sp|Q8RUF8|NILP3_ARATH ----> Omega-amidase, chloroplastic
Intron 1 GTACGTCCGT ... TTGCATGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 17.96 | 137 | 0 | 30 |
| A2 | 23.26 | 99 | 0 | 30 |
| A3 | 19.41 | 137 | 0 | 33 |
| A4 | 26.27 | 87 | 0 | 31 |
| A5 | 18.03 | 50 | 0 | 11 |
| A6 | 26.98 | 414 | 0 | 153 |
| A7 | 25.52 | 426 | 1 | 146 |
| A8 | 28.48 | 530 | 3 | 211 |
| A9 | 26.47 | 536 | 5 | 193 |
| A10 | 29.98 | 341 | 0 | 146 |
>TRINITY_DN40216_c0_g1_i6 from sample A9 / Example spliced isoformCAACAGTAAGTCTCTATAAGAAACTTGGAAACTTAAAACTTATATTTCTGTGTAACCGGAGTTTCATTAGTATCATTCACATTTACATTAGGAGAAACCGGAGTTAGCCCTTTTTTGGATGGATGGGGTATCTTTAGTCCATCGAGTAAACGCCAAATATCTCAATCAAGCTGATCACTATGGATCGATCTCAATCGGAG
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GCTTACCGATTTCATCCACTATAAACAACTTTGTATTCAAAGAAAATGAGAATTTCATGGTTGTAACAAATAGCCGTAGCATGCTCATATTTCTTACCTGTAAACAAGTTGAGGTATAGCCATCGGATGCTTTGACTATATCTGATAGATTGAGACTCGATTTGAATTGAACATTGAAAGCAAAAACGCACATATACTGT
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>TRINITY_DN40216_c0_g1_i3 from sample A9 / Example unspliced isoform:GCAACAGGGCAGTCGATAATCAGgtacgtccgtgttttaacaaccaagtttccatacatatactattggtttaaaacatgtatacatgatcaatgactttaagttgtatgtggtcagtgttaatattgtgtaggttttgcatgcagATCTACGTTGCTACATGTTCACCTGCTCGTGACGTAAATGCAGGCTATATTGCC
TGGGGCCACTCCACTCTTGTTGCACCGTTTGGAGAAATTGTTGCAACAACGGAGCATGAAGAAGCAACAATCATAGCAGATATTGACTATTCGCGAATAGAGGAAAGAAGGATGAATATGCCACTCGAAAAGCAGCGACATGGTGATTTGTATCAACTCGTTGACATTAGCAGGTTGGACACAGAAAAACATTGATCACG
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