TRINITY_DN39683_c3_g1_i6 from sample A9 / Example unspliced isoform:AACACGTTGTGTTCTGTGTTATATAAATGAAGCACGCGGATGACGTCAACAAGAAATGCTGCATGCAACTTGCTAGGAAGTAAGTTGCATCTATGTTTGTGGCACCTGCCGGCTGCCATCCTGTAGGCCCGGGCGGAGACTCGTCCGTCGAAGCAGAATATTCATCATCGCCCAATAAATAAGCGATTGCTACAATTAAC
AAATTCGTCGCAGAAGAGGTCTCGCGATCGAATCCTGAAGAGACAATCATTCTCCGGAATCAGATCCTTGACTTAACAAATATTTGGCTATTCTCCATCTTGGCCTCTTTAACTGGAAAGAACAATTGAAATTCAAAATGGTACGAGCAAGCTTGGAAGCACCACTTGTGGACTATGGCAACAATAATTCCTCCAAACGT
TCCATTCGGGGAATTGTCCAGACAACATTTACATTGCTTCTAGTGGCAGTGATTGCTCTTGCTTGTATTTTTGCATTTTCCAACATTGATAATAGCAGAGCATCACTTGAGACAGGTGGTCAGTTTCAAAAGGAAAACGGTGACATTGTAGAAGCAGAACATGGAGTGGTTGCTGCAGATGATGAACGTTGCTCTGATAT
TGGTATAGACATACTCAGAGAAGGGGGACATGCAGTGGATGCTGCTGTAGCAACCTCCTTATGCCTTGGTGTGGTGAGTCCAGCATCAAGTGGCCTTGGTGGAGGTGCCTTCATGCTATTAAGATCTTCAAATGGGCAAGCTCAAGCCTTCAACATGAGGGAGACTGCACCTCAAGCTGCTTCTGAGGACATGTATGCCA
AAAATCCTGCAGCCAAAAAGATTGGCCCTCTATCTGTAGGTGTACCAGgtgagcttgcagggctccatctagcatggacacagcatggaaaactgccttggaagaggcttgtccagcctgtaattaaattggtagccaagggttttgtcatttctccttatcttgcctcacacattaaaaattgtaaaaatgctattctg
gctgacaaagGTCTTCGAGGAGTTTTTACAGTCAATGGGAAACTCCTAAGTGCCGGTGATACTTGCTACAACAAGAAGTTGGCAGAGACATTGCAAGCCATTTCTGATTTTGGACCAAGTGCCTTTTACAATGGTACCATTGGAAAAAGACTAGTAGCAGATGTACAAGCAGCCGGGGGGATCCTTTCTTTTGAGGATAT
GCAGAACTATAAAGTAGAAGTCATGGATCCTATTTCAGCGGAGGTCATGGGATATACAGTTCTGGGAATGCCACCTCCCTCTTCTGGAGCTGCAGGGCTAATTTTAGCTCTCAACATTCTTGGAAGCTATGGAACACCTGATGCAGCACAGGGCATATTGGGCCTACACCGTACAATTGAGGCCTTCAAACATATGTTTT
CTGTGAGGATGAATCTTGGTGACCCAAAATTTGTCAACATCAAGGATACATTGTCTGATATGCTTTCTCCAAAGTTTGCTGTAAAACTTAAAAGTAAAATATATGACAACACCACTTTTCCATCAGAGTACTATGGATACAAATGGAACCAACTTAGAGACCATGGTACCAGTCATTTTTGCATTGTCGATAGTGAGCGC
AATGCAGTGTCCATGACCACCACAGTGAATTACGCCTTCGGAGCCCTTATGCTCTCTCCTTCTACAGGCATTGTATTGAATAATGAAATGGATGACTTCTCCACACCTACAGAGATTTCTCCAGACAGGCTTCCTCCGGCTCCAGCAAATTTCATCAAACCTAATAAGCAACCATTATCTTCAATGTCTCCTACTATAGT
TCTGAAGGGCGGGCAATTAGCAGGGGTGCTTGGTGGCAGTGGCGGACTAAAAATAATCCCTGCAGTTGTTCAAGTTTTCCTGAACCATTTCATAAATGGGATGGATCCACTAGTTGCTGTAACAGCTCCAAGAGTATACCATAGGTTGATCCCAAACATGGTCACGTATGAAAACTGGACGGTTTTGAATGGACAGCACA
TTGAACTTTCTAGTGAGTCAAAGATGGGTTTGAGCCAAAGAGGCCATTCGTTAGAAGCACAGTCATCAGGTGCCATATCTCAGCTTGTTGTGCAGAACTTGAATAACCCTATAAAGCTGGAGTCAGATAATCAAGTTTTCTATGGGAAACTGACAGCGGTAAGTGACCCCAGGAAAGCTGGAATTCCAGCTGGGTTCTAG
ATACTTGAGTTGTCTGTCACTTCATTCTGTACTGTTGCTGCATGAGGATACATAACGCAGGATAAGCAAACAACACCTGTATCATAGATGATGCAAAATATAACAACTATTCCATTGTACCACAGCGTTAGAGAGTCTAAGTTGAGATCGTCTTGTCTATTATTGGACAACTTAATGCACAGTTTCAAACGACTTATTAC
TTTTCCCTAGCAAGGGTTTATATGGCTTCTATTCAGAGAGTGCAAAGACCCTGGAATGCCTCTTATCTACTTAGACAGGATCTGTGCATCTAAGCGTTATACTAGTCTAAGTAGTTTGAGATGTATATGATATTGATACTCTAACTGGTGGAGTGCTCGTTACCATAATATAATAAAAA
Intron 3 GTTTGTAAAA ... GAGATTTTAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 33.33 | 8 | 1 | 7 |
| A2 | 41.67 | 7 | 4 | 6 |
| A3 | 25 | 9 | 1 | 5 |
| A4 | 47.37 | 5 | 4 | 5 |
| A5 | 20 | 4 | 2 | 0 |
| A6 | 25 | 3 | 2 | 0 |
| A7 | 30.43 | 8 | 3 | 4 |
| A8 | 17.65 | 7 | 1 | 2 |
| A9 | 28.57 | 10 | 1 | 7 |
| A10 | 25 | 15 | 3 | 7 |
>TRINITY_DN43102_c0_g1_i1 from sample A7 / Example spliced isoformCATCTATGTTTGTGGCACCTGCCGGCTGCCATCCTGTAGGCCCGGGCGGAGACTCGTCCGTCGAAGCAGAATATTCATCATCGCCCAATAAATAAGCGATTGCTACAATTAACAAATTCGTCGCAGAAGAGGTCTCGCGATCGAATCCTGAAGAGACAATCATTCTCCGGAATCAGGCAAGATTACTGTAGTTTCGTCCT
CTCGTCCGACAGATTGACCAAGATCCTTGACTTAACAAATATTTGGCTATTCTCCATCTTGGCCTCTTTAACTGGAAAGAACAATTGAAATTCAAAATGGTACGAGCAAGCTTGGAAGCACCACTTGTGGACTATGGCAACAATAATTCCTCCAAACGTTCCATTCGGGGAATTGTCCAGACAACATTTACATTGCTTCT
AGTGGCAGTGATTGCTCTTGCTTGTATTTTTGCATTTTCCAACATTGATAATAGCAGAGCATCACTTGAGACAGGTGGTCAGTTTCAAAAGGAAAACGGTGACATTGTAGAAGCAGAACATGGAGTGGTTGCTGCAGATGATGAACGTTGCTCTGATATTGGTATAGACATACTCAGAGAAGGGGGACATGCAGTGGATG
CTGCTGTAGCAACCTCCTTATGCCTTGGTGTGGTGAGTCCAGCATCAAGTGGCCTTGGTGGAGGTGCCTTCATGCTATTAAGATCTTCAAATGGGCAAGCTCAAGCCTTCAACATGAGGGAGACTGCACCTCAAGCTGCTTCTGAGGACATGTATGCCAAAAATCCTGCAGCCAAAAAGATTGGCCCTCTATCTGTAGGT
GTACCAGGTGAGCTTGCAGGGCTCCATCTAGCATGGACACAGCATGGAAAACTGCCTTGGAAGAGGCTTGTCCAGCCTGTAATTAAATTGGTAGCCAAGGGTTTTGTCATTTCTCCTTATCTTGCCTCACACATTAAAAATTGTAAAAATGCTATTCTGGCTGACAAAGGTCTTCGAGGAGTTTTTACAGTCAATGGGAA
ACTCCTAAGTGCCGGTGATACTTGCTACAACAAGAAGTTGGCAGAGACATTGCAAGCCATTTCTGATTTTGGACCAAGTGCCTTTTACAATGGTACCATTGGAAAAAGACTAGTAGCAGATGTACAAGCAGCCGGGGGGATCCTTTCTTTTGAGGATATGCAGAACTATAAAGTAGAAGTCATGGATCCTATTTCAGCGG
AGGTCATGGGATATACAGTTCTGGGAATGCCACCTCCCTCTTCTGGAGCTGCAGGGCTAATTTTAGCTCTCAACATTCTTGGAAGCTATGGAACACCTGATGCAGCACAGGGCATATTGGGCCTACACCGTACAATTGAGGCCTTCAAACATATGTTTTCTGTGAGGATGAATCTTGGTGACCCAAAATTTGTCAACATC
AAGGATACATTGTCTGATATGCTTTCTCCAAAGTTTGCTGTAAAACTTAAAAGTAAAATATATGACAACACCACTTTTCCATCAGAGTACTATGGATACAAATGGAACCAACTTAGAGACCATGGTACCAGTCATTTTTGCATTGTCGATAGTGAGCGCAATGCAGTGTCCATGACCACCACAGTGAATTACGCCTTCGG
AGCCCTTATGCTCTCTCCTTCTACAGGCATTGTATTGAATAATGAAATGGATGACTTCTCCACACCTACAGAGATTTCTCCAGACAGGCTTCCTCCGGCTCCAGCAAATTTCATCAAACCTAATAAGCAACCATTATCTTCAATGTCTCCTACTATAGTTCTGAAGGGCGGGCAATTAGCAGGGGTGCTTGGTGGCAGTG
GCGGACTAAAAATAATCCCTGCAGTTGTTCAAGTTTTCCTGAACCATTTCATAAATGGGATGGATCCACTAGTTGCTGTAACAGCTCCAAGAGTATACCATAGGTTGATCCCAAACATGGTCACGTATGAAAACTGGACGGTTTTGAATGGACAGCACATTGAACTTTCTAGTGAGTCAAAGATGGGTTTGAGCCAAAGA
GGCCATTCGTTAGAAGCACAGTCATCAGGTGCCATATCTCAGCTTGTTGTGCAGAACTTGAATAACCCTATAAAGCTGGAGTCAGATAATCAAGTTTTCTATGGGAAACTGACAGCGGTAAGTGACCCCAGGAAAGCTGGAATTCCAGCTGGGTTCTAGATACTTGAGTTGTCTGTCACTTCATTCTGTACTGTTGCTGC
ATGAGGATACATAACGCAGGATAAGCAAACAACACCTGTATCATAGATGATGCAAAATATAACAACTATTCCATTGTACCACAGCGTTAGAGAGTCTAAGTTGAGATCGTCTTGTCTATTATTGGACAACTTAATGCACAGTTTCAAACGACTTATTACTTTTCCCTAGCAAGGGTTTATATGGCTTCTATTCAGAGAGT
GCAAAGACCCTGGAATGCCTCTTATCTACTTAGACAGGATCTGTGCATCTAAGCGTTATACTAGTCTAAGTAGTTTGAGATGTATATGATATTGATACTCTAACTGGTGGAGTGCTCGA
>TRINITY_DN43102_c0_g1_i4 from sample A7 / Example unspliced isoform:CATCTATGTTTGTGGCACCTGCCGGCTGCCATCCTGTAGGCCCGGGCGGAGACTCGTCCGTCGAAGCAGAATATTCATCATCGCCCAATAAATAAGCGATTGCTACAATTAACAAATTCGTCGCAGAAGAGGTCTCGCGATCGAATCCTGAAGAGACAATCATTCTCCGGAATCAGGCAAGATTACTGTAGTTTCGTCCT
CTCGTCCGACAGATTGACCAAGgtttgtaaaaattgtcttgaagatctccgtgatttgctggaaattcagcggaaagaaaggagagacatagagattttagATCCTTGACTTAACAAATATTTGGCTATTCTCCATCTTGGCCTCTTTAACTGGAAAGAACAATTGAAATTCAAAATGGTACGAGCAAGCTTGGAAGCAC
CACTTGTGGACTATGGCAACAATAATTCCTCCAAACGTTCCATTCGGGGAATTGTCCAGACAACATTTACATTGCTTCTAGTGGCAGTGATTGCTCTTGCTTGTATTTTTGCATTTTCCAACATTGATAATAGCAGAGCATCACTTGAGACAGGTGGTCAGTTTCAAAAGGAAAACGGTGACATTGTAGAAGCAGAACAT
GGAGTGGTTGCTGCAGATGATGAACGTTGCTCTGATATTGGTATAGACATACTCAGAGAAGGGGGACATGCAGTGGATGCTGCTGTAGCAACCTCCTTATGCCTTGGTGTGGTGAGTCCAGCATCAAGTGGCCTTGGTGGAGGTGCCTTCATGCTATTAAGATCTTCAAATGGGCAAGCTCAAGCCTTCAACATGAGGGA
GACTGCACCTCAAGCTGCTTCTGAGGACATGTATGCCAAAAATCCTGCAGCCAAAAAGATTGGCCCTCTATCTGTAGGTGTACCAGGTGAGCTTGCAGGGCTCCATCTAGCATGGACACAGCATGGAAAACTGCCTTGGAAGAGGCTTGTCCAGCCTGTAATTAAATTGGTAGCCAAGGGTTTTGTCATTTCTCCTTATC
TTGCCTCACACATTAAAAATTGTAAAAATGCTATTCTGGCTGACAAAGGTCTTCGAGGAGTTTTTACAGTCAATGGGAAACTCCTAAGTGCCGGTGATACTTGCTACAACAAGAAGTTGGCAGAGACATTGCAAGCCATTTCTGATTTTGGACCAAGTGCCTTTTACAATGGTACCATTGGAAAAAGACTAGTAGCAGAT
GTACAAGCAGCCGGGGGGATCCTTTCTTTTGAGGATATGCAGAACTATAAAGTAGAAGTCATGGATCCTATTTCAGCGGAGGTCATGGGATATACAGTTCTGGGAATGCCACCTCCCTCTTCTGGAGCTGCAGGGCTAATTTTAGCTCTCAACATTCTTGGAAGCTATGGAACACCTGATGCAGCACAGGGCATATTGGG
CCTACACCGTACAATTGAGGCCTTCAAACATATGTTTTCTGTGAGGATGAATCTTGGTGACCCAAAATTTGTCAACATCAAGGATACATTGTCTGATATGCTTTCTCCAAAGTTTGCTGTAAAACTTAAAAGTAAAATATATGACAACACCACTTTTCCATCAGAGTACTATGGATACAAATGGAACCAACTTAGAGACC
ATGGTACCAGTCATTTTTGCATTGTCGATAGTGAGCGCAATGCAGTGTCCATGACCACCACAGTGAATTACGCCTTCGGAGCCCTTATGCTCTCTCCTTCTACAGGCATTGTATTGAATAATGAAATGGATGACTTCTCCACACCTACAGAGATTTCTCCAGACAGGCTTCCTCCGGCTCCAGCAAATTTCATCAAACCT
AATAAGCAACCATTATCTTCAATGTCTCCTACTATAGTTCTGAAGGGCGGGCAATTAGCAGGGGTGCTTGGTGGCAGTGGCGGACTAAAAATAATCCCTGCAGTTGTTCAAGTTTTCCTGAACCATTTCATAAATGGGATGGATCCACTAGTTGCTGTAACAGCTCCAAGAGTATACCATAGGTTGATCCCAAACATGGT
CACGTATGAAAACTGGACGGTTTTGAATGGACAGCACATTGAACTTTCTAGTGAGTCAAAGATGGGTTTGAGCCAAAGAGGCCATTCGTTAGAAGCACAGTCATCAGGTGCCATATCTCAGCTTGTTGTGCAGAACTTGAATAACCCTATAAAGCTGGAGTCAGATAATCAAGTTTTCTATGGGAAACTGACAGCGGTAA
GTGACCCCAGGAAAGCTGGAATTCCAGCTGGGTTCTAGATACTTGAGTTGTCTGTCACTTCATTCTGTACTGTTGCTGCATGAGGATACATAACGCAGGATAAGCAAACAACACCTGTATCATAGATGATGCAAAATATAACAACTATTCCATTGTACCACAGCGTTAGAGAGTCTAAGTTGAGATCGTCTTGTCTATTA
TTGGACAACTTAATGCACAGTTTCAAACGACTTATTACTTTTCCCTAGCAAGGGTTTATATGGCTTCTATTCAGAGAGTGCAAAGACCCTGGAATGCCTCTTATCTACTTAGACAGGATCTGTGCATCTAAGCGTTATACTAGTCTAAGTAGTTTGAGATGTATATGATATTGATACTCTAACTGGTGGAGTGCTCGA
Intron 4 GCAAGATTAC ... ATTGACCAAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 39.13 | 7 | 1 | 8 |
| A2 | 61.9 | 4 | 6 | 7 |
| A3 | 53.85 | 6 | 5 | 9 |
| A4 | 46.67 | 4 | 2 | 5 |
| A5 | 66.67 | 2 | 4 | 4 |
| A6 | 68.42 | 3 | 10 | 3 |
| A7 | 61.54 | 5 | 8 | 8 |
| A8 | 60 | 5 | 8 | 7 |
| A9 | 45.95 | 10 | 7 | 10 |
| A10 | 51.11 | 11 | 8 | 15 |
>TRINITY_DN39683_c3_g1_i6 from sample A9 / Example spliced isoformAACACGTTGTGTTCTGTGTTATATAAATGAAGCACGCGGATGACGTCAACAAGAAATGCTGCATGCAACTTGCTAGGAAGTAAGTTGCATCTATGTTTGTGGCACCTGCCGGCTGCCATCCTGTAGGCCCGGGCGGAGACTCGTCCGTCGAAGCAGAATATTCATCATCGCCCAATAAATAAGCGATTGCTACAATTAAC
AAATTCGTCGCAGAAGAGGTCTCGCGATCGAATCCTGAAGAGACAATCATTCTCCGGAATCAGATCCTTGACTTAACAAATATTTGGCTATTCTCCATCTTGGCCTCTTTAACTGGAAAGAACAATTGAAATTCAAAATGGTACGAGCAAGCTTGGAAGCACCACTTGTGGACTATGGCAACAATAATTCCTCCAAACGT
TCCATTCGGGGAATTGTCCAGACAACATTTACATTGCTTCTAGTGGCAGTGATTGCTCTTGCTTGTATTTTTGCATTTTCCAACATTGATAATAGCAGAGCATCACTTGAGACAGGTGGTCAGTTTCAAAAGGAAAACGGTGACATTGTAGAAGCAGAACATGGAGTGGTTGCTGCAGATGATGAACGTTGCTCTGATAT
TGGTATAGACATACTCAGAGAAGGGGGACATGCAGTGGATGCTGCTGTAGCAACCTCCTTATGCCTTGGTGTGGTGAGTCCAGCATCAAGTGGCCTTGGTGGAGGTGCCTTCATGCTATTAAGATCTTCAAATGGGCAAGCTCAAGCCTTCAACATGAGGGAGACTGCACCTCAAGCTGCTTCTGAGGACATGTATGCCA
AAAATCCTGCAGCCAAAAAGATTGGCCCTCTATCTGTAGGTGTACCAGGTGAGCTTGCAGGGCTCCATCTAGCATGGACACAGCATGGAAAACTGCCTTGGAAGAGGCTTGTCCAGCCTGTAATTAAATTGGTAGCCAAGGGTTTTGTCATTTCTCCTTATCTTGCCTCACACATTAAAAATTGTAAAAATGCTATTCTG
GCTGACAAAGGTCTTCGAGGAGTTTTTACAGTCAATGGGAAACTCCTAAGTGCCGGTGATACTTGCTACAACAAGAAGTTGGCAGAGACATTGCAAGCCATTTCTGATTTTGGACCAAGTGCCTTTTACAATGGTACCATTGGAAAAAGACTAGTAGCAGATGTACAAGCAGCCGGGGGGATCCTTTCTTTTGAGGATAT
GCAGAACTATAAAGTAGAAGTCATGGATCCTATTTCAGCGGAGGTCATGGGATATACAGTTCTGGGAATGCCACCTCCCTCTTCTGGAGCTGCAGGGCTAATTTTAGCTCTCAACATTCTTGGAAGCTATGGAACACCTGATGCAGCACAGGGCATATTGGGCCTACACCGTACAATTGAGGCCTTCAAACATATGTTTT
CTGTGAGGATGAATCTTGGTGACCCAAAATTTGTCAACATCAAGGATACATTGTCTGATATGCTTTCTCCAAAGTTTGCTGTAAAACTTAAAAGTAAAATATATGACAACACCACTTTTCCATCAGAGTACTATGGATACAAATGGAACCAACTTAGAGACCATGGTACCAGTCATTTTTGCATTGTCGATAGTGAGCGC
AATGCAGTGTCCATGACCACCACAGTGAATTACGCCTTCGGAGCCCTTATGCTCTCTCCTTCTACAGGCATTGTATTGAATAATGAAATGGATGACTTCTCCACACCTACAGAGATTTCTCCAGACAGGCTTCCTCCGGCTCCAGCAAATTTCATCAAACCTAATAAGCAACCATTATCTTCAATGTCTCCTACTATAGT
TCTGAAGGGCGGGCAATTAGCAGGGGTGCTTGGTGGCAGTGGCGGACTAAAAATAATCCCTGCAGTTGTTCAAGTTTTCCTGAACCATTTCATAAATGGGATGGATCCACTAGTTGCTGTAACAGCTCCAAGAGTATACCATAGGTTGATCCCAAACATGGTCACGTATGAAAACTGGACGGTTTTGAATGGACAGCACA
TTGAACTTTCTAGTGAGTCAAAGATGGGTTTGAGCCAAAGAGGCCATTCGTTAGAAGCACAGTCATCAGGTGCCATATCTCAGCTTGTTGTGCAGAACTTGAATAACCCTATAAAGCTGGAGTCAGATAATCAAGTTTTCTATGGGAAACTGACAGCGGTAAGTGACCCCAGGAAAGCTGGAATTCCAGCTGGGTTCTAG
ATACTTGAGTTGTCTGTCACTTCATTCTGTACTGTTGCTGCATGAGGATACATAACGCAGGATAAGCAAACAACACCTGTATCATAGATGATGCAAAATATAACAACTATTCCATTGTACCACAGCGTTAGAGAGTCTAAGTTGAGATCGTCTTGTCTATTATTGGACAACTTAATGCACAGTTTCAAACGACTTATTAC
TTTTCCCTAGCAAGGGTTTATATGGCTTCTATTCAGAGAGTGCAAAGACCCTGGAATGCCTCTTATCTACTTAGACAGGATCTGTGCATCTAAGCGTTATACTAGTCTAAGTAGTTTGAGATGTATATGATATTGATACTCTAACTGGTGGAGTGCTCGTTACCATAATATAATAAAAA
>TRINITY_DN39683_c3_g1_i9 from sample A9 / Example unspliced isoform:AACACGTTGTGTTCTGTGTTATATAAATGAAGCACGCGGATGACGTCAACAAGAAATGCTGCATGCAACTTGCTAGGAAGTAAGTTGCATCTATGTTTGTGGCACCTGCCGGCTGCCATCCTGTAGGCCCGGGCGGAGACTCGTCCGTCGAAGCAGAATATTCATCATCGCCCAATAAATAAGCGATTGCTACAATTAAC
AAATTCGTCGCAGAAGAGGTCTCGCGATCGAATCCTGAAGAGACAATCATTCTCCGGAATCAGgcaagattactgtagtttcgtcctctcgtccgacagattgaccaagATCCTTGACTTAACAAATATTTGGCTATTCTCCATCTTGGCCTCTTTAACTGGAAAGAACAATTGAAATTCAAAATGGTACGAGCAAGCTT
GGAAGCACCACTTGTGGACTATGGCAACAATAATTCCTCCAAACGTTCCATTCGGGGAATTGTCCAGACAACATTTACATTGCTTCTAGTGGCAGTGATTGCTCTTGCTTGTATTTTTGCATTTTCCAACATTGATAATAGCAGAGCATCACTTGAGACAGGTGGTCAGTTTCAAAAGGAAAACGGTGACATTGTAGAAG
CAGAACATGGAGTGGTTGCTGCAGATGATGAACGTTGCTCTGATATTGGTATAGACATACTCAGAGAAGGGGGACATGCAGTGGATGCTGCTGTAGCAACCTCCTTATGCCTTGGTGTGGTGAGTCCAGCATCAAGTGGCCTTGGTGGAGGTGCCTTCATGCTATTAAGATCTTCAAATGGGCAAGCTCAAGCCTTCAAC
ATGAGGGAGACTGCACCTCAAGCTGCTTCTGAGGACATGTATGCCAAAAATCCTGCAGCCAAAAAGATTGGCCCTCTATCTGTAGGTGTACCAGGTGAGCTTGCAGGGCTCCATCTAGCATGGACACAGCATGGAAAACTGCCTTGGAAGAGGCTTGTCCAGCCTGTAATTAAATTGGTAGCCAAGGGTTTTGTCATTTC
TCCTTATCTTGCCTCACACATTAAAAATTGTAAAAATGCTATTCTGGCTGACAAAGGTCTTCGAGGAGTTTTTACAGTCAATGGGAAACTCCTAAGTGCCGGTGATACTTGCTACAACAAGAAGTTGGCAGAGACATTGCAAGCCATTTCTGATTTTGGACCAAGTGCCTTTTACAATGGTACCATTGGAAAAAGACTAG
TAGCAGATGTACAAGCAGCCGGGGGGATCCTTTCTTTTGAGGATATGCAGAACTATAAAGTAGAAGTCATGGATCCTATTTCAGCGGAGGTCATGGGATATACAGTTCTGGGAATGCCACCTCCCTCTTCTGGAGCTGCAGGGCTAATTTTAGCTCTCAACATTCTTGGAAGCTATGGAACACCTGATGCAGCACAGGGC
ATATTGGGCCTACACCGTACAATTGAGGCCTTCAAACATATGTTTTCTGTGAGGATGAATCTTGGTGACCCAAAATTTGTCAACATCAAGGATACATTGTCTGATATGCTTTCTCCAAAGTTTGCTGTAAAACTTAAAAGTAAAATATATGACAACACCACTTTTCCATCAGAGTACTATGGATACAAATGGAACCAACT
TAGAGACCATGGTACCAGTCATTTTTGCATTGTCGATAGTGAGCGCAATGCAGTGTCCATGACCACCACAGTGAATTACGCCTTCGGAGCCCTTATGCTCTCTCCTTCTACAGGCATTGTATTGAATAATGAAATGGATGACTTCTCCACACCTACAGAGATTTCTCCAGACAGGCTTCCTCCGGCTCCAGCAAATTTCA
TCAAACCTAATAAGCAACCATTATCTTCAATGTCTCCTACTATAGTTCTGAAGGGCGGGCAATTAGCAGGGGTGCTTGGTGGCAGTGGCGGACTAAAAATAATCCCTGCAGTTGTTCAAGTTTTCCTGAACCATTTCATAAATGGGATGGATCCACTAGTTGCTGTAACAGCTCCAAGAGTATACCATAGGTTGATCCCA
AACATGGTCACGTATGAAAACTGGACGGTTTTGAATGGACAGCACATTGAACTTTCTAGTGAGTCAAAGATGGGTTTGAGCCAAAGAGGCCATTCGTTAGAAGCACAGTCATCAGGTGCCATATCTCAGCTTGTTGTGCAGAACTTGAATAACCCTATAAAGCTGGAGTCAGATAATCAAGTTTTCTATGGGAAACTGAC
AGCGGTAAGTGACCCCAGGAAAGCTGGAATTCCAGCTGGGTTCTAGATACTTGAGTTGTCTGTCACTTCATTCTGTACTGTTGCTGCATGAGGATACATAACGCAGGATAAGCAAACAACACCTGTATCATAGATGATGCAAAATATAACAACTATTCCATTGTACCACAGCGTTAGAGAGTCTAAGTTGAGATCGTCTT
GTCTATTATTGGACAACTTAATGCACAGTTTCAAACGACTTATTACTTTTCCCTAGCAAGGGTTTATATGGCTTCTATTCAGAGAGTGCAAAGACCCTGGAATGCCTCTTATCTACTTAGACAGGATCTGTGCATCTAAGCGTTATACTAGTCTAAGTAGTTTGAGATGTATATGATATTGATACTCTAACTGGTGGAGT
GCTCGTTACCATAATATAATAAAAA
Intron 5 GCTCTCAACA ... AGTTCTGAAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 75.76 | 4 | 15 | 10 |
| A2 | 83.33 | 1 | 6 | 4 |
| A3 | 100 | 0 | 6 | 7 |
| A4 | 68.42 | 3 | 8 | 5 |
| A5 | 71.43 | 1 | 5 | 0 |
| A6 | 80.95 | 2 | 9 | 8 |
| A7 | 59.32 | 12 | 19 | 16 |
| A8 | 56.16 | 16 | 29 | 12 |
| A9 | 69.57 | 7 | 15 | 17 |
| A10 | 70 | 12 | 37 | 19 |
>TRINITY_DN42904_c0_g1_i1 from sample A10 / Example spliced isoformGGCACTTTGATTGAAATTTCGTACAATAAAATTATATGCCTCTCATCCGATGCGGATTTTTGGTTCCCAATCCCCTTGAGACATAGTGAAACCAGGAGCATACCATCATGAAAATGTAAAAATGAGACGAACCGCGATGTTGACGAGGAGAACCAGAATGGAATAATCAGAAAACCCTGATTTCCCCGATATTAACGCAG
AAATCCATCCTAGAAACTACTGGATATGAATGAACTTTATCCTCGTTGCTAAGGGAGCCTAGAGCTGGCTTGAATTTATGGTTGTTAGAGCTATTAGATGCGACTCATGCGAGTCGCGAATCTGACGAGTTGGTGGGCATCAAGCCCTGTCTTCTCCAGGATCGGTACCGAGACGTCAGCCGAAATAGAATATTCATCTC
CCCAGAGCATGAGGAGTTGGTTTGTGGGGATCTGGCTTATGTAGGTTCGGCACCGAGCCGTCAGCCGAAATAGAATGTCCATGATTGCCCAGCACAGAGCTGATTGCTTCACTCAACTAAATTCGTTGCAGACGAGGTCAACGATCGAATCTTGCAGACACAATCGTTTCCACAAGAAGATCCTTGACTTAACAAATATT
TGGCTATTCTCCATCTTGGCCTCTTTAACTGGAAAGAACAATTGAAATTCAAAATGGTACGAGCAAGCTTGGAAGCACCACTTGTGGACTATGGCAACAATAATTCCTCCAAACGTTCCATTCGGGGAATTGTCCAGACAACATTTACATTGCTTCTAGTGGCAGTGATTGCTCTTGCTTGTATTTTTGCATTTTCCAAC
ATTGATAATAGCAGAGCATCACTTGAGACAGGTGGTCAGTTTCAAAAGGAAAACGGTGACATTGTAGAAGCAGAACATGGAGTGGTTGCTGCAGATGATGAACGTTGCTCTGATATTGGTATAGACATACTCAGAGAAGGGGGACATGCAGTGGATGCTGCTGTAGCAACCTCCTTATGCCTTGGTGTGGTGAGTCCAGC
ATCAAGTGGCCTTGGTGGAGGTGCCTTCATGCTATTAAGATCTTCAAATGGGCAAGCTCAAGCCTTCAACATGAGGGAGACTGCACCTCAAGCTGCTTCTGAGGACATGTATGCCAAAAATCCTGCAGCCAAAAAGATTGGCCCTCTATCTGTAGGTGTACCAGGTGAGCTTGCAGGGCTCCATCTAGCATGGACACAGC
ATGGAAAACTGCCTTGGAAGAGGCTTGTCCAGCCTGTAATTAAATTGGTAGCCAAGGGTTTTGTCATTTCTCCTTATCTTGCCTCACACATTAAAAATTGTAAAAATGCTATTCTGGCTGACAAAGGTCTTCGAGGAGTTTTTACAGTCAATGGGAAACTCCTAAGTGCCGGTGATACTTGCTACAACAAGAAGTTGGCA
GAGACATTGCAAGCCATTTCTGATTTTGGACCAAGTGCCTTTTACAATGGTACCATTGGAAAAAGACTAGTAGCAGATGTACAAGCAGCCGGGGGGATCCTTTCTTTTGAGGATATGCAGAACTATAAAGTAGAAGTCATGGATCCTATTTCAGCGGAGGTCATGGGATATACAGTTCTGGGAATGCCACCTCCCTCTTC
TGGAGCTGCAGGGCTAATTTTAGGCGGGCAATTAGCAGGGGTGCTTGGTGGCAGTGGCGGACTAAAAATAATCCCTGCAGTTGTTCAAGTTTTCCTGAACCATTTCATAAATGGGATGGATCCACTAGTTGCTGTAACAGCTCCAAGAGTATACCATAGGTTGATCCCAAACATGGTCACGTATGAAAACTGGACGGTTT
TGAATGGACAGCACATTGAACTTTCTAGTGAGTCAAAGATGGGTTTGAGCCAAAGAGGCCATTCGTTAGAAGCACAGTCATCAGGTGCCATATCTCAGCTTGTTGTGCAGAACTTGAATAACCCTATAAAGCTGGAGTCAGATAATCAAGTTTTCTATGGGAAACTGACAGCGGTAAGTGACCCCAGGAAAGCTGGAATT
CCAGCTGGGTTCTAGATACTTGAGTTGTCTGTCACTTCATTCTGTACTGTTGCTGCATGAGGATACATAACGCAGGATAAGCAAACAACACCTGTATCATAGATGATGCAAAATATAACAACTATTCCATTGTACCACAGCGTTAGAGAGTCTAAGTTGAGATCGTCTTGTCTATTATTGGACAACTTAATGCACAGTTT
CAAACGACTTATTACTTTTCCCTAA
>TRINITY_DN42904_c0_g1_i6 from sample A10 / Example unspliced isoform:AGGAAGTAAGTTGCATCTATGTTTGTGGCACCTGCCGGCTGCCATCCTGTAGGCCCGGGCGGAGACTCGTCCGTCGAAGCAGAATATTCATCATCGCCCAATAAATAAGCGATTGCTACAATTAACAAATTCGTCGCAGAAGAGGTCTCGCGATCGAATCCTGAAGAGACAATCATTCTCCGGAATCAGGCAAGATTACT
GTAGTTTCGTCCTCTCGTCCGACAGATTGACCAAGATCCTTGACTTAACAAATATTTGGCTATTCTCCATCTTGGCCTCTTTAACTGGAAAGAACAATTGAAATTCAAAATGGTACGAGCAAGCTTGGAAGCACCACTTGTGGACTATGGCAACAATAATTCCTCCAAACGTTCCATTCGGGGAATTGTCCAGACAACAT
TTACATTGCTTCTAGTGGCAGTGATTGCTCTTGCTTGTATTTTTGCATTTTCCAACATTGATAATAGCAGAGCATCACTTGAGACAGGTGGTCAGTTTCAAAAGGAAAACGGTGACATTGTAGAAGCAGAACATGGAGTGGTTGCTGCAGATGATGAACGTTGCTCTGATATTGGTATAGACATACTCAGAGAAGGGGGA
CATGCAGTGGATGCTGCTGTAGCAACCTCCTTATGCCTTGGTGTGGTGAGTCCAGCATCAAGTGGCCTTGGTGGAGGTGCCTTCATGCTATTAAGATCTTCAAATGGGCAAGCTCAAGCCTTCAACATGAGGGAGACTGCACCTCAAGCTGCTTCTGAGGACATGTATGCCAAAAATCCTGCAGCCAAAAAGATTGGCCC
TCTATCTGTAGGTGTACCAGGTGAGCTTGCAGGGCTCCATCTAGCATGGACACAGCATGGAAAACTGCCTTGGAAGAGGCTTGTCCAGCCTGTAATTAAATTGGTAGCCAAGGGTTTTGTCATTTCTCCTTATCTTGCCTCACACATTAAAAATTGTAAAAATGCTATTCTGGCTGACAAAGGTCTTCGAGGAGTTTTTA
CAGTCAATGGGAAACTCCTAAGTGCCGGTGATACTTGCTACAACAAGAAGTTGGCAGAGACATTGCAAGCCATTTCTGATTTTGGACCAAGTGCCTTTTACAATGGTACCATTGGAAAAAGACTAGTAGCAGATGTACAAGCAGCCGGGGGGATCCTTTCTTTTGAGGATATGCAGAACTATAAAGTAGAAGTCATGGAT
CCTATTTCAGCGGAGGTCATGGGATATACAGTTCTGGGAATGCCACCTCCCTCTTCTGGAGCTGCAGGGCTAATTTTAgctctcaacattcttggaagctatggaacacctgatgcagcacagggcatattgggcctacaccgtacaattgaggccttcaaacatatgttttctgtgaggatgaatcttggtgacccaaa
atttgtcaacatcaaggatacattgtctgatatgctttctccaaagtttgctgtaaaacttaaaagtaaaatatatgacaacaccacttttccatcagagtactatggatacaaatggaaccaacttagagaccatggtaccagtcatttttgcattgtcgatagtgagcgcaatgcagtgtccatgaccaccacagtga
attacgccttcggagcccttatgctctctccttctacaggcattgtattgaataatgaaatggatgacttctccacacctacagagatttctccagacaggcttcctccggctccagcaaatttcatcaaacctaataagcaaccattatcttcaatgtctcctactatagttctgaagGGCGGGCAATTAGCAGGGGTG
CTTGGTGGCAGTGGCGGACTAAAAATAATCCCTGCAGTTGTTCAAGTTTTCCTGAACCATTTCATAAATGGGATGGATCCACTAGTTGCTGTAACAGCTCCAAGAGTATACCATAGGTTGATCCCAAACATGGTCACGTATGAAAACTGGACGGTTTTGAATGGACAGCACATTGAACTTTCTAGTGAGTCAAAGATGGG
TTTGAGCCAAAGAGGCCATTCGTTAGAAGCACAGTCATCAGGTGCCATATCTCAGCTTGTTGTGCAGAACTTGAATAACCCTATAAAGCTGGAGTCAGATAATCAAGTTTTCTATGGGAAACTGACAGCGGTAAGTGACCCCAGGAAAGCTGGAATTCCAGCTGGGTTCTAGATACTTGAGTTGTCTGTCACTTCATTCT
GTACTGTTGCTGCATGAGGATACATAACGCAGGATAAGCAAACAACACCTGTATCATAGATGATGCAAAATATAACAACTATTCCATTGTACCACAGCGTTAGAGAGTCTAAGTTGAGATCGTCTTGTCTATTATTGGACAACTTAATGCACAGTTTCAAACGACTTATTACTTTTCCCTAGCAAGGGTTTATATGGCTT
CTATTCAGAGAGTGCAAAGACC