sp|Q84TF0|AKRCA_ARATH ----> Aldo-keto reductase family 4 member C10

Intron 1 GTGGAGTTGC ... CCCAGAACAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	67.83	23	69	28
A2	70.43	17	47	34
A3	67.92	17	46	26
A4	80.43	9	41	33
A5	76	3	13	6
A6	68.64	130	307	262
A7	72.71	64	192	149
A8	68.5	80	196	152
A9	69.12	88	221	173
A10	69.64	51	142	92

>TRINITY_DN40748_c0_g1_i1 from sample A10 / Example spliced isoform

CACCCGGGTAGCATATTCTTCCATGCAACAAAAAGTATCCATAGATCAATAAACGATGATGATAGTGGACAAATATGCAGACAAACTGCCCCTCAACGGTATTCACTGGTAAAAGTGCGCCGCTAATCAGTAGCCTTATGGAAAAATCCTTTGTTTTCACCCACTGTAAACATCTGGTTACATGATGTGGAACCCATCAT
TTTCTCAGCTACATTCAATGCTGAATTCAGCTAGATTTCAATGGGCACATTTCTTAATTCATAGCTAGATTTGGTGCGATATTTGATTGTGAATGGATGGCCGTAAATTATGATGATAACTGGGTAAAGAGAAAAAGTTTGTTAGTCATAGGAAAATTTACAGTAAAATCGCCATATGTTTGGGAAATCAGAAGACTTTG
GGGGCATACGGGGATCTTCGAACCCAAGTTTGACTCTTCTTTTCTAGGGCAGAACGATGGCGTTTATTCAACAACTTTGAATAGCAGACTTTGGAAAAAAAATTAGATCCTATCCATATACCAGTTTCTAGACTTCCAAGCGGAAAGTTCATTCAAGATACGTAATGTTAGACAGACCCACTATGGGTGGTCCTATTGGC
TCAATTTCAGAAATCATTTTTAATGCTTTCTGATTGAATTCTCATTCGTGCAAAGAAATTAGTGTGCACCCAACAGAGGAAGGCAGGCACCCATTTGGTAAAAAGTTGGAAAACAGAAGAAAAGGTGGATTTCGGGTGAACAATTGATCGTATAAAACCTGAAGGGTTACAGAGATTGTTGTTTTTTCTGAGTTTTAATT
GGTGTACTGGGTCAGTATTCCATTGAATCATATATACACAACATTTATGAGAATGAGAGCAAAGGGGAGCAATAGTACTATGCATCATTTTGTATTGAATACAGGGCATAAAATCCCTGCTGTTGGCCTGGGAACATGGCAGGCTGATGGGGATATATGCACTGAGGCTGTTAGGACTGCGCTGAAGGTTGGGTACCGCC
ATCTGGATTGTGCCCATCTCTATGGAAACGAGGTTGAAGTAGGCCAGGCATTGGCAGAGGCCTTGAGTGGAGATGTGCCTGGACTGAGGAGAGAGGATGTTTTTGTGACCTCCAAGCTGTGGTGCACCACAAATGCCCCTCGGAGGGTTGAGACATCTGTTAAGGTATGCTTGAAGAATCTTGGGGTATCATATTTGGAT
CTGTATTTGGTGCATTGGCCTGTGACTTTCTCCTTTGGGGATGCCACAGATCCTCCTAGGAATTCTGGTGGAGAATTGAGGATGCGAACTTCACATCGGTTGAAAGCAACATGGCAGGCCATGGAGTGTTTGGTGGAGAAAGGGCTTGTGAATGCGATCGGAGTCAGCAATTTCAGTATACAACAGATAGAGGAATTGCT
CACCTTTGCCAAGATAGTTCCTGCTGTTAATCAGGTTATTTTACGATGGGGATTACAACGAGGCACAAGTGTGTTACCTCGCAGCTTAAGACCTGAGAGAATTAGGACAAATTTTGATATCTTCAACTGGTCATTATCTGAAGAAGATTGGAAAAAGATCAACTCACTTGAGCCCCAATATCGCCTGATAGACAGTGGGT
ACTCTTATATATCTGAAACTGGACCTCTACAAGCAGTTCAAGAGATCGATGATGATGTCGAAGCTGGTGTTTAATGGAAATGTTTACATTGTTCTGAAGATTTATGTAGAGTAAAAAGTCAATTGAAGCACTTCTACCGTGTTCTTGCTATGTTATTACTGTTCTGTTAAAAGTCTTGTTGTATATTTCATCTATTAGAA
TTTGAACAAATATTTGTATCCACCCGTGTAAGTTTCTCAAGAATTCTCAATAATAAACTATCGCTTCCGAAGGATTGCAACTGATTTGAATCCTCCACAGTGTTTTTGGAATTACTTTTGTAGAGCTACTCAATTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTCCTCTCTAAATTTCCAAATTTCAGAATATGGTTATACATAAAAT
TTTTCTTTCTATGTG

>TRINITY_DN40748_c0_g1_i2 from sample A10 / Example unspliced isoform:

CACCCGGGTAGCATATTCTTCCATGCAACAAAAAGTATCCATAGATCAATAAACGATGATGATAGTGGACAAATATGCAGACAAACTGCCCCTCAACGGTATTCACTGGTAAAAGTGCGCCGCTAATCAGTAGCCTTATGGAAAAATCCTTTGTTTTCACCCACTGTAAACATCTGGTTACATGATGTGGAACCCATCAT
TTTCTCAGCTACATTCAATGCTGAATTCAGCTAGATTTCAATGGGCACATTTCTTAATTCATAGCTAGATTTGGTGCGATATTTGATTGTGAATGGATGGCCGTAAATTATGATGATAACTGGGTAAAGAGAAAAAGTTTGTTAGTCATAGGAAAATTTACAGTAAAATCGCCATATGTTTGGGAAATCAGAAGACTTTG
GGGGCATACGGGGATCTTCGAACCCAAGTTTGACTCTTCTTTTCTAGGGCAGAACGATGGCGTTTATTCAACAACTTTGAATAGCAGACTTTGGAAAAAAAATTAGATCCTATCCATATACCAGTTTCTAGACTTCCAAGCGGAAAGTTCATTCAAGATACGTAATGTTAGACAGACCCACTATGGGTGGTCCTATTGGC
TCAATTTCAGAAATCATTTTTAATGCTTTCTGATTGAATTCTCATTCGTGCAAAGAAATTAGTGTGCACCCAACAGAGGAAGGCAGGCACCCATTTGGTAAAAAGTTGGAAAACAGAAGAAAAGGTGGATTTCGGGTGAACAATTGATCGTATAAAACCTGAAGGGTTACAGAGATTGTTGTTTTTTCTGAGTTTTAATT
GGTGTACTGGGTCAGTATTCCATTGAATCATATATACACAACATTTATGAGAATGAGAGCAAAGGGGAGCAATAGTACTATGCATCATTTTGTATTGAATACAGGGCATAAAATCCCTGCTGTTGGCCTGGGAACATGGCAGGCTGATGGGGATATATGCACTGAGGCTGTTAGGACTGCGCTGAAGGTTGGGTACCGCC
ATCTGGATTGTGCCCATCTCTATGGAAACGAGGTTGAAGTAGGCCAGGCATTGGCAGAGGCCTTGAGTGGAGATGTGCCTGGACTGAGGAGAGAGGATGTTTTTGTGACCTCCAAGCTGTGGTGCACCACAAATGCCCCTCGGAGGGTTGAGACATCTGTTAAGGTATGCTTGAAGAATCTTGGGGTATCATATTTGGAT
CTGTATTTGGTGCATTGGCCTGTGACTTTCTCCTTTGGGGATGCCACAGATCCTCCTAGGAATTCTGGTGGAGAATTGAGGATGCGAACTTCACATCGGTTGAAAGCAACATGGCAGGCCATGGAGTGTTTGGTGGAGAAAGGGCTTGTGAATGCGATCGGAGTCAGCAATTTCAGTATACAACAGATAGAGGAATTGCT
CACCTTTGCCAAGATAGTTCCTGCTGTTAATCAGgtggagttgcatcctttttggcgccaagacgaccttgtaaaattttgtcaagcaaagggtattcatgtatcagctcatacacctttgggtgttcctgcaagcaatccgttaagtaatgattgtgggtctagtggtgaggatgaatgtgagacacctcgaattgcat
tcagaaggtgcaggtctgttcatgcaccaatgcttaaatcatctgtagtagcaaacattgcagcacgtctccacaagaccccagaacagGTTATTTTACGATGGGGATTACAACGAGGCACAAGTGTGTTACCTCGCAGCTTAAGACCTGAGAGAATTAGGACAAATTTTGATATCTTCAACTGGTCATTATCTGAAGAA
GATTGGAAAAAGATCAACTCACTTGAGCCCCAATATCGCCTGATAGACAGTGGGTACTCTTATATATCTGAAACTGGACCTCTACAAGCAGTTCAAGAGATCGATGATGATGTCGAAGCTGGTGTTTAATGGAAATGTTTACATTGTTCTGAAGATTTATGTAGAGTAAAAAGTCAATTGAAGCACTTCTACCGTGTTCT
TGCTATGTTATTACTGTTCTGTTAAAAGTCTTGTTGTATATTTCATCTATTAGAATTTGAACAAATATTTGTATCCACCCGTGTAAGTTTCTCAAGAATTCTCAATAATAAACTATCGCTTCCGAAGGATTGCAACTGATTTGAATCCTCCACAGTGTTTTTGGAATTACTTTTGTAGAGCTACTCAATTCTCTCTCTCT
CTCTCTCTCTTCCTCTCTAAATTTCCAAATTTCAGAATATGGTTATACATAAAATTTTTCTTTCTATGTG

Intron 2 GTGAGTCTGT ... GAAGGTACAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	23.26	66	25	15
A2	32.98	63	41	21
A3	27.27	52	15	24
A4	21.21	39	13	8
A5	25	36	16	8
A6	20.25	126	32	32
A7	19.49	136	33.8	32
A8	20	54	12	15
A9	20.54	127.7	31	35
A10	21.92	130	50	23

>TRINITY_DN128581_c0_g1_i3 from sample A1 / Example spliced isoform

CCCGGGTAGCATATTCTTCCATGCAACAAAAAGTATCCATAGATCAATAAACGATGATGATAGTGGACAAATATGCAGACAAACTGCCCCTCAACGGTATTCACTGGTAAAAGTGCGCCGCTAATCAGTAGCCTTATGGAAAAATCCTTTGTTTTCACCCACTGTAAACATCTGGTTACATGATGTGGAACCCATCATTT
TCTCAGCTACATTCAATGCTGAATTCAGCTAGATTTCAATGGGCACATTTCTTAATTCATAGCTAGATTTGGTGCGATATTTGATTGTGAATGGATGGCCGTAAATTATGATGATAACTGCGTAAAAAGAAAAAGTTTGTTAGTCATAGGAAAATTTACAGTAAAATCGCCATATGTTTGGGAAATCAGAAGACTTTGGG
GGCATACGGGGATCTTCGAACCCAAGTTTGACTCTTCTTTTCTAGGGCAGAACGATGGCGTTTATTCAACAACTTTGAATAGCAGACTTTGGAAAAAAAATTAGATCCTATCCATATACCAGTTTCTAGACTTCCAAGCGGAAAGTTCATTCAAGATACGTAATGTTAGACAGACCCACTATGGGTGGTCCTATTGGCTC
AATTTCAGAAATCATTTTTAATGCTTTCTGATTGAATTCTCATTCGTGCAAAGAAATTAGTGTGCACCCAACAGAGGAAGGCAGGCACCCATTTGGTAAAAAGTTGGAAAACAGAAGAAAAGGTGGATTTCGGGTGAACAATTGATCGTATAAAACCTGAAGGGTTACAGAGATTGTTGTTTTTTCTGAGTTTTAATTGG
TGTACTGGGTCAGTATTCCATTGAATCATATATACACAACATTTATGAGAATGAGAGCAAAGGGGAGCAATAGTACTATGCATCATTTTGTATTGAATACAGGGCATAAAATCCCTGCTGTTGGCCTGGGAACATGGCAGGCTGATGGGGATATATGCACTGAGGCTGTTAGGACTGCGCTGAAGGTTGGGTACCGCCAT
CTGGATTGTGCCCATCTCTATGGAAACGAGGTTGAAGTAGGCCAGGCATTGGCAGAGGCCTTGAGTGGAGATGTGCCTGGACTGAGGAGAGAGGATGTTTTTGTGACCTCCAAGCTGTGGTGCACCACAAATGCCCCTCGGAGGGTTGAGACATCTGTTAAGGTATGCTTGAAGAATCTTGGGGTATCATATTTGGATCT
GTATTTGGTGCATTGGCCTGTGACTTTCTCCTTTGGGGATGCCACAGATCCTCCTAGGAATTCTGGTGGAGAATTGAGGATGCGAACTTCACATCGGTTGAAAGCAACATGGCAGGCCATGGAGTGTTTGGTGGAGAAAGGGCTTGTGAATGCGATCGGAGTCAGCAATTTCAGTATACAACAGATAGAGGAATTGCTCA
CCTTTGCCAAGATAGTTCCTGCTGTTAATCAGGTGGAGTTGCATCCTTTTTGGCGCCAAGACGACCTTGTAAAATTTTGTCAAGCAAAGGGTATTCATGTATCAGCTCATACACCTTTGGGTGTTCCTGCAAGCAATCCGTTAAGTAATGATTGTGGGTCTAGTGGTGAGGATGAATGTGAGACACCTCGAATTGCATTC
AGAAGGTGCAGGTCTGTTCATGCACCAATGCTTAAATCATCTGTAGTAGCAAACATTGCAGCACGTCTCCACAAGACCCCAGAACAGGTTATTTTACGATGGGGATTACAACGAGGCACAAGTGTGTTACCTCGCAGCTTAAGACCTGAGAGAATTAGGACAAATTTTGATATCTTCAACTGGTCATTATCTGAAGAAGA
TTGGAAAAAGATCAACTCACTTGAGCCCCAATATCGCCTGATAGACAGTGGGTACTCTTATATATCTGAAACTGGACCTCTACAAGCAGTTCAAGAGATCGATGATGATGTCGAAGCTGGTGTTTAATGGAAATGTTTACATTGTTCTGAAGATTTATGTAGAGTAAAAAGTCAATTGAAGCACTTCTACCGTGTTCTTG
CTATGTTATTACTGTTCTGTTAAAAGTCTTGTTGTATATTTCATCTATTAGAATTTGAACAAATATTTGTATCCACCCGTGTAAGTTTCTCAAGAATTCTCAATAATAAACTATCGCTTCCGAAGGATTGCAACTGATTTGAATCCTCCACAGTGTTTTTGGAATTACTTTTGTAGAGCTACTCAATTCTCTCTCTCTCT
CTCTCTCTTCCT

>TRINITY_DN128581_c0_g1_i2 from sample A1 / Example unspliced isoform:

CCCGGGTAGCATATTCTTCCATGCAACAAAAAGTATCCATAGATCAATAAACGATGATGATAGTGGACAAATATGCAGACAAACTGCCCCTCAACGGTATTCACTGGTAAAAGTGCGCCGCTAATCAGTAGCCTTATGGAAAAATCCTTTGTTTTCACCCACTGTAAACATCTGGTTACATGATGTGGAACCCATCATTT
TCTCAGCTACATTCAATGCTGAATTCAGCTAGATTTCAATGGGCACATTTCTTAATTCATAGCTAGATTTGGTGCGATATTTGATTGTGAATGGATGGCCGTAAATTATGATGATAACTGCGTAAAAAGAAAAAGTTTGTTAGTCATAGGAAAATTTACAGTAAAATCGCCATATGTTTGGGAAATCAGAAGACTTTGGG
GGCATACGGGGATCTTCGAACCCAAGTTTGACTCTTCTTTTCTAGGGCAGgtgagtctgtttgagatggatgtttgttgggccctgtttttcattatttttgtttatgtatttatttttgcaaattttggaaggattgttgtaattttttaacctgtgaaggtacagAACGATGGCGTTTATTCAACAACTTTGAATAGC
AGACTTTGGAAAAAAAATTAGATCCTATCCATATACCAGTTTCTAGACTTCCAAGCGGAAAGTTCATTCAAGATACGTAATGTTAGACAGACCCACTATGGGTGGTCCTATTGGCTCAATTTCAGAAATCATTTTTAATGCTTTCTGATTGAATTCTCATTCGTGCAAAGAAATTAGTGTGCACCCAACAGAGGAAGGCA
GGCACCCATTTGGTAAAAAGTTGGAAAACAGAAGAAAAGGTGGATTTCGGGTGAACAATTGATCGTATAAAACCTGAAGGGTTACAGAGATTGTTGTTTTTTCTGAGTTTTAATTGGTGTACTGGGTCAGTATTCCATTGAATCATATATACACAACATTTATGAGAATGAGAGCAAAGGGGAGCAATAGTACTATGCAT
CATTTTGTATTGAATACAGGGCATAAAATCCCTGCTGTTGGCCTGGGAACATGGCAGGCTGATGGGGATATATGCACTGAGGCTGTTAGGACTGCGCTGAAGGTTGGGTACCGCCATCTGGATTGTGCCCATCTCTATGGAAACGAGGTTGAAGTAGGCCAGGCATTGGCAGAGGCCTTGAGTGGAGATGTGCCTGGACT
GAGGAGAGAGGATGTTTTTGTGACCTCCAAGCTGTGGTGCACCACAAATGCCCCTCGGAGGGTTGAGACATCTGTTAAGGTATGCTTGAAGAATCTTGGGGTATCATATTTGGATCTGTATTTGGTGCATTGGCCTGTGACTTTCTCCTTTGGGGATGCCACAGATCCTCCTAGGAATTCTGGTGGAGAATTGAGGATGC
GAACTTCACATCGGTTGAAAGCAACATGGCAGGCCATGGAGTGTTTGGTGGAGAAAGGGCTTGTGAATGCGATCGGAGTCAGCAATTTCAGTATACAACAGATAGAGGAATTGCTCACCTTTGCCAAGATAGTTCCTGCTGTTAATCAGGTGGAGTTGCATCCTTTTTGGCGCCAAGACGACCTTGTAAAATTTTGTCAA
GCAAAGGGTATTCATGTATCAGCTCATACACCTTTGGGTGTTCCTGCAAGCAATCCGTTAAGTAATGATTGTGGGTCTAGTGGTGAGGATGAATGTGAGACACCTCGAATTGCATTCAGAAGGTGCAGGTCTGTTCATGCACCAATGCTTAAATCATCTGTAGTAGCAAACATTGCAGCACGTCTCCACAAGACCCCAGA
ACAGGTTATTTTACGATGGGGATTACAACGAGGCACAAGTGTGTTACCTCGCAGCTTAAGACCTGAGAGAATTAGGACAAATTTTGATATCTTCAACTGGTCATTATCTGAAGAAGATTGGAAAAAGATCAACTCACTTGAGCCCCAATATCGCCTGATAGACAGTGGGTACTCTTATATATCTGAAACTGGACCTCTAC
AAGCAGTTCAAGAGATCGATGATGATGTCGAAGCTGGTGTTTAATGGAAATGTTTACATTGTTCTGAAGATTTATGTAGAGTAAAAAGTCAATTGAAGCACTTCTACCGTGTTCTTGCTATGTTATTACTGTTCTGTTAAAAGTCTTGTTGTATATTTCATCTATTAGAATTTGAACAAATATTTGTATCCACCCGTGTA
AGTTTCTCAAGAATTCTCAATAATAAACTATCGCTTCCGAAGGATTGCAACTGATTTGAATCCTCCACAGTGTTTTTGGAATTACTTTTGTAGAGCTACTCAATTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTCCT