NA ----> NA
Intron 1 GTGGGATCTC ... GTTGAATCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 70.59 | 5 | 12 | 12 |
| A2 | 75 | 3 | 9 | 9 |
| A3 | 54.55 | 5 | 3 | 9 |
| A4 | 100 | 0 | 2 | 7 |
| A5 | 76.47 | 2 | 7 | 6 |
| A6 | 80 | 1 | 4 | 4 |
| A7 | 56.52 | 5 | 9 | 4 |
| A8 | 85.71 | 1 | 6 | 6 |
| A9 | 41.18 | 5 | 1 | 6 |
| A10 | 64.71 | 3 | 3 | 8 |
>TRINITY_DN91636_c0_g1_i1 from sample A3 / Example spliced isoformGTTCAACTTGCTTGAAGAGAAGCTGTATTGCAGCTTCACGGTTAATGGAGCTTCTTCGCAACATTCTAAAAACAGGCCAGTTTATAACTGATGAGTGTGCAGATGTCTATTTACATATTGCAGATACATACATTGTGGATGTGGCTTGGATTCTCTTACATAAGCTTTCTCTGGAAGAAACTGTTTCTACTTTGAATTCT
TCGAGTGAGATTCATCCACTCTCTCTAAGAAACAAAGAGCATCATTATGTGGAAAAGGAACTTGTTTTAGGGTCTTTACTTCAGATTCTTTGCTCCTTGGTCCATGTTATTGTTTCAAAGAATGGTGAAGTGGAAGGAGGGAATCTTTTAAATCAATGGCCTATGGTAGCAAAAGTTAATGAACTGATTCCAGCACTTTC
AGTTCAAGGTCTTGCTCCACATAGTCACTCAGGACATGATTGCATTTCAGATTTCCTGCGCCATAAGCTTTTGATGTTAATGATCAGGATTAGTGATTGCTTTCTACAGAAGCCTTGTACTTTCATCCTATGGTTGGACTTGCTTTGGAAACATGCTGCAGATCTCCTTGGTTACTCATTACCTGAAAGAAAAATCCACG
AGATCGCTTTGGTGGTCAAAGGGCTGTTGCAGCTCTAAAAGATTGGCTGCTGAGGCAGATTTCCTGTTTATCAGATTTTACTGGTGATGTTTTCAGAAACAGATGCAACAAGTTCACGTCATCCTTTTTGCAGTTGTTTATGGATGAGGATGATCTCATGTTTGAAATGTTGCTGCAACTTTTGAATATGCCAGTACCTT
TGCGACAAGTGCTATGTGGTGGAGACAAGATCTTTGATAAGAAAGTATTCATGGAGGCTTGCTTAGAAGCATTGAAGCCACATCTCCTTTTCTATGAACTCTTAGCAGGGATACAATATGATCACTCTGTACTTGTTGATTACCTCATTTCAAAGAGTACAGGAATCTTGTGTTTGCGGTATCTTTTGAGGTGTTTAAGA
GTTATCTGTGATTTGTGGCCTGATTCTATTGAATTCTTACTTGATATAGGTGATCCCAGCCTTTCTAGTAACAAGAGAAGGCGACACCAGCTGGCGGCCTTAAAAGAGCCTTTAGAAAGGCATCGATCAAGTATGTTGGACATATCTAGTTTATCAACAGTTGCTTCAGACATTTCTCATATTTCTGTACCAAGCAAAGT
TGAGTTAGAATCGGGACAAACATTATGCAAAAGAAAAGGAGCAGTGCAGCTTTCTCCTACGTCTAGTGTCATCAATGATGATTTGAGATTTGAAAATGTTCAGAGATGTTTGTCATCTTTGCATGATGCTATTGAGAGTCTTCATAATAAGGGCTTGTTTCC
>TRINITY_DN91636_c0_g1_i2 from sample A3 / Example unspliced isoform:GTTCAACTTGCTTGAAGAGAAGCTGTATTGCAGCTTCACGGTTAATGGAGCTTCTTCGCAACATTCTAAAAACAGGCCAGTTTATAACTGATGAGTGTGCAGATGTCTATTTACATATTGCAGATACATACATTGTGGATGTGGCTTGGATTCTCTTACATAAGCTTTCTCTGGAAGAAACTGTTTCTACTTTGAATTCT
TCGAGTGAGATTCATCCACTCTCTCTAAGAAACAAAGAGCATCATTATGTGGAAAAGGAACTTGTTTTAGGGTCTTTACTTCAGATTCTTTGCTCCTTGGTCCATGTTATTGTTTCAAAGAATGGTGAAGTGGAAGGAGGGAATCTTTTAAATCAATGGCCTATGGTAGCAAAAGTTAATGAACTGATTCCAGCACTTTC
AGTTCAAGGTCTTGCTCCACATAGTCACTCAGGACATGATTGCATTTCAGATTTCCTGCGCCATAAGCTTTTGATGTTAATGATCAGGATTAGTGATTGCTTTCTACAGAAGCCTTGTACTTTCATCCTATGGTTGGACTTGCTTTGGAAACATGCTGCAGATCTCCTTGGTTACTCATTACCTGAAAGAAAAATCCACG
AGATCGCTTTGgtgggatctccgttttggacctctttaaatcattgcaacaaagactctatgatctgcaaaattcatttgcagaatcgtgctgtctatttgctgtttaaatgttctttaattctaataaaaaatgatttggaaagtcccagaggaattggttcttttgatggttctcatttggcatcagagtatgaaaag
tctgttcttcagctgaatcttaaagttgaatcagGTGGTCAAAGGGCTGTTGCAGCTCTAAAAGATTGGCTGCTGAGGCAGATTTCCTGTTTATCAGATTTTACTGGTGATGTTTTCAGAAACAGATGCAACAAGTTCACGTCATCCTTTTTGCAGTTGTTTATGGATGAGGATGATCTCATGTTTGAAATGTTGCTGCA
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GGTATCTTTTGAGGTGTTTAAGAGTTATCTGTGATTTGTGGCCTGATTCTATTGAATTCTTACTTGATATAGGTGATCCCAGCCTTTCTAGTAACAAGAGAAGGCGACACCAGCTGGCGGCCTTAAAAGAGCCTTTAGAAAGGCATCGATCAAGTATGTTGGACATATCTAGTTTATCAACAGTTGCTTCAGACATTTCT
CATATTTCTGTACCAAGCAAAGTTGAGTTAGAATCGGGACAAACATTATGCAAAAGAAAAGGAGCAGTGCAGCTTTCTCCTACGTCTAGTGTCATCAATGATGATTTGAGATTTGAAAATGTTCAGAGATGTTTGTCATCTTTGCATGATGCTATTGAGAGTCTTCATAATAAGGGCTTGTTTCC