sp|Q9C757|INT2_ARATH ----> Probable inositol transporter 2

Intron 1 GTATCTATTT ... ATTATTGCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	14.29	6	1	1
A2	50	1	1	1
A3	33.33	9	6	3
A4	25	6	1	3
A5	0	5	0	0
A6	20.83	19	3	7
A7	23.33	23	8	6
A8	26.32	14	5	5
A9	25.3	31	2	19
A10	20	24	0	12

>TRINITY_DN36942_c0_g1_i2 from sample A8 / Example spliced isoform

GTCCAGTCCGGTAAGTTTCAGGGGGCTGCTGGTTAAAAGCTGATAAATCACACGGAAGAAACGTTCTGAAAGAGTTTTTTTTTTTCTTGATTTATCATGGCAAAGAAGGGAGAGAGAGTCGACACGTCCAACGACGGAGCCATGGAGTACAGCGACGATGTCCATCTGCTCCAGCGCCCCCAAAACGAAGAGGTCGAGGT
TCGAATCTCAAAAATTGGCTTAGATATTAGCAGTTACGATGGATCAAGGAATGCAGAAATAAGTTCTTCAAAGCTTTTCGTGATTATCTTGACCCTAGCTGCTGGAATAAGCGGATTCCTCTTTGGATACGATACCGGAGTTATTTCTGGGGCTCTACTTTATATTCGTGAAGATTTTGACACTGTAGACAAGAGCACAG
TTCTTCAGGAGACCATTGTGAGCACAGCTATAGGTGGAGCTGCATTGGGAGCAGCTTTGGGAGGTAAAACCTGTGATCGTTTTGGAAGGAAAATGAGCATGCTCATTGCAGATGTTATTTTCCTTTTGGGTTCCCTGCTTATGGCAGCAGCTCCATCTCCATCAGTTTTAATTTGCGGCAGGGTGATGGTTGGTCTTGGC
ATTGGTATTGCTTCAATGGCAGCCCCCTTGTATATTGCGGAAACTTCGCCATCTCATATTCGAGGAGCACTCGTTAGCATAAATACTCTTATGGTCACCTTTGGCCAGTTTGTCTCCTATCTCGTAAATTATGGATTTACACAGGTTCCAGGAACATGGCGCTGGATGTTAGGAATGGCTGGTGTACCTGCAGTGCTTCA
AATAGTCATATTTACATGTTTGCCAGAATCTCCCCGATGGCTTATAAGAAATGGAAATGTTGATGATGCTATTCCTATTTTTAAAAGAATTTATCCTCCAGAGCAATTGAAGACTGAATTGGAGGAAATTATGGATGCATCAGAGACTGAATCTGGTCCTGATGGAGTTCCAAAGGATGTAAGCATTGGTGATATATTGG
GTTCAAAAGAGATGAGGCTAGCACTAATAGCAGGTGTTGGAATGCAGATTTTTCAGCAGTTAGTGGGTATTAATACTGTGATGTATTATAGCCCATCTATCATGGAGCTGGCAGGATTTGCCTCTCATAGGACAGCATTAATGCTGTCATTAGTTGTTGCTGGTGTGAATGTATTGGGCACAATTGCTGGCATCCTACTG
ATAGACAATTCAGGAAGAAGGCGGCTTGCTCTATCCAGCTTGATTGGTGTAACAGGAGCCTTACTTTTGTTATCAGTGGGGTTCTTCATGACCACTACTGACTCGCCCGGTGTCATAAGACCAGAGGATACTTTCAGAGGAGAACTTTTATGCTCAGCCATGCAGACCAAGCAAAGTATATCTAGATCTCTCTCTTGCCT
TGACTGCTTGCATGCAGCATGTGGGTTTTGTGCTGCTCCTGAAAATAAGATGGAACCAGGTAGCTGTTTAATTTACAATGCAACTGTCGCTGGTATCTGCACTAGTAGTTCTAGATCATGGTATACACAAGCTTGCCCAAGCCAGTACGGCTGGTTAGCATTGGTTGGCCTTGTATTGTACATTGTGGCATTTTCCCCTG
GAATGGGGCCAGTTCCTTGGACTGTCAATTCTGAGATTTACCCTGCACAATATAGGAGTGTGTGTGGAGGAATCGCAGCAACTGCAAATTGGATTTCAAATCTTCTTGTTGCGCAGTCGTTCCTATCACTGACACGTTTATTAGGAACATCTGGGACATTTTTCCTGTTTACATGCGTGTCTGTGCTGGCTATCATTTTT
GTCTTTGTAACTATTCCAGAAACAAAGGGACTATCCTTTGAAGAGGTGGCAGCATTGTGGGAGGAAAGAGCAAAGAATACAAAGGCATGGTTTCCATGGACAACTGATAGGCTTCAGTATTCTCGTGCTAGTGAAAAGTCAGTGCCTATGCAAATCTTCTCTGACTTGGATTCTATACGGAATGGTACCTGATTGTTAAG
TTTTATCACAGGCACACAGGGAGCCTGGTATATTCTTATTCAACTATTCTTTTTAGGGGAAATATCATGATATTCTTTTGAAGGCCTACCATGATTTCTTGGACAGGGGGTGATGTTCATCCTCTCCAATTTAATATACTGCCGGTGTAGTAGCAAGGGCATGTCTTAAATCATTGTTGAAAACTACTCCCATTTGGAGT
TATGAAATCAACAAGCTTATCAAAGTATTAGCCACATTATTAGAGGCCTTCAATCGAGCTCATGTCATTGTATTTTAGAGGAATTTGGGATTAAACGAGACTCCCAACAAGAAGGGGAAGTGAAATTCATTTATAAACATTTGACAATGTCAAGCCGGACATGATTCCTGATTAAAATTATTCTTTCATTAAACTTTATT
ATCTACAAGGTAAAAATTGCTTACTATTTTT

>TRINITY_DN36942_c0_g1_i1 from sample A8 / Example unspliced isoform:

GTCCAGTCCGGTAAGTTTCAGGGGGCTGCTGGTTAAAAGCTGATAAATCACACGGAAGAAACGTTCTGAAAGAGTTTTTTTTTTTCTTGATTTATCATGGCAAAGAAGGGAGAGAGAGTCGACACGTCCAACGACGGAGCCATGGAGTACAGCGACGATGTCCATCTGCTCCAGCGCCCCCAAAACGAAGAGGTCGAGGT
TCGAATCTCAAAAATTGGCTTAGATATTAGCAGTTACGATGGATCAAGGAATGCAGAAATAAGTTCTTCAAAGCTTTTCGTGATTATCTTGACCCTAGCTGCTGGAATAAGCGGATTCCTCTTTGGATACGATACCGGAGTTATTTCTGGGGCTCTACTTTATATTCGTGAAGATTTTGACACTGTAGACAAGAGCACAG
TTCTTCAGGAGACCATTGTGAGCACAGCTATAGGTGGAGCTGCATTGGGAGCAGCTTTGGGAGGTAAAACCTGTGATCGTTTTGGAAGGAAAATGAGCATGCTCATTGCAGATGTTATTTTCCTTTTGGGTTCCCTGCTTATGGCAGCAGCTCCATCTCCATCAGTTTTAATTTGCGGCAGGGTGATGGTTGGTCTTGGC
ATTGGTATTGCTTCAATGGCAGCCCCCTTGTATATTGCGGAAACTTCGCCATCTCATATTCGAGGAGCACTCGTTAGCATAAATACTCTTATGGTCACCTTTGGCCAGTTTGTCTCCTATCTCGTAAATTATGGATTTACACAGGTTCCAGGAACATGGCGCTGGATGTTAGGAATGGCTGGTGTACCTGCAGTGCTTCA
AATAGTCATATTTACATGTTTGCCAGAATCTCCCCGATGGCTTATAAGAAATGGAAATGTTGATGATGCTATTCCTATTTTTAAAAGAATTTATCCTCCAGAGCAATTGAAGACTGAATTGGAGGAAATTATGGATGCATCAGAGACTGAATCTGGTCCTGATGGAGTTCCAAAGGATGTAAGCATTGGTGATATATTGG
GTTCAAAAGAGATGAGGCTAGCACTAATAGCAGGTGTTGGAATGCAGATTTTTCAGCAGTTAGTGGGTATTAATACTGTGATGTATTATAGCCCATCTATCATGGAGCTGGCAGGATTTGCCTCTCATAGGACAGCATTAATGCTGTCATTAGTTGTTGCTGGTGTGAATGTATTGGGCACAATTGCTGGCATCCTACTG
ATAGACAATTCAGGAAGAAGGCGGCTTGCTCTATCCAGCTTGATTGGTGTAACAGGAGCCTTACTTTTGTTATCAGTGGGGTTCTTCATGACCACTACTGACTCGCCCGGTGTCATAAGACCAGAGGATACTTTCAGAGGAGAACTTTTATGCTCAGCCATGCAGACCAAGCAAAGTATATCTAGATCTCTCTCTTGCCT
TGACTGCTTGCATGCAGCATGTGGGTTTTGTGCTGCTCCTGAAAATAAGgtatctatttattttattgaacttcaaaatttcaagtgtaattaagtaacaaacacctatggagagcatgctagtcccaatggatctatactgacatcatttgctattattgcagATGGAACCAGGTAGCTGTTTAATTTACAATGCAACT
GTCGCTGGTATCTGCACTAGTAGTTCTAGATCATGGTATACACAAGCTTGCCCAAGCCAGTACGGCTGGTTAGCATTGGTTGGCCTTGTATTGTACATTGTGGCATTTTCCCCTGGAATGGGGCCAGTTCCTTGGACTGTCAATTCTGAGATTTACCCTGCACAATATAGGAGTGTGTGTGGAGGAATCGCAGCAACTGC
AAATTGGATTTCAAATCTTCTTGTTGCGCAGTCGTTCCTATCACTGACACGTTTATTAGGAACATCTGGGACATTTTTCCTGTTTACATGCGTGTCTGTGCTGGCTATCATTTTTGTCTTTGTAACTATTCCAGAAACAAAGGGACTATCCTTTGAAGAGGTGGCAGCATTGTGGGAGGAAAGAGCAAAGAATACAAAGG
CATGGTTTCCATGGACAACTGATAGGCTTCAGTATTCTCGTGCTAGTGAAAAGTCAGTGCCTATGCAAATCTTCTCTGACTTGGATTCTATACGGAATGGTACCTGATTGTTAAGTTTTATCACAGGCACACAGGGAGCCTGGTATATTCTTATTCAACTATTCTTTTTAGGGGAAATATCATGATATTCTTTTGAAGGC
CTACCATGATTTCTTGGACAGGGGGTGATGTTCATCCTCTCCAATTTAATATACTGCCGGTGTAGTAGCAAGGGCATGTCTTAAATCATTGTTGAAAACTACTCCCATTTGGAGTTATGAAATCAACAAGCTTATCAAAGTATTAGCCACATTATTAGAGGCCTTCAATCGAGCTCATGTCATTGTATTTTAGAGGAATT
TGGGATTAAACGAGACTCCCAACAAGAAGGGGAAGTGAAATTCATTTATAAACATTTGACAATGTCAAGCCGGACATGATTCCTGATTAAAATTATTCTTTCATTAAACTTTATTATCTACAAGGTAAAAATTGCTTACTATTTTT

Intron 2 GTAAGTTTCA ... CATGGCAAAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	69.81	8	21	16
A2	80.49	4	12	21
A3	79.66	6	18	29
A4	66.67	5	7	13
A5	55.56	4	4	6
A6	75	1	2	4
A7	80.65	3	6	19
A8	66.67	1	0	4
A9	65.96	8	19	12
A10	60.78	10	17	14

>TRINITY_DN40684_c0_g1_i3 from sample A10 / Example spliced isoform

CGCACCACGTGATGACGACTTTTATTTTTTATTTTTATTTTTGTTTTTGTGGACTCGGTTCTTCCCGCCGTGACAAGCGCACAATTTAACGGAGAATGAGCCGTTCAACAGGAGGCAATTAGCACATGGCCCATACATAACACGGACTGACAATTCTTGAAACTGCTGATAACATCCAATGTCCAGATCAGTCCAGTCCG


AAGGGAGAGAGAGTCGACACGTCCAACGACGGAGCCATGGAGTACAGCGACGATGTCCATCTGCTCCAGCGCCCCCAAAACGAAGAGGTCGAGGTTCGAATCTCAAAAATTGGCTTAGATATTAGCAGTTACGATGGATCAAGGAATGCAGAAATAAGTTCTTCAAAGCTTTTCGTGATTATCTTGACCCTAGCTGCTGG
AATAAGCGGATTCCTCTTTGGATACGATACCGGTGGGACAGACCACAGTGCGAACG

>TRINITY_DN40684_c0_g1_i1 from sample A10 / Example unspliced isoform:

CGCACCACGTGATGACGACTTTTATTTTTTATTTTTATTTTTGTTTTTGTGGACTCGGTTCTTCCCGCCGTGACAAGCGCACAATTTAACGGAGAATGAGCCGTTCAACAGGAGGCAATTAGCACATGGCCCATACATAACACGGACTGACAATTCTTGAAACTGCTGATAACATCCAATGTCCAGATCAGTCCAGTCCG


gtaagtttcagggggctgctggttaaaagctgataaatcacacggaagaaacgttctgaaagagtttttttttttctttatttatcatggcaaagAAGGGAGAGAGAGTCGACACGTCCAACGACGGAGCCATGGAGTACAGCGACGATGTCCATCTGCTCCAGCGCCCCCAAAACGAAGAGGTCGAGGTTCGAATCTCA
AAAATTGGCTTAGATATTAGCAGTTACGATGGATCAAGGAATGCAGAAATAAGTTCTTCAAAGCTTTTCGTGATTATCTTGACCCTAGCTGCTGGAATAAGCGGATTCCTCTTTGGATACGATACCGGAGTTATTTCTGGGGCTCTACTTTATATTCGTGAAGATTTTGACACTGTAGACAAGAGCACAGTTCTTCAGGA
GACCATTGTGAGCACAGCTATAGGTGGAGCTGCATTGGGAGCAGCTTTGGGAGGTAAAACCTGTGATCGTTTTGGAAGGAAAATGAGCATGCTCATTGCAGATGTTATTTTCCTTTTGGGTTCCCTGCTTATGGCAGCAGCTCCATCTCCATCAGTTTTAATTTGCGGCAGGGTGATGGTTGGTCTTGGCATTGGTATTG
CTTCAATGGCAGCCCCCTTGTATATTGCGGAAACTTCGCCATCTCATATTCGAGGAGCACTCGTTAGCATAAATACTCTTATGGTCACCTTTGGCCAGTTTGTCTCCTATCTCGTAAATTATGGATTTACACAGGTTCCAGGAACATGGCGCTGGATGTTAGGAATGGCTGGTGTACCTGCAGTGCTTCAAATAGTCATA
TTTACATGTTTGCCAGAATCTCCCCGATGGCTTATAAGAAATGGAAATGTTGATGATGCTATTCCTATTTTTAAAAGAATTTATCCTCCAGAGCAATTGAAGACTGAATTGGAGGAAATTATGGATGCATCAGAGACTGAATCTGGTCCTGATGGAGTTCCAAAGGATGTAAGCATTGGTGATATATTGGGTTCAAAAGA
GATGAGGCTAGCACTAATAGCAGGTGTTGGAATGCAGATTTTTCAGCAGTTAGTGGGTATTAATACTGTGATGTATTATAGCCCATCTATCATGGAGCTGGCAGGATTTGCCTCTCATAGGACAGCATTAATGCTGTCATTAGTTGTTGCTGGTGTGAATGTATTGGGCACAATTGCTGGCATCCTACTGATAGACAATT
CAGGAAGAAGGCGGCTTGCTCTATCCAGCTTGATTGGTGTAACAGGAGCCTTACTTTTGTTATCAGTGGGGTTCTTCATGACCACTACTGACTCGCCCGGTGTCATAAGACCAGAGGATACTTTCAGAGGAGAACTTTTATGCTCAGCCATGCAGACCAAGCAAAGTATATCTAGATCTCTCTCTTGCCTTGACTGCTTG
CATGCAGCATGTGGCTTTTGTGCTGCTCCTGAAAATAAGATGGAACCAGGTAGCTGTTTAATTTACAATGCAACTGTCGCTGGTATCTGCACTAGTAGTTCTAGATCATGGTATACACAAGCTTGCCCAAGCCAGTACGGCTGGTTAGCATTGGTTGGCCTTGTATTGTACATTGTGGCATTTTCCCCTGGAATGGGGCC
AGTTCCTTGGACTGTCAATTCTGAGATTTACCCTGCACAATATAGGAGTGTGTGTGGAGGAATCGCAGCAACTGCAAATTGGATTTCAAATCTTCTTGTTGCGCAGTCGTTCCTATCACTGACACGTTTATTAGGAACATCTGGGACATTTTTCCTGTTTACATGCGTGTCTGTGCTGGCTATCATTTTTGTCTTTGTAA
CTATTCCAGAAACAAAGGGACTATCCTTTGAAGAGGTGGCAGCATTGTGGGAGGAAAGAGCAAAGAATACAAAGGCATGGTTTCCATGGACAACTGATAGGCTTCAGTATTCTCGTGCTAGTGAAAAGTCAGTGCCTATGCAAATCTTCTCTGACTTGGATTCTATACGGAATGGTACCTGATTGTTAAGTTTTATCACA
GGCACACAGGGAGCCTGGTATATTCTTATTCAACTATTCTTTTTAGGGGAAATATCATGATATTCTTTTGAAGGCCTACCATGATTTCTTGGACAGGGGGTGATGTTCATCCTCTCCAATTTAATATACTGCCGGTGTAGTAGCAAGGGCATGTCTTAAATCATTGTTGAAAACTACTCCCATTTGGAGTTATGAAATCA
ACAAGCTTATCAAAGTATTAGCCACATTATTAGAGGCCTTCAATCGAGCTCATGTCATTGTATTTTAGAGGAATTTGGGATTAAACGAGACTCCCAACAAGAAGGGGAAGTGAAATTCATTTATAAACATTTGACAATGTCAAGCCGGACATGATTCCTGC