NA ----> NA

Intron 1 GTACTTCTCT ... AACGCCTCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	45.45	3	3	2
A2	71.8	4.3	9	13
A3	51.85	13	20	8
A4	100	0	1	2
A5	36.03	10.7	10	2
A6	62.02	45.8	87	62.7
A7	55.55	35.3	60	28.3
A8	62.19	25.8	53	32
A9	51.55	41.8	55	34
A10	64.67	16.7	34	27

>TRINITY_DN120822_c1_g2_i2 from sample A3 / Example spliced isoform

GTTTGAAGAGTGTTTCCTGCCTGCTGTAACGGACTCTGCGTTGGATTGCTTGCTTTCTTTCTTTCTGACTGTCGTATAATCGCATGTCATGTCATGTCAGAGAAGATATTTAATCTTTGAATTGTTGACCAGCGGGCCATTGATTCAAGACTGGCTTTTCCTGGGGGAACTGCCTATTTCAACATTGAATCTGGCTATCG
AATCTGAGATCTCCATCGCTGGTGGGTGATGCCCCTGAAGAATCCAGTCGCCGATGCATTCGGTGCACTTATGTTGGGTTTAGTGCTGCTCTTCGTCCTGTCAGGGTTCTGCTGCTTGGGCTATGTTTTGTATTTTCGATCACAGACACGCAGAGAAAATCTTCACAAGTTTCGTGAATTTAATTCCCCATGGATGATTC
GGACAGTACTGATCCTGTTCCAAATCCTGTGTGTTCTGGGCGAATTGTCGAGGATTCGTTTGTTTAGAACCCATTGGTTTCTGCACTCATTGAGCTTGAAATGGCAGGAAAATATATGTAGATTTCATTTAATAGTCTTTTTGGGTTTTACAGAGCCGGGGTTTTTTCTCACCCTGTATTTTCTGGTACGGAGATCACTT
CGCCATGAAGCAAACAGAAGGGTGTTTACATTTGTGCTCCTTATGTGCCTGCCAACCATCATTGCACAAGTCTGCATTAATGTTATCAACCCCAGAATTGAAATTCAGAAAGAAGGCTATGGTGGAAAGATGCCCAAGTACTTCACTGCAGCAGTTTTTGAAGAAGGTAAAGTGGCATATTGTACTTATCCTTTATTGAG
TATCATAGTGCATGGAGTGTTTGTTGCTTCGTTTGTGAGTTCTTTCCTGTATATGGGCTTGAAGATCATATCTTTGGCTATCAATAAGAGCCTGGAGAGACGAGTTTGGGTAATGATATTATCAGTAGTTGTTTTTCTTCCATTGAGGGTATTGTTCTTGGGGTTCACTGTAATGTCAAAGCCTGGTGAACTGACATTTG
AAGCTCTGGCGTTCTTGGGATTCTTGGCTCTGCTTTTAAGCACTTCAGTGTGTGTGGTGATCTCGGTTCTAAGGCCTATTGCTGATTCATTAGCTGTTCACTGGATTTTTGAGTCTAGAGAATTTAGGACACAGCAGCAGCAGTTGAACATAATACCTATGGAGCCCTTTGGAAAGCCTCTTTCGAGTTTCTTGAGTGAC
GTTGATGATGATTTTTCAGTTGGTGCAAGTCAGAGTCTTCTTGCAACAGCAGTATAATTGTTGAGAAGGATTCATTTGTCACTCGTCAAAATGAAGAGCCAGTTCTATTTCTATTCTGATCGATCTGTCCTTGCATAGGAAGCGGGCCTTTTTGTAGATATCAACTGAATTCAGTTTTTCTATTTGCAGTCCTGTTTCCA
GGGCATGATTTTGATGTTGATCTGGCAAAGCTCGGGGCTCAAACATTGTTTATTAGGCACCCACATTCTCAACTGTTTCCCAGGTATGATTTTAATTTTGATCTGGCAAAGCTCAAGGCTCAATATGGGAGGTTCACTGGAATGCCTTTGATCACTGTATATATTGGGATCCTACTGTAAGGAATATATGACTGTTTCTG

AAGGATATGGATTGGGATTGTTACTCCGCTATATGAGTTCTTACTGTGACCTCTTGGTGAAAACGCCTACTAATTTTCTGGAGGATATGGACTTTTATTGTGAACGTGACGATTAGCTGATCATCCCTGGTCAGTAACAATCAAAAGGAAAAGGAATCATGTATGATAACTGTTACCCTTTACTATCACTTACAAATCTA
ATCAGATTCAAATTAATGAAGGCTTGAGTTGGCATCTTATTTTATTTTTCAGTTTGTATTTCTTTTACCAGGCAGTTGTTAAACTGCAAATTACATGTTGTATTGCTTGCTTGTCATGTTGCATAAGGCAAAGCATTACAATTTGAAGTAGGAAAATGCTCT

>TRINITY_DN120822_c1_g2_i1 from sample A3 / Example unspliced isoform:

GTTTGAAGAGTGTTTCCTGCCTGCTGTAACGGACTCTGCGTTGGATTGCTTGCTTTCTTTCTTTCTGACTGTCGTATAATCGCATGTCATGTCATGTCAGAGAAGATATTTAATCTTTGAATTGTTGACCAGCGGGCCATTGATTCAAGACTGGCTTTTCCTGGGGGAACTGCCTATTTCAACATTGAATCTGGCTATCG
AATCTGAGATCTCCATCGCTGGTGGGTGATGCCCCTGAAGAATCCAGTCGCCGATGCATTCGGTGCACTTATGTTGGGTTTAGTGCTGCTCTTCGTCCTGTCAGGGTTCTGCTGCTTGGGCTATGTTTTGTATTTTCGATCACAGACACGCAGAGAAAATCTTCACAAGTTTCGTGAATTTAATTCCCCATGGATGATTC
GGACAGTACTGATCCTGTTCCAAATCCTGTGTGTTCTGGGCGAATTGTCGAGGATTCGTTTGTTTAGAACCCATTGGTTTCTGCACTCATTGAGCTTGAAATGGCAGGAAAATATATGTAGATTTCATTTAATAGTCTTTTTGGGTTTTACAGAGCCGGGGTTTTTTCTCACCCTGTATTTTCTGGTACGGAGATCACTT
CGCCATGAAGCAAACAGAAGGGTGTTTACATTTGTGCTCCTTATGTGCCTGCCAACCATCATTGCACAAGTCTGCATTAATGTTATCAACCCCAGAATTGAAATTCAGAAAGAAGGCTATGGTGGAAAGATGCCCAAGTACTTCACTGCAGCAGTTTTTGAAGAAGGTAAAGTGGCATATTGTACTTATCCTTTATTGAG
TATCATAGTGCATGGAGTGTTTGTTGCTTCGTTTGTGAGTTCTTTCCTGTATATGGGCTTGAAGATCATATCTTTGGCTATCAATAAGAGCCTGGAGAGACGAGTTTGGGTAATGATATTATCAGTAGTTGTTTTTCTTCCATTGAGGGTATTGTTCTTGGGGTTCACTGTAATGTCAAAGCCTGGTGAACTGACATTTG
AAGCTCTGGCGTTCTTGGGATTCTTGGCTCTGCTTTTAAGCACTTCAGTGTGTGTGGTGATCTCGGTTCTAAGGCCTATTGCTGATTCATTAGCTGTTCACTGGATTTTTGAGTCTAGAGAATTTAGGACACAGCAGCAGCAGTTGAACATAATACCTATGGAGCCCTTTGGAAAGCCTCTTTCGAGTTTCTTGAGTGAC
GTTGATGATGATTTTTCAGTTGGTGCAAGTCAGAGTCTTCTTGCAACAGCAGTATAATTGTTGAGAAGGATTCATTTGTCACTCGTCAAAATGAAGAGCCAGTTCTATTTCTATTCTGATCGATCTGTCCTTGCATAGGAAGCGGGCCTTTTTGTAGATATCAACTGAATTCAGTTTTTCTATTTGCAGTCCTGTTTCCA
GGGCATGATTTTGATGTTGATCTGGCAAAGCTCGGGGCTCAAACATTGTTTATTAGGCACCCACATTCTCAACTGTTTCCCAGGTATGATTTTAATTTTGATCTGGCAAAGCTCAAGGCTCAATATGGGAGGTTCACTGGAATGCCTTTGATCACTGTATATATTGGGATCCTACTGTAAGGAATATATGACTGgtactt
ctctctctctcactctctcttctataaaactatatctttattctttgagattgtcaccctccatatgagttcttactgtgccctcttggtgaaaacgcctcagTTTCTGAAGGATATGGATTGGGATTGTTACTCCGCTATATGAGTTCTTACTGTGACCTCTTGGTGAAAACGCCTACTAATTTTCTGGAGGATATGGA
CTTTTATTGTGAACGTGACGATTAGCTGATCATCCCTGGTCAGTAACAATCAAAAGGAAAAGGAATCATGTATGATAACTGTTACCCTTTACTATCACTTACAAATCTAATCAGATTCAAATTAATGAAGGCTTGAGTTGGCATCTTATTTTATTTTTCAGTTTGTATTTCTTTTACCAGGCAGTTGTTAAACTGCAAAT
TACATGTTGTATTGCTTGCTTGTCATGTTGCATAAGGCAAAGCATTACAATTTGAAGTAGGAAAATGCTCT