NA ----> NA


Intron 1 GTAGTAAGGT ... TGCTAAGCAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A125.12792924
A223.6442188
A321.21651520
A424.35733116
A5162144
A623.631815359
A724.962277477
A823.192556787
A924.492427879
A1024.051806549



>TRINITY_DN115749_c0_g1_i2 from sample A1 / Example spliced isoform
CATGTAACGTGTTGGATCTCTCATCGGACCAAAGCCCATTGACTTTCAACAATATTCTATATTCAATAATATTGTTTTATTTTACACACTGAATCACATACAGGGCGTGGGGCCGATACCGGCCCACGGCTTTGGTTAATGCCTGGTATCCAATACCTTCCACTCCAGTGGGACAGAGTCCACAAAATCAGTATAAGAGA
ATGCCCAGTACGCATTGGGACGTGTTAATTCTCATAATTTCCCGCCCTTCGGCAAGAACAGAGCAAAAGCCTCCACAGAGACCAGAAGAGAGACCAGAAGAAAGAATCAGAGGTTTGTAAATTTTGGTCTCATATCATATCGGTAATCCACTCAGGGACCAGGGCTGTTAAAAAGAAAGTAAGAAATGGAGGTCCCTGTG
ATTGATTTGGAGCCATACTTGAAATTCACGGGCAGATACGAATGCGGGTCTGACTCCAAAGGTGATCCAATCGACCCTGCCTGTAACCCAAATGGCGATCTCGAGCATAGTCCGGAGTTGAAGAGCTTATGCGAGAAAGTGGCGGAGTCTCTGAAGCAAACAGGGGCATTGGTGGTCAGAGATCCGAGGTGCCCAGCGGA
GGTTAACGACACGTTTCTGGACATGATGGAAACGTATTTTCAAAAATCAGTTGACTTCAAGCGCAAACAAGAGCGCCCGGATCTTCATTACCAGGTAGGAGTGACACCGGAAGGAGTTGAGTTGCCTAGAGCTGCAGTAGACAAAGAGATGCAAATGAAAATCCAAGACGTACCAGAGGAATATCGGCCCCATATTCCTG
TTGGTGCTGATCCCAAATGGAGATATATGTGGAGAGTGGGCCCTCGGCCATTGAAGACACGTTTTAGGGAATTAAATTCTGATCCTGTGGTGCCAGAGGGGTTCCCAGAGTGGGCGGATACAATGGATGGATGGGGTTCTACGATGATCTCTGCTGTTGAGGTTGTTGCGGAGATGGCAGGTATTGGGTTTGGGATTTCA
AAAGATTCATTTACGTCACTGATGCTACAGGGACCTCACTTGCTCGCTCCTACAGGGAGTGATCTTTCAAGGCATGGAAAAGAAGGGACTGTATTTGCAGGTTACCATTATGATCTTAACTTTCTAACTATCCACGGTCGCAGTAGATTCCCTGGACTCTACATTTGGTTGAGAAATGGTCAAAAAGTTGAAGTACGTGT
CCCCGTTGGGTGTCTGTTGATCCAAGCTGGAAAACAGCTTGAGTGGCTTACAGGTGGTGATTGCCTGGCTGGAATGCATGAAGTTGTTGTCACTAAAAGAACTCTTGCAGCTATTGAAGCAGCAAGTCAGGCAGGAAAGAGCTTATGGAGGGTTTCCTCCACAGTTTTTGGACACATTGCCTCTGATGCAATCTTAGAAC
CACTTGGTCACTTTGCAAATTCACCTCTTGCACAAAACTATCCTCCCATTTGTGCTGGAGATTTCGTGGAGCTAGAACTTGCAGCCATAAATTTGAAGGGCAAGCAAGATGGTGTCTTAGATCTAGAAAATGGGAACTGTGAGCAAGAAACAGTGGGATAATATCCTCCCAAAGGTATCGATAATTCTTTGCAACTAGAA
GAAAACCGGAATAGCCTCTGAAGATTATAATTGGTCTCTAAAGCTTGAAATTTCAGTTCTATTTACACTCTCTTCTACTTTGCTGCAATAAAGAATTAAGTACACCGGTTCAGCTTACAGTCAATGTGTATAAATATTCTGATACAGTTTGGTACGTTGTATAAATATTCTGATACAATTTGGTACATTTGAGTTGTCGA
CAGCATGACTCATTTCTTGAACACAAAATGTGTAAACTGGACAACTATAAACTTCAATAATGTTCAAAAATCTGTATAATGCCTTTAACTACTGTTTAATCCAGTCAACCGACAAAAGCCTCTTGGTCAAATTTAGTGAGTAGTGATCAGAGAGATTCTAATGATCAGGGAGATAATGTATGCAAAAATATATGTTGATG
AGAAGGTAAGTAGTCATATTAGTGTGG


>TRINITY_DN115749_c0_g1_i1 from sample A1 / Example unspliced isoform:
CATGTAACGTGTTGGATCTCTCATCGGACCAAAGCCCATTGACTTTCAACAATATTCTATATTCAATAATATTGTTTTATTTTACACACTGAATCACATACAGGGCGTGGGGCCGATACCGGCCCACGGCTTTGGTTAATGCCTGGTATCCAATACCTTCCACTCCAGTGGGACAGAGTCCACAAAATCAGTATAAGAGA
ATGCCCAGTACGCATTGGGACGTGTTAATTCTCATAATTTCCCGCCCTTCGGCAAGAACAGAGCAAAAGCCTCCACAGAGACCAGAAGAGAGACCAGAAGAAAGAATCAGAGGTTTGTAAATTTTGGTCTCATATCATATCGGTAATCCACTCAGGGACCAGGGCTGTTAAAAAGAAAGTAAGAAATGGAGGTCCCTGTG
ATTGATTTGGAGCCATACTTGAAATTCACGGGCAGATACGAATGCGGGTCTGACTCCAAAGGTGATCCAATCGACCCTGCCTGTAACCCAAATGGCGATCTCGAGCATAGTCCGGAGTTGAAGAGCTTATGCGAGAAAGTGGCGGAGTCTCTGAAGCAAACAGGGGCATTGGTGGTCAGAGATCCGAGGTGCCCAGCGGA
GGTTAACGACACGTTTCTGGACATGATGGAAACGTATTTTCAAAAATCAGTTGACTTCAAGCGCAAACAAGAGCGCCCGGATCTTCATTACCAGGTAGGAGTGACACCGGAAGGAGTTGAGTTGCCTAGAGCTGCAGTAGACAAAGAGATGCAAATGAAAATCCAAGACGTACCAGAGGAATATCGGCCCCATATTCCTG
TTGGTGCTGATCCCAAATGGAGATATATGTGGAGAGTGGGCCCTCGGCCATTGAAGACACGTTTTAGGGAATTAAATTCTGATCCTGTGGTGCCAGAGGGGTTCCCAGAGTGGGCGGATACAATGGATGGATGGGGTTCTACGATGATCTCTGCTGTTGAGGTTGTTGCGGAGATGGCAGGTATTGGGTTTGGGATTTCA
AAAGATTCATTTACGTCACTGATGCTACAGGGACCTCACTTGCTCGCTCCTACAGGGAGTGATCTTTCAAGGCATGGAAAAGAAGGGACTGTATTTGCAGGTTACCATTATGATCTTAACTTTCTAACTATCCACGGTCGCAGTAGATTCCCTGGACTCTACATTTGGTTGAGAAATGGTCAAAAAGTTGAAGTACGTGT
CCCCGTTGGGTGTCTGTTGATCCAAGCTGGAAAACAGgtagtaaggttcaacatttcactagttacaattatcaatttgagatttatggggaatccagattatggttctaacatattgatctggtttgcatttgctgctaagcagCTTGAGTGGCTTACAGGTGGTGATTGCCTGGCTGGAATGCATGAAGTTGTTGTCA
CTAAAAGAACTCTTGCAGCTATTGAAGCAGCAAGTCAGGCAGGAAAGAGCTTATGGAGGGTTTCCTCCACAGTTTTTGGACACATTGCCTCTGATGCAATCTTAGAACCACTTGGTCACTTTGCAAATTCACCTCTTGCACAAAACTATCCTCCCATTTGTGCTGGAGATTTCGTGGAGCTAGAACTTGCAGCCATAAAT
TTGAAGGGCAAGCAAGATGGTGTCTTAGATCTAGAAAATGGGAACTGTGAGCAAGAAACAGTGGGATAATATCCTCCCAAAGGTATCGATAATTCTTTGCAACTAGAAGAAAACCGGAATAGCCTCTGAAGATTATAATTGGTCTCTAAAGCTTGAAATTTCAGTTCTATTTACACTCTCTTCTACTTTGCTGCAATAAA
GAATTAAGTACACCGGTTCAGCTTACAGTCAATGTGTATAAATATTCTGATACAGTTTGGTACGTTGTATAAATATTCTGATACAATTTGGTACATTTGAGTTGTCGACAGCATGACTCATTTCTTGAACACAAAATGTGTAAACTGGACAACTATAAACTTCAATAATGTTCAAAAATCTGTATAATGCCTTTAACTAC
TGTTTAATCCAGTCAACCGACAAAAGCCTCTTGGTCAAATTTAGTGAGTAGTGATCAGAGAGATTCTAATGATCAGGGAGATAATGTATGCAAAAATATATGTTGATGAGAAGGTAAGTAGTCATATTAGTGTGG



Intron 2 GTGGTCCAGA ... ATCTGGGTAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A132.081081151
A230.5884837
A323.33921928
A425.27681523
A529.8240617
A632.5921134102
A736.6629243169
A835.4123929131
A929.3826232109
A1032.2721224101



>TRINITY_DN107291_c0_g2_i1 from sample A3 / Example spliced isoform
AAAGCCCATTGACTTTCAACAATGTTCTATATTCAATAATATTGTTTTATTTTACACACTGAATCACATACAGGGCGTGGGGCCGATACCGGCCCACGGCTTTGGTTAATGCCTGGTATCCAATACCTTCCACTCCAGTGGGACAGAGTCCACAAAATCAGTATAAGAGAATGCCCAGTACGCATTCGGACGTGTTAATT
CTCATAATTTCCCGCCCTTCGGCAAGAACAGAGCAAAAGCCTCCACAGAGACCAGAAGAAAGAATCAGAGGTTTGTAAATTTTGGTCTCATATCATATCGGTAATCCACTCAGGGACCAGGGCTGTTAAAAAGAAAGTAAGAAATGGAGGTCCCTGTGATTGATTTGGAGCCATACTTGAAATTCACGGGCAGATACGAA
TGCGGGTCTGACTCCAAAGGTGATCCAATCGACCCTGCCTGTAACCCAAATGGCGATCTCGAGCATAGTCCGGAGTTGAAGAGCTTATGCGAGAAAGTGGCGGAGTCTCTGAAGCAAACAGGGGCATTGGTGGTCAGAGACCCGAGGTGCCCAGCGGAGGTTAACGACATGTTTCTGGACATGATGGAAACGTATTTTCA
AAAATCAGTTGACTTCAAGCGCAAACAAGAGCGCCCGGATCTTCATTACCAGGTAGGAGTGACACCGGAAGGAGTTGAGTTGCCTAGAGCTGCAGTAGACAAAGAGATGCAAATGAAAATCCAAGACGTACCAGAGGAATATCGGCCCCATATTCCTGTTGGTGCTGATCCCAAATGGAGATATATGTGGAGAGTGGGCC
CTCGGCCATTGAAGACACGTTTTAGGGAATTAAATTCTGATCCTGTGGTGCCAGAGGGGTTCCCAGAGTGGGCGGATACAATGGATGGATGGGGTTCTACGATGATCTCTGCTGTTGAGGTTGTTGCGGAGATGGCAGGTATTGGGTTTGGGATTTCAAAAGATTCATTTACGTCACTGATGCTACAGGGACCTCACTTG
CTCGCTCCTACAGGGAGTGATCTTTCAAGGCATGGAAAAGAAGGGACTGTATTTGCAGGTTACCATTATGATCTTAACTTTCTAACTATCCACGGTCGCAGTAGATTCCCTGGACTCTACATTTGGTTGAGAAATGGTCAAAAAGTTGAAGTACGTGTCCCCGTTGGGTGTCTGTTGATCCAAGCTGGAAAACAGCTTGA
GTGGCTTACAGGTGGTGATTGCCTGGCTGGAATGCATGAAGTTGTTGTCACTAAAAGAACTCTTGCAGCTATTGAAGCAGCAAGTCAGGCAGGAAAGAGCTTATGGAGGGTTTCCTCCACAGTTTTTGGACACATTGCCTCTGATGCAATCTTAGAACCACTTGGTCACTTTGCAAATTCACCTCTTGCACAAAACTATC
CTCCCATTTGTGCTGGAGATTTCGTGGAGCTAGAACTTGCAGCCATAAATTTGAAGGGCAAGCAAGATGGTGTCTTAGATCTAGAAAATGGGAACTGTGAGCAAGAAACAGTGGGATAATATCCTCCCAAAGGTATCGATAATTCTTTGCAACTAGAAGAAAACCGGAATAGCCTCTGAAGATTATAATTGGTCTCTAAA
GCTTGAAATTTCAGTTCTATTTACACTCTCTTCTACTTTGCTGCAATAAAGAATTAAGTACACCGGTTCAGCTTACAGTCAATGTGTATAAATATTCTGATACAGTTTGGTACGTTGTATAAATATTCTGATACAATTTGGTACATTTGAGTTGTCGACAGCATGACTCATTTCTTGAACACAAAATGTGTAAACTGGAC
AACTATAAACTTCAATAATGTTCAAAAATCTGTATAATGCCTTTAACTACTGTTTAATCCAGTCAACCGACAAAAGCCTCTTGGTCAAATTTAGTGAGTAGTGATTAGAGAGATTCTAATGATCAGGGA


>TRINITY_DN107291_c0_g2_i2 from sample A3 / Example unspliced isoform:
AAAGCCCATTGACTTTCAACAATGTTCTATATTCAATAATATTGTTTTATTTTACACACTGAATCACATACAGGGCGTGGGGCCGATACCGGCCCACGGCTTTGGTTAATGCCTGGTATCCAATACCTTCCACTCCAGTGGGACAGAGTCCACAAAATCAGTATAAGAGAATGCCCAGTACGCATTCGGACGTGTTAATT
CTCATAATTTCCCGCCCTTCGGCAAGAACAGAGCAAAAGCCTCCACAGAGACCAGAAGAAAGAATCAGAGGTTTGTAAATTTTGGTCTCATATCATATCGGTAATCCACTCAGGGACCAGGGCTGTTAAAAAGAAAGTAAGAAATGGAGGTCCCTGTGATTGATTTGGAGCCATACTTGAAATTCACGGGCAGATACGAA
TGCGGGTCTGACTCCAAAGGTGATCCAATCGACCCTGCCTGTAACCCAAATGGCGATCTCGAGCATAGTCCGGAGTTGAAGAGCTTATGCGAGAAAGTGGCGGAGTCTCTGAAGCAAACAGGGGCATTGGTGGTCAGAGACCCGAGGTGCCCAGCGGAGGTTAACGACATGTTTCTGGACATGATGGAAACGTATTTTCA
AAAATCAGTTGACTTCAAGCGCAAACAAGAGCGCCCGGATCTTCATTACCAGGTAGGAGTGACACCGGAAGGAGTTGAGTTGCCTAGAGCTGCAGTAGACAAAGAGATGCAAATGAAAATCCAAGACGTACCAGAGGAATATCGGCCCCATATTCCTGTTGGTGCTGATCCCAAATGGAGATATATGTGGAGAGTGGGCC
CTCGGCCATTGAAGACACGTTTTAGGGAATTAAATTCTGATCCTGTGGTGCCAGAGGGGTTCCCAGAGTGGGCGGATACAATGGATGGATGGGGTTCTACGATGATCTCTGCTGTTGAGgtggtccagatagatggtttcttatttcttctcatattagttgtcttttcgattaattttttacaaatttttttgtcacat
tgtttatggctctttccagtatatttattcaattatctgggtagGTTGTTGCGGAGATGGCAGGTATTGGGTTTGGGATTTCAAAAGATTCATTTACGTCACTGATGCTACAGGGACCTCACTTGCTCGCTCCTACAGGGAGTGATCTTTCAAGGCATGGAAAAGAAGGGACTGTATTTGCAGGTTACCATTATGATCTT
AACTTTCTAACTATCCACGGTCGCAGTAGATTCCCTGGACTCTACATTTGGTTGAGAAATGGTCAAAAAGTTGAAGTACGTGTCCCCGTTGGGTGTCTGTTGATCCAAGCTGGAAAACAGCTTGAGTGGCTTACAGGTGGTGATTGCCTGGCTGGAATGCATGAAGTTGTTGTCACTAAAAGAACTCTTGCAGCTATTGA
AGCAGCAAGTCAGGCAGGAAAGAGCTTATGGAGGGTTTCCTCCACAGTTTTTGGACACATTGCCTCTGATGCAATCTTAGAACCACTTGGTCACTTTGCAAATTCACCTCTTGCACAAAACTATCCTCCCATTTGTGCTGGAGATTTCGTGGAGCTAGAACTTGCAGCCATAAATTTGAAGGGCAAGCAAGATGGTGTCT
TAGATCTAGAAAATGGGAACTGTGAGCAAGAAACAGTGGGATAATATCCTCCCAAAGGTATCGATAATTCTTTGCAACTAGAAGAAAACCGGAATAGCCTCTGAAGATTATAATTGGTCTCTAAAGCTTGAAATTTCAGTTCTATTTACACTCTCTTCTACTTTGCTGCAATAAAGAATTAAGTACACCGGTTCAGCTTA
CAGTCAATGTGTATAAATATTCTGATACAGTTTGGTACGTTGTATAAATATTCTGATACAATTTGGTACATTTGAGTTGTCGACAGCATGACTCATTTCTTGAACACAAAATGTGTAAACTGGACAACTATAAACTTCAATAATGTTCAAAAATCTGTATAATGCCTTTAACTACTGTTTAATCCAGTCAACCGACAAAA
GCCTCTTGGTCAAATTTAGTGAGTAGTGATTAGAGAGATTCTAATGATCAGGGA