sp|Q8RWV3|CCL11_ARATH ----> Cyclin-L1-1
Intron 1 GTAAGTAAAA ... GGATATGTAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 79.12 | 19 | 72 | 43 |
| A2 | 92.38 | 8 | 97 | 29 |
| A3 | 86.42 | 11 | 70 | 32 |
| A4 | 77.92 | 17 | 60 | 27 |
| A5 | 86.79 | 7 | 46 | 14 |
| A6 | 86.9 | 140 | 929 | 241 |
| A7 | 84.04 | 125 | 658 | 179 |
| A8 | 86.75 | 124 | 812 | 266 |
| A9 | 83.28 | 154 | 767 | 194 |
| A10 | 87.01 | 86 | 576 | 112 |
>TRINITY_DN111952_c4_g2_i8 from sample A3 / Example spliced isoformGCCAGCTTATTTCATATCATGGATGCACAGTGGGATTCCTTGCAGAAATTAATGTTTATGCTTCTTTCACGGCCTTTTTACAGGTTGTCGATTGTCAAGGATTGTGGAGCTAAAGCGTCATTTTCTGCTGCCAAGATGTCAATTGAAGGGATGTAGCACAGTAGAAACGCTGTAACTGCTGTCTACAAGAACGTTGAATT
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>TRINITY_DN111952_c4_g2_i6 from sample A3 / Example unspliced isoform:GCCAGCTTATTTCATATCATGGATGCACAGTGGGATTCCTTGCAGAAATTAATGTTTATGCTTCTTTCACGGCCTTTTTACAGATACAGGTTGTCGATTGTCAAGGATTGTGGAGCTAAAGCGTCATTTTCTGCTGCCAAGATGTCAATTGAAGGGATGTAGCACAGTAGAAACGCTGTAACTGTTGTCGGTTGTCGAGG
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GAGGTCGTATGGGGAGACTTATCCCCGCACTCCATGCCAAAAAAAGCCATAATCCAGACCAACTGGAGAACAAGCCATGCAAAGGTCGTTTCAGTTATCTGTTAATGTTGTGCCATAATCCAGACCAACTGGAGAACAAGCCATGCAAAGGTCGTTTCAGTTATCTGTTAATGTTGTGGGAATCAATGACAATTTGCCTT
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Intron 2 GTTGTCGGTT ... GGATATGTAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 69.35 | 19 | 43 | 43 |
| A2 | 82.02 | 8 | 44 | 29 |
| A3 | 74.71 | 11 | 33 | 32 |
| A4 | 61.36 | 17 | 27 | 27 |
| A5 | 75 | 7 | 28 | 14 |
| A6 | 77.2 | 140 | 707 | 241 |
| A7 | 73.57 | 125 | 517 | 179 |
| A8 | 76.97 | 124 | 563 | 266 |
| A9 | 73.12 | 154 | 644 | 194 |
| A10 | 77.81 | 86 | 491 | 112 |
>TRINITY_DN111952_c4_g2_i8 from sample A3 / Example spliced isoformGCCAGCTTATTTCATATCATGGATGCACAGTGGGATTCCTTGCAGAAATTAATGTTTATGCTTCTTTCACGGCCTTTTTACAGGTTGTCGATTGTCAAGGATTGTGGAGCTAAAGCGTCATTTTCTGCTGCCAAGATGTCAATTGAAGGGATGTAGCACAGTAGAAACGCTGTAACTGCTGTCTACAAGAACGTTGAATT
TCCCCAATAATTCGGTTGTCATGATTTGTCCAGTTTTGTTGATTTTTTGTTTCAGTTAATCGAAACATCGTTTAATTTGATACGATTAAACCCTACTTTACTGTAGTTGTCATATTAAATGACGTCCAAAGTATTGAGCTTAGGGTCGCTCCAACTTCCCATTTTAGTTTTGCACAGTTCTTAGCGTGGTTGAGCTTTTC
TCTTAACTTGATAATATTTGTGGCGTTTAAATAGTTTCGCTGCTTGAACATGATCATTCAAAAACCGTTTGTCCAAACAATAGGCAAAGTCGCGGGTTCCATCCCCATAAAAGGGGAATTCAAGAGTTCCCGTTGTATTCTATGTTAATCAAATAATTTGATTAAGTAGTGCCATGATTTAATTTTAGGATTATCAACAA
TGAACCATTTGTTTAAGAGGCAGTTTCCTCTGTAGGCTTAGTCAACAAAGAGGCCGTTTCCACTGGCGGCTTCGTTGTCTGTTGACGGCTTATGAGGAGAGCCGCTCTTCTCACACCTTTTAATAAATATAAAGGATCTCCCTTCGAACTACATCTCACCGACCGACAATCACGATATGAAGCTTTTATCTGTACATGGG
GCATGGATATCGGGACTTCAGAATAATACCAGCCTTCACATCATATATTTTAATCACAATTATATAATTAATTACAGCGTTACTACTTCGCCACATGGTGGCCGTCGCGCCTACTGTTTGTTTAGTTTTTTTATTATTCTTGATTTCCGATCATAAAATATTTTCCCTGAAGAAGAACAAATGACAGGATCAATGTTCAG
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TCAATTTTTATGTCATTTTTTTATGAATATATTACTGCATTTAGGTGCAATATTGAGCTTAGTAGCCAATCAAATTAATTTGTATTGGATTTTCCCTG
>TRINITY_DN111952_c4_g2_i1 from sample A3 / Example unspliced isoform:TAATAATAATAATAATATTTAAATTTAAGTATTATTATTATTATTCCAATAGATATGATATATTAAGTAATTTTATTCTTCTAGATACAGGTTGTCGATTGTCAAGGATTGTGGAGCTAAAGCGTCATTTTCTGCTGCCAAGATGTCAATTGAAGGGATGTAGCACAGTAGAAACGCTGTAACTgttgtcggttgtcgag
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