sp|Q9C912|R35A3_ARATH ----> Large ribosomal subunit protein eL33y
Intron 1 GTAAGAGATC ... CTGTTTTCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 52.38 | 5 | 5 | 6 |
| A2 | 53.68 | 22 | 23 | 28 |
| A3 | 51.61 | 15 | 18 | 14 |
| A4 | 60 | 6 | 15 | 3 |
| A5 | 45.45 | 12 | 13 | 7 |
| A6 | 30.36 | 125 | 85 | 24 |
| A7 | 23.39 | 95 | 44 | 14 |
| A8 | 27.03 | 81 | 48 | 12 |
| A9 | 27.54 | 75 | 45 | 12 |
| A10 | 26.56 | 94 | 42 | 26 |
>TRINITY_DN40999_c0_g1_i3 from sample A7 / Example spliced isoformAAAAAAACACCACTCGCTTTCATGATGCCCTAAAATGACTCGTTTAACAACCTAAATACGAAAATCCAATTATCATCGCTAAAATAACAATAAGAAGTCAAATTAATAAAAAGATTTGACCGCCAATAGGCAGGAAATAATATGACCCAGAAGCCAAAGGTTGAACATTAATGCATACACAGGGGTGATTTACCGGACTA
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CTTGTATTGGCTGTTACTTGGCATGTATCCAATGCACTATCCGTCTTTTCATTAATTAGATGGAAGTATTATTTGGAATTTCTTTTATTAATGGATATTTCGGTGTCTGGGGCATCCACATATAGCTAAGTTAATAAATATTATATTAAGTATCACTGTTAAGATTATTTTTGTGATTTAGCTACTCGATCTATTAATAA
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CCTTTTGTACTTGCCCTGTATTAGCTGAAACTTGAAG
>TRINITY_DN40999_c0_g1_i2 from sample A7 / Example unspliced isoform:AAAAAAACACCACTCGCTTTCATGATGCCCTAAAATGACTCGTTTAACAACCTAAATACGAAAATCCAATTATCATCGCTAAAATAACAATAAGAAGTCAAATTAATAAAAAGATTTGACCGCCAATAGGCAGGAAATAATATGACCCAGAAGCCAAAGGTTGAACATTAATGCATACACAGGGGTGATTTACCGGACTA
GCCAGTCAAAGGGTTAGGGTTTTGGAGTAGGGAGTTTTAAAGGGCATTTGGTCTCTCTTTTCTACTATTGATAAAATTATCTCAGTAGGGTTTTGAGCGTCTGTGTGTAGAGGCGGATCGTGAGGAGCGAAGATGGTGAAGGGACGCCAAGGAGAGCGTATCAGgtaagagatcttgattgccatcctctctctgttgtg
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GAAGCCTATGCTTGATCGCGGCGGCCCAATAGCAGCCAATCGTTTTATATGCAGGGAACGACCATCGGTTTGCTCTCAGTTGTCCACCTCGTCGTCAGCCTCCTCAGGCTCGTCGAGCAAATCATCCACCAGCCTCCATTCCCATTTGATGGGACAGTTAATCTTGTTATCGTTTTTTTTGGTTTCTTTAAACTTGCTTC
CTGTTCTTAAGCCTGTATTGCTGTTGTGACTGGTGAAAATCTACGCGGGGTAGCTGACAAGCCTCTGAGCGAAGAACGGATTGAATATAACCTCGCTTAAGGATCTCACCAGGTTACCTGTTTTAGATTTCCCGTCTGCTTGTAAGAACATGGCTTCCAGTATTCCCCGTTTCTACTTGTGGGCCCAATGCTCGTGGATG
GGTGATGTTATAGATTGTTTGAAATTGTAGTTGGAAGAATGTATGCCCTTTTAGGTTTAATATGGCTAAGCGGTTTGATAATACCCAATGCATGCCCTGTAAAGTTTGGATGCGGTGTTGGGTTCGATATCCTTGGGATTACCTTTCGAAGAGGCTTAACCTTGTTAAAATACCTGGCCAATAAAGTAACTCTTTAAAAA
TACTAATATGATACTGTGATCTTCGTTACATATGAATAACGCTGTAAGCACTCCACCGAATGTTGTTTGATGTGTCTTAAGGTTGAAAATGCGGAGATATAGAATATTTCTTGTATTGGCTGTTACTTGGCATGTATCCAATGCACTATCCGTCTTTTCATTAATTAGATGGAAGTATTATTTGGAATTTCTTTTATTAA
TGGATATTTCGGTGTCTGGGGCATCCACATATAGCTAAGTTAATAAATATTATATTAAGTATCACTGTTAAGATTATTTTTGTGATTTAGCTACTCGATCTATTAATAATATACAGATCGCTGAAACAGAAATACGTGCCTGATTCATTGGGACTGTTCACTCAGTTGATACAGTTGGTTTGAGAGATGCTGTATAAAGG
AATTTTTTGACAGATTATAGAGTTAACTAGATCATTTTTCTGCTTTATAATTTTCAGGACAATGCTGCCTGGTATGTGCTGTATTCCTATCAATTTGACCAATTGAATAATTAGATGTGATGCTCATCTCCTACTTTATTGATAAGATCCAATGCTGTGTGATATGTAGACAGAGTTGACTGTACGGAGATAATTAATTT
TACCAAACATTCATTGAAGGGCTGCATGGTAAGACTGTTCTGATTGTGTGTATGCGCCTCACACGATGACGTCTTGACTGAGGACCAAGACTGGGGTCTGCTTGGAATCCCTTTTGTACTTGCCCTGTATTAGCTGAAACTTGAAG