sp|Q9SZA7|DRL29_ARATH ----> Probable disease resistance protein At4g33300
Intron 1 GTGTACATAC ... ATCTATGTAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 65.96 | 16 | 30 | 32 |
| A2 | 46.48 | 19 | 13 | 20 |
| A3 | 45.83 | 13 | 14 | 8 |
| A4 | 45.76 | 16 | 11 | 16 |
| A5 | 33.33 | 13 | 8 | 5 |
| A6 | 76.47 | 2 | 2 | 11 |
| A7 | 66.67 | 2 | 5 | 3 |
| A8 | 53.85 | 3 | 5 | 2 |
| A9 | 50 | 2 | 1 | 3 |
| A10 | 77.78 | 1 | 6 | 1 |
>TRINITY_DN116216_c0_g1_i7 from sample A2 / Example spliced isoformAGGAGTACAGTTTGCCAGGAAAATGGGATCTGTTCAAGGATCAAGCATTTGATGCTCAAATAGTTTCCATATCCACATGCGGTTGATTTTAGCTGCTTGCTTAAGGTGACATGGAAGAGACTCAGTGGTGCAACATTAAATTTTGTGAGGCAGAGGCTTTAATTTTACTCTTTTATGCAAGCGAATACTTTCTTCCACCT
TTTTTGAGTTCTATGAGAAAACTTAAAGACTAAATTCCTCATAGTGTTCAATTATGGGTCCAAGAGAGAGGCTCACCATTATGTATTCATGGAGAATTTGAGGTTTTATCCACACAAAACCCTTCAAAAGTAAGAAAACTTACTTTGCTAAAGCTTTTCCTATTTCTAACTTAACTCATTAACCAGAAACAACCAAGGTC
CCATTGCATTTCCATTGTGAAAAGTTGAAAATGTTCTTCACCCAAAACACTGACAAAGATTTTGTATGTATGGCCTACCCTCTCTTTGGGCCCTGGGATATGCAGAGGTGAATTAATCCTTTTTTAATATTCACTTGTTTTTAGAGTATGTGACTTGGAGCATGCCATAGGTCACAAGAACTTAGACTTTTTACATATTA
TGAAAATTGTGGACCTTCCAAGCCATGGAGTGAATGTGGGCACACACCTAATAATTGTTGAGTTATGCTTGAGCCCCAATT
>TRINITY_DN116216_c0_g1_i8 from sample A2 / Example unspliced isoform:AGGAGTACAGTTTGCCAGGAAAATGGGATCTGTTCAAGGATCAAGCATTTGATGCTCAAATAGTTTCCATATCCACATGCGGTTGATTTTAGCTGCTTGCTTAAGgtgtacatacttattttcttcaaaacatttatagtcaaaagtattgcattgtgaatttcttcttttctctatcccttgtgttccatgctaacaaa
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GGAAGAGACTCAGTGGTGCAACATTAAATTTTGTGAGGCAGAGGCTTTAATTTTACTCTTTTATGCAAGCGAATACTTTCTTCCACCTTTTTTGAGTTCTATGAGAAAACTTAAAGACTAAATTCCTCATAGTGTTCAATTATGGGTCCAAGAGAGAGGCTCACCATTATGTATTCATGGAGAATTTGAGGTTTTATCCA
CACAAAACCCTTCAAAAGTAAGAAAACTTACTTTGCTAAAGCTTTTCCTATTTCTAACTTAACTCATTAACCAGAAACAACCAAGGTCCCATTGCATTTCCATTGTGAAAAGTTGAAAATGTTCTTCACCCAAAACACTGACAAAGATTTTGTATGTATGGCCTACCCTCTCTTTGGGCCCTGGGATATGCAGAGGTGAA
TTAATCCTTTTTTAATATTCACTTGTTTTTAGAGTATGTGACTTGGAGCATGCCATAGGTCACAAGAACTTAGACTTTTTACATATTATGAAAATTGTGGACCTTCCAAGCCATGGAGTGAATGTGGGCACACACCTAATAATTGTTGAGTTATGCTTGAGCCCCAATT
Intron 2 GTGTACATAC ... ATCTATGTAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 60.34 | 23 | 38 | 32 |
| A2 | 42.86 | 28 | 22 | 20 |
| A3 | 40 | 24 | 24 | 8 |
| A4 | 44 | 21 | 17 | 16 |
| A5 | 34.78 | 15 | 11 | 5 |
| A6 | 58.33 | 5 | 4 | 10 |
| A7 | 57.89 | 4 | 8 | 3 |
| A8 | 44.44 | 5 | 6 | 2 |
| A9 | 42.86 | 4 | 3 | 3 |
| A10 | 77.78 | 1 | 6 | 1 |
>TRINITY_DN128129_c3_g3_i4 from sample A1 / Example spliced isoformATGTGAATGCTTAAATCTGCTGAATTTAACAAGCAATCTCAGGAGTCCAGTAATCAATTATGGAAGTGCCTTTGAGCTGTACTTTTCTCAGCACAATGTAATCCGACACTTGGCCATATATTTGGCTTCCGGAGACAGTATAGTTCATAGGAAAAGGTTGCTTATGCCTAGAAAGGAGTACAGTTTGCCAGGAAAATGGG
ATCTGTTCAAGGATCAAGCATTTGATGCTCAAATAGTTTCCATATCCACATGCGGTTGATTTTAGCTGCTTGCTTAAGGTGACATGGAAGAGACTCAGTGGTGCAACATTAAATTTTGTGAGGCAGAGGCTTTAATTTTACTCTTTTATGCAAGCGAATACTTTCTTCCACCTTTTTTGAGTTCTATGAGAAAACTTAAA
GACTAAATTCCTCATAGTGTTCAATTATGGGTCCAAGAGAGCCACAGTGAATGGTCTACCAACCTTATCTTCACTCACTCAACTTAAGACTATTCACTTGGAGAGGTTACTTGTGGCTCCACTTAACAAGCATAGCGAAACCTTATTGAACTTAGAGAAGCTATCTTTGAGCTTATGTGAAGGGATTGGAAATATGTCCA
GGTTCAACAACACCCAGTCAAGCCTAAATCTTCCC
>TRINITY_DN128129_c3_g3_i6 from sample A1 / Example unspliced isoform:AATCTCAGGAGTCCAGTAATCAATTATGGAAGTGCCTTTGAGCTGTACTTTTCTCAGCACAATGTAATCCGACACTTGGCCATATATTTGGCTTCCGGAGACAGTATAGTTCATAGGAAAAGGTTGCTTATGCCTAGAAAGGAGTACAGTTTGCCAGGAAAATGGGATCTGTTCAAGGATCAAGCATTTGATGCTCAAAT
AGTTTCCATATCCACATGCGGTTGATTTTAGCTGCTTGCTTAAGgtgtacatacttattttcctcaaaacatttatggtcaaaagtattgcattgtgaaattcttcttttctctatctatttcatgctaacaaagaattttaaccaacaaagggcacatgcagactgtcatggaccaggcctagaaaccatagagccttc
tgaagaaaatcttatgggtatctttataacgaaatggttattttttaagcatttcctttgaaattgcaccttccaatcaccaaattctctataagtttctcctaattattttacttttaatatcagaattttatgttttactcaaactatatatgtattatgaactaattaataatgtaccatggatacttttattgtct
acttttcttttagacagaacactgtgctttgctacttatctgtgtcaagcaattaacttcatagaaaaccatttatttttgttgaacaatcaccatatacaccatatccattcacatagtttgttctctgagattttatgtgcatgtcacaggggaatcttaccctatacccaacaattgatcactacgtgacctgcaaa
aactaatcacaaacaaatttgtagttgttgtccattgatgtcaaagatcttagaaaatgttttcacagtatgtccaataacctataatgttctaactaaacttttcatttgtggtttatctatgtagGTGACATGGAAGAGACTCAGTGGTGCAACATTAAATTTTGTGAGGCAGAGGCTTTAATTTTACTCTTTTATGC
AAGCGAATACTTTCTTCCACCTTTTTTGAGTTCTATGAGAAAACTTAAAGACTAAATTCCTCATAGTGTTCAATTATGGGTCCAAGAGAGCCACAGTGAATGGTCTACCAACCTTATCTTCACTCACTCAACTTAAGACTATTCACTTGGAGAGGTTACTTGTGGCTCCACTTAACAAGCATAGCGAAACCTTATTGAAC
TTAGAGAAGCTATCTTTGAGCTTATGTGAAGGGATTGGAAATATGTCCAGGTTCAACAACACCCAGTCAAGCCTAAATCTTCCC