sp|Q653S9|NCPR3_ORYSJ ----> NADPH--cytochrome P450 reductase 3
Intron 1 GTGAAGAAAT ... AAATTTGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 25.63 | 148 | 51 | 15 |
| A2 | 20.71 | 134 | 35 | 17.3 |
| A3 | 30.59 | 111.2 | 49 | 8.7 |
| A4 | 27.48 | 95 | 36 | 12.3 |
| A5 | 24.59 | 92 | 30 | 8.7 |
| A6 | 26.17 | 138.2 | 49 | 17 |
| A7 | 23.16 | 209 | 63 | 21.7 |
| A8 | 22.53 | 134.1 | 39 | 18.3 |
| A9 | 16.75 | 169 | 34 | 17.3 |
| A10 | 27.3 | 165.1 | 62 | 9.7 |
>TRINITY_DN114533_c0_g1_i4 from sample A1 / Example spliced isoformATAAAATTGAGGGATTTATCAGTAATACTGACGTAATTAAGTATTGGTGAGAAATCAATGGTAGTAGGTGCCAAGGGAAGATTCCGGATGCCTTACCTTGTGGTTTGGACAGAGGCCATCTAAGTGGTATTTAGTGGTGCATTTAGTGTTAATGGGAAATGGTAGGTGGATTTGACCCTTGGACCTCTGGTTGGTGAAAC
CCCCACTTATAAAGGCCAGACCTTTCCAGAGCTCCTGAGGCGACGTCGATAAGTCACAAGGAGCCAGGGTAGGTCTGAGGTGGACGAAAAGCTCCGGGGACAATAAAACTCGCCCGTCTTAGCAGGCAGGTCACAGGTTCGAATCGAATACCCGAGAGAGATCGTGTTTCTCGTCTCCTTACCCTGGTTTTCTTGATTCG
TCCGAATGCAGGCTAATTCGAACACCGTGGAGAGGGGCACCCAGGGCCTTGGGAAGAGCTTGCTGGAGATATCTCGGCTTGACCATGTTTTGGCCCTTTTCGTGAATGGCAAGGGGGATCTGGGGGGACTGATGGGGTCGGCGGTCGTTTTGAGGGAAAATTCGGAGCTTTTGATGGTCTTGACTACTTCTCTGGCTGTC
TTGTTTGCTTGCGTTTTGTTCTTTGTTTGGCGGAGAGGAGCTGCTCCCTCGAAGCTGCCAGAGAAGCCGACGCCTCTGGGGAGAGTAGAGGAAGAGGAGGAGGAGGAGGATGATTCCGGGAAAAAGAAAGTGACGGTTTTCTTTGGGACTCAGACCGGGACGGCTGAAGGATTTGCCAAGGCTCTGGCCGAGGAAGCCAA
AGCTAGGTATGACAAGGCTGTCTTTAAAGTAGTGGATCTGGATGATTATGCAGCAGATGATGATCAGTATGAAGAAAAGTTAAAGAAGGAAAAATTAGCATTTTTTATGCTCGCAACGTATGGAGATGGAGAGCCAACTGACAATGCAGCAAGGTTTTACAAGTGGTTTTCTGAGACGGAAAAAGAGAGAGGGCCTTGGC
TTTCTAACCTTACGTACGGGGTATTTGGTTTAGGCAACAGGCAGTATGAGCATTTCAATAAGGTGGCTTGCACAGTAGATGAAGCATTAAGTGAGCAAGGTGGGAAACGACTTGTTCAAATGGGCCTCGGTGATGATGATCAGTGCATTGAAGATGACTTTACTGCTTGGCGAGAGCAGGTTTGGCCTGAGCTAGATCAG
TTACTCCGTGACGAAGATGATCAGCCTTCAAGTGCTACAACTTATACAGCAGCTATACCTGAGTACCGGGTAGAAATCCATGATCCTTCAGTTTCGCTTTATGAGGAAACTTATGCAACACAGAATGGTCAAGCCATTTATGATATCCATCACCCTTGCCGAGCAAATGTAGCAGTGCGAAGGGAACTTCATACGCCATT
GTCTGACCGTTCTTGCATCCATTTGGAATTTGATATCTCAGGCACTGGCCTAACGTACGAGACTGGAGACCATGTTGGTGTCTATGCAGAAAACTTAAATGATACCGTGGAGGAAGCTGCAAAATTGTTAGGCTACCCACTAGACACAATAATTTCAGTCCATAGTGATAAAGAAGATGGTACGCCTCTTGGTGGAAGCT
CCTTGCCACCACCCTTCCCTGGTCCATGTACCCTGCAGACTGCTCTTGCTCGTTATGCAGATTTGTTGAATCCTCCTCGAAAGGCTGCCTTGGTTGCATTGGCTAGTCATGCATCTGATCCAGCTGAAGCAGAGAGGTTGAAGTTCCTTTCATCACCAGCCGGAAAGGATGAGTACTCCCAATGGATTACTGTGAGTCAA
AGAAGTCTTTTAGAAGTAATGGCGGAATTTCCTTCAGCAAAACCACCTCTTGGTGTCTTCTTTGCAGCAGTTGCCCCGCGTCTGCAACCTCGATATTATTCTATTTCTTCCTCTCCCAGGTATGCACCCAATAGAATACATGTCACATGTGCTCTGGTTTATGGGCCCAGTCCAACCGGCAGAATTCACAAAGGTGTTTG
TTCGAATTGGATGAAGAGTTCAGTGCCTTCTGAGAAAAGCCATGATTGTAGCTGGGCACCAGTCTATGTTAGACAGTCAAATTTCAAATTGCCATCAGATCCTTCAGTTCCTATTGTTATGGTGGGCCCTGGAACTGGTTTAGCACCTTTTAGAGGCTTTTTGCAGGAAAGAGCTGCACTTCAAGAATCTGGAGAGAAGC
TTGGGCCAGCTGTTCTTTTCTTTGGATGCAGGAATCGCCAAATGGATTACATATATGAAGATGAACTGAAGAGCTATGTGGAAAATGGTGTACTGACTGATCTTGTTCTTGCTTTCTCTCGCGAAGGAGCAACCAAAGAGTATGTGCAGCACAAGATTACAGAAAAGGGATCCTATATCTGGAATTTGATTGCTCAAGGT
GGCTATTTCTATGTATGTGGTGATGCCAAGGGCATGGCTAGGGATGTGCACAGGACACTACACAGTATTGTCCAAGAGCAGGTAAAGCTTGTTGCTTGGTTGCTTTTTACTGAATATCACCATACTGTTTCTATTCTAATCATAGGACACTACAGACTATTGTCGAAGAGCAGGTAATGATTGTGGCTTGG
>TRINITY_DN114533_c0_g1_i9 from sample A1 / Example unspliced isoform:ATAAAATTGAGGGATTTATCAGTAATACTGACGTAATTAAGTATTGGTGAGAAATCAATGGTAGTAGGTGCCAAGGGAAGATTCCGGATGCCTTACCTTGTGGTTTGGACAGAGGCCATCTAAGTGGTATTTAGTGGTGCATTTAGTGTTAATGGGAAATGGTAGGTGGATTTGACCCTTGGACCTCTGGTTGGTGAAAC
CCCCACTTATAAAGGCCAGACCTTTCCAGAGCTCCTGAGGCGACGTCGATAAGTCACAAGGAGCCAGGGTAGGTCTGAGGTGGACGAAAAGCTCCGGGGACAATAAAACTCGCCCGTCTTAGCAGGCAGGTCACAGGTTCGAATCGAATACCCGAGAGAGATCGTGTTTCTCGTCTCCTTACCCTGGTTTTCTTGATTCG
TCCGAATGCAGGCTAATTCGAACACCGTGGAGAGGGGCACCCAGGGCCTTGGGAAGAGCTTGCTGGAGATATCTCGGCTTGACCATGTTTTGGCCCTTTTCGTGAATGGCAAGGGGGATCTGGGGGGACTGATGGGGTCGGCGGTCGTTTTGAGGGAAAATTCGGAGCTTTTGATGGTCTTGACTACTTCTCTGGCTGTC
TTGTTTGCTTGCGTTTTGTTCTTTGTTTGGCGGAGAGGAGCTGCTCCCTCGAAGCTGCCAGAGAAGCCGACGCCTCTGGGGAGAGTAGAGGAAGAGGAGGAGGAGGAGGATGATTCCGGGAAAAAGAAAGTGACGGTTTTCTTTGGGACTCAGACCGGGACGGCTGAAGGATTTGCCAAGGCTCTGGCCGAGGAAGCCAA
AGCTAGGTATGACAAGGCTGTCTTTAAAGTAGTGGATCTGGATGATTATGCAGCAGATGATGATCAGTATGAAGAAAAGTTAAAGAAGGAAAAATTAGCATTTTTTATGCTCGCAACGTATGGAGATGGAGAGCCAACTGACAATGCAGCAAGGTTTTACAAGTGGTTTTCTGAGACGGAAAAAGAGAGAGGGCCTTGGC
TTTCTAACCTTACGTACGGGGTATTTGGTTTAGGCAACAGGCAGTATGAGCATTTCAATAAGGTGGCTTGCACAGTAGATGAAGCATTAAGTGAGCAAGGTGGGAAACGACTTGTTCAAATGGGCCTCGGTGATGATGATCAGTGCATTGAAGATGACTTTACTGCTTGGCGAGAGCAGGTTTGGCCTGAGCTAGATCAG
TTACTCCGTGACGAAGATGATCAGCCTTCAAGTGCTACAACTTATACAGCAGCTATACCTGAGTACCGGGTAGAAATCCATGATCCTTCAGTTTCGCTTTATGAGGAAACTTATGCAACACAGAATGGTCAAGCCATTTATGATATCCATCACCCTTGCCGAGCAAATGTAGCAGTGCGAAGGGAACTTCATACGCCATT
GTCTGACCGTTCTTGCATCCATTTGGAATTTGATATCTCAGGCACTGGCCTAACGTACGAGACTGGAGACCATGTTGGTGTCTATGCAGAAAACTTAAATGATACCGTGGAGGAAGCTGCAAAATTGTTAGGCTACCCACTAGACACAATAATTTCAGTCCATAGTGATAAAGAAGATGGTACGCCTCTTGGTGGAAGCT
CCTTGCCACCACCCTTCCCTGGTCCATGTACCCTGCAGACTGCTCTTGCTCGTTATGCAGATTTGTTGAATCCTCCTCGAAAGGCTGCCTTGGTTGCATTGGCTAGTCATGCATCTGATCCAGCTGAAGCAGAGAGGTTGAAGTTCCTTTCATCACCAGCCGGAAAGGATGAGTACTCCCAATGGATTACTGTGAGTCAA
AGAAGTCTTTTAGAAGTAATGGCGGAATTTCCTTCAGCAAAACCACCTCTTGGTGTCTTCTTTGCAGCAGTTGCCCCGCGTCTGCAACCTCGATATTATTCTATTTCTTCCTCTCCCAGgtgaagaaatttctgaggcatgtttcttgaggttaaatcatggttttcagcatttaaaaactgcatatggtgtcttcaatt
aagtttgttgttatagcataaattcacatcccactgcaacctcaatattattatatttcttcctcacacaggtgaagaaatttctgaaacctgtctcttgaggttaaatttttgttttgagcatttaaaaactgcatgtggtgtcttgattaagtttgtttgtatagcctaaattcaaatccaaacttgtctcaatcttc
aaaatttgcagGTATGCACCCAATAGAATACATGTCACATGTGCTCTGGTTTATGGGCCCAGTCCAACCGGCAGAATTCACAAAGGTGTTTGTTCGAATTGGATGAAGAGTTCAGTGCCTTCTGAGAAAAGCCATGATTGTAGCTGGGCACCAGTCTATGTTAGACAGTCAAATTTCAAATTGCCATCAGATCCTTCAGT
TCCTATTGTTATGGTGGGCCCTGGAACTGGTTTAGCACCTTTTAGAGGCTTTTTGCAGGAAAGAGCTGCACTTCAAGAATCTGGAGAGAAGCTTGGGCCAGCTGTTCTTTTCTTTGGATGCAGGAATCGCCAAATGGATTACATATATGAAGATGAACTGAAGAGCTATGTGGAAAATGGTGTACTGACTGATCTTGTTC
TTGCTTTCTCTCGCGAAGGAGCAACCAAAGAGTATGTGCAGCACAAGATTACAGAAAAGGGATCCTATATCTGGAATTTGATTGCTCAAGGTGGCTATTTCTATGTATGTGGTGATGCCAAGGGCATGGCTAGGGATGTGCACAGGACACTACACAGTATTGTCCAAGAGCAGGAATCCGTGAATAGCACCAGCGCAGAG
GCCACAGTGAAGAAATTACAGACAGAAGGAAGATATTTACGAGATGTATGGTAATTGAGTGAATTTTGCTCTAGGTCAGTTCAATCTCATCTCGTGCAGAATTGGTAAGAAGATTGAGGAAAAGAGAAAGCTTAGCCAAGTATTTATTTGGGAAAAGAAATCTCTTGGCAAACTAATGCTTAAGTTCATTTACCACGGAA
TTGTGGGATTCTTTACACCTTCAAATACTGCATTCCAGGATTTGCTATCACTGTGGTCATCAAATTTTCTAGCACCGGTATAACATTAGTACTGGTCTAGAATTGTATTCTTAATTCATTTGTGTCTAAGAGTTTAGTACCAGCAAAGTTAAATATCATGCCCTTCGGTTAGAGGACAACTCTCCACGTTATAGAATTTT
TAATATATCTTGGTATGATCTTTGCATACCATACTTGACCTTCTTCTCATTATCTATATGGGAAGGGATTCCTTTCCAGTTTGATGTTGTGTTTCTCTTCCTTCTATAATGGCATATAAGAATCGATACTGGATTGAAGCATTCAGTGTCTCATGATACAGTGGATGACTTTGAACTTTGAGGTGTCTGAATATTGATGT
TCTAGATGAATATCAGATAGTTGATATATCTAATTCCCTTGTATGGATACAATCTTTTTCCAACACTGTTTCATTACAGTTCAGAACAATCCTAAATTTGATGCATCTGTATAATATGTCGCTCATGGAAAACAGCTGCTATATTGAAAATACTTGATTTTAGAATTCTTCAGATAAGGAGTATAAATCCAAGGCATTTT
ATTCAGTGTACACCTTGAGAAACTCCTTACACCTGAAAGCAGACGGGTATTTATTTTGTACGTTTGAGAACTTGGTAGTTATTATTATAGCTTTACTCTTAATCTGCAAAAAAA
Intron 2 GTACGTTTAG ... ATTTTTCTAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 91.67 | 1 | 11 | 2 |
| A2 | 100 | 0 | 8 | 1 |
| A3 | 77.78 | 2 | 7 | 2 |
| A4 | 100 | 0 | 1 | 3 |
| A5 | 75 | 2 | 6 | 0 |
| A6 | 50 | 1 | 1 | 1 |
| A7 | 66.67 | 3 | 6 | 2 |
| A8 | 93.75 | 1 | 15 | 3 |
| A9 | 0 | 2 | 0 | 1 |
| A10 | 0 | 1 | 0 | 1 |
>TRINITY_DN44784_c0_g2_i15 from sample A8 / Example spliced isoformAGGGAAGATTCCGGATGCCTTACCTTGTGGTTTGGACAGAGGCCATCTAAGTGGTATTTAGTGGTGCATTTAGTGTTAATGGGAAATGGTAGGTGGATTTGACCCTTGGACCTCTGGTTGGTGAAACCCCCACTTATAAAGGCCAGACCTTTCCAGAGCTCCTGAGGCGACGTCGATAAGTCACAAGGAGCCAGGGTAGG
TCTGAGGTGGACGAAAAGCTCCGGGGACAATAAAACTCGCCCGTCTTAGCAGGCAGGTCACAGGTTCGAATCGAATACCCGAGAGAGATCGTGTTTCTCGTCTCCTTACCCTGGTTTTCTTGATTCGTCCGAATGCAGGCTAATTCGAACACCGTGGAGAGGGGCACCCAGGGCCTTGGGAAGAGCTTGCTGGAGATATC
TCGGCTTGACCATGTTTTGGCCCTTTTCGTGAATGGCAAGGGGGATCTGGGGGGACTGATGGGGTCGGCGGTCGTTTTGAGGGAAAATTCGGAGCTTTTGATGGTCTTGACTACTTCTCTGGCTGTCTTGTTTGCTTGCGTTTTGTTCTTTGTTTGGCGGAGAGGAGCTGCTCCCTCGAAGCTGCCAGAGAAGCCGACGC
CTCTGGGGAGAGTAGAGGAAGAGGAGGAGGAGGAGGATGATTCCGGGAAAAAGAAAGTGACGGTTTTCTTTGGGACTCAGACCGGGACGGCTGAAGGATTTGCCAAGGCTCTGGCCGAGGAAGCCAAAGCTAGGTATGACAAGGCTGTCTTTAAAGTAGTGGATCTGGATGATTATGCAGCAGATGATGATCAGTATGAA
GAAAAGTTAAAGAAGGAAAAATTAGCATTTTTTATGCTCGCAACGTATGGAGATGGAGAGCCAACTGACAATGCAGCAAGGTTTTACAAGTGGTTTTCTGAGACGGAAAAAGAGAGAGGGCCTTGGCTTTCTAACCTTACGTACGGGGTATTTGGTTTAGGCAACAGGCAGTATGAGCATTTCAATAAGGTGGCTTGCAC
AGTAGATGAAGCATTAAGTGAGCAAGGTGGGAAACGACTTGTTCAAATGGGCCTCGGTGATGATGATCAGTGCATTGAAGATGACTTTACTGCTTGGCGAGAGCAGGTTTGGCCTGAGCTAGATCAGTTACTCCGTGACGAAGATGATCAGCCTTCAAGTGCTACAACTTATACAGCAGCTATACCTGAGTACCGGGTAG
AAATCCATGATCCTTCAGTTTCGCTTTATGAGGAAACTTATGCAACACAGAATGGTCAAGCCATTTATGATATCCATCACCCTTGCCGAGCAAATGTAGCAGTGCGAAGGGAACTTCATACGCCATTGTCTGACCGTTCTTGCATCCATTTGGAATTTGATATCTCAGGCACTGGCCTAACGTACGAGACTGGAGACCAT
GTTGGTGTCTATGCAGAAAACTTAAATGATACCGTGGAGGAAGCTGCAAAATTGTTAGGCTACCCACTAGACACAATAATTTCAGTCCATAGTGATAAAGAAGATGGTACGCCTCTTGGTGGAAGCTCCTTGCCACCACCCTTCCCTGGTCCATGTACCCTGCAGACTGCTCTTGCTCGTTATGCAGATTTGTTGAATCC
TCCTCGAAAGGCTGCCTTGGTTGCATTGGCTAGTCATGCATCTGATCCAGCTGAAGCAGAGAGGTTGAAGTTCCTTTCATCACCAGCCGGAAAGGATGAGTACTCCCAATGGATTACTGTGAGTCAAAGAAGTCTTTTAGAAGTAATGGCGGAATTTCCTTCAGCAAAACCACCTCTTGGTGTCTTCTTTGCAGCAGTTG
CCCCGCGTCTGCAACCTCGATATTATTCTATTTCTTCCTCTCCCAGGTATGCACCCAATAGAATACATGTCACATGTGCTCTGGTTTATGGGCCCAGTCCAACCGGCAGAATTCACAAAGGTGTTTGTTCGAATTGGATGAAGAGTTCAGTGCCTTCTGAGAAAAGCCATGATTGTAGCTGGGCACCAGTCTATGTTAGA
CAGTCAAATTTCAAATTGCCATCAGATCCTTCAGTTCCTATTGTTATGGTGGGCCCTGGAACTGGTTTAGCACCTTTTAGAGGCTTTTTGCAGGCAAGATCTGCACTTCAAGAATACGGAGAGAAGCTTGGGCCAGCTGTTCTTTTCTTTGGATGCAGAAATCGCTAAATGGAGCAACTAAAGAGTATGTGCAGCACAAG
ATTACAGAGAAGGATTATTTCGAGCAGATGAGGAAGGAACAACAAAAGGTGCTTCAGGAAAAACAGAAA
>TRINITY_DN44784_c0_g2_i3 from sample A8 / Example unspliced isoform:CCGGACCTAACCGGACCGGTTCAATACCAAACCGGACCTAACCGGACCGGTTCATTACCAAACCAGACCTAACCGGATCTAACCGGACCAGTTCATTACCAAACTGGCCGGCCAGCTAAAAAACACGCCTGCGGGCCCAAAATCAGGTTTTTCAATTTTTACATTAAAAAACTCATATAGTATGAATTCCTATGATATTA
ATGATATATCCCAAGCAAGAAATTTACATTAAAAATTACCTTACAGCCTATGAAATTTAAAACATTAACTCAGCGGCGAGAATGTTTACTGGCTGGTATTATTGCTATTAAAGTCATGGATTTGTGGATGTATGTGTGATGCGTATGTCTTTATTTAGTGAAAATATTTCGAATACTTATGGTTATTTATCCTTTATAGG
TCCTAAATACAAGATGAATTCGAGATTGTGATGTGCTCTTTTTTCTATCATATTGAAAATTTGAAAGTTTATATGAGTAGACTTTACATATTATGTGTCTAATGGTTTCAAATATACATATTATGTGTCTAATGGTTTCTGAAATATAGCTTGGAATGTTAAATATAATTTTTATGATTAAAATTGTAATTTTTTTTGTA
TTTTTAATTGTCCGGTTCATTGAAATCAAACGCTCCAGTTCATTACCGGTTCCGGTTCCGGTCCAAGTTTACTCCTGACCGGTTTGATTCCCGGTTCCGGTTTTTAAAACATTGGAACTGAAGAGCTGTGTGGAAAATGGTGTATTGATTGATCTTGTTCTTTCTTTCTCTCGTGAAGGAGCAACTAAAGAGTATGTGCA
GCACAAGATTACAGAGAAGgtacgtttagttcttttctgaaatagtttatatattagttctttgtatgcaacagtttattgatgccacttctgcgtacaaggatcctatatccggaatctgatttctcaaggtggctctctctatctgattgcagtttgctaattatttttctagGATTATTTCGAGCAGATGAGGAAGG
AACAACAAAAGGTGCTTCAGGAAAAACAGAAA
Intron 3 GCAGGTCACA ... CCGAATGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 90.93 | 45 | 499 | 403 |
| A2 | 90.39 | 50 | 516 | 425 |
| A3 | 90.26 | 57 | 560 | 497 |
| A4 | 87.87 | 49 | 380 | 330 |
| A5 | 93.39 | 25 | 373 | 334 |
| A6 | 92.59 | 12 | 148 | 152 |
| A7 | 85.44 | 60 | 351 | 353 |
| A8 | 81.43 | 22 | 101 | 92 |
| A9 | 84.81 | 65 | 352 | 374 |
| A10 | 89.53 | 52 | 431 | 458 |
>TRINITY_DN104227_c0_g2_i3 from sample A4 / Example spliced isoformATTTATCAGTAATACTGACGTAATTAAGTATTGGTGAGAAATCAATGGTAGTAGGTGCCAAGGGAAGATTCCGGATGCCTTACCTTGTGGTTTGGACAGAGGCCATCTAAGTGGTATTTAGTGGTGCATTTAGTGTTAATGGGAAATGGTAGGTGGATTTGACCCTTGGACCTCTGGTTGGTGAAACCCCCACTTATAAA
GGCCAGACCTTTCCAGAGCTCCTGGGGCGACGTCGATAAGTCACAAGGAGCCAGGGTAGGTCTGAGGTGGACGAAAAGCTCCGGGGACAATAAAACTCGCCCGTCTTAGCAGGCTAATTCGAACACCGTGGAGAGGGGCACCCAGGGCCTTGGGAAGAGCTTGCTGGAGATATCTCGGCTTGACCATGTTTTGGCCCTTT
TCGTGAATGGCAAGGGGGATCTGGGGGGACTGATGGGGTCGGCGGTCGTTTTGAGGGAAAATTCGGAGCTTTTGATGGTCTTGACTACTTCTCTGGCTGTCTTGTTTGCTTGCGTTTTGTTCTTTGTTTGGCGGAGAGGAGCTGCTCCCTCGAAGCTGCCAGAGAAGCCGACGCCTCTGGGGAGAGTAGAGGAAGAGGAG
GAGGAGGAGGATGATTCCGGGAAAAAGAAAGTGACGGTTTTCTTTGGGACTCAGACCGGGACGGCTGAAGGATTTGCCAAGGCTCTGGCCGAGGAAGCCAAAGCTAGGTATGACAAGGCTGTCTTTAAAGTAGTGGATCTGGATGATTATGCAGCAGATGATGATCAGTATGAAGAAAAGTTAAAGAAGGAAAAATTAGC
ATTTTTTATGCTCGCAACGTATGGAGATGGAGAGCCAACTGACAATGCAGCAAGGTTTTACAAGTGGTTTTCTGAGACGGAAAAAGAGAGAGGGCCTTGGCTTTCTAACCTTACGTACGGGGTATTTGGTTTAGGCAACAGGCAGTATGAGCATTTCAATAAGGTGGCTTGCACAGTAGATGAAGCATTAAGTGAGCAAG
GTGGGAAACGACTTGTTCAAATGGGCCTCGGTGATGATGATCAGTGCATTGAAGATGACTTTACTGCTTGGCGAGAGCAGGTTTGGCCTGAGCTAGATCAGTTACTCCGTGACGAAGATGATCAGCCTTCAAGTGCTACAACTTATACAGCAGCTATACCTGAGTACCGGGTAGAAATCCATGATCCTTCAGTTTCGCTT
TATGAGGAAACTTATGCAACACAGAATGGTCAAGCCATTTATGATATCCATCACCCTTGCCGAGCAAATGTAGCAGTGCGAAGGGAACTTCATACGCCATTGTCTGACCGTTCTTGCATCCATTTGGAATTTGATATCTCAGGCACTGGCCTAACGTACGAGACTGGAGACCATGTTGGTGTCTATGCAGAAAACTTAAA
TGATACCGTGGAGGAAGCTGCAAAATTGTTAGGCTACCCACTAGACACAATAATTTCAGTCCATAGTGATAAAGAAGATGGTACGCCTCTTGGTGGAAGCTCCTTGCCACCACCCTTCCCTGGTCCATGTACCCTGCAGACTGCTCTTGCTCGTTATGCAGATTTGTTGAATCCTCCTCGAAAGGCTGCCTTGGTTGCAT
TGGCTAGTCATGCATCTGATCCAGCTGAAGCAGAGAGGTTGAAGTTCCTTTCATCACCAGCCGGAAAGGATGAGTACTCCCAATGGATTACTGTGAGTCAAAGAAGTCTTTTAGAAGTAATGGCGGAATTTCCTTCAGCAAAACCACCTCTTGGTGTCTTCTTTGCAGCAGTTGCCCCGCGTCTGCAACCTCGATATTAT
TCTATTTCTTCCTCTCCCAGGTATGCACCCAATAGAATACATGTCACATGTGCTCTGGTTTATGGGCCCAGTCCAACCGGCAGAATTCACAAAGGTGTTTGTTCGAATTGGATGAAGAGTTCAGTGCCTTCTGAGAAAAGCCATGATTGTAGCTGGGCACCAGTCTATGTTAGACAGTCAAATTTCAAATTGCCATCAGA
TCCTTCAGTTCCTATTGTTATGGTGGGCCCTGGAACTGGTTTAGCACCTTTTAGAGGCTTTTTGCAGGAAAGAGCTGCACTTCAAGAATCTGGAGAGAAGCTTGGGCCAGCTGTTCTTTTCTTTGGATGCAGGAATCGCCAAATGGATTACATATATGAAGATGAACTGAAGAGCTATGTGGAAAATGGTGTACTGACTG
ATCTTGTTCTTGCTTTCTCTCGCGAAGGAGCAACCAAAGAGTATGTGCAGCACAAGATTACAGAAAAGGGATCCTATATCTGGAATTTGATTGCTCAAGGTGGCTATTTCTATGTATGTGGTGATGCCAAGGGCATGGCTAGGGATGTGCACAGGACACTACACAGTATTGTCCAAGAGCAGGAATCCGTGAATAGCACC
AGCGCAGAGGCCACAGTGAAGAAATTACAGACAGAAGGAAGATATTTACGAGATGTATGGTAATTGAGTGAATTTTGCTCTAGGTCAGTTCAATCTCATCTCGTGCAGAATTGGTAAGAAGATTGAGGAAAAGAGAAAGCTTAGCCAAGTATTTATTTGGGAAAAGAAATCTCTTGGCAAACTAATGCTTAAGTTCATTT
ACCACGGAATTGTGGGATTCTTTACACCTTCAAATACTGCATTCCAGGATTTGCTATCACTGTGGTCATCAAATTTTCTAGCACCGGTATAACATTAGTACTGGTCTAGAATTGTATTCTTAATTCATTTGTGTCTAAGAGTTTAGTACCAGCAAAGTTAAATATCATGCCCTTCGGTTAGAGGACAACTCTCCACGTTA
TAGAATTTTTAATATATCTTGGTATGATCTTTGCATACCATACTTGACCTTCTTCTCATTATCTATATGGGAAGGGATTCCTTTCCAGTTTGATGTTGTGTTTCTCTTCCTTCTATAATGGCATATAAGAATCGATACTGGATTGAAGCATTCAGTGTCTCATGATACAGTGGATGACTTTGAACTTTGAGGTGTCTGAA
TATTGATGTTCTAGATGAATATCAGATAGTTGATATATCTAATTCCCTTGTATGGATACAATCTTTTTCCAACACTGTTTCATTACAGTTCAGAACAATCCTAAATTTGATGCATCTGTATAATATGTCGCTCATGGAAAACAGCTGCTATATTGAAAATACTTGATTTTAGAATTCTTCAGATAAGGAGTATAAATCCA
AGGCATTTTATTCAGTGTACACCTTGAGAAACTCCTTACACCTGAAAGCAGACGGGTATTTATTTTGTACGTTTGAGAACTTGGTAGTTATTATTATAGCTTTAC
>TRINITY_DN104227_c0_g2_i1 from sample A4 / Example unspliced isoform:ATTTATCAGTAATACTGACGTAATTAAGTATTGGTGAGAAATCAATGGTAGTAGGTGCCAAGGGAAGATTCCGGATGCCTTACCTTGTGGTTTGGACAGAGGCCATCTAAGTGGTATTTAGTGGTGCATTTAGTGTTAATGGGAAATGGTAGGTGGATTTGACCCTTGGACCTCTGGTTGGTGAAACCCCCACTTATAAA
GGCCAGACCTTTCCAGAGCTCCTGGGGCGACGTCGATAAGTCACAAGGAGCCAGGGTAGGTCTGAGGTGGACGAAAAGCTCCGGGGACAATAAAACTCGCCCGTCTTAGCAGgcaggtcacaggttcgaatcgaatacccgagagagatcgtgtttctcgtctccttaccctggttttcttgattcgtccgaatgcagGC
TAATTCGAACACCGTGGAGAGGGGCACCCAGGGCCTTGGGAAGAGCTTGCTGGAGATATCTCGGCTTGACCATGTTTTGGCCCTTTTCGTGAATGGCAAGGGGGATCTGGGGGGACTGATGGGGTCGGCGGTCGTTTTGAGGGAAAATTCGGAGCTTTTGATGGTCTTGACTACTTCTCTGGCTGTCTTGTTTGCTTGCG
TTTTGTTCTTTGTTTGGCGGAGAGGAGCTGCTCCCTCGAAGCTGCCAGAGAAGCCGACGCCTCTGGGGAGAGTAGAGGAAGAGGAGGAGGAGGAGGATGATTCCGGGAAAAAGAAAGTGACGGTTTTCTTTGGGACTCAGACCGGGACGGCTGAAGGATTTGCCAAGGCTCTGGCCGAGGAAGCCAAAGCTAGGTATGAC
AAGGCTGTCTTTAAAGTAGTGGATCTGGATGATTATGCAGCAGATGATGATCAGTATGAAGAAAAGTTAAAGAAGGAAAAATTAGCATTTTTTATGCTCGCAACGTATGGAGATGGAGAGCCAACTGACAATGCAGCAAGGTTTTACAAGTGGTTTTCTGAGACGGAAAAAGAGAGAGGGCCTTGGCTTTCTAACCTTAC
GTACGGGGTATTTGGTTTAGGCAACAGGCAGTATGAGCATTTCAATAAGGTGGCTTGCACAGTAGATGAAGCATTAAGTGAGCAAGGTGGGAAACGACTTGTTCAAATGGGCCTCGGTGATGATGATCAGTGCATTGAAGATGACTTTACTGCTTGGCGAGAGCAGGTTTGGCCTGAGCTAGATCAGTTACTCCGTGACG
AAGATGATCAGCCTTCAAGTGCTACAACTTATACAGCAGCTATACCTGAGTACCGGGTAGAAATCCATGATCCTTCAGTTTCGCTTTATGAGGAAACTTATGCAACACAGAATGGTCAAGCCATTTATGATATCCATCACCCTTGCCGAGCAAATGTAGCAGTGCGAAGGGAACTTCATACGCCATTGTCTGACCGTTCT
TGCATCCATTTGGAATTTGATATCTCAGGCACTGGCCTAACGTACGAGACTGGAGACCATGTTGGTGTCTATGCAGAAAACTTAAATGATACCGTGGAGGAAGCTGCAAAATTGTTAGGCTACCCACTAGACACAATAATTTCAGTCCATAGTGATAAAGAAGATGGTACGCCTCTTGGTGGAAGCTCCTTGCCACCACC
CTTCCCTGGTCCATGTACCCTGCAGACTGCTCTTGCTCGTTATGCAGATTTGTTGAATCCTCCTCGAAAGGCTGCCTTGGTTGCATTGGCTAGTCATGCATCTGATCCAGCTGAAGCAGAGAGGTTGAAGTTCCTTTCATCACCAGCCGGAAAGGATGAGTACTCCCAATGGATTACTGTGAGTCAAAGAAGTCTTTTAG
AAGTAATGGCGGAATTTCCTTCAGCAAAACCACCTCTTGGTGTCTTCTTTGCAGCAGTTGCCCCGCGTCTGCAACCTCGATATTATTCTATTTCTTCCTCTCCCAGGTGAAGAAATTTCTGAGGCATGTTTCTTGAGGTTAAATCATGGTTTTCAGCATTTAAAAACTGCATATGGTGTCTTCAATTAAGTTTGTTGTTA
TAGCATAAATTCACATCCCACTGCAACCTCAATATTATTATATTTCTTCCTCACACAGGTGAAGAAATTTCTGAAACCTGTCTCTTGAGGTTAAATTTTTGTTTTGAGCATTTAAAAACTGCATGTGGTGTCTTGATTAAGTTTGTTTGTATAGCCTAAATTCAAATCCAAACTTGTCTCAATCTTCAAAATTTGCAGGT
ATGCACCCAATAGAATACATGTCACATGTGCTCTGGTTTATGGGCCCAGTCCAACCGGCAGAATTCACAAAGGTGTTTGTTCGAATTGGATGAAGGTATGTCATTCTATGTGTAACCACTTATATTTACCAGTTGAAAATGGGTTCATGCTTAATATAATGGATGCTGCTTAGACTGAAGGAATTGGAAAACCTTGACAG
AGTTCAGTGCCTTCTGAGAAAAGCCATGATTGTAGCTGGGCACCAGTCTATGTTAGACAGTCAAATTTCAAATTGCCATCAGATCCTTCAGTTCCTATTGTTATGGTGGGCCCTGGAACTGGTTTAGCACCTTTTAGAGGCTTTTTGCAGGAAAGAGCTGCACTTCAAGAATCTGGAGAGAAGCTTGGGCCAGCTGTTCT
TTTCTTTGGATGCAGGAATCGCCAAATGGATTACATATATGAAGATGAACTGAAGAGCTATGTGGAAAATGGTGTACTGACTGATCTTGTTCTTGCTTTCTCTCGCGAAGGAGCAACCAAAGAGTATGTGCAGCACAAGATTACAGAAAAGGGATCCTATATCTGGAATTTGATTGCTCAAGGTGGCTATTTCTATGTAT
GTGGTGATGCCAAGGGCATGGCTAGGGATGTGCACAGGACACTACACAGTATTGTCCAAGAGCAGGAATCCGTGAATAGCACCAGCGCAGAGGCCACAGTGAAGAAATTACAGACAGAAGGAAGATATTTACGAGATGTATGGTAATTGAGTGAATTTTGCTCTAGGTCAGTTCAATCTCATCTCGTGCAGAATTGGTAA
GAAGATTGAGGAAAAGAGAAAGCTTAGCCAAGTATTTATTTGGGAAAAGAAATCTCTTGGCAAACTAATGCTTAAGTTCATTTACCACGGAATTGTGGGATTCTTTACACCTTCAAATACTGCATTCCAGGATTTGCTATCACTGTGGTCATCAAATTTTCTAGCACCGGTATAACATTAGTACTGGTCTAGAATTGTAT
TCTTAATTCATTTGTGTCTAAGAGTTTAGTACCAGCAAAGTTAAATATCATGCCCTTCGGTTAGAGGACAACTCTCCACGTTATAGAATTTTTAATATATCTTGGTATGATCTTTGCATACCATACTTGACCTTCTTCTCATTATCTATATGGGAAGGGATTCCTTTCCAGTTTGATGTTGTGTTTCTCTTCCTTCTATA
ATGGCATATAAGAATCGATACTGGATTGAAGCATTCAGTGTCTCATGATACAGTGGATGACTTTGAACTTTGAGGTGTCTGAATATTGATGTTCTAGATGAATATCAGATAGTTGATATATCTAATTCCCTTGTATGGATACAATCTTTTTCCAACACTGTTTCATTACAGTTCAGAACAATCCTAAATTTGATGCATCT
GTATAATATGTCGCTCATGGAAAACAGCTGCTATATTGAAAATACTTGATTTTAGAATTCTTCAGATAAGGAGTATAAATCCAAGGCATTTTATTCAGTGTACACCTTGAGAAACTCCTTACACCTGAAAGCAGACGGGTATTTATTTTGTACGTTTGAGAACTTGGTAGTTATTATTATAGCTTTAC
Intron 4 GTAAATTGTT ... ATTTGACCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 10.91 | 197 | 0 | 23 |
| A2 | 14.15 | 175 | 2 | 27 |
| A3 | 15.88 | 203.3 | 0 | 37 |
| A4 | 16.67 | 185.5 | 3 | 35 |
| A5 | 21.18 | 128 | 6 | 33 |
| A6 | 16.05 | 74 | 0 | 13 |
| A7 | 15.42 | 223.8 | 0 | 39 |
| A8 | 17.51 | 74.5 | 0 | 15 |
| A9 | 16.69 | 200.3 | 0 | 38 |
| A10 | 13.16 | 197.3 | 0 | 28 |
>TRINITY_DN104227_c0_g2_i3 from sample A4 / Example spliced isoformATTTATCAGTAATACTGACGTAATTAAGTATTGGTGAGAAATCAATGGTAGTAGGTGCCAAGGGAAGATTCCGGATGCCTTACCTTGTGGTTTGGACAGAGGCCATCTAAGTGGTATTTAGTGGTGCATTTAGTGTTAATGGGAAATGGTAGGTGGATTTGACCCTTGGACCTCTGGTTGGTGAAACCCCCACTTATAAA
GGCCAGACCTTTCCAGAGCTCCTGGGGCGACGTCGATAAGTCACAAGGAGCCAGGGTAGGTCTGAGGTGGACGAAAAGCTCCGGGGACAATAAAACTCGCCCGTCTTAGCAGGCTAATTCGAACACCGTGGAGAGGGGCACCCAGGGCCTTGGGAAGAGCTTGCTGGAGATATCTCGGCTTGACCATGTTTTGGCCCTTT
TCGTGAATGGCAAGGGGGATCTGGGGGGACTGATGGGGTCGGCGGTCGTTTTGAGGGAAAATTCGGAGCTTTTGATGGTCTTGACTACTTCTCTGGCTGTCTTGTTTGCTTGCGTTTTGTTCTTTGTTTGGCGGAGAGGAGCTGCTCCCTCGAAGCTGCCAGAGAAGCCGACGCCTCTGGGGAGAGTAGAGGAAGAGGAG
GAGGAGGAGGATGATTCCGGGAAAAAGAAAGTGACGGTTTTCTTTGGGACTCAGACCGGGACGGCTGAAGGATTTGCCAAGGCTCTGGCCGAGGAAGCCAAAGCTAGGTATGACAAGGCTGTCTTTAAAGTAGTGGATCTGGATGATTATGCAGCAGATGATGATCAGTATGAAGAAAAGTTAAAGAAGGAAAAATTAGC
ATTTTTTATGCTCGCAACGTATGGAGATGGAGAGCCAACTGACAATGCAGCAAGGTTTTACAAGTGGTTTTCTGAGACGGAAAAAGAGAGAGGGCCTTGGCTTTCTAACCTTACGTACGGGGTATTTGGTTTAGGCAACAGGCAGTATGAGCATTTCAATAAGGTGGCTTGCACAGTAGATGAAGCATTAAGTGAGCAAG
GTGGGAAACGACTTGTTCAAATGGGCCTCGGTGATGATGATCAGTGCATTGAAGATGACTTTACTGCTTGGCGAGAGCAGGTTTGGCCTGAGCTAGATCAGTTACTCCGTGACGAAGATGATCAGCCTTCAAGTGCTACAACTTATACAGCAGCTATACCTGAGTACCGGGTAGAAATCCATGATCCTTCAGTTTCGCTT
TATGAGGAAACTTATGCAACACAGAATGGTCAAGCCATTTATGATATCCATCACCCTTGCCGAGCAAATGTAGCAGTGCGAAGGGAACTTCATACGCCATTGTCTGACCGTTCTTGCATCCATTTGGAATTTGATATCTCAGGCACTGGCCTAACGTACGAGACTGGAGACCATGTTGGTGTCTATGCAGAAAACTTAAA
TGATACCGTGGAGGAAGCTGCAAAATTGTTAGGCTACCCACTAGACACAATAATTTCAGTCCATAGTGATAAAGAAGATGGTACGCCTCTTGGTGGAAGCTCCTTGCCACCACCCTTCCCTGGTCCATGTACCCTGCAGACTGCTCTTGCTCGTTATGCAGATTTGTTGAATCCTCCTCGAAAGGCTGCCTTGGTTGCAT
TGGCTAGTCATGCATCTGATCCAGCTGAAGCAGAGAGGTTGAAGTTCCTTTCATCACCAGCCGGAAAGGATGAGTACTCCCAATGGATTACTGTGAGTCAAAGAAGTCTTTTAGAAGTAATGGCGGAATTTCCTTCAGCAAAACCACCTCTTGGTGTCTTCTTTGCAGCAGTTGCCCCGCGTCTGCAACCTCGATATTAT
TCTATTTCTTCCTCTCCCAGGTATGCACCCAATAGAATACATGTCACATGTGCTCTGGTTTATGGGCCCAGTCCAACCGGCAGAATTCACAAAGGTGTTTGTTCGAATTGGATGAAGAGTTCAGTGCCTTCTGAGAAAAGCCATGATTGTAGCTGGGCACCAGTCTATGTTAGACAGTCAAATTTCAAATTGCCATCAGA
TCCTTCAGTTCCTATTGTTATGGTGGGCCCTGGAACTGGTTTAGCACCTTTTAGAGGCTTTTTGCAGGAAAGAGCTGCACTTCAAGAATCTGGAGAGAAGCTTGGGCCAGCTGTTCTTTTCTTTGGATGCAGGAATCGCCAAATGGATTACATATATGAAGATGAACTGAAGAGCTATGTGGAAAATGGTGTACTGACTG
ATCTTGTTCTTGCTTTCTCTCGCGAAGGAGCAACCAAAGAGTATGTGCAGCACAAGATTACAGAAAAGGGATCCTATATCTGGAATTTGATTGCTCAAGGTGGCTATTTCTATGTATGTGGTGATGCCAAGGGCATGGCTAGGGATGTGCACAGGACACTACACAGTATTGTCCAAGAGCAGGAATCCGTGAATAGCACC
AGCGCAGAGGCCACAGTGAAGAAATTACAGACAGAAGGAAGATATTTACGAGATGTATGGTAATTGAGTGAATTTTGCTCTAGGTCAGTTCAATCTCATCTCGTGCAGAATTGGTAAGAAGATTGAGGAAAAGAGAAAGCTTAGCCAAGTATTTATTTGGGAAAAGAAATCTCTTGGCAAACTAATGCTTAAGTTCATTT
ACCACGGAATTGTGGGATTCTTTACACCTTCAAATACTGCATTCCAGGATTTGCTATCACTGTGGTCATCAAATTTTCTAGCACCGGTATAACATTAGTACTGGTCTAGAATTGTATTCTTAATTCATTTGTGTCTAAGAGTTTAGTACCAGCAAAGTTAAATATCATGCCCTTCGGTTAGAGGACAACTCTCCACGTTA
TAGAATTTTTAATATATCTTGGTATGATCTTTGCATACCATACTTGACCTTCTTCTCATTATCTATATGGGAAGGGATTCCTTTCCAGTTTGATGTTGTGTTTCTCTTCCTTCTATAATGGCATATAAGAATCGATACTGGATTGAAGCATTCAGTGTCTCATGATACAGTGGATGACTTTGAACTTTGAGGTGTCTGAA
TATTGATGTTCTAGATGAATATCAGATAGTTGATATATCTAATTCCCTTGTATGGATACAATCTTTTTCCAACACTGTTTCATTACAGTTCAGAACAATCCTAAATTTGATGCATCTGTATAATATGTCGCTCATGGAAAACAGCTGCTATATTGAAAATACTTGATTTTAGAATTCTTCAGATAAGGAGTATAAATCCA
AGGCATTTTATTCAGTGTACACCTTGAGAAACTCCTTACACCTGAAAGCAGACGGGTATTTATTTTGTACGTTTGAGAACTTGGTAGTTATTATTATAGCTTTAC
>TRINITY_DN104227_c0_g2_i7 from sample A4 / Example unspliced isoform:TTTGTCACGAGGTCTTACGGTCCAATTTTTCCAAGCACTGAAGCACTTTATATTTGCTTTATTTGTGCAGGTATGGAGATGGAGAGCCAACTGACAATGCAGCAAGGTTTTACAAGTGGTTTTCTGAGACGgtaaattgttaaacctttaacatttgttcagattactggttcatttgactattctattggaagttaata
acaggcttattgcccttttgtatatttgaccagGAAAAAGAGAGAGGGCCTTGGCTTTCTAACCTTACGTACGGGGTATTTGGTTTAGGCAACAGGCAGTATGAGCATTTCAATAAGGTGGCTTGCACAGTAGATGAAGCATTAAGTGAGCAAGGTGGGAAACGACTTGTTCAAATGGGCCTCGGTGATGATGATCAGTG
CATTGAAGATGACTTTACTGCTTGGCGAGAGCAGGTTTGGCCTGAGCTAGATCAGTTACTCCGTGACGAAGATGATCAGCCTTCAAGTGCTACAACTTATACAGCAGCTATACCTGAGTACCGGGTAGAAATCCATGATCCTTCAGTTTCGCTTTATGAGGAAACTTATGCAACACAGAATGGTCAAGCCATTTATGATA
TCCATCACCCTTGCCGAGCAAATGTAGCAGTGCGAAGGGAACTTCATACGCCATTGTCTGACCGTTCTTGCATCCATTTGGAATTTGATATCTCAGGCACTGGCCTAACGTACGAGACTGGAGACCATGTTGGTGTCTATGCAGAAAACTTAAATGATACCGTGGAGGAAGCTGCAAAATTGTTAGGCTACCCACTAGAC
ACAATAATTTCAGTCCATAGTGATAAAGAAGATGGTACGCCTCTTGGTGGAAGCTCCTTGCCACCACCCTTCCCTGGTCCATGTACCCTGCAGACTGCTCTTGCTCGTTATGCAGATTTGTTGAATCCTCCTCGAAAGGCTGCCTTGGTTGCATTGGCTAGTCATGCATCTGATCCAGCTGAAGCAGAGAGGTTGAAGTT
CCTTTCATCACCAGCCGGAAAGGATGAGTACTCCCAATGGATTACTGTGAGTCAAAGAAGTCTTTTAGAAGTAATGGCGGAATTTCCTTCAGCAAAACCACCTCTTGGTGTCTTCTTTGCAGCAGTTGCCCCGCGTCTGCAACCTCGATATTATTCTATTTCTTCCTCTCCCAGGTATGCACCCAATAGAATACATGTCA
CATGTGCTCTGGTTTATGGGCCCAGTCCAACCGGCAGAATTCACAAAGGTGTTTGTTCGAATTGGATGAAGAGTTCAGTGCCTTCTGAGAAAAGCCATGATTGTAGCTGGGCACCAGTCTATGTTAGACAGTCAAATTTCAAATTGCCATCAGATCCTTCAGTTCCTATTGTTATGGTGGGCCCTGGAACTGGTTTAGCA
CCTTTTAGAGGCTTTTTGCAGGAAAGAGCTGCACTTCAAGAATCTGGAGAGAAGCTTGGGCCAGCTGTTCTTTTCTTTGGATGCAGGAATCGCCAAATGGATTACATATATGAAGATGAACTGAAGAGCTATGTGGAAAATGGTGTACTGACTGATCTTGTTCTTGCTTTCTCTCGCGAAGGAGCAACCAAAGAGTATGT
GCAGCACAAGATTACAGAAAAGGGATCCTATATCTGGAATTTGATTGCTCAAGGTGGCTATTTCTATGTATGTGGTGATGCCAAGGGCATGGCTAGGGATGTGCACAGGACACTACACAGTATTGTCCAAGAGCAGGAATCCGTGAATAGCACCAGCGCAGAGGCCACAGTGAAGAAATTACAGACAGAAGGAAGATATT
TACGAGATGTATGGTAATTGAGTGAATTTTGCTCTAGGTCAGTTCAATCTCATCTCGTGCAGAATTGGTAAGAAGATTGAGGAAAAGAGAAAGCTTAGCCAAGTATTTATTTGGGAAAAGAAATCTCTTGGCAAACTAATGCTTAAGTTCATTTACCACGGAATTGTGGGATTCTTTACACCTTCAAATACTGCATTCCA
GGATTTGCTATCACTGTGGTCATCAAATTTTCTAGCACCGGTATAACATTAGTACTGGTCTAGAATTGTATTCTTAATTCATTTGTGTCTAAGAGTTTAGTACCAGCAAAGTTAAATATCATGCCCTTCGGTTAGAGGACAACTCTCCACGTTATAGAATTTTTAATATATCTTGGTATGATCTTTGCATACCATACTTG
ACCTTCTTCTCATTATCTATATGGGAAGGGATTCCTTTCCAGTTTGATGTTGTGTTTCTCTTCCTTCTATAATGGCATATAAGAATCGATACTGGATTGAAGCATTCAGTGTCTCATGATACAGTGGATGACTTTGAACTTTGAGGTGTCTGAATATTGATGTTCTAGATGAATATCAGATAGTTGATATATCTAATTCC
CTTGTATGGATACAATCTTTTTCCAACACTGTTTCATTACAGTTCAGAACAATCCTAAATTTGATGCATCTGTATAATATGTCGCTCATGGAAAACAGCTGCTATATTGAAAATACTTGATTTTAGAATTCTTCAGATAAGGAGTATAAATCCAAGGCATTTTATTCAGTGTACACCTTGAGAAACTCCTTACACCTGAA
AGCAGACGGGTATTTATTTTGTACGTTTGAGAACTTGGTAGTTATTATTATAGCTTTAC
Intron 5 GTATGCTTTA ... ATTCTTTCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 16.51 | 273 | 54 | 0 |
| A2 | 17.13 | 295 | 61 | 0 |
| A3 | 19.36 | 379 | 91 | 2 |
| A4 | 15.55 | 233.6 | 43 | 2 |
| A5 | 14.98 | 193 | 34 | 5 |
| A6 | 19.65 | 151.3 | 37 | 0 |
| A7 | 19.56 | 407.3 | 99 | 1 |
| A8 | 14.09 | 128 | 21 | 0 |
| A9 | 15.29 | 310.3 | 56 | 0 |
| A10 | 16.27 | 350 | 68 | 0 |
>TRINITY_DN104227_c0_g2_i7 from sample A4 / Example spliced isoformTTTGTCACGAGGTCTTACGGTCCAATTTTTCCAAGCACTGAAGCACTTTATATTTGCTTTATTTGTGCAGGTATGGAGATGGAGAGCCAACTGACAATGCAGCAAGGTTTTACAAGTGGTTTTCTGAGACGGTAAATTGTTAAACCTTTAACATTTGTTCAGATTACTGGTTCATTTGACTATTCTATTGGAAGTTAATA
ACAGGCTTATTGCCCTTTTGTATATTTGACCAGGAAAAAGAGAGAGGGCCTTGGCTTTCTAACCTTACGTACGGGGTATTTGGTTTAGGCAACAGGCAGTATGAGCATTTCAATAAGGTGGCTTGCACAGTAGATGAAGCATTAAGTGAGCAAGGTGGGAAACGACTTGTTCAAATGGGCCTCGGTGATGATGATCAGTG
CATTGAAGATGACTTTACTGCTTGGCGAGAGCAGGTTTGGCCTGAGCTAGATCAGTTACTCCGTGACGAAGATGATCAGCCTTCAAGTGCTACAACTTATACAGCAGCTATACCTGAGTACCGGGTAGAAATCCATGATCCTTCAGTTTCGCTTTATGAGGAAACTTATGCAACACAGAATGGTCAAGCCATTTATGATA
TCCATCACCCTTGCCGAGCAAATGTAGCAGTGCGAAGGGAACTTCATACGCCATTGTCTGACCGTTCTTGCATCCATTTGGAATTTGATATCTCAGGCACTGGCCTAACGTACGAGACTGGAGACCATGTTGGTGTCTATGCAGAAAACTTAAATGATACCGTGGAGGAAGCTGCAAAATTGTTAGGCTACCCACTAGAC
ACAATAATTTCAGTCCATAGTGATAAAGAAGATGGTACGCCTCTTGGTGGAAGCTCCTTGCCACCACCCTTCCCTGGTCCATGTACCCTGCAGACTGCTCTTGCTCGTTATGCAGATTTGTTGAATCCTCCTCGAAAGGCTGCCTTGGTTGCATTGGCTAGTCATGCATCTGATCCAGCTGAAGCAGAGAGGTTGAAGTT
CCTTTCATCACCAGCCGGAAAGGATGAGTACTCCCAATGGATTACTGTGAGTCAAAGAAGTCTTTTAGAAGTAATGGCGGAATTTCCTTCAGCAAAACCACCTCTTGGTGTCTTCTTTGCAGCAGTTGCCCCGCGTCTGCAACCTCGATATTATTCTATTTCTTCCTCTCCCAGGTATGCACCCAATAGAATACATGTCA
CATGTGCTCTGGTTTATGGGCCCAGTCCAACCGGCAGAATTCACAAAGGTGTTTGTTCGAATTGGATGAAGAGTTCAGTGCCTTCTGAGAAAAGCCATGATTGTAGCTGGGCACCAGTCTATGTTAGACAGTCAAATTTCAAATTGCCATCAGATCCTTCAGTTCCTATTGTTATGGTGGGCCCTGGAACTGGTTTAGCA
CCTTTTAGAGGCTTTTTGCAGGAAAGAGCTGCACTTCAAGAATCTGGAGAGAAGCTTGGGCCAGCTGTTCTTTTCTTTGGATGCAGGAATCGCCAAATGGATTACATATATGAAGATGAACTGAAGAGCTATGTGGAAAATGGTGTACTGACTGATCTTGTTCTTGCTTTCTCTCGCGAAGGAGCAACCAAAGAGTATGT
GCAGCACAAGATTACAGAAAAGGGATCCTATATCTGGAATTTGATTGCTCAAGGTGGCTATTTCTATGTATGTGGTGATGCCAAGGGCATGGCTAGGGATGTGCACAGGACACTACACAGTATTGTCCAAGAGCAGGAATCCGTGAATAGCACCAGCGCAGAGGCCACAGTGAAGAAATTACAGACAGAAGGAAGATATT
TACGAGATGTATGGTAATTGAGTGAATTTTGCTCTAGGTCAGTTCAATCTCATCTCGTGCAGAATTGGTAAGAAGATTGAGGAAAAGAGAAAGCTTAGCCAAGTATTTATTTGGGAAAAGAAATCTCTTGGCAAACTAATGCTTAAGTTCATTTACCACGGAATTGTGGGATTCTTTACACCTTCAAATACTGCATTCCA
GGATTTGCTATCACTGTGGTCATCAAATTTTCTAGCACCGGTATAACATTAGTACTGGTCTAGAATTGTATTCTTAATTCATTTGTGTCTAAGAGTTTAGTACCAGCAAAGTTAAATATCATGCCCTTCGGTTAGAGGACAACTCTCCACGTTATAGAATTTTTAATATATCTTGGTATGATCTTTGCATACCATACTTG
ACCTTCTTCTCATTATCTATATGGGAAGGGATTCCTTTCCAGTTTGATGTTGTGTTTCTCTTCCTTCTATAATGGCATATAAGAATCGATACTGGATTGAAGCATTCAGTGTCTCATGATACAGTGGATGACTTTGAACTTTGAGGTGTCTGAATATTGATGTTCTAGATGAATATCAGATAGTTGATATATCTAATTCC
CTTGTATGGATACAATCTTTTTCCAACACTGTTTCATTACAGTTCAGAACAATCCTAAATTTGATGCATCTGTATAATATGTCGCTCATGGAAAACAGCTGCTATATTGAAAATACTTGATTTTAGAATTCTTCAGATAAGGAGTATAAATCCAAGGCATTTTATTCAGTGTACACCTTGAGAAACTCCTTACACCTGAA
AGCAGACGGGTATTTATTTTGTACGTTTGAGAACTTGGTAGTTATTATTATAGCTTTAC
>TRINITY_DN104227_c0_g2_i5 from sample A4 / Example unspliced isoform:ATTTATCAGTAATACTGACGTAATTAAGTATTGGTGAGAAATCAATGGTAGTAGGTGCCAAGGGAAGATTCCGGATGCCTTACCTTGTGGTTTGGACAGAGGCCATCTAAGTGGTATTTAGTGGTGCATTTAGTGTTAATGGGAAATGGTAGGTGGATTTGACCCTTGGACCTCTGGTTGGTGAAACCCCCACTTATAAA
GGCCAGACCTTTCCAGAGCTCCTGGGGCGACGTCGATAAGTCACAAGGAGCCAGGGTAGGTCTGAGGTGGACGAAAAGCTCCGGGGACAATAAAACTCGCCCGTCTTAGCAGGCAGGTCACAGGTTCGAATCGAATACCCGAGAGAGATCGTGTTTCTCGTCTCCTTACCCTGGTTTTCTTGATTCGTCCGAATGCAGGC
TAATTCGAACACCGTGGAGAGGGGCACCCAGGGCCTTGGGAAGAGCTTGCTGGAGATATCTCGGCTTGACCATGTTTTGGCCCTTTTCGTGAATGGCAAGGGGGATCTGGGGGGACTGATGGGGTCGGCGGTCGTTTTGAGGGAAAATTCGGAGCTTTTGATGGTCTTGACTACTTCTCTGGCTGTCTTGTTTGCTTGCG
TTTTGTTCTTTGTTTGGCGGAGAGGAGCTGCTCCCTCGAAGCTGCCAGAGAAGCCGACGCCTCTGGGGAGAGTAGAGGAAGAGGAGGAGGAGGAGGATGATTCCGGGAAAAAGAAAGTGACGGTTTTCTTTGGGACTCAGACCGGGACGGCTGAAGGATTTGCCAAGGCTCTGGCCGAGGAAGCCAAAGCTAGGTATGAC
AAGGCTGTCTTTAAAGTAGTGGATCTGGATGATTATGCAGCAGATGATGATCAGTATGAAGAAAAGTTAAAGAAGGAAAAATTAGCATTTTTTATGCTCGCAACGTATGGAGATGGAGAGCCAACTGACAATGCAGCAAGGTTTTACAAGTGGTTTTCTGAGACGGAAAAAGAGAGAGGGCCTTGGCTTTCTAACCTTAC
GTACGGGGTATTTGGTTTAGGCAACAGGCAGTATGAGCATTTCAATAAGGTGGCTTGCACAGTAGATGAAGCATTAAGTGAGCAAGGTGGGAAACGACTTGTTCAAATGGGCCTCGGTGATGATGATCAGTGCATTGAAGATGACTTTACTGCTTGgtatgctttatcctcaagaattgcctgattatagtgggagatag
taattagctggttgtaatataatttatctgcagcctgcaagattgttagcattgcttttttcagttatgtttggataagatgcattctcccttttaagccttttgcagtattaatggtctgttggtgactgtatgggtacattctttcagGCGAGAGCAGGTTTGGCCTGAG
Intron 6 GTATGTCATT ... ACCTTGACAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 29.78 | 136.8 | 1.8 | 58 |
| A2 | 24.02 | 123.5 | 4 | 39 |
| A3 | 34.85 | 121.5 | 3 | 65 |
| A4 | 27.89 | 100.9 | 4.6 | 39 |
| A5 | 22.36 | 80 | 1.2 | 23 |
| A6 | 21.19 | 186 | 3.6 | 50 |
| A7 | 18.52 | 233.4 | 1.2 | 53 |
| A8 | 24.52 | 197.1 | 3.6 | 64 |
| A9 | 22.99 | 207.8 | 1.8 | 62 |
| A10 | 25.2 | 169.3 | 0 | 57 |
>TRINITY_DN114533_c0_g1_i4 from sample A1 / Example spliced isoformATAAAATTGAGGGATTTATCAGTAATACTGACGTAATTAAGTATTGGTGAGAAATCAATGGTAGTAGGTGCCAAGGGAAGATTCCGGATGCCTTACCTTGTGGTTTGGACAGAGGCCATCTAAGTGGTATTTAGTGGTGCATTTAGTGTTAATGGGAAATGGTAGGTGGATTTGACCCTTGGACCTCTGGTTGGTGAAAC
CCCCACTTATAAAGGCCAGACCTTTCCAGAGCTCCTGAGGCGACGTCGATAAGTCACAAGGAGCCAGGGTAGGTCTGAGGTGGACGAAAAGCTCCGGGGACAATAAAACTCGCCCGTCTTAGCAGGCAGGTCACAGGTTCGAATCGAATACCCGAGAGAGATCGTGTTTCTCGTCTCCTTACCCTGGTTTTCTTGATTCG
TCCGAATGCAGGCTAATTCGAACACCGTGGAGAGGGGCACCCAGGGCCTTGGGAAGAGCTTGCTGGAGATATCTCGGCTTGACCATGTTTTGGCCCTTTTCGTGAATGGCAAGGGGGATCTGGGGGGACTGATGGGGTCGGCGGTCGTTTTGAGGGAAAATTCGGAGCTTTTGATGGTCTTGACTACTTCTCTGGCTGTC
TTGTTTGCTTGCGTTTTGTTCTTTGTTTGGCGGAGAGGAGCTGCTCCCTCGAAGCTGCCAGAGAAGCCGACGCCTCTGGGGAGAGTAGAGGAAGAGGAGGAGGAGGAGGATGATTCCGGGAAAAAGAAAGTGACGGTTTTCTTTGGGACTCAGACCGGGACGGCTGAAGGATTTGCCAAGGCTCTGGCCGAGGAAGCCAA
AGCTAGGTATGACAAGGCTGTCTTTAAAGTAGTGGATCTGGATGATTATGCAGCAGATGATGATCAGTATGAAGAAAAGTTAAAGAAGGAAAAATTAGCATTTTTTATGCTCGCAACGTATGGAGATGGAGAGCCAACTGACAATGCAGCAAGGTTTTACAAGTGGTTTTCTGAGACGGAAAAAGAGAGAGGGCCTTGGC
TTTCTAACCTTACGTACGGGGTATTTGGTTTAGGCAACAGGCAGTATGAGCATTTCAATAAGGTGGCTTGCACAGTAGATGAAGCATTAAGTGAGCAAGGTGGGAAACGACTTGTTCAAATGGGCCTCGGTGATGATGATCAGTGCATTGAAGATGACTTTACTGCTTGGCGAGAGCAGGTTTGGCCTGAGCTAGATCAG
TTACTCCGTGACGAAGATGATCAGCCTTCAAGTGCTACAACTTATACAGCAGCTATACCTGAGTACCGGGTAGAAATCCATGATCCTTCAGTTTCGCTTTATGAGGAAACTTATGCAACACAGAATGGTCAAGCCATTTATGATATCCATCACCCTTGCCGAGCAAATGTAGCAGTGCGAAGGGAACTTCATACGCCATT
GTCTGACCGTTCTTGCATCCATTTGGAATTTGATATCTCAGGCACTGGCCTAACGTACGAGACTGGAGACCATGTTGGTGTCTATGCAGAAAACTTAAATGATACCGTGGAGGAAGCTGCAAAATTGTTAGGCTACCCACTAGACACAATAATTTCAGTCCATAGTGATAAAGAAGATGGTACGCCTCTTGGTGGAAGCT
CCTTGCCACCACCCTTCCCTGGTCCATGTACCCTGCAGACTGCTCTTGCTCGTTATGCAGATTTGTTGAATCCTCCTCGAAAGGCTGCCTTGGTTGCATTGGCTAGTCATGCATCTGATCCAGCTGAAGCAGAGAGGTTGAAGTTCCTTTCATCACCAGCCGGAAAGGATGAGTACTCCCAATGGATTACTGTGAGTCAA
AGAAGTCTTTTAGAAGTAATGGCGGAATTTCCTTCAGCAAAACCACCTCTTGGTGTCTTCTTTGCAGCAGTTGCCCCGCGTCTGCAACCTCGATATTATTCTATTTCTTCCTCTCCCAGGTATGCACCCAATAGAATACATGTCACATGTGCTCTGGTTTATGGGCCCAGTCCAACCGGCAGAATTCACAAAGGTGTTTG
TTCGAATTGGATGAAGAGTTCAGTGCCTTCTGAGAAAAGCCATGATTGTAGCTGGGCACCAGTCTATGTTAGACAGTCAAATTTCAAATTGCCATCAGATCCTTCAGTTCCTATTGTTATGGTGGGCCCTGGAACTGGTTTAGCACCTTTTAGAGGCTTTTTGCAGGAAAGAGCTGCACTTCAAGAATCTGGAGAGAAGC
TTGGGCCAGCTGTTCTTTTCTTTGGATGCAGGAATCGCCAAATGGATTACATATATGAAGATGAACTGAAGAGCTATGTGGAAAATGGTGTACTGACTGATCTTGTTCTTGCTTTCTCTCGCGAAGGAGCAACCAAAGAGTATGTGCAGCACAAGATTACAGAAAAGGGATCCTATATCTGGAATTTGATTGCTCAAGGT
GGCTATTTCTATGTATGTGGTGATGCCAAGGGCATGGCTAGGGATGTGCACAGGACACTACACAGTATTGTCCAAGAGCAGGTAAAGCTTGTTGCTTGGTTGCTTTTTACTGAATATCACCATACTGTTTCTATTCTAATCATAGGACACTACAGACTATTGTCGAAGAGCAGGTAATGATTGTGGCTTGG
>TRINITY_DN114533_c0_g1_i7 from sample A1 / Example unspliced isoform:GTGTTTGTTCGAATTGGATGAAGgtatgtcattctatgtgtaaccacttatatttaccagttgaaaatgggttcatgcttaatataatggatgctgcttagactgaaggaattggaaaaccttgacagAGTTCAGTGCCTTCTGAGAAAAGCCATGATTGTAGCTGGGCACCAGTCTATGTTAGACAGTCAAATTTCAAA
TTGCCATCAGATCCTTCAGTTCCTATTGTTATGGTGGGCCCTGGAACTGGTTTAGCACCTTTTAGAGGCTTTTTGCAGGAAAGAGCTGCACTTCAAGAATCTGGAGAGAAGCTTGGGCCAGCTGTTCTTTTCTTTGGATGCAGGAATCGCCAAATGGATTACATATATGAAGATGAACTGAAGAGCTATGTGGAAAATGG
TGTACTGACTGATCTTGTTCTTGCTTTCTCTCGCGAAGGAGCAACCAAAGAGTATGTGCAGCACAAGATTACAGAAAAGGGATCCTATATCTGGAATTTGATTGCTCAAGGTGGCTATTTCTATGTATGTGGTGATGCCAAGGGCATGGCTAGGGATGTGCACAGGACACTACACAGTATTGTCCAAGAGCAGGAATCCG
TGAATAGCACCAGCGCAGAGGCCACAGTGAAGAAATTACAGACAGAAGGAAGATATTTACGAGATGTATGGTAATTGAGTGAATTTTGCTCTAGGTCAGTTCAATCTCATCTCGTGCAGAATTGGTAAGAAGATTGAGGAAAAGAGAAAGCTTAGCCAAGTATTTATTTGGGAAAAGAAATCTCTTGGCAAACTAATGCT
TAAGTTCATTTACCACGGAATTGTGGGATTCTTTACACCTTCAAATACTGCATTCCAGGATTTGCTATCACTGTGGTCATCAAATTTTCTAGCACCGGTATAACATTAGTACTGGTCTAGAATTGTATTCTTAATTCATTTGTGTCTAAGAGTTTAGTACCAGCAAAGTTAAATATCATGCCCTTCGGTTAGAGGACAAC
TCTCCACGTTATAGAATTTTTAATATATCTTGGTATGATCTTTGCATACCATACTTGACCTTCTTCTCATTATCTATATGGGAAGGGATTCCTTTCCAGTTTGATGTTGTGTTTCTCTTCCTTCTATAATGGCATATAAGAATCGATACTGGATTGAAGCATTCAGTGTCTCATGATACAGTGGATGACTTTGAACTTTG
AGGTGTCTGAATATTGATGTTCTAGATGAATATCAGATAGTTGATATATCTAATTCCCTTGTATGGATACAATCTTTTTCCAACACTGTTTCATTACAGTTCAGAACAATCCTAAATTTGATGCATCTGTATAATATGTCGCTCATGGAAAACAGCTGCTATATTGAAAATACTTGATTTTAGAATTCTTCAGATAAGGA
GTATAAATCCAAGGCATTTTATTCAGTGTACACCTTGAGAAACTCCTTACACCTGAAAGCAGACGGGTATTTATTTTGTACGTTTGAGAACTTGGTAGTTATTATTATAGCTTTACTCTTAATCTGCAAAAAAA
Intron 7 GTGAGTAAGT ... ATTCCACCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 0.55 | 270 | 1 | 2 |
| A2 | 0 | 282 | 0 | 0 |
| A3 | 0.79 | 315 | 1 | 4 |
| A4 | 1.67 | 235 | 5 | 3 |
| A5 | 0.32 | 156 | 0 | 1 |
| A6 | 0 | 115 | 0 | 0 |
| A7 | 0 | 264 | 0 | 0 |
| A8 | 0 | 96 | 0 | 0 |
| A9 | 0 | 226 | 0 | 0 |
| A10 | 0 | 247 | 0 | 0 |
>TRINITY_DN104227_c0_g2_i3 from sample A4 / Example spliced isoformATTTATCAGTAATACTGACGTAATTAAGTATTGGTGAGAAATCAATGGTAGTAGGTGCCAAGGGAAGATTCCGGATGCCTTACCTTGTGGTTTGGACAGAGGCCATCTAAGTGGTATTTAGTGGTGCATTTAGTGTTAATGGGAAATGGTAGGTGGATTTGACCCTTGGACCTCTGGTTGGTGAAACCCCCACTTATAAA
GGCCAGACCTTTCCAGAGCTCCTGGGGCGACGTCGATAAGTCACAAGGAGCCAGGGTAGGTCTGAGGTGGACGAAAAGCTCCGGGGACAATAAAACTCGCCCGTCTTAGCAGGCTAATTCGAACACCGTGGAGAGGGGCACCCAGGGCCTTGGGAAGAGCTTGCTGGAGATATCTCGGCTTGACCATGTTTTGGCCCTTT
TCGTGAATGGCAAGGGGGATCTGGGGGGACTGATGGGGTCGGCGGTCGTTTTGAGGGAAAATTCGGAGCTTTTGATGGTCTTGACTACTTCTCTGGCTGTCTTGTTTGCTTGCGTTTTGTTCTTTGTTTGGCGGAGAGGAGCTGCTCCCTCGAAGCTGCCAGAGAAGCCGACGCCTCTGGGGAGAGTAGAGGAAGAGGAG
GAGGAGGAGGATGATTCCGGGAAAAAGAAAGTGACGGTTTTCTTTGGGACTCAGACCGGGACGGCTGAAGGATTTGCCAAGGCTCTGGCCGAGGAAGCCAAAGCTAGGTATGACAAGGCTGTCTTTAAAGTAGTGGATCTGGATGATTATGCAGCAGATGATGATCAGTATGAAGAAAAGTTAAAGAAGGAAAAATTAGC
ATTTTTTATGCTCGCAACGTATGGAGATGGAGAGCCAACTGACAATGCAGCAAGGTTTTACAAGTGGTTTTCTGAGACGGAAAAAGAGAGAGGGCCTTGGCTTTCTAACCTTACGTACGGGGTATTTGGTTTAGGCAACAGGCAGTATGAGCATTTCAATAAGGTGGCTTGCACAGTAGATGAAGCATTAAGTGAGCAAG
GTGGGAAACGACTTGTTCAAATGGGCCTCGGTGATGATGATCAGTGCATTGAAGATGACTTTACTGCTTGGCGAGAGCAGGTTTGGCCTGAGCTAGATCAGTTACTCCGTGACGAAGATGATCAGCCTTCAAGTGCTACAACTTATACAGCAGCTATACCTGAGTACCGGGTAGAAATCCATGATCCTTCAGTTTCGCTT
TATGAGGAAACTTATGCAACACAGAATGGTCAAGCCATTTATGATATCCATCACCCTTGCCGAGCAAATGTAGCAGTGCGAAGGGAACTTCATACGCCATTGTCTGACCGTTCTTGCATCCATTTGGAATTTGATATCTCAGGCACTGGCCTAACGTACGAGACTGGAGACCATGTTGGTGTCTATGCAGAAAACTTAAA
TGATACCGTGGAGGAAGCTGCAAAATTGTTAGGCTACCCACTAGACACAATAATTTCAGTCCATAGTGATAAAGAAGATGGTACGCCTCTTGGTGGAAGCTCCTTGCCACCACCCTTCCCTGGTCCATGTACCCTGCAGACTGCTCTTGCTCGTTATGCAGATTTGTTGAATCCTCCTCGAAAGGCTGCCTTGGTTGCAT
TGGCTAGTCATGCATCTGATCCAGCTGAAGCAGAGAGGTTGAAGTTCCTTTCATCACCAGCCGGAAAGGATGAGTACTCCCAATGGATTACTGTGAGTCAAAGAAGTCTTTTAGAAGTAATGGCGGAATTTCCTTCAGCAAAACCACCTCTTGGTGTCTTCTTTGCAGCAGTTGCCCCGCGTCTGCAACCTCGATATTAT
TCTATTTCTTCCTCTCCCAGGTATGCACCCAATAGAATACATGTCACATGTGCTCTGGTTTATGGGCCCAGTCCAACCGGCAGAATTCACAAAGGTGTTTGTTCGAATTGGATGAAGAGTTCAGTGCCTTCTGAGAAAAGCCATGATTGTAGCTGGGCACCAGTCTATGTTAGACAGTCAAATTTCAAATTGCCATCAGA
TCCTTCAGTTCCTATTGTTATGGTGGGCCCTGGAACTGGTTTAGCACCTTTTAGAGGCTTTTTGCAGGAAAGAGCTGCACTTCAAGAATCTGGAGAGAAGCTTGGGCCAGCTGTTCTTTTCTTTGGATGCAGGAATCGCCAAATGGATTACATATATGAAGATGAACTGAAGAGCTATGTGGAAAATGGTGTACTGACTG
ATCTTGTTCTTGCTTTCTCTCGCGAAGGAGCAACCAAAGAGTATGTGCAGCACAAGATTACAGAAAAGGGATCCTATATCTGGAATTTGATTGCTCAAGGTGGCTATTTCTATGTATGTGGTGATGCCAAGGGCATGGCTAGGGATGTGCACAGGACACTACACAGTATTGTCCAAGAGCAGGAATCCGTGAATAGCACC
AGCGCAGAGGCCACAGTGAAGAAATTACAGACAGAAGGAAGATATTTACGAGATGTATGGTAATTGAGTGAATTTTGCTCTAGGTCAGTTCAATCTCATCTCGTGCAGAATTGGTAAGAAGATTGAGGAAAAGAGAAAGCTTAGCCAAGTATTTATTTGGGAAAAGAAATCTCTTGGCAAACTAATGCTTAAGTTCATTT
ACCACGGAATTGTGGGATTCTTTACACCTTCAAATACTGCATTCCAGGATTTGCTATCACTGTGGTCATCAAATTTTCTAGCACCGGTATAACATTAGTACTGGTCTAGAATTGTATTCTTAATTCATTTGTGTCTAAGAGTTTAGTACCAGCAAAGTTAAATATCATGCCCTTCGGTTAGAGGACAACTCTCCACGTTA
TAGAATTTTTAATATATCTTGGTATGATCTTTGCATACCATACTTGACCTTCTTCTCATTATCTATATGGGAAGGGATTCCTTTCCAGTTTGATGTTGTGTTTCTCTTCCTTCTATAATGGCATATAAGAATCGATACTGGATTGAAGCATTCAGTGTCTCATGATACAGTGGATGACTTTGAACTTTGAGGTGTCTGAA
TATTGATGTTCTAGATGAATATCAGATAGTTGATATATCTAATTCCCTTGTATGGATACAATCTTTTTCCAACACTGTTTCATTACAGTTCAGAACAATCCTAAATTTGATGCATCTGTATAATATGTCGCTCATGGAAAACAGCTGCTATATTGAAAATACTTGATTTTAGAATTCTTCAGATAAGGAGTATAAATCCA
AGGCATTTTATTCAGTGTACACCTTGAGAAACTCCTTACACCTGAAAGCAGACGGGTATTTATTTTGTACGTTTGAGAACTTGGTAGTTATTATTATAGCTTTAC
>TRINITY_DN104227_c0_g2_i4 from sample A4 / Example unspliced isoform:CAAATTCTGAGAAATCTACGCCATTCTTTGAATTATAATCAATATTATTGGTAATGCTATTAAATCGTGTATGCAATCTGTATTGGTTATGAATCCTCTTCGTTCCATGTTATCATTATTATTTTTATTATTGTTCCTGAAGTTCCGAAGCAGTCTTGGTTTTGATTCCACGTTGCTATTTGCATTGTCATTATGCTACT
TTTAATGAATCTATATCTACGGAAATGATTTGATGATAATTTGATATGTGTGACAGGCTCTGGCCGAGGAAGCCAAAGCTAGGTATGACAAGGCTGTCTTTAAAGTAGTGGATCTGgtgagtaagtctgtcaatacaaggctgttttgataattttttaattgattatatctttcaaaaatttgaaccgtctgttactca
aatgagtggagtcaaataacatgatatcttatttggttgaattccaccagGATGATTATGCAGCAGATGATGATCAGTATGAAGAAAAGTTAAAGAAGGAAAAATTAGCATTTTTTATGCTCGCAACGTAAGATACAAATATTAGACCATCTACGTTTATCTTACTAAGCTTCTTTATGCAGTCCGCATTAAAATGTTTA
GTCCACAGATTGTTTGGTTTAGTTGATTTGTATGAACAGTATTA
Intron 8 GTCTATTATC ... GCCATTCCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 24.67 | 113 | 0 | 37 |
| A2 | 23.64 | 84 | 0 | 26 |
| A3 | 28.08 | 105 | 0 | 41 |
| A4 | 37.76 | 89 | 1 | 54 |
| A5 | 28.09 | 64 | 0 | 25 |
| A6 | 31.33 | 103 | 0 | 47 |
| A7 | 21.15 | 164 | 0 | 44 |
| A8 | 32.5 | 108 | 0 | 52 |
| A9 | 25.24 | 157 | 0 | 53 |
| A10 | 26.71 | 118 | 0 | 43 |
>TRINITY_DN107460_c0_g2_i2 from sample A2 / Example spliced isoformATTGAAATAAAATTGAGGGATTTATCAGTAATACTGACGTAATTAAGTATTGGTGAGAAATCAATGGTAGTAGGTGCCAAGGGAAGATTCCGGATGCCTTACCTTGTGGTTTGGACAGAGGCCATCTAAGTGGTATTTAGTGGTGCATTTAGTGTTAATGGGAAATGGTAGGTGGATTTGACCCTTGGACCTCTGGTTGG
TGAAACCCCCACTTATAAAGGCCAGACCTTTCCAGAGCTCCTGAGGCGACGTCGATAAGTCACAAGGAGCCAGGGTAGGTCTGAGGTGGACGAAAAGCTCCGGGGACAATAAAACTCGCCCGTCTTAGCAGGCAGGTCACAGGTTCGAATCGAATACCCGAGAGAGATCGTGTTTCTCGTCTCCTTACCCTGGTTTTCTT
GATTCGTCCGAATGCAGGCTAATTCGAACACCGTGGAGAGGGGCACCCAGGGCCTTGGGAAGAGCTTGCTGGAGATATCTCGGCTTGACCATGTTTTGGCCCTTTTCGTGAATGGCAAGGGGGATCTGGGGGGACTGATGGGGTCGGCGGTCGTTTTGAGGGAAAATTCGGAGCTTTTGATGGTCTTGACTACTTCTCTG
GCTGTCTTGTTTGCTTGCGTTTTGTTCTTTGTTTGGCGGAGAGGAGCTGCTCCCTCGAAGCTGCCAGAGAAGCCGACGCCTCTGGGGAGAGTAGAGGAAGAGGAGGAGGAGGAGGATGATTCCGGGAAAAAGAAAGTGACGGTTTTCTTTGGGACTCAGACCGGGACGGCTGAAGGATTTGCCAAGGCTCTGGCCGAGGA
AGCCAAAGCTAGGTATGACAAGGCTGTCTTTAAAGTAGTGGATCTGGATGATTATGCAGCAGATGATGATCAGTATGAAGAAAAGTTAAAGAAGGAAAAATTAGCATTTTTTATGCTCGCAACGTATGGAGATGGAGAGCCAACTGACAATGCAGCAAGGTTTTACAAGTGGTTTTCTGAGACGGAAAAAGAGAGAGGGC
CTTGGCTTTCTAACCTTACGTACGGGGTATTTGGTTTAGGCAACAGGCAGTATGAGCATTTCAATAAGGTGGCTTGCACAGTAGATGAAGCATTAAGTGAGCAAGGTGGGAAACGACTTGTTCAAATGGGCCTCGGTGATGATGATCAGTGCATTGAAGATGACTTTACTGCTTGGCGAGAGCAGGTTTGGCCTGAGCTA
GATCAGTTACTCCGTGACGAAGATGATCAGCCTTCAAGTGCTACAACTTATACAGCAGCTATACCTGAGTACCGGGTAGAAATCCATGATCCTTCAGTTTCGCTTTATGAGGAAACTTATGCAACACAGAATGGTCAAGCCATTTATGATATCCATCACCCTTGCCGAGCAAATGTAGCAGTGCGAAGGGAACTTCATAC
GCCATTGTCTGACCGTTCTTGCATCCATTTGGAATTTGATATCTCAGGCACTGGCCTAACGTACGAGACTGGAGACCATGTTGGTGTCTATGCAGAAAACTTAAATGATACCGTGGAGGAAGCTGCAAAATTGTTAGGCTACCCACTAGACACAATAATTTCAGTCCATAGTGATAAAGAAGATGGTACGCCTCTTGGTG
GAAGCTCCTTGCCACCACCCTTCCCTGGTCCATGTACCCTGCAGACTGCTCTTGCTCGTTATGCAGATTTGTTGAATCCTCCTCGAAAGGCTGCCTTGGTTGCATTGGCTAGTCATGCATCTGATCCAGCTGAAGCAGAGAGGTTGAAGTTCCTTTCATCACCAGCCGGAAAGGATGAGTACTCCCAATGGATTACTGTG
AGTCAAAGAAGTCTTTTAGAAGTAATGGCGGAATTTCCTTCAGCAAAACCACCTCTTGGTGTCTTCTTTGCAGCAGTTGCCCCGCGTCTGCAACCTCGATATTATTCTATTTCTTCCTCTCCCAGGTATGCACCCAATAGAATACATGTCACATGTGCTCTGGTTTATGGGCCCAGTCCAACCGGCAGAATTCACAAAGG
TGTTTGTTCGAATTGGATGAAGAGTTCAGTGCCTTCTGAGAAAAGCCATGATTGTAGCTGGGCACCAGTCTATGTTAGACAGTCAAATTTCAAATTGCCATCAGATCCTTCAGTTCCTATTGTTATGGTGGGCCCTGGAACTGGTTTAGCACCTTTTAGAGGCTTTTTGCAGGAAAGAGCTGCACTTCAAGAATCTGGAG
AGAAGCTTGGGCCAGCTGTTCTTTTCTTTGGATGCAGGAATCGCCAAATGGATTACATATATGAAGATGAACTGAAGAGCTATGTGGAAAATGGTGTACTGACTGATCTTGTTCTTGCTTTCTCTCGCGAAGGAGCAACCAAAGAGTATGTGCAGCACAAGATTACAGAAAAGGGATCCTATATCTGGAATTTGATTGCT
CAAGGTGGCTATTTCTATGTATGTGGTGATGCCAAGGGCATGGCTAGGGATGTGCACAGGACACTACACAGTATTGTCCAAGAGCAGGTAAAGCTTGTTGCTTGGTTGCTTTTTACTGAATATCACCATACTGTTTCTATTCTAATCATAGGACACTACAGACTATTGTCGAAGAGCAGGTAATGATTGTGGCT
>TRINITY_DN107460_c0_g2_i6 from sample A2 / Example unspliced isoform:CCTTTCATCACCAGCCGGAAAGgtctattatcttttttcattgtctaaatttgtttatgtggaggtcgtttgtttcgttgataaatatatttgccgactttcaggccttaattctgttcatttaatttttgttcatatctgccattccagGATGAGTACTCCCAATGGATTACTGTGAGTCAAAGAAGTCTTTTAGAAGT
AATGGCGGAATTTCCTTCAGCAAAACCACCTCTTGGTGTCTTCTTTGCAGCAGTTGCCCCGCGTCTGCAACCTCGATATTATTCTATTTCTTCCTCTCCCAGGTATGCACCCAATAGAATACATGTCACATGTGCTCTGGTTTATGGGCCCAGTCCAACCGGCAGAATTCACAAAGGTGTTTGTTCGAATTGGATGAAGA
GTTCAGTGCCTTCTGAGAAAAGCCATGATTGTAGCTGGGCACCAGTCTATGTTAGACAGTCAAATTTCAAATTGCCATCAGATCCTTCAGTTCCTATTGTTATGGTGGGCCCTGGAACTGGTTTAGCACCTTTTAGAGGCTTTTTGCAGGAAAGAGCTGCACTTCAAGAATCTGGAGAGAAGCTTGGGCCAGCTGTTCTT
TTCTTTGGATGCAGGAATCGCCAAATGGATTACATATATGAAGATGAACTGAAGAGCTATGTGGAAAATGGTGTACTGACTGATCTTGTTCTTGCTTTCTCTCGCGAAGGAGCAACCAAAGAGTATGTGCAGCACAAGATTACAGAAAAGGGATCCTATATCTGGAATTTGATTGCTCAAGGTGGCTATTTCTATGTATG
TGGTGATGCCAAGGGCATGGCTAGGGATGTGCACAGGACACTACACAGTATTGTCCAAGAGCAGGTAAAGCTTGTTGCTTGGTTGCTTTTTACTGAATATCACCATACTGTTTCTATTCTAATCATAGGACACTACAGACTATTGTCGAAGAGCAGGTAATGATTGTGGCT
Intron 9 GTGACTTCTC ... TATTGTTTAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 30.06 | 114 | 49 | 0 |
| A2 | 24.81 | 100 | 33 | 0 |
| A3 | 30.28 | 99 | 43 | 0 |
| A4 | 32.22 | 61 | 29 | 2 |
| A5 | 25.47 | 79 | 27 | 0 |
| A6 | 23.76 | 77 | 24 | 0 |
| A7 | 22.45 | 152 | 44 | 0 |
| A8 | 21.35 | 70 | 19 | 0 |
| A9 | 21.43 | 110 | 30 | 0 |
| A10 | 27.37 | 130 | 49 | 0 |
>TRINITY_DN104227_c0_g2_i7 from sample A4 / Example spliced isoformTTTGTCACGAGGTCTTACGGTCCAATTTTTCCAAGCACTGAAGCACTTTATATTTGCTTTATTTGTGCAGGTATGGAGATGGAGAGCCAACTGACAATGCAGCAAGGTTTTACAAGTGGTTTTCTGAGACGGTAAATTGTTAAACCTTTAACATTTGTTCAGATTACTGGTTCATTTGACTATTCTATTGGAAGTTAATA
ACAGGCTTATTGCCCTTTTGTATATTTGACCAGGAAAAAGAGAGAGGGCCTTGGCTTTCTAACCTTACGTACGGGGTATTTGGTTTAGGCAACAGGCAGTATGAGCATTTCAATAAGGTGGCTTGCACAGTAGATGAAGCATTAAGTGAGCAAGGTGGGAAACGACTTGTTCAAATGGGCCTCGGTGATGATGATCAGTG
CATTGAAGATGACTTTACTGCTTGGCGAGAGCAGGTTTGGCCTGAGCTAGATCAGTTACTCCGTGACGAAGATGATCAGCCTTCAAGTGCTACAACTTATACAGCAGCTATACCTGAGTACCGGGTAGAAATCCATGATCCTTCAGTTTCGCTTTATGAGGAAACTTATGCAACACAGAATGGTCAAGCCATTTATGATA
TCCATCACCCTTGCCGAGCAAATGTAGCAGTGCGAAGGGAACTTCATACGCCATTGTCTGACCGTTCTTGCATCCATTTGGAATTTGATATCTCAGGCACTGGCCTAACGTACGAGACTGGAGACCATGTTGGTGTCTATGCAGAAAACTTAAATGATACCGTGGAGGAAGCTGCAAAATTGTTAGGCTACCCACTAGAC
ACAATAATTTCAGTCCATAGTGATAAAGAAGATGGTACGCCTCTTGGTGGAAGCTCCTTGCCACCACCCTTCCCTGGTCCATGTACCCTGCAGACTGCTCTTGCTCGTTATGCAGATTTGTTGAATCCTCCTCGAAAGGCTGCCTTGGTTGCATTGGCTAGTCATGCATCTGATCCAGCTGAAGCAGAGAGGTTGAAGTT
CCTTTCATCACCAGCCGGAAAGGATGAGTACTCCCAATGGATTACTGTGAGTCAAAGAAGTCTTTTAGAAGTAATGGCGGAATTTCCTTCAGCAAAACCACCTCTTGGTGTCTTCTTTGCAGCAGTTGCCCCGCGTCTGCAACCTCGATATTATTCTATTTCTTCCTCTCCCAGGTATGCACCCAATAGAATACATGTCA
CATGTGCTCTGGTTTATGGGCCCAGTCCAACCGGCAGAATTCACAAAGGTGTTTGTTCGAATTGGATGAAGAGTTCAGTGCCTTCTGAGAAAAGCCATGATTGTAGCTGGGCACCAGTCTATGTTAGACAGTCAAATTTCAAATTGCCATCAGATCCTTCAGTTCCTATTGTTATGGTGGGCCCTGGAACTGGTTTAGCA
CCTTTTAGAGGCTTTTTGCAGGAAAGAGCTGCACTTCAAGAATCTGGAGAGAAGCTTGGGCCAGCTGTTCTTTTCTTTGGATGCAGGAATCGCCAAATGGATTACATATATGAAGATGAACTGAAGAGCTATGTGGAAAATGGTGTACTGACTGATCTTGTTCTTGCTTTCTCTCGCGAAGGAGCAACCAAAGAGTATGT
GCAGCACAAGATTACAGAAAAGGGATCCTATATCTGGAATTTGATTGCTCAAGGTGGCTATTTCTATGTATGTGGTGATGCCAAGGGCATGGCTAGGGATGTGCACAGGACACTACACAGTATTGTCCAAGAGCAGGAATCCGTGAATAGCACCAGCGCAGAGGCCACAGTGAAGAAATTACAGACAGAAGGAAGATATT
TACGAGATGTATGGTAATTGAGTGAATTTTGCTCTAGGTCAGTTCAATCTCATCTCGTGCAGAATTGGTAAGAAGATTGAGGAAAAGAGAAAGCTTAGCCAAGTATTTATTTGGGAAAAGAAATCTCTTGGCAAACTAATGCTTAAGTTCATTTACCACGGAATTGTGGGATTCTTTACACCTTCAAATACTGCATTCCA
GGATTTGCTATCACTGTGGTCATCAAATTTTCTAGCACCGGTATAACATTAGTACTGGTCTAGAATTGTATTCTTAATTCATTTGTGTCTAAGAGTTTAGTACCAGCAAAGTTAAATATCATGCCCTTCGGTTAGAGGACAACTCTCCACGTTATAGAATTTTTAATATATCTTGGTATGATCTTTGCATACCATACTTG
ACCTTCTTCTCATTATCTATATGGGAAGGGATTCCTTTCCAGTTTGATGTTGTGTTTCTCTTCCTTCTATAATGGCATATAAGAATCGATACTGGATTGAAGCATTCAGTGTCTCATGATACAGTGGATGACTTTGAACTTTGAGGTGTCTGAATATTGATGTTCTAGATGAATATCAGATAGTTGATATATCTAATTCC
CTTGTATGGATACAATCTTTTTCCAACACTGTTTCATTACAGTTCAGAACAATCCTAAATTTGATGCATCTGTATAATATGTCGCTCATGGAAAACAGCTGCTATATTGAAAATACTTGATTTTAGAATTCTTCAGATAAGGAGTATAAATCCAAGGCATTTTATTCAGTGTACACCTTGAGAAACTCCTTACACCTGAA
AGCAGACGGGTATTTATTTTGTACGTTTGAGAACTTGGTAGTTATTATTATAGCTTTAC
>TRINITY_DN104227_c0_g2_i6 from sample A4 / Example unspliced isoform:ATTTATCAGTAATACTGACGTAATTAAGTATTGGTGAGAAATCAATGGTAGTAGGTGCCAAGGGAAGATTCCGGATGCCTTACCTTGTGGTTTGGACAGAGGCCATCTAAGTGGTATTTAGTGGTGCATTTAGTGTTAATGGGAAATGGTAGGTGGATTTGACCCTTGGACCTCTGGTTGGTGAAACCCCCACTTATAAA
GGCCAGACCTTTCCAGAGCTCCTGGGGCGACGTCGATAAGTCACAAGGAGCCAGGGTAGGTCTGAGGTGGACGAAAAGCTCCGGGGACAATAAAACTCGCCCGTCTTAGCAGGCAGGTCACAGGTTCGAATCGAATACCCGAGAGAGATCGTGTTTCTCGTCTCCTTACCCTGGTTTTCTTGATTCGTCCGAATGCAGGC
TAATTCGAACACCGTGGAGAGGGGCACCCAGGGCCTTGGGAAGAGCTTGCTGGAGATATCTCGGCTTGACCATGTTTTGGCCCTTTTCGTGAATGGCAAGGGGGATCTGGGGGGACTGATGGGGTCGGCGGTCGTTTTGAGGGAAAATTCGGAGCTTTTGATGGTCTTGACTACTTCTCTGGCTGTCTTGTTTGCTTGCG
TTTTGTTCTTTGTTTGGCGGAGAGGAGCTGCTCCCTCGAAGCTGCCAGAGAAGCCGACGCCTCTGGGGAGAGTAGAGGAAGAGGAGGAGGAGGAGGATGATTCCGGGAAAAAGAAAGTGACGGTTTTCTTTGGGACTCAGACCGGGACGGCTGAAGGATTTGCCAAGGCTCTGGCCGAGGAAGCCAAAGCTAGGTATGAC
AAGGCTGTCTTTAAAGTAGTGGATCTGGATGATTATGCAGCAGATGATGATCAGTATGAAGAAAAGTTAAAGAAGGAAAAATTAGCATTTTTTATGCTCGCAACGTATGGAGATGGAGAGCCAACTGACAATGCAGCAAGGTTTTACAAGTGGTTTTCTGAGACGGAAAAAGAGAGAGGGCCTTGGCTTTCTAACCTTAC
GTACGGGGTATTTGGTTTAGGCAACAGGCAGTATGAGCATTTCAATAAGGTGGCTTGCACAGTAGATGAAGCATTAAGTGAGCAAGGTGGGAAACGACTTGTTCAAATGGGCCTCGGTGATGATGATCAGTGCATTGAAGATGACTTTACTGCTTGGCGAGAGCAGGTTTGGCCTGAGCTAGATCAGTTACTCCGTGACG
AAGATGATCAGCCTTCAAGTGCTACAACTTATACAGCAGCTATACCTGAGTACCGGGTAGAAATCCATGATCCTTCAGTTTCGCTTTATGAGGAAACTTATGCAACACAGAATGGTCAAGCCATTTATGATATCCATCACCCTTGCCGAGCAAATGTAGCAGTGCGAAGGGAACTTCATACGCCATTGTCTGACCGTTCT
TGCATCCATTTGGAATTTGATATCTCAGGCACTGGCCTAACGTACGAGACTGGAGACCATGTTGGTGTCTATGCAGAAAACTTAAATGATACCGTGGAGGAAGCTGCAAAATTGTTAGGCTACCCACTAGACACAATAATTTCAGTCCATAGTGATAAAGAAGATGGTACGCCTCTTGGTGGAAGCTCCTTGCCACCACC
CTTCCCTGGTCCATGTACCCTGCAGACTGCTCTTGCTCGTTATGCAGATTTGTTGAATCCTCCTCGAAAGgtgacttctctgaaaaacattgcccttcttatagtatttactaatggtttagctagtgaagatcttaatttttttatatttgtattgtttagGCTGCCTTGGTTGCATTGGCT