NA ----> NA

Intron 1 GTAAGGCATT ... GTTTATTCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	24.27	78	38	12
A2	24.42	65	29	13
A3	18.48	75	29	5
A4	29.52	37	18	13
A5	28	18	7	7
A6	6.4	139	14	5
A7	2.67	292	12	4
A8	2.48	373	17	2
A9	5.68	241	23	6
A10	3.04	335	19	2

>TRINITY_DN110950_c6_g1_i1 from sample A5 / Example spliced isoform

CTTGGTTATGTTTTGTTTAATTGAGTTTGTTTCTTTATGTTTTGGGTCTGTATTTGGATTGTGAGGGTGGAGTCATAAGGTGAGGCAGTAATTAACCGTAGATCATATGACCAGGTGTTTCTCAGCATCCCAAATACCATATGATGCCCTCGAATTTCAAGGCGATACATGAAGCAACCATACATGCTCCTTCAGATACT
CTTGAATTTCAAGATTTCAGGTGAGTGTTTAAGTTCTGTTGGTGTAGTCTTAAATCCACATTGGCTGCAGTTTTTACTTTTTACTTTTTTCCCTCTTCTTCATATTCTTATTTCATCTAGGGTTTGGTAAATTTTAATGATATT

>TRINITY_DN110950_c6_g1_i2 from sample A5 / Example unspliced isoform:

CTTGGTTATGTTTTGTTTAATTGAGTTTGTTTCTTTATGTTTTGGGTCTGTATTTGGATTGTGAGGGTGGAGTCATAAGGTGAGGCAGTAATTAACCGTAGATCATATGACCAGGTGTTTCTCAGCATCCCAAATACCATATGgtaaggcatttgcttttaatttctggtaatgtgctcatgcgatgtattgtcttgtat
tgttaatttttttggggtttattcagATGCCCTCGAATTTCAAGGCGATACATGAAGCAACCATACATGCTCCTTCAGATACTCTTGAATTTCAAGATTTCAGGTGAGTGTTTAAGTTCTGTTGGTGTAGTCTTAAATCCACATTGGCTGCAGTTTTTACTTTTTACTTTTTTCCCTCTTCTTCATATTCTTATTTCATC
TAGGGTTTGGTAAATTTTAATGATATTCAGTGATGGCTTTAGCGAGGAAATGTTAGATAATTTGGATTGTAAGATAATTTGCTGTTTTCTTGTTTTTAAGATTTTCGGTTAGATTTACATTCTGAAGTACTCTGAACAGTTTAGTTTAGTTTAGATCTCCGGTGGAGAATAAGTGTAGTTCTCTGATTTTAGGTCTAATT
TAGAATCCTCTACTGTTTCTTTTTCTAATTTGGTAATTTTTTAATAATCTTCAGCGATGGCTGTGGCGATGGGAGGTTAGATTAGGCTTTAGCGATGATCTTTAGTGATGAGAGGTTAGAGGTTAGATGAGAGGTTAGATGGTTAGATTAGGCTTTAATTATCTTCAGTGATTGTAGTTCCACTTCTGAAGACCTTGCAC
GTTCCTGTGACTATCATCTCGTTCAGTGCTAGCTTTCACGGCAGCTTACCCGCCAGCTTTCATTGCAGCTTCCCTGCGAGCTTTCACGGCAGCTTCCCCGCCAGCTTCCCTCCAATATTCCGACAATATTCCCGACAATATTCCCATCTCGCTTATTATTCCCAAGATTATTATTCCCATCTCGCTTATTATTCCCAAGA
TCAGATGCGGGTCTTGCGCTCCCGCCTCTATTTATGATTATAGGTTGGGATTTAGAATTGTGTACCAGTCTTTTGAGTTTATAATGTCTATTAAAGTTTTTAAGCCGGTATTATGAGTTTGAGTTTATAAGGTTTAACAATGCGATAAATATTTATGATAAATTTTTTATTTCTTAGTTTTTTTTTTAAATTTTATTATA
AATTATTTTTGGGGTA