NA ----> NA
Intron 1 GTACTGATAC ... TTCTCTCCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 90.12 | 8 | 20 | 73 |
| A2 | 98.46 | 1 | 16 | 64 |
| A3 | 96 | 5 | 50 | 120 |
| A4 | 90 | 8 | 17 | 72 |
| A5 | 89.39 | 7 | 17 | 59 |
| A6 | 94.57 | 5 | 31 | 87 |
| A7 | 89.16 | 22 | 50 | 181 |
| A8 | 92.31 | 9 | 37 | 108 |
| A9 | 92.27 | 17 | 48 | 203 |
| A10 | 95 | 9 | 77 | 171 |
>TRINITY_DN46525_c1_g2_i11 from sample A7 / Example spliced isoformACAAAATCTGCCATTGATAGACGTCAAGATTTCGTGCAAGCACGCCGTTTCCGGCGTCCATCCCTATAAATTCCCTTCCGCCATTCCGCTTGTGCAATAGACGAAAGTATTCTCTCCTGTACATATGTCGCTCGATTGAATTCCAGCAAGTTCACGGTCTCGATTTTTCTTCAGGGGGGCGAGGGTTATTGTTCGGGGGA
ATTCAAAATGCCTGCAGTGTACTGGGGATGCGTTCGAATCCCCAGCGAGATGTGCCAGGGTTCGTTCTTCCACGGGGCCGTTTCGTCTCATCGTCTGAAACATTGGAAGGGTAATATTAGTACTAGTTGACCTTCTAAGTCAATTTATTGAAAAGAACACGCGGATCCTTCGGTTTTTGCAAAATATTTACAGAAAAGAG
CTTTTGTGGTTTCCCCACCAAAATCTTAACCATTTTTGCCCCTTCAAAAGTCTACGCCACGCTTCTAGCCTTCCGGAGTTTGGGTTTCGTCCGATCTGATCCGGTTTCTGGTTCTTGTGAATTTACCGAGGTTCGATAATTGGCAGATATTGAATTCCGAGAGTTATTGGGGTTTTCATATCAATCAGTTTCACAGTAAT
GGTGGGTTTACTGTTTACTGATACTATATAAGCGTGCGGGTTACACTTGATTGTGAATTGGGATCCGGATTTTCGGCTGGATATAGTTTATTATTGCGTTTTATCAGGCGGTAATTTGAACATTGAGGAGCATTCTGAACTGCAAGTTCAATTTCCAAAGGAGCTTTGTATTGTAGATGAAAGAAAAAATAACAATGCAA
ATGCCAGAATGAAAGATATGTGTATTAATGCACAAAGTGCCACAAGCAATCCTGTTGAAGAAGGTTTTAAGGCAGATAATATGGTGGTTAGCATTGACATTGTACATTTAGAGAATTTTCCAGTAGAAGAGCTGCAGCATGCTTTTGAAGCAGGTTTGCATATTGATGGTGTAGAAAAGCAAGACTGTAATGACAATCAG
AATCAGATGGTTCACCTGGTTTCATGCAAAGATGAGAAAAAAGAAGTGCGCAAAGGATCACCTCAAACTCCCAAAGGATCCCCTCAAACGCCCAGACTAAATTCTGCTGTCAGTGATGAACAATCAAGAATGGAACATAAAAAACCTTTTGTAGATTCAGCAGAGTTGGTGATGTGCCAGACTTTGTCAGAGTGTGTGAG
CTTTCCATGTTCTGTGCAGCTATCTCCGTCACCCACTGGCAAGCCTAACGAGAGAGCTGAGACGACTGAGAATGTGATTGTCGGTGGTGAGCAATCTCTTGAAGAGAAGAATACAGTTTCTAGTCAGACAAGTTCTCTTCCATCTTCTTTCAAAATAATATCAGCAATGCGAGGAGGTCAGGAACAGAATGGTTTGGGCC
CTAGACCCAAGCTTTCTGTGAAATGGGCACCTGATGTTCAAGAACCTCAGATCAGTTCTGTTTCTCATACTGTTAAAAATAATCGGTGGCACCAATCAAAAAAGAAGGATCGCAAACACAAGCACAAAGGGAAATCAAGTCATGCAAGTGGAAGCAATAAAAATGACAAGAAACATCATTCCAAGCGAAGCTACAATACC
GAGATTGGTCGTTCAAGATTGTGGTCTTCATCATATGAGAAGAAAATGCTGCTAGATGTTTGGGCTTCCAGAAACTCTATGTTAGTGCTTGATAAAACTATTGGTTGGGAGACTCCTATGTTCAGAATGAAGATGGAAGAGGATGATGTTATGCTCAATATGCCTTCCAAGCATTCATGTGGGAAAGGGCACAGCGATTT
TTTAATGAAAGGTTCGTCAGATGCAGAATTTCCATCTCAAGGTTTCAAATGTGCCAGTCACCTTGGGCACACTCTTCAGAATAAACACATAACATATGCTGAGGCTGCATGAAAAAAAGCATTTAGGTGGATCTTCTCATCCTTCTGATGGATGTTCTGATCACAGGCTGTTCAGTTTATATTGTTATTTTGTAGATGGA
TCTCTTTTACTTGATGTGATCTGAGATGTCAACGAGAGATTGCTTATTTACATCTTAGCGATGTATAGAATGTCAATGGACTATGTTGCTTTCAATATGTTTGTGACTCGGAATTCATATAATGCTGTTTAGGTTTGATAAGCCTTGTTTCGAGATCATGCATATCAATTGAGAATGATCATATTTTTTTCCATGAAAAA
AACATGACGAGAGTGATCACATTTGTATGTGGCAAAGGGACGATTGTTTTACAACTATATGTATTTATCTTTTTGTTAGTGTCATATTTTGTGGCATAGAAAGTATGTTAATCACAATGAAAGAGGTGAAGTTCTTGTCGTGTATTAAACTGATTTCTATAGTGGTTACGCTGTCAAGAAAGCCGCATAGGGAATAAGAT
ATAGGGGGTGAAACTAATGCTCCAGTGAGACTTCTTGCGTTCCCCGAGGCAAGAGTGTGAGGACCGTTGGAAGTCTCGCTGGTGCTTAATGTTCACCAGATAGAGGGTGCCAGCTCTGAAAAAGGCTTCGTTCTCTAAGAAAATGACTCATCAATATATGTACCTTTTAATTAGAATCCAGGAATAGCATTACGGATGCA
TGCATCTTCTCTACAGTCCGGTGGGGGTATCAAGGTCAAAAATACATTCTAATTCATGTGTTCTATGTAGATTGGTTTATTAGTTCATTATTGTTAATAACATACACCAATGATTATACAATAATCTAGGAAAGTCTGAAATTTTCATATTTAAATATCTATACATATATCAATTGAAAAGTGAGATTATTG
>TRINITY_DN46525_c1_g2_i2 from sample A7 / Example unspliced isoform:ACAAAATCTGCCATTGATAGACGTCAAGATTTCGTGCAAGCACGCCGTTTCCGGCGTCCATCCCTATAAATTCCCTTCCGCCATTCCGCTTGTGCAATAGACGAAAGTAGTCTCTCCTGTACATATgtactgatactaatttttcgttttatagagccttcgtctgcatcgtcatgggctgaatctacgccctccctctc
cagaattctgccctgttgcaaattgtttaatccaagttttcatttctctccagGTCGCTCGATTGAATTCCAGCAAGTTCACGGTCTCGATTTTTCTTCAGGGGGGCGAGGGTTATTGTTCGGGGGAATTCAAAATGCCTGCAGTGTACTGGGGATGCGTTCGAATCCCCAGCGAGATGTGCCAGGGTTCGTTCTTCCAC
GGGGCCGTTTCGTCTCATCGTCTGAAACATTGGAAGGGTAATATTAGTACTAGTTGACCTTCTAAGTCAATTTATTGAAAAGAACACGCGGATCCTTCGGTTTTTGCAAAATATTTACAGAAAAGAGCTTTTGTGGTTTCCCCACCAAAATCTTAACCATTTTTGCCCCTTCAAAAGTCTACGCCACGCTTCTAGCCTTC
CGGAGTTTGGGTTTCGTCCGATCTGATCCGGTTTCTGGTTCTTGTGAATTTACCGAGGTTCGATAATTGGCAGATATTGAATTCCGAGAGTTATTGGGGTTTTCATATCAATCAGTTTCACAGTAATGGTGGGTTTACTGTTTACTGATACTATATAAGCGTGCGGGTTACACTTGATTGTGAATTGGGATCCGGATTTT
CGGCTGGATATAGTTTATTATTGCGTTTTATCAGTTTGATAAGTCCTAGATACAAATTTTCAAGTGAGTTATTCGATGGATGTTTCTGAGAATCAGAGTAGTCTTTTGTCTCTTGAAGGCGGTAATTTGAACATTGAGGAGCATTCTGAACTGCAAGTTCAATTTCCAAAGGAGCTTTGTATTGTAGATGAAAGAAAAAA
TAACAATGCAAATGCCAGAATGAAAGATATGTGTATTAATGCACAAAGTGCCACAAGCAATCCTGTTGAAGAAGGTTTTAAGGCAGATAATATGGTGGTTAGCATTGACATTGTACATTTAGAGAATTTTCCAGTAGAAGAGCTGCAGCATGCTTTTGAAGCAGGTTTGCATATTGATGGTGTAGAAAAGCAAGACTGTA
ATGACAATCAGAATCAGATGGTTCACCTGGTTTCATGCAAAGATGAGAAAAAAGAAGTGCGCAAAGGATCACCTCAAACTCCCAAAGGATCCCCTCAAACGCCCAGACTAAATTCTGCTGTCAGTGATGAACAATCAAGAATGGAACATAAAAAACCTTTTGTAGATTCAGCAGAGTTGGTGATGTGCCAGACTTTGTCA
GAGTGTGTGAGCTTTCCATGTTCTGTGCAGCTATCTCCGTCACCCACTGGCAAGCCTAACGAGAGAGCTGAGACGACTGAGAATGTGATTGTCGGTGGTGAGCAATCTCTTGAAGAGAAGAATACAGTTTCTAGTCAGACAAGTTCTCTTCCATCTTCTTTCAAAATAATATCAGCAATGCGAGGAGGTCAGGAACAGAA
TGGTTTGGGCCCTAGACCCAAGCTTTCTGTGAAATGGGCACCTGATGTTCAAGAACCTCAGATCAGTTCTGTTTCTCATACTGTTAAAAATAATCGGTGGCACCAATCAAAAAAGAAGGATCGCAAACACAAGCACAAAGGGAAATCAAGTCATGCAAGTGGAAGCAATAAAAATGACAAGAAACATCATTCCAAGCGAA
GCTACAATACCGAGATTGGTCGTTCAAGATTGTGGTCTTCATCATATGAGAAGAAAATGCTGCTAGATGTTTGGGCTTCCAGAAACTCTATGTTAGTGCTTGATAAAACTATTGGTTGGGAGACTCCTATGTTCAGAATGAAGATGGAAGAGGATGATGTTATGCTCAATATGCCTTCCAAGCATTCATGTGGGAAAGGG
CACAGCGATTTTTTAATGAAAGGTTCGTCAGATGCAGAATTTCCATCTCAAGGTTTCAAATGTGCCAGTCACCTTGGGCACACTCTTCAGAATAAACACATAACATATGCTGAGGCTGCATGAAAAAAAGCATTTAGGTGGATCTTCTCATCCTTCTGATGGATGTTCTGATCACAGGCTGTTCAGTTTATATTGTTATT
TTGTAGATGGATCTCTTTTACTTGATGTGATCTGAGATGTCAACGAGAGATTGCTTATTTACATCTTAGCGATGTATAGAATGTCAATGGACTATGTTGCTTTCAATATGTTTGTGACTCGGAATTCATATAATGCTGTTTAGGTTTGATAAGCCTTGTTTCGAGATCATGCATATCAATTGAGAATGATCATATTTTTT
TCCATGAAAAAAACATGACGAGAGTGATCACATTTGTATGTGGCAAAGGGACGATTGTTTTACAACTATATGTATTTATCTTTTTGTTAGTGTCATATTTTGTGGCATAGAAAGTATGTTAATCACAATGAAAGAGGTGAAGTTCTTGTCGTGTATTAAACTGATTTCTATAGTGGTTACGCTGTCAAGAAAGCCGCATA
GGGAATAAGATATAGGGGGTGAAACTAATGCTCCAGTGAGACTTCTTGCGTTCCCCGAGGCAAGAGTGTGAGGACCGTTGGAAGTCTCGCTGGTGCTTAATGTTCACCAGATAGAGGGTGCCAGCTCTGAAAAAGGCTTCGTTCTCTAAGAAAATGACTCATCAATATATGTACCTTTTAATTAGAATCCAGGAATAGCA
TTACGGATGCATGCATCTTCTCTACAGTCCGGTGGGGGTATCAAGGTCAAAAATACATTCTAATTCATGTGTTCTATGTAGATTGGTTTATTAGTTCATTATTGTTAATAACATACACCAATGATTATACAATAATCTAGGAAAGTCTGAAATTTTCATATTTAAATATCTATACATATATCAATTGAAAAGTGAGATTA
TTG
Intron 2 GTTTATTTAT ... GTTTTGGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 25.3 | 189 | 0 | 64 |
| A2 | 20.75 | 126 | 0 | 33 |
| A3 | 24.7 | 125 | 1 | 41 |
| A4 | 22.81 | 88 | 0 | 26 |
| A5 | 19.23 | 42 | 0 | 10 |
| A6 | 29.13 | 382 | 1 | 157 |
| A7 | 20.01 | 739.3 | 0 | 185 |
| A8 | 19.42 | 738.3 | 3 | 178 |
| A9 | 21.83 | 598 | 2 | 167 |
| A10 | 20.19 | 541.7 | 0 | 137 |
>TRINITY_DN40508_c0_g1_i6 from sample A9 / Example spliced isoformCTGCCATTGATGGACATCAAGATTTCGTGCAAGCACGCCGTTTCCGGCGTCCATCCCTATAAATTCCCTTCCGCCATTCCGCTTGTGCAATAGACGAAAGTAGTCTCTCCTGTACATATGTACTGATACTAATTTTTCGTTTTATAGAGCCTTCGTCTGCATCGTCATGGGCTGAATCTACGCCCTCCCTCTCCAGAATT
CTGCCCTGTTGCAAATTGTTTAATCCAAGTTTTCATTTCTCTCCAGGTCGCTCGATTGAATTCCAGCAAGTTCACGGTCTCGATCTTTCTTCAGGGGGGCGAGGGTTATTGTTCGGGGGAATTCAAAATGCCTGCAGTGTACTGGGGATGCGTTCGAATCCCCAGCGAGATGTGCCAGGGTTCGTTCTTCCACGGGGCCG
TTTCGTCTCATCGTCTGAAACATTGGAAGGGTAATATTAGTACTAGTTGACCTTCTAAGTCAATTTATTGAAAAGAACACGCGGATCCTTCGGTTTTTGCAAAATATTTACAGAAAAGAGCTTTTGTGGTTTCCCCACCAAAATCTTAACCATTTTTGCCCCTTCAAAAGTCTACGCCACGCTTCTAGCCTTCCGGAGTT
TGGGTTTCGTCCGATCTGATCCGGTTTCTGGTTCTTGTGAATTTACCGAGGTTCGATAATTGGCAGATATTGAATTCCGAGAGTTATTGGGGTTTTCATATCAATCAGTTTCACAGTAATGGTGGGTTTACTGTTTACTGATACTATATAAGCGTGCGGGTTACACTTGATTGTGAATTGGGATCCGGATTTTCGGCTGG
GTATAGTTTATTATTGCGTTTTATCAGGCGGTAATTTGAACATTGAGGAGCATTCTGAACTGCAAGTTCAATTTCCAAAGGAGCTTTGTATTGTAGATGAAAGAAAAAATAACAATGCAAATGCCAGAATGAAAGATATGTGTATTAATGCACAAAGTGCCACAAGCAATCCTGTTGAAGAAGGTTTTAAGGCAGATAAT
ATGGTGGTTAGCATTGACATTGTACATTTAGAGAATTTTCCAGTAGAAGAGCTGCAGCATGCTTTTGAAGCAGGTTTGCATATTGATGGTGTAGAAAAGCAAGACTGTAATGACAATCAGAATCAGATGGTTCACCTGGTTTCATGCAAAGATGAGAAAAAAGAAGTGCGCAAAGGATCACCTCAAACTCCCAAAGGATC
CCCTCAAACGCCCAGACTAAATTCTGCTGTCAGTGATGAACAATCAAGAATGGAACATAAAAAACCTTTTGTAGATTCAGCAGAGTTGGTGATGTGCCAGACTTTGTCAGAGTGTGTGAGCTTTCCATGTTCTGTGCAGCTATCTCCGTCACCCACTGGCAAGCCTAACGAGAGAGCTGAGACGACTGAGAATGTGATTG
TCGGTGGTGAGCAATCTCTTGAAGAGAAGAATACAGTTTCTGGTCAGACAAGTTCTCTTCCATTGTGTGTGCTCCTTTTCAGTCTTCTTTCAAAATAATATCAGCAATGCGAGGAGGTCAGGAACAGAATGGTTTGGGCCCTAGACCCAAGCTTTCTGTGAAATGGGCACCTGATGTTCAAGAACCTCAGATCAGTTCTG
TTTCTCATACTGTTAAAAATAATCGGTGGCACCAATCAAAAAAGAAGGATCGCAAACACAAGCACAAAGGGAAATCAAGTCATGCAAGTGGAAGCAATAAAAATGACAAGAAACATCATTCCAAGCGAAGCTACAATACCGAGATTGGTCGTTCAAGATTGTGGTCTTCATCATATGAGAAGAAAATGCTGCTAGATGTT
TGGGCTTCCAGAAACTCTATGTTAGTGCTTGATAAAACTATTGGTTGGGAGACTCCTATGTTCAGAATGAAGATGGAAGAGGATGATGTTATGCTCAATATGCCTTCCAAGCATTCATGTGGGAAAGGGCACAGCGATTTTTTAATGAAAGGTTCGTCAGATGCAGAATTTCCATCTCAAGGTTTCAAATGTGCCAGTCA
CCTTGGGCACACTCTTCAGAATAAACACATAACATATGCTGAGGCTGCATGAAAAAAAGCATTTAGGTGGATCTTCTCATCCTTCTGATGGATGTTCTGATCACAGGCTGTTCAGTTTATATTGTTATTTTGTAGATGGATCTCTTTTACTTGATGTGATCTGAGATGTCAACGAGAGATTGCTTATTTACATCTTAGCG
ATGTATAGAATGTCAATGGACTATGTTGCTTTCAATATGTTTGTGACTCGGAATTCATATAATGCTGTTTAGGTTTGATAAGCCTTGTTTCGAGATCATGCATATCAATTGAGAATGATCATATTTTTTTCCATGAAAAAAACATGACGAGAGTGATCACATTTGTATGTGGCAAAGGGACGATTGTTTTACAACTATAT
GTATTTATCTTTTTGTTAGTGTCATATTTTGTGGCATAGAAAGTATGTTAATCACAATGAAAGAGGTGAAGTTCTTGTCGTGTATTAAACTGATTTCTATAGTGGTTACGCTGTCAAGAAAGCCGCATAGGGAATAAGATATAGGGGGTGAAACTAATGCTCCAGTGAGACTTCTTGCGTTCCCCGAGGCAAGAGTGTGA
GGACCGTTGGAAGTCTCGCTGGTGCTTAATGTTCACCAGATAGAGGGTGCCAGCTCTGAAAAAGGCTTCGTTCTCTAAGAAAATGACTCATCAATATATGTACCTTTTAATTAGAATCCAGGAATAGCATTACGGATGCATGCATCTTCTCTACAGTCCGGTGGGGGTATCAAGGTCAAAAATACATTCTAATTCATGTG
TTCTATGTAGATGGGTTTATTAGTTCCTTATTGTTAATAACATACACCAATGATTATACAATAATCTAGGAAAGTCGGAAATTTTCATATTTAAATATCTATACATATATCAATTGAAAAGTGAGATTATTGTGC
>TRINITY_DN40508_c0_g1_i2 from sample A9 / Example unspliced isoform:CCGAGATTGGTCGTTCAAGgtttatttatttagccatttgctggatgtatgctttatctatgtgcttgttgtaataacttttttcactatgttgtgcaattttcttgagagtggttttggcagATTGTGGTCTTCATCATATGAGAAGAAAATGCTGCTAGATGTTTGGGCTTCCAGAAACTCTATGTTAGTGCTTGATA
AAACTATTGGTTGGGAGACTCCTATGTTCAGAATGAAGATGGAAGAGGATGATGTTATGCTCAATATGCCTTCCAAGCATTCATGTGGGAAAGGGCACAGCGATTTTTTAATGAAAGGTTCGTCAGATGCAGAATTTCCATCTCAAGGTTTCAAATGTGCCAGTCACCTTGGGCACACTCTTCAGAATAAACACATAACA
TATGCTGAGGCTGCATGAAAAAAAGCATTTAGGTGGATCTTCTCATCCTTCTGATGGATGTTCTGATCACAGGCTGTTCAGTTTATATTGTTATTTTGTAGATGGATCTCTTTTACTTGATGTGATCTGAGATGTCAACGAGAGATTGCTTATTTACATCTTAGCGATGTATAGAATGTCAATGGACTATGTTGCTTTCA
ATATGTTTGTGACTCGGAATTCATATAATGCTGTTTAGGTTTGATAAGCCTTGTTTCGAGATCATGCATATCAATTGAGAATGATCATATTTTTTTCCATGAAAAAAACATGACGAGAGTGATCACATTTGTATGTGGCAAAGGGACGATTGTTTTACAACTATATGTATTTATCTTTTTGTTAGTGTCATATTTTGTGG
CATAGAAAGTATGTTAATCACAATGAAAGAGGTGAAGTTCTTGTCGTGTATTAAACTGATTTCTATAGTGGTTACGCTGTCAAGAAAGCCGCATAGGGAATAAGATATAGGGGGTGAAACTAATGCTCCAGTGAGACTTCTTGCGTTCCCCGAGGCAAGAGTGTGAGGACCGTTGGAAGTCTCGCTGGTGCTTAATGTTC
ACCAGATAGAGGGTGCCAGCTCTGAAAAAGGCTTCGTTCTCTAAGAAAATGACTCATCAATATATGTACCTTTTAATTAGAATCCAGGAATAGCATTACGGATGCATGCATCTTCTCTACAGTCCGGTGGGGGTATCAAGGTCAAAAATACATTCTAATTCATGTGTTCTATGTAGATGGGTTTATTAGTTCCTTATTGT
TAATAACATACACCAATGATTATACAATAATCTAGGAAAGTCGGAAATTTTCATATTTAAATATCTATACATATATCAATTGAAAAGTGAGATTATTGTGC
Intron 3 GTTTATTTAT ... GTTTTGGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 25.3 | 189 | 5.5 | 64 |
| A2 | 20.75 | 126 | 5.3 | 33 |
| A3 | 24.7 | 125 | 2.8 | 41 |
| A4 | 22.81 | 88 | 1.8 | 26 |
| A5 | 19.23 | 42 | 1 | 10 |
| A6 | 29.52 | 382 | 11.8 | 160 |
| A7 | 20.19 | 739.3 | 27.3 | 187 |
| A8 | 19.69 | 738.3 | 30.5 | 181 |
| A9 | 21.83 | 598 | 19.5 | 167 |
| A10 | 20.3 | 541.5 | 18.5 | 138 |
>TRINITY_DN46525_c1_g2_i11 from sample A7 / Example spliced isoformACAAAATCTGCCATTGATAGACGTCAAGATTTCGTGCAAGCACGCCGTTTCCGGCGTCCATCCCTATAAATTCCCTTCCGCCATTCCGCTTGTGCAATAGACGAAAGTATTCTCTCCTGTACATATGTCGCTCGATTGAATTCCAGCAAGTTCACGGTCTCGATTTTTCTTCAGGGGGGCGAGGGTTATTGTTCGGGGGA
ATTCAAAATGCCTGCAGTGTACTGGGGATGCGTTCGAATCCCCAGCGAGATGTGCCAGGGTTCGTTCTTCCACGGGGCCGTTTCGTCTCATCGTCTGAAACATTGGAAGGGTAATATTAGTACTAGTTGACCTTCTAAGTCAATTTATTGAAAAGAACACGCGGATCCTTCGGTTTTTGCAAAATATTTACAGAAAAGAG
CTTTTGTGGTTTCCCCACCAAAATCTTAACCATTTTTGCCCCTTCAAAAGTCTACGCCACGCTTCTAGCCTTCCGGAGTTTGGGTTTCGTCCGATCTGATCCGGTTTCTGGTTCTTGTGAATTTACCGAGGTTCGATAATTGGCAGATATTGAATTCCGAGAGTTATTGGGGTTTTCATATCAATCAGTTTCACAGTAAT
GGTGGGTTTACTGTTTACTGATACTATATAAGCGTGCGGGTTACACTTGATTGTGAATTGGGATCCGGATTTTCGGCTGGATATAGTTTATTATTGCGTTTTATCAGGCGGTAATTTGAACATTGAGGAGCATTCTGAACTGCAAGTTCAATTTCCAAAGGAGCTTTGTATTGTAGATGAAAGAAAAAATAACAATGCAA
ATGCCAGAATGAAAGATATGTGTATTAATGCACAAAGTGCCACAAGCAATCCTGTTGAAGAAGGTTTTAAGGCAGATAATATGGTGGTTAGCATTGACATTGTACATTTAGAGAATTTTCCAGTAGAAGAGCTGCAGCATGCTTTTGAAGCAGGTTTGCATATTGATGGTGTAGAAAAGCAAGACTGTAATGACAATCAG
AATCAGATGGTTCACCTGGTTTCATGCAAAGATGAGAAAAAAGAAGTGCGCAAAGGATCACCTCAAACTCCCAAAGGATCCCCTCAAACGCCCAGACTAAATTCTGCTGTCAGTGATGAACAATCAAGAATGGAACATAAAAAACCTTTTGTAGATTCAGCAGAGTTGGTGATGTGCCAGACTTTGTCAGAGTGTGTGAG
CTTTCCATGTTCTGTGCAGCTATCTCCGTCACCCACTGGCAAGCCTAACGAGAGAGCTGAGACGACTGAGAATGTGATTGTCGGTGGTGAGCAATCTCTTGAAGAGAAGAATACAGTTTCTAGTCAGACAAGTTCTCTTCCATCTTCTTTCAAAATAATATCAGCAATGCGAGGAGGTCAGGAACAGAATGGTTTGGGCC
CTAGACCCAAGCTTTCTGTGAAATGGGCACCTGATGTTCAAGAACCTCAGATCAGTTCTGTTTCTCATACTGTTAAAAATAATCGGTGGCACCAATCAAAAAAGAAGGATCGCAAACACAAGCACAAAGGGAAATCAAGTCATGCAAGTGGAAGCAATAAAAATGACAAGAAACATCATTCCAAGCGAAGCTACAATACC
GAGATTGGTCGTTCAAGATTGTGGTCTTCATCATATGAGAAGAAAATGCTGCTAGATGTTTGGGCTTCCAGAAACTCTATGTTAGTGCTTGATAAAACTATTGGTTGGGAGACTCCTATGTTCAGAATGAAGATGGAAGAGGATGATGTTATGCTCAATATGCCTTCCAAGCATTCATGTGGGAAAGGGCACAGCGATTT
TTTAATGAAAGGTTCGTCAGATGCAGAATTTCCATCTCAAGGTTTCAAATGTGCCAGTCACCTTGGGCACACTCTTCAGAATAAACACATAACATATGCTGAGGCTGCATGAAAAAAAGCATTTAGGTGGATCTTCTCATCCTTCTGATGGATGTTCTGATCACAGGCTGTTCAGTTTATATTGTTATTTTGTAGATGGA
TCTCTTTTACTTGATGTGATCTGAGATGTCAACGAGAGATTGCTTATTTACATCTTAGCGATGTATAGAATGTCAATGGACTATGTTGCTTTCAATATGTTTGTGACTCGGAATTCATATAATGCTGTTTAGGTTTGATAAGCCTTGTTTCGAGATCATGCATATCAATTGAGAATGATCATATTTTTTTCCATGAAAAA
AACATGACGAGAGTGATCACATTTGTATGTGGCAAAGGGACGATTGTTTTACAACTATATGTATTTATCTTTTTGTTAGTGTCATATTTTGTGGCATAGAAAGTATGTTAATCACAATGAAAGAGGTGAAGTTCTTGTCGTGTATTAAACTGATTTCTATAGTGGTTACGCTGTCAAGAAAGCCGCATAGGGAATAAGAT
ATAGGGGGTGAAACTAATGCTCCAGTGAGACTTCTTGCGTTCCCCGAGGCAAGAGTGTGAGGACCGTTGGAAGTCTCGCTGGTGCTTAATGTTCACCAGATAGAGGGTGCCAGCTCTGAAAAAGGCTTCGTTCTCTAAGAAAATGACTCATCAATATATGTACCTTTTAATTAGAATCCAGGAATAGCATTACGGATGCA
TGCATCTTCTCTACAGTCCGGTGGGGGTATCAAGGTCAAAAATACATTCTAATTCATGTGTTCTATGTAGATTGGTTTATTAGTTCATTATTGTTAATAACATACACCAATGATTATACAATAATCTAGGAAAGTCTGAAATTTTCATATTTAAATATCTATACATATATCAATTGAAAAGTGAGATTATTG
>TRINITY_DN46525_c1_g2_i10 from sample A7 / Example unspliced isoform:AATACCGAGATTGGTCGTTCAAGgtttatttatttagccatttgctggatgtatgctttatctatgtgcttgttgtaataacttttttcactatgttgtgcaattaatttcttgagagtggttttggcagATTGTGGTCTTCATCATATGAGAAGAAAATGCTGCTAGATGTTTGGGCTTCCAGAAACTCTATGTTAGTG
CTTGATAAAACTATTGGTTGGGAGACTCCTATGTTCAGAATGAAGATGGAAGAGGATGATGTTATGCTCAATATGCCTTCCAAGCATTCATGTGGGAAAGGGCACAGCGATTTTTTAATGAAAGGTTCGTCAGATGCAGAATTTCCATCTCAAGGTTTCAAATGTGCCAGTCACCTTGGGCACACTCTTCAGAATAAACA
CATAACATATGCTGAGGCTGCATGAAAAAAAGCATTTAGGTGGATCTTCTCATCCTTCTGATGGATGTTCTGATCACAGGCTGTTCAGTTTATATTGTTATTTTGTAGATGGATCTCTTTTACTTGATGTGATCTGAGATGTCAACGAGAGATTGCTTATTTACATCTTAGCGATGTATAGAATGTCAATGGACTATGTT
GCTTTCAATATGTTTGTGACTCGGAATTCATATAATGCTGTTTAGGTTTGATAAGCCTTGTTTCGAGATCATGCATATCAATTGAGAATGATCATATTTTTTTCCATGAAAAAAACATGACGAGAGTGATCACATTTGTATGTGGCAAAGGGACGATTGTTTTACAACTATATGTATTTATCTTTTTGTTAGTGTCATAT
TTTGTGGCATAGAAAGTATGTTAATCACAATGAAAGAGGTGAAGTTCTTGTCGTGTATTAAACTGATTTCTATAGTGGTTACGCTGTCAAGAAAGCCGCATAGGGAATAAGATATAGGGGGTGAAACTAATGCTCCAGTGAGACTTCTTGCGTTCCCCGAGGCAAGAGTGTGAGGACCGTTGGAAGTCTCGCTGGTGCTT
AATGTTCACCAGATAGAGGGTGCCAGCTCTGAAAAAGGCTTCGTTCTCTAAGAAAATGACTCATCAATATATGTACCTTTTAATTAGAATCCAGGAATAGCATTACGGATGCATGCATCTTCTCTACAGTCCGGTGGGGGTATCAAGGTCAAAAATACATTCTAATTCATGTGTTCTATGTAGATTGGTTTATTAGTTCA
TTATTGTTAATAACATACACCAATGATTATACAATAATCTAGGAAAGTCTGAAATTTTCATATTTAAATATCTATACATATATCAATTGAAAAGTGAGATTATTG