sp|F4KGU4|DEAHC_ARATH ----> ATP-dependent RNA helicase DEAH12, chloroplastic
Intron 1 GTTTGTATGA ... AATGTTCCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 62.79 | 24 | 40 | 41 |
| A2 | 64.52 | 22 | 33 | 47 |
| A3 | 63.01 | 27 | 43 | 49 |
| A4 | 86.05 | 6 | 38 | 36 |
| A5 | 68.7 | 18 | 38 | 41 |
| A6 | 64.71 | 3 | 4 | 7 |
| A7 | 71.43 | 2 | 5 | 5 |
| A8 | -1 | 0 | 0 | 0 |
| A9 | 33.33 | 2 | 0 | 2 |
| A10 | 55.56 | 2 | 2 | 3 |
>TRINITY_DN116459_c0_g1_i5 from sample A1 / Example spliced isoformGAAACTTGAGCAGAAAGAGTTAAAAACGCATCTCCAGGTGTCGTGATGACAACGAACATCGGCAATACCCGCCACTGGAGTTAAAACCATAGCAAGGATGGTATAAATTCAATTCAGTGGATCTACGAGACCGGATCGGACAGGGCGTGACAACCCTTTGAAATTCACCTCGTGCATAGAAGAAACTTGTGTGTCTGCCA
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GGAGAGTGCAAAGGATGCTATGGAGGCATACAGTCTGTTAATTGTTGCACTACATACACTCCCAGAGAGCGTTCATTAGCAAAGGTTAACTATATGACTGACCATGTACTCCTTCAACTATGTATGTCAGATTCAGAGTTGTCAGATATCAGCTGTATCATAGTAGATGAAGCTCATGAGCGCAGCTTAAGCACAGACCT
TCTTTTAGCACTGCTTAAAAGATGCTTGCTCAAGAGACCAGAGTTGAGGCTTATCATAATGTCTGCAACAGCAGATGCACATACATTGTCAGATTATTTTGGTGGTTGCAGCATTTTCTATGTAACTGGAAGAAATTTTCCTGTAGATATTAAGTACATTGCAAGGGATGATGCAGAAGCTTCACAAAACTCTGCTGTGA
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TGTAGGTTTGGTACAGAGGCAGAAAAATCAAAGTCTGACTGTTTAAAACTTCGTTTCTGTCATCCAGATGGAGACCTTTTTACTCTTCTTTCAGTTTACAAGGAGTGGGAGGATAAACAAAAATTCAGTAGGAACAAATGGTGCTGGGAAAATAGCATCAATGCCAAATCCATGGTGAGATGTAAAGATGCTATAACAGA
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ATTTGTCCGATCTGCTTCTGTGAGATTGAAGACTGCTACAGACTTGAAGGATGTGGCCATGCCTTTTGCAGAGCATGCCTAGTAGGGCAGTGTAACACAGCCATTCGTCATCATGATGGCTTCCCTCTTGTTTGTGCTCATGAAGATTGCAACGCTTTGTTCTTAATTGCTGATCTAAAATCCTTAATCTCCAGTGAGGC
ACTGGATGACTTATTTAGAGCTTCCCTTGGGGCCTTTGTAGCTTCTAGTAAAGGTACCTACAGATTCTGCACCACCCCAGATTGTCCATCCATATACGAGGTGTCAACTTCTGGCAGACTCTTTGTTTGTGGCAGTTGTTCGGTGGAGTTGTGTACAACCTGTCATCTAGAGTATCATCCATACCTGTCATGTGAAGAAT
ATAGAGAATTCAAGCAAGATCCTGATGCCTCTCTCAAAGAGTGGTGCAAAGGCAAAGATGATGTTAAAAGGTGTCCTGGTTGTGGGTTCACAATTGAAAAAAGTGAAGGCTGCAATCACATCAGTTGTAAGTGTGGTAAACATATTTGTTGGGTATGTCTAGACTCCTTTGACAGCAGTGACAGTTGTTATAGCCATTTG
CGTGCTGTACATGGTGGTTACTAATTGCAAACTCTCTTTTTCTCACTCA
>TRINITY_DN116459_c0_g1_i3 from sample A1 / Example unspliced isoform:GAAACTTGAGCAGAAAGAGTTAAAAACGCATCTCCAGGTGTCGTGATGACAACGAACATCGGCAATACCCGCCACTGGAGTTAAAACCATAGCAAGGATGGTATAAATTCAATTCAGTGGATCTACGAGACCGGATCGGACAGGGCGTGACAACCCTTTGAAATTCACCTCGTGCATAGAAGAAACTTGTGTGTCTGCCA
CACAATCTCGAGTCTACTTTCAGCATAGTGCGAGGTTTTAAAGGGTTCTAAAATTGGCGAGGAGGTTAAGGTTTTAAGGATTTTCAGAGGGTTTTACGGACTCCAGAGGTCAAGGGTTTTGAAGATTCGAGTTTAAATTTGAAGATTCAAAGgtttgtatgaagattcatagttttgaagaagcaagggtttaggtttga
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CCAGTTTCTCTCAGGGAAGTGAGACTGTTTTCATGGGGAGGGATTTGTAATTCTTCCGAGAAGGTAAGAAAGTGCGACCTGAAAGGCGTCATAGAAGCGTGCCCCGAGGTTAAAGATTCGCAAGTATGTACAGGTGCAGGGCCAATGGTGGCGAAATTGTTTTTTCAAAGCTGGGAATTGGCGGTCGAAGGTATGGTTTA
TCTGTGGGAACAGCGTTTATTAGGTATCCACGGCTTCACTCCTGAAGTAATTTTTGCCCAACGGCCCCAGATTATTGAAATTGGCCGTCGATTGCGAGAGGTTTTCATGAATTATCTCAAATCGCTGCCTCAGGGGGAGGCCGCGAGAAAGTGCAAGAATGAGATCGAGGCCGTCGACAAGGAGCTCCGCAGGGCTTCGA
ATTCGAGGAAGAACCGGAATTCTCTGAAGAAGTATTTTGAGCTGGAAAGCTTGAGAGAGGGTCTCACTGTACAGAAGAATCTGCTCTATAAAAAGCTTGAGGAGTTTGAAAGGGCCCTGGAATGCTTGCAGCTGTACTTGATTCACGAAGACTGGGATGGTGGCATTGGGAATGTTGATTGTGCCGATGAGAGGCCAGTT
TTTGTTCTGGGAAAAGGCTGGACATGGAATCAATTGCATAATATTCTTCTCAGGGAGTGCAGTCGGCTCGAATCGGCGTTGCCCATGTATTCCAGCAGATGGGAAACCATTCAGCAAGTCCACATGAACCAGGTAATGGTACTGATTGGAGAGACAGGTTCTGGAAAGAGCACTCAGTTGGTGCAGTATCTTGCAGACTC
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AAACTTCTTGCTTTGGGTATCCAGGACCTTGAATCCTTTGATTTTGTTCAAGCCCCAAGCCACGAGGCAATAAGTGTAGCTGTTAAAAATTTAATCCAGTTAGGTGCAGTGGTTTGTGGCCAGAAAGGTCTAAAAAAATTAACTGATTCTGGTTTGAAGCTTGTCAAGCTGGGTGTAGAACCTCGATTAGGAAAGATTAT
TCTGGACAGCTTATCTCAGCGTTTGGGTAGGGAAGGCCTTGTACTTGCAGCTTTGATGGCAAATGCAGGAAGTATATTTTGTAGGTTTGGTACAGAGGCAGAAAAATCAAAGTCTGACTGTTTAAAACTTCGTTTCTGTCATCCAGATGGAGACCTTTTTACTCTTCTTTCAGTTTACAAGGAGTGGGAGGATAAACAAA
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GAAAACCTGGCCATGTTTTCTGGATATGACCGGCTAGGATATGATGTAGCTGCTACAGAACAGCAAGCATACTTGCATCCGTCATGCTCATTTTTAGCTTTAGGTCATAAGCCCAAATGGGTTGTTTTTGGGGAACTTTTATGCACCACAAGGCAGTTTTTGATTTGTGTGACAGCAGTAGAGGAGGATTGGGTCTCTGC
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TTAAGCATTGAAGTTTGTCATCCCAATGCACAATCTCTTGATGATAGAGAGCTCTTGTTAAAGTTTGAAAATTGTACTGGTAGCATAGCTGGTTTCCATAAATACCCAGTGGCAGGACAAGGAGAAGTTACTCGAAAATGGGGTACAATAACATTTTTCTCTCCAGAAGCAGCTCAAACAGCAGTGCATCAGCTCAGTAA
TGCAGAACTAGGAGGTTCATCTTTGTCTGTCTATCCTTTGAAGGTATCTCCTGTAATGGACCATAAGAGATCTGGATTTCCATCTGTCAAAGCAATGCTTAAATGGCCTCGGCGGCAGAGTAAGGGATTGGCTGTCATTCGGTGTGATCCTGATGATGTCGATCGAATTTCATTACTTTGCTCAGGCATGCTCATAGGAA
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CTTACTGTCTTTGTCCCTCAAGATAAGTGTGATGTAGTTGTATACAATTCAGATACTAAGGATTTCTATACACGAGCTCTAGTTACATTTGATGGTAGCATACATTTGAGGGCAGCAAGGGCATTGTCTCATCTCCAAGGAAAAGTGCTTTCCGTCTGTATGCCTTGGCAAAAGATTATCTGTCAACAAACATATTACAG
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TCTAGCTCATTCCTCGTATTATAAGATTAGCCTATAGGATCCATATGCCCCTCTTAAAAGTTAAAACATAATTATTTTTGTTTGTTTGGGAAAGTTGATGGTTATAATAATATATGAAGAAACATAATACAATGATACTGTACAAGGAAGAAATGACTCATTTCTGCCTAAAGTACAGTATAATGCCTCTAGGTCGGATT
GTACCCTGGGATCACAATCTCTCACATCTCTCCTAATGAAAATGTTTTTGAGTGTGGATGATAATAAAAGAAGAATGGATTATTGGGTAGATCACTTGCCTAAAGTTTACTACAATGACAAGCTTG